Chip

用DESeq2包来对RNA-seq数据进行差异分析

可以是任意features的count数据，比如对各个基因的count，或者外显子，或者CHIP-seq的一些feature，都可以用来做差异分析。使用这个包也是需要三个数据：表达矩阵分组矩阵

Seurat_Satija·2024-09-13 23:49

使用ESP-IDF出现A fatal error occurred: This chip is ESP32-S3 not ESP32. Wrong --chip argument?的解决方案

使用ESP-IDF出现Afatalerroroccurred:ThischipisESP32-S3notESP32.Wrong--chipargument?的问题是因为没有把芯片设为目标。在将环境设置为esp-idf，就是需要export.sh一下，这个不做解释。之后我们在terminal中逐个输入以下代码idf.pyset-target#我的是esp32s3，这里填写你的芯片#idf.pyful

HawkJgogogo·2024-09-05 05:06

JAVA 手机部件功耗计算

要求如下：1.创建一个ComputePower接口，接口中有方法：doublecomputePower();2.创建两个类Chip、Discrete，这些类都实现了ComputePower接口，能够提供功耗

西柚第一深情jq·2024-09-03 17:53

ZCC575Digital On‐chip Temperature Sensor with I2C Interface

FeaturesTemperatureaccuracy‐±1℃from-20℃~80℃‐±2℃from-40℃~125℃Lowpowerconsumption‐4.5uAshutdowncurrentatVDD=5.0V‐125uAcontinuousconversioncurrent2.2~8.0Vultra-wideoperationsupplyvoltageHighPSRintemp

ZCWC123·2024-03-15 18:21

keil MDK报错显示error: #20: identifier “inline“ is undefined

\LCD\atk_md0430.c(72):error:#20:identifier"inline"isundefinedstaticinlineuint16_tatk_md0430_get_chip_id

Lulifer。·2024-02-20 23:18

2021-10-31

2.我在本片文章/音频/视频中学到的怦然心动的单词(精读和视听说分别总结)视听说：①extremely②retell③chip精读：①priority②crucial③intangible3，在本篇文章

人文一班刘彤·2024-02-20 01:28

Quantitative Analysis: PIM Chip Demands for LLAMA-7B inference

1Architecture如果将LLAMA-7B模型参数量化为4bit，则存储模型参数需要3.3GB。那么，至少PIMchip的存储至少要4GB。AiM单个bank为32MB，单个die512MB，至少需要8个die的芯片。8个die集成在一个芯片上。提供8×16bank级别的访存带宽。整个推理过程完全下放至PIM。CPU把prompt传给ControllerController控制推理过程，将推

简vae·2024-02-19 14:53

转录调控研究数据库推荐 | 你要找的ChIP-seq数据都在这里啦！

来自同济大学的研究人员开发了人类和小鼠ChIP-seq和染色质可及性数据库：CistromeDB(CistromeDataBrowser)，为转录和表观遗传调控研究提供最全面数据资源。

尐尐呅·2024-02-15 04:49

生信地基系列--常规分析流程

领域特异性分析包括质量评估、ChIP-seq、差异表达、RNA-seq和其他方法。

可能性之兽·2024-02-14 18:17

K210如何下载程序

一、打开资料包里提供的K-Flash程序烧录软件二、选择串口三、选择波特率四、选择In-Chip，烧录到Flash芯片里面，重新上电还会运行程序五、如果选择In-Memory，这次可以运行，但下次重新上电就不会保持这次的程序了

我先去打把游戏先·2024-02-14 15:52

numa网卡绑定

#概念参考：https://www.jianshu.com/p/0f3b39a125eb(opensnewwindow)chip：芯片，一个cpu芯片上可以包含多个cpucore，比如四核，表示一个chip

大隐隐于野·2024-02-08 23:19

看了老大比较基因组学视频后扩展的小内容

老大视频比较基因组在IGV看了http://www.bio-info-trainee.com/2218.htmlwes：探针捕获rna-seq：不会出现外显子两边下降chip-seq：不会出现整齐，得到的文件是

