靶基因测序

小麦雌蕊相关基因和网络的共表达网络分析

https://peerj.com/articles/13902/#摘要作物雄性不育具有重要的理论研究和育种应用价值。HTS-1的雄蕊转化为雌蕊或雌蕊状结构，是春季三雌蕊（CSTP）小麦中重要的雄性不育材料。然而，HTS-1中雌蕊发育的分子机制仍然是一个谜。11个小麦组织的RNA-seq数据来自美国国家生物技术信息中心（NCBI），包括CSTP的雄蕊和HTS-1的雌蕊和雌蕊。鲑鱼程序用于量化11种
请你喝好果汁641·2025-02-06 06:07

deseq2进行差异分析时的分组问题

它展示了如何在不同实验设计下进行差异表达分析，包括两组比较、两条件两基因型的交互作用，以及两条件三基因型的分析。
请你喝好果汁641·2025-02-06 06:07

BWA、Bowtie2、TopHat 和 HISAT2 这四款常用的序列比对软件

1.BWA（Burrows-WheelerAligner）BWA是一种常用的基因组比对工具，特别适合将低差异的短序列（如Illumina读取序列）比对到大型参考基因组上。
请你喝好果汁641·2025-02-06 06:07

R语言：将R语言中的Seurat数据对象转换为Python能处理的h5ad格式

背景在基因组学数据分析场景下，有些数据被保存为了R语言中的Seurat对象格式，我们的需求是将Seurat对象格式的数据转换为Python能处理的h5ad格式。
S.GJ·2025-02-06 04:52

单细胞数据h5ad格式转换成seurat

探序基因肿瘤研究院整理比如宫颈癌单细胞文章：Multiomicanalysisofcervicalsquamouscellcarcinomaidentifiescellularecosystemswithbiologicalandclinicalrelevance
探序基因·2025-02-06 04:20

ssGSEA中GSVA调用报错的解决方法

ssGSEA中GSVA调用报错问题expr是表达谱，表达数据矩阵，行是基因，列是样本。cellMarker是一个包含基因集的列表。
影林握雪·2025-02-03 18:30

人工智能在药物研发中的应用 - 从靶点发现和化合物筛选：利用AI深度学习技术加速药物研发流程

文章概述了AI在药物靶点识别、化合物筛选、药物设计优化等方面的应用，并详细介绍了机器学习和深度学习的基本原理。通过一个实操案例，展示了如何利用AI技术对化合物数据进行分析，预测潜在的药物候选物。
AI_DL_CODE·2025-02-02 10:50

三甲医院大型生信服务器多配置方案剖析与应用（2024版）

随着高通量测序技术、医学影像技术等的飞速发展，生物医学数据呈爆发式增长，这些数据涵盖了基因组、蛋白质组、代谢组等多个层面的信息，为医学研究和临床诊断提供了前所未有的机遇与挑战。
Allen_LVyingbo·2025-02-02 09:41

深度学习基因组学+机器学习单细胞分析，当下最火热研究方向！

深度学习已经被广泛应用于基因组学研究中，利用已知的训练集对数据的类型和应答结果进行预测，深度学习，可以进行预测和降维分析。
qwmb919·2025-02-02 07:25

隐马尔可夫模型（Hidden Markov Model, HMM） 和 最大熵马尔可夫模型（Maximum Entropy Markov Model, MEMM）

GenerativeModel）HMM通过建模整个联合概率分布P(X,Y)P(X,Y)P(X,Y)来进行序列标注，其中：X=(x1,x2,...,xn)X=(x_1,x_2,...,x_n)X=(x1,x2,...,xn)是观测序列
苏西月·2025-02-02 07:24

单细胞-第五节 多样本数据分析,打分R包AUCell

文件在单细胞\5_GC_py\1_single_cell\3.AUCell.Rmd1.基因rm(list=ls())load("g.Rdata")2.AUCellhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov
遗落凡尘的萤火-生信小白·2025-01-31 09:20

bulk-seq数据和单细胞数据的联合分析

作者，EvilGenius随着现在研究的不断深入，越来越多的情况需要我们对多种数据的联合分析，其中在单细胞没有出来之前，普通转录组（bulk-seq）的测序结果是非常多的，也解决了我们很多的生物学问题，
追风少年ii·2025-01-31 09:50

