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Chip
2021-08-09 MAnorm差异分析-一款寻找两个
ChIP
-Seq样本之间差异peak的软件
3.2第二种方式MAnorm差异分析-一款寻找两个
ChIP
-Seq样本之间差异peak的软件软件网址:https://manorm.readthedocs.io/en/latest/usage.html
xiaoguolaile
·
2023-10-31 03:55
RISC-V IDE MRS使用笔记(二):Board
chip
status error
RISC-VIDEMRS使用笔记(二):Boardchipstatuserror【问题描述】【报错原因】下载或调试时,通过两线调试接口获取芯片状态失败。【解决方法】检查硬件连线:WCH-Link的SWCLK和SWDIO与芯片管脚是否连接正确。检查芯片是否正常工作:芯片工作电压是否正常,芯片是否存在虚焊、损坏现象。检查芯片内程序:是否含有Flash上锁、睡眠、看门狗…功能,影响了两线调试接口。检查是
MounRiver_Studio
·
2023-10-30 14:13
RISC-V
RISC-V
IDE
ARM
IDE
risc-v
单片机
stm32
CHIP
---OSPF复习总结
基础信息OSPF数据包OSPF状态机OSPF的工作过程OSPF的基础配置OSPF从邻居关系建立为邻接关系的条件OSPF的接口网络类型OSPF的不规则区域OSPF的数据库表OSPF知识点思维导图:
J_597
·
2023-10-28 22:08
安全
网络
服务器
运维
网络协议
Chip
-seq简介
与蛋白结合的复合体,然后用蛋白特异性的抗体,通过抗原抗体特异性结合的免疫学手段捕获该复合体,然后洗脱蛋白质,得到与目的蛋白结合的DNA片段,将富集到的DNA片段进行上机测序,即形成了一套成熟的分析流程,称之为
chip
-seq
生信修炼手册
·
2023-10-28 16:54
Chip
-seq分析笔记
目录前言一、软件安装二、创建环境及安装软件1.创建环境chipseq2.chipseq环境下安装软件三、具体分析步骤1.数据来源2.下载数据并重命名3.fastq文件转换(--sra-id此步骤把SRR的名称改掉,加快运行速度,速度非常快)4.质控4.1trim_galore4.2FastQC质控报告生成(旧的数据)5.bowtie2比对(15min/file)6.samtoolssam转换bam
xsq420281
·
2023-10-28 16:50
生信分析
chip
mac
干货│步步为赢,
ChIP
实验攻略(中篇)
导读上一期,给大家介绍了
ChIP
实验操作中的染色质制备。本期小编就
ChIP
实验中的免疫沉淀和DNA纯化进行详细的介绍和细节汇总,让您少走弯路,扎扎实实做好
ChIP
实验。话不多说,干货呈上。
爱博泰克生命科学
·
2023-10-28 16:18
生物医药
生命科学
科研试剂
科技
干货 │ 步步为赢,
ChIP
实验攻略
导读染色质免疫沉淀(ChromatinImmunoprecipitation,
ChIP
)作为研究体内DNA与蛋白质相互作用的金标准,对于基因表达调控研究具有重要意义。
爱博泰克生命科学
·
2023-10-28 16:48
生命科学
生物医药
科研试剂
科技
学习
健康医疗
全文检索
集成学习
ChIP
实验简介
ChIP
实验简介一、
ChIP
实验的作用染色质免疫沉淀(
ChIP
)是研究体内蛋白质-DNA相互作用的一种有价值的方法,鉴定各种DNA相互作用蛋白(如转录因子和调节因子、修饰组蛋白和表观遗传修饰因子)的结合位点和模式是必不可少的
卡梅德生物
·
2023-10-28 16:15
科技
chip
_seq质量评估之计算样本间的相关性
在
chip
_seq的实验中,由于抗体反应的敏感性,生物学重复样本的一致性很难把控。为了保证重复样本具有较好的一致性,除了在实验上保证操作流程的规范化,对于测序数据,我们也需要对其进行评估。
生信修炼手册
·
2023-10-27 20:53
MFI芯片I2C地址转换(写读转7位传入API接口)
可加我微信hezkz17,本群提供音频技术答疑服务MFI芯片I2C地址转换(写读转7位传入API接口)#defineMFI_I2C_
CHIP
_ADDR0x10//芯片写/读0x20/0x21(写/读)七位地址
周南音频科技教育学院(AI湖湘学派)
·
2023-10-26 22:30
车载DSP音频系统研究开发
音频
算法
c语言
香蕉派 Banana PI BPI-R64开源路由器,MTK MT7622 64位开发板
MediaTekMT7622,1.35GHZ64bitdual-coreARMCortex-A532,1GDDR3SDRAM3,MiniPCIEinterfacesupport4Gmodule4,built-in4x4n802.11n/Bluetooth5.0system-on-
chip
5
Wendy_BananaPi
·
2023-10-26 02:06
物联网
iot
硬件工程
单片机
ubuntu
上海见 | 易基因科技与您相约2023年中国微生物学会学术年会
图片来源:中国微生物学会公众号易基因科技受邀参加会议,将携原核三代甲基化、原核转录组、宏病毒组、细菌
ChIP
-s
易基因科技
·
2023-10-25 10:03
