PYG 第6页

GNN在生化任务上的工程实现学习笔记

目录1.预备知识GNNFramework2.GNN使用PyG(PyTorch第三方库)的实现torch_geometric官方文档1.MessagePassing继承MessagePassing基类的GCNConv2

ALE.code·2022-11-22 21:02

PYG教程【四】Node2Vec节点分类及其可视化

本文主要是介绍如何用PyTorchGeometric快速实现Node2Vec节点分类，并对其结果进行可视化。整个过程包含四个步骤：导入图数据（这里以Cora为例）创建Node2Vec模型训练和测试数据TSNE降维后可视化Node2vec方法的参数如下：edge_index(LongTensor)：邻接矩阵embedding_dim(int)：每个节点的embedding维度walk_length(

vincent_hahaha·2022-11-22 12:44

pyG利用MessagePassing实现GCN(了解pyG的底层逻辑）

目录必备了解利用MessagePassing实现GCN利用MessagePassing实现GCN是pyG官网的例子，后面graphSAGE和GAT是根据公式和pyG例子写的！

山、、、·2022-11-22 12:42

GCN——一张图是一个样本的情况（ENZYMES数据集）

之后结合pyg的官网和网上的介绍实现了一下ENZYMES这个数据集的图卷积预测。

WenbinYao&YouweiHu·2022-11-22 12:09

torch_scatter安装报错

pipinstalltorch_scatter报错呢，有可能是版本对应有问题，可以进入网站https://data.pyg.org/whl/找到对应自己python/torch/cuda版本，再指定包版本安装比如

RessCris·2022-11-22 09:41

安装torch_scatter,torch-sparse,torch-cluster,torch-spline-conv全套包——附下载链接

使用PyG-Temporal库时，需要安装包含torch、torch_scatter,torch-sparse,torch-cluster,torch-spline-conv,torch-geometric

陨越·2022-11-22 09:39

安装PYG的前提，安装torch-scatter, torch-sparse, torch-cluster报错

安装torch-geometric之前需要安装torch-scatter,torch-sparse,torch-cluster首先要保证安装的torch,torchvision,cuda的版本都相对应；再安装torch_scatter，然而，使用pipinstall安装torch-scatter报错了，但是使用指令：pipinstall--no-indextorch-scatter-fhttps:

无脑敲代码，bug漫天飞·2022-11-22 09:01

手把手教你安装torch_geometric库（pyg）

正常步骤：1.在安装前要检查电脑的上的torch和cuda版本importtorch;print(torch.__version__)检查torch版本；importtorch;print(torch.version.cuda)检查cuda版本；2.检查完后，可以按照官网上的步骤直接用pip或者conda的命令进行安装；（Installation—pytorch_geometricdocument

杰克船长有烦恼·2022-11-22 05:18

windows下MiniAnaconda+pyg(torch-geometric)的安装

前端时间尝试着在windows的系统下装torch-geometric(pyg)，但是用pycharm里面的pip进行安装却一直出现错误，当时出现的是cpp编译出错，所以当时直接放弃了。

阿强de·2022-11-22 05:46

torch-geometric包安装（适用于无法直接conda或pip安装）

__version__#查看torch和cuda版本2.去官网whl文件将包下载到本地https://data.pyg.org/whl/torch-1.10.0+cu113.html其中如果我的torch

MaZhe丶·2022-11-22 05:12

图神经网络环境搭建

图神经网络环境搭建1.PyG安装创建一个用于搭建图神经网络的专用虚拟环境，方便后续管理安装Pytorch，PyTorch要安装1.11.*版本的（到历史版本里去找），不要安装1.12.

