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核苷酸
TUNEL分析
TUNEL方法(末端脱氧
核苷酸
转移酶介导的dUTP-地高辛配基切口标记)源自完整固定的细胞核DNA裂解部位标记(如Gavrielietal.1992)。
实验小助手
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2024-09-12 15:14
遗传算法:启发自真实现象
用编程模拟自然系统作者:DanielShiffman译者:周晗彬ISBN:978-7-115-36947-5第9章目录9.1遗传算法:启发自真实现象1、目标我们的目标不是深入研究遗传和进化的科学原理,我们不会研究旁氏表、
核苷酸
大龙10
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2024-08-30 18:20
如何对利用GWAS关联到的SNP位点进行注释
GWAS(全基因组关联研究)关联到的SNP(单
核苷酸
多态性)位点注释是一个复杂的过程,涉及多个步骤,旨在理解这些位点在基因组中的生物学意义。
生信学习小达人
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2024-08-30 02:03
分析
学习方法
力扣_字符串10—重复的DNA序列
题目DNA序列由一系列
核苷酸
组成,缩写为‘A’,‘C’,‘G’和‘T’.。例如,“ACGAATTCCG”是一个DNA序列。在研究DNA时,识别DNA中的重复序列非常有用。
qweasdwxc
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2024-02-20 11:14
leetcode
算法
哈希算法
利用以比对好的氨基酸序列比对对应的
核苷酸
序列
1、将所有样品的CDS序列合并到一个文件cat*orfs.cds>all.cds2、使用seqkit在合集的文件中提取ID号相同的
核苷酸
序列seqkitcommonall.cdsOG0011069.fasta-ocommon.fasta
惊鸿影
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2024-02-20 07:24
187. 重复的DNA序列
所有DNA都由一系列缩写为A,C,G和T的
核苷酸
组成,例如:“ACGAATTCCG”。在研究DNA时,识别DNA中的重复序列有时会对研究非常有帮助。
雪上霜
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2024-02-19 12:41
2021-06-04 双管齐下——mTORC1调控m6A
mTORC1通路控制细胞类各种重要的代谢过程,包括
核苷酸
代谢,糖代谢以及蛋白质代谢等。而有关mTORC1在RNAm6A修饰相关过程中的功能机制尚不明确。
NAome
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2024-02-13 05:05
《计算分子进化》练习题探讨-第1章
第1章
核苷酸
置换模型1.采用JC69模型下的转换概率(公式(1.3))来验证Chapman-Kolmogorov定理(公式(1.4))。考虑两种情形即可:(1)i=T,j=T;(2)i=T,j=C。
Cherrieg
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2024-02-12 00:15
重复的DNA序列
问题:DNA序列由一系列
核苷酸
组成,缩写为'A','C','G'和'T'.。例如,"ACGAATTCCG"是一个DNA序列。在研究DNA时,识别DNA中的重复序列非常有用。
N. LAWLIET
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2024-02-11 18:24
java
javascript
开发语言
三维基因组|分子生物学简介 (1)
限制酶限制性内切酶在称为限制性位点的特定
核苷酸
序列处切割
冷冻工厂
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2024-02-09 09:10
程序人生
DNA replication stress --DNA 复制压力
有许多原因会导致复制压力,其中有:1.核糖
核苷酸
的错误掺入2.不寻常的DNA结构3.复制和转录同时进行的问题4.基本复制因子不足5.染色质处于压缩状态(Chromatininaccessibility)
寒山梦绮
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2024-02-07 18:58
理解生物信息学FASTA格式
在生物信息学中,FASTA格式是一种基于文本的、用于表示
核苷酸
序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来表示,且允许在序列前添加序列名及注释。
陈佶1
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2024-02-07 09:36
2021-12-10
突变的影响原创楠烟不可言图灵基因2021-12-1007:02收录于话题#前沿分子生物学机制撰文:楠烟不可言IF=53.242推荐度:⭐⭐⭐⭐亮点:这篇文章介绍了诱导多能干细胞(iPSC)存在线粒体单
核苷酸
变异
图灵基因
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2024-02-07 08:30
文件格式——FASTA
FASTA文件的格式在生物信息学中,FASTA格式(又称为Pearson格式)是一种基于文本的、用于表示
核苷酸
序列或氨基酸序列的格式。
oddxix
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2024-02-04 03:57
基因投错票,肿瘤来报道
其宗旨在于测定组成人类染色体(指单倍体)中所包含的六十亿对组成的
核苷酸
序列,从而绘制人类基因组图谱,并且辨识其载有的基因及其序列,达到破译人类遗传信息的最终目的。基
uhuh拒绝吸烟
·
2024-01-31 04:53
盘点结构变异在医学研究中的应用
迄今为止,绝大多数遗传研究都集中在单
核苷酸
变异(Single-nucleotidevariants,SNVs)上。
生信师姐
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2024-01-30 05:35
rgene_gamma计算2023-10-02
序列文件:fas或者phy
核苷酸
序列DNAdataset针对
核苷酸
序列DNAdataset,需要使用basemlbaseml.ctlse
土雕艺术家
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2024-01-27 21:40
rgene_gamma计算2023-10-02
序列文件:fas或者phy
核苷酸
序列DNAdataset针对
核苷酸
序列DNAdataset,需要使用basemlbaseml.ctlse
土雕艺术家
·
2024-01-27 21:40
如何使用SnapGene将DNA序列转换为氨基酸序列
在序列比对的过程中,常常需要将
核苷酸
序列转换为氨基酸序列,比对氨基酸是否有所突变。方法有很多,我常用的一种是通过SnapGene软件转换。
队长的生物实验室
·
2024-01-27 19:01
【卡梅德生物】SELEX技术|核酸适配体筛选技术
核酸适配体是一类能够与目标分子特异性结合的寡
核苷酸
序列,其结构和功能类似于抗体。与抗体相比,核酸适配体具有较小的体积和更容易工程化的优势,因此在生物医学研究中备受关注。
卡梅德生物
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2024-01-26 14:40
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业界资讯
网络
【新书抽奖】Go 语言进阶,这样学!
