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Chip
全反式维甲酸(ATAR)诱导白血细胞的染色质构象改变而影响分化进程
AlterationsofspecificchromatinconformationaffectATRA-inducedleukemiacelldifferentiation期刊:CellDeath&Disease影响因子:6.044主要技术:Hi-C、ATAC-seq、
ChIP
-seq
d5c9c866171f
·
2024-01-24 11:45
ChIP
-seq数据质控
日常瞎掰
ChIP
-seq可以用来研究某种转录因子或者组蛋白(后面统称为蛋白因子吧)在基因组上的结合位置,从而来确定蛋白因子可能调控的靶基因,继而推测出在生物过程中的相关调控功能。
生信云笔记
·
2024-01-23 17:36
2019-03-16
EP3C40F780I7N介绍:EP3C40F780I7N属于芯片,芯片(
chip
)就是半导体元件产品的统称。是集成电路(IC,integratedcircuit)的载体,由晶圆分割而成。
QUEQUE123
·
2024-01-22 20:19
CUTANA™ CUT&RUN Assays ——实现超敏基因组定位
研究细胞内蛋白质-DNA相互作用的常用方法是染色质免疫沉淀(ChromatinImmunoprecipitation,
ChIP
),同时
ChIP
还常被用于确定基因组上与组蛋白修饰相关的特定位点(即组蛋白修饰酶的靶标
Neobioscience
·
2024-01-22 11:14
CUTANA
CUT
RUN
Assays
表观遗传学
TiED:人类组织特异性增强子数据库
鉴定了增强子的组织特异性,网址如下http://lcbb.swjtu.edu.cn/TiED/首先综合H3K27ac,H3K4me1,H3K4me3和DHS的结果来识别增强子区域,从Roadmap和ENCODE下载
chip
_seq
生信修炼手册
·
2024-01-20 07:21
IPQ9574: High-performance WiFi7 wireless network
chip
leading the future
Withthecontinuousadvancementoftechnology,wirelessnetworkshavebecomeanindispensablepartofourlives.IPQ9574,asawirelessnetworkchipbasedonWiFi7technology,leadsthefutureofwirelessconnectionswithitsexcellen
Wallytech
·
2024-01-19 09:54
网络
5G
嵌入式硬件
物联网
大数据
易基因:
ChIP
-seq等揭示WWOX基因通过上调Myc促进骨肉瘤发生发展的表观调控机制|Cell Death Dis
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。骨肉瘤(Osteosarcoma,OS)是一种高侵袭性骨肿瘤,主要影响儿童和青少年。这种恶性肿瘤与不良临床结果相关,尤其是肺转移。由于其罕见性和生物学异质性,对其分子基础研究有限,阻碍了有效疗法的发展。WW结构域氧化还原酶(WWdomain-containingoxidoreductase,WWOX)是一种在人骨肉瘤中经常发生变化的基因
易基因科技
·
2024-01-16 13:23
高分文献
文献科普
项目文章
生物学
生物信息学
经验分享
数据挖掘
易基因:
ChIP
-seq等揭示Runx2通过转录调控Itgav表达激活肝星状细胞以促进肝纤维化|科研进展
这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。肌成纤维细胞(myofibroblasts)主要由肝脏中活化的肝星状细胞(hepaticstellatecellsHSC)组成,在肝纤维化进展中发挥着核心作用。由于肌成纤维细胞主要负责细胞外基质蛋白的合成、沉积和重塑,因此靶向HSC被认为是肝纤维化治疗的一种新策略,并且正在进行越来越多的临床前研究和临床试验。先前的研究表明,runt相关转录因子
易基因科技
·
2024-01-16 13:20
文献科普
高分文献
生物学
生物信息学
经验分享
数据挖掘
python多线程
具有这种能力的系统包括对称多处理机、多核心处理器以及芯片级多处理(
Chip
-levelmultithreading)或同时多线程(Simultaneousmultit
Yznx_请叫我小哥
·
2024-01-15 18:31
UPF与低功耗设计实现实例 -- 附UPF与DC综合脚本
UPF》孙轶群
[email protected]
国民技术股份有限公司NationzTechnologiesInc4.0低功耗设计实现实例这里提供一个DEMO(pl8051_extend_
chip
sunvally
·
2024-01-15 09:16
低功耗设计与验证
硬件工程
修改BAM文件中的染色体名字
在处理
ChIP
-seq数据的时候,遇到这样一个问题:前期我的FASTA和GTF文件中染色体的名字是1,2,3......22这样的,但后期某些分析过程要求染色体名称必须以chr开头,比如用来找enhancer
生信菜菜鸟
·
2024-01-14 15:33
用于WB,IP,IHC,IF,
ChIP
的抗体有哪些区别?
