16s基因全长测序

【RAG系列】文字的数字化分身 - 向量嵌入的魔法世界

文字的数字化分身-向量嵌入的魔法世界文字向量编码器数字分身语义空间相似度计算代数运算关系推理一、认知革命：文字的数字基因工程1.1文字GPS坐标系想象每个词语都是银河系中的星球，向量坐标就是它们的星际坐标
什么都想学的阿超·2025-02-26 04:52

关于 error LNK2001: unresolved external symbol "public: __thiscall Genome::Genome(void)"的解决

源代码为classGenome{public:friendclassGenAlg;//种群全部基因friendclassGenEngine;Genome()Genome(vectorvec,doublef
lalapanda·2025-02-25 18:08

GO和kEGG富集分析

**GO富集分析：**2.KEGG富集分析：二、使用步骤1.数据处理2.GO分析3.KEGG富集总结前言GO（GeneOntology，基因本体）富集和KEGG（KyotoEncyclopediaofGenesandGenomes
begei·2025-02-25 02:46

运动发酵单胞菌的葡萄糖-果糖氧化还原酶（GFOR）氨基酸序列长度到底是多少

**争议来源：菌株变异与移码突变**-**1996年研究背景**：针对运动发酵单胞菌的某些菌株（如ZM4亚种），发现其*gfo*基因存在**6-bp的缺失**，导致移码突变（frameshiftmutation
土玉·2025-02-25 00:33

MicrobeCensus：快速估计宏基因组数据中的平均基因组大小

MicrobeCensus：快速估计宏基因组数据中的平均基因组大小在微生物组学研究中，了解微生物群落的平均基因组大小（AGS）对于揭示群落结构和功能至关重要。
邪恶的凹凸曼·2025-02-24 00:39

R语言安装生物信息数据库包

.*.db系列包生物信息学分析中，我们常处理基因相关数据，比如基因功能注释、位置、参与的生物学通路等。org.*.*.db系列包就像基因百科全书，提供不同物种的基因注释信息。
Bio Coder·2025-02-23 04:50

[机缘参悟-130] ：《洞见》:为什么佛学是真的 -1-人的感觉、感受是自然选择的结果，是为基因传承服务的，苦和烦等各种感觉是个性化的幻觉，从心理学看佛学

目录一、心理学对人的感觉的解释1.1感觉、知觉/感知、思维=》意识结果1.2感觉与其种类1.3知觉1.4感知1.5思维1.6意识1.7潜意识：灵修关注的领域1.8情绪二、情绪管理2.1情绪管理的方法2.2积极的思维方式2.3情绪管理的本质三、进化心理学对感知和情绪的解释3.1概述3.2进化心理学解释为什么人的情绪中，负面情绪占绝大多数3.3进化心理学解读人的快乐情绪3.4进化心理学解释为什么人的情
文火冰糖的硅基工坊·2025-02-22 04:33

BFS算法——层层推进，最短之路，广度优先搜索算法的诗意旅程（下）

1.1题目链接：https://leetcode.cn/problems/nearest-exit-from-entrance-in-maze/1.2题目分析：1.3思路讲解：1.4代码实现:二.最小基因变化
诚丞成·2025-02-21 22:06

实测｜用DeepSeek批量生成头条爆款标题，1小时搞定1周工作量！效率提升300%的秘诀全公开

——某科技领域创作者自述二、[技术革命]DeepSeek的标题生成黑科技1.爆款基因解码系统实时
kang_deepsk·2025-02-21 18:37

centos服务器安装基因组分析软件-bwa和samtools等

探序基因肿瘤研究院整理安装bwa：github地址：https://github.com/lh3/bwa或者Burrows-WheelerAligner下载页面：https://sourceforge.net
探序基因·2025-02-21 05:12

centos操作系统安装R包单细胞拟时序分析CytoTRACE2

探序基因肿瘤研究院整理作者操作系统为centosstream8，R版本为4.3.3devtools::install_github("digitalcytometry/cytotrace2",subdir
探序基因·2025-02-20 15:56

