blas

卷积计算代码实现

后者比前者执行速度快许多将卷积运算转化为矩阵乘法，从乘法和加法的运算次数上看，两者没什么差别，但是转化成矩阵后，运算时需要的数据被存在连续的内存上，这样访问速度大大提升（cache），同时，矩阵乘法有很多库提供了高效的实现方法，像BLAS
chenghaoy·2023-08-30 05:31

水稻叶病害识别（图像连续识别和视频识别,python代码，pytorch框架）

（图像连续识别和视频识别,python代码，pytorch框架）_哔哩哔哩_bilibili1.数据集介绍：自然环境下，4种水稻叶片病虫害数据集Bacterialblight（白叶枯病）共1548张，Blast
深度学习的奋斗者·2023-08-29 21:22

【openEuler创新项目探索】一个Java端的向量化BLAS库VectorBLAS

VectorBLAS简介VectorBLAS是一个使用Java语言实现的向量化BLAS高性能库，目前已在openEuler社区开源。
openEuler社区·2023-08-29 07:49

为什么 Biopython 的在线 BLAST 这么慢？

用过网页版本BLAST的童鞋都会发现，提交的序列比对往往在几分钟，甚至几十秒就可以得到比对的结果；而通过调用API却要花费几十分钟或者更长的时间！这到底是为什么呢？
BioIT爱好者·2023-08-28 12:09

【openEuler创新项目探索】一个Java端的向量化BLAS库VectorBLAS

VectorBLAS简介VectorBLAS是一个使用Java语言实现的向量化BLAS高性能库，目前已在openEuler社区开源。
·2023-08-28 11:01

Seattle Children’s opens first pediatric CAR T-Cell trial dual targeting CD22 and CD19

T-cellimmunotherapytrialintheU.S.forchildrenandyoungadultswithrelapsedorrefractoryCD19-andCD22-positiveacutelymphoblasticleukemia
路经纬Gavin·2023-08-27 07:31

Meta 推出 SeamlessM4T，无缝翻译和转录语音和文本

SeamlessM4T允许跨语音和文本单元进行评估的BLASER2.0进行测试时，与目前最先进的语音到文本任务模型相比，SeamlessM4T模型在语音到文本任务中对抗背景噪声和说话者变化的表现更好Meta
ejinxian·2023-08-26 10:13

大咖培训讲座|高性能计算专场 认识真正的高性能计算，探究如何成为高性能计算工程师 ...

猿代码科技高性能计算讲座原文——OpenBLAS创始人无保留分享我们如何成为一个高性能计算的工程师，或者这种性能优化的这一部分的软件工程师。我其实想了一下，这一部分的入门的基础其实没那么难。
猿代码科技·2023-08-26 05:55

ubuntu中运行ros2节点，共享库libblas.so.3无法加载报错的问题解决

工作中需要调试新的摄像头，安装对应的驱动：cindy@ubuntu:~/Downloads$sudodpkg-iros-foxy-deptrum-ros-driver-stellar400_0.1.1-0focal_arm64.deb[sudo]passwordforcindy:Selectingpreviouslyunselectedpackageros-foxy-deptrum-ros-dri
张江一哥·2023-08-25 14:24

文章拆解:基因组+免疫浸润+干预=6分SCI？

杂志上的一篇文章，“GeneticandImmuneChangesAssociatedwithDiseaseProgressionunderthePressureofOncolyticTherapyinANeuroblastomaOutlierPatient
科研菌·2023-08-25 09:12

blast | diamond 输出结果选择和解析 | 比对

之前的文章：构建NCBI本地BLAST数据库(NRNT等)|blastx/diamond使用方法|blast构建索引|makeblastdb本地运行blast时，需要指定outformat。
weixin_34032792·2023-08-25 07:26

linux比对nt数据库,linux BLAST序列比对 （nt/nr库）

安装本地blast序列比对软件，我们可以搜索一个查询序列定制数据库，例如想研究一个新测序的基因组，或者感兴趣的一组蛋白质序列。
城北增暮寒·2023-08-25 07:56