那么实验当中,用于WB,IP,IHC,IF,
ChIP
的抗体有哪些区别?
百奥创新
·
2024-01-12 12:21
经验分享
科技
健康医疗
CUTANA™ pAG-Tn5 for CUT&Tag
与
ChIP
-seq相比,CUT&Tag在降低细胞需求量和测序深度的信噪比方面进行了显著改进。
Neobioscience
·
2024-01-11 07:16
CUTANA
pAG-Tn5
表观遗传学
零代码差异表达分析工具:GEO2R
不仅有DNA数据,表达谱数据,也有甲基化数据和
chip
-seq的数据。
生信交流平台
·
2024-01-09 07:04
halcon10_测量_1_一维测量(找边测量边的距离)
流程代码*1读取图片参数(输出参数Image,输入参数图片路径)read_image(Image,'printer_
chip
/printer_
chip
_01')*3画一个矩形,再将151.674,815.649
baivfhpwxf2023
·
2024-01-07 19:51
机器视觉
笔记
经验分享
学习
chip
-seq测序分析流程
步骤1:质量控制fastqc质控,假如有两个样本,实验组为sample1,对照组为control1#双端测序fastqcsample1_1.fq.gzsample1_2.fq.gzfastqccontrol1_1.fq.gzcontrol1_2.fq.gz去除接头序列在进行比对之前,需要对测序数据进行质量控制。这包括剔除低质量的读段,去除接头序列等。#安装trimmomaticcondainsta
微光**
·
2024-01-06 14:11
chrome
前端
2022-11-13
任何观念都会随着长大而改变2,我在本片文章/音频/视频中学到的怦然心动的单词(精读和视听说分别总结)misspend虚度ornate华丽的exert用力fallout结果frame框架origin起因affluent富裕的
chip
地理科学7班夏雨桐
·
2024-01-06 05:01
一。IMX6q emm烧录 步骤
1.使用对应工具mfgtools我的开发板IMX6Q(工业级1G+8G)设备树烧写工具查看cfg.ini文件[profiles]
chip
=Linux[platform]board=SabreSD[LIST
chilian12321
·
2024-01-05 11:37
linux
imx6q
RNA-seq最强综述名词解释&思维导图|关于RNA-seq,你想知道的都在这(续)
前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、
ChIP
-seq分析(
ChIP
-seq基本分析流程)、单细胞测序分析(重磅综述:三万字长文读懂单细胞
生信宝典
·
2024-01-02 16:05
HALCON学习笔记(八)——HALCON相关实例和算法
实例:dev_update_window('off')read_image(Image,'printer_
chip
/printer_
chip
_01')get_image_size(Image,Width
weixin_45482443
·
2024-01-01 17:09
HALCON
oj 1.8编程基础之多维数组 25:螺旋加密
谢谢Thanks♪(・ω・)ノ
Chip
和Dale发明了一种文本信息加密技术。他们事先秘密约定好矩阵的行数和列数。接着,将字符按如下方式编码:1.所有文本只包含大写字母和空格。
一小彭水
·
2023-12-31 12:49
算法
C语言
c++
学习力践行day101
chip
'srobot我故意读成biff,他就给我讲
chip
和kipper是男生,biff是女生。其中有个G开头的词,他大概知道发k的音,只是后面读不出来,差不多能蒙点。3.逻辑狗两页自己读题完成。
赵小动
·
2023-12-31 09:59
各种无线协议、不同厂家的统一者?什么是matter,它的网络结构
1.1背景Matter前称叫
CHIP
项目(ConnectedHomeOverIP),智能家居的一个全新连接标准,早期是由几大巨头,谷歌、苹果、ZigBee联盟等牵头主导并开源的一个用于解决无线物联IOT
