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M6A
2021-07-03 RNA
m6A
修饰位点鉴定新策略-1
今天介绍两种不依赖
m6A
抗体的RNAm6A修饰位点鉴定新策略:m6A-label-seq与m6A-SEAL-seq。
NAome
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2021-07-04 22:32
ScorpioGirl的
m6A
调研笔记
图文复现资源:文献1:Post-transcriptionalregulationofantiviralgeneexpressionbyN6-methyladenosine链接:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7981787/代码:https://github.com/al-mcintyre/merip_reanalysis_scripts
ScorpioGirll
·
2021-06-25 22:14
RNA分子
m6A
机制研究4:核心机理
m6A
是目前研究的热点,最近出来的高分文章很多。相当多的老师是在研究
m6A
对靶标RNA的调控机制。我们在2020年底讨论过3类
m6A
的经典思路。
纪伟讲测序
·
2021-06-21 04:58
microRNA调控
m6A
RNA甲基化文献解读
m6ARNAMethylationIsRegulatedbyMicroRNAsandPromotesReprogrammingtoPluripotency摘要:
m6A
目前已经被确认为真核生物mRNA保守性的表观修饰
Ray钱
·
2021-06-20 05:02
微量样本RNA甲基化
m6A
技术比较
在哺乳动物mRNA中,N6-甲基腺苷(
m6A
)约占所有腺苷的0.2%至0.6%,是丰度最高的mRNA修饰。
易基因科技
·
2021-06-15 06:40
纯生信分析套路 综述|癌症中
m6A
与非编码RNA之间相互作用新见解
说起国自然研究新宠儿“
m6A
甲基化修饰”,想必大家都不陌生,
m6A
甲基化是包括mRNA和ncRNA(即非编码RNA,包括miRNA,rRNA,circRNA和lncRNA等)在内的所有RNA最普遍的表观遗传修饰
呆呆聊生信
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2021-06-14 22:37
生信文章这么“虚”,其意义何在?
本期我们以就
m6A
的
纪伟讲测序
·
2021-06-13 16:06
表观遗传--RNA甲基化之
m6A
前沿表观遗传学,包括组蛋白共价修饰(covalenthistonemodification)、DNA甲基化修饰(DNAmethylation)、RNA甲基化修饰(RNAmethylation)、基因组印记(genomicimprinting)、基因沉默(genesilencing)、RNA编辑(RNAediting)及非编码RNA(noncodingRNA)等,是指在核苷酸序列不发生改变的情况下,
假装_学霸
·
2021-06-09 20:05
m6A
甲基化数据分析流程
那么今天小天就和大家一起探讨一下,
m6A
甲基化数据分析的基本流程。
生信交流平台
·
2021-04-18 08:37
抓住一个热点,可以发无数篇纯生信SCI
现在都是流行追热点,例如
m6A
这个研究热点,很多人利用它发了n篇纯生信数据挖掘的文章;再比如铁死亡这个研究热点,有一大堆纯数据挖掘的文章正在投稿中;现在我们看看这个已经发了无数篇纯数据挖掘文章的研究热点
SCI狂人团队
·
2021-04-13 11:11
circRNA测序-病毒circRNA与宿主细胞互作思考
circRNA的研究很火热,不过思路大体就那么三四种,ceRNA机制,结合蛋白,翻译多肽,
m6A
甲基化调控。很多老师希望做出新意。
纪伟讲测序
·
2021-03-11 18:06
m5C-RNA—掀起表观转录组学研究新浪潮
近年来,随着康奈尔大学第一篇RNA腺苷N6位置甲基化(
m6A
)图谱的绘制及其在mRNA普遍存在的发现,转录修饰这一未开垦的学术领域,逐渐成为生物医药界争相挖掘的新领地。
易基因科技
·
2021-01-05 09:09
技术解读
生物信息学
生物学
β-elemene通过
m6A
甲基转移酶METTL3介导的自噬逆转NSCLC细胞吉非替尼耐药
前言肺癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,其发病率和死亡率一直居恶性肿瘤之首。肺癌可分为两种亚型,非小细胞肺癌(non-smallcellLungcancer,NSCLC)和小细胞肺癌。NSCLC可进一步分为腺癌、鳞状细胞癌和大细胞癌,约占所有肺癌病例的80%。然而,肿瘤治疗的主要手段仍然是手术结合放疗和化疗。尽管越来越多的新型抗癌药物和治疗策略被用于治疗非小细胞肺癌,但它们的疗效仍不令人满意。其中,
