富集

BigData | 一文带你搞清楚"数据倾斜"（上）

在了解数据倾斜之前，我们应该有一个常识，就是现实生活中的数据分布是不均匀的，俗话说"28定理"，80%的财富集中在20%的人
Pysamlam·2020-08-18 10:02

KEGG基因富集分析

#kegg:基因功能存储在pathway数据库里rm(list=ls())##魔幻操作，一键清空~load(file='deg.Rdata')head(deg)##不同的阈值，筛选到的差异基因数量就不一样，后面的超几何分布检验结果就大相径庭。logFC_t=1.5deg=nrDEGdeg$g=ifelse(deg$P.Value>0.05,'stable',ifelse(deg$logFC>log
JiangCaifu·2020-08-17 11:48

MSigDB:基因集数据库

GeneSetEnrichmentAnalysis，中文名称为基因集富集分析，是由BroadInstitute研究所的科学家提出的一种富集方法，在提出该方法的同时还对应提供了分析的软件GSEA和一个基因集数据库
weixin_43569478·2020-08-16 16:26

ELRCN（富集长期递归卷积网络）微表情识别

EnrichedLong-termRecurrentConvolutionalNetworkforFacialMicro-ExpressionRecognition论文地址：https://arxiv.org/abs/1805.08417源码地址：https://github.com/IcedDoggie/Micro-Expression-with-Deep-Learning网络架构ELRCN的总
支持向量叽·2020-08-16 05:47

对眼睛最好的3种食物，你一定得知道！比猪肝还补眼睛

不过，按照富集原理
健康生活百科·2020-08-16 00:00

《梦幻西游》这部动画新作，让敦煌文化刷爆了全网

作为第九艺术的电子游戏，正在联动多种媒体联动形式，以特有的信息富集、表达、传播、互动特性，将敦煌文化等优秀民族精
GameRes游资网·2020-08-14 00:00

AUCell：在单细胞转录组中识别细胞对“基因集”的响应

AUCell使用“曲线下面积”(AreaUndertheCurve，AUC)来计算输入基因集的一个关键子集是否在每个细胞的表达基因中富集。
周运来就是我·2020-08-13 20:36

Rabbit MQ 简单入门 看这篇文章就懂了

，并且RabbitMQ是基于AMQP协议的RabbitMQ的优点:开源、性能优秀、稳定性保障提供可靠性消息投递模式(confirm)、返回模式(return)与SpringAMQP完美的整合、API丰富集群模式丰富
这个程序员像只猴·2020-08-12 18:32

R: clusterProfiler/enrichplot 富集分析与可视化神器

使用R包clusterProfiler进行富集分析与可视化clusterProfiler官方网址：http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html
下凡的生信人·2020-08-11 00:49

万达财富集团 共享信用是未来信用经济发展方向

共享信用研究专家、万达财富集团董事长李炳春日前表示
科技宅说·2020-08-10 20:39

从《血战湘江》到《决不掉队》谱写万达财富集团文化发展之路

其实在我国主旋律电影中，由万达财富集团参与投资拍摄的《血战湘江》也堪称经典力作。喷射的火舌，飞啸的子弹，跳动的弹壳以及迸溅的
科技宅说·2020-08-10 20:39

第一届“万达财富杯”舞蹈才艺大赛圆满落幕 舞出精彩人生

万达财富集团董事长李炳春先生发表开幕式致辞，北京电视台台长汤玲女士、万达财富集团副总金戈先生、万达财富新媒体运营总裁刘夏女士受邀担任现场评委。
科技宅说·2020-08-10 13:57

PNAS-2018-病原菌在植物免疫下的转录组

本文介绍了一种新方法，可以去除植物组织，特异富集病原菌的转录本，从而获得植物体内病原菌转录组。本文的通讯作者为马普植物育种研究所的KenichiTsuda研究员和密歇根州立大学的美国科学院院士何胜阳
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:31

