blas

debug OpenBLAS library 和 应用示例

1.构建openblas[email protected]:OpenMathLib/OpenBLAS.gitcdOpenBLAS/如果要安装在自定义文件夹中，可以修改PREFIX的定义：
Eloudy·2024-01-13 12:50

ubuntu 16.04卸载cudnn，cuda，nvidia驱动并重装过程

sudoapt-get--purgeremove"*cublas*""*cufft*""*curand*"\"*cusolver*""*cu
暮光629·2024-01-12 21:00

Bioperl的安装以及使用npm安装

metacpan.org/release/BioPerl注：以下都是在我的env下进行一、Bioperl安装1、进度对应模块儿（需要安装的东西）界面点击侧边的installinstructions，如图1（这个是blastutils
暮色下的烟波澜·2024-01-12 08:44

噬菌体

噬菌体的宿主预测：利用细菌的spacers和自己宏基因组测序得到的序列，细菌的spacers建立blast索引，然后使用blastn参数：blastn-short-e1e-5进行比对。
宏病毒组·2024-01-11 18:00

monocle2 fibroblast silicosis inmt

gc()#####安装archr包##别处复制.libPaths(c("/home/data/t040413/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.2","/home/data/t040413/R/yll/usr/local/lib/R/site-library","/usr/local/lib/R/library","/home/data/refdir/Rlib/"))
生信小博士·2024-01-11 04:33

failed to run cuBLAS routine cublasSgemm_v2: CUBLAS_STATUS_EXECUTION_FAILED

最近在跑一个三维分割网络，开始的时候报错：tensorflow.python.framework.errors_impl.InternalError:BlasSGEMMlaunchfailed就去搜索了一下
Lwang2018·2024-01-10 19:08

生物信息百Jia软件（八）：blat

blat与blast其实是不同的，虽然都是局部比对工具，但是blat实现了“多对一”的比对，也就是能将不同的外显子定位到同一个基因上。
基因学苑·2024-01-10 10:46

基于llama.cpp学习开源LLM本地部署

二、使用步骤1.下载编译llama.cpp2.普通编译3.BLAS编译3.1、OpenBLAS编译CPU版3.2cuBLAS编译GPU版本4.模型量化4.1、模型文件下载：
joimson·2024-01-10 01:00

点点点 | 真香！Simple GO GSEA 富集分析 ~

那会，我写了几款小的软件，包括“blast3go”，为的是应对即将收费的“blast2go”。当然，后来相关功能都整合到TBtools中。而其中有一个重点功能，即GO富集分析。
生信石头·2024-01-09 21:17

植库‖油菜花，有才华——身着淡黄的长裙，和阳光起舞

中文学名：油菜花拉丁学名：Blassikakapestris
浮生记Fleur·2024-01-09 18:04

OpenBLAS 的静态库命名分析 — — 以 x86_64 的静态库为例

在不同的机器上，生成的openblas生成的lib的名字可能是这样的：libopenblas_skylakexp-r0.3.26.dev.alibopenblas_skylakexp-r0.3.26.dev.so
Eloudy·2024-01-09 12:59

4.2 MATRIX MULTIPLICATION

矩阵乘法是基本线性代数子程序（BLAS）标准的重要组成部分（见第3章中的“线性代数函数”边栏：可扩展并行执行）。该函数是许多线性代数求解器（如LU分解）的基础。
王莽v2·2024-01-09 06:10

建立深度学习工作站：在Ubuntu上安装Keras及其依赖

目录一、建立深度学习工作站的步骤二、基础安装1.安装`BLAS`库2.安装Python科学套件：`Numpy`、`SciPy`和`Matplotlib`3.安装HDF54.安装Graphviz和pydot-ng5
南七行者·2024-01-07 05:18

PCL——数据转换：txt转pcd、bin转pcd

尝试las转pcd，网上教程很多，需要先配置liblas库。配置完之后，简单测试了一下打开las文件的代码，报错：st
.Vector·2024-01-07 02:38

tensorflow环境安装配置

下载匹配cuda的kaldi镜像Ubuntu20.04includingPython3.8NVIDIACUDA11.6.0cuBLAS11.8.1.74NVIDIAcuDNN8.3.2.44NVIDIANCCL2.11.4
weixin_43870390·2024-01-06 18:34

本地blast

建数据库：makeblastdb-in.
德先森的书·2024-01-06 12:04

『比较基因组学』TBtools 30秒解决基因组共线性。

直接给我惊呆了，从点开开始到出结果一共32秒ಥ_ಥ，想当年光blastp就得跑大半天，更不要说编译MCScanX，各种奇葩问题...先看下什么是共线性：Syntenic*=asetoflociintwodifferentspecieswhichislocatedonthesamechromosomeineach
ShawnMagic·2024-01-03 22:29

成功安装Milvus!零基础Ubuntu部署安装Milvus教程

Milvus源码编译安装Milvus源码编译安装Golang和C++开发环境安装源码安装编译基础依赖：OpenBLAS安装Rust安装前置依赖下载源码更改安装脚本开始编译测试Milvus是否安装成功遇到的问题问题
就想做一条闲鱼·2024-01-03 09:49