将NR数据库diamond比对结果做物种注释

需求：环境菌功能基因扩增子测序的OTU序列已经用diamond进行了NR全库的比对（blastx），还需得知其物种信息。P.S.本人是没接触过扩增子比对相关内容，不保证该过程的合理性。
江有枫xx·2023-08-25 07:54

blast命令

蛋白质序列比对蛋白质数据库（blastp）blastp-queryseq.fast-outseq.blast-dbdbname-outfmt6-evalue1e-5-num_descriptions10
Chenhu7·2023-08-25 07:54

Lecture 11-20

本地blast使用下载及安装：curl-Oftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ncbi-blast-2.6.0+-x64
杨亮_SAAS·2023-08-25 06:18

四级词汇

1.alterv.改变,改动,变更2.burstvi.,n.突然发生,爆裂3.disposevi.除掉;处置;解决;处理(of)4.blastn.爆炸;气流vi.炸,炸掉5.consumev.消耗,耗尽
奔跑的虫子·2023-08-25 00:20

CUBLAS矩阵乘法

include#include#include#include#include"cuda_runtime.h"#include"device_launch_parameters.h"#include"cublas_v2
给算法爸爸上香·2023-08-23 14:58

Nature 子刊 | 中国航天员科研训练中心李英贤团队揭示骨重塑的力学调控新机制

2022年2月24日，该团队关于骨重塑力学调控机制的研究成果“MechanosensitivelncRNANeat1promotesosteoblastfunctionthroughparaspec
尐尐呅·2023-08-22 06:15

Opencv+MKL+Cuda+Cudnn+mxnet for win10

需要准备的环境有，MinGW（gcc）、OpenCV、CUDA、CuDnn、MKL/Openblas、mxnet。自己整理的资源：https://download.csdn.net/dow
舟江渔谣·2023-08-21 06:09

专栏五：食管癌Cancer Cell文章生信部分解析

两篇食管癌文章，来自同一课题组，部分共用一套代码：EpithelialcellsactivatefibroblaststopromoteesophagealcancerdevelopmentDissectingesophagealsquamous-cellcarcinomaecosystembysingle-celltranscriptomicanalysis
18kkk·2023-08-20 10:41

无法解析的外部符号cusolverDnCreate

问题：无法解析的外部符号cusolverDnCreate解决方案那么就在启动项目-》属性-》连接器-》输入-》附加依赖项：加：cublas.libcublas_device.libcuda.libcudadevrt.libcudart.libcudart_static.libcufft.libcufftw.libcurand.libcusolver.libcusparse.libnppc.libn
Lsuper11·2023-08-20 09:22

CUDA Bug＜二＞ 无法解析的外部符号 cublasCreate_v2

CUDAcublasBugerror:错误252errorLNK2019:无法解析的外部符号cublasCreate_v2，该符号在函数“void__cdecltrain(bool,floatconst
Lsuper11·2023-08-20 09:51

常用生物信息学在线分析工具汇总(记录中...)

数据库NCBI主站：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/拟南芥：https://www.arabidopsis.org/AmiGO2STRINGPham序列比对、寻找同源蛋白、基因BLAST
胜言_·2023-08-19 00:34

OpenBLAS 是否应该放弃对Russia的Elbrus CPU的支持？

偶尔看到一篇标题为“#OpenBLASDecidingWhetherToDropSupportFor#Russia'sElbrusCPUs”原文链接：https://www.phoronix.com/news
深圳王哥·2023-08-18 17:10

简洁 | 优雅地整理 BLAST 比对结果

写在前面用过BLAST进行基因功能注释的朋友应该常常遇到两个问题：BLAST输出格式较多，选择哪一类输出格式更为实用？输出结果信息较多，如果方便下游数据分析？
生信石头·2023-08-18 10:12

