PYG 第4页

搭建SGC实现引文网络节点预测(PyTorch+PyG)

目录前言数据集模型实现PyTorch实现PyG实现实验结果完整代码前言SGC的原理比较简单，具体请见：ICML2019|SGC：简单图卷积网络数据集数据集采用节点分类常用的三大引文网络：Citeseer

Cyril_KI·2023-01-14 06:49

PyG搭建GNN实现链接回归预测

前言前面写了一些有关GNN的各种图任务，主要是节点分类以及链接预测：PyG搭建GCN前的准备：了解PyG中的数据格式PyG搭建GCN实现节点分类（GCNConv参数详解）PyG搭建GAT实现节点分类PyG

Cyril_KI·2023-01-14 06:18

【安装DGL（可用清华源）和pyg】；选择adam等优化器；激活函数选择

使用pipinstall安装.whl文件出现isnotasupportedwheelonthisplatform解决办法_michelle__7的博客-CSDN博客Linksfordgl后来发现我搞错了自己的python，应该是3.9我以为是3.6再后来用清华源就对了，不会有超时的错误了。pipinstalldgl-0.6.1-cp39-cp39-win_amd64.whl-iSimpleInde

爱吃甜的火龙果巧克力·2023-01-13 07:15

邻接矩阵与Pyg数据格式互相转换

普通邻接矩阵转换为Pyg数据格式fromtorch_geometric.dataimportDataifself.

木槿myj·2023-01-12 15:09

PyG Temporal搭建STGCN实现多变量输入多变量输出时间序列预测

目录I.前言II.STGCNIII.PyGTemporalIV.模型训练/测试V.代码I.前言前面已经写过不少时间序列预测的文章：深入理解PyTorch中LSTM的输入和输出（从input输入到Linear输出）PyTorch搭建LSTM实现时间序列预测（负荷预测）PyTorch中利用LSTMCell搭建多层LSTM实现时间序列预测PyTorch搭建LSTM实现多变量时间序列预测（负荷预测）PyT

Cyril_KI·2023-01-12 06:05

安装torch_geometric失败

python-mpipinstalltorch_clusterpython-mpipinstalltorch_scatterpython-mpipinstalltorch_spline_conv下载并安装一个符合自己版本的第四个小组件#检查版本nvcc-Vhttps://pytorch-geometric.com/whl/比如说https://data.pyg.org

sinat_38007523·2023-01-10 09:21

PyG教程(3)：邻居采样

在PyG中，邻居采样的方式有很多种，具体详解torch_geometric.loader。本文以GraphSage中的邻居采样为例进行介绍，其在PyG中实现为NeighborLoader。

斯曦巍峨·2023-01-09 21:36

在Colab上安装pytorch-geometric，导入包时出现libcudart.so.10.2

问题背景描述：在googleColab上使用图神经网络的包pyg，执行过程如下：Step1：在NotebookSetting里设定环境为GPU；Step2：查看Colab里torch的版本信息：importtorchtorch

javafalcon·2023-01-09 19:25

GNN学习笔记（三）：PyG构建Message Passing Network实例（Cora）

参照官方文档学习：1数据集加载Cora是一个机器学习论文数据集。其中共有7个类别（num_classes：基于案例、遗传算法、神经网络、概率方法、强化学习、规则学习、理论。整个数据集中共有2708篇论文，在词干堵塞和去除词尾后，只剩下1433个独特的单词（num_node_features）,文档频率小于10的所有单词都被删除。fromtorch_geometric.datasetsimportP

花锄·2023-01-09 18:36

利用MessagePassing实现GraphSAGE(了解pyG的底层逻辑）

一些基础的理解参考（必看前面的必要了解）pyG利用MessagePassing实现GCN(了解pyG的底层逻辑）_山、、、的博客-CSDN博客pyG利用MessagePassing实现GCNhttps:

山、、、·2023-01-09 18:06

图神经网络（8）——续 GNN编程实践建议附论文名单

目录使用pyG实现GNN，好用的包：编程实践的通用建议：DebugNN使用pyG实现GNN，好用的包：DeepSNAP：提供了GNN流程中的核心模块GraphGym：设计GNN编程实践的通用建议：1.数据的预处理非常非常重要

