Chip

u-boot之Nand Flash操作

擦除NandFlash（1）整片擦除nanderase.chip（2）分区擦除nanderase.part如果NandFlash已经分区了，那么可以单独擦除某个分区。
飞哥物联·2023-03-09 16:55

使用deeptools生成ChIP-seq信号热图与谱图

整理ChIP-seq/CUT&Tag分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。
尘世中一个迷途小书僮·2023-03-09 15:01

Flutter入门（38）：Flutter 组件之 Chip、ActionChip、ChoiceChip、FilterChip 详解

1.基本介绍Chip、ActionChip、ChoiceChip、FilterChip是一个常见的标签控件，会内敛布局，并且有一些常用的点击功能。2.示例代码代码下载地址。
Maojunhao·2023-03-08 22:08

ChIP-seq 分析：文库的复杂性和丰富性（7）

1.文库复杂性ChIPseq中的一个潜在噪声源是ChIPseq库在PCR步骤中的过度放大。这可能会导致大量重复读取，从而混淆峰值调用。2.重复我们应该比较样本之间的重复率，以确定任何经历过度放大的样本，从而确定复杂性较低的可能性。flattagcounts()函数报告可以报告重复的数量和总映射读取，因此我们可以从那里计算我们的重复率。myFlags<-flagtagcounts(myQC)myFl
·2023-02-25 17:07

ChIP-seq 分析：评估片段长度与处理（6）

1.片段长度评估片段长度的预测是ChIPseq的重要组成部分，它会影响峰识别、峰识别和覆盖概况。使用互相关或交叉覆盖可以评估按链进行的读取聚类，从而衡量质量。在ChIPseq中，通常是dsDNA的短单端读取。片段的5'将在“+”链上测序片段末端的3'将位于“-”链上。虽然我们只有部分链序列，但根据预测的片段长度，我们可以预测整个片段“+”读数应仅在正方向延伸“-”只读负数2.交叉覆盖图plotCC
·2023-02-21 23:50

ChIP-seq 分析：数据质控实操（5）

1.数据今天将继续回顾我们在上一次中研究的MycChIPseq。这包括用于MEL和Ch12细胞系的MycChIPseq及其输入对照。可在此处找到MEL细胞系中MycChIPseq的信息和文件可在此处找到Ch12细胞系中MycChIPseq的信息和文件可以在此处找到MEL细胞系的输入控制可在此处找到Ch12细胞系的输入对照。2.质量控制ChIPseq有许多潜在噪声源，包括抗体的不同效率非特异性结合文
·2023-02-19 11:50

CUT&Tag技术势必将引领蛋白质—DNA互作新革命！【百迈客生物】

染色质免疫共沉淀测序技术（ChromatinImmunopreciptationwithSequencing，ChIP-Seq），作为传统的研究细胞内蛋白质与DNA互作的重要工具，技术成熟，已被广泛应用于动植物的表观遗传学研究
百迈客生物·2023-02-18 02:13

R-loop数据分析之R-ChIP(样本间BAM比较和可视化)

样本间相关性评估上一步得到各个样本的BAM文件之后，就可以在全基因组范围上看看这几个样本之间是否有差异。也就是先将基因组分成N个区间，然后用统计每个区间上比对上的read数。脚本scripts/07.genome_bin_read_coverage.sh如下#!/bin/bashset-eset-uset-opipefailsamples=${1?missingsamplefile}chromsi
xuzhougeng·2023-02-17 11:15

ChIP-Seq分析

hbctraining.github.io/Intro-to-ChIPseq/schedule/2-day.htmlATAC-seq分析实操生信技能树健明教程https://www.jianshu.com/p/09e05bcd6981ChIP-seq
大胆冒险实践者·2023-02-17 03:43

ChIP-seq 分析：Mapped 数据可视化（4）

1.Mappedreads现在我们有了BAM文件的索引，我们可以使用idxstatsBam()函数检索和绘制映射读取的数量。mappedReads<-idxstatsBam("SR_Myc_Mel_rep1.bam")TotalMapped<-sum(mappedReads[,"mapped"])ggplot(mappedReads,aes(x=seqnames,y=mapped))+geom_b
·2023-02-16 22:03