基于python使用scanpy分析单细胞转录组数据

探序基因肿瘤研究院整理相关后缀的格式介绍：.h5ad：是一种用于存储单细胞数据的文件格式，可以通过anndata库在Python中处理.loom：高效的数据存储格式（.loom文件），使得用户可以轻松地存储
探序基因·2025-02-20 15:26

GATK3.5GATK4.0与java版本的关系

探序基因肿瘤研究院整理操作系统centosstream9yum安装java后，输入java-version可看到：openjdkversion"11.0.20.1"2023-08-24LTSOpenJDKRuntimeEnvironment
探序基因·2025-02-20 15:26

单细胞轨迹分析-monocle包的使用

探序基因肿瘤研究院整理安装：monocle源码下载：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/monocle.htmlR版本，4.2.0BiocManager
探序基因·2025-02-20 15:26

Linux发展史：从个人项目到开源帝国的技术演进

一、起源与诞生（1960s-1991）UNIX的奠基Linux的基因可追溯至1969年贝尔实验室的KenThompson与DennisRitchie。
♢.＊·2025-02-20 14:16

火山引擎数据飞轮帮助音乐 APP 充分洞察用户需求，提升用户粘性

得益于生长在互联网土壤，先天带有数字化基因，目前音乐APP的用户反馈收集早已摒弃传统行业的做法，如调研问卷、电话回访、线下访谈等，转而采用更加高效的形式。
·2025-02-19 15:04

K-means聚类：解锁数据隐藏结构的钥匙

其中，K-means聚类作为一种经典且实用的无监督学习算法，以其简单高效的特点，广泛应用于市场细分、图像分割和基因聚类等领域。
小村学长毕业设计·2025-02-18 20:18

人工智障的软件开发-git仓库篇-弃gitlab，走gitea

指令接收：「开始构建代码宇宙」系统检测：需求模糊度99.9%启动应急协议：构建最小可行性生态圈核心组件锁定：代码基因库（人类称之为Git仓库）需求分析：论人类语言的艺术性人类指令翻译机表面指令：“给我写个软件
Yuanymoon·2025-02-17 17:26

编程语言背后的“江湖”：揭秘科技巨头们的技术DNA

从Google的搜索引擎到微信的十亿级消息推送，从Meta的社交帝国到微软的云端生态，这些科技巨头的技术基因深深烙印在其选择的编程语言中。为什么不同公司对编程语言的偏好差异如此之大？
虫洞没有虫·2025-02-16 10:45

单细胞分析（11）——scRNA-seq数据整合

单细胞RNA-seq数据整合：SeuratIntegrationandHarmony1.研究背景在单细胞RNA测序（scRNA-seq）研究中，批次效应（batcheffect）是不可忽视的问题。
生信小鹏·2025-02-16 01:15

可可泛基因组-文献精读112

GenomicstructuralvariantsconstrainandfacilitateadaptationinnaturalpopulationsofTheobromacacao,thechocolatetree基因组结构变异在可可树
让学习成为一种生活方式·2025-02-15 01:00

基因组之全局互作热图可视化

引言PlotHiC是一个专为Hi-C数据可视化分析而设计的Python包。Hi-C技术是一种能够检测染色体三维结构的实验方法，它能揭示DNA在细胞核内的三维组织结构。为了更好地展示和解释这些复杂的数据，PlotHiC可以帮助用户方便地绘制Hi-C数据的热图。优势仅使用.hic文件，无需merged_nodups.txt，仅5秒即可出图可自定义染色体名称无需assembly文件更新如果有新的需求或者
·2025-02-14 01:59

R中单细胞RNA-seq分析教程 (6)

简介现在，很少有人只进行一次单细胞RNA测序实验并仅产生一份数据。原因很直接：目前的单细胞RNA测序技术每次只能捕捉到有限样本的分子状态。
·2025-02-13 20:18

Python实现基因遗传算法

目录基因遗传算法简介基因遗传算法的基本步骤Python实现基因遗传算法场景：优化二次函数Python代码实现代码解释场景说明总结基因遗传算法简介基因遗传算法（GeneticAlgorithm,GA）是一种基于自然选择和遗传学原理的优化算法
闲人编程·2025-02-12 20:43