NBT：未培养病毒基因组的最少信息标准（MIUViG）

文章目录未培养病毒基因组的最少信息标准写在前面摘要介绍图1随着时间推移病毒基因组数据库的大小病毒富集后UViGs的回收图2UViGs的识别未经富集后的UViGs的回收病毒序列的计算鉴定方法表1UViGs
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:12

Cell子刊：人类微生物组参考基因集中的单体基因

文章目录人类肠道和口腔微生物组中遗传基因全貌热心肠日报摘要主要结果表1.文章中名词定义图1.综合分析口腔和肠道微生物组图2.口腔和肠道微生物组的遗传多样性图3.口腔和肠道微生物组的已知和未知功能多样性图4.单体和非单体在肠道和口腔生态位中富集的功能图
刘永鑫Adam·2020-08-08 01:39

GSEA分析结果详细解读

在解读传统的富集分析结果时，经常会有这样的疑问，一个富集到的通路下，既有上调差异基因，也有下调差异基因，那么这条通路总体的表现形式究竟是怎样呢，是被抑制还是激活？
weixin_43569478·2020-08-06 10:02

使用clusterProfiler进行GO富集分析

clusterProfiler是一个功能强大的R包，同时支持GO和KEGG的富集分析，而且可视化功能非常的优秀，本章主要介绍利用这个R包来进行GeneOntology的富集分析。
weixin_43569478·2020-08-06 10:02

揭秘差异基因功能富集分析

欢迎关注微信公众号《生信修炼手册》！通过差异分析，我们可以知道不同分组间是否存在差异，存在差异的是哪些基因。再进一步，需要探究这些基因的表达量出现差异是由哪些生物学过程介导的，我们的实验处理影响了哪些生物学过程。为了探究上述问题，我们首先需要知道基因参与的生物学过程，这个依赖于我们对生命活动的已有认知，比如常见的KEGG数据库，就存储了基因对应的通路信息。其次，我们还需要一点统计学手段，差异基因的
weixin_43569478·2020-08-06 10:02

使用clusterProfiler进行KEGG富集分析

欢迎关注微信公众号《生信修炼手册》!KEGGpathway是最常用的功能注释数据库之一，可以利用KEGG的API获取一个物种所有基因对应的pathway注释，human对应的API链接如下http://rest.kegg.jp/link/hsa/pathway通过该链接可以获得以下内容path:hsa00010hsa:10327path:hsa00010hsa:124path:hsa00010hs
weixin_43569478·2020-08-06 10:02

RabbitMQ学习笔记-第二章、核心概念

，并且RabbitMQ是基于AMQP协议的为什么选用RabbitMQ开源、性能优秀、稳定性保障提供可靠性消息投递模式（confirm）、返回模式（return）SpringAMQP完美的整合、API丰富集群模式丰富
一年而已·2020-08-05 03:54

神经网络架构搜索——可微分搜索（Fair-DARTS）

神经网络架构搜索——可微分搜索（Fair-DARTS）动机skip-connection富集现象skipconnections的不公平优势softmax的排外竞争部署训练的离散化差异（discretizationdiscrepancy
AI异构·2020-08-04 18:36

神经网络架构搜索——可微分搜索（ DARTS+）

动机方法实现早停准则1早停准则2实验结果CIFARTiny-ImageNet-200ImageNet华为诺亚方舟实验室的NAS工作，针对现有DARTS框架在搜索阶段训练过程中存在skip-connection富集现象
AI异构·2020-08-04 18:36

[Java Concurrency in Practice]第五章 基础构建模块

平台类库中包含了一个并发构建块的丰富集合，如线程安全的容器与同步工具。
Coding-lover·2020-08-03 20:45

Nature综述：鸟枪法宏基因组-从取样到数据分析——2万字带你系统入门宏基因组实验和分析

从取样到数据分析热心肠日报摘要正文图1.宏基因组分析流程概述附图1.用于规划宏基因组学研究的示例工作流程附框1.实验设计中的问题和解决方案鸟枪法宏基因组学研究方案设计样本采集和DNA提取表1.在测序之前富集微生物细胞和
刘永鑫Adam·2020-08-02 14:05