小粥铺·2022-11-22 01:19

安装pytorch_geometric

看论文代码的时候发现需要一个叫torch_cluster的包，本来以为就是那种随便pip一下就可以下载下来的包，但最终还是被折磨了一天才发现这是pyg（pytorch_geometric）的一个子包，然后正确的安装上了

把分还我，我不玩了·2022-11-21 01:24

安装pytorch geometric提示torch-scatter安装失败的解决办法

给出的安装命令pipinstalltorch-scattertorch-sparsetorch-clustertorch-spline-convtorch-geometric-fhttps://data.pyg.org

浩然*·2022-11-20 19:11

torch-geometric 大坑(2) conda 和pip安装

0426更新：由于使用了新的服务器，又得重新安装pyg，五件套分别是单独从Pythoninterpreter里面找的安装的，又报错：这是手动安装的版本重新卸载，使用pip命令安装：torch-scatter

LUQC638·2022-11-20 13:49

【深度学习6】图神经网络库 PyTorch Geometric（PYG）手动安装流程（绝对成功）

目录PyTorchGeometric简介安装PyTorchGeometricPyTorchGeometric简介官方网站：PyGDocumentation—pytorch_geometricdocumentation(pytorch-geometric.readthedocs.io)PyTorchGeometric中设计了一种新的表示图数据的存储结构，也是PyTorchGeometric中实现的各

烈日松饼·2022-11-20 13:06

torch-geometric本地whl安装

**torch-geometric（pyg）安装**一、介绍最近跑实验需要用到torch-geometric，但是安装老是报错，历经一番艰辛终于搞定了，记录一下。

m0_37207831·2022-11-20 13:34

利用PyG实现端到端的链路预测+社区检测（组合优化）

文章目录链路预测和社区检测论文介绍——端到端的学习与优化技术方法ClusterNet基于PyG下的Cora数据集实现组合优化总体思路概述导入需要的包导入Cora数据集模型搭建GCNClusterNet模块度矩阵函数和损失函数

Coconut Shao·2022-11-19 12:26

利用PyG实现社区检测经典算法ClusterNet

文章目录社区检测论文介绍——端到端的学习与优化技术方法ClusterNet基于Cora数据集复现ClusterNet优化部分代码导入需要的包导入Cora数据集数据处理和模型搭建方法一（PyG简洁版）方法二

Coconut Shao·2022-11-19 12:25

pyG框架报错: OSError: libcudart.so.10.1: cannot open shared object file: No such file or directory

继续学习pyG(PytorchGeometric)框架，今天突发报了这个错——OSError:libcudart.so.10.1:cannotopensharedobjectfile:Nosuchfileordirectory

噢啦啦耶·2022-11-19 10:32

深度学习环境配置(pytorch和tensorflow对应的gpu版本环境的兼容)：cuda10.1 + cudnn7.6.5 + tensorflow=2.3.0，tensorflow-gpu=2....

cudnn7.6.5+tensorflow=2.3.0，tensorflow-gpu=2.3.0(tf23虚拟环境，python3.7.3)+pytorch1.81(cu101)+torch-geometric(PYG181

ZhemgLee·2022-11-19 07:46

pytorch中dataloader的num_workers参数

1问题描述在之前的任务超大图上的节点表征学习中，使用PyG库用于数据加载的DataLoader，ClusterLoader等类时，会涉及到参数num_workers。

SheltonXiao·2022-11-19 07:26

PyG库的安装

1.安装正确版本的pytorch和cudatoolkitpytorch和cudatoolkit的安装过程参见博主另一博客查看版本命令见下图：2.安装对应版本的PyG库安装命令见：https://pytorch-geometric.readthedocs.io

奥瑞给给~~·2022-11-19 00:01

python安装使用PyG图神经网络框架

首先切换到CMD，打开python交互环境输入，查看你所安装的pytorch版本importtorchprint(torch.version)我的当前pytorch版本是>>>1.6.0安装依赖包及torch-geometricpipinstalltorch-scatter-fhttps://pytorch-geometric.com/whl/torch-TORCH+{TORCH}+TORCH+{

茵茵学习编程·2022-11-19 00:30

MAC M1安装 PyG

$condaupdateconda$condacreate-npyGpython=3.9$condaactivatepyG$condainstall-yclang_osx-arm64clangxx_osx-arm64gfortran_osx-arm64$condainstallpytorch==1.8$MACOSX_DEPLOYMENT_TARGET=12.4CC=clangCXX=clang++