Aaron Mo
·
2023-12-31 06:13
物联网
设计规范
射频工程
网络
Histone H3K27ac Antibody, SNAP-
ChIP
® Certified
EpiCypher推出的
ChIP
级别的HistoneH3K27acAntibody符合EpiCypher的“SNAP-
ChIP
®Certified”标准,用于
ChIP
实验中的特异性和有效靶标富集(整板的交叉反应性
Neobioscience
·
2023-12-30 08:02
H3K27ac抗体
EpiCypher
ChIP
-seq综述
WritingChIP–seq:advantagesandchallengesofamaturingtechnology概述相比
chip
-
chip
,
chip
-seq提供了更高的分辨率,更少的noise以及更大的覆盖度
Shaoqian_Ma
·
2023-12-29 20:45
2020.9.15丨
Chip
-seq结果可视化之peak检测(上)
macs2运行参数macs2callpeak-tK1_ChIPed_S1_L007_R1.bam-cK1_Input_S5_L007_R1.bam-fBAM-gmm-nK1-B-q0.01-t-c实验组和对照组结果-f输入文件格式-g参考基因组有效大小,人类选择hs,也可以根据基因组大小直接输入数值-n输出前缀-B输出bdg格式文件,可以上传到UCSC生成峰图-qq值,默认0.05-pp值,未校正
穆易青
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2023-12-29 19:43
生物信息
R语言
Chip-seq
2020.9.17丨
Chip
-seq结果可视化之peak检测(下)
我使用的工具是MEME-
ChIP
,MEME是一个工具系列,挖掘motif的工具比较丰富,MEME、DREME、TomTom、MEME-
ChIP
,其中MEME-
ChIP
可以同时调用其他几个工具进行综合分析
穆易青
·
2023-12-29 19:43
Chip-seq
生物信息
基因组
Chip
-seq数据分析流程
1、数据质量评估与过滤使用fastqc进行数据的测序质量评估、运行结束后生成一个*.html网页文件,一个*.zip压缩文件fastqc*.fq.gz使用trimmomatic对测序数据进行过滤,剔除测序质量不好的数据##下载Trimmomaticwgethttp://www.usadellab.org/cms/uploads/supplementary/Trimmomatic/Trimmomat
比它虎
·
2023-12-29 19:13
r语言
python
高通---
ChIP
-Seq数据的Peak calling以及visualization
ChIP
-Seq数据的Peakcalling以及visualization文章目录
ChIP
-Seq数据的Peakcalling以及visualization一、主要分析流程二、去除PCRduplicate
大柚子8323
·
2023-12-29 19:13
linux
ChIP
-seq 数据分析
1
ChIP
-Seq技术1.1概念1.2
ChIP
-seq技术原理2
ChIP
-Seq数据分析2.1数据下载2.2质量控制(data_assess)2.3比对到参考基因组(mapping_analysis)2.4
fengzhibifang
·
2023-12-29 19:13
ChIP
-seq笔记
文章目录
ChIP
-seq学习1数据下载1.1数据主要分为三个部分1.2从NCBI上下载数据2质量控制2.1软件安装2.2转化数据格式sra-----fastq2.3下载小鼠参考基因组的index2.4质量检测
sunyu_03
·
2023-12-29 19:43
ChIP-seq学习笔记
ChIP
-seq 数据分析1
ChIP
-Seq技术2
ChIP
-Seq数据分析
1
ChIP
-Seq技术1.1概念1.2
