核苷酸

CPG岛

pG双核苷酸在人类基因组中的分布很不均一，而在基因组的某些区段，CpG保持或高于正常概率。
YX_Andrew·2023-03-24 18:27

生物学思维

生物大分子是由氨基酸、核苷酸等23个这样的有机物的小分子组成，这些小分子是基本的物质形态，并没有展现出生命
Justin只问耕耘·2023-03-23 09:27

DNA甲基化数据分析(一)

所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明，DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性
杨博士聊生信·2023-03-22 20:07

1 基因芯片到底是什么

芯片的类型cDNA芯片（cDNA微阵列）Oligo芯片（寡聚核苷酸微阵列）原位合成芯
油炸椒盐菠萝·2023-03-21 16:19

基础知识 — Exons,Introns,ORF,CDS,UTR,lncRNA,转录本,可变剪切,密码子,启动子,顺式作用元件,转录起始位点,终止子,转录因子,结构基因

核酸的单体结构为核苷酸。每一个核苷酸分子由三部分组成：一个五碳糖、一个含氮碱基（A,T,C,G,U）和一个磷酸基。如果五碳糖是脱氧核糖则为脱氧核糖核苷酸，此单体之聚合物是D
ytbao·2023-03-21 14:42

计算分子进化-搞懂PAML的正选择分析

我们应该知道组成蛋白序列的氨基酸对应的核苷酸突变可以分为两类，同义置换(synonymoussubstitution)和非同义置换
xuzhougeng·2023-03-21 09:03

细胞生物学

细胞的基本共性：1，相似的化学组成，各细胞的基本构成元素都是C,H,O,N,P,S,等几种，这些元素所形成的氨基酸，核苷酸，脂质和糖类是构成细胞的基本构件。
操控者·2023-03-20 12:39

2021-06-12

NMN抗衰老全世界关注佰斯成行业发展先驱β-烟酰胺单核苷酸是一种维生素B族衍生物，也是烟酰胺腺嘌呤二核苷酸（NicotinamideAdenineDinucleotide，NAD+）的前体之一。
小小狐狸猪·2023-03-20 10:26

序列比对软件 MUMmer 结果文件解读（三）

该系列主要介绍了MUMmer软件下核苷酸序列比对程序nucmer的使用，计算操作见前两篇推文；序列比对软件MUMmer快速上手（一）序列比对软件MUMmer高级使用（二）这一块主要解释一下比对的结果文件
风知秋·2023-03-20 09:56

易基因 | 原核DNA甲基化简述

该过程可以在不改变核苷酸序列的情况下改变DNA的转录。尽管自20世纪50年代以来，人们就已经知道DNA甲基化的存在，但其机理和作用仍在研究中。
易基因科技·2023-03-19 15:31

外显子测序简介及分析流程

对于试图揭示超过6,800种罕见疾病原因的遗传研究人员而言，外显子组测序能够识别单核苷酸变异体(SNVs)、小插入缺失(
Seurat_Satija·2023-03-17 00:25

【陪你学·生信】三、核苷酸序列数据库的使用（1）

这章内容将介绍如何使用GenBank。此数据库是国际协作核酸序列数据库（INSDC）的一部分，由美国国家生物技术信息中心（NCBI）主管，NCBI为美国国立卫生研究院的下属机构。GenBank和它的合作者（DNADataBankofJapan(DDBJ),EuropeanNucleotideArchive(ENA)和GenBankofNCBI）从全球各个实验室接收了超过百万种生物的数据。一、基本生
乔伊nikkie·2023-03-13 03:57

2021-06-12

NMN促进生命延长佰斯（Bswell）改善衰老机体如果说近几年最火的健康产品，那么非NMN(β-烟酰胺单核苷酸)莫属。NMN是近年来在国内外科研界高度关注和密集研究的前沿科技延缓衰老的物质。
小小狐狸猪·2023-03-11 19:54

NCBI Gene数据库中检索基因结构

变异包含很多种：单核苷酸多态性（SNP）、插入缺失突变（INDEL）、拷贝数变异（CNV）以及结构变异（SV）等。
weixinsuoxian·2023-03-10 14:11

常用生物学数据库

-------------------------------------------------------------EMBL（EMBLnucleotidesequencedatabaseEMBL核苷酸序列数据库
枫狂灬呆子·2023-03-10 03:19

群体遗传学统计指标——种群核苷酸多样性

理论种群核苷酸多样性，顾名思义指的就是核苷酸多样性，值越大说明核苷酸多样性越高。通常用于衡量群体内的核苷酸多样性，也可以用来推演进化关系。
EwanH·2023-02-24 04:03

10X Visium:空间转录组样本制备到数据分析

5000个含有数亿个寡核苷酸的数据点，用于捕获mRNA灵敏度高简单的仅需1天的组织和文
周运来就是我·2023-02-18 23:56

组装 → 分类注释→下游分析， 按步骤帮你整理宏基因组生信分析工具

组装和注释GenovoGenovo用于基因序列的从头组装，与其他短读长组装程序相比，Genovo可获得更多核苷酸碱基，识别/预测更多的基因，得到更高质量的
尐尐呅·2023-02-18 11:44