扮猪的三木·2022-11-19 00:00

Linux本地安装包安装PyG

Linux本地安装包安装PyG基础环境安装包下载安装基础环境Linux系统python3.6.13torch1.5.0cuda10.1cudnn7.6.3确保安装的torch和cuda版本配套，可在torch

0 errors·2022-11-19 00:59

linux环境下PYG安装，报错及解决

之前跑时空预测实验的时候，装过一次PYG，当时也折腾了好几天，网上没有比较好的教程。各种报错但是最后莫名其妙的好了，就一直用着。

qq_44698491·2022-11-19 00:58

PyG(PyTorch Geometric)安装教程(附Cora数据集)

PyG(PyTorchGeometric)安装教程(附Cora数据集)PyG是多特蒙德工业大学（TechnischeUniversityDortmund）的MatthiasFey博士基于PyTorch框架提出的图卷积

Torture_L·2022-11-19 00:28

基于Conda的PyTorch Geometric报“段错误 (核心已转储)”的解决方法

我需要在一台新的PC上运行基于PyTorchGeometric(PyG)和Transformers的代码，但是发现PyG会报错，例如仅仅是这样一条语句：fromtorch_geometric.dataimportData

蛐蛐蛐·2022-11-19 00:28

PyG安装

PyG安装1.GPU安装1.1查看torch,CUDA版本1.2根据版本号安装支持库2.CPU安装（推荐新手）2.1新建虚拟环境（若是初次安装，此步骤也可跳过）2.2安装cpu版torch并查看版本2.3

sanananana·2022-11-19 00:28

PyG 的安装

安装之前的环境版本太低了，导致经常报错，去pyG官方github的issue里面也没有很好的解决办法，因为pyG包也有问题，过段时间估计就有修改，因此为了彻底修复这里就重新进行了最新的安装。

Complicated__76·2022-11-19 00:27

Pytorch-GPU+PyG极简安装！！

目录一、安装pytorch二、安装PyG继极简安装TensorFlow-GPU版本之后，这边继续更新一个极简安装pytorch-gpu教程，依然在Anaconda下面安装，步骤如下：一、安装pytorch0

curiousNinen·2022-11-19 00:27

（有错误，待修改）PyG安装步骤

安装pyg需要依赖pytorch，而安装pytorch需要安装cuda。

_wjunjie·2022-11-19 00:27

PyG快速安装（一键脚本，2021.7.14简单有效）

PYG快速安装通过脚本安装离线本地安装安装结果测试本文提供两种方法安装都可成功安装pyg通过脚本安装直接通过脚本安装，自建一个python脚本，直接运行即可，代码如下：importloggingimportsubprocessfromsetuptoolsimportsetupimporttorchcuda_v

不堪沉沦·2022-11-19 00:57

安装PyTorch Geometric(PyG)教程

安装&测试PyG初始环境：PyTorch1.10.0Python3.8Cuda11.3安装步骤Step0:安装之前强烈建议检查版本：python-c"importtorch;print(torch.

4Rester·2022-11-19 00:57

Win10下PyTorch-Geometric（PyG）安装教程

PyG(即PyTorch-geometric)是德国多特蒙德工业大学的研究者们提出的一个基于Pytorch的拓展库，为各种复杂的图神经网络封装好了一个统一的规范接口，为我们搭建自己设计的图神经网络提供了便利

偶然is·2022-11-19 00:57

基于anaconda安装Pytorch，并安装PyG图网络框架

清华源直接安装pytorch是没有用的，必须下载whl格式的Pytorch到电脑里，然后通过pipinstall***.whl安装torch才行）anaconda安装pytorch由于我们后续需要安装PyG

小安同学apj·2022-11-19 00:56

PyTorch Geometric (PyG) 安装教程

诸神缄默不语-个人CSDN博文目录PyG官方下载主页：Installation—pytorch_geometricdocumentation以下仅考虑Linux系统的情况。