小梦游仙境·2024-02-08 12:56

2022-08-14

上一次写随笔还是两周前八月第一周在玩异度之刃3.....第二周把EGO数据库挖掘的内容结束了，另外学了chip-seq全流程，这一次感觉比rna-seq那一趟顺利多了，当然，数据量也是大多了，分析结束后还要把

佳奥·2024-02-06 09:00

【学习笔记】单片机结构与原理（MCS-51为例）

单片机结构与原理(MCS-51为例）基础知识概述什么是单片机单片机（Single-Chip-Microcomputer）又称为单片微计算机结构特点：将微型计算机的基本功能部件全部集成在一个半导体芯片上单片机的特点集成度高

Benjamin Chen.·2024-02-06 09:56

Matter （CHIP）从入门到入土（一）

usingBLEusingWIFIUsingExistingIP-bearingNetwork示例matter配网流程引用前言Matter（ProjectConnectedHomeoverIP，简称为CHIP

Jeff_·2024-02-05 16:04

AXI3与AXI4区别及互联

主要从事ISP/MIPI/SOC/车规芯片设计首发于知乎专栏：芯片设计进阶之路同步微信公众号：芯片设计进阶之路(x_chip)转发无需授权，请保留这段声明。

元直数字电路验证·2024-02-04 22:52

LUC项目文章|14-3-3蛋白BdGF14a增加了BdbZIP62的转录调控活性，从而在烟草中赋予了抗旱和抗盐能力

中，我们介绍了几种验证转录因子与靶基因启动子互作的方法：ChIP-qPCR、双荧光素酶报告实验（LUC）、酵母单杂交（Y1H）点对点验证和凝胶阻滞实验EMSA。

爱基百客·2024-02-02 15:16

iPhone 14 Pro可能搭载A16芯片

以下文章来自WX公主号“英语跃进”TheiPhone14Proand14ProMaxmaybetheonlymodelsintheupcominglineuptocarryanewA16chip,accordingtoreliableAppleanalystMing-ChiKuo.Inatweet

Sky008·2024-02-02 14:15

IPQ4019: Revolutionizing Long-Range Wireless Connectivity

UnveilingtheIPQ4019:RevolutionizingLong-RangeWirelessConnectivityIntroduction:TheIPQ4019System-on-Chip

wallyslilly·2024-01-31 23:25

傻白入门芯片设计，史上最最最全DRAM介绍（十二）

阵列的读取1.4、DRAM刷新2、DRAM芯片的读写2.1、必须的周围逻辑2.2、完整的读过程（重点）2.3、完整的写过程2.4、时间消耗和行缓存3、DRAM系统层次3.1、bank划分3.2、存储芯片/chip3.3

好啊啊啊啊·2024-01-30 20:40

12.如何将图像转化为矩阵形式

read_image(Image,'printer_chip/printer_chip_01')*获取图片大小get_image_size(Image,Width,Height)*获取区域里各点(每个点

baivfhpwxf2023·2024-01-29 06:18

计算机硬件之集成电路

集成电路也可以称为微电路（microcircuit）、微芯片（microchip）、芯片（chip）。

小明的Fire计划·2024-01-26 04:20

python AI人工智能的数据补全

importpandasaspdimportnumpyasnpdata=pd.read_csv("chip_test.csv")data.head()mask=data.loc[:,"pass"]==1

augisTrench·2024-01-24 14:44

全反式维甲酸（ATAR）诱导白血细胞的染色质构象改变而影响分化进程

AlterationsofspecificchromatinconformationaffectATRA-inducedleukemiacelldifferentiation期刊：CellDeath&Disease影响因子：6.044主要技术：Hi-C、ATAC-seq、ChIP-seq

d5c9c866171f·2024-01-24 11:45

ChIP-seq数据质控

日常瞎掰 ChIP-seq可以用来研究某种转录因子或者组蛋白(后面统称为蛋白因子吧)在基因组上的结合位置，从而来确定蛋白因子可能调控的靶基因，继而推测出在生物过程中的相关调控功能。

生信云笔记·2024-01-23 17:36

2019-03-16

EP3C40F780I7N介绍：EP3C40F780I7N属于芯片，芯片（chip）就是半导体元件产品的统称。是集成电路（IC,integratedcircuit）的载体，由晶圆分割而成。