2022-11-01

表观基因组的共同进化原创存在一棵树图灵基因2022-11-0110:11发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文：存在一棵树IF=69.504推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：1、精确空间采样，同时分析来自相同个体癌变组织腺体和正常组织隐窝的单核苷酸变异
图灵基因·2023-02-17 13:14

使用partitionfinder分区建系统发育树

当我们用多个串联基因建树时，如果把多基因串联数据看做一个整体，只计算整体的核苷酸替换模型及参数，那么就是不分区建树，操作方法和单基因的建树相同，具体的操作方法参照之前写过的文章。
xiaoxianyu·2023-02-06 01:18

R包——Mutational Pattern

二核苷酸替换，而5-甲基胞嘧啶的自发脱氨导致cpg位点的c>t取代，因此，突变模式可以用来推断哪些变异
oddxix·2023-02-03 04:48

SyRI：从全基因组组装中找到基因组重排和局部序列差异

基因组差异从单核苷酸差异到复杂的结构变异。
wo_monic·2023-02-02 16:52

医维他教你快速便捷的备孕营养要点

叶酸在体内参与氨基酸和核苷酸的代谢，
文静而又秀气的青柠屋·2023-02-02 04:00

Formation of unusual sugars: mechanistic studies and biosynthetic applications

关键词脱氧糖生物合成机理抗生素组合生物摘要:稀有糖羟基被HNH2烷烃链取代NDP葡萄糖是前体参与C-2C-3C-4C-6脱氧糖合成的酶核苷酸转移酶识别结合底物类似物糖基转移酶识别多种底物介绍:碳水化合物
拧巴小姐·2023-01-31 02:28

SSR、SNPs、RAPD和AFLP的概念

SNPs的概念、检测与应用SNPs是SingleNucleotidePolymorphisms的缩写，称为单核苷酸多态性。
天明豆豆·2023-01-30 10:30

生信常用文件格式

2021.6.61.序列格式1.1fasta简介一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。
lkj666·2023-01-30 09:48

i6mA-DNC:基于深度学习的二核苷酸表示预测水稻基因组DNA n6 -甲基腺苷位点

i6mA-DNC:基于深度学习的二核苷酸表示预测水稻基因组DNAn6-甲基腺苷位点摘要一、简介二、材料和方法1.基准数据集2.提出的模型3.绩效评估3.1交叉验证三、结果与讨论四、预测器模型的web服务器摘要
Super齐·2023-01-30 08:08

CD-Hit 生信 碱基序列去除冗余的方法

1.CD-Hit介绍官方介绍：CD-HIT是一个非常广泛使用的程序，用于蛋白质或核苷酸序列的聚类和比较。
oyoli·2023-01-29 21:19

“长生不老药”NMN能吃吗？

挟“哈佛长生不老药”的名头C位出道，受多位哈佛教授包括诺贝尔奖获得者加持，据说能让人的身体机能从八十岁重回二十岁，这些都是对β-烟酰胺单核苷酸（NMN）这种膳食补充剂的描述。
e8a76a89b571·2023-01-26 03:32

变异记录文件格式 vcf

1.vcf文件概述vcf文件格式是变异结果存储的标准格式，一般多用于单核苷酸变异（SNV）或小片段的插入缺失（indel
新爷话数据·2023-01-07 16:33

【论文解读：bCNN-Methylpred: Feature-Based Prediction of RNA Sequence Modification Using Branch Convoluti】

序列修饰预测摘要1、介绍2、相关研究（1）CNN的一个新分支：该网络结合了不同编码方案的特征，准确地预测了不同RNA序列中的m6a位点（2）一种新的编码方案：我们提出了一种新的环状编码方案，它考虑了RNA序列中四个核苷酸碱基的每一个可能的组合
HXH@·2023-01-06 16:57

Detection of transcription factors binding to methylatedDNA by deep recurrent neural network

表观遗传学普遍认为甲基化的核苷酸可以阻止转录因子与DNA片段结合。然而，最近的研究证实，一些转录因子具有与甲基化DNA片段相互作用
YZT8848·2023-01-06 16:27

论文解读《Detection of transcription factors binding to methylated DNA by deep recurrent neural network》

在表观遗传学中，人们普遍认为甲基化的核苷酸可以阻止TFs与DNA片段的结合。然而，最近的研究证实，一些转录因子有能力与甲基化的DNA片段相互作用，从而进一步调控基因表达。
HXH@·2023-01-06 16:27

数据库 | MitoPhen 数据库：基于人体表型进行线粒体 DNA 疾病诊断

mtDNA突变占线粒体疾病诊断的三分之二，其中绝大多数是由于mtDNA(mtSNVs)的单核苷酸变异(SNVs)引起的。MitoPhen数据库提供了已发表的mtDNA
SHANGHAILINGEN·2022-12-30 04:16

2020.9.12丨变异检测的原理&应用方向

变异检测的原理&技术要点定义：变异检测是指通过测序技术对某一物种个体或群体的基因组进行测序及差异分析，获得单核苷酸多态性SNP）、插入缺失InDel）、结构变异（SV）、拷贝数变异CNV）等大量的遗传变异信息用于开发分子标记建立遗传多态性数据库
穆易青·2022-12-29 03:05