生物学
生物信息学
经验分享
科技
VC密码正确无法登陆。证书过期。处理。
0x00007fecb000b770]_serverNamespace=/action=Allow_pipeName=/var/run/vmware/vpxd-webserver-pipe)进入ssh界面检查
chip
mgaofeid
·
2023-10-20 12:05
VMware
Horizon
ssh
安装visual studio报错“无法安装msodbcsql“
未能安装包“msodbcsql,version=17.2.30929.1,
chip
=x64,language=zh-CN”。
香煎三文鱼
·
2023-10-20 04:15
VS
windows
visual
studio
无法安装msodbcsql
ATAC-seq分析干货-2
ATAC-Seq能帮助我们从全基因组范围内推测可能的开放染色质位点,其分析从本质上来说和
ChIP
-seq区别不大,核心都是peak-calling。
生信阿拉丁
·
2023-10-19 22:45
一文读懂 ChIPseq
一、介绍
ChIP
-seq,测序方法
ChIP
指染色质免疫共沉淀技术(ChromatinImmunoprecipitation,
ChIP
),seq指的是二代测序方法作用:识别蛋白质与DNA互相作用情况原理:
白墨石
·
2023-10-19 15:32
用Bing绘制「V我50」漫画;GPT-5业内交流笔记;LLM大佬的跳槽建议;Stable Diffusion生态全盘点第一课 | ShowMeAI日报
美国升级AI芯片出口禁令,13家中国GPU企业被列入实体清单nytimes.com/2023/10/05/technology/
chip
-makers-china-lobbying.html去年,受到美政府的限制
ShowMeAI
·
2023-10-19 03:11
ShowMeAI资讯日报
⛽
首席AI资讯收纳官
人工智能
音视频
LLM
AIGC
大语言模型
prompt
gpu算力
③ valr实例计算
ChIP
-seq中Upstream + GeneBody + Downstream上下游reads的分布
这里只考虑正向的,如果有反向的可以先转为正向。#Summarizingintervalcoverageacrossgenomicfeaturesbedfile%filter(strand=="+")%>%mutate(end=start+1)#1000bpupanddownstreamregion_size%bed_slop(genome,both=region_size)%>%bed_makew
热衷组培的二货潜
·
2023-10-18 22:10
linux gpio 学习
前情基于linuxgpio会在/sys/class/gpio目录下会生成export,unexport文件,当然也有gpiochipx文件,gpiochipx是对引脚的管理,如某一个
chip
可能控制着一定数量的引脚
jmdvirus
·
2023-10-18 08:27
易基因:
ChIP
-seq揭示组蛋白修饰H3K27me3调控高温下棉花的雄性不育机制|Plant Com
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。气候变化导致极端天气事件更加频繁地发生,包括反常的高温(hightemperature,HT),HT胁迫对作物的生长发育和产量有严重的负面影响,如平均生长温度每升高1°C,水稻产量就会下降10%,这一下降主要是由于对生殖发育的影响。棉花(Gossypiumspp.)是世界上最重要的经济作物之一,陆地棉(Gosspyiumhirsutum
易基因科技
·
2023-10-17 10:11
生物学
生物信息学
数据挖掘
经验分享
CV计算机视觉每日开源代码Paper with code速览-2023.10.13
【基础网络架构】
CHIP
:ContrastiveHierarchicalImagePretraining论文地址:https://arxiv.org//pdf/2310.08304开源代码:GitHub-harshiljhaveri
CV51
·
2023-10-15 20:40
CV每日paper
with
code
计算机视觉
人工智能
【工具速递】使用 Chromap 快速对齐和预处理染色质图谱-Fast alignment and preprocessing of chromatin profiles with Chromap
Chromap在比对精度上与BWA-MEM和Bowtie2相当,比传统工作流程在批量
ChIP
-seq/Hi-C配置文件上快10倍以上,在单细胞ATAC
六博说
·
2023-10-14 14:54
什么是GRACE CPU --- Grace CPU架构详解
超级芯片的核心是NVLinkChip-2-
Chip
(C2C),它允许NVIDIAGraceCPU以900GB/s的双
扫地的小何尚
·
2023-10-14 10:05
架构
NVIDIA
计算机视觉
人工智能
AI
ChIP
-Seq分析流程记录
ChIP
-seq简介概念:
ChIP
-Seq是用于在全基因组范围中研究DNA结合蛋白(相互反应)、组蛋白修饰(表观遗传标记)和核小体的技术,研究这三个主题可有助于了解基因之间的相互调控以及染色体的功能结构
Zhai1994
