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Linux
Chip
1/2--linux下利用conda安装所需的软件,数据库下载原始数据
以下是根据生信技能树
ChIP
-seq视频记的笔记,代码来自视频。
徐沫沫
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2023-04-10 11:17
操作系统论文导读(四):Minimizing Memory Utilization of Real-Time Task Sets in Single and…
多处理器方面七、基本的相关调度八、协议特点MinimizingMemoryUtilizationofReal-TimeTaskSetsinSingleandMulti-ProcessorSystems-on-a-
chip
管二狗赶快去工作!
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2023-04-10 05:49
OS学习笔记
系统安全
risc-v
AMBA协议- AXI协议指南(1)
Channeltransfersandtransactions5.通道信号1.概述本文介绍了一个名为AdvancedMicrocontrollerBusArchitecture(AMBA)AXI的协议,它是现代SoC(System-on-
Chip
初夏的雪花
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2023-04-09 17:50
soc
芯片
mcu
介绍一下芯片OCV
OCV全称是onchipvariation,指的是在同一片wafer上,因为片上工艺的误差,导致不同位置的
chip
性能不一样。另外对于同一块
chip
,不同位置上的同一类cell的性能也会有差异。
伟酱的芯片后端之路
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2023-04-09 12:24
GEO数据库视频学习笔记(芯片数据下载和数据读取)
之前写的的
CHIP
-seq和RNA-seq很多练习的数据都是从GEO数据库下载的。但是从来没有细致的了解过GEO这个数据库。
生信start_site
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2023-04-09 07:06
六、Nand初始化
nand_init();voidnand_init(void){inti;unsignedintsize=0;for(i=0;i
chip
[T]
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2023-04-09 00:38
二刷uboot
uboot
2021.3.20 第一天
……………………1.陪娃在家跳舞20min;2.跑步带娃一起;3.睡前读绘本《
Chip
’srobot》;4.10点半左右哄娃入睡。
空谷幽兰Share
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2023-04-08 17:28
【万科V-learn父母学院-家庭双语启蒙】1705-140-
Chip
-2017年12月14日
用心陪伴每一天1音频1b、peppapig第一季1-10集、牙牙学语1、不一样的卡梅拉2动画字母歌、wewishyouamerrychristmas3儿歌与游戏A、SantawillpopoutBaby,IamSanta.Iwillhidebehindthechair.Whenwesing“outSantawillpop”,Iwilljumpout.Let’ssingthesongtogether
水中的珊瑚雨
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2023-04-08 17:48
ChIP
实验操作以及
Chip
-seq数据分析
ChIP
(Chromatinimmunoprecitation)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。
BohanL
·
2023-04-08 00:36
ChIP
实验操作以及
Chip
-seq数据分析
ChIP
(Chromatinimmunoprecitation)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。
BohanL
·
2023-04-08 00:36
flutter Wrap
Chip
微信截图_20200318170941.pngWidgetgetOtherSubmitWidget(){returnWrap(spacing:ScreenUtil.getInstance().setWidth(32),//主轴(水平)方向间距runSpacing:ScreenUtil.getInstance().setWidth(16),//纵轴(垂直)方向间距alignment:WrapAlig
基本密码宋
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2023-04-07 18:46
bed文件转成等bin的bedgraph格式
image.png标准输入文件:一定长度为bins的count数统计文件(类似bedgraph格式)假设你手里有
ChIP
-seq测序结果的bed文件,如何得到等bin区间的bedgraph结果呢。
caokai001
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2023-04-06 03:56
2020-06-23
Chip
-seq 数据分析(1)
E.etal.Polycombassociatesgenome-widewithaspecificRNApolymeraseIIvariant,andregulatesmetabolicgenesinESCs.CellStemCell10,157–170(2012).2.文章中的原始数据:ACCESSIONNUMBERS(文章中)
ChIP
-seqandmRNA-seqd
简冉_ys
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2023-04-05 07:49
R-loop数据分析之R-
ChIP
