生物信息学r语言热图

AI人工智能深度学习算法：在生物信息学中的应用

AI人工智能深度学习算法：在生物信息学中的应用关键词：人工智能、深度学习、生物信息学、基因组学、蛋白质结构预测、药物发现、个性化医疗文章目录AI人工智能深度学习算法：在生物信息学中的应用1.背景介绍2.
AI大模型应用之禅·2025-01-27 16:52

R语言学习笔记5-数据结构-多维数组

R语言学习笔记5-数据结构-多维数组多维数组(array)介绍特点和用途创建多维数组多维数组的索引和切片多维数组的运算获取多维数组的维度和属性多维数组的合并和拆分多维数组的逻辑操作多维数组的转置和重塑多维数组的元素操作多维数组的统计函数多维数组的循环操作使用
Colin♛·2025-01-27 15:17

R语言学习笔记6-数据框

R语言学习笔记6-数据框数据框(DataFrame)介绍数据框用途创建数据框从矩阵创建数据框索引和切片添加和修改列数据框的预处理数据框的排序数据框的筛选处理缺失值应用函数处理数据重塑数据框使用dplyr
Colin♛·2025-01-27 15:17

利用MetaNeighbor验证重复性和跨物种分群

R语言中有一个包就可以利用直观的热图展示这一需求。
木与长清·2025-01-27 14:41

使用anyNA函数判断data.table中是否存在缺失值

在R语言中，data.table是一种强大的数据处理工具，常用于处理大型数据集。在数据分析和清洗过程中，经常需要检查数据是否存在缺失值。
独行侠WU·2025-01-27 14:40

科研绘图系列：R语言绘制基因富集GSVA热图（GSVA heatmap）

文章目录介绍加载R包数据下载导入数据数据预处理画图1画图2保存图片系统信息介绍科研绘图系列：R语言绘制基因富集GSVA热图（GSVAheatmap）加载R包library(tidyverse)library
生信学习者1·2025-01-26 22:51

学习R语言：数学运算与模拟

本文内容来自《R语言编程艺术》(TheArtofRProgramming)，有部分修改R内置很多数学函数和统计分布函数。
Mrrunsen·2025-01-26 14:50

【R语言】数学运算

一、基础运算R语言中能实现加、减、乘、除、求模、取整、取绝对值、指数、对数等运算。
关关钧·2025-01-26 13:18

Error in py_run_file_impl(file, local, convert) : ModuleNotFoundError: No module named ‘igraph‘

在HPC平台上跑我的R语言代码，结果一直报错说：Errorinpy_run_file_impl(file,local,convert):ModuleNotFoundError:Nomodulenamed'igraph
hyena_7·2025-01-24 16:56

R 语言科研绘图第 18 期 --- 箱线图-散点

为了便于使用，本系列文章介绍的所有绘图都已收录到了sciRplot项目中，获取方式：R语言科研绘图模板---sciRplothttps://mp.weixin.qq.com/s/QA_8LVqjkdg4A16zLonw4w
TigerZ 生信宝库·2025-01-24 05:54

【R语言】debug：run all 和 knit 有什么区别？

文章目录1.RunAll2.Knit具体区别示例使用`RunAll`使用`Knit`总结在R语言中，特别是在RMarkdown文档（.Rmd）中，RunAll和Knit是两个常用的执行代码的选项，但它们在功能和行为上有一些重要的区别
tsumikistep·2025-01-23 10:11

FunASR语言识别的环境安装、推理

目录一、环境配置1、创建虚拟环境2、安装环境及pytorch官网：pytorch下载地址3、安装funasr之前，确保已经安装了下面依赖环境:python代码调用（推荐）4、模型下载5、启动funasr服务二、客户端连接2.1html连接三、推理识别模型1、实时语音识别2、非实时语音识别一、环境配置源码地址：FunASRFunASR/README_zh.mdatmain·alibaba-damo-
山山而川_R·2025-01-23 08:55

R语言的编程范式

R语言的编程范式探讨引言R语言作为一种专门用于统计分析和数据可视化的编程语言，近年来得到了广泛的应用。
编程小筑·2025-01-22 21:22

R语言机器学习算法实战系列（十九）特征选择之Monte Carlo算法（Monte Carlo Feature Selection）

禁止商业或二改转载，仅供自学使用，侵权必究，如需截取部分内容请后台联系作者!文章目录介绍原理步骤下载数据加载R包导入数据数据预处理数据分割MCFS运行MCFS-ID过程混淆矩阵重要特征的RI最小阈值距离与共同部分收敛特征重要性排序选择重要特征构建特征依赖图提取重要特征基于重要特征构建随机森林模型混淆矩阵评估模型AUC曲线刻画模型在训练和测试数据集的表现总结系统信息介绍特征选择（FeatureSel
生信学习者1·2025-01-22 17:21