ChIP-seq 分析：教程简介（1）

它涵盖比对、QC、peakcalling、基因组富集测试、基序富集和差异ChIP分析。课程材料和练习可在https://rockefelleruniversity...上以呈现的HTML形式查看。
·2023-02-05 22:33

重复单细胞it-ChIP文章小图

Tips:最近看单细胞ChIP-seq文章一个图，本来作者用baseplot画的，因此尝试用ggplot2画出baseplot风格。
caokai001·2023-02-05 00:00

MACS2

是两条互补链insertsize中方向相对的两条序列，再比对到单链的参考基因组之前会先将其中一条read转义，然后进行比对，所以比对得到的SAM和BAM文件中read1和read2有一条是被转了的.First,ChIP-SeqtagsrepresentonlytheendsoftheChIPfragments
shine_9457·2023-02-04 04:09

ChIP-seq上游分析流程

0.数据格式及数据存放文件夹说明获得了测序公司提供的fq.gz文件，每个样本均为双端测序，得到的数据分别命名为“样品名1.fq.gz”与“样品名2.fq.gz”。下设文件夹包含主要文件说明如下：/raw存放公司发回的原始数据。/clean存放使用trim_galore软件过滤后的数据。/qc_raw与/qc_clean分别对/raw与/clean中的数据进行质控。/align使用bowtie2软件
ouyang22222·2023-02-03 22:43

DAP-seq完整技术实验流程和原理-蓝景科信河北生物科技有限公司

ChIP-seq是进行体内检测TFBS的主要方法。然而，ChIP-seq依赖于抗体质量，这对低表达的蛋白质具有很大的挑战性。所以，ChIP-seq通常在规模上受到限制，难以进行高通量扩展。
蓝景科信·2023-02-03 17:24

关于NGS数据处理中的PCR Duplicate

最近在学ChIP-seq数据分析，遇到一个之前没遇到过的问题，关于PCRDuplicates的问题，记录一下自己搜索的答案和思考在做转录组数据分析质控那一项的过程中，利用Fastqc质检得到的html结果文件中会出现一项指标
不玩手机的蛇佬腔·2023-02-02 10:00

让孩子短时间内认识大量单词的秘诀

PhonicsThemoonJet_腾讯视频牛津阅读树家庭版（Biff,Chip＆Kipper）的阅读包括了两种：（1）为了练习phonics而做的阅读；（2）纯故事阅读。
yesifeng·2023-02-01 18:28

创建测量模型之前先模板定位

://www.icode9.com/content-4-689857.htmlMeasureLines[]nullread_image(Image,'G:/Workspace/2020/Images/chip
It-is-me!·2023-02-01 14:44

LACE-seq 保姆级教程

也许，我们对ChIP-seq并不陌生，知道它可以用来研究某个转录因子或者组蛋白在基因组范围的结合位点。
生信店小二·2023-02-01 06:54

【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-Chip-2018年3月24-26日

用心陪伴每一天1音频1b、supersimplesongs、美猴王2动画peppapig、超级飞侠3儿歌与游戏A、ThegoodmorningbusiscomingBaby,let’splaywithblocks.Herearethehouses.Hereisaroad.Hereisatree.Thisisapark.Thisisaminicommunityonthetable.Theanimal
水中的珊瑚雨·2023-01-31 19:42

第三章 PCB 封装库绘制

目录第三章PCB封装库绘制3.1常见贴片（CHIP）封装的创建3.2常见IC类封装的创建3.3利用IPC封装创建向导快速创建封装3.4常用PCB封装的直接调用3.53D模型的创建和导入第三章PCB封装库绘制
果子狸PLG·2023-01-30 21:57

