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R语言-回归分析
R语言
找不到文件或目录:无法打开文件
R语言
找不到文件或目录:无法打开文件在
R语言
中,有时候你可能会遇到一个常见的错误消息:“无法打开文件:Nosuchfileordirectory”(找不到文件或目录)。
SVIPCODE
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2023-12-01 03:49
r语言
开发语言
R语言
多元
回归分析
(stata)
文章目录导入数据清屏分为定量数据(summarize)定性数据多元
回归分析
(定量)联合显著性检验显著性调整后R2R^2R2回归系数表以及它们对应的p值置信区间多元
回归分析
(定性)(既有虚拟变量)定性分析
疯狂成瘾者
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2023-12-01 00:06
数学建模
R语言
专题班(直播:2023.8.4~8.6)
茗创科技专注于脑科学,涵盖(EEG/ERP,fMRI,结构像,DTI,ASL,FNIRS)等,欢迎留言讨论及转发推荐,也欢迎了解茗创科技的脑科学课程,数据处理服务及脑科学工作站销售业务,可添加我们的工程师(微信号MCKJ-zhouyi或17373158786)咨询。★课程简介★R是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件,它是一个用于统计计算和统计制
茗创科技
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2023-11-30 21:29
[
R语言
可视化-精美图形绘制系列]--Mental分析
[组学分析系列的教程--Mental分析],前期还是整理一下前期的教程。前期自己分享了精美图形的绘制。但是,距离现在很久了,不知道有多少童鞋还会使用或回去复习。从今天开始,前期我们一起学习这个教程,我们的目标是:至少可以满足现在的自己使用!!是小杜好友的可以直接和小杜索要源代码和实例数据,我希望的是:交流(Communication)!!不敢多说,文章容易被锁!!!小杜的生信筆記,主要发表或收录生
小杜的生信筆記
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2023-11-30 20:21
学习小组DAY4笔记——shoan
R语言
入门思维导图总览
R语言
入门.png学习资料RforDataScience小试牛刀plot(rnorm(50))image.pngboxplot(iris$Sepal.Length~iris$Species
shoan078
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2023-11-30 18:51
R语言
杂谈(三)
1.条件控制ifif(condition){dosth}else{dosthdifferent}2.循环for#知道重复的次数primes<-c(2,3,5,7,11,13)#第一种循环for(pinprimes){print(p)}#第二种循环,最常用的方法for(iin1:length(primes)){print(primes[i])}2.1Next和Breaknum<-seq(1:5)fo
爱思考的照
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2023-11-30 17:37
学习小组Day4笔记--行
正式开始学习
R语言
了,今天笔记内容为
R语言
基础和ggplot2的入门学习
R语言
基础1、认识R与RStudioR是用于统计分析、绘图的语言和操作环境。
奔跑的羽蒙
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2023-11-30 13:28
R语言
,rayshader包,raster_to_matrix函数栅格转矩阵
转为矩阵作图来源#WedOct0709:49:012020-#字符编码:UTF-8#R版本:Rx644.0.2forwindow10#
[email protected]
#个人笔记不负责任#——拎了个梨require(rayshader)#raster_to_matrix栅格转矩阵rm(list=ls());gc()#将montereybay保存为栅格并使用文件名打开。temp_raster_f
youmigo
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2023-11-30 12:24
机器学习系列 - 6. 重要概念补充
1.多项式回归&Pipeline1.1多项式回归:研究一个因变量与一个或多个自变量间多项式的
回归分析
方法,称为多项式回归(PolynomialRegression)。
小蘑菇1962
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2023-11-30 11:20
聚类分析5—物种集合-数量生态学:
R语言
的应用 第四章
数量生态学:
R语言
的应用第四章聚类分析5—物种集合在这之前我们学习了聚类分析的基本概念、几种计算层次聚类的方法、进一步解读和比较层次聚类结果以及非层次聚类,也学习了基于环境数据来进行聚类分析。
fafu生信小蘑菇
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2023-11-30 11:50