RNA-ATTO 390|RNA-ATTO 425|RNA-ATTO 465|RNA-ATTO 488|RNA-ATTO 495|RNA-ATTO 520近红外荧光染料标记核糖核酸RNA

RNA-ATTO465|RNA-ATTO488|RNA-ATTO495|RNA-ATTO520近红外荧光染料标记核糖核酸RNA核糖核酸（英语：ribonucleicacid，缩写：RNA），是一类由核糖核苷酸通过
qiyueshengwu·2022-12-28 06:30

LncFinder | 非编码RNA的识别与分析神器！！！~

长链非编码RNA（lncRNA）指的是长于200核苷酸的不编码蛋白质的转录物（随着对ncRNAs的不对认知，这个概念也在不断修改）。
生信卷·2022-12-26 11:46

重复的dna序列

重复的dna序列DNA序列由一系列核苷酸组成，缩写为‘A’,‘C’,‘G’和’T’.。例如，”ACGAATTCCG”是一个DNA序列。在研究DNA时，识别DNA中的重复序列非常有用。
·2022-12-26 00:08

PSSM矩阵（位置权重矩阵）

构造PSSM的第一步：通过计算每个位置上每个碱基出现的次数来创建一个基本频率矩阵（PFM)第二步：标准化，用每个位置的原核苷酸计数除以序列数。构建位置频率矩阵给定一个长度为l的序列集合
zjy1125·2022-12-24 08:03

用于阿尔茨海默症分期早期检测的多模态深度学习模型

因此，我们使用深度学习对成像（磁共振成像（MRI））、基因（单核苷酸多态性（SNPs））和临床测试数据进行综合分析，将患者分为AD、MCI和对照组（CN）。
思影科技·2022-12-23 12:18

高粱根质膜中K~+ -ATPase活性重组入人工脂质体/硫修饰脂质体包裹的VEGF反义寡核苷酸的相关研究

小编在这里给大家整理了高粱根质膜中K~+-ATPase活性重组入人工脂质体/硫修饰脂质体包裹的VEGF反义寡核苷酸的相关研究，一起来看！
瑞禧生物小晓·2022-12-21 23:58

生物化学复习题II·核酸

2.核酸核苷酸的分类组成就不用出题了叭，大家高中应该都会，hy老师大概也这么想……3.在碱性条件下易被水解的核酸是_____。4.简述核苷酸聚合的方式，画出分子式的示意图。
寒山凝碧·2022-12-08 15:37

计算肿瘤突变负荷

数学表达为：:检测到的非同义突变的细胞变异个数:有效覆盖区域非同义突变：不导致氨基酸改变的核苷酸变异我们称为同义突变，反之则称为非同义突变。对于TMB和DNA损伤修复的一篇
生信小鹏·2022-12-07 23:42

基因组学重点整理

生物五界：动物、植物、真菌、原生生物和原核生物；生物三界：真细菌、古细菌、真核生物具有催化活性的RNA分子称为核酶（ribozyme）核酶催化的生化反应有：自我剪接、催化切断其它RNA、合成多肽键、催化核苷酸的合成大学课程资料中转群新基因的产生
Kyle942·2022-12-06 11:28

基因组学课件整理

SNP：即单核苷酸多态性，是由于基因组中等位位点上单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。
Kyle942·2022-12-03 14:50

GORMACS如何使用？一个方法快速完成动力学模拟计算

它的模拟程序包包含GROMACS力场(蛋白质、核苷酸、糖等)，研究的范围可以包括玻璃和液晶、到聚合物、晶体和生物分子溶液。在详细的操作步骤前，先简单看一下在北鲲云超算平台提交Gromacs作
北鲲云_beikun·2022-11-24 19:08

ANI-平均核苷酸一致性

ANI-平均核苷酸一致性ANIDDH(DNA-DNAhybridization)DNA分子杂交-曾经作为基因组水平上的原核物种界定的黄金标准已经被使用了将近50年。
songyi10·2022-11-19 01:45

Enzo Life Sciences HPV E6/E7 检测试剂盒说明书

该测定采用一种新颖的原位杂交技术，利用对E6和E7基因内的多个靶标特异的寡核苷酸探针混合物，以确保从大多数已知的高危HPV变体中检测这些转录物。
Sylvia_sc·2022-11-03 19:36

芯片数据分析笔记【01】 | 基因芯片的基本原理

基因芯片的测序原理是杂交测序方法，即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法，在一块基片表面固定了序列已知的靶核苷酸的探针。
【云森】·2022-10-31 21:24

智能DNA分子纳米机器人模型来了

文章目录前言用DNA分子造个机器人不仅能精准送药还能“杀敌”补齐短板方可迎来广阔前景前言智能DNA分子纳米机器人模型以短的单链DNA为骨架，长度通常为100个左右的核苷酸，通过自身折叠形成纳米尺度的结构
梁辰兴·2022-10-21 12:35
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