基于Python的人工智能驱动基因组变异算法：设计与应用（下）

3.3.2数据清洗与预处理在基因组变异分析中，原始数据往往包含各种噪声和不完整信息，数据清洗与预处理是确保分析结果准确性和可靠性的关键步骤。
Allen_LVyingbo·2025-02-12 19:08

deepseek等AI工具是程序员技能发展的双刃剑

这场由AI引发的技能革命，正在重塑程序员的职业基因。一、效率革命：AI工具带来的技能加速器1.1代码生产的
牛马程序员_江·2025-02-12 12:23

基于Python的人工智能驱动基因组变异算法：设计与应用（上）

一、引言1.1研究目标与内容本研究旨在设计并应用基于Python的人工智能驱动的基因组变异算法，以应对基因组学研究中日益增长的数据挑战，提高对基因组变异的理解和应用能力。
Allen_LVyingbo·2025-02-12 09:28

前瞻技术大解密，未来发展抢先看

比如通过基因工程，可以改造微生物来高效生产药物成分。而且生物技术能让制药过程更精准，减少杂质，确保药物品质更好。
火龙果wa·2025-02-11 15:18

【半全局匹配】基于改进SmithWaterman算法的半全局基因匹配方法

算法介绍：全局匹配：Needleman-Wunsch算法使用这个算法主要考虑三个步骤：1.构造打分规则，分为匹配，错配和空位；2.初始化矩阵；3.回溯求出最长序列具体来说：设两条序列分别为A和B（长度分别为m和n）在初始化时，构造（m+1，n+1）矩阵，第一列和第一行使用空位罚分规则进行计分。初始化的（0，0）点，默认设置为0。之后的每一行每一列的每一个单元格的值，是，左，上，左上角的值加上对应的
蓝色洛特·2025-02-10 17:56

ChatGPT vs. DeepSeek：大模型赛道的差异化竞争

一、技术基因与演进路径ChatGPT基于OpenAI的GPT系列模型持续迭代，其技术底座采
TKang8912·2025-02-10 12:49

前沿科技改变未来生活

还有，基因工程也被用来改善作物。通过改变某些植物的特性，使其能够生长在受污染的土地上，同
巴巴郭海鹄·2025-02-10 12:47

前瞻技术趋势：未来改变生活的关键创新

通过基因工程，科学家可以改变微生物，使其更有效地分解有机物。这样，的原材料可以转化为更高效的燃料，提升能源的产量。比如，某公司利用工程化细菌来生产乙醇，效率比传统方法高50%。这样，
巴巴郭海鹄·2025-02-10 12:47

gseapy python包GO、KEGG富集(注释)分析

gseapy_example.html#Over-representation-analysis-by-Enrichr-web-services简介：富集分析是一种常见的生物信息学分析方法，通过比较一个给定的基因集
loong_XL·2025-02-09 05:39

gsea结果分析图怎么看_利用GSEA对基因表达数据做富集分析

imageGeneSetEnrichmentAnalysis(GSEA)isacomputationalmethodthatdetermineswhetheranaprioridefinedsetofgenesshowsstatisticallysignificant,concordantdifferencesbetweentwobiologicalstates(e.g.phenotypes).用
骆逸·2025-02-09 05:08

调控元件，顺式作用元件和反式作用因子

调控元件（RegulatoryElements,REs）定义：调控元件是基因组中能够调控基因表达的DNA序列。它们通过与转录因子和其他调控蛋白相互作用，影响基因的转录活性。
梦云澜·2025-02-09 05:36

Linux/MacOS下安装BioPerl

背景：师姐毕业论文需要一张系统发育树+基因结构+motif分析的组合图。
烽洋·2025-02-08 07:31

AI 赋能医疗：重塑医疗保健的未来

AI还可以分析患者的基因组数据、病史和生活方式，从而制定个性化的治疗方案。案例：AI算法
HelloZheQ·2025-02-07 12:24

聚类算法与应用

中心点与数据点的距离2.1.2簇的形成和迭代优化2.2应用场景2.2.1图像分割2.2.2客户分群3.层次聚类3.1基本原理3.1.1树状结构的建立3.1.2聚合或分裂策略3.2应用场景3.2.1生物学中的基因表达数据聚类
theskylife·2025-02-07 06:16