(转帖)
R语言
-Visualization of Functional Enrichment Result
原文地址:http://bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/enrichplot/inst/doc/enrichplot.htmlTheenrichplotpackageimplementsseveralmethodsforenrichmentresultvisualizationtohelpinterpretation.Itsupport
苏慕晨枫
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2023-11-30 10:59
R语言
:利用rhdf5包分别创建单组学,多组学.h5文件
最近在跑的方法需要.h5作为输入文件,就学习了一下怎么创建.h5文件,原有数据结构如下:生成单组学.h5文件的代码如下:library(rhdf5)library(dplyr)library(patchwork)rna.data<-Read10X(data.dir='Processed_dataset/RNA',gene.column=1)atac.data<-Read10X(data.dir='
hyena_7
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2023-11-30 08:04
R
数据分析
r语言
生物信息
如何用
R语言
优雅地玩转PubMed-RISmed包的使用
PubMed是最大的生命科学文献数据库之一,在开展课题使用关键词搜索时,会检索出大量文献。如何对这些文献进行筛选,出了巧妙使用关键词组合外,还可以使用R将相关文献信息一键提取,实现文献的快速浏览。RISmed是一个用于从PubMed数据库获取和分析医学文献数据的R包。它可以帮助你进行文献检索、下载文献摘要、获取作者信息等操作。其具体应用如下。#安装加载包#install.packages("RIS
一个人旅行*-*
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2023-11-30 08:31
java
数据库
服务器
scitb包1.5版本发布—增加了统计值的结果和自动判断数据是否正态分布的功能
目前,本人写的scitb包1.5版本已经正式在
R语言
官方CRAN上线,scitb包是一个为生成专业化统计表格而生的R包。目前只能绘制基线表一。
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:23
R语言
我写的R包
r语言
基线表
表一
R语言
提取文字(字符串)中的内容--正则式(2)
科学研究中有时候咱们收集到的数据很乱,不能马上进行分析,如SEER数据,用过都知道,咱们需要对数据进行清洗,从数据中提取咱们需要的东西,才能进行分析,这时候有个有用的东西叫正则式,对于我们在字符串中提取数据非常实用,上一章《
R语言
提取文字
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:23
R语言
r语言
开发语言
R语言
dlnm包在时间序列空气污染数据的分布滞后线性和非线性模型的应用(2)
本期应粉丝要求复现一篇6分左右文章的图片,文章名称是:Airpollutionandcoronaryheartdisease–relatedhospitalvisitsinBeijing,China:time-seriesanalysisusingageneralizedadditivemode(空气污染和冠心病相关医院访问,中国北京:时间序列分析应用广义加性模型)作者研究了多种空气污染物与冠心病
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:23
R语言
r语言
开发语言
R语言
基于Matching包进行倾向评分匹配(PSM)
倾向评分匹配(PropensityScoreMatching,简称PSM)是一种统计学方法,用于处理观察研究(ObservationalStudy)的数据,在SCI文章中应用非常广泛。在观察研究中,由于种种原因,数据偏差(bias)和混杂变量(confoundingvariable)较多,倾向评分匹配的方法正是为了减少这些偏差和混杂变量的影响,以便对实验组和对照组进行更合理的比较。为什么需要做倾向
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:22
R语言
r语言
开发语言
R语言
rhdf5读写hdf5文件(.h5)展示文件组织结构和数据索引
h5只是一种简单的数据组织格式【层级数据存储格式(HierarchicalDataFormat:HDF)】,该格式被设计用以存储和组织大量数据。在一些单细胞文献中,作者通常会将分析的数据上传到GEO数据库保存为.h5格式文件,而不是我们常见的工程文件(rds文件,表格数据等),所以为了解析利用这些数据需要对hdf5格式的组织结构有一定的了解。(注:在Seurat包中有现成的函数Seurat::Re
Nh_code
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2023-11-30 08:19
r语言
Linux 下用
R语言
打开hdf5(.h5)文件异常的解决方案
