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dgl
图结构数据的构建-
DGL
库
官方文档一、图的特点同构性与异构性相比同构图,异构图里可以有不同类型的节点和边。这些不同类型的节点和边具有独立的ID空间和特征;同构图和二分图只是一种特殊的异构图,它们只包括一种关系节点与边有向图一条边、无向图两条边、加权图具有权重;节点和边可具有多个用户定义的、可命名的特征,用以储存图的节点和边的属性。消息传递(类比神经元)消息传递:定义在每条边上的消息函数,它通过将边上特征与其两端节点的特征相
SatVision-RS
·
2024-03-01 10:21
深度学习杂谈
人工智能
python
在Conda中搭建PyTorch+
DGL
+PyG时需要仔细查看的几个关于版本的网页
因为这个repo用到了
DGL
(我也是用
DGL
和PyG比较多),报了一些诸如:cannotimportname'Mapping'from'c
蛐蛐蛐
·
2024-02-09 01:25
conda
pytorch
人工智能
AutoDL使用conda运行pytorch、
dgl
环境配置要是出现兼容问题还是挺繁琐的。所以这里记录下成功的配置情况。condacreate--nameTestpython=3.9#构建一个虚拟环境condainitbash&&source/root/.bashrc#更新bashrc中的环境变量condaactivateTest#切换到该虚拟环境pipinstalltorchtorchvisiontorchaudio--index-urlhttp
重剑DS
·
2024-01-31 12:08
深度学习
conda
pytorch
人工智能
基于GCN和
DGL
实现的图上 node 分类, 值得一看!!!
#基于GCN和
DGL
实现的图上node分类,值得一看!!!基于GCN和
DGL
实现的图上node分类,值得一看!!!
Dashesand
·
2024-01-31 00:09
分类
数据挖掘
人工智能
HNU-数据挖掘-实验4-链接预测
数据挖掘课程实验实验4链接预测计科210X甘晴void202108010XXX文章目录数据挖掘课程实验实验4链接预测实验背景实验要求数据集解析实验建模实验探索过程失败的探索——
DGL
库
DGL
库简介读取基因并构建图构建
甘晴void
·
2024-01-22 06:32
#
【专选】数据挖掘
数据挖掘
人工智能
机器学习模型的超参数优化用于分子性质预测
在《预测化学分子的nlogP——基于sklearn,deepchem,
DGL
,Rdkit的图卷积网络模型》中简单介绍了sklearn模型的使用方法。
wufeil
·
2024-01-12 04:26
药物设计
机器学习
深度学习
python
NeuralKG运行备忘
1.9.1+cu111-fhttps://download.pytorch.org/whl/torch_stable.htmlpipinstalldgl-cu111dglgo-fhttps://data.
dgl
.ai
GCTTTTTT
·
2023-12-25 06:07
知识图谱
知识图谱
基于graphsage的欺诈用户风险识别
图技术利用neo4j、networkx、
dgl
、python做图分析挖掘【1】最短路径算法dijkstra【2】基于networkx的隐性集团关系识别模型【3】基于Neo4j的担保社群型态分析挖掘【4】
MO2T
·
2023-12-20 13:25
图分析与挖掘
neo4j
Graph2NLP浅谈
图技术利用neo4j、networkx、
dgl
、python做图分析挖掘【1】最短路径算法dijkstra【2】基于networkx的隐性集团关系识别模型【3】基于Neo4j的担保社群型态分析挖掘【4】
MO2T
·
2023-12-20 13:53
图分析与挖掘
知识图谱
人工智能
算法
GraphSAGE 到底在训练什么? 图上的Mini-Batch 是怎么训练的 ?
DGL
为GraphSAGE实现了2种训练:full-graph和mini-batch:下面这个代码就是full-graph的GraphS
chuanauc
·
2023-12-19 12:18
batch
深度学习
pytorch
【源码复现】《Simple and Deep Graph Convolutional Networks》——GCNII模型
目录1、论文简介2、论文核心介绍2.1、研究动机2.2、创新点2.3、具体实现2.3.1、初始残差链接2.3.2、恒等映射2.3.3、模型3、源码复现3.1、Torch复现3.2、
DGL
复现1、论文简介论文题目
鲸可落
·
2023-12-18 18:04
图神经网络
神经网络
深度学习
算法
【源码复现】《Towards Deeper Graph Neural Networks》
目录1、论文简介2、论文核心介绍2.1、基本概述2.2、模型介绍3、源码复现3.1、torch复现3.2、
DGL
复现1、论文简介论文题目——《TowardsDeeperGraphNeuralNetworks
鲸可落
·
2023-12-18 18:58
图神经网络
神经网络
深度学习
算法
图神经网络22-
DGL
实战:针对边分类任务的邻居采样训练方法
sampler=
dgl
.dataloading.MultiLayerFullNeighborSampler(2)想要用
DGL
提供的邻居采样器做边分类,需要将其与:class:~
dgl
.dataloading.pytorch.EdgeDataLoader
致Great
·
2023-12-16 13:22
dgl
的cuda 版本 环境配置(
dgl
cuda 版本库无法使用问题解决)
1.如果你同时有dgldglcu-XX.XX那么,应该只会运行
dgl
(
DGL
的CPU版本),因此,你需要把
dgl
(CPU)版本给卸载了但是我只卸载CPU版本还不够,我GPU版本的dglcu依旧不好使,因此吧
chuanauc
·
2023-12-05 04:17
python
DGL
GCN,GraphSAGE 到底在训练什么呢?