牛津阅读树What Dogs Like

Chip跑过来……妈妈……（写作画画的观察能力）4.复数与单数，讲讲。前面书用的过去时，这本书用的现在时，是讲一般规律的时候。（语法渗透）5.4次都是对的，容易让我们觉得这本书讲的都是对的。
海蓝蓝a·2023-01-28 17:25

DNA和RNA修饰的鉴定和编辑技术前沿综述 （全文翻译版）

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析
生信宝典·2023-01-21 10:31

积微论坛--用微生物组时序数据重现生物膜装配动态过程PPT对应的讲解和提问

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、高颜值在线绘图和分析、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析
生信宝典·2023-01-21 10:31

RocketChip RISC-V生成RTL到仿真全流程

$rocket-chip/src/main/scala/system/Config.scala1）newWithNExtTopInterrupts(128)++，修改中断输入数量，这里是128个外部中断
远古架构师alanwu·2023-01-17 15:35

送书《R语言数据分析和可视化》 | 这个为生信学习和生信作图打造的开源R教程真香！！！...

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析
生信宝典·2023-01-17 09:41

木桶排序算法_【生信常识】二代测序的比对算法浅析

废话不多说，我们开始本次的主题吧~相信大家日常跑数据的时候总是要从检查数据质量，比对，转换格式，差异分析这么一套既定的流程对我们的rna-seq或者chip-seq数据进行
梦游前生·2023-01-11 08:28

CHIP-seq流程学习笔记（13）-ATAC_seq 数据加工处理

先放个找好的参考文章：ATAC-seq/ChIP-seq分析方法1.建立相应目录对新数据建立对应实验人员（zhaoyingying）、测序类型（ATAC_seq）和日期（2021_05_03）的目录。
垚垚爸爱学习·2023-01-09 17:17

【chip-tool】 使用 chip-tool 工具测试matter设备步骤

【chip-tool】使用chip-tool工具测试matter设备1.主要步骤1.1编译matter设备的固件程序1.2在matter设备上开启BLE蓝牙广播1.3确保已设置IP网络1.4确定网络配对凭据
1024-bytes·2023-01-09 09:35

【chip-tool】chip-tool工具常用指令介绍

chip-tool工具可用于调试matter设备，是matter协议新兴起时所使用的重要工具，由于资料都是英文的很不友好，因此本文根据官方教程和自己的理解整理如下，本文主要介绍chip-tool常用的一些命令
1024-bytes·2023-01-09 09:35

linux系统中进一步理解设备树

目录第一：前言第二：框图第三：体验设备树第四：实验过程分析第五：实验代码1、应用程序ledtest.c：2、驱动层leddrv.c3、硬件层：chip_demo_gpio.c4、Makefile文件第六
ST小智·2023-01-08 03:00

生信常见文件格式 bed

bed文件是记录基因组位置信息的标准文件格式，同时也用于存储与位置相关的信息，例如在ChIP-Seq分析中，长以bed文件存储检测信号强度的信息、结构变异检测（SV）结果也可以用bed文件或bedpe文件进行存储
新爷话数据·2023-01-07 16:33

Virtual ChIP-seq: predicting transcription factor binding by learning from the transcriptome

摘要本文开发了虚拟chip-seq，整合了基因表达和结合的关联信息，使用了来自其他细胞类型的TF结合位点，以及新细胞类型中染色质可及性数据，能够预测新细胞类型中单个TF的结合。
与光i·2023-01-06 16:57

报错解决 | 重装VS2017报错140.Tools.HostX64.TargetARM.Msi.Reso

MSI:D:\VS2017\Packages\Microsoft.VisualC.140.Tools.HostX64.TargetARM.Msi.Resources,version=14.0.24234,chip
uuyymilkyl·2023-01-06 14:21

浅谈pcie硬件验证方案

目录1.1.pcie起源1.2.pcie应用2.1.pcie架构介绍2.2.pcie耦合电容与detect2.3.pcie均衡技术3.1.Chip-to-Chip测试指标3.1.1.无源参数指标3.1.1
逆流而上的鱼儿@·2023-01-06 05:16

bandgap分析（原理、trimming、非线性、chopper）

ASingle-TrimCMOSBandgapReferenceWitha3δInaccuracyof0.15%From40Cto125C概述：1、为了消掉process偏差导致的每片chip的偏差，需要使用
winkle_Zhang·2023-01-04 21:50

