生物信息学r语言热图第6页

R语言学习case10：ggplot基础画图Parallel Coordinate Plot 平行坐标图

step1:导入ggplot2库文件library(ggplot2)step2：带入自带的iris数据集iris<-datasets::irisstep3：查看数据信息dim(iris)维度为[150,5]head(iris)查看数据前6行的信息step4：利用ggplot工具包绘图plot5<-ggparcoord(data=iris,columns=1:4,groupColumn="Speci

早起CaiCai·2024-02-04 17:18

COX预测模型过程中，我踩过的那些雷

R语言做！初学者先进来看看！！！

皮肤科大白·2024-02-04 14:41

Cox等级资料是个坑

R语言做！初学者先进来看看！！！

皮肤科大白·2024-02-04 14:07

【年度盛会征稿】第二届全国精准营养与生命健康创新大会（PNHIC 2024）

“精准营养”研究借助多组学、可穿戴、影像学、生物信息学、人工智能等多种新技术和新理论对不同个体营养状况和需求开展系统研究，提供量身定制的膳食和生活方式干预和指导，从而更有效地促进健康和防控重大疾病。

搞科研的小刘选手·2024-02-04 14:41

跟着Nature Ecology&Evolution学作图:R语言ggmsa包展示多序列比对结果

论文https://www.nature.com/articles/s41559-022-01771-6#code-availability论文没有权限下载但是查看数据代码链接的时候发现github主页上提供了论文的下载链接论文中的图做的都非常好看，而且提供数据和代码，我们可以找来学习数据代码链接https://github.com/sebepedroslab/chromatin-evolutio

小明的数据分析笔记本·2024-02-04 12:23

Python | 常用的命令

1如何忽略报错信息2Python常见绘图系列代码2.1绘制对比箱线图2.2分区绘制图形2.3绘制相关系数图（热图）2.4绘制计数的条形图countplot2.5直方图和核密度图的合体distplot3绘图函数封装

写代码的阿呆·2024-02-04 11:30

R语言

对象R是一种基于对象(Object)的语言，所以你在R语言中接触到的每样东西都是一个对象，一串数值向量是一个对象，一个函数是一个对象，一个图形也是一个对象。

医学小咖成长之路·2024-02-04 09:19

cesium three性能比较_mapboxgl + three 动画 — 网格热图

一、前言最近工作上需要实现一个地图动画效果，简单的动画效果，是的，简单；不过在此之前，我并不认为它简单，需要有一点点的webgl、three.js的基础。效果大概就是一个网格起伏热力图的动画，像心跳一样、heartbeat……，像这样。Agridheatmap上面这个动效，它好像是基于一个gltf模型来做的，它不给地图交互，现在我们也想实现类似的效果，我们最后实现的效果跟这个效果比还有点差距，我们

weixin_39667801·2024-02-04 08:43

文件格式——FASTA

FASTA文件的格式在生物信息学中，FASTA格式（又称为Pearson格式）是一种基于文本的、用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。

oddxix·2024-02-04 03:57

2万个基因的生存分析

一、生存分析R语言基础我们将使用两个R包：survival用于计算存活分析survminer用于总结和可视化生存分析结果library(survival)library(survminer)结果展示：fit2

芋圆学徒·2024-02-03 23:33

R语言专题班（训练营：2023.10.23~10.30）

茗创科技专注于脑科学，涵盖（EEG/ERP，fMRI，结构像，DTI，ASL，FNIRS）等，欢迎留言讨论及转发推荐，也欢迎了解茗创科技的脑科学课程，数据处理服务及脑科学工作站销售业务，可添加我们的工程师（微信号MCKJ-zhouyi或17373158786）咨询。★课程简介★R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计计算和统计制

茗创科技·2024-02-03 23:03

高效R编程

这是《高效R语言编程》的学习笔记，前面的笔记在这里：https://blog.csdn.net/zd200572/article/details/115349366https://www.jianshu.com

zd200572·2024-02-03 23:10

scRNA-seq | Windows下的R、RStudio下载和安装

2020/5/25，下定决心用R语言了，Python虽然顺手但是生物信息学尤其是单细胞测序领域主要还是R的天下。（发现一篇Naturecommunication居然用R调用了Tensorflow！

