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Linux
核苷酸
2019-07-06
不导致氨基酸改变的
核苷酸
变异我们称为同义突变,反之则称为非同义突变。一般认为,同义突变不受自然选择,而非同义突变则受到自然选择作用。在进化分析中,了解同义突变和非同义突变发生的速率是很有意义的。
YX_Andrew
·
2023-08-11 15:37
肿瘤突变负荷计算
不导致氨基酸改变的
核苷酸
变异我们称为同义突变,反之则称为非同义突变这个应该是可以理解到的,因为密码子的简并性,有的点突变虽然发生,但并没有改变密码子所编码的氨基酸,突变了个寂寞。
小洁忘了怎么分身
·
2023-08-10 20:07
LD连锁不平衡和
核苷酸
多样性(pi,π)的关系
在此,我想说一下,LD曲线和
核苷酸
多样性的图的问题。一般来说,LD连锁程度越高,表明两个SNP之间的相似度越高,那么,对于PI值来说,SNP的多样性就降低了。
闲暇的逮虾户
·
2023-08-09 16:06
PGCGAP v1.0.35版本更新
Oxfordreads或PacBioreads作为输入,可以完成基因组组装、基因预测和注释,并可以进行比较基因组学分析,包括构建单拷贝核心蛋白进化树以及单拷贝核心基因SNPs进化树,泛基因组分析与进化树构建,全基因组平均
核苷酸
一致性
了尘兰若
·
2023-08-04 10:39
gwas snp 和_GWAS | 原理和流程 | 全基因组关联分析
应用基因组中数以百万计的单
核苷酸
多态;SNP为分子遗传标记
weixin_39978101
·
2023-08-02 14:54
gwas
snp
和
GWAS 基本概念
全基因组关联分析GWAS(Genome-wideassociationstudy)应用基因组中数以百万计的单
核苷酸
多态;SNP为分子遗传标记,进行全基因组水平上的对照分析或相关性分析,通过比较发现影响复杂性状的基因变异的一种新策略
wangchuang2017
·
2023-08-02 14:24
GWAS
其他
生物信息学
基因组信息学的关键是“读懂”基因组的
核苷酸
顺序,即全部基因在染色体上的确切位置以及各DNA片段的功能;同时在发现了新基
纵横生长
·
2023-07-29 08:00
PSP - 使用 MMseqs2 工具快速搜索蛋白质序列数据库 (GMGC)
spike.blog.csdn.net/本文地址:https://spike.blog.csdn.net/article/details/131934642MMseq2是非常强大和高效的生物信息学软件,可以在极短的时间内对大规模的
核苷酸
和蛋白质序列进行搜索和聚类
SpikeKing
·
2023-07-28 18:41
AI
for
Biotech
蛋白质数据库
GMGC
MMseq2
SmallBFD
TWAS分析与GWAS分析有什么不同
GWAS主要关注基因组上的单
核苷酸
多态性(SNP)与疾病或其他复杂特征之间的关联。通过对大量基因组和表型数据的关联分析,可以帮助我们找到与疾病或特
木得感情的程序员
·
2023-07-27 12:06
人工智能
药物设计学笔记:基础篇
.药物设计的分子基础2.药物设计的理论基础1.药物设计的分子基础化学小分子药物与生物大分子靶标之间相互作用是药物设计的分子基础临床所用的药物50%都属于手性化合物,这是因为药物靶标的基本单元如氨基酸或
核苷酸
都是手性结构区分构型
_森罗万象
·
2023-07-27 10:29
读书笔记
CADD
单细胞CNV分析--CopyKAT
拷贝数目多态),是由于基因组发生重排而导致的大小介于1kb至3Mb的DNA片段的变异,是基因组结构变异(SV)的组成部分,其突变率远超过SNPs(SingleNucleotidePolymorphisms,单
核苷酸
多态性
七哥就是我
·
2023-07-22 04:51
引物合成原理及纯化方式选择
引物合成过程 寡
核苷酸
(后面简称引物)的制备是通过使用DNA合成仪完成的,合成仪本质上是一套由计算机控制的试剂递送系统。
临窗听风雨
·
2023-07-22 02:37
Seurat4.0系列教程21: 结合Cell Hashing分析双细胞
CellHashing由NYGC技术创新小组与Satija实验室合作开发,使用寡
核苷酸
标记的抗体标记细胞表面表达的蛋白质,在每个单细胞上放置一个"样本条形码",使不同的样品能够一起多路复用,并在单次实验中运行
Seurat_
·
2023-07-21 08:33
分子病概论
由DNA分子的
核苷酸
改变导致蛋白质分子结构或者合成数量异常,直接引起机体功能障碍的一类疾病称为分子病。
嘿嘿嘿就是嘿嘿嘿啊
·
2023-07-20 08:27
了解Azido TAT,使用铜催化的叠氮化物反应修饰Tat肽,以下内容查看详细信息!