Microbiome：所谓的“富集培养”获得的微生物真的都是被“富集”出来的吗？

Microbiome：所谓的“富集培养”获得的微生物真的都是被“富集”出来的吗？第一作者：穆大帅通讯作者：杜宗军单位：山东大学官方新闻稿转自山东大学(威海)海洋学院官网https://mc.
刘永鑫Adam·2020-08-01 07:53

展望2018年云享富

云享富集团回顾2017，展望2018：1、云享富物联商城2017年8月强势出击。2、4个月时间，平台注册会员超过130万，遍布全球，包括中国大陆、港澳台地区、马来西亚、日本、韩国等地。
刘保财·2020-08-01 06:03

全球化，80%的人被边缘化

会上，与会者一致认为，全球化会加剧贫富差距，会使财富集中在全球20%的人手上，而另外80%的人被边缘化。那么，如何化解这80%的人和20%精英之间的冲突？
做个行动派1981·2020-08-01 06:56

RNA-seq分析简洁版

前面RNA-seq分析：从软件安装到富集分析部分已经把转录组全部流程走完了一遍，这次利用RNA-seq(2)-2:下载数据中下载的肝癌数据进行分析，不在赘述细节，所以有看细节的还是请去这里。
Y大宽·2020-08-01 01:43

我的校园微生活（151）孙纪洋:宁静沧桑，蓬勃不衰——我与育英那些事儿

同学们纷纷拿起笔，用富集着情感的文字或表达喜爱，或写下期待，或描绘着育校文化，或展现着育校风采。他们共同许下了美好祝愿—祝育校七十周年生日快乐。
志存心诚·2020-07-31 20:22

ChIP-seq实践(H3K27Ac,enhancer的筛选和enhancer相关基因的GO分析)

例如H3K4me2和H3K4me3修饰大多数富集在转录起始位点附近的启动子上激活基因表达，而H3K27me2和H3K
生信start_site·2020-07-31 10:22

R语言：qgg包

qgg包：一款大规模数量遗传和基因组分析的R包一、概述该包基于：假设基因组特征可能会富集影响性状的因果变体。根据以往的研究和不同的信息来源，可以分成几种基因组特征,如基因、染色体或生物途径。
谁曾经不是菜鸟啦·2020-07-30 22:03

武汉MEM培训：北大软微MEM提前面试问题汇总

社会约80%的财富集中在20%的人手里，而80%的人只拥有20%的社会财富。这种统计的不平衡性在社会、经
嘉禾博研袁老师·2020-07-30 08:27

富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO

前言一般我们挑出一堆感兴趣的基因想临时看看它们的功能，需要做个富集分析。虽然公司买了最新版的数据库，如KEGG，但在集群跑下来嫌麻烦。这时网页在线或者本地化工具派上用场了。
bioin·2020-07-29 17:06

何演婷和她的云享富之路

何演婷和她的云享富之路在大众创业，万众创新的时代潮流里，2016年，何演婷创立了云享富集团。以物联网、大数据、云计算等技术为支撑，在品质电商、生态养老、文化传播等领域都取得了初步的成绩。
趋势动车组·2020-07-29 13:49

红沁

【每日读玉】红沁红沁当然比黄沁更难得，它需要铁离子富集，毕竟，在土壤环境中，和田的红胶泥也不能保证形成红沁。
凤凰的星座故事·2020-07-29 10:04

2019-01-09

CRISPR-Cas9，然后Illumina测序gRNA的表现度，使用MaGeCK根据所有gRNA的平均log2倍数改变（LFC）和错误发现率（FDR）确定候选基因，使用超几何分布统计特异性消耗gRNA或富集
Mingyan_C·2020-07-29 05:47

TCGA|GEO可视化分析第2篇---KEGG|GO分析大全

那今天我和各位小伙伴深入的讲一下：（1）如何用clusterProfiler做KEGG|GO富集条形图，气泡图；（2）如何用enrichplot做gene-GOterms|gene-KEGGpathways
科研君·2020-07-28 22:18