ChIP
-seq技术原理2
ChIP
-Seq数据分析2.1数据下载2.2质量控制(data_assess)2.3比对到参考基因组(mapping_analysis)2.4
wx1871428
·
2023-12-29 19:43
数据分析
数据原理——1、
ChIP
-seq
4、检测蛋白质与DNA序列的结合峰(1)测序片段匹配到参考基因组(2)检测峰(2)提高峰质量5、影响ChIPseq测序结果的因素(1)免疫共沉淀的影响(2)测序的影响(3)酶断裂方法和超声波打断的影响
ChIP
-seq
很酷的女超人
·
2023-12-29 19:12
数据原理
CHIP
-Seq数据分析流程
文章目录
CHIP
-Seq数据分析流程相关软件安装数据下载将SRA转化为fastq文件数据质控,过滤数据质控然后进行质控,过滤低质量reads,去接头比对下载小鼠参考基因组的索引和注释文件比对sam文件转
美丽的lemon
·
2023-12-29 19:41
生信学习
数据分析
linux
生物信息学
易基因|
ChIP
-seq分析方法:实用的工作流程和高级应用
2020年03月,《Methods》杂志上发表一篇关于表观组学
ChIP
-seq分析方法的综述文章,详细介绍了染色质免疫共沉淀(
ChIP
-seq)的工作流程和高级应用。
易基因科技
·
2023-12-29 19:40
技术解读
生物信息学
生物学
经验分享
BED 文件格式
chip
-seq m6a数据可视化会用到
Generalusage—bedtools2.31.0documentationhttps://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/general-usage.htmlBED格式(BrowserExtensibleDataformat)是一种在生物信息学中广泛使用的文本文件格式,用于描述基因组上的特征和区域。BED文件通常包含基因组坐标、特征的名称、
生信小博士
·
2023-12-29 19:10
信息可视化
学习:StatQuest-
Chip
-seq
什么是
Chip
-seqimage.png翻译下就是染色质免疫共沉淀技术,作用是研究体内蛋白质与DNA相互作用,找蛋白或者转录因子的结合
Chip
-seq建库过程image.png第一步就是要将蛋白和DNA
小潤澤
·
2023-12-29 01:16
ChIP
实验原理精讲
什么是染色质免疫共沉淀技术(
ChIP
)?染色质免疫共沉淀法是在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。
斗战胜佛oh
·
2023-12-26 13:03
喜讯连连捷报传,文章累累创佳绩,平均IF 18分!!!
近期(11月23日-12月4日),高分项目文章频出,涉及物种有梨、腰果、蘑菇、青枯雷尔氏菌和心肌细胞,我们提供的技术支持有
ChIP
、重测序、RNA-seq和代谢组,发表期刊包括PlantJournal、
爱基百客
·
2023-12-25 15:34
全基因组重测序
ChIP-seq
表观代谢
人工智能
ChIP
-seq再立功,组蛋白去甲基化酶在水稻种子的表观调控机制见刊The Plant Journal
发表单位:广东省农业科学院农业生物基因研究中心发表日期:2023年12月20日期刊:ThePlantJournal影响因子:7.22023年12月20日,广东省农业科学院农业生物基因研究中心种子表观遗传刘军研究团队在ThePlantJournal上发表题为“OsJMJ718,ahistonedemethylasegene,positivelyregulatesseedgerminationinri
爱基百客
·
2023-12-25 15:34
ChIP-seq
其他
开源贡献世纪榜评选揭晓,TDengine 成功入选并亮相 FICC 开源计算机系统大会
此前国际测试委员会发布了全球首个人工智能贡献世纪榜(AI100)、首个开源贡献世纪榜(Open100)、首个芯片贡献世纪榜(
Chip
100)、首个测试基准与评价贡献世纪榜单(Bench100)榜单,以展示对