切瓜少年·2024-02-03 20:37

【C++动态规划学习总结】

1.动态规划：初识动态规划（英语：Dynamicprogramming，简称DP），是一种在数学、管理科学、计算机科学、经济学和生物信息学中使用的，通过把原问题分解为相对简单的子问题的方式求解复杂问题的方法

PP mod·2024-02-03 17:30

软件系统架构黄金法则17：图形数据存储架构法则

禅与计算机程序设计艺术·2024-02-03 15:47

200826 Circ之旅3-构建人类基因组索引

注：后面可能还会构建鼠源的x参考：RNA-seq(5):序列比对：Hisat2人类基因组hg19、hg38构建bwa索引生物信息学习——bowtie2使用手册bwabowtie2salmonsubreadhisat2

dicklim·2024-02-03 15:13

Bokeh，一个超强交互式 Python 可视化库！

之前一直有小伙伴私信说让我多出些关于Python进行可视化绘制的教程，不想再学一门语言(R语言)进行可视化绘制。怎么说呢？

VIP_CQCRE·2024-02-03 13:23

2019-11-10 r语言安装包路径

开始安装了onedrive，然后不知怎么r语言安装包被放在了onedrive的盘里，不知什么时候就塞满了，无法安装新的包，所以想着怎么修改Rpackage的安装路径。

d22ec11ce43f·2024-02-03 12:31

R语言统计系列第12篇-泊松回归

今天是各类统计方法R语言实现的第12期，我们主要介绍泊松回归。泊松回归计数型，如某地区某年发生肿瘤患者的人数等，常用泊松回归，假设因变量Y服从泊松分布。

拾光_2020·2024-02-03 12:28

FigDraw 4. SCI 文章绘图之散点图（Scatter）

关注公众号，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你72篇原创内容-->公众号前两期简单介绍了R语言基础

90066456ace6·2024-02-03 11:30

R语言学习case9：ggplot基础画图（Scatter Metrics 矩阵散点图）

step1:导入ggplot2库文件library(ggplot2)step2：带入自带的iris数据集iris<-datasets::irisstep3：查看数据信息dim(iris)维度为[150,5]head(iris)查看数据前6行的信息step4：利用ggplot工具包绘图开发者们在ggplot2的基础上，还开发出了其它画图包，比如GGally。下面画图需要用到GGallyinstall

早起CaiCai·2024-02-03 07:45

利用R语言把某网站的所有那啥妹子都爬了下来！

不管怎么说，先上妹子##gilrclawerlibrary(RCurl)library(dplyr)library(rvest)library(downloader)setwd("E:\\girl")start=24656end=24657#end=25370base_url="https://m.nvshens.com/g/"myheader=c("User-Agent"="Mozilla/5.

jackGan·2024-02-03 07:03

R语言 | 数据分析与处理

目录一、随机抽样1.1将随机抽样应用于扑克牌1.2种子值1.3模拟骰子1.4比重的设置二、再谈向量数据的抽取——以islands为实例三、数据框数据的抽取——重复值的处理3.1重复值的搜索3.2which()函数3.3抽取数据是去除重复值四、数据框数据的抽取——缺少值的处理4.1抽取数据时去除含NA值得行数据4.2na.omit()函数五、数据框的字段运算5.1基本数据框的字段运算5.2with(

天下弈星~·2024-02-03 04:10

R语言分析任务：

有需要实验报告的可CSDN主页个人私信《大数据统计分析软件（R语言）》实验报告指导教师：专业：班级：姓名：学号：完成时间：实验目的掌握数据读入的各类函数；简单的数据处理：新变量的生成，数据集筛选排序，数据集合并

八块腹肌的小胖·2024-02-03 04:34

R语言粗暴的数据可视化#3 简单数据散点图

前言：让我们粗暴地解决问题！在研究的路上，很多东西不是难的，但是就是没有人带而已，我不想其他人也走我走过的弯路。如果有什么问题、需要R代码文件、示例数据集，欢迎在下方评论。如果连学不来，没时间学，不介意地话就私信我，我来做吧，文章带上名字就好～如图：散点图带回归线的散点图代码：#简单数据散点图x=c(20,30,40,10,55,37,77)y=c(1,2,4,5,2,3,4)z=c(2,4,6,

