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Amber
用Gromacs对蛋白与小分子进行模拟
本文主要参考Gromacs官方的教程,另外关于
amber
的部分主要参考了antechamber和acpype用Gromacs对蛋白与小分子进行模拟最重要的是要生成小分子的力场文件。
华山论剑
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2023-09-04 20:37
高中英语《In Search of the
Amber
Room》阅读课,逐字逐句,试讲稿
《InSearchoftheAmberRoom》试讲稿高中题目:阅读课材料:FrederickWilliamI,theKingofPrussia,couldneverhaveimaginedthathisgreatestgifttotheRussianpeoplewouldhavesuchanamazinghistory.ThisgiftwastheAmberRoom,whichwasgivent
风水宝地
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2023-09-04 03:03
第十章
amber
醒悟
amber
向Luna摆摆手示意她不用出来,然后再熟门熟路的从柜子里将领带
予羽千
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2023-08-27 18:07
有关梦想的一些随笔
28/07/2019寒腊(
Amber
)
安老伯儿
·
2023-08-22 13:26
【转】都是 “编码格式” 惹得祸
原文地址:https://wyiyi.github.io/
amber
/2021/01/13/unicode/coverdescription:"很多事来不及思考,就这样自然发生了"date:2021.02.2810
AlphaHinex
·
2023-08-20 14:23
Flutter 开发笔记
UIWidgetsInkWellonContainerwithbackground下面这种情况下,为InkWell设置的splashColor不会生效:InkWell(splashColor:Colors.
amber
aJIEw
·
2023-08-15 16:12
写给
Amber
的23岁
Amber
是我口语考试时用的英文名。它让我想起Perfume:TheStoryofaMurderer里Laura酒红色柔软的长发和某个夜晚与Grenouille四目相对时酝酿暧昧和杀机的惊鸿一瞥。
郎骑南瓜来
·
2023-08-14 03:04
MJ关键词检索
好看的颜色Cerulean(天蓝色)Magenta(洋红色)Goldenrod(金菊黄色)Emerald(翠绿色)Crimson(深红色)Turquoise(绿松石色)Lavender(薰衣草紫色)
Amber
是jin奥
·
2023-08-13 18:20
人工智能
计算机视觉
vol.29:金门有个北山,北山有个蔡依林 | 黑熊FM
这是「跨海声音纪录片」的第二部分,紧接上集在风狮爷看完《小丑》之后,打车前往北山洋玩艺民宿,主理人叫Jack,安柏(
Amber
)是他的姐姐。和他一起打理民宿。她六年前从台北回到金门,她父母的老家。
通米
·
2023-08-13 05:41
流式套接字学习笔记
本文首发于
Amber
'sBlog-流式套接字学习笔记流式套接字依托TCP协议提供面向连接的、可靠的数据传输服务,基于流的特点,使用流式套接字传输的数据形态是没有记录边界的有序数据流。
Ackerzy
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2023-08-09 10:01
「像美国人一样说英语」找朋友出去玩儿前,来自妈妈的突然关心
TEDGOESOUTFORTHEEVENINGTedleavestogovisithisgirlfriendAmber.Ted'smotherSusansaysshedoesn'treallylikeAmber.Shewisheshimagoodtimeanyway.Ted去看望他的女朋友
Amber
京酱Jing
·
2023-08-07 15:52
Max工作总结
今日工作总结1.打扫卫生开会30mins2.开教研会,学习几个新的游戏方式30mins3.第一大道搬回来橱子一个饮水机一个1.5h4.
amber
一对一,课后反馈1.5h相对来说内容比较简单,比较适合孩子
Max_pang
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2023-08-06 12:53
amber
复盘-20180216
年度目标:阅读10本以上书籍/每日运动,降低感冒频次;哈他瑜伽阴瑜伽结合练习,提高1个层次/幼儿成长,陪同养成自主自理习惯/理财,获取多种投资途径/工作尽责/家庭,好好有效沟通,包容,控制情绪化;本周目标:阅读完一本书籍/瑜伽2次/每日运动/冥想昨日复盘:瑜伽30分钟/亲子教育/游乐场大年三十陪着公婆看春晚到结束,顺便也忙着朋友圈抢红包/给朋友发新年祝福,支付宝五福卡分到1.88元,虽然今年没花太
amber2040
·
2023-08-06 03:10
Elasticsearch官方测试数据导入
pwd=7n5n提取码:7n5n文档格式{"index":{"_id":"1"}}{"account_number":1,"balance":39225,"firstname":"
Amber
","lastname
IEVEl
·
2023-08-05 13:35
Elasticsearch
elasticsearch
搜索引擎
全文检索
理财启蒙(一)
一前期准备在听的过程中,重燃了对儿子财商启蒙的想法,印象中
Amber
写过结合《小狗钱钱》对七岁女儿理财意识的引导,我是不是可以借鉴一下呢!