(数据预处理)
文件重命名我们需要对下载的SRRXXXXX文件进行重命名,毕竟有意义的命名才能方便后续展示。那么,应该如何做呢?首先,你需要将GSE97072页面的中Samples这部分的内容复制到一个文本文件中(我将其命名为sample_name.txt),分为两列,第一列是GSM编号,第二列是样本的命名。samplename注:这里面有一个希腊字符在不同系统表示有所不同,所以我在复制之后手动修改。此外,你还需
xuzhougeng
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2023-04-05 07:27
10X单细胞(10X空间转录组)转录因子活性分析之DoRothEA
DoRothEAregulons收集了文献,
ChIP
-seqpea
Evil_Genius
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2023-04-05 04:07
了解
ChIP
-Seq的实验流程
刘小泽写于2020.3.27
ChIP
-Seq的目的是研究感兴趣蛋白在基因组上的结合位点,可以用来鉴定转录因子(transcriptionfactor,TF)的结合位点或者转录后更广范围的组蛋白修饰(histonemarks
刘小泽
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2023-04-04 23:17
苹果芯片(M1/Apple
Chip
)通过UTM安装x86架构虚拟机指南/性能测试(以ubuntu18.04为例)
苹果芯片性能强功耗低,但是虚拟机作为计算机常用软件,大多数虚拟软件在苹果芯片上仅支持原生架构(ARM)的虚拟机。然而,常用的开发环境是属于x86架构的。那么,如何在苹果芯片上运行不同架构的虚拟机呢?UTM底层基于QEMU实现,可以通过指令转译运行不同架构的系统,这里给出如何通过UTM安装ubuntu18.04-server的教程:官网下载UTM下载ubuntu18.04-server.iso在UT
Overflow_me
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2023-04-04 22:01
架构
虚拟机
基因组序列比对算法介绍(一)
,与人类参考基因组(reference)进行匹配,允许错配(mismatch),插入缺失(indel),目的是在参考基因组找到序列最相似的位置,通常是基因组分析(包括variationcalling,
ChIP
-seq
基因组分析
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2023-04-04 22:13
Linux GPIO文档
www.kernel.org/doc/html/v5.7/driver-api/gpio/index.html闲来无事,看了下官方的文档;当然是边看边用翻译翻的,特地发上来备个份Corestructgpio_irq_
chip
心情复杂i
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2023-04-04 07:33
Linux内核
内核
驱动程序
理解DDR Part 1
DDRx4x8x16x4x8x16指的上图黑色的
chip
输出的位宽,正常的DDRbuswidth需要64bit,所以chipwidthx4x8x16黑色
chip
数量1684上图是最常见的x8,也就有8个黑色的
南方铁匠
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2023-04-04 06:36
Memory
计算机体系结构
DDR
DDR基础知识点汇总
文章目录文档推荐DDR颗粒的电路图来源DDR3SDRAM电路结构高清图DDR4SDRAM电路结构高清图DDR3-1866控制器/PHY/颗粒之间的带宽关系channel>DIMM>rank>
chip
>bank
亓磊
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2023-04-04 03:10
verilog
ddr
DDR存储器中的一些概念
例子中,一个i7CPU支持两个Channel(双通道),每个Channel上可以插俩个DIMM,而每个DIMM由两个rank构成,8个
chip
组成一个rank。
rainbowbirds_aes
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2023-04-04 03:08
SOC外设及接口标准
ddr
利用TCseq包进行基因表达趋势分析
TCseq包提供了一个统一的套件去处理不同时序类型的数据分析,可以应用于转录组或者像ATAC-seq,
Chip
-seq的表观基因组时序型数据分析。
凯凯何_Boy
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2023-04-03 16:20
易基因:
ChIP
-seq等组学分析揭示Hippo-YAP信号调控动物胚胎干细胞(ESC)分化机制:NAR
大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。2020年07月27日,中山大学王金凯教授课题组与袁平教授课题组合作以“Hippo-YAPsignalingcontrolslineagedifferentiationofmouseembryonicstemcellsthroughmodulatingtheformationofsuper-enhancers”为题在《NucleicAc
易基因科技
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2023-04-03 12:47
生物学
生物信息学
数据挖掘
经验分享
人工智能
易基因:高通量测序后的下游实验验证方法——
ChIP
-seq篇|干货系列
此前,我们分享了染色质免疫共沉淀测序(
ChIP
-seq)的数据挖掘思路(点击查看详情),进而筛选出TF结合/组蛋白修饰的目标区域和候选靶基因。
易基因科技
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2023-04-03 12:16
人工智能
生物学
生物信息学
经验分享
数据挖掘
易基因|一文看懂:
ChIP
实验和qPCR定量分析怎么做
