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BLAST深入源码剖析

背景：以前分屏pip课程时候讲解过pip由小变大时候有使用到一个方式方式叫做同步事务，这个之前课程也讲解了他的使用方式和作用及表面原理，并没有深入到BLASTBufferQueue部分讲解。

千里马学框架·2024-01-22 15:54

第三天：软件安装

1.RepeatMasker安装功能：重复序列屏蔽（已知什么序列是重复序列了）(1)准备工作利用conda安装rmblasttrf软件~$condainstallrmblasttrf#下载RepeatMasker

焱黎·2024-01-21 22:16

Nvidia GPU相关包与命令及参考链接

里面包含CUBLAS库，

badman250·2024-01-21 20:09

生物信息学导论-北大-变异的功能预测3（Comparative Modeling）

回放：同源建模HomologyModeling：SWISS-MODEL执行：先在数据库中搜索（i.e.BLAST）找到至少一个

陆沙·2024-01-21 17:34

RuntimeError: cublas runtime error : the GPU program failed to execute at /tmp/pip-req-build-jh50bw2

RuntimeError:cublasruntimeerror:theGPUprogramfailedtoexecuteat/tmp/pip-req-build-jh50bw28/aten/src/THC

徐心兰·2024-01-20 14:02

基因组拼接中常见的名词解释

readsrawdatacleandatascaffoldcontigcontig50scaffold50N50L50pseudomolecules:pseudomoleculesaresuperscaffoldspseudochromosomes基因组拼接中常见的名词解释Question:Blastsearchforsolanumpseudomolecules

灵动的小猪·2024-01-19 07:25

EDA课设(数字系统设计)--quartusII 9.0安装及altera usb-blaster驱动识别失败解决

目录1，资源下载及quartusII9.0的下载2，建立一个测试工程；3，编写VHDL程序和仿真文件4，alterausb-blaster驱动识别失败解决1，资源下载及quartusII9.0的下载链接

望525·2024-01-18 14:45

序列比对原理

主要几种算法包括全局比对算法（Needleman-Wunsch算法），局部比对算法（Smith-Waterman算法），Blast等。

生信自修室·2024-01-18 05:40

蛋白质基础分析

NCBI数据库常用四个子库:PubMed、BLAST、Nucleotide、Protein.对于一个蛋白质的基础分析:1.获得蛋白质序列：NCBI2.预测信号肽:SignalP4.1Server3.等电点和分子量

BioLearner·2024-01-18 04:53

braker2注释流程

一：软件安装由于BRAKER2:依赖AUGUSTUS3.3,GeneMark-EX4.33,BAMTOOLS2.5.1,NCBIBLAST+2.2.31+(可选SAMTOOLS1.74+,GenomeThreader1.70

多啦A梦的时光机_648d·2024-01-17 21:42

Ubuntu下载并安装blas、cblas、lapack

1、安装gfortransudoapt-getinstallgfortran2.下载安装包blas：http://www.netlib.org/blas/blas.tgzcblas：http://www.netlib.org

美人胖八分·2024-01-17 19:37

Quartus Prime 18.0与ModelSim的安装

安装ModelSim.安装JTAGUSBBlaster驱动程序。

技术无极限·2024-01-17 18:16

【cuda】六、基础库：cuBLAS入门

cuBLAS基础介绍CUDABasicLinearAlgebraSubprograms（BLAS）提供了高效计算线性代数的方法。

prinTao·2024-01-17 14:51

易基因：ChIP-seq等揭示Runx2通过转录调控Itgav表达激活肝星状细胞以促进肝纤维化｜科研进展

肌成纤维细胞（myofibroblasts）主要由肝脏中活化的肝星状细胞(hepaticstellatecellsHSC)组成，在肝纤维化进展中发挥着核心作用。

易基因科技·2024-01-16 13:20

使用Diamond比对NR数据库获取物种注释

再用NR库试试参考：将NR数据库diamond比对结果做物种注释_diamond物种注释-CSDN博客NR下载nohupwget-t0-c-bhttps://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast

CAAS_IFR_zp·2024-01-15 22:56

Unblast：免费设计素材平台分享

一、产品介绍Unblast是一个致力于为设计师提供高质量、免费设计素材的在线平台。这里包含了全球优秀设计师创作的各类设计资源，如模板、字体、图标、图形等。

什么软件好·2024-01-15 13:16

剧本杀百变大侦探《消失的制作人》凶手是谁剧透+真相答案复盘解析攻略

剧本杀部分真相复盘剧透获取完整真相复盘只需两步①【微信关注公众号：奶茶剧本杀】②回复【消失的制作人】即可查看获取哦剧本杀百变大侦探消失的制作人剧本杀真相答案凶手剧透：以下是部分关键证据，凶手，时间线，复盘解析，推理逻辑茂先生（男）今年41岁，是BLAST

VX搜_奶茶剧本杀·2024-01-15 02:08

Unity IL2CPP 游戏分析入门

最近迷上了一个小游戏DreamBlast，今天就拿他解剖吧。com.rovio.dream二、步骤侦测敌情从apk包里面发现libil2cpp.so，就足

fenfei331·2024-01-14 08:13

训练模型时Interal Error：Blas GEMM launch failed.