DMLC深度机器学习框架MXNet的编译安装

最小构建需求：最新的支持C++11的C++编译器，比如g++>=4.8，clang一份BLAS库，比如libblas
AI小白龙*·2024-01-03 07:18

UE多人游戏c++随笔（返回菜单功能+RPC+委托绑定+编程逻辑）

今天的视频有点绕，脑子转了好久，所以详细记录一下编程逻辑，供日后参考视频功能：我们需要播放离开的动画掉落武器对最高分的选手进行追踪server离开游戏时，所有玩家全部踢掉client离开游戏,就自己滚蛋头文件我们在BlasterCharacter
Alexander yaphets·2024-01-03 07:07

Sequence database files 信息搬运

db_files.htmlSearchcommandsrequirea-dboptionspecifyingadatabasefilename.Foru-commands(usearch_global,usearch_localandublast
代号北极能·2024-01-01 19:10

【帖子】安全帖子收藏锦囊

情报社区-威胁情报查寻:https://x.threatbook.com/Vulhub:https://vulhub.org/各类账号密码爆破:https://github.com/arthur0081/Blasting_dictionary
网络安全之路·2023-12-31 01:42

深度学习Tensorflow缺失cublas64_11.dll cublasLt64_11.dllcufft64_10.dll，cusparse64_11.dll等dll问题解决方法：

tensorflow_gpu-2.6.0的安装与配置深度学习Tensorflow缺失cublasLt64-11.dllcusolver64-11.dll等dll问题解决方法：当你的tensorflow_gpu
不做梵高417·2023-12-30 10:36

极智开发 | 解读英伟达软件生态 基本线性代数库cuBLAS

欢迎关注我的公众号[极智视界]，获取我的更多经验分享大家好，我是极智视界，本文来介绍一下解读英伟达软件生态基本线性代数库cuBLAS。
极智视界·2023-12-29 21:23

NCBI线下blastn-short比对

ncbi的BLAST比我想象中的要强大，用普通blastn貌似不能将basepire数小于50的序列比对到基因组。像我，想将一些15bp的序列比对到基因组上做统计。
嗒嘀嗒嗒嘀嗒嘀嘀·2023-12-28 03:33

hive行转列、列转行

col1stringcol2arraytable1数据：col1col2a1["a","b"]列转行处理方式：selectcol1,col22fromtable1lateralviewexplode(col2)tmp_tblascol22
山上的小竹子·2023-12-25 06:59

ClustalW----多序列比对分析(一)

例如:BLAST、FASTA。序列同源性分析:将待研究序列与一组与之同源，但来自不同物种的序列进行多序列比较，以确定该序列与其他序列间的同源性大小。完成这一步需要多序列比对算法。例如:Clustal。
bcl_hx·2023-12-25 03:44

Maya设置Viewport显示对象类型

问题描述maya拍屏时只显示特定类型的对象解决方法options={"playblastOverrideViewport":True,"playblastShowCVs":True,"playblastShowCameras
SHCQMY·2023-12-24 20:18

2022-02-28

UkraineClaimsitsTroopsRepelledSeveralAttacksbyRussianTroopsTryingtoStormOutskirtsofKyivReadingTime:1minreadphotoBlastswereheardbeforedawninthecapitalKyiv
微笑的旗子萝卜·2023-12-24 01:38

[数据集][目标检测]水稻病害目标检测数据集VOC+YOLO格式3355张4类别

格式txt文件)图片数量(jpg文件个数)：3355标注数量(xml文件个数)：3355标注数量(txt文件个数)：3355标注类别数：4标注类别名称:["Hispa","Healthy","LeafBlast
FL1623863129·2023-12-23 20:18

探针寻找之旅（2）——与探针匹配的基因组序列的提取

步骤1stblast提取匹配序列ID#打点当前目录参数cd$(pwd)#建库makeblastdb-incsi.chromosome.fa-dbtypenucl-outcsi.chromosome.fa-parse_seqids
嗒嘀嗒嗒嘀嗒嘀嘀·2023-12-23 18:18

blast安装及简单使用

一、安装blast1.Ubuntu环境#下载blastwgethttps://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.9.0/ncbi-blast
陈年小趴菜·2023-12-23 14:15

Linux本地化运行NCBI blast+

前言：作为生物科研人员的标配，BLAST知多少？BLAST简介：BLAST是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。
谢俊飞·2023-12-23 00:39

非root用户安装nodejs和npm

2020-02-19注意，安装这个主要是为了安装blastutils，安装blastutils或者是说blast-pipe，主要是为了解决VFDB毒力因子的本地化的问题一、下载和安装nodejs和npm
暮色下的烟波澜·2023-12-21 15:20

Paddle3D 1 环境安装—— 包含ExternalError: CUBLAS error(7)解决办法

Paddle3D1环境安装——包含ExternalError:CUBLASerror(7)解决办法0我的本地环境介绍：Ubuntu20.04nvidia-smi后：NVIDIA-SMI510.47.03DriverVersion
爱吃油淋鸡的莫何·2023-12-20 11:30

cuBLAS使用（1）

cuBLAS的API参考指南，CUDA基本线性代数子程序库(CUDABasicLinearAlgebraSubroutine)。
蓝天巨人·2023-12-18 14:42