文献阅读-亨廷顿患者成纤维细胞转化为年龄相关的纹状体细胞构建

杀杀最近因为课程接触了一些神经生物学以及神经退行性疾病的文献，写个总结，当作课外阅读啦~StriatalneuronsdirectlyconvertedfromHuntington’sdiseasepatientfibroblastsrecapitulateage-associateddiseasephenotypes
不会生信哟·2023-08-18 07:12

对于生物信息的几款软件的深究

NCBI-BLASTSRA-ToolkitHISAT2用来rna-seqbwa用来DNA环境变量：envexport显示变量值：echo$变量名变量名之前一定要有$echo才能讲变量名替换成实际变量值vim
c4d82bfede08·2023-08-18 04:52

windows本地BLAST（二）：操作及应用

以blastn用法为例:1、建索引：makeblastdb-dbtypenucl-inref.fasta注：-dbtype：序列类型，nucl为核酸序列，prot为蛋白序列。
想要学好生信的小白·2023-08-18 02:51

实验篇——基因家族成员鉴定（一)

文章目录前言一、TBtools介绍1.1TBtools能做什么1.2主界面介绍二、基因家族成员鉴定2.1获取序列文件2.2提取出CDS序列2.3将CDS序列翻译为AA序列2.4准备参考序列2.5第一次BLAST
星石传说·2023-08-16 13:13

Cmake链接第三方库的三种方法

本文介绍链接第三方库的3种方法(以OpenBLAS举例。使用的工程名称为Test_lib（可执行文件名字），主程序为library.c。
SofterICer·2023-08-15 19:41

Cmake链接第三方库的三种方法

本文介绍链接第三方库的3种方法(以OpenBLAS举例。使用的工程名称为Test_lib（可执行文件名字），主程序为library.c。
SofterICer·2023-08-15 19:41

[树莓派]ImportError: libcblas.so.3: cannot open shared object file

尝试在树莓派4b安装opencv-python,出现以下错误,ImportError:libcblas.so.3:cannotopensharedobjectfile:Nosuchfileordirectory
FL1623863129·2023-08-14 10:57

VS2015+cublas实操记录（cuda加速GEMM矩阵乘加算子）

1.环境配置：cuda安装后一般的安装位置在：C:\ProgramFiles\NVIDIAGPUComputingToolkit\CUDA\v11.8把这个目录下的include和lib分别配置在vs中，安装cuda教程可参考：https://zhuanlan.zhihu.com/p/520995962（笔者实操ok版本:win11+cuda11.8+cdunn8.2.1.32+trt8.5.3.
Thomas_Cai·2023-08-13 13:27

关于DNA正负链的定义

用了NCBI的blast工具。发现结果当中每个exon在目标转录本上的匹配位置与这些exon在bed文件中的顺序是相反的。查了一下文献，整理如下。首先，是一些定义
Cady_duan·2023-08-12 11:01

CUDA编程

银河系CUDA编程指南(3)——矩阵乘法的分块实现银河系CUDA编程指南(3)——矩阵乘法的分块实现-知乎0写在前面前面一节实现了一个朴素的GPU矩阵乘法，效果和使用cublas库差距极大。
a flying bird·2023-08-10 09:18

糖心炮弹（一）

这个游戏的原型是BallBlast，起了具有中国特色的糖心炮弹的名字。这个游戏在微信上有1300万用户玩过，可见这个游戏也很火啊。大人们真无聊。
阿达老师·2023-08-09 15:26

硬核原著·读圣经，学西语（第4期）

原文展示：Génesis1：4YvioDiosquelaluzerabuena;yseparóDioslaluzdelastinieblas.文本分
胡老师的英语课·2023-08-09 04:48