6月10日从GEO数据库下载了作者上传的表达矩阵h5格式文件,需用从中提取出表达矩阵然后重构Seurat分析对象;该exp_matrix.hdf5文件在我的Window系统上,可以通过rhdf5::H5Fopen和hdf5r::H5File$new两种方法打开读取文件内容。但是由于文件太大,有6个G,在我24G内存的Windows系统上没办法完全加载出矩阵。于是就把文件上传到服务器集群进行处理,以
Nh_code
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2023-11-30 08:19
r语言
R语言
gWQS包在加权分位数和回归模型的应用
传统模型在评价多因素联合暴露时存在数据维度高、多重共线性等问题.WQS回归模型的基本原理是通过分位数间距及加权的方法,将多种研究因素的效应综合成为一个指数,再进行
回归分析
。
天桥下的卖艺者
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2023-11-30 08:16
R语言
r语言
回归
kotlin
多重共线性案例
虽然在实际分析中,自变量高度相关是很常见的,但是在
回归分析
中存在多重共线性可能会导致一些问题,比如相关分析是负相关
回归分析
时影响关系是正影响等,所以针对多重共线性问题需要去解决。
spssau
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2023-11-30 07:53
R语言
学习DAY04:
回归分析
首先从最常用的
回归分析
说起。有关线性
回归分析
模型的基本假定需要注意:1)关于随机干扰项的高斯-马尔科夫定理;2)关于自变量的:不存在共线性;3)关于模型的:模型设定正确。
sonder_943f
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2023-11-30 07:54
数据挖掘
回归分析
第五章学习通习题
文章目录一.单选题1.某超市研究销售纪录数据后发现,买啤酒的人很大概率也会购买尿布,这种属于数据挖掘的哪类问题()2.置信度(confidence)是衡量哪种兴趣度度量的指标()3.下列指标中,能够度量一个规则的强度,同时衡量两个集合之间的独立性的是()。4.下列几种数据挖掘功能中被广泛的用于购物篮分析的是()。5.设X={1,2,3}是频繁项集,则可由X产生多少个关联规则()。二.多选题6.下表
silly_foxWY
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2023-11-30 06:05
樱花大的作业
数据挖掘
回归
学习
R语言
ggplot2绘制Y轴截断柱形图
有时候做柱形图如果其中某一两个数值非常大,作图的时候其他柱子就非常低,看起来就不是很美观,其中一种办法是对Y轴进行截断,如果单纯使用ggplot2的代码实现起来还是相对比较麻烦的,Y叔(ggtree/clusterProfiler等R包的作者)开发的ggbreak可以很方便的实现Y轴截断参考链接SetAxisBreakforggplot2(r-project.org)
小明的数据分析笔记本
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2023-11-30 03:37
R语言
绘制小RNA丰度条形图
R语言
绘制小RNA丰度条形图小RNA中的丰度分布十分不均,少数种类小RNA的丰度占全部的比例较高,研究重点也都放在丰度较高的小RNA上,小RNA长度分布图可以有效筛选丰度较高的小RNA,我们以文献CharacterizationofmouseserumexosomalsmallRNAcontent
纪伟讲测序
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2023-11-30 00:09
IF:4+ 鉴定与股骨头坏死软骨氧化应激相关的Hub基因和通路
点击关注,桓峰基因桓峰基因生物信息分析,SCI文章撰写及生物信息基础知识学习:
R语言
学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你75篇原创内容-->公众号现在肿瘤的文章已经很多很多了
90066456ace6
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2023-11-30 00:53
学习小组Day4-Bossa
day4mind.png初识
R语言
软件的安装R软件的安装从官网下载对应版本,下载地址为:
R语言
官网。
七比比
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2023-11-30 00:57
2020-05-13 常用的数据分析与挖掘工具
常用的数据分析与挖掘工具
R语言
是由奥克兰大学统计系的Robert和Ross共同开发的,并在1993年首次亮相。其具备灵活的数据操作、高效的向量化运算、优秀的数据可视化等优点,受到用户的广泛欢迎。
程凉皮儿
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2023-11-29 19:39
R绘制堆积柱形图
前面给大家讲了☞【
R语言
】百分比表格删除两行重新计算百分比,有小伙伴对文中的两个堆积柱形图比较感兴趣。那么今天我们就来聊聊这两张图是如何绘制出来了。
生信交流平台
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2023-11-29 19:15
《
R语言
实战》自学笔记56-方差分析术语