染色质免疫共沉淀(ChromatinImmunoprecipitation,
ChIP
),是研究体内蛋白质与DNA相互作用的经典方法。
易基因科技
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2023-04-03 12:45
高分文章
高分文献
技术解读
生物信息学
生物学
ChIP
-seq基本分析流程
欢迎关注天下博客:http://blog.genesino.com/2018/03/
chip
-pipeline/前年在中科院做培训时,整理了一套
ChIP
-seq分析流程,截选实战部分,略作修改,分享出来
生信宝典
·
2023-04-03 05:39
结合
CHIP
-seq和ATAC-seq结果进行分析
,作者的分析结果并不是独立的把ATAC-seq和
Chip
-seq、RNA-seq的结果独立开来,他们把这三种实验的结果进行了整合的分析。从而得到了很多有用的信息。
生信start_site
·
2023-04-03 02:49
使用deeptools计算
ChIP
-seq样本之间的相关性
整理
ChIP
-seq/CUT&Tag分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。当我们需要评估
ChIP
-seq类测序数据的相关性时,deeptools是一个可行且方便的工具。
尘世中一个迷途小书僮
·
2023-04-02 06:32
chip
-seq
Chip
-seqidentifiesthelocationsinthegenomeboundbyproteins.一.技术背景什么是
ChIP
-seq测序建库技术?
cHarden13
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2023-04-01 19:28
chip
-seq数据分析流程
chip
-seq数据分析流程1.
chip
-seq数据下载及更换名称1.1.根据文献提供的ncbi的编号,下载sra数据。1.2.更换文件名:更换后的文件名能表明数据所对应的实验组。
梁兄_小白
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2023-04-01 17:46
一文看全!史上以来的59家测序仪公司
前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、
ChIP
-seq分析(
ChIP
-seq基本分析流程)、单细胞测序分析(重磅综述:三万字长文读懂单细胞
生信宝典
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2023-03-31 09:31
关于编程学习的一些思考
▼生物信息学习的正确姿势(第三版)NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、
ChIP
-seq分析(
ChIP
-seq基本分析流程)、单细胞测序分析
生信宝典
·
2023-03-31 02:11
编程语言
java
python
人工智能
html
使用deeptools将bam文件转换为bw文件
整理
ChIP
-seq/CUT&Tag分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。deeptools提供两个bam转换为bw的命令,分别是bamCoverage和bamCompare。
尘世中一个迷途小书僮
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2023-03-30 04:16
Motif 文库筛选策略——精准定义转录因子结合 DNA 基序!—钟鼎生物
为了解锁上述奥义,经典的技术
Chip
-seq应运而生。但是在植物科学领域,
Chip
级别的抗体难以获得,遗传转化材料的获取周期较长,阻碍了研究进程。
钟小博
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2023-03-29 05:31
TM1638和TM1639差异说明
具体的手册请前往官网查阅:http://www.titanmec.com/product/display-drivers/led-panel-display-driver-
chip
/p/1.html好多平台提供的该芯片的数据手册都是内容不全或者版本比较旧的
perseverance52
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2023-03-28 20:14
电子电路
TM1638
TM1639
Matter统一的智能家居连接标准,赋能智能设备间本地自动化交互
Matter(前称
CHIP
项目)是一个统一的智能家居连接标准,由连接标准联盟发起并领导多家物联网龙头公司联合开发,致力于构建安全、可靠且能够无缝使用的物联网设备。
飞睿科技
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2023-03-28 19:37
MCU芯片
WiFi模块
物联网
网络
科技
嵌入式硬件
IC
Chip
Hot Sell Recomments 11th November
Ouradvantageproducthaveinfineon,DIODES,IR,ST,TI,ADI,Microchip,NXP,XILINX,LINEAR,Atmel,CYPRESS,JST,Maxim,VISHAY,FUJITSU,TOSHIBA,TEandsoon.Wehaveourwonwarehouse,ICshoponlocalcity,wealsojoinedinTBF,HKInv
探达几
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2023-03-28 15:40
基因组染色质状态预测
基因组染色质状态预测对于预测GBR基因组的染色质状态,可以使用ChromHMM这样的工具,以下是一般的步骤:数据准备:从公共数据库或者实验室中获得
ChIP
-seq数据,一般包括多个组织和细胞类型的数据。
Apache_lin
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2023-03-26 21:50
Flutter(32):Material组件之
Chip
Flutter教学目录持续更新中Github源代码持续更新中1.