最近在跑毕业实验，遇到上述问题原因：30系显卡不支持tensorflow1.x，所以要使用Nvidia维护的[nvidia-tensorflow]NVIDIA/tensorflow:AnOpenSourceMachineLearningFrameworkforEveryone(github.com)需要运行下列命令pipinstall--usernvidia-pyindexpipinstall--

intmain_S·2024-01-14 05:03

OpenBLAS windows 10 编译

1.简介OpenBLAS是一个基于BSD许可（开源）发行的优化BLAS计算库.BLAS（BasicLinearAlgebraSubprograms基础线性代数程序集）是一个应用程序接口（API）标准，用以规范发布基础线性代数操作的数值库

一个摸鱼AI喵·2024-01-13 12:06

debug OpenBLAS library 和应用示例

1.构建openblas[email protected]:OpenMathLib/OpenBLAS.gitcdOpenBLAS/如果要安装在自定义文件夹中，可以修改PREFIX的定义：

Eloudy·2024-01-13 12:50

ubuntu 16.04卸载cudnn，cuda，nvidia驱动并重装过程

sudoapt-get--purgeremove"*cublas*""*cufft*""*curand*"\"*cusolver*""*cu

暮光629·2024-01-12 21:00

Bioperl的安装以及使用npm安装

metacpan.org/release/BioPerl注：以下都是在我的env下进行一、Bioperl安装1、进度对应模块儿（需要安装的东西）界面点击侧边的installinstructions，如图1（这个是blastutils

暮色下的烟波澜·2024-01-12 08:44

噬菌体

噬菌体的宿主预测：利用细菌的spacers和自己宏基因组测序得到的序列，细菌的spacers建立blast索引，然后使用blastn参数：blastn-short-e1e-5进行比对。

宏病毒组·2024-01-11 18:00

monocle2 fibroblast silicosis inmt

gc()#####安装archr包##别处复制.libPaths(c("/home/data/t040413/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2","/home/data/t040413/R/yll/usr/local/lib/R/site-library","/usr/local/lib/R/library","/home/data/refdir/Rlib/"))

生信小博士·2024-01-11 04:33

failed to run cuBLAS routine cublasSgemm_v2: CUBLAS_STATUS_EXECUTION_FAILED

最近在跑一个三维分割网络，开始的时候报错：tensorflow.python.framework.errors_impl.InternalError:BlasSGEMMlaunchfailed就去搜索了一下

Lwang2018·2024-01-10 19:08

生物信息百Jia软件（八）：blat

blat与blast其实是不同的，虽然都是局部比对工具，但是blat实现了“多对一”的比对，也就是能将不同的外显子定位到同一个基因上。

基因学苑·2024-01-10 10:46

基于llama.cpp学习开源LLM本地部署

二、使用步骤1.下载编译llama.cpp2.普通编译3.BLAS编译3.1、OpenBLAS编译CPU版3.2cuBLAS编译GPU版本4.模型量化4.1、模型文件下载：

joimson·2024-01-10 01:00

点点点 | 真香！Simple GO GSEA 富集分析 ~

那会，我写了几款小的软件，包括“blast3go”，为的是应对即将收费的“blast2go”。当然，后来相关功能都整合到TBtools中。而其中有一个重点功能，即GO富集分析。

生信石头·2024-01-09 21:17

植库‖油菜花，有才华——身着淡黄的长裙，和阳光起舞

中文学名：油菜花拉丁学名：Blassikakapestris

浮生记Fleur·2024-01-09 18:04

OpenBLAS 的静态库命名分析 — — 以 x86_64 的静态库为例

在不同的机器上，生成的openblas生成的lib的名字可能是这样的：libopenblas_skylakexp-r0.3.26.dev.alibopenblas_skylakexp-r0.3.26.dev.so

Eloudy·2024-01-09 12:59

4.2 MATRIX MULTIPLICATION

矩阵乘法是基本线性代数子程序（BLAS）标准的重要组成部分（见第3章中的“线性代数函数”边栏：可扩展并行执行）。该函数是许多线性代数求解器（如LU分解）的基础。

王莽v2·2024-01-09 06:10

建立深度学习工作站：在Ubuntu上安装Keras及其依赖

目录一、建立深度学习工作站的步骤二、基础安装1.安装`BLAS`库2.安装Python科学套件：`Numpy`、`SciPy`和`Matplotlib`3.安装HDF54.安装Graphviz和pydot-ng5

南七行者·2024-01-07 05:18

PCL——数据转换：txt转pcd、bin转pcd

尝试las转pcd，网上教程很多，需要先配置liblas库。配置完之后，简单测试了一下打开las文件的代码，报错：st

.Vector·2024-01-07 02:38

tensorflow环境安装配置

下载匹配cuda的kaldi镜像Ubuntu20.04includingPython3.8NVIDIACUDA11.6.0cuBLAS11.8.1.74NVIDIAcuDNN8.3.2.44NVIDIANCCL2.11.4

weixin_43870390·2024-01-06 18:34

本地blast

建数据库：makeblastdb-in.