Python3 【集合】项目实战：3 个新颖的学习案例

基因序列比对文章推荐系统运行日志分析项目1：基因序列比对（集合运算与去重）项目描述在生物信息学中，比对两个基因序列的相似性。使用集合的交集和并集计算相似度。
李智 - 重庆·2025-01-30 14:09

创新药周报及靶点研发分析报告

报告关注靶点研发的关键性，详细介绍特定靶点如肿瘤抑制因子等的生物学功能和作为药物靶点的潜力，同时深入临床试验阶段的新药项目，讨论新药审批流程和政策环境。
魔都财观·2025-01-29 04:54

GSEA - Gene set enrichment analysis 基因集富集 | ORA - Over-Representation Analysis 分析原理与应用...

普通的转录组套路并不多，差异表达基因、富集分析、WGCNAnetwork以及一些
weixin_30294709·2025-01-28 18:30

AI人工智能深度学习算法：在生物信息学中的应用

AI人工智能深度学习算法：在生物信息学中的应用关键词：人工智能、深度学习、生物信息学、基因组学、蛋白质结构预测、药物发现、个性化医疗文章目录AI人工智能深度学习算法：在生物信息学中的应用1.背景介绍2.
AI大模型应用之禅·2025-01-27 16:52

科研绘图系列：R语言绘制基因富集GSVA热图（GSVA heatmap）

文章目录介绍加载R包数据下载导入数据数据预处理画图1画图2保存图片系统信息介绍科研绘图系列：R语言绘制基因富集GSVA热图（GSVAheatmap）加载R包library(tidyverse)library
生信学习者1·2025-01-26 22:51

神经网络入门推荐知识,神经网络入门书籍推荐

遗传算法是从代表问题可能潜在的解集的一个种群（population）开始的，而一个种群则由经过基因（gene）编码的一定数目的个体(individual)组成。
快乐的小肥熊·2025-01-26 16:06

分形、大自然的分形几何、数据可视化、Python绘图

本系列共有八章，分别为海岸线有多长，基因与
timedot-hj·2025-01-25 23:20

比亚迪进军具身智能：未来实验室的战略布局与挑战

比亚迪未来实验室的战略意义：汽车基因与智能融合比亚迪进军机器人领域并非偶然之举。其深厚的汽车制造经验和规模化生产能力，为其在机器人研发方面奠定
·2025-01-21 17:11

[ vulhub漏洞复现篇 ] Apache Tomcat 文件包含漏洞 (CVE-2020-1938)

目录博主介绍一、漏洞简介二、漏洞编号（选填）三、漏洞靶场（选填）1.vulhub靶场环境搭建2.切换到此靶场目录3.启动靶
_PowerShell·2025-01-21 11:12

K-means聚类：解锁数据隐藏结构的钥匙

其中，K-means聚类作为一种经典且实用的无监督学习算法，以其简单高效的特点，广泛应用于市场细分、图像分割和基因聚类等领域。
陈辰学长·2025-01-20 20:56

Vulnhub DC-1靶机攻击实战(一)

第三步、开始获取靶机信息  由于我们导入靶机之后，由于没有对应的账户和密码，所以我们无法进入到靶
nihui123·2025-01-20 16:47

DNA图谱分析：自动分析DNA图谱中的变异YOLOv5、YOLOv8、YOLOv10

目录引言项目背景与目标YOLO模型简介DNA图谱数据集准备YOLOv5、YOLOv8和YOLOv10模型训练与优化DNA图谱变异检测的实现UI界面设计与实现评估与优化未来展望结论完整代码实现1.引言随着基因组学的进步
2025年数学建模美赛·2025-01-19 23:58

解放双手，提高生产力，看我如何用 Python 实现自动化剪视频

  人类和动物最本质的区别就是人类懂的制造并使用工具，这是由上古时代一直延续至今的基因所决定的。  
程序猿-小菜·2025-01-19 17:59

Python AI教程之二十一：监督学习之支持向量机（SVM）算法

SVM具有很强的适应性，适用于各种应用，例如文本分类、图像分类、垃圾邮件检测、笔迹识别、基因表达分析、人脸检测和异常检测。
潜洋·2025-01-18 10:25