QUEQUE123·2024-01-22 20:19

CUTANA™ CUT&RUN Assays ——实现超敏基因组定位

研究细胞内蛋白质-DNA相互作用的常用方法是染色质免疫沉淀(ChromatinImmunoprecipitation,ChIP)，同时ChIP还常被用于确定基因组上与组蛋白修饰相关的特定位点（即组蛋白修饰酶的靶标

Neobioscience·2024-01-22 11:14

TiED:人类组织特异性增强子数据库

鉴定了增强子的组织特异性，网址如下http://lcbb.swjtu.edu.cn/TiED/首先综合H3K27ac,H3K4me1,H3K4me3和DHS的结果来识别增强子区域，从Roadmap和ENCODE下载chip_seq

生信修炼手册·2024-01-20 07:21

IPQ9574: High-performance WiFi7 wireless network chip leading the future

Withthecontinuousadvancementoftechnology,wirelessnetworkshavebecomeanindispensablepartofourlives.IPQ9574,asawirelessnetworkchipbasedonWiFi7technology,leadsthefutureofwirelessconnectionswithitsexcellen

Wallytech·2024-01-19 09:54

易基因：ChIP-seq等揭示WWOX基因通过上调Myc促进骨肉瘤发生发展的表观调控机制｜Cell Death Dis

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。骨肉瘤（Osteosarcoma,OS）是一种高侵袭性骨肿瘤，主要影响儿童和青少年。这种恶性肿瘤与不良临床结果相关，尤其是肺转移。由于其罕见性和生物学异质性，对其分子基础研究有限，阻碍了有效疗法的发展。WW结构域氧化还原酶（WWdomain-containingoxidoreductase，WWOX）是一种在人骨肉瘤中经常发生变化的基因

易基因科技·2024-01-16 13:23

易基因：ChIP-seq等揭示Runx2通过转录调控Itgav表达激活肝星状细胞以促进肝纤维化｜科研进展

这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。肌成纤维细胞（myofibroblasts）主要由肝脏中活化的肝星状细胞(hepaticstellatecellsHSC)组成，在肝纤维化进展中发挥着核心作用。由于肌成纤维细胞主要负责细胞外基质蛋白的合成、沉积和重塑，因此靶向HSC被认为是肝纤维化治疗的一种新策略，并且正在进行越来越多的临床前研究和临床试验。先前的研究表明，runt相关转录因子

易基因科技·2024-01-16 13:20

python多线程

具有这种能力的系统包括对称多处理机、多核心处理器以及芯片级多处理（Chip-levelmultithreading）或同时多线程（Simultaneousmultit

Yznx_请叫我小哥·2024-01-15 18:31

UPF与低功耗设计实现实例 -- 附UPF与DC综合脚本

UPF》孙轶群[email protected]国民技术股份有限公司NationzTechnologiesInc4.0低功耗设计实现实例这里提供一个DEMO（pl8051_extend_chip

sunvally·2024-01-15 09:16

修改BAM文件中的染色体名字

在处理ChIP-seq数据的时候，遇到这样一个问题：前期我的FASTA和GTF文件中染色体的名字是1，2，3......22这样的，但后期某些分析过程要求染色体名称必须以chr开头，比如用来找enhancer

生信菜菜鸟·2024-01-14 15:33

用于WB，IP，IHC，IF，ChIP的抗体有哪些区别？

那么实验当中，用于WB，IP，IHC，IF，ChIP的抗体有哪些区别？

百奥创新·2024-01-12 12:21

CUTANA™ pAG-Tn5 for CUT&Tag

与ChIP-seq相比，CUT&Tag在降低细胞需求量和测序深度的信噪比方面进行了显著改进。

Neobioscience·2024-01-11 07:16

零代码差异表达分析工具：GEO2R

不仅有DNA数据，表达谱数据，也有甲基化数据和chip-seq的数据。

生信交流平台·2024-01-09 07:04

halcon10_测量_1_一维测量(找边测量边的距离)