告别 Excel，拥抱 R 语言：开启数据分析新时代

为何弃Excel选R语言？强大的数据处理能力Excel简单易用，但其处理大数据集时，效率与能力着实有限。R语言作为专业的数据分析工具，处理成千上万的数据行不在话下，还支持丰富
码农老关【关东升】·2025-01-22 16:42

Spark GraphX原理与代码实例讲解

SparkGraphX原理与代码实例讲解作者：禅与计算机程序设计艺术/ZenandtheArtofComputerProgramming1.背景介绍1.1问题的由来随着互联网和大数据技术的迅猛发展，社交网络、推荐系统、生物信息学
AI大模型应用之禅·2025-01-22 07:34

R语言的面向对象编程

R语言的面向对象编程在现代编程中，面向对象编程（Object-OrientedProgramming，OOP）是一种重要的编程范式，它通过将数据和操作数据的函数结合在一起，来提高代码的重用性和可维护性。
2501_90183952·2025-01-22 02:57

在VScode设置R语言

在VScode设置R语言1.下载R语言和VScode2.安装所需要的插件3.下载对接RLSP的R包3.下载Radian4.设置VScode中的路径1.下载R语言和VScodeR语言官网：https://
weixin_39287540·2025-01-21 13:34

科研绘图系列：R语言绘制带有数值的地图（map with values）

文章目录介绍加载R包数据下载导入数据数据预处理画图画美国地图内嵌图合并图形保存图片系统信息参考介绍科研绘图系列：R语言绘制带有数值的地图（mapwithvalues）加载R包library(maps)library
生信学习者1·2025-01-21 10:04

R语言的正则表达式

R语言中的正则表达式：深度解析与应用引言正则表达式（RegularExpression），简称正则，是一种用于描述字符串模式的工具。
编程小筑·2025-01-21 10:33

Elixir语言的软件工程

Elixir语言的软件工程引言在当今的软件工程领域，选择编程语言和技术栈是一个至关重要的决策。随着分布式系统、实时应用和高并发场景的需求日益增加，Elixir语言应运而生。
十二日后·2025-01-21 07:10

基于R语言的DICE模型实践技术应用；评估气候变化对经济的影响以及不同减排政策的经济成本和效益

以下是一个关于DICE模型在气候变化影响评估中的实际应用案例，结合R语言代码进行讲解。实际案例：评估全球碳税政策的影响假设我们要评估一项全球碳税政策对经济增长、碳排放和气候变化的影响。
KY_chenzhao·2025-01-21 03:36

R语言的软件工程

R语言的软件工程1.引言随着数据科学的快速发展，R语言作为一种统计计算和图形绘制的编程语言，其在数据分析、可视化以及机器学习等领域的应用日益广泛。
BinaryBardC·2025-01-21 03:35

基于R语言的现代贝叶斯统计学方法（贝叶斯参数估计、贝叶斯回归、贝叶斯计算实践过程

专题一贝叶斯统计学的思想与概念1.1信念函数与概率1.2事件划分与贝叶斯法则1.3稀少事件的概率估计1.4可交换性1.5预测模型的构建专题二单参数模型2.1二项式模型与置信域2.2泊松模型与后验分布2.3指数族模型与共轭先验专题三蒙特卡罗逼近3.1蒙特卡罗方法3.2任意函数的后验推断3.3预测分布采样3.4后验模型检验专题四正态模型4.1均值与条件方差的推断4.2基于数学期望的先验4.3非正态分布
xiao5kou4chang6kai4·2025-01-19 17:37

R语言 | vscode R plot 不弹出图形窗口，看不到图怎么办？

原因未知。现在可以逐行执行了，但是要在浏览器查看图片：#install.packages("httpgd")library(httpgd)hgd()httpgd::hgd_url()#把输出的url复制到浏览器，查看接下来的绘图#同样打开设置面板，搜索r.plot.usehttpgd，勾选开启即可。x=seq(0,3*pi,by=0.1)plot(x,sin(x),type="l")支持拖拽改变长
biomooc·2025-01-19 02:44

R语言的并发编程

R语言的并发编程引言在现代计算中，如何有效地利用计算资源进行数据处理和分析已成为一个重要的研究方向。尤其在大数据时代，数据量的急剧增加让单线程处理方式显得力不从心。
技术的探险家·2025-01-18 21:31