资料编辑|陕西新研博美生物科技有限公司小编MISSwu【产品描述】Azido-TAT中Tat肽已被证明具有优异的细胞穿透性,可以增强对特异性靶向疾病的诊断和寡
核苷酸
的吸收。
简单科研
·
2023-07-19 20:38
螯合剂
其他
01 甲基化基础知识——学习于生信技能树公众号
甲基化基础知识基础知识甲基化是表观修饰的一种表观遗传修饰是指对基因组功能的相关修饰,通过一系列生物学修饰改变基因的活性而不是DNA的
核苷酸
序列影响基因的表达。
whykm
·
2023-07-15 21:08
第一篇:DNA与染色体
(二)核苷(Nucleosides):糖与碱基之间以糖苷键相连核糖核苷脱氧核糖核苷(三)
核苷酸
(Nucleotides):核苷与磷酸合成核
艾叶
·
2023-06-19 00:34
甲基化知识点
表观遗传修饰是指对基因组功能的相关修饰,通过一系列生物学修饰改变基因的活性而不是DNA的
核苷酸
序列影响基因的表达。
斗战胜佛oh
·
2023-06-18 16:13
三行情书
我还是很喜欢你,像劫后余生,漂流过海终见陆地;我还是很喜欢你,像细雨洒落在热带与极地,不远万里;我还是很喜欢你,像太阳自转,无论朝夕;我还是很喜欢你,像鹿隐于深林茕茕孑立,怯级望极;我还是很喜欢你,像
核苷酸
组合排序
DeepinD
·
2023-06-18 15:55
了解D-Galactopyranose pentaacetate,CAS号25878-60-8的性质和应用
5g、10gCAS:25878-60-8分子式:C16H22O11分子量:390.34熔点:113°C沸点:451°C密度:1.30结构式:反应机理:D-半乳糖五乙酸酯用于通过酶促岩藻糖基化合成产生糖
核苷酸
简单科研
·
2023-06-14 17:15
糖化学
其他
生物信息学基础知识(一)
基本类型及测序技术一、类型1、
核苷酸
序列数据DNA:ATCGRNA:AUCG2、蛋白序列20种氨基酸排列的顺序3、其他(1)分子标记数据(2)生物芯片数据(3)生物表型数据二、测序技术1、一代测序主要是
jkl_bio
·
2023-06-10 23:39
python
linux
r语言
Gromacs安装
它的模拟程序包包含Gromacs力场(蛋白质、
核苷酸
、糖等),研究的范围可以包括玻璃和液晶、到聚合物、晶体和生物分子溶液。Gromacs是一个功能强大的分子动力学的模拟软件,其在模拟大量分
今天月亮不加班
·
2023-06-10 10:46
结构变异,动植物基因组学研究的下一个风口
长期以来单
核苷酸
多态性(SNP)被认为是遗传变异的重要部分,随着二代测序技术的蓬勃发展,更是展开其研究的霸屏模式,随着测序技术的发展,特别是第三代长读长测序的崛起,越来越多的研究开始关注结构变异,包括模式物种及非模式生物的种内和种间的结构变异
贝瑞科服
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2023-06-10 06:19
读书总结《自私的基因》(第二周1.13-1.19)
精读第一、二、三、四章姓名:崔宝荣日期:2020.1.19一、一段话概述前四章内容:基因是DNA(脱氧核糖核酸)分子上具有遗传效应的特定
核苷酸
序列的总称,是具有遗传效应的DNA分子片段。
晓崔_80a7
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2023-06-07 12:04
2020-07-25全基因组重测序基础及高级分析知识汇总
通过全基因组重测序,研究者可以找到大量的单
核苷酸
多态性位点(SNP)、拷贝数变异(CopyNumberVari
阿乜太帅
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2023-04-18 17:45
NMN是什么?|关于NMN,你想知道的都在这了
1.NMN中文全称烟酰胺单
核苷酸
,常温状态下是一种雪花状的粉末;2.近年来,NMN成分经过了充足的生物实验以及广范的学术论证,是目前国
那就更努力
·
2023-04-18 10:50
如何改变写进DNA中的懒惰?