R包对植物进行GO，KEGG注释

https://bioconductor.org/biocLite.R")BiocManager::install("clusterProfiler")library(clusterProfiler)##富集分析
weixin_30300225·2020-07-28 16:18

GSEA结果解读

上一篇GSEA可以做什么之后，继续进行结果解读1Enrichmentscore（ES）ES是GSEA最初的结果，反应全部杂交data排序后，在此序列top或bottom富集的程度。
Y大宽·2020-07-28 08:35

GSEA可以做什么

基因集富集分析GSEA（gene-setenrichmentanalysis）。这个操作并不难，主要就是准备符合GSEA要求的数据文件（本地的话4个），关于文件准备，可细见官方说明。
Y大宽·2020-07-28 06:46

云享健，云享富人的故事！

2017年7月16日，云享富集团董事长何演婷受邀参加了北京举办的“中国品牌创新峰会”。2017年8月31日，何演婷董事长得到中华人民共和国商务部副部长魏
云享健·2020-07-28 01:20

2020-07-26 脂质代谢+胶质瘤+生信=4分

GO和GSEA发现，神经胶质瘤（GBM）主要表现出糖鞘脂代谢进程的富集，而低级神经胶质瘤（LGGs）表现出磷脂酰肌醇代谢进程的富集。根据LGG和GBM之间脂质代
卅衣·2020-07-27 13:57

10X 靶向单细胞基因表达测序|| Panel文件与基本结果

靶向基因表达技术主要针对在测序前直接从单细胞RNA-seq库中富集的相关靶向基因。通过杂交捕获特异性富集感兴趣的靶向分子，使靶向基因表达能够在显著降低测序深度的情况下提供关于靶向基因表达的增强信息。
周运来就是我·2020-07-19 09:02

护士茶纪实52：重金属对人体的危害

而重金属具有富集性，很难在环境中降解重金属在人体内能和蛋白质及各
营养师露露·2020-07-16 05:15

GSEA-基因集富集分析

1.为什么写？网上教程一抓一大把，有的能重复，有的不能重复不了，很多原因。别人能做的不代表你能复制，实践出真知。不做搬运工，只写有用的，防止以后忘记。每个人理解不同，记录下来，供自己今后参考，顺便分享他人。2.GSEA基本概念GeneSetEnrichmentAnalysis思路：使用预定义的基因集（通常来自功能注释或先前实验的结果），将基因按照在两类样本中的差异表达程度排序，然后检验预先设定的基
bioin·2020-07-16 04:36

R 学习 - 散点图

散点图散点图在生物信息分析中是应用比较广的一个图，常见的差异基因火山图、功能富集分析泡泡图、相关性分析散点图、抖动图、PCA样品分类图等。凡是想展示分布状态的都可以用散点图。
生信宝典·2020-07-16 04:53

玖富钱包理财安全吗有哪些理财产品

玖富钱包是玖富集团旗下的子品牌之一，但在玖富的官网上对于玖富钱包的介绍比较少。根据小编了
榆树306陈百灵·2020-07-15 23:03

《国家为什么失败》读书笔记D7

第十四章《打破僵局》第十五章《理解繁荣与贫困》书摘：许多国家成为失败国家并非因为他们的地理或文化，而是因为汲取性制度的遗产，它将权力和财富集中到了控制国家的人手中，为动乱、冲突和内战开辟了道路。
哈皮波·2020-07-14 14:07

[NAR|2019] Cistrome-GO chip-seq富集分析

Cistrome-GO是对chip-seq数据得到的转录因子调控的基因进行富集分析的网站。
xhog·2020-07-14 06:06

斯里兰卡蓝宝石价格 斯里兰卡蓝宝石多少钱

斯里兰卡最大优势在于矿业和地理位置，它是一个宝石富集的岛屿，世界前五名的宝石生产大国，被誉为“宝石岛”。
玖叁宝石·2020-07-13 19:07
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