诸神缄默不语·2022-11-19 00:25

安装教程 PyG(PyTorch Geometric)

首先打开PyG的官网，点击这里或许复制下方链接都可。

xiao黄·2022-11-19 00:25

安装PYG

目录1.通过Anaconda安装2.通过pip安装3.尝试历程：参考1.通过Anaconda安装condainstallpyg-cpyg-cconda-forge2.通过pip安装首先通过如下命令获取系统torch和CUDA版本：python-c"importtorch;print(torch.__version__)"python-c"importtorch;print(torch.versio

yimenren·2022-11-19 00:55

在conda环境下安装PyTorch+PyTorch Geometric（Pyg）

关于cuda和cudnn不需要按网上教程去官网下载，也不需要手动在conda环境内安装。直接按PyTorch官网命令安装PyTorch即可，cuda和cudnn会自动按你选择的版本下载。建立conda环境并激活大家应该都会condacreate-n你的环境名字python=你想要的python版本如：condacreate-npytorchpython=3.6激活condaactivate你的环境

Zayden4GNN·2022-11-19 00:55

安装PyG时踩的坑

今天在安装PyG的时候解决了以前困扰了一段时间的bug。

JeryDeak·2022-11-19 00:24

创建图神经网络的Pycharm项目

前面安装了anaconda，在anaconda创建虚拟环境PyG，并在PyG中安装了pytorch和pytorch的图几何计算的包，今天在Pycharm中创建一个项目，解释器就用前面PyG中的解释器。

·2022-11-17 10:56

图神经网络通用框架 —— NLNN非局部神经网络

正在更新中~✨我的项目环境：平台：Windows10语言环境：python3.7编译器：PyCharmPyTorch版本：1.11.0PyG版本：2.1.0项目专栏：【入门图

咕嘟·2022-11-13 20:30

图神经网络 pytorch_geometric库的安装

PyG中实现了很多先进（stateoftheart）的GNN模块，例如GCN、GraphSage、GAT、SGC、GIN等等。

德卡先生的信箱·2022-11-13 11:41

PyG:PyTorch Geometric Library

PyG是一个基于PyTorch用与处理部规则数据（比如图）的库，是一个用于在图等数据上快速实现表征学习的框架，是当前最流行和广泛使用的GNN（GraphNeuralNetworks,GNN图神经网络）库

studyeboy·2022-11-13 11:10

GNN-第三方库：PyG（Pytorch Geometric）【基于Pytorch构建的库，可以帮助用户快速构建和训练自己的图神经网络模型】【DeepWalk、LINE、GCN、GAT等】

一.什么是PyG?PyG全称是PytorchGeometric，它是一个基于Pytorch构建的库，可以帮助用户快速构建和训练自己的图神经网络模型。

u013250861·2022-11-13 11:40

图神经网络--pytorch_geometric基本使用

论文地址:https://arxiv.org/abs/1609.029071.pytorch_geometric的安装不建议直接使用pipinstall直接进行安装，参考其GITHUB：GitHub-pyg-team

樱花的浪漫·2022-11-13 11:38

使用Pytorch Geometric建立自己的数据集

使用PytorchGeometric建立自己的数据集一．引言最近在学习GNN的相关知识，在编写代码的过程中不乏会遇到编程问题，学习过GNN的各位应该都知道这个叫PyG(PyTorchGeometric,

芒果冻挞·2022-11-13 11:06

PyTorch Geometric(PYG)入门指南

pytorch基础请移步pytorch训练CNN1.数据类型介绍类比于pytorch，pyg拥有同样名称的库用于构建网络和处理数据：库名作用torch_geometric.nn封装了常用的GNN相

GIS_11·2022-11-13 11:36

第十六课.Pytorch-geometric入门(一)

目录PyG安装图结构基础基准数据集Mini-Batches构建GCNPyG安装Pytorch-geometric即PyG，是一个基于pytorch的图神经网络框架。

tzc_fly·2022-11-13 11:35

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