造成这个差异的因素有两个:一个是单
核苷酸
的多型性,也就是说DNA中的一个碱基被另一个碱基取代了。
魏三猫
·
2023-04-18 08:07
leetcode187. 重复的DNA序列(map+滑动窗口)
187.重复的DNA序列DNA序列由一系列
核苷酸
组成,缩写为‘A’,‘C’,‘G’和‘T’.。例如,“ACGAATTCCG”是一个DNA序列。在研究DNA时,识别DNA中的重复序列非常有用。
FakeOccupational
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2023-04-17 04:40
笔记
算法
leetcode
数据结构
尊重,永远是相互的!
很快就很快就会进口
核苷酸
分公标志性不怎能形成不怎么吃不买川
强强不是很强
·
2023-04-15 09:53
10x Genomics文库结构知多少【3' v2 & V(D)J】
10xChromium平台的核心--NextGEM技术NextGEM技术NextGEM技术的核心--凝胶微珠凝胶微珠(GelBeads)表面上百万的寡
核苷酸
引物序列是多种建库策略得以高效实现的关键3'v2Libraries3
林枫bioinfo
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2023-04-14 18:26
高美高的北纬44°寻鲜之旅
专家们认为“鲜”是多种呈味
核苷酸
、氨基酸、多肽以及脂类的组合,是蛋白质的滋味,或者理解为蛋白质是鲜的主要来源。为什么要让宝宝吃得鲜?
高美高
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2023-04-14 16:42
BGI-College生信入门系列——3、数据库
上期在介绍GenBank格式时举了新冠病毒基因组的例子,仅一个S基因就长达3822nt(nucleotide,这里指
核苷酸
数),基因组全长接近3万个碱基。
华大基因学院
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2023-04-14 00:05
学习g:Profiler基因功能富集分析软件
GOSt用于分析flatorrankedgenelists以获得富集特征;g:Conver用于转换不同类别的基因标识符;g:Orth用于将基因映射到相关物种中的直系同源基因g:SNPense,它将SNP(单
核苷酸
多态性
Mingyan_C
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2023-04-13 23:49
全基因组关联分析GWAS
基础概念referencegenome,consensussequence"globalreferencegenometrackhub"(UCSC)(目前的序列比对算法需要考虑同一个位点有多种
核苷酸
的情况
雾雨Vik
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2023-04-13 09:04
生物学 100 问 | Ribosomal frameshifting
PRF信号是嵌入在mRNAs中的顺式作用元件,随机地将核糖体翻译到一个新的阅读框中(即+1或−1
核苷酸
)。
biogeeker
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2023-04-08 22:15
如何从NCBI中获得16S rRNA序列
收集了16SribosomalRNAsequence,可以进行下载:ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/dbimage.png解压后是已经建好索引的文件:image.png并没有
核苷酸
文件
scdzzdw
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2023-04-07 06:45
No.1 第三代测序单分子荧光测序之Pacbio 测序原理
测序原理:边合成边测序测序特点:1.四色荧光基团分别将四色荧光基团标记在脱氧
核苷酸
的磷酸基团的末端。当碱基配对完成之后,随着磷酸基团的掉落而掉落,并且不会影响后续的测序过程。
曾杰_788c
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2023-04-06 10:38
SRA数据库简介及使用方法
来源于SRA官网介绍SRA是NIH高通量测序数据的主要存档,并且是国际
核苷酸
序列数据库协作(INSDC)的一部分,该数据库包括NCBI序列阅读档案(SRA),欧洲生物信息学研究所(EBI)以及日本(DDBJ
正经昵称征集中
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2023-04-06 10:13
SRA数据库简介
简介SRA是NIH的高通量测序数据的主要档案,是国际
核苷酸
序列数据库协作(INSDC)的一部分,包括NCBI序列阅读档案(SRA),欧洲生物信息学研究所(EBI)和DNA数据库。日本(DDBJ)。
Forest_Lee