金字塔和狮身人面像由沙石堆砌而成,作为生物体遗传密码的DNA,也不过是由几种基础的
核苷酸
组合而成的。
qcrao
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2024-01-25 21:07
golang
开发语言
后端
高分文章热门测序结果验证方法,解决你的选择困扰
SangerSanger测序原理(图1)[1]:选择的DNA序列是用一个测序反应制备的,其中脱氧
核苷酸
三磷酸(dNTP)与终止的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)结合。
ee00dc6faab7
·
2024-01-25 09:26
羊奶粉的好处和功效 喝羊奶粉的十大好处
一、营养更多丰富的核酸、
核苷酸
、ATP、增强机体功能,丰富的磷脂、DNA、胆碱对脑力工作者、学生极佳,丰富的钾、镁,可预防中老年高血压病旨起的中风。
好项目高省
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2024-01-25 05:25
为什么错配基因修复(MMR)和微卫星不稳(MSI)会不一致?
学习精神的浩瀚Thevastnessofspirit人类细胞DNA在复制过程中可能整合错误的
核苷酸
,但随即会被选择性地从新生DNA链中移除,从而防止子代细胞出现基因突变,这种机理称为错配修复MMR。
介入小崔哥
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2024-01-20 05:00
文献翻译--ASpedia:人类选择性剪切的综合百科全书
然而,其他功能特征,如miRNA靶位点、磷酸化位点和单
核苷酸
变异直接受到选择性剪接的影响,并影响下游功能。因此,我们建立了一个ASpedia数据库:一个全面的人
ECHO1216
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2024-01-18 03:06
肿瘤为什么这么难治——肿瘤异质性背个锅
单
核苷酸
突变(SNV)和DNA拷贝数目变化(CNV)又可以表现为病人间异质性(inter-patient)、肿瘤间异质性(inter-tumour)和肿瘤内异质性(intra-tumour)。
生信杂谈
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2024-01-15 07:37
用R语言随便编一个模拟fasta序列
在生物信息学中,FASTA格式(又称为Pearson格式),是一种基于文本用于表示
核苷酸
序列或氨基酸序列的格式。
小贝学生信
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2024-01-12 22:31
全基因组关联分析(GWAS)protocol
全基因组关联分析(Genome-wideassociationstudy,GWAS)是应用基因组中数以百万级别的单
核苷酸
多样性(SingleNucleotidePloymorphism,SNP)作为分子遗传标记
只看不写_nathan
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2024-01-12 17:06
2022-06-30
NatureCompSci|AI辅助寡
核苷酸
靶点发现原创图灵基因图灵基因2022-06-3014:11发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析日本早稻田大学高级科学与工程研究生院的研究人员表示,他们已经引入了
图灵基因
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2024-01-12 10:23
GS-7340 hemifumarate
15232BAnti-infection-GS-7340(Tenofoviralafenamide)hemifumarate是Tenofovir(TFV)的前体,Tenofovir(TFV)是一种HIV-1
核苷酸
逆转录酶抑制剂
莫小枫
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2024-01-11 09:25
氨基酸密码子表及偏好性(2022-05-03)
密码子(codon)是指信使RNA(mRNA)分子中每相邻的三个
核苷酸
编成一组,在蛋白质合成时,代表某一种氨基酸的规律。信使RNA在细胞中能决定蛋白质分子中的氨基酸种类和排列次序。
会飞的老猫
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2024-01-07 18:42
LeetCode-187-重复的DNA序列
所有DNA都由一系列缩写为'A','C','G'和'T'的
核苷酸
组成,例如:"ACGAATTCCG"。在研究DNA时,识别DNA中的重复序列有时会对研究非常有帮助。
刻苦驴哝
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2024-01-06 20:19
shRNA慢病毒载体合成步骤
设计出对应的靶点、loop序列,酶切位点序列,详见LncRNA的shRNA慢病毒载体引物设计-一.引物退火引物先用10000g在4°离心2min,再按照说明书的要求,加入DEPC或者无酶ddH2O将寡
核苷酸
稀释为
种葫芦娃的小爷
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2024-01-05 15:21
Rosalind 037 Counting Subsets
题目背景:这个问题来自于计算生物学领域,特别是涉及到了遗传学中的一个概念,即单
核苷酸
多态性(SNP)。SNP是遗传学研究中常用的一种基因特征,用于区分不同的生物个体或群体。
Kyookk
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2024-01-04 07:34
生物信息
python
Rosalind 035 Creating a Distance Matrix
以下是问题和过程的详细说明:理解P距离:两个DNA字符串之间的p距离是指在相应位置上两个字符串不同的
核苷酸
比例。
Kyookk