七年一遇
·
2023-07-26 23:15
《大表姐excel》学习笔记
十点课堂上学了大表姐的,对了大表姐
Amber
也叫琥珀老师。将学习笔记记录如下。零、双击公式格子右下角代替拉拽。
王晓城
·
2023-07-25 21:22
AMBER
生物分子动力模拟工作站配置推荐
Amber
是专门针对生物分子系统模拟而开发的分子动力学应用程序,
AMBER
支持GPU加速,可运行显式溶剂PME和隐式溶剂GB模拟。
wdf8088
·
2023-07-24 22:22
Day6 朋友圈
日常&精致【传奇】不对称设计,宴会之王【胡桃夹子】实物比图片更美,小星星可以在轨道上移动,又名“旋转星星”【巴洛克】大圈修饰脸型,树脂质地轻巧,配色百搭【
Amber
】手工滴胶,金色底色大气,中长款各种脸型均可产品介绍思路
唧唧啊唧唧
·
2023-07-21 17:07
【2班组】Day9 新媒体写作的特殊之处
图片发自App【学员信息】:2班1组-
Amber
-07【作业要求】:文章标题修改/分析,价值分析【作业如下】:请对以下文章进行标题修改,价值分析《金融圈的香艳丑闻里,没有一个无辜者》https://mp.weixin.qq.com
静然说
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2023-07-21 11:05
只有想不到,没有做不到
最初本来就是给
Amber
过生日,可是无意中,创造了一个大家没见过的“蛋糕”套路,用这个套路一路进军中区。
爱读书君
·
2023-07-21 08:51
2020-02-12
却一直在向错误的方向寻找友情,我很沉迷于虚拟世界,但我也明白不可能,自己生活中的感情才是自己的,镜头下的生活,那是别人的,我永远也无法和他们发生交互,也可能一旦认识,聊了之后会发现他们并没有意思,我说的是那些明星(
amber
黑夜里独行
·
2023-07-20 19:54
2022-02-10
amber
,mmpbsa
ante-MMPBSA.py-pbox.prmtop-ccom.prmtop-s":WAT,Cl-"--radii=mbondi2ante-MMPBSA.py-pbox.prmtop-crec.prmtop-s":WAT,Cl-,475"--radii=mbondi2ante-MMPBSA.py-pbox.prmtop-clig.prmtop-s":WAT,cl-,1-474"--radii=mb
DoubleT_2aac
·
2023-07-16 19:00
同源建模MOE:请叫我永远的神!
MMFF94x是一个用于小分子和复合物模拟的力场,不能很好地适用于大分子模拟,由于这里我们要进行同源模建,模拟对象是蛋白质结构,因此首先要将缺省分子力场MMFF94x更改为适用于蛋白质模拟的相关分子力场,如
Amber
lixuegaoyunfeng
·
2023-07-15 13:49
前端
人工智能
数据库
AMBER
分子动力学模拟之结果分析(突变型的能量计算,丙氨酸扫描)-- HIV蛋白酶-抑制剂复合物(5)
AMBER
分子动力学模拟之结果分析(突变型的能量计算,丙氨酸扫描)--HIV蛋白酶-抑制剂复合物(5)丙氨酸扫描在带电残基上引入一个或几个丙氨酸,观察这些改变对蛋白功能的影响。
发呆的比目鱼
·
2023-06-17 16:12
DrugAi
机器学习
算法
AMBER
分子动力学模拟之结果分析(构象分析)-- HIV蛋白酶-抑制剂复合物(6)
AMBER
分子动力学模拟之结果分析(构象分析)--HIV蛋白酶-抑制剂复合物(6)RMSDRMSFb-facto计算RMSDRMSDmeasuresthedeviationofatargetsetofcoordinates
发呆的比目鱼
·
2023-06-17 16:12
DrugAi
机器学习
算法
人工智能
关于
Amber
庄迪
2020第一天,伽涛老师带我参加了一个酒会,中国都市女性俱乐部,认识了
Amber
庄迪这个人,91年,年收入8-9位数,之前在网络上大致了解,原以为那些都是包装出来的,因为现在那样的人太多了,随便一个人出来都说自己是导师
爱音_zhang
·
2023-06-14 16:25
AMBER
分子动力学模拟技术
AMBER
分子动力学程序包是加州圣弗兰西斯科大学(UniversityofCaliforniaSanFrancisco,UCSF)的PeterAKollman和其同事编的,程序很全,现在已经发展到版本9.0
桃子0
·
2023-06-13 09:54
蛋白-配体相互作用、柔性对接及基于结构的虚拟筛选、基于药效团虚拟筛选、构效关系模型预测分子活性
其它相关课程:《
Amber
分子动力学技术与应用专题培训》、《Gromacs分子动力学技术与应用专题培训》、《人工智能药物设计技术与应用专题培训》、《新药先导化合物的虚拟筛选技术与实践专题培训》具体介绍请咨询联系人
桃子0
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2023-04-20 14:16
amber
复盘--20180211