山、、、·2023-01-09 17:35

PyG教程(6)：自定义消息传递网络

一.前言在上篇文章中主要介绍了GNN的消息传递机制，在PyG中提供了一个消息传递基类torch_geometric.nn.MessagePassing，它实现了消息传递的自动处理，继承该类就可以简单方便的构建自己的消息传播

斯曦巍峨·2023-01-09 17:05

【图神经网络】PyG的MessagePassing机制实现

在PyG图机器学习库中，MessagePassing类实现了上述机制，并作为所有图卷积层的基类，该机制最重要的公式如下：该机制过程主要有下面三个函数保证：消息传递，message

kang0709·2023-01-09 17:35

利用MessagePassing实现GAT(了解pyG的底层逻辑）

利用MessagePassing实现GAT，感觉还挺麻烦的。当然geometric实现的GAT比我实现的这个更难。GAT的计算公式依照官方文件第一个函数__init__GAT需要的参数更多，本次实现GAT采用了多头注意力机制，heads表示多头数目，negative_slope表示LeakyReLU的负斜率。lin_l和lin_r表示：att_l和att_r表示：classGAT(MessageP

山、、、·2023-01-09 17:04

PyG的第一个示例：下载数据后使用GCN训练

这是一个PyG官网的例子，先让代码跑起来！PyG用于图神经网络建模。

与非学堂·2023-01-08 07:21

torch、torch_sparse、dgl三者spmm显存占用对比

简单比较一下torch原生，torch_sparse(pyG依赖模块)以及DGL中spmm的显存占用和时间版本：torch1.7dgl0.5pyg1.6torch原生，显存占用主要是对结点敏感（bakward

先云·2023-01-06 11:19

torch-geometric包的使用

torch-geometric的安装1.1安装注意点1.需要安装他的依赖包2.搭配使用的torch版本>=1.8.1，最好直接安装torch==1.10.13.需要将依赖包直接下载到本地（GitHub-pyg-team

菜虚空·2023-01-03 17:31

The ‘data’ object was created by an older version of PyG. If this error occurred while loading ...

The‘data’objectwascreatedbyanolderversionofPyG.Ifthiserroroccurredwhileloadinganalreadyexistingdataset,removethe‘processed/’directoryinthedataset’srootfolderandtryagain.”但实际上data中没有processed文件(data中的数

anshiquanshu·2022-12-31 16:24

【OpenI开源项目推荐-GammaGL】支持国内外主流深度学习框架的图神经网络算法库

除此之外，GammaGL遵循了PyTorchGeometric(PyG)的Tensor-centric

OpenI启智社区·2022-12-31 09:13

PyG搭建图神经网络实现多变量输入多变量输出时间序列预测

目录I.前言II.图的建立III.数据集构建IV.模型搭建(1)V.模型搭建(2)VI.模型训练/测试I.前言前面已经写过不少时间序列预测的文章：深入理解PyTorch中LSTM的输入和输出（从input输入到Linear输出）PyTorch搭建LSTM实现时间序列预测（负荷预测）PyTorch中利用LSTMCell搭建多层LSTM实现时间序列预测PyTorch搭建LSTM实现多变量时间序列预测（

Cyril_KI·2022-12-31 07:56

GNN动手实践(二)：复现图注意力网络GAT

本文的内容包括：图注意力网络的架构介绍、基于PyG来复现GAT模型。二.GAT架构介绍正如第一节中介绍的那样，G

斯曦巍峨·2022-12-30 08:05

pytorch_geometric环境配置二 — pytorch_geometric

传送门：GitHub-pyg-team/pytorch_geometric:GraphNeuralNetworkLibraryforPyTorch进入后，ctrl+fwheel到如下部分：点击here，

咯咯哒哒哒哒哒·2022-12-28 17:10

Datawhale 图神经网络 Task01简单图论与环境配置与PyG库

1.简单图论用neo4j生成了一张图用以简单的了解图以及其背后的知识。首先，这张图有两种元素构成，节点和边，对应的就是实体和关系。然后节点油分为两类，一类是人，另一类是电影。图其实就是把语言以图的形式表现出来，重点是强调各个个体之间的关系，在这个万物互联的时代，图显得更加贴切实际了。自然而然的想到，图会包含节点属性，边属性，行走连同等等方面的特点，这都是为了充分考虑图的特性。当我们把自然语言或者实