遗传算法与深度学习实战（26）——编码卷积神经网络架构

遗传算法与深度学习实战（26）——编码卷积神经网络架构0.前言1.EvoCNN原理1.1工作原理1.2基因编码2.编码卷积神经网络架构小结系列链接0.前言我们已经学习了如何构建卷积神经网络(ConvolutionalNeuralNetwork
盼小辉丶·2025-01-16 23:03

大数据新视界 --大数据大厂之大数据于基因测序分析的核心应用 - 洞悉生命信息的密钥

亲爱的朋友们，热烈欢迎你们来到青云交的博客！能与你们在此邂逅，我满心欢喜，深感无比荣幸。在这个瞬息万变的时代，我们每个人都在苦苦追寻一处能让心灵安然栖息的港湾。而我的博客，正是这样一个温暖美好的所在。在这里，你们不仅能够收获既富有趣味又极为实用的内容知识，还可以毫无拘束地畅所欲言，尽情分享自己独特的见解。我真诚地期待着你们的到来，愿我们能在这片小小的天地里共同成长，共同进步。本博客的精华专栏：大数
青云交·2025-01-16 16:21

Cell Insight | 单细胞测序技术又一新发现，可用于HIV-1和Mtb共感染个体诊断

国家感染性疾病临床医学研究中心/深圳市第三人民医院张国良团队携手深圳华大生命科学研究院吴靓团队，共同研究得出单细胞测序
尐尐呅·2024-09-16 10:28

GenVisR 基因组数据可视化实战(三)

3.genCov画每个突变位点附件的coverage，跟igv有点相似。这个操作起来很复杂，但是图还是挺有用的。可以考虑。由于我的referencegenomebuild是hg38BiocManager::install(c("TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene","BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38"))library(TxDb.Hsapien
11的雾·2024-09-16 05:47

python抓取网页内容401应该用哪个库_python3使用requests模块爬取页面内容入门

1.Requests唯一的一个非转基因的PythonHTTP库，人类可以安全享用。官网：http://cn.python-requests.org/zh_CN/
坂田月半·2024-09-15 18:25

潜意识通过负面情绪向你传达哪些信号

潜意识隐藏在海面之下，它聚集了人类数百万年来的遗传基因层次的信息，囊括了人类生存最
云手a·2024-09-15 05:59

小肠是身体的加油站，大肠是资源回收利用专家

近期，专家介绍目前有不少青少年肠道有问题，18岁得直肠癌的有家族遗传基因，也有经常烧烤吃腌制食品的，都是得直肠癌的因素。预防结直肠癌多吃新鲜食物、蔬菜和果。
乐乐飞扬·2024-09-15 05:17

2023-10-25

研究显示，孩子的身高，70%取决于父母的遗传基因，30%取决于后天因素。后天影响因素包括饮食、运动、睡眠、心理健康等。其中，睡眠对身高的影响很大。
帕金森大健康·2024-09-15 02:55

9.单细胞 RNA-seq：聚类分析

image目标：为了生成特定细胞类型的簇，并使用已知的细胞类型的标志基因来确定的簇的身份。
denghb001·2024-09-15 02:52

达尔文医学——《我们为什么生病》笔记完结篇

其原因在于：1、遗传因素很多疾病具有遗传性，人类的基因并不是完美无缺。一些致病基因是其只在生命晚期表现出危害，石器时期的人根本活不到这个年龄，自然选择也就没有机会清除掉。
蹉跎笑我·2024-09-14 22:59

hulk能量来源？

绿巨人形成原因是由于班纳受到了大量的伽马射线的照射，使其体内细胞基因发生变异，导致班纳的细胞能在过度活跃的情况下变成绿巨人的细胞。那么问题来了，绿
fourtwo·2024-09-14 20:48