Lección 4　¿Qué lenguas hablas? 你说什么语言？

第一段：Ronaldo:Tengo25años.Soybrasileñoysoyeconomista.Ronaldo:Habloportugués,inglés,yfrancés.我25岁了。我是巴西人，我是经济学家。(economista阴阳同形）罗纳尔多：我会说葡萄牙语，英语和法语。第二段：Ana:Tengo19años.Soyestadounidenseysoyestudiante.Ana:
梅bE·2023-08-08 19:06

prologue epilogue

www.hackerschool.com/blog/7-understanding-c-by-learning-assemblyhttps://www.hackerschool.com/blog/5-learning-c-with-gdbLasttime
weixin_30411997·2023-08-08 04:40

ubuntu cuda cudnn tensorRT的卸载和安装

1.安装显卡驱动显卡安装教程查看N卡驱动支持的最高cuda版本:nvidia-smi2.卸载sudoapt-get--purgeremove"*cublas*""*cufft*""*curand*"\"
lzfshub·2023-08-06 19:12

Shell脚本学习-阶段二十七-命令解释三

文章目录前言quyotastatsrepquotaconvertquotaswapoffswaponsyncchrootgetentlastlastblastloglogrotatelogsavelogwatchopensslsudo
低调的小哥哥·2023-08-05 14:08

SPAMS安装

安装要求在安装SPAMS之前，需要安装libblas&liblapack。
SuperSources·2023-08-05 10:02

北京同立海源生物助力CAR-T细胞治疗再攀高峰

JournalofClinicalOncology》（影响因子44.54）在线发表题为“Donor-DerivedCD7ChimericAntigenReceptorTCellsforT-CellAcuteLymphoblasticLeukemia
北京同立海源生物-CGT上游原料生产企业·2023-08-04 20:38

Quartus Prime 软件 USB-blaster 驱动安装失败【已解决】

检查是否安装多版本quartus2.5错误代码392.6设备描述符请求失败2.7更新驱动后，设别管理器显示，但Quartus不显示一、安装步骤1、将FPGA开发板插入电脑时，未安装驱动的电脑会提示安装usb-Blaster
青柠Miya·2023-08-04 16:16

Cmake链接第三方库的三种方法

Cmake链接第三方库的三种方法本文介绍链接第三方库的3种方法(以OpenBLAS举例。使用的工程名称为Test_lib（可执行文件名字），主程序为library.c。
弯曲时空·2023-08-03 14:12

[Quora高赞翻译]作为一个垂死之人，你对生活的建议是什么？

-Upvoted107.5K-OssamaSuleiman,8yearsglioblastomabraincancersurvivor-UpdatedApr13，2018-TranslatedbyQee11Icangiveyouafirsthandanswerhere.In
Qee11·2023-08-03 03:36

2010年郭国骥老师的开篇作（一）

ResolutionofCellFateDecisionsRevealedbySingle-CellGeneExpressionAnalysisfromZygotetoBlastocyst利用单细胞基因表达分析揭示从受精卵到胚泡细胞命运决定的解析作者程凉皮老师文章点评
不如好好学生信吧·2023-08-01 20:16

R语言中的并行计算实现

并行计算有显性并行和隐式并行，隐式并行：OpenBLAS，IntelMKL，NVIDIAcuBLAS，H2O(参考我的博客)等显性并行：parallel（主打lapply应用）、foreach（主打for
zoujiahui_2018·2023-07-30 14:58

单细胞研究 | Cell BLAST：一个自带高质量参考数据库的scRNA-seq数据检索/注释工具

遇到批次效应做单细胞数据分析时，我们常常用到不同时期或不同测序平台的数据，即使是同样的细胞类型也可能不能聚类到一个细胞群中。精确的单细胞转录组（scRNA-seq）数据检索和注释需要：1.克服数据集之间的批次效应；2.跨物种、平台、具有高质量注释的scRNA-seq数据库。近日，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）、北京大学生命科学学院生物信息中心
尐尐呅·2023-07-30 06:28

Python OSError: symbol cublasLtHSHMatmulAlgoInit, version libcublasLt.so.11 not defined的解决

问题与排查原报错信息如下：OSError:/opt/conda/lib/python3.8/site-packages/nvidia/cublas/lib/libcublas.so.11:symbolcublasLtHSHMatmulAlgoInit
WinterShiver·2023-07-29 11:06
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