没有网也可以安装 Conda 环境

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析
生信宝典·2022-12-30 09:47

送书 | 222Beta多样性限制性排序CPCoA/CCA/RDA/LDA

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析(重磅综述
生信宝典·2022-12-29 15:55

Halcon工具之特征直方图

Halcon工具之特征直方图Halcon工具之特征直方图Halcon工具之特征直方图一分割出特征区域read_image(Image,'printer_chip/printer_chip_01')threshold
*Major*·2022-12-28 19:17

数据准备技巧及其对机器学习的重要性

——Chip&DanHeath本文最初发布于Medium，经原作者授权由InfoQ中文站翻译并分享。数据是什么？数据是指在某领域中能够描述你所想解决问题的例子，而数据的选择则取决于你想满足的任务目标。
喜欢打酱油的老鸟·2022-12-27 03:36

esp-matter 学习

2021年5月11日，CHIP协议更名为Matter协议，ZigBee联盟也更名为连接标准
qq_21911097·2022-12-18 17:24

Matter 仓库介绍

1.connectedhomeip-spechttps://github.com/CHIP-Specifications/connectedhomeip-spec此仓库为Matter规范技术文档(specifications
AlexeyElijah·2022-12-18 17:54

易基因｜ChIP-seq等实验揭示CHD6转录激活前列腺癌通路的关键功能 | 肿瘤耐药研究

易基因｜ChIP-seq等实验揭示CHD6转录激活前列腺癌通路的关键功能|肿瘤耐药研究大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。
易基因科技·2022-12-17 07:12

易基因｜染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)分析实验全流程

本期，易基因小编给您讲讲染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）实验怎么做，从技术原理、建库测序流程、信息分析流程和实验成功的关键问题等四方面详细介绍。
易基因科技·2022-12-17 07:10

[从零开始学习FPGA编程-56]：视野篇-常见概念：chip（芯片）、chipset（芯片组）、chiplet（芯粒）、die（裸片）的区别

目录Wafer（晶圆）die（裸片）chip（芯片）chipset（芯片组）chiplet（芯粒）Wafer（晶圆）晶圆是指制作硅半导体电路所用的
文火冰糖的硅基工坊·2022-12-15 14:43

Chip Move

题意：从原点开始走，每一步走正整数步，第一步走k的倍数步，第二步走k+1的倍数步，问你走到[1,n]的方案数分别为多少。分析：#include//cout#defineM(a,b)make_pair(a,b)#definefifirst#definesesecond#definepbpush_back#define__builtin_popcountpopcnt1//getcnt#definedb
qq_51268115·2022-12-14 19:13

在B站学习大名鼎鼎的StatQuest 系列统计和生信分析视频（中文字幕）- 也见证助理教授到创业者的华丽转身...

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析
生信宝典·2022-12-12 14:49

245热图展示微生物组的物种和功能丰度或有无、距离矩阵

生物信息学习的正确姿势NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析（Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这）、ChIP-seq分析（ChIP-seq基本分析流程）、单细胞测序分析
生信宝典·2022-12-12 02:47

DRAM Address Mapping/Decoding(内存地址解码)

DRAMAddressMapping(多通道卡槽定位和颗粒定位)解释：是指从64bit的内存物理地址(比如，0x12345678234)到Dram地址(socket/ctrl/chl/dimm/rank/chip
一棹春风一叶舟·2022-12-09 18:53

Rocket-chip学习基础篇

目录1.ChipyardBasics环境构建（done）2.ChipyardSimulation仿真3.ChipyardincludedRTLGenerator一些生成器组件4.ChipyardDevelopmentTools5.VLSIFlow6.Customization10.PrototypingFlowchipyarddocument6.9教程2.1RocketPipeline3.1基本C
JACKLJ1998·2022-12-08 19:04
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