/幼儿成长,陪同养成自主自理习惯/理财,获取多种投资途径/工作尽责/家庭,好好有效沟通,包容,控制情绪化;本周目标:阅读完一本书籍/瑜伽2次/每日运动/冥想昨日复盘:瑜伽15分钟/牛津树教学/亲子陪伴牛津树教材实在不知该怎样指导才好,才第3小册,孩子情绪依然不高,一遍遍带读憋了一肚子火,简单单词还能跟读,一到句子就像对牛弹琴。是不是已经错过了敏感期,点读笔也是一顿乱点乱按,完全没有学习的兴趣。看着
amber2040
·
2023-04-13 15:42
Week5│记录,是为了留下生活中的高光时刻
文│
Amber
本周小成就【每日打卡】听力练习7天、英语阅读7天,极光单词7天,潘多拉口语7天,英文日记1天、中文阅读4天。【书籍阅读】《芒果街的小屋》(英),输出读后感。
Amber的教学日记
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2023-04-11 21:24
2018-05-19
我肯定回复你“像
Amber
和下铺这样,下铺给
Amber
在37摄氏度的土壤里种一颗爱的草莓,
Amber
趁着下铺碎觉的时候给她在眉心揪出来一个通红通红的天眼,像二郎神一样”逢人人怕的天眼~小谷说她觉得自己整个人都变了
南希大人
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2023-04-09 14:15
第三章 成员聚齐(二)
amber
看见宋茜只是微笑不说话,就体贴的中文解释:“你好,我是
amber
,我是中国人,她是在夸…你漂亮,她叫…崔雪莉,那个最高的…叫朴善怜,至于那个害羞…躲在后面的…小鬼叫郑秀晶。”
予羽千
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2023-04-05 01:12
05-24禅生见解:新级别中枢开端,主流币酝酿新机会!
7.
Amber
首席执行官:比特币不是一场技术革命,而是一场
禅生论币
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2023-04-03 16:04
amber
复盘-20170120
年度目标:阅读10本以上书籍/每日运动,降低感冒频次;哈他瑜伽阴瑜伽结合练习,提高1个层次/幼儿成长,陪同养成自主自理习惯/理财,获取多种投资途径/工作尽责/家庭,好好有效沟通,包容,控制情绪化;本周目标:阅读完一本书籍/瑜伽2次/每日运动/冥想上周复盘:上周制定的计划因为出差都没完成今日目标:阅读1小时/养身:温灸泡澡/瑜伽一次昨日又在嘉兴一整天,终于定下来购买万科中环公园的项目。购买者以上海投
amber2040
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2023-04-02 15:51
【芷水文心教育故事】隔离的某三个晚上
上学期
Amber
怀孕期间,经常加班很晚,有时吃饭也很晚,他常常绕到办公室问
Amber
:“
Amber
,你在干嘛呢?你怎么还不吃饭?”没有更多的话,渐渐地,
Amber
就懂得了,那是关心。
芷水文心
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2023-04-01 03:32
敏捷自组织团队的10个特质 2020-07-15
敏捷自组织团队的10个特质Selforgnizingteam翻译:
Amber
原文地址:https://devqa.io/10-traits-agile-self-organizing-team/成功的敏捷思维的关键重要方面之一就是拥有一个自组织的团队
AmberLi00000
·
2023-03-31 13:23
Amber
的ScalersTalk第四轮《新概念》朗读持续力训练 Day19 20181029
Lesson22GlassenvelopeMydaughter,Jane,neverdreamedofreceivingaletterfromagirlofherownageinHolland.Lastyear,weweretravelingacrosstheChannelandJaneputapieceofpaperwithhernameandaddressonitintoabottle.She
Amber_2ae5
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2023-03-29 12:33
《魔鬼经济学》笔记第六天-孩子的名字
Amber
和Heather刚开始是高收入家庭使用的名字,Stephanie;和Brittany也是如此,可很快,富人家庭里每出生一个Stephanie或Brittany,就会有5个低收入家庭给自己的孩子取同样的名字
爱读书君
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2023-03-26 17:26
《哈利·波特》:不合格教师的6个特征
文|
Amber
看完《哈利·波特与凤凰社》(本文简称《哈利·波特5》),对反派DoloresUmbridge(多洛雷斯·乌姆里奇)这个角色真是恨得咬牙切齿。
Amber的教学日记