医学小蛋散·2024-02-03 04:37

统计（九）_置换检验

置换检验置换检验也称随机检验或重随机化检验步骤：（引自R语言实战，此时数据分为A和B两组，每组有5个得分）（1）与参数方

拾光_2020·2024-02-03 00:45

R语言统计系列第11篇-Logistic回归

今天是各类统计方法R语言实现的第11期，我们主要介绍Logistic回归。Logistic回归属于广义线性回归，因此我们从广义线性回归讲起。

拾光_2020·2024-02-02 23:37

R语言小作业-中级

首先需要完成R语言练习题-初级，在http://www.bio-info-trainee.com/3793.html#设置镜像，安装包，使用循环嵌套cran_packages<-c('tidyverse

weixinsuoxian·2024-02-02 22:48

【R语言】如何利用SNP的rs号提取坐标信息

前面给大家介绍了【R语言】获取基因组上某个区域内的SNP信息我们经常会从一些文献或者数据库里得到一些与疾病相关的SNP信息。

生信交流平台·2024-02-02 21:26

了解和绘制火山图

我都快愁死了......师兄：你不是学过R语言吗？师弟：道理倒是都懂，看书归看书，但是实际应用起来大脑就一片空白，完全没有构思......师兄：不怕，我这个有个完整的框架，你来学习一下？

纪伟讲测序·2024-02-02 21:39

代码+视频，R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图

今天我们使用R语言forestploter包优雅的绘制孟德尔随机化研究森林图。

天桥下的卖艺者·2024-02-02 13:13

R-kknn包-类别插值可视化绘制

今天这篇推文，我们就使用R语言的kknn包进行类别插值可视化绘制，主要知识点如下：R-kknn包简介及应用kknn模型结果可视化绘制所有完整代码都已整理之我们的线上课程，有需要的同学+vyidianshuyulove

数据魅力(DataCharm)·2024-02-02 10:53

R语言使用 c() 遇到的问题的解决---%in%

提取特定列或者行，使用c()时候提示错误：longerobjectlengthisnotamultipleofshorterobjectlength改成使用%in%%in%的使用：

初于青丝mc终于白发·2024-02-02 08:19

R语言|绘制NMDS图

非度量多维标度（NMDS）分析非度量多维标度（Non-metricMultidimensionalScaling，NMDS）是一种将多维空间的研究对象（样本或变量）简化到低维空间进行定位、分析和归类，同时又保留对象间原始关系的数据分析方法。与PCoA相似，NMDS都使用样本相似性距离矩阵进行降维排序分析，但NMDS侧重反映距离矩阵中数值的排序关系，NMDS图形常用作微生物群落研究的β分析。来看看R

维凡生物·2024-02-02 08:23

R语言杂谈（六）---处理矩阵及因子

ma<-matrix(c(1:4,6,9:15),nrow=3)###建立矩阵ma#给他一个名字colnames(ma)<-c("A","B","C","D")rownames(ma)<-c("x","y","z")ma##返回的结果是：ABCDx141013y261114z391215##针对矩阵的一些函数##按照行取平均值，超级实用rowMeans(ma)##按照行求和rowSums(ma)#

爱思考的照·2024-02-02 07:56

卡梅计算机生物专业怎么样,美国卡梅生物信息学专业录取案例

Carnegiemellonuniversity卡耐基梅隆大学computationalbiology计算机生物学Universityofmichigan,annarbor密歇根大学安娜堡分校bioinformatics生物信息学

weixin_39683863·2024-02-02 04:14

《R语言实战》自学笔记47-简单线性回归

数据准备df|t|)##(Intercept)0.938540.0749712.5191.75e-11***##v30.073250.016904.3330.000268***##---##Signif.codes:0'***'0.001'**'0.01'*'0.05'.'0.1''1####Residualstandarderror:0.07646on22degreesoffreedom##Mu

zjh9280·2024-02-02 02:36

eGPS_v1.0.5_两种形式的韦恩图你会了吗

专题汇总科学家发布生物进化与多组学综合分析软件eGPS开篇与使用示例一eGPS使用示例二eGPS使用示例三与其他五秒做一个热图你值得拥有eGPS下载地址：http://www.egps-software.org