德先森的书·2024-01-06 12:04

『比较基因组学』TBtools 30秒解决基因组共线性。

直接给我惊呆了，从点开开始到出结果一共32秒ಥ_ಥ，想当年光blastp就得跑大半天，更不要说编译MCScanX，各种奇葩问题...先看下什么是共线性：Syntenic*=asetoflociintwodifferentspecieswhichislocatedonthesamechromosomeineach

ShawnMagic·2024-01-03 22:29

成功安装Milvus!零基础Ubuntu部署安装Milvus教程

Milvus源码编译安装Milvus源码编译安装Golang和C++开发环境安装源码安装编译基础依赖：OpenBLAS安装Rust安装前置依赖下载源码更改安装脚本开始编译测试Milvus是否安装成功遇到的问题问题

就想做一条闲鱼·2024-01-03 09:49

DMLC深度机器学习框架MXNet的编译安装

AI小白龙*·2024-01-03 07:18

UE多人游戏c++随笔（返回菜单功能+RPC+委托绑定+编程逻辑）

今天的视频有点绕，脑子转了好久，所以详细记录一下编程逻辑，供日后参考视频功能：我们需要播放离开的动画掉落武器对最高分的选手进行追踪server离开游戏时，所有玩家全部踢掉client离开游戏,就自己滚蛋头文件我们在BlasterCharacter

Alexander yaphets·2024-01-03 07:07

Sequence database files 信息搬运

db_files.htmlSearchcommandsrequirea-dboptionspecifyingadatabasefilename.Foru-commands(usearch_global,usearch_localandublast

代号北极能·2024-01-01 19:10

【帖子】安全帖子收藏锦囊

情报社区-威胁情报查寻:https://x.threatbook.com/Vulhub:https://vulhub.org/各类账号密码爆破:https://github.com/arthur0081/Blasting_dictionary

网络安全之路·2023-12-31 01:42

深度学习Tensorflow缺失cublas64_11.dll cublasLt64_11.dllcufft64_10.dll，cusparse64_11.dll等dll问题解决方法：

tensorflow_gpu-2.6.0的安装与配置深度学习Tensorflow缺失cublasLt64-11.dllcusolver64-11.dll等dll问题解决方法：当你的tensorflow_gpu

不做梵高417·2023-12-30 10:36

极智开发 | 解读英伟达软件生态基本线性代数库cuBLAS

欢迎关注我的公众号[极智视界]，获取我的更多经验分享大家好，我是极智视界，本文来介绍一下解读英伟达软件生态基本线性代数库cuBLAS。

极智视界·2023-12-29 21:23

NCBI线下blastn-short比对

ncbi的BLAST比我想象中的要强大，用普通blastn貌似不能将basepire数小于50的序列比对到基因组。像我，想将一些15bp的序列比对到基因组上做统计。

嗒嘀嗒嗒嘀嗒嘀嘀·2023-12-28 03:33

hive行转列、列转行

col1stringcol2arraytable1数据：col1col2a1["a","b"]列转行处理方式：selectcol1,col22fromtable1lateralviewexplode(col2)tmp_tblascol22

山上的小竹子·2023-12-25 06:59

ClustalW----多序列比对分析(一)

例如:BLAST、FASTA。序列同源性分析:将待研究序列与一组与之同源，但来自不同物种的序列进行多序列比较，以确定该序列与其他序列间的同源性大小。完成这一步需要多序列比对算法。例如:Clustal。

bcl_hx·2023-12-25 03:44

Maya设置Viewport显示对象类型

问题描述maya拍屏时只显示特定类型的对象解决方法options={"playblastOverrideViewport":True,"playblastShowCVs":True,"playblastShowCameras

SHCQMY·2023-12-24 20:18

2022-02-28

UkraineClaimsitsTroopsRepelledSeveralAttacksbyRussianTroopsTryingtoStormOutskirtsofKyivReadingTime:1minreadphotoBlastswereheardbeforedawninthecapitalKyiv

微笑的旗子萝卜·2023-12-24 01:38

[数据集][目标检测]水稻病害目标检测数据集VOC+YOLO格式3355张4类别

格式txt文件)图片数量(jpg文件个数)：3355标注数量(xml文件个数)：3355标注数量(txt文件个数)：3355标注类别数：4标注类别名称:["Hispa","Healthy","LeafBlast

FL1623863129·2023-12-23 20:18

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