Chip
介绍
Chip
:标签,一个Materialwidget。它可以将一个复杂内容实体展现在一个小块中,如联系人。
starryxp
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2023-03-25 21:49
PePr识别组蛋白修饰
ChIP
-seq差异峰+bed文件注释
PePr相关内容:文章连接:NCBI-WWWErrorBlockedDiagnosticPePr下载和使用:GitHub-shawnzhangyx/PePr:apeak-callinganddifferentialanalysistoolforreplicatedChIP-Seqdata提前安装的软件和文件:sratoolkit;fastq;bowtie2;samtools;PePr;参考基因组:
Apache_lin
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2023-03-24 11:12
代码分析 | 单细胞转录组Normalization详解
标准化加高变基因选择NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、
ChIP
-seq分析(
ChIP
-seq基本分析流程)、单细胞测序分析(重磅综述:
生信宝典
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2023-03-22 17:10
ChIP
-seq数据分析学习资源总结
首先这个名字要写对:
ChIP
-seq,有很多论文没注意大小写,其实没理解每个字母所代表的含义。
M78_a
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2023-03-20 20:27
文献阅读笔记:CUT&Tag
除了这篇综述,我还查询了其他文献,在本篇笔记的末尾放了一张
ChIP
-seq,CUT&RUN和CUT&Tag三种技术的样品制备比较示意图,非常直观的可以看到3种方法的差异。也易于理解。题目:C
生信start_site
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2023-03-19 13:56
三维基因组(Hi-C)的原理以及应用
Hi-C技术不仅可以研究染色体片段之间的相互作用,建立基因组折叠模型,还可以应用于基因组组装、单体型图谱构建、辅助宏基因组组装等,并可以与RNA-Seq、
ChIP
-S
生信编程日常
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2023-03-15 12:45
SPI
W25Q128的擦除方法有三种,一种为Sector擦除(16个page,共4KB),一种为Block擦除(128个page,共32KB),另一种为
Chip
擦除(整个擦除)MOSI:主设备数据输入,从设备数据输出
Michael_Johnson
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2023-03-14 03:23
新型生物传感器:可实时监测“器官芯片”中的含氧量!
器官芯片(organs-on-a-
chip
),也称为“芯片上的器官”,是近些年发展起来的一门新兴的交叉学科,也是当今生物学研究中最热门的前沿技术之一,吸引了社会各界的广泛关注,被2016年达沃斯世界经济论坛列为
单晶科技
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2023-03-13 05:10
【环境搭建】MacOS系统M1芯片从零开始安装torch torch-geometric(PyG) torch-sparse torch-scatter步骤详解、配置图神经网络(GNN)训练环境教程
前言:实际上只装PyTorch或者torch不会遇到什么问题,但是torch-geometric、torch-scatter、torch-sparse在M1
chip
的Mac上非常难安装(PyGDocumentation
FR1SKY
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2023-03-10 15:46
python
macos
神经网络
pytorch
ChIP
-seq数据分析实战训练(三)
ChIP
-seq数据分析实战训练(三)六、合并bam文件在进行peakscalling的时候,需要把bam进行合并。
小浆果果
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2023-03-10 04:02
u-boot之Nand Flash操作
擦除NandFlash(1)整片擦除nanderase.
chip
(2)分区擦除nanderase.part如果NandFlash已经分区了,那么可以单独擦除某个分区。
飞哥物联
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2023-03-09 16:55
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