Andrew_zjc·2022-12-28 17:09

Windows下torch_geometric的CPU版本安装

以下是我的安装流程：先激活环境：condaactivatepy37由于我安装的是：PyTorch1.10.0，故需要执行以下的操作：pipinstalltorch-scatter-fhttps://data.pyg.or

五氧化二钒·2022-12-26 12:22

KDD20: DAGNN Towards Deeper Graph Neural Networks

ZH的维度都是类别的维度c3.同时采用了一个projectvector（实际上还是一个降维的，作者自己用PyG实现时还是采用了Linear实现降维。

Complicated__76·2022-12-25 15:25

PyG安装出现libcusparse.so.11: cannot open shared object file: No such file or dir解决方法【亲测有效】

1、在/home/user/anaconda3/lib/中放入缺少的libcusparse.so.11文件，链接，提取码:m2m2。若无法下载，则访问此链接。2、如果仍然报错，则在/home/user/.bashrc文件最下面，加入一行即可。注意，此路径下需包含libcusparse.so.11文件。exportLD_LIBRARY_PATH="/home/user/anaconda3/lib/"

随意凯·2022-12-25 10:51

蚂蚁开源，又一超棒的 Python 开源可视化库

Python数据开发·2022-12-25 06:29

pyg与graphgym

如果要使用pyg，那么会容易遇到一个报错：File"d:\Programfile\graphgym\run\main_pyg.py",line10,infromgraphgym.loader_pygimportc

0x3fffffff·2022-12-24 20:22

PaperNotes(15)-图神经网络、PyG极简版入门笔记

图神经网络概况1.GNN,GCN,GE的区别2.图卷积的通式--矩阵该如何作用2.1实现12.2实现22.3实现33.PyTorchgeometric3.1PyG内置数据集3.1.1ENZYMESdataset3.1.2Cora3.2PyG

小陈同学-陈百万·2022-12-24 12:31

消息传递图神经网络

PytorchGeometric中的MessagePassing基类PytorchGeometric(PyG)提

model2018·2022-12-24 12:27

【图神经网络】Pytorch图神经网络库——PyG创建消息传递网络

PyG创建消息传递网络消息传递基类：MessagePassingGCN层的实现实现EdgeConvolution内容来源：将卷积算子推广到不规则域通常表示为邻域聚合或消息传递方案。

镰刀韭菜·2022-12-24 12:24

在pyG上定义数据集

使用数据集的一般过程PyG定义了使用数据的一般过程：从网络上下载数据原始文件；对数据原始文件做处理，为每一个图样本生成一个Data对象；对每一个Data对象执行数据处理，使其转换成新的Data对象；过滤

zyrlia·2022-12-23 10:47

动手学PyG(二)PyG中包含的常用Benchmark数据集

PyG中常用的Benchmark数据集本文主要参考了PyG英文文档PyG中包含了大量常用的benchmark数据集，如所有Planetoid数据集(Cora,Citeseer,Pubmed)。

光H尘·2022-12-23 10:45

PyG自定义数据集学习笔记（持续更新

文章目录1前言1.1torch_geometric.data.Data1.2torch_geometric.datasets自带的数据集1.3自定义数据集基于Data创建数据集的参数2继承InMemoryDataset构建内存数据集2.1需要实现的方法2.2例子3继承Dataset构建内存数据集3.1实现的方法3.2例子3.3几个容易出问题的地方4TUDataset自定义数据集实战4.1重新自定义

来包番茄沙司·2022-12-23 10:13

torch-geometric(PYG) 环境配置

一、引言PyTorchGeometric，简称Pyg。

推荐算法研究僧·2022-12-21 19:04

创建图神经网络的Pycharm项目

前面安装了anaconda，在anaconda创建虚拟环境PyG，并在PyG中安装了pytorch和pytorch的图几何计算的包，今天在Pycharm中创建一个项目，解释器就用前面PyG中的解释器。

·2022-12-21 10:50

从零开始学习图神经网络 - Data类和Datasets的基本使用

Data类——PyG中图的表示及其使用torch_geometric.data.DataPyG-01数据预处理-torch_geometric.data.Data#Data类的构造函数classData