R语言的计算机基础

R语言计算机基础引言R语言是一种用于数据分析、统计计算和图形显示的编程语言。它被广泛应用于统计学、数据科学、生态学、生物信息学等多个领域。
java熊猫·2025-01-18 06:23

R语言的正则表达式

R语言中的正则表达式详解引言在数据分析和处理过程中，文本数据占据着重要的角色。为了从这些文本数据中提取有价值的信息，正则表达式（RegularExpressions）便成为了一种强有力的工具。
代码驿站520·2025-01-18 06:52

Web APP 阶段性综述

在医学与生物信息学领域，WebAPP扮演着重要角色。在生物信息学领域，诸多工具以WebAPP的形式呈现，相较之下，医学领域的此类应用数量相对较少。
预测模型的开发与应用研究·2025-01-18 00:09

21章5节：如何绘制三维曲面图、三维球面图和三维曲面地形图

在R语言中，plot3D包提供了多个强大的函数，如surf3D和spheresurf3D，用于绘制这些三维图形。
DAT｜R科学·2025-01-16 14:08

【机器学习与R语言】1-机器学习简介

1.基本概念机器学习：发明算法将数据转化为智能行为数据挖掘VS机器学习：前者侧重寻找有价值的信息，后者侧重执行已知的任务。后者是前者的先期准备过程：数据——>抽象化——>一般化。或者：收集数据——推理数据——归纳数据——发现规律抽象化：训练：用一个特定模型来拟合数据集的过程用方程来拟合观测的数据：观测现象——数据呈现——模型建立。通过不同的格式来把信息概念化一般化：一般化：将抽象化的知识转换成可用
苹果酱0567·2024-09-15 09:43

R语言标准普尔500指数Garch(1,1)模型

一、例3.3标准普尔500指数的月超额收益率，从1926年开始，共792个观察值，如图所示。记rt为超额收益率，rt的样本ACF和rt2的样本PACF。在间隔为1，3时有少许序列相关性，但主要特征是平方序列显示的强烈线性相关性。例题建立garch(1,1)模型的过程：（1）应用arma(p,q)模型消除数据的线性依赖（2）在arma(p,q)模型基础上，建立garch(1,1)模型（3）改进g
ronghuilin·2024-09-14 22:51

R 地图绘制-比例尺与指北针

ggplot绘制mapR语言可以进行数据分析，也可以进行地图绘制，而且非常简洁，快速。
jamesjin63·2024-09-14 21:30

学习小组Day4笔记--王英芳

R语言基础准备工作电脑用户名需要是英文R基础，Rstudio人性化界面资源Rfordatasciencechapter1下载RandRstudio给自己一个全新的R语言环境R是什么一种变成语言，统计计算和绘图的环境
一万万万万·2024-09-13 19:51

R语言 基础笔记

起因:今天不知道要写什么。把之前的笔记复制一下。代码开头，导入:#清除系统变量rm(list=ls())#隐藏警告信息:options(warn=-1)#把当前目录，设置为工作目录。library(rstudioapi)current_folder_path0.0&ideology<10.0)分组聚合，类似groupby()df2<-aggregate(df1KaTeXparseerror:Exp
waterHBO·2024-09-13 15:38

R语言包AMORE安装报错问题以及RStudio与Rtools环境配置

在使用R语言进行AMORE安装时会遇到报错，这时候需要采用解决办法：'''AMORE包安装，需要离线官网下载安装包：Indexof/src/contrib/Archive/AMORE(r-project.org
卡卡_R-Python·2024-09-13 14:29

生态位宽度计算&可视化展示（R语言）

生态位宽度是指物种（或其它生物单位）在群落中所利用的各种不同资源的总和。物种的生态位越宽，该物种的特化程度就越小，倾向于泛化种（generalistspecies）；物种的生态位越窄，倾向于是一个特化种（specialistsspecies）。本篇所使用为生态位宽度指数即**Levins的生态位宽度指数。**（除此之外也有用shannon指数）#安装并加载必要的包if(!requireNamesp
光疏介质·2024-09-12 17:12

R语言多项逻辑回归-因变量是无序多分类

因变量是无序多分类资料（＞2）时，可使用多分类逻辑回归（multinomiallogisticregression）。使用课本例16-5的数据，课本电子版及数据已上传到QQ群，自行下载即可。某研究人员欲了解不同社区和性别之间居民获取健康知识的途径是否相同，对2个社区的314名成人进行了调查，其中X1是社区，社区1用0表示，社区2用1表示；X2是性别，0是男，1是女，Y是获取健康知识途径，1是传统大
医学和生信笔记·2024-09-12 09:22