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2023-03-26 07:29
JDK20正式发布了GA版本,短期维护支持,以及JDK21预览
JDK20提供了来自OpenJDK项目
Amber
的语言改进(S
小简(JanYork)
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2023-03-25 19:27
Java
jvm
java
开发语言
JDK20正式发布了GA版本,短期维护支持,以及JDK21预览
JDK20提供了来自OpenJDK项目
Amber
的语言改进(S
Java知识库
·
2023-03-25 00:07
jvm
java
开发语言
Day6经典案例实操巩固
3组-
Amber
拆解案例:***AI英语【课程名称】第一部分/营销模型一、【模型框架】:49元转2880元(1)模型1教育分销平台投放49转2880选择理由:家长群体比较集中优缺点:家长之间通过分销形式裂变速度更快
琥珀妞
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2023-03-23 00:51
PySpark库
导入库frompysparkimportSparkConf,SparkContextsc=SparkContext.getOrCreate()创建RDDdata=sc.parallelize([('
Amber
JUNjianshuZHU
·
2023-03-22 03:27
amber
复盘-2017年12月17日-21天
加入123复盘群已经21天了,感觉过得飞快!坚持记录大概17天,期间发了4次左右的红包。每天生活平静按部就班,没太大的变化,后期已经感觉内容贫乏没什么好记录的,好几次萌生放弃的念头。明天开始尝试用excel记录法,把每天计划要做的事分解列出来。这21天围绕亲子/健康/阅读三大块展开,亲子每天持续进行也取得一定成就,阿诺在识字阅读/电子琴上进步较大。健康锻炼断断续续进行着,但不系统没有太大的感觉。阅
amber2040
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2023-03-21 00:34
语冰/
Amber
的2021-2022年度之最
今年的时间大部分过得比较收敛~最有成就感的时刻,我在二语习得领域的重大发现,终于可以为四年的探索基本画出一个句点了,给我一点时间,我会把这些整理发出来......最开心的时刻,被偶像语音回答问题并有个简短的交流,开兴到自己在家像个孩子蹦起来最生气的时刻,因为学生工作一些同学不配合气到凌晨1点睡不着,表示这种事情以后再不会发生最感动的时刻,看姐姐出嫁最突破的时刻,学游泳(我恐水,严格地说,我还没突破
王文静_5a03
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2023-03-20 12:33
你的自律中隐藏着你的价值
下面是我学
amber
老师的时间管理课梳理的一些想法:一、时间有形人有觉时间一刻不停地流逝,为什么我们察觉不到呢?
曹瀚文
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2023-03-19 04:55
肥胖也有“克星”,想瘦的你千万别忽视被称为“刮油神器”的膳食纤维!
现在
Amber
就为你介绍一种“刮油神器”,它就是被誉为“脂肪克星”的膳食纤维。那么,究竟什么是膳食纤维?膳食纤维有哪些好处?跟着
Amber
了解一下吧【什么是膳食纤维?】
Amber正能量博主
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2023-03-16 14:56
大人越放手 孩子更能干
中午和
Amber
一起商讨如何具体安排。
Lucy56
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2023-03-15 17:48
教育操盘手自查标准——操盘手必备条件
3组-
Amber
1、个人背景【昵称】
Amber
【公司】**英语(前)【岗位】社群运营【工作年限】4年(转少儿教育行业0.5年)【年薪范围】***2、核心能力模型【人员管理】4-10人团队管理【承载能力】
琥珀妞
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2023-03-15 09:13
amber
复盘
年度目标:阅读10本以上书籍/每日运动,降低感冒频次;哈他瑜伽阴瑜伽结合练习,提高1个层次/幼儿成长,陪同养成自主自理习惯/理财,获取多种投资途径/工作尽责/家庭,好好有效沟通,包容,控制情绪化;本周目标:阅读2小时/瑜伽1次/每日运动本周复盘:亲子/聚会/出差/阅读本周已经发了4次红包,连续多天没有复盘记录。缘由:上午开会及出差。聚餐+出差引起的问题:本周已经连续2晚下班跟朋友聚会加上出差2天,
amber2040
·
2023-03-12 08:40
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