博士苑
·
2020-12-11 18:54
RNA的
m6A
修饰在基因表达调控中的功能(
m6A
专题)
m6A
修饰几乎涉及RNA代谢的所有方面,含
m6A
基因的转录组分析也揭示了最相关的功能途径与RNA代谢有关。基于甲基转移酶和去甲基酶的定位,
m6A
可以在核或细胞质中被引入或去除。
Ray钱
·
2020-07-12 22:47
m6A
甲基化及预测方法工具总结
DNA、RNA和蛋白三个层面的可逆修饰示意图(Fuetal.NatureReviewsGenetics,2014)DNA和蛋白存在各种修饰,RNA也不例外,目前已知的RNA修饰已经超过上百种。RNA根据编码性可分为编码RNA(protein-codingRNA)和非编码RNA(noncodingRNA)两大类,这些RNA转录后会发生各种修饰,包括N6-腺苷酸甲基化(N6-methyladenosi
dikuangzhong6068
·
2020-06-23 04:34
27-干湿结合挖掘
m6A
在胃癌中的功能抑制和潜在分子机制
一.研究背景
m6A
修饰广泛存在于哺乳动物细胞中,是mRNA以及lncRNA中最常见的表观修饰。
m6A
影响mRNA结构,成熟以及稳定性,从而调节蛋白质表达。
生信学霸
·
2020-04-13 09:38
文献解析(38)胃癌中
m6A
修饰的减少预示恶性表型以及Wnt/PI3K-Akt信号通路增强
一.研究背景
m6A
修饰广泛存在于哺乳动物细胞中,是mRNA以及lncRNA中最常见的表观修饰。
m6A
影响mRNA结构,成熟以及稳定性,从而调节蛋白质表达。
biocc
·
2020-02-21 02:30
m6A
调节因子在肾透明细胞中的基因特征和预后价值:一项使用TCGA数据库的回顾性研究
(1)背景知识真核生物RNA可以携带100多种化学修饰,其中RNA甲基化修饰约占60%,而N6-甲基腺嘌呤(
m6A
)在甲基化修饰中最为普遍,占有率高达80%。
柳叶刀与小鼠标
·
2020-01-05 11:31
一篇
m6A
综述阅读笔记
title:文献笔记-Where,When,andHowContext-DependentFunctionsofRNAMethylationWriters,Readers,andErasersinfectiondate:2019-11-2212:00:00type:"tags"tags:天然免疫categories:文献笔记注:以前看综述的时候,我喜欢把原文逐字翻译为汉语,效率比较低,现在我就采用
backup备份
·
2020-01-04 05:09
[R|数据库]
m6A
数据库总结(上)
需求描述随着网上数据库的增多,我们在做科研的时候,经常可以通过数据库来对对研究点进行提前的预测。但是数据库应该怎么寻找呢?设计思路由于数据库的建立也会伴随着发表一篇类似的文章来介绍数据库。因此我们可以通过pubmed来检索相关发表的数据库,再提取相关数据库信息即可。数据操作检索表达式的构建由于所有网络数据库都是网页形式的,另外在发表文章的时候,肯定都会附数据库的具体网址,因此我们只需要检索网址的特
xhog
·
2019-12-26 01:02
m6A
甲基化对我来说就是好新鲜
m6A
甲基化,咋一听名字我就是拒
春卷00
·
2019-12-15 06:41
m6A
甲基化及预测方法工具总结
DNA、RNA和蛋白三个层面的可逆修饰示意图(Fuetal.NatureReviewsGenetics,2014)DNA和蛋白存在各种修饰,RNA也不例外,目前已知的RNA修饰已经超过上百种。RNA根据编码性可分为编码RNA(protein-codingRNA)和非编码RNA(noncodingRNA)两大类,这些RNA转录后会发生各种修饰,包括N6-腺苷酸甲基化(N6-methyladenosi
AIPuFu
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2019-09-14 09:00
关于mRNA上的
m6A
富集分析文献解读
小编今天给大家带来一篇2012年cell杂志发表的关于
m6A
在mRNA上富集的综合分析文献解读和文献中研究方法的介绍。
Ray钱
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2019-05-27 11:16
m6A
测序原理
图片发自Appref1:RNA甲基化修饰(2)——如何检测
m6A
|重磅前沿建库peakcallingmRNA的5’起始位置,以及3’终止密码子区域存在高甲基化现象建库
苏牧传媒
·
2018-11-20 21:25
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