高通量测序的数据处理与分析指北(二)--宏基因组篇

博客原文宏基因组篇前言之前的一篇文章已经从生物实验的角度讲述了高通量测序的原理，这篇文章旨在介绍宏基因组二代测序数据的处理方式及其原理。在正文开始之前，我们先来认识一下什么是宏基因组。
lantary·2024-09-14 12:52

山东大学小树林支教调研团青青仓木队

传承红色基因赓续红色血脉---希望小屋·山大担当暑期社会实践7月25日，山东大学“青青仓木”暑期线上支教队给枣庄欧峪小学四年级的小朋友们开展了“一起红色寻访”主题班会。第一个模块叫做“红领巾心向党”。
山东大学青青仓木队·2024-09-14 11:43

骨神经纤维瘤应该怎么治疗

目前已知本病在染色体上的基因定位。多发性神经纤维瘤病为胚胎形成早期阶段神经嵴分化和迁徙异常导致的多系统损害的、常见的常染色体显性遗传病。神经纤维瘤
乐一_d7c7·2024-09-14 02:34

用DESeq2包来对RNA-seq数据进行差异分析

可以是任意features的count数据，比如对各个基因的count，或者外显子，或者CHIP-seq的一些feature，都可以用来做差异分析。使用这个包也是需要三个数据：表达矩阵分组矩阵
Seurat_Satija·2024-09-13 23:49

群体遗传分析（一）#学习笔记

（通过观察值和理论值之间的差异性测验中性进化假说）群体遗传多态性与结构分析Locus：遗传座位，在群体中通常包含多个allele：等位基因，即遗传多态性。大多数的新突变是由于geneticd
kangroomoon·2024-09-13 20:12

王清霞平顶山网络焦点中级八期坚持分享第183天20180716

先天素质是由遗传基因和胎儿发育过程的环境因素之间复杂的相互作用决定的，后天环境主要是指儿童生长过程中的营养、睡眠和运动等。
懒洋洋_a7fc·2024-09-13 09:58

颠颠撞撞在人间，胜在有这一张嘴（好好说话）

“你儿子充分遗传了你的优秀基因，在学校混得风生水起，错误跟我无缘。”小华自夸起来。“上次打架呢？”老妈坐在
曹润青·2024-09-13 08:27

2022-05-07

比方说，买个油，我就想知道是不是转基因的，大多商品都没有明确展示。这几天，情况消停了不少。咱也多光顾光顾菜场商超了。对网购也慢慢淡了下来。
cholv正践录·2024-09-13 07:43

2021-08-13

集英雄和奸贼于一身的曹操，拼杀一辈子打下半壁江山，却没料到最钟爱的两个接班人曹昂和曹冲都先后早死，最后曹丕和曹植这对同胞兄弟上演了一出夺嫡大戏，笑到最后的是继承了曹操奸诈基因的曹丕。
白月梦闲谈·2024-09-13 06:46

2022-04-17

NatBiotech|组织中单细胞转录组的空间图谱原创图灵基因图灵基因2022-04-1707:03收录于话题#前沿生物大数据分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）已经彻底改变了单细胞水平上的基因表达研究
图灵基因·2024-09-12 15:12

生信人应该这样来装软件(未完待续)

P1优先选择二进制可执行软件来安装不同组学任务模块比对重要全基因组测序/外显子测序找差异和变异转录组相关计数软件安装规律：二进制，下载解压，全路径调用#C语言查看在还是不在whichmakewhichcmakewhichjavawhichperlwhichpython
dandanwu90·2024-09-12 15:50

谁让我眼小？

没办法，谁让我的遗传基因不好呢？爷爷是大眼睛、双眼皮；奶奶是单眼皮、小眼睛；爸爸是遗传了奶奶的基因。我长的特像爸爸，只要一出去，不认识的人见了我就叫小杨健。
我是眉尾旋·2024-09-12 13:57

守护童年，找寻人生最初的执著；追逐梦想，童年无憾，一生无怨

从呱呱坠地的那一刻起，很多东西都像命定一样，深刻在一个人的骨子里，籍由着遗传基因，在未来的岁月中，逐渐显山露水。环境对一个人的影响也特别重要，这也是为什么这几年，原生家庭这个概念如此火的原因。
安之腾·2024-09-12 11:23
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