M6A

2021-05-29 m6A reader——IGF2BPs

m6Areader鉴定的经典套路——m6A修饰RNA探针的RNApulldown结合质谱。今天分享的这项研究就是使用这种方法鉴定到新的m6Ainteractor——IGF2BP1-3。

NAome·2024-02-20 10:25

2021-06-04 双管齐下——mTORC1调控m6A

今天分析的两个研究是同期发表于Molecularcell上的关于mTORC1调控m6A修饰的功能与机制。

NAome·2024-02-13 05:05

ALKBH5通过m6A-dependent表观遗传沉默pre-miR-181b-1/YAP信号轴抑制骨肉瘤的进展

N6-methyladenosine(m6A)是真核生物mRNA中最丰富的可逆甲基化修饰。近年来，许多研究集中在m6a修饰的mRNA的生物学功能上。m6A修饰被

博士苑·2024-01-19 03:27

科研汪的日常 81 读文献10

Sevofluraneimpairsm6A-mediatedmRNAtranslationandleadstofinemotorandcognitivedeficits这是2021年4月发表在CellBiolToxicol上的关于“七氟烷损害m6A

007木子·2024-01-16 01:47

累计IF>5000 | m6A RNA甲基化文章2021上半年发表汇总

RNA甲基化作为近年的研究热点，为科研人员解读生物学问题提供了新的观察角度，其相关研究受到国自然科学基金的青睐，同时，文章成果频发。此前，我们分享了“研究思路”和“生信分析流程”等内容。我们一起看下2021上半年的文章发表情况。利用PubMed检索m6ARNA甲基化，以下数据仅为我们检索所得结果：1.2021上半年RNA甲基化文章发表588篇，IF累计5041.23，平均IF达到8.573，整体分

ee00dc6faab7·2024-01-08 21:37

m6A图文复现01-文献解读|在人的四种不同组织中m6A甲基化的遗传驱动因素

1.文献信息标题：Geneticdriversofm6Amethylationinhumanbrain,lung,heartandmuscle发表时间：2021年7月1日杂志：NatureGenetics（2020IF=27.605）作者：麻省理工学院计算机与人工智能实验室ManolisKellis课题组数据和方法主要数据image-20210711235626527.pngm6AmeRIP–se

_十三·2024-01-07 20:36

纯生信热点摆在眼前，就看你的手速了

随着时间的流逝，很多旧的热点都不好发了，例如细胞焦亡、铁死亡、m6A等。既然旧的热点不好发，就需要找新的热点来做纯生信。提到了新的热点，有人就会问有没有新热点推荐？

SCI狂人团队·2024-01-07 04:17

国自然中标小能手「m6A修饰」的新功能研究

无论是SCI高分文章还是国自然中标项目，都能看出这两年m6A真的很热。

尐尐呅·2024-01-03 15:25

BED 文件格式 chip-seq m6a数据可视化会用到

Generalusage—bedtools2.31.0documentationhttps://bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/general-usage.htmlBED格式（BrowserExtensibleDataformat）是一种在生物信息学中广泛使用的文本文件格式，用于描述基因组上的特征和区域。BED文件通常包含基因组坐标、特征的名称、

生信小博士·2023-12-29 19:10

本周最新文献速递20210704

20210704一、精细解读文献一文献题目：Geneticdriversofm6Amethylationinhumanbrain,lung,heartandmuscle不想看英文题目：人脑、肺、心脏和肌肉中m6A

橙子牛奶糖·2023-12-19 23:28

7+m6A+分型+实验，甲基化方向的生信思路，没有思路的同学可参考

生信风暴·2023-12-16 14:36

RNA甲基化专题 | 癌症研究篇

研究表明，m6A在不同组织，细胞系中是一个复杂的调控网路，m6ARNA甲基化参与RNA的代谢过程，并与肿瘤的发生和发展密切相关。

诺禾致源·2023-11-29 13:10

一篇综述读懂m6A甲基化+分型+免疫浸润+机器学习。快来get

结果解读：m6A甲基化调节

生信风暴·2023-11-16 03:42

m6A+预后模型，这篇文章带你一探究竟.学会轻松get7+

生信风暴·2023-11-10 19:47

5+m6A+预后模型+WGCNA，简单又高效，学习下这篇思路吧

结果解读：在训练集中，基于3个与m6A相关的长非编码RNA建立了一个预后标志在基于276个m6A相关lncRNA的表达水平对EC

生信风暴·2023-11-10 19:12

4+m6A+机器学习+分型，要素过多，没有思路的同学可借鉴

结果解读：脓毒症中m6A调节因子的转录改变为了鉴定脓毒症患者中编码m6A调节因子的差异表达基因，使用“limma”软件包进行差异表达

生信风暴·2023-11-05 04:54

生信交流平台·2023-11-03 11:40

corrplot展示m6a甲基化基因表达相关性

生信交流平台·2023-10-28 10:57

生信分析＋实验验证探究m6A RNA甲基化调节因子与癌症转移的关系（IF10+）

Analysisandidentificationofm6ARNAmethylationregulatorsinmetastaticosteosarcoma转移性骨肉瘤中m6ARNA甲基化调节因子的分析和鉴定发表期刊：MolTherNucleicAcids发表日期：2021Dec11DOI:10.1016/j.omtn.2021.12.008期刊相关信息一、背景骨肉瘤（OS）的特征是快速生长和早期