18.cuBLAS开发指南中文版--cuBLAS中的Level-2函数gbmv()

2.6.cuBLASLevel-2函数参考在本章中，我们将描述执行矩阵向量运算的Level-2基本线性代数子程序(BLAS2)函数。
扫地的小何尚·2023-12-18 13:09

解决Python中cuBLAS插件无法注册问题

解决Python中cuBLAS插件无法注册问题在使用TensorFlow进行深度学习模型训练时，有时候会遇到"UnabletoregistercuBLASfactoryAttemptingtoregisterfactoryforplugincuBLAS
完美代码·2023-12-18 13:07

llya Sutskever回忆让机器能学习的研发过程。没有GPU，没有数据，没有思路，神经网络为什么能学习？还有其它的结构可以让计算机学习吗？

2、最开始用的是CPU3、神经元只有50个或几百个(算很大的)4、100万的参数认为是很庞大了5、不懂BLAS，用优化过的Matlab6、用什么的问题来提问比较好，试试这个
小黄人软件·2023-12-18 12:45

以gaps为线索提取序列，想到如何面向对象编程

序列，这个对象拥有序列的属性allgaps，print_seq都是方法参考#date:2019-4-211:02:33#[email protected]#从blastXML提取的比对序列，
qizhengyang·2023-12-18 12:39

ubuntu 自动安装 MKL Intel fortran 编译器 ifort 及完美平替

首先据不完全观察，gfortran与openblas是intelfortran编译器ifotr和mkl的非常优秀的平替，openblas连函数名都跟mkl一样，加了一个下划线。
Eloudy·2023-12-17 14:13

11 月公链盘点：Solana 强势复苏，Blast 飞速崛起，Web3 游戏市值猛涨

在以太坊继续主导TVL和像Arbitrum这样的Layer2成为焦点的同时，我们也见证了Solana引人注目的复苏和Blast流星般的崛起。
Footprint_Analytics·2023-12-17 04:55

11 月 NFT 动态：交易量增长，Layer 2 格局剧变

NFT领域中，Blur的交易量飙升，进一步巩固地位；Blast的亮相，改写了Layer2格局。与此同时，币安CEO宣布辞职，标志着一个拥抱合规并勇往直前的成熟市场的到来。
Footprint_Analytics·2023-12-17 04:49

【INTEL（ALTERA）】Agilex7 FPGA Development Kit DK-DEV-AGI027R1BES编程/烧录/烧写/下载步骤

DK-DEV-AGI027R1BES的编程步骤：将外部USBBlasterII连接到J10-外部JTAG接头。将交换机SW5.3设置为ON（首次）。
神仙约架·2023-12-16 23:33

"dpkg-deb：错误：子进程 粘贴 被信号(断开的管道) 终止了" 问题解决过程

问题trace信息：sudoapt-getinstalllibcublas-dev正在读取软件包列表...完成正在分析软件包的依赖关系树正在读取状态信息...完成下列软件包是自动安装的并且现在不需要了：
淡然收到非·2023-12-16 22:43

巴拿马国San Blas Area

巴拿马共和国SunBlas自制区群岛11号早上，我们停靠在一个小小的有着成片的椰子树林和美丽屋顶的草屋小岛边。作为外来船只，到达后需要到岸上的巴拿马共和国驻SanBlus自治区的海关办公室申请签证。
骑着船儿去旅行·2023-12-16 18:09

Sci Transl Med

Radiation-inducedcirculatingmyeloid-derivedsuppressorcellsinducesystemiclymphopeniaafterchemoradiotherapyinpatientswithglioblastoma
生信风暴·2023-12-16 14:36

【已解决】RuntimeError: CUDA error: CUBLAS_STATUS_INVALID_VALUE when calling `cublasSgemm( handle, opa, o

前情提要今天来复现一下WaterKnn，这个项目的话遇到的问题不算很多，所以就长话短说。项目地址：https://github.com/adiyoss/WatermarkNN项目简介：https://medium.com/@carstenbaum/the-ubiquity-of-machine-learning-and-its-challenges-to-intellectual-property
鳗小鱼·2023-12-15 20:49

Simplingua简语语法03-名词

可数名词有复数形式，表示多于一个，一般直接在名词后方加上-s即可构成，如：studentes（学生们）、tablas（几张桌子）、lampas（
傻傻不知天年·2023-12-14 15:54

Blast 5【某活动设定稿】

最近在忙的间隙，接了一个小私活，给某线上活动做设定，包括人设、背景设定、故事梗概，等等。第一版的时候对方提的需求和最后所给的需求，基本完全不同，这个倒也没啥，很正常。然后这是第一版的时候写的设定，晚上干完正事的时候所想的，后来不出意料地被KO了，对方想要更逗逼更中二的。虽说是随便写的，而且也被KO了，但放自己电脑上还是感觉太浪费了，所以放出来让大家乐乐，说不定还能激发别人灵感/吐槽欲望，这也挺好。
LostAbaddon·2023-12-06 02:56
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