涛思数据(TDengine)
·
2023-12-24 00:55
新闻
tdengine
大数据
时序数据库
3D基因组—实验技术
一、3D基因组之
ChIP
-seq基因组的三维立体结构的主要组成是DNA和蛋白质。研究基因组的三维立体结构就是研究DNA与蛋白之间的互作。
ChIP
一直是研究蛋白与DNA互作的重要方法。
Ray钱
·
2023-12-23 13:18
BCT642BROAD
CHIP
高速 MIPI 开关 代理商方案
BCT642Low-Power,Three-Port,High-SpeedMIPI交换机一般描述特性BCT642是一款bi-directional,low-power,high-低通电容:7.0pF典型快速模拟开关。引脚输出被设计为·低导通电阻:7.0典型简化差分信号布局,配置为差分3db带宽:1.5GHz一种三极双掷开关(TPDT).24引线QFN(2.5x3.4mm)BCT642针对两个MIP
禾川兴科技
·
2023-12-23 07:03
MIPI切换开关
单片机
fpga开发
嵌入式硬件
《生物信息学生R入门教程》读书笔记 Chapter 1
前言最近在阅读欧剑虹老师《生物信息学生R入门教程》非常适合于刚入手NGS的初学者使用,这里我仅做我个人的读书笔记使用本书分为八个章节:1.R/Bioconductor简介2.基因芯片的数据分析3.RNA-seq数据分析4.
Chip
-seq
小潤澤
·
2023-12-19 19:08
牛津阅读树 1-3阶精讲精练音频课
牛津阅读树系列就像一家人在给大家讲故事,这一家人就是贯穿整个系列书的主人公Biff,
Chip
,Kipper,Mum,和Dad,同时也不
知识绿洲
·
2023-12-17 14:18
什么是DMAC?
AbouttheDMACTheDMACisanAdvancedMicrocontrollerBusArchitecture(AMBA)compliantSystem-on-
Chip
(SoC)peripheralthatisdeveloped
Embeded_FPGA
·
2023-12-17 07:02
DMAC
AMBA
AHB
ARM
牛津阅读树点读版和家庭版,读完秒懂它们的区别!
「家庭版」简介目前市面上最常见的版本,是《牛津阅读树》的ReadWithBiff,
Chip
&Kipper系列读本。这个系列包含1-6级,共计58本读物(含2册家长阅读指导);适勇于亲子互动,辅助孩
孩宝小镇
·
2023-12-16 15:28
About the ARM PrimeCell GPIO
ThePrimeCellGPIOisanAdvancedMicrocontrollerBusArchitecture(AMBA)compliantSystem-on-
Chip
(SoC)peripheralthatisdeveloped
Embeded_FPGA
·
2023-12-16 14:17
arm开发
AMBA
APB
GPIO
Chip
and Ribbon Educational Codeforces Round 158 (Rated for Div. 2)
Problem-B-Codeforces题目大意:有一个n个数的数组a,有一个初始等于1的指针,有两种操作:1.设指针当前位置为l,可以选择一个任意位置r(r>=l),使[l,r]内所有数+12.将指针移动到一个任意位置,并令那个位置上的数+1问对于一个初始有n个0的数组,最少要多少次操作2能使其等于a数组1=1思路:因为要操作2次数最少,所以就要让操作1尽量发挥他的作用,那么就让每一次操作1从当
timidcatt
·
2023-12-16 13:39
差分
贪心
算法
c++
c语言
数据结构
海思驱动开发之寄存器操作
在SDK中打开“ReleaseDoc\zh\00.hardware\
chip
\Hi3516EV200”路径,里面有3个文档:《Hi3516EV200经济
lzg2021
·
2023-12-16 10:57
海思开发专栏
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