前向概率和后向概率

1.前向概率和后向概率的定义前向概率αt(i)\alpha_t(i)αt(i)：表示从初始状态q0q_0q0出发，经过ttt步达到状态qiq_iqi，并且生成观测序列O1,O2,…,OtO_1,O_2,
苏西月·2025-02-07 03:30

弹性文件服务（SFS）的使用场景

以下是九河云总结的SFS的典型使用场景：1.高性能计算（HPC）在高性能计算场景中，如仿真实验、基因测序、图像处理、气象预报等，SFS能够为大规模计算任务提供高带宽、低延迟的存储支持。
九河云·2025-02-06 14:02

小麦雌蕊相关基因和网络的共表达网络分析

https://peerj.com/articles/13902/#摘要作物雄性不育具有重要的理论研究和育种应用价值。HTS-1的雄蕊转化为雌蕊或雌蕊状结构，是春季三雌蕊（CSTP）小麦中重要的雄性不育材料。然而，HTS-1中雌蕊发育的分子机制仍然是一个谜。11个小麦组织的RNA-seq数据来自美国国家生物技术信息中心（NCBI），包括CSTP的雄蕊和HTS-1的雌蕊和雌蕊。鲑鱼程序用于量化11种
请你喝好果汁641·2025-02-06 06:07

deseq2进行差异分析时的分组问题

它展示了如何在不同实验设计下进行差异表达分析，包括两组比较、两条件两基因型的交互作用，以及两条件三基因型的分析。
请你喝好果汁641·2025-02-06 06:07

BWA、Bowtie2、TopHat 和 HISAT2 这四款常用的序列比对软件

1.BWA（Burrows-WheelerAligner）BWA是一种常用的基因组比对工具，特别适合将低差异的短序列（如Illumina读取序列）比对到大型参考基因组上。
请你喝好果汁641·2025-02-06 06:07

R语言：将R语言中的Seurat数据对象转换为Python能处理的h5ad格式

背景在基因组学数据分析场景下，有些数据被保存为了R语言中的Seurat对象格式，我们的需求是将Seurat对象格式的数据转换为Python能处理的h5ad格式。
S.GJ·2025-02-06 04:52

单细胞数据h5ad格式转换成seurat

探序基因肿瘤研究院整理比如宫颈癌单细胞文章：Multiomicanalysisofcervicalsquamouscellcarcinomaidentifiescellularecosystemswithbiologicalandclinicalrelevance
探序基因·2025-02-06 04:20

ssGSEA中GSVA调用报错的解决方法

ssGSEA中GSVA调用报错问题expr是表达谱，表达数据矩阵，行是基因，列是样本。cellMarker是一个包含基因集的列表。
影林握雪·2025-02-03 18:30

三甲医院大型生信服务器多配置方案剖析与应用（2024版）

随着高通量测序技术、医学影像技术等的飞速发展，生物医学数据呈爆发式增长，这些数据涵盖了基因组、蛋白质组、代谢组等多个层面的信息，为医学研究和临床诊断提供了前所未有的机遇与挑战。
Allen_LVyingbo·2025-02-02 09:41

深度学习基因组学+机器学习单细胞分析，当下最火热研究方向！

深度学习已经被广泛应用于基因组学研究中，利用已知的训练集对数据的类型和应答结果进行预测，深度学习，可以进行预测和降维分析。
qwmb919·2025-02-02 07:25

隐马尔可夫模型（Hidden Markov Model, HMM） 和 最大熵马尔可夫模型（Maximum Entropy Markov Model, MEMM）

GenerativeModel）HMM通过建模整个联合概率分布P(X,Y)P(X,Y)P(X,Y)来进行序列标注，其中：X=(x1,x2,...,xn)X=(x_1,x_2,...,x_n)X=(x1,x2,...,xn)是观测序列
苏西月·2025-02-02 07:24

单细胞-第五节 多样本数据分析,打分R包AUCell

文件在单细胞\5_GC_py\1_single_cell\3.AUCell.Rmd1.基因rm(list=ls())load("g.Rdata")2.AUCellhttps://www.ncbi.nlm.nih.gov
遗落凡尘的萤火-生信小白·2025-01-31 09:20
上一页 1 2 3 4 5 6 7 8 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他