·
2023-10-14 06:01
Linux GPIO 驱动 (gpiolib)
目录1、简述2、Gpiolib相关数据结构分析2.1gpio_
chip
结构2.2gpio_desc结构2.3gpio_device结构3、Gpiolib对接芯片底层3.1、注册GPIO资源(gpiochip_add
爱洋葱
·
2023-10-14 04:06
#
设备驱动
Gpiolib
ChIP
-seq基本分析流程
前年在中科院做培训时,整理了一套
ChIP
-seq分析流程,截选实战部分,略作修改,分享出来,希望大家指正。
生信宝典
·
2023-10-13 11:28
二代测序文库构建-概述与挑战(1)
这些因素包括,DNA/RNA材料的定量和物理性质以及潜在应用(比如,基因组测序、靶向测序、RNA-seq、
ChIP
-seq、RIP-seq和甲基化),在制备高质量测序文库的内容中将提到。另
Juan_NF
·
2023-10-13 03:49
Matter(
CHIP
)环境搭建
搭建参照https://github.com/project-
chip
/connectedhomeip/blob/master/docs/guides/BUILDING.mdubuntu系统使用wsl,
iot-lorawan
·
2023-10-12 14:43
Matter
iot
物联网
网络协议
arm
浅谈先进封装技术
SoCvs.SiPSoC:全称System-on-
chip
,系统
cy413026
·
2023-10-10 04:33
芯片制造
先进封装
表观遗传--CUT&Tag
CUT&Tagforefficientepigenomicprofilingofsmallsamplesandsinglecells,文章详述了CUT&Tag的实验方案、详细结果,以及和其他两个技术的
ChIP
-seq
假装_学霸
·
2023-10-09 23:12
单细胞
ChIP
-seq技术(CoBATCH)
文献翻译:CoBATCH一个基于单细胞的
ChIP
-seq技术image.png>SUMMARY缺乏一种有效的,可推广的全基因组方法单细胞组蛋白修饰或染色质结合蛋白的定位方法。
caokai001
·
2023-10-09 23:37
rocket-
chip
[email protected]
验证环境操作指南
[email protected]
验证环境操作指南========================================================rocket-tools版本号*(HEADdetachedat2022.12.26)--------------------------------------------------------------
前滩西岸
·
2023-10-09 03:26
risc-v
chisel
rocketchip
【ARM CoreLink 系列 1 -- SoC 片上互联介绍】
片上系统(System-on-
Chip
,
CodingCos
·
2023-10-08 07:40
#
ARM
AMBA
Bus
Introduction
片上互联
共享总线结构
NOC
Crossbar
架构
mesh
总线
noc
总线
NOC
QoS
ATAC-Seq与
ChIP
-Seq的异同
ATAC-Seq与
ChIP
-Seq的异同ATAC-Seq与
ChIP
-Seq的不同的是ATAC-Seq是全基因组范围内检测染色质的开放程度,可以得到全基因组范围内的蛋白质可能结合的位点信息,一般用于不知道特定的转录因子
RachaelRiggs
·
2023-10-07 22:15
安装ubuntu时报错ima: error communicating to tpm
chip
解决方法
1.进入安装时,光标移动到"installubuntu"2.按"e"进入编辑模式,进入命令行模式3.找到’‘quitesplash’'然后去掉"—"后,添加“nomodeset”(依照不同显卡进行不同显卡驱动选项的添加,如果使用的是Nvidia显卡,添加nomodeset)4.F10安装5.安装成功后重启,选择Ubuntu,同样按e,在quitesplash后加nomodeset;按F10启动系统
zxw610
·
2023-10-06 06:03
系统
遇到了一次colorspace的测序数据
我通常处理的都是RNA-seq数据,也全是来自illumina测序平台(自认为擅长RNA测序数据的个性化分析),但是最近学习
ChIP
-seq的时候,碰巧下载了一组SOLiDcolorspaceformat
果蝇饲养员的生信笔记
·
2023-10-06 02:57
嵌入式Linux应用开发-基础知识-第十八章系统对中断的处理②
②18.3Linux中断系统中的重要数据结构18.3.1irq_desc数组18.3.2irqaction结构体18.3.3irq_data结构体18.3.4irq_domain结构体18.3.5irq_
chip
华为奋斗者精神
·
2023-10-02 05:13
Linux
ARM
MCU
MCU
C51
linux
单片机
运维
c++
c语言
FLUTTER学习笔记--布局
文章目录一、线性布局1.Column2.Row3.代码4.效果二、弹性布局1.Flex2.Expanded(可伸缩组件)3.代码4.效果三、流式布局1.Wrap(解决内容溢出问题)2.