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2023-04-06 07:32
生物信息数据质控详解(全基因组)第一辑
目标全基因组关联研究(GWAS)在鉴定单
核苷酸
多态性(SNP)和表型特征之间的关联方面变得越来越流行。GWAS方法通常应用于社会科学。但是,需要仔细进行统计分析,并且需要使用专用的遗传学软件。
超级宇航员
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2023-04-05 04:09
2022-02-16
然而,目前的诊断方法,如RT-PCR(逆转录聚合酶链反应)、FISH(荧光原位杂交)、核型分析和SNP(单
核苷酸
多态性)阵列,往往无法检测基因融合。荷
图灵基因
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2023-04-04 18:13
2021-01-05腺苷5'-三磷酸简介
5'-三磷酸腺苷(ATP,56-65-5)是一种腺嘌呤
核苷酸
,由三个被酯化成糖部分的磷酸基团组成,存在于所有活细胞中。5'-三磷酸腺苷参与代谢过程和RNA合成的能量产生。
范德biofount
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2023-04-03 20:57
Fasta与Fastq格式文件
FASTA文件格式FASTA格式是一种用于表示
核苷酸
序列或多肽序列的文本格式。其中碱基对或氨基酸用单个字母来表示,且允许在序列前添加序列名及注释。该格式已成为生物信息学领域的一项标准。
Nemo_53e9
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2023-04-02 19:43
生物学基础知识------CDS与ORF
基因(Gene):指产生一条有功能的蛋白质或RNA所需的全部
核苷酸
序列。基因结构示意图编码区CDS(codingsequence):是指编码一段蛋白产物的序列,是与蛋白质密码子一一对应的DNA序列。
Han_zh
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2023-04-02 09:36
2020-12-08 CpG island CpG岛
fr=aladdinCpG岛CpG双
核苷酸
在人类基因组中的分布很不均一,而在基因组的某些区段,CpG保持或高于正常概率。
Koalaemu
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2023-04-02 04:41
新冠病毒在攻击什么?量子力学能不能派上用场!
RNA由核糖
核苷酸
经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖
核苷酸
分子由磷酸,核糖和碱基构成。RNA的碱基主要有4种,即A腺嘌呤、G鸟嘌呤、C胞嘧啶、U尿嘧啶,其中,U(尿嘧啶)取代了DNA中的T。
星弦科学
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2023-04-02 02:11
2021-09-18
免疫细胞激活调节剂的癌症疗法原创图灵基因图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制加州大学洛杉矶分校琼森综合癌症中心科学家的一项新研究发现,激活蛋白质STING(一种公认的免疫细胞激活调节剂)的新兴药物,会显著改变负责生成DNA
核苷酸
构建块的代谢途径的活性
图灵基因
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2023-03-29 13:45
抗衰老家族大起底,五大前体凭啥只有NMN火了(上)
NAD+全名烟酰胺腺嘌呤二
核苷酸
(氧化态),主要作用是线粒体和细胞核之间通信的酶。可以修复DNA,可以激活长寿基因。
丁别说
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2023-03-28 23:59
GWAS分析-说人话(1)什么是GWAS,都分析啥?
全基因组关联分析(Genome-wideassociationstudy)是指在人类全基因组范围内找出存在的序列变异,即单
核苷酸
多态性(SNP),从中筛选出与疾病相关的SNPs。维基百科链接:全基因组
医学小蛋散
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2023-03-28 03:06
DAY7-孟思博
测序相关知识集中充电测序过程和原理优秀的参考文章:《测序的世界》:https://www.jianshu.com/p/101c14c3a1d2第一代测序技术-Sanger法测序聚丙烯酰胺凝胶电泳能够把长度只差一个
核苷酸
的单链
孟思博
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2023-03-27 23:25
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