第9章方差分析9.1术语速成为便于理解方差分析的相关名词,我构建一个案例:假如我们研究氮肥用量和玉米品种对玉米产量影响。设置一个田间试验,试验包括氮肥用量两个N1(200kg/ha)和N2(300kg/ha),玉米品种两个先玉335(XY335)和郑单958(ZD958),3次重复,测定指标为玉米产量。1、田间试验相关概念试验处理(experimentaltreatments):事先设计好的实施在
zjh9280
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2023-11-29 19:12
R语言
rvest包网络爬虫
R语言
网络爬虫初学者指南(使用rvest包)钱亦欣发表于今年06-0414:505228阅读作者SAURAVKAUSHIK译者钱亦欣引言网上的数据和信息无穷无尽,如今人人都用百度谷歌来作为获取知识,了解新鲜事物的首要信息源
weixin_33883178
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2023-11-29 15:26
r语言
爬虫
runtime
一文详解人工智能:线性回归、逻辑回归和支持向量机(SVM)
一、线性回归(LinearRegression)线性回归是一种用于建立变量之间线性关系的
回归分析
方法。它通过拟合一个线性模型来预测连续变量的值。
RRRRRoyal
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2023-11-29 12:47
人工智能
线性回归
逻辑回归
R语言
实现MapReduce的协同过滤算法
原文地址:http://www.tuicool.com/articles/63EjqiAuthor:张丹(Conan)Date:2013-04-07Weibo:@Conan_ZEmail:
[email protected]
:http://www.fens.me/blogAPPs:@晒粉丝http://www.fens.me@每日中国天气http://apps.weibo.com/chin
张小琦
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2023-11-29 12:28
数据挖掘
R sort、rank、order、arrange排序函数
本文转载自:https://www.cnblogs.com/hider/p/10019536.html
R语言
中排序有几个基本函数:sort()、rank()、order()、arrange()一、总结sort
淡水鱼Ada
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2023-11-29 11:31
Fourier分析入门——第9章——Fourier系数的假设检测
目录第9章Fourier系数的假设检验9.1引言9.2
回归分析
(Regressionanalysis)9.3带限信号(Band-limitedsignals)9.4可信区间(Confidenceintervals
ComputerInBook
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2023-11-29 11:49
数学与应用数学
傅里叶
傅立叶
假设检测
假设检验
“SRP模型+”多技术融合在生态环境脆弱性评价模型构建、时空格局演变分析与RSEI指数的生态质量评价及拓展应用
生态环境脆弱性驱动力研究生态环境脆弱性研究热点二、文献可视化软件介绍及常用功能介绍VOSViewer文献可视化及研究热点分析;Citespace文献可视化及研究热点分析;ArcGIS软件介绍及安装技巧
R语言
环境部署
Teacher.chenchong
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2023-11-29 08:18
生态
经验分享
SRP模型丨生态环境脆弱性评价模型构建、时空格局演变分析与RSEI指数的生态质量评价;地理探测器运行等;集成云端、桌面端等环境,结合遥感云计算、GIS空间分析、
R语言
统计分析的优势
集成云端、桌面端等环境,结合遥感云计算、GIS空间分析,
R语言
统计分析的优势,以分析生态环境脆弱性的时空演变为主线。
小艳加油
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2023-11-29 08:47
生态
SRP模型
生态环境脆弱性评价
时空格局演变分析
RSEI
指数
地理探测器
shell语言练习for循环和if判断的小脚本
目录需求:ping一下当前网段下的所有地址,能ping通的加入一个文件,不能ping通则加入另一个文件这个fo
r语言
写法是仿C写法,可能是之前语言的印象比较深吧,也可以使用foriin{1..254}for
丨析木丨
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2023-11-29 07:32
linux
shell
linux
服务器
网络
r语言
相关性作图_
R语言
:多个基因的相关性分析与展示
R语言
:多个基因的相关性分析与展示。关于批量相关性分析,我们发过两个帖子。单基因批量相关性分析的妙用,又是神器!基于单基因批量相关性分析的GSEA。
weixin_39747721
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2023-11-29 03:03
r语言
相关性作图
r语言
相关性作图_用
R语言
进行相关性分析:画出散点图、拟合线及标注相关系数和P值...