生信学霸·2023-10-24 15:27

一种癌肽调节m6A读取蛋白IGF2BP1对m6A的识别和肿瘤发生

NatureCommunications的文章——Anoncopeptideregulatesm6Arecognitionbythem6AreaderIGF2BP1andtumorigenesis.N6-甲基腺苷（m6A

博士苑·2023-10-19 03:01

14-IF8+:纯生信分析m6A基因与白血病预后的关系

一.研究背景近两年，科学家们首次发现了一种可逆性的RNA甲基化—m6A，m6A是真核生物mRNA中最常见的修饰[1]，m6A修饰能调控基因表达、蛋白质的转录和mRNA的可变剪切[2,3]。

AAA肿瘤信息学王协·2023-10-15 07:39

M6A rna甲基化最新研究成果进展、论文合集（2021年）

【1】M6ARNA甲基化介导的RMRP稳定性通过调控TGFBR1/SMAD2/SMAD3通路，导致非小细胞肺癌的增殖和进展2021-11-04报道，基于TheCancerGenomeAtlas数据库的综合分析，作者发现线粒体RNA加工核糖核酸内切酶(MitochondrialRNAProcessingEndoribonuclease,RMRP)的lncRNA-RNA组件是与NSCLC低生存率相关的

“泽平科技”公众号24h在线答疑·2023-10-14 11:16

【文献01】m6A修饰增强mRNA的相分离

文献：Ries,R.J.,Zaccara,S.,Klein,P.,Olarerin-George,A.,Namkoong,S.,Pickering,B.F.,...&Jaffrey,S.R.(2019).m6AenhancesthephaseseparationpotentialofmRNA.Nature,571(7765),424-428.相关同类型文献：Dynamicm6Amethylatio

活着之上_要有点理想·2023-10-12 01:48

MC：m6A相关lncRNA组织特异性

m6A是癌症研究的热点，而今天小编要和大家分享的是今年一月份发表在MolecularCancer（IF:15.302）杂志上的关于泛癌中m6A相关长非编码RNA的文章。

概普生信·2023-10-10 04:30

RNA m6A甲基化检测方法

前面给大家简单介绍过m6A甲基化的概念，也给大家介绍了☞m6A甲基化数据分析流程☞corrplot展示m6a甲基化基因表达相关性☞m6a甲基化相关基因boxplot并显示p值☞m6a甲基化相关基因根据临床信息分组绘制

生信交流平台·2023-10-08 13:48

m6A相关lncRNAs做预后分析，效果怎么样？

目前已知的RNA修饰有100多种，其中RNA甲基化修饰占60%以上，而m6A(N6-甲基腺嘌呤)作为高等生物RNA上最为普遍的修饰，近几年的热度只增不减。

概普生信·2023-10-06 11:08

发生信SCI的希望不应该寄托在过去的热点上

例如m6A在2019年到2020年期间可以轻松发表生信SCI，但是到了2022年，这个热点的生信文章就基本发不出去

SCI狂人团队·2023-10-01 04:19

国自然研究热点-RNA甲基化研究指南

m6ARNA甲基化真核生物RNA携带100多种化学修饰，其中RNA甲基化修饰约占60%，而N6-甲基腺嘌呤（m6A）在RNA甲基化修饰中最为普遍，占有率高达80%。

诺禾致源·2023-09-28 04:39

MC：RNA修饰万字综述

6-甲基腺苷(m6A)是mRNA中含量最丰富、特征较好的内部修饰，其作用是调节胚胎干细胞和癌细胞的自我更新，有利于热休克或DNA损伤后的生存。除了m6A修饰在mRNA中的作用外，m6

概普生信·2023-09-27 14:23

生信分析又一个被生信人预测成真的铁死亡新思路

当时给大家举的例子是m6A（详细看副推哦）,最后给大家讲了一个铁死亡思路的分型版本，生信人这次又一语中的了（凡尔赛一下，吼吼），毕竟铁死亡真的很火，发文那么快也是情理之

概普生信·2023-09-25 23:28

一篇综述搞懂m6A、非编码RNA、肿瘤干性调控关系

Theinterplaybetweenm6AmodificationandnoncodingRNAincancerstemnessmodulation:mechanisms,signalingpathways,andclinicalimplicationsm6A修饰和非编码RNA在肿瘤干性调节中的关系：机制、通路及临床意义m6A