Protocol Buffer编译器安装

该站点上的大多数示例代码都使用protocolbuffer语言（proto3）的版本3。protocolbuff
雪域迷影·2024-09-12 03:22

R语言自学笔记-2内置数据集

#b站视频——R语言入门与数据分析#内置数据集#固定格式的数据（矩阵、数据框或一个时间序列等）#统计建模、回归分析等试验需要找合适的数据集#R内置数据集，存储在，通过help(package="datasets
实验室长工·2024-09-12 00:36

# Seaborn热图修改画布大小|Seaborn热图修改横纵坐标大小|Seaborn删除注释|Seaborn删除调色板|Seaborn注释添加标注文字|Seaborn删除刻度线

Seaborn热图修改画布大小|Seaborn热图修改横纵坐标大小|Seaborn删除注释|Seaborn删除调色板|Seaborn注释添加标注文字|Seaborn删除刻度线查看图片importmatplotlibaspltplt.show
Red Red·2024-09-11 09:30

在TCGA上下载数据并且进行处理

使用R语言脚本对数据进行处理，将其提取为genesymbol和样本的数据，推荐看一下该博主处理数据！！真的非常详细！他R语言脚本在这个链接里
Red Red·2024-09-11 09:00

R语言-非结构化数据-文本数据读入

#2.2.2非结构化数据-文本数据读入rm(list=ls())#清空工作空间##1.读入简单文本数据###假如数据包含大量经过结构化的文本数据#只需按照读入csv等标准式数据的方法读入#例：novel=read.csv("novel.csv",fileEncoding="UTF-8")head(novel)##2.用readtable读入文本###文本数据普通读法test=read.table(
pdc31czy·2024-09-10 22:44

Coding and Paper Letter（十四）

1Coding:1.R语言包ungeviz，ggplot2的拓展包，专门用来作不确定性的可视化。ungeviz2.计算机图形学相关开源项目。计算机图形学光线追踪开源项目C++源码。
G小调的Qing歌·2024-09-10 13:10

r语言做绘制精美pcoa图_R语言高级绘图 — ggplot2

2)PCA的作图PCA主成分分析，可以将高维数据进行降维处理。我们的OTU表格就是典型的高维数据，可以对其进行降维处理得到主成分PC1和PC2，然后将所有样品都分解到这两个成分方向，进行散点绘图，可以直观的看出样品间的差异。首先需要一系列的统计处理，然后用ggplot2进行绘图，过程如下：#加载需要的三个包(需要先下载，再加载)>library(ade4)>library(ggplot2)>lib
weixin_39560002·2024-09-10 06:59

紫苑花

图片发自App没有牡丹的富贵没有玫瑰的娇艳默然怒放在旷野悄悄地散发着自己的光和热图片发自App图片发自App
caoxia·2024-09-10 00:46

科研绘图系列：R语言扩展物种堆积图（Extended Stacked Barplot）

介绍R语言的扩展物种堆积图是一种数据可视化工具，它不仅展示了物种的堆积结果，还整合了不同样本分组之间的差异性分析结果。
生信学习者1·2024-09-09 16:10

科研绘图系列：R语言柱状图分布（histogram plot）

文章目录介绍加载R包读取数据画图介绍柱状图（BarChart）是一种常用的数据可视化图表，用于展示和比较不同类别或组的数据。它通过在二维平面上绘制一系列垂直或水平的柱子来表示数据的大小，每个柱子的长度或高度代表一个数据点的数值。柱状图非常适合于展示分类数据的分布和比较。柱状图的特点：直观比较：柱状图可以直观地展示不同类别之间的数值比较，易于理解。分类展示：数据按照类别或组别进行分组展示，每个类别用
生信学习者1·2024-09-09 15:06

科研绘图系列：R语言富集散点图（enrichment scatter plot）

介绍富集通路散点图（EnrichmentPathwayScatterPlot）是一种数据可视化工具，用于展示基因集富集分析（GeneSetEnrichmentAnalysis,GSEA）的结果。横坐标是对应基因名称，纵坐标是通路名称，图中的点表示该基因在某个通路下的qvalue，可以简单理解为不同环境下的贡献大小。加载R包导入所需要的R包，在导入前需要用户自己安装。library(readxl)l
生信学习者1·2024-09-09 14:57

R可视化之ComplexHeatmap【四】：热图小方格个性化修饰、提取亚集及热图信息

热图系列我们已经有：R可视化之ComplexHeatmap【一】：颜色、标题、聚类R可视化之ComplexHeatmap【二】：行（列）顺序、行（列）名R可视化之ComplexHeatmap【三】：拆分今天分享
Bio_Infor·2024-09-09 11:19
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