excel表格的,对于读取excel,此处有一个小技巧读取excel方法1.把excel文件另存为CSV文件1png2.png3.png4.png2.按照读取csv文件方法读取dat此名为excel1文件被
R语言
读取二
JunyuanLI
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2023-11-29 03:03
r语言
相关性作图
r语言
相关性作图_
R语言
绘图:相关性分析及绘图展示
rm(list=ls())#先把我们的R清空一下datafile="C:\\Users\\gaom\\Desktop\\
R语言
绘图\\相关性分析\\",header=T,=1,sep="\t")#读取数据
董振业
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2023-11-29 03:02
r语言
相关性作图
ROC及曲线面积汇总学习
目录ROC基础生成模拟数据率的计算
R语言
计算测试ROCR:pROCROC绘制单个ROC两个ROCLogistic回归的ROC曲线timeROCROC基础ROC曲线的横坐标是假阳性率,纵坐标是真阳性率,需要的结果是这个率表示疾病阳性的率
hx2024
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2023-11-29 03:32
学习
r语言
相关性作图_
R语言
做相关性分析
衡量随机变量相关性的方法主要有三种:pearson相关系数,spearman相关系数,kendall相关系数:1.pearson相关系数,亦即皮尔逊相关系数pearson相关系数用来衡量两个随机变量之间的相关性
R语言
中求两个随机变量
黑潮制作所
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2023-11-29 03:32
r语言
相关性作图
r语言
相关性作图_R绘图:相关性分析与作图
公众号“生信小课堂”TCGA数据分析课程:生物信息学教学相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能,单基因的批量相关性分析,可以用于做单基因的GO,KEGG富集分析和GSEA分析,也有多基因之间的相关性分析,或者多个基因集之间的相关性分析。今天我们利用TCGA肝癌数据,挑选一些基因做相关性分析,并用不同的R包展示。load(file="mRNAdata.Rda")#加载数据library(tidyv
知乎剧综
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2023-11-29 03:32
r语言
相关性作图
R语言
rayrender包,microfacet微面材料
R语言
rayrender包,microfacet微面材料#TueJul1303:14:532021-#字符编码:UTF-8#R版本:R4.1x64forwindow11#cgh163email@163.
youmigo
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2023-11-28 23:58
对高数的调侃!
从这几座城里流出了几条溪,比较著名的有:柯溪(Cauchy)、数学分溪(数学分析)、泛函分溪(泛函分析)、回归分溪(
回归分析
)、时间序列分溪(时间序列分析)等。其
听风在唱看花在舞
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2023-11-28 18:53
机器学习的复习笔记2-回归
回归分析
可以帮助我们理解当其他变量保持不变时,因变量的值如何随着自变量的变化而变化。
大滑稽儿
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2023-11-28 15:46
机器学习
笔记
回归
R语言
-matrix函数创建矩阵特殊情况
R语言
-matrix函数创建矩阵特殊情况创建矩阵的函数为matrix(data=x,nrow=y,ncol=z,byrow=FALSE,dimnames=NULL)data参数为矩阵元素;nrow参数:
dogplays
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2023-11-28 14:32
r语言
DNA 11. 识别肿瘤蛋白质三维结构上突变热点(HotSpot3D)
点击关注,桓峰基因桓峰基因生物信息分析,SCI文章撰写及生物信息基础知识学习:
R语言
学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你125篇原创内容-->公众号桓峰基因公众号推出基于基因组变异数据生信分析教程并配有视频在线教程
90066456ace6
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2023-11-28 14:46
R语言
量化投资相关
R语言
在金融领域提供了很多的金融计算框架和工具,当你具备金融理论知识和市场经验,你可以利用这些第三方提供的技术框架来构建自己的金融模型。
Liam_ml
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2023-11-28 07:34
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