Chip
(标签)3
VaIOReTto1
·
2023-09-30 10:22
flutter学习笔记
flutter
学习
android
芯片设计、流片、验证、成本的那些事!
一、晶圆术语芯片(
chip
、die
路丝栈
·
2023-09-28 10:45
嵌入式硬件
单片机
Molecular Cancer|CDK9抑制诱导表观遗传重编程,揭示了规避淋巴瘤耐药性的策略
在淋巴瘤细胞中,如何通过ATAC-seq和
ChIP
-seq揭示CDK9抑制诱导表观遗传重编程?看看今天带来的这个文章。发表单位:美国希望之城国家医疗中心期刊:MolecularCance
爱基百客
·
2023-09-27 18:53
ATAC
单细胞ChIP
其他
阅读牛津阅读树必看知识! 牛津人物介绍大百科!
牛津阅读树主要是Kipper、Biff和
Chip
一家和他们的邻居之间发生的故事。讲故事前,先把主要人物为孩子介绍一下吧!
麦芽书屋
·
2023-09-27 14:15
在ubuntu20.04上面跑通rocket-
chip
仿真,用rocket-tools工具
ubuntu20.04$sudoapt-getinstallautoconfautomakeautotools-devcurllibmpc-devlibmpfr-devlibgmp-devlibusb-1.0-0-devgawkbuild-essentialbisonflextexinfogperflibtoolpatchutilsbczlib1g-devdevice-tree-compilerp
前滩西岸
·
2023-09-27 11:15
chisel
riscv
verilator
chisel
rocketchip
risc-v
代码分析 | 单细胞转录组质控详解
前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、
ChIP
-seq分析(
ChIP
-seq基本分析流程)、单细胞测序分析(重磅综述:三万字长文读懂单细胞
生信宝典
·
2023-09-25 08:00
SOC芯片在精度测量领域的设计应用
soc芯片即System-on-a-
Chip
,简单解释就是系统级芯片。它是一个产品,是一个有专用目标的集成电路,其中包含完整系统并有嵌入软件的全部内容。
鼎盛合设计开发
·
2023-09-22 17:54
单片机
嵌入式硬件
Week7—TFmapper: 用
ChIP
-seq/ATAC-seq/DNase-seq数据预测感兴趣基因的调控因子
原文:TFmapper:AToolforSearchingPutativeFactorsRegulatingGeneExpressionUsingChIP-seqDataDOI:10.7150/ijbs.28850发表日期:2018.09.07作者:JianmingZeng(大神哦)TFmapper:http://www.tfmapper.org/功能:用于搜索感兴趣的基因的调控因子感兴趣基因组区
六六_ryx
·
2023-09-21 20:18
芯片生产封装过程简介及概念
1.wafer,die,
chip
,cell的概念wafer(晶圆):高纯度的多晶硅溶解后掺入硅晶体晶种,然后慢慢拉出,形成圆柱形的单晶硅。硅晶棒在经过研磨,抛光,切片后,形成硅晶圆片,也就是晶圆。
cy413026
·
2023-09-21 04:15
soc
芯片制造
3D
COB小间距的工艺技术,cob小间距相比常规表贴(SMD)小间距有何优势?
JRCLED晶锐创显COB(
Chip
-on-Board),也称为芯片直接贴装技术,是指将裸芯片直接粘贴在印刷电路板上,然后进行引线键合,再用有机胶将芯片和引线包封保护的工艺。
晶锐创显JRCLED
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2023-09-20 23:56
matter
[官网](https://buildwithmatter.com/)[Github](https://github.com/project-
chip
/connectedhomeip)[开放联盟](https
高巨龙
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2023-09-20 11:33
代码分析 | 单细胞转录组clustering详解
聚类可视化NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、
ChIP
-seq分析(
ChIP
-seq基本分析流程)、单细胞测序分析(重磅综述:三万字长文读懂单细胞
生信宝典
·
2023-09-20 04:14
Nvidia Jetson 板子序列号或者
chip
id 查看
NvidiaJetson板子序列号或者chipid查看jetson开发时,有时候需要利用设备唯一序列号对代码进行加密,防止被拷贝到别的机器上运行序列号可以用如下指令获取cat/sys/firmware/devicetree/base/serial-number或者cat/proc/device-tree/serial-numberchip-id可以用如下方式获取cat/sys/module/fus
啦啦啦小石头
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2023-09-18 09:51
ubuntu
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