流程代码*1读取图片参数(输出参数Image，输入参数图片路径）read_image(Image,'printer_chip/printer_chip_01')*3画一个矩形,再将151.674,815.649

baivfhpwxf2023·2024-01-07 19:51

chip-seq测序分析流程

步骤1：质量控制fastqc质控，假如有两个样本，实验组为sample1，对照组为control1#双端测序fastqcsample1_1.fq.gzsample1_2.fq.gzfastqccontrol1_1.fq.gzcontrol1_2.fq.gz去除接头序列在进行比对之前，需要对测序数据进行质量控制。这包括剔除低质量的读段，去除接头序列等。#安装trimmomaticcondainsta

微光**·2024-01-06 14:11

2022-11-13

任何观念都会随着长大而改变2，我在本片文章／音频／视频中学到的怦然心动的单词（精读和视听说分别总结）misspend虚度ornate华丽的exert用力fallout结果frame框架origin起因affluent富裕的chip

地理科学7班夏雨桐·2024-01-06 05:01

一。IMX6q emm烧录步骤

1.使用对应工具mfgtools我的开发板IMX6Q(工业级1G+8G)设备树烧写工具查看cfg.ini文件[profiles]chip=Linux[platform]board=SabreSD[LIST

chilian12321·2024-01-05 11:37

RNA-seq最强综述名词解释&思维导图|关于RNA-seq，你想知道的都在这（续）

前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述：三万字长文读懂单细胞

生信宝典·2024-01-02 16:05

HALCON学习笔记（八）——HALCON相关实例和算法

实例：dev_update_window('off')read_image(Image,'printer_chip/printer_chip_01')get_image_size(Image,Width

weixin_45482443·2024-01-01 17:09

oj 1.8编程基础之多维数组 25:螺旋加密

谢谢Thanks♪(･ω･)ﾉChip和Dale发明了一种文本信息加密技术。他们事先秘密约定好矩阵的行数和列数。接着，将字符按如下方式编码：1.所有文本只包含大写字母和空格。

一小彭水·2023-12-31 12:49

学习力践行day101

chip'srobot我故意读成biff，他就给我讲chip和kipper是男生，biff是女生。其中有个G开头的词，他大概知道发k的音，只是后面读不出来，差不多能蒙点。3.逻辑狗两页自己读题完成。

赵小动·2023-12-31 09:59

各种无线协议、不同厂家的统一者？什么是matter，它的网络结构

1.1背景Matter前称叫CHIP项目（ConnectedHomeOverIP），智能家居的一个全新连接标准，早期是由几大巨头，谷歌、苹果、ZigBee联盟等牵头主导并开源的一个用于解决无线物联IOT

Aaron Mo·2023-12-31 06:13

Histone H3K27ac Antibody, SNAP-ChIP® Certified

EpiCypher推出的ChIP级别的HistoneH3K27acAntibody符合EpiCypher的“SNAP-ChIP®Certified”标准，用于ChIP实验中的特异性和有效靶标富集（整板的交叉反应性

Neobioscience·2023-12-30 08:02

ChIP-seq综述

WritingChIP–seq:advantagesandchallengesofamaturingtechnology概述相比chip-chip，chip-seq提供了更高的分辨率，更少的noise以及更大的覆盖度

Shaoqian_Ma·2023-12-29 20:45

2020.9.15丨Chip-seq结果可视化之peak检测（上）

macs2运行参数macs2callpeak-tK1_ChIPed_S1_L007_R1.bam-cK1_Input_S5_L007_R1.bam-fBAM-gmm-nK1-B-q0.01-t-c实验组和对照组结果-f输入文件格式-g参考基因组有效大小，人类选择hs，也可以根据基因组大小直接输入数值-n输出前缀-B输出bdg格式文件，可以上传到UCSC生成峰图-qq值，默认0.05-pp值，未校正

穆易青·2023-12-29 19:43

2020.9.17丨Chip-seq结果可视化之peak检测（下）

我使用的工具是MEME-ChIP，MEME是一个工具系列，挖掘motif的工具比较丰富，MEME、DREME、TomTom、MEME-ChIP，其中MEME-ChIP可以同时调用其他几个工具进行综合分析