沧浪之水v·2024-02-02 01:32

代写network、代做chocolate pipeline、代写R语言、R设计代写代做Python程序|代写 Statistics

ChocolateWillyWonkahasachocolatepipelinedistributionnetworkasshownbelow.Eachnodecorrespondstoasinglestoragetank,andthenumbersontheedgesrepresentflowcapacities(perhour)ofsomeunitoffluidchocolate.Noteth

foemfu8·2024-02-02 01:26

初步认识R语言

学习目的：1.安装R和Rstudio2.粗略了解R语言，干什么的，认识Rstudio的工作界面3.学会外观设置和基本操作4.用R做图image.png代码plot(rnorm(50))#必应查查plot

大王飞刀·2024-02-01 23:02

R语言：更改R包安装路径

1.RStudio-Tools-GlobalOptions，GeneralBasic中有R的基本信息，可以从这里看到（记不清了的）R的安装路径2.在路径里找到etc文件夹，其中Rprofile.site文件在这个文件中加入语句：.libPaths(c("需要的路径",.libPaths()))保存，关闭，重启Rstudio，包的默认路径就已经得到更改了。3.library(包)，都是正常的，之前安

Freemacon·2024-02-01 21:20

学习小组Day4笔记--LBB

今天的学习内容是R语言基础安装R（基础）和Rstudio（人性化一些的界面）注意电脑的用户名需要是英文，需要安装在C盘下载R语言https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/

LBB·2024-02-01 18:44

R语言入门笔记2.0

1.创建数据框在R语言中，可以使用data.frame函数来创建数据框。

Mrji1995·2024-02-01 16:21

2020-02-25 Day30 利用生物信息学分析鉴定乳腺癌的潜在关键基因和关键通路

在本研究中，我们旨在通过公共数据集的生物信息学分析来鉴定乳腺癌中潜在的病原性和预后差异表达基因（DEG）。

卅衣·2024-02-01 15:13

利用ggcor包绘制相关性组合图及环状热图

imageggcor包最初是因为能快速实现19年Science一组合相关性图(上图所示)变得流行起来，除此该包对热图、热图等等的可视化都是很方便快捷的，除了之前介绍过的几种相关性图几种方式，此包也是个不错的选择

单细胞空间交响乐·2024-02-01 14:57

《生物信息学：导论与方法》--新一代测序NGS：转录组分析RNA-Seq--听课笔记（十四）

第八章新一代测序NGS：转录组分析RNA-Seq8.1转录组介绍Atranscriptomeisacollectionofallthetranscriptspresentinagivencell.所谓转录组（transcriptome），是指特定细胞中全体转录本（transcript）的集合。也可以说是细胞特定时刻基因表达谱的一个快照（snapshotofexpressionprofile）在转录

盲人骑瞎马5555·2024-02-01 12:52

《生物信息学：导论与方法》----变异的功能预测----听课笔记（十一）

第六章变异的功能预测6.1问题概述Wheredidyourgeneticvariationscomefrom?inheritedfromparentsdenovomutations（70~100个新发突变）somaticmutations（体细胞突变，如癌症）有很多的先天的小儿疾病，就是这个孩子有一个Denovomutation，刚好落在了一个重要的基因上，它有可能有这种严重的疾病。肿瘤细胞一般都

盲人骑瞎马5555·2024-02-01 12:21

生信学习笔记1：学习如何用OPLS-DA分析代谢组数据（从入门到掌握）

它们广泛应用于化学计量学、生物信息学、经济预测等领域。偏最小二乘法（PLS）偏最小二乘法是一种多变量分析方法，主要用于找到两组数据（通常是预测变量集和响应变量集）之间的线性关系。

盲人骑瞎马5555·2024-02-01 12:18

代做R、Matlab代做、调试Matlab程序、R语言程序代写

准备工作以及注意点：将文件”Nachname_Vorname.R”命名为YuXu并保存.打开R并以”UTF—8“为编码分配对象”11605933“并执行代码，请用“football_rand.csv”分析所有数据。（同样在SPAA和SAS中）注意SPSS处理：阅读文件“football_rand.cvs”并另存为’Xu_Yu.sav”.这些数据文件应该和一个’SPSS-Syntax-文件“Xu_Y

pimatuo·2024-02-01 10:17

R语言入门笔记2.1

分支、循环与函数（1）1.if语句在R语言中，if语句用于根据条件执行不同的代码块。

Mrji1995·2024-02-01 07:43

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