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2024-01-04 07:03
生物信息
算法
Rosalind 036 Matching Random Motifs
这个值在0和1之间,表示任何单个碱基(
核苷酸
)是G或C的概率
Kyookk
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2024-01-04 07:03
生物信息
python
samtools
介绍SAM(序列比对/图谱)格式是用于存储大
核苷酸
序列比对的通用格式。
m1chiru
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2024-01-03 23:09
学习方法
day01 | 利用深度学习从基因转录数据中预测药物疗效
图1读文献之前的几个基础概念:1.基因表达谱(changesintranscriptionalprofiles,CTPs):是一种在分子生物学领域,借助cDNA、表达序列标签(EST)或寡
核苷酸
芯片来测定细胞基因表达情况
从你美丽的流域
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2024-01-02 02:14
微卫星不稳定性与肿瘤的诊断和治疗
微卫星不稳定性与错配修复缺陷微卫星(microsatellite)又称简单重复序列,是存在于基因组中的一些小片段
核苷酸
的重复序列,重复单位一般由16个
核苷酸
组成,15-65个这些序列在基因组上重复分布就构成了一段微卫星微卫星序列
Seurat_Satija
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2024-01-01 19:26
基因组survey——K-mer频谱
Kmer是从测序数据中滑窗提取出的长度为k的寡聚
核苷酸
序列,可以评估基因组大小、杂合度、重复序列比例等。
徐诗芬
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2024-01-01 16:52
【阅读记录】20190723-Gibson assembly
具体的原理是:1.核酸外切酶从5’端移除单个
核苷酸
,同源片段通过anneal(退火)搭在一起;2.DNA聚合酶以某一链为模板,补充缺失的片段;3.DNA连接酶形成磷酸二酯键,最后产生完整、没有连接缝隙的
琐云
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2023-12-31 15:33
Rosalind 001 Counting DNA Nucleotides
背景知识:核酸单体称为
核苷酸
,用作链长单位(简称nt)。每个
核苷酸
由三部分组成:糖分子,称为磷酸盐的带负电荷的离子,以及一种称为核碱基(简称“碱”)的化合物。
Kyookk
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2023-12-31 10:57
生物信息
python
DNA测序分析之Genetic variation和测序类型介绍
Geneticvariation分成4中类型:单
核苷酸
失常SNV(P),单
核苷酸
失常又分成了两种,其中一种是snp,也就是单
核苷酸
多态性,是在人群中有的突变;另一种就是SNV,是单
核苷酸
突变,是在个体中发生的突变
gtt儿_生物信息学习
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2023-12-31 07:26
神奇的基因
原来基因是一种叫
核苷酸
的物质,它会把父母的特征遗传给孩子。但是尽管如此,个人的脾气性格不全是爸爸妈妈遗传给你的,而是靠后天的努力和环境决定的。
玛卡巴卡你卡巴卡米咔蹦
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2023-12-30 19:29
2022-07-18
双脱氧
核苷酸
三磷酸(d
图灵基因
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2023-12-30 00:53
2023 年中国高校大数据挑战赛 赛题 B DNA 存储中的序列聚类与比对
DNA存储技术指的是使用人工合成的脱氧核糖
核苷酸
(DNA)作为介质进行信息存储的技术
BZD数模社
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2023-12-29 09:03
大数据
RAxml-8.2.X使用说明
ThisisRAxMLversion8.2.12releasedbyAlexandrosStamatakisonMay2018.简单示例:raxmlHPC-PTHREADS-s比对文件-n输出文件名-m替代模型(
核苷酸
或氨基酸替代模型
007goodmans
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2023-12-28 03:47
生信格式之fasta、fastq
要点一:fasta格式1、目的蛋白质序列与核酸(DNA/RNA)序列研究是生命科学的核心,前者的组成单位为20种氨基酸,后者则是
核苷酸
(DNA与RNA均有四种不同
核苷酸
);为了便于记录与研究,科学家们分别统一了二者组成单位的字母表示方法
小贝学生信
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2023-12-25 17:37
chatgpt告诉你如何设计RNA引物?
引物长度:一般来说,RNA引物的长度应该在18-24个
核苷酸
之间。引物长度不宜过长
伍鸿荣
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2023-12-24 19:48
生物学上描述DNA/RNA的长度常用的kb\nt\bp是指什么?
kb=千碱基对kilobase(pair).是kbp的简写nt=
核苷酸
nucleotidebp=碱基对basepair1Mb=1000kb=1000000bp
大大的世界和小小的人儿
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2023-12-20 15:08
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