兀坐晴窗独饮茶·2022-12-19 13:24

【实战】疾病-基因与图神经网络和图自动编码器的相互作用

疾病-基因与图神经网络和图自动编码器的相互作用：学习图自编码器PyG实战1.学习内容：2.GAE自编码器：3.数据集的处理4.总结1.学习内容：图卷积GNN知识GCN作为图形自动编码器GAE架构GAE架构在疾病

battle不停息·2022-12-15 21:56

PyG导入HGBDataset：OSError: [Errno 22] Invalid argument: ‘data\\ACM\\acm\\raw\\?p=%2FACM.zip&dl=1‘

场景使用PyG导入ACM数据集：dataset=HGBDataset('data/ACM',name='ACM',transform=transform)报错代码Downloadinghttps://cloud.tsinghua.edu.cn

Cyril_KI·2022-12-15 08:25

图神经网络GNN-使用PyG踩坑：Cora数据集加载失败

dataset=Planetoid(root='../dataset/data1',name='Cora')这里提供的是手动下载方法，虽然麻烦，但最有保障。使用git下载数据gitclonehttps://github.com/kimiyoung/planetoid.gitorgitclonehttps://gitee.com/jiajiewu/planetoid.git下载的是planetoid

埘间海洋·2022-12-15 07:22

图神经网络学习(三)-常见的图神经网络库

1.PytorchGeometricPyTorchGeometricLibrary(简称PyG)是一个基于PyTorch的图神经网络库。

Enoch Liu98·2022-12-11 19:27

深度学习基础----GAE和VGAE

就看这一个就行了：PytorchGeometricTutorial配合PyG的文档食用：torch_geometric.nn—pytorch_geometricdocumentation只有一个地方不理解

无意识积累中·2022-12-11 14:52

PyG初探（一）

今天主要安装了一下torch-geometric，本来之前以为直接pipinstall就完事了，结果使用时发现了很多报错，主要报错有1：undefinedsymbol:_ZN3c105ErrorC1ENS_14SourceLocationERKSs2：ModuleNotFoundError:Nomodulenamed‘torch_scatter’3：AttributeError:‘NoneType

Hills＇·2022-12-11 10:28

GNN学习笔记（二）：PyG数据集加载与处理

参照官方文档学习：1图的构建构建一个三个节点，四条边的图（有两条无向边，用四条有向边表示）importtorchfromtorch_geometric.dataimportData#data.edge_index:GraphconnectivityinCOOformatwithshape[2,num_edges]andtypetorch.long#也可以以该矩阵的转置形式定义edge_indexe

花锄·2022-12-08 19:25

图卷积神经网络笔记——第五章：（2）基于PyG库构造自己的数据集&查阅其他GCN方法

这一小节看基于PyG库构造自己的数据集和查阅其他GCN方法。

Ma Sizhou·2022-12-08 19:25

【PyG】文档总结以及项目经验（持续更新

文章目录1.介绍1.1图数据处理1.2常用的图神经网络数据集1.3使用batch加载数据集1.4数据转换DataTransforms2.建立消息传递MessagePassing网络2.1MessagePassing基类2.2GCN实现2.3EdgeConvolution的实现3.创建自己的数据集3.1创建一个能够完全放入内存中的图数据集InMemoryDataset3.2创建无法完全放入（更大的）

来包番茄沙司·2022-12-08 19:25

yelp数据集_pyg学习04：数据集创建

引言在pyg的torch_geometric.datasets的包中，已经包含许多常见的数据集，但是针对的自己的需求去构建或者引用其他的一些数据集的时候，我们需要在pyg提供的函数的基础上进行数据的规范化

weixin_39793105·2022-12-08 19:55

PyG教程(4)：自定义数据集

一.前言在PyG中，除了直接使用它自带的benchmark数据集外，用户还可以自定义数据集，其方式与Pytorch类似，需要继承数据集类。

斯曦巍峨·2022-12-08 19:24

PyG中的数据集Cora等

https://blog.csdn.net/weixin_34570232/article/details/114452066数据集PyTorchGeometric已经包含有很多常见的基准数据集，包括：Cora：一个根据科学论文之间相互引用关系而构建的Graph数据集合，论文分为7类：Genetic_Algorithms，Neural_Networks，Probabilistic_Methods，

糖醋鸡翅不加醋·2022-12-08 19:24

PyG学习 - Dataset, DataLoader, Tranforms

目录自定义DatasetDataLoaderTransforms复制自：图神经网络PyTorchGeometric入门教程-掘金PyG的Dataset继承自torch.utils.data.Dataset

无脑敲代码，bug漫天飞·2022-12-08 19:23

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