概普生信·2023-09-18 15:53

易基因： MeRIP-seq等揭示组蛋白乙酰化和m6A修饰在眼部黑色素瘤发生中的互作调控｜肿瘤研究

N6-甲基腺嘌呤(m6A)是最普遍的mRNA修饰，在肿瘤发生调控中起重要作用。然而，对组蛋白乙酰化和m6ARNA修饰之间的互作研究仍然未知。

易基因科技·2023-09-18 14:07

易基因：MeRIP-seq等揭示mRNA m6A甲基化调控拟南芥的抗寒性分子机制｜植物抗逆

最近研究表明，m6A、m5C等RNA修饰可以影响RNA调控和鉴定mRNA修饰稳定性，从而揭示了另一层在调控基因表达中发挥重要作用的转录后调控。m6A在植物生长

易基因科技·2023-09-18 14:36

m6A都有哪些相关验证实验？来看一下吧

话不多说，接下来我们就细数一下MeRIP-seq，都有哪些相关的验证实验吧~一、m6A区域验证首先，如果需要对m6A修饰位点进行严格的验证，可以用下面这个方法：1、m6A-IP-qPCRm6A-IP-qPCR

嘉因小助手·2023-09-17 09:25

RNA甲基化修饰m6A检测热门技术—MeRIP-seq

m6A甲基化是转录后调控中重要的表观遗传修饰方式，它普遍存在于病毒和真核生物中。

felix108·2023-09-11 06:20

m6a甲基化相关基因根据临床信息分组绘制boxplot并显示p值

生信交流平台·2023-09-10 16:05

27-干湿结合挖掘m6A在胃癌中的功能抑制和潜在分子机制

一.研究背景m6A修饰广泛存在于哺乳动物细胞中，是mRNA以及lncRNA中最常见的表观修饰。m6A影响mRNA结构，成熟以及稳定性，从而调节蛋白质表达。

AAA肿瘤信息学王协·2023-09-09 23:35

Cell Reports | 揭开METTL14在介导m6A修饰中的神秘面纱

m6A被认为是最丰富的mRNA修饰，广泛分布在大多数真核生物中，包括哺乳动物、植物、昆虫、酵母和某些病毒。

爱基百客·2023-09-06 14:39

2021-08-14 头颈部鳞状细胞癌中PD-L1 和 m 6 A RNA 甲基化调节因子的免疫浸润的综合分析

1628943565(1).pngAbstract由于大多数研究都集中在肿瘤的内在致癌途径，因此N6-甲基腺苷(m6A)甲基化在肿瘤免疫微环境(TIME)中的潜在作用仍然难以捉摸。

卅衣·2023-09-06 04:09

文献分享：m6A调控肿瘤转移

文献来源于19年的NatureCommunication：RNAm6AmethylationregulatestheepithelialmesenchymaltransitionofcancercellsandtranslationofSnail，https://doi.org/10.1038/s41467-019-09865-9记录一下文章的设计思路：图1：EMTincancercellsisr

Lucas21423·2023-09-05 23:29

(27分)文献解读：胃癌中m6A调节器介导的甲基化修饰模式和肿瘤微环境浸润特征分析

背景知识和展望m6ARNA甲基化广泛存在于mRNA、lncRNA和miRNA中，且m6A修饰是哺乳动物细胞中一种动态可逆过程，受甲基转移酶、去甲基化酶和结合蛋白的调控。m6A调节因子的表

脱氧核糖核苷酸·2023-09-04 15:21

m6A peak分布饼图绘制 2019-02-25

#读取注释文件>read.table("PA_NC_specific.anno(distribution).txt",header=F,sep="\t",quote="")V1V2V3V4V5V6V7V8V9V10V11V12V13V141chr1205749988205749989chr1:205749771-205750206chr1205712819205750276ENST00000367

chaupak·2023-09-03 17:03

m6A甲基化

前沿表观遗传学，包括组蛋白共价修饰(covalenthistonemodification)、DNA甲基化修饰(DNAmethylation)、RNA甲基化修饰(RNAmethylation)、基因组印记(genomicimprinting)、基因沉默(genesilencing)、RNA编辑(RNAediting)及非编码RNA(noncodingRNA)等，是指在核苷酸序列不发生改变的情况下，

Seurat_Satija·2023-09-02 19:14

易基因：MeRIP-seq等揭示ALKBH5介导m6A去甲基化调控皮肤创面再上皮化分子机制｜科研进展

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。哺乳动物的损伤皮肤屏障完整性恢复通过创面愈合基本机制实现，这是一个包括凝血、炎症、再上皮化（re-epithelialization）、肉芽组织形成和疤痕重塑的多步骤过程。再上皮化是决定创面成功愈合的重要因素，再上皮化受损是创伤、糖尿病、血管疾病、感染或辐射导致的所有慢性创面无法愈合的原因。因此研究创面再上皮化调控机制具有重要的临床意义

易基因科技·2023-08-29 13:41

易基因：m6A-seq等揭示RBM33参与调控m6A去甲基化酶ALKBH5活性及其底物选择性｜科研进展

大家好，这里是专注表观组学十余年，领跑多组学科研服务的易基因。RNA结合蛋白（RNA-bindingprotein，RBP）是一类结构和功能多样化的蛋白质，参与多种生物过程。越来越多的证据表明，RBP通过调控编码或非编码RNA的可变剪接、转运、稳定性、降解和翻译，在基因表达的转录后调控中发挥着关键作用，但RBP中RNA结合motif蛋白33（RNA-bindingmotifprotein33,RB

易基因科技·2023-08-29 13:09

m6A相关lncRNAs与肿瘤的关系