根据
DGL
来做的,按照
DGL
实现来讲述1.GCNCora训练代码:importosos.environ["DGLBACKEND"]="pytorch"importdglimportdgl.dataimporttorchimporttorch.nnasnnimporttorch.nn.functionalasFfromdgl.nn.pytorchimportGraphConvclassGCN
chuanauc
·
2023-12-05 04:45
python
深度学习
开发语言
第4章:图数据处理管道
第4章:图数据处理管道
DGL
在
dgl
.data里实现了很多常用的图数据集。它们遵循了由
dgl
.data.DGLDataset类定义的标准的数据处理管道。
发呆的比目鱼
·
2023-11-27 23:57
图神经网络
python
机器学习
深度学习
大咖眼中的AI开源 | 张建:图神经网络和
DGL
的实际应用
6月26日,亚马逊云科技CommunityDay在上海举办。亚马逊云科技首席开发者布道师、资深数据科学家、资深应用科学家以及亚马逊云科技MachineLearningHero悉数到场,针对AI开源的技术趋势及落地实践项目进行分享和讨论。第一期:大咖眼中的AI开源|王宇博:四位一体,构建开源机器学习生态系统第二期:大咖眼中的AI开源|王敏捷:深图在人工智能中的探索和研究第三期:大咖眼中的AI开源|吴
亚马逊云开发者
·
2023-11-27 23:26
网络
DGL
中NN模块的构造函数
上图引用自:
dgl
用户文档第三章(nn模块编写)"""构造函数完成以下几个任务:1、设置选项。2、注册可学习的参数或者子模块。3、初始化参数。"""
♡Coisíní♡
·
2023-11-27 23:25
DGL
深度学习
人工智能
DGL
GNN
图卷积神经网络
异构图
GCN
DGL
在异构图上的GraphConv模块
回顾同构图GraphConv模块首先回顾一下同构图中实现GraphConv的主要思路(以GraphSAGE为例):在初始化模块首先是获取源节点和目标节点的输入维度,同时获取输出的特征维度。根据SAGE论文提出的三种聚合操作,需要获取所使用的聚合类型,方便后面使用Pytorch中的nn模块实现。最后是特征归一化操作。其具体的代码段为:获取相关输入特征#获取源节点和目标节点的输入特征维度self._i
♡Coisíní♡
·
2023-11-27 23:25
DGL
DGL
图卷积神经网络
异构图
GCN
GNN
跟着官方文档学
DGL
框架第七天——下载和处理数据集
参考链接https://docs.
dgl
.ai/guide/data.html#guide-data-pipelinehttps://docs.
dgl
.ai/en/0.5.x/_modules/
dgl
/
cqu_shuai
·
2023-11-27 23:24
DGL
深度学习
python
pytorch
DGL
图神经网络
DGL
的图数据处理管道
DGL
在
dgl
.data里实现了很多常用的图数据集。它们遵循了由
dgl
.data.DGLDataset类定义的标准的数据处理管道。
♡Coisíní♡
·
2023-11-27 23:52
DGL
GCN
图卷积网络
图神经网络
python
GNN
DGL
DGL
获取节点邻居代码
简单记录一下
DGL
根据节点采样子图的代码。先创建一个简单的同构图。
Guapifang
·
2023-11-21 11:27
图神经网络
python
numpy
深度学习
DGL
_图的创建、保存、加载
importdglimporttorchasthfromdgl.data.utilsimportsave_graphsg1=
dgl
.DGLGraph()g1.add_nodes(3)g1.add_edges
cici_iii
·
2023-11-21 11:53
DGL
数据挖掘
内置函数和消息传递API
消息传递范式消息函数、聚合函数与更新函数消息函数接受一个参数edges,这是一个EdgeBatch的实例,在消息传递时,它被
DGL
在内部生成以表示一批边。
♡Coisíní♡
·
2023-11-21 11:19
DGL
GCN
图卷积神经网络
DGL
异构图
深度学习
编写高效的消息传递代码-对消息进行降维
DGL
优化了消息传递的内存消耗和计算速度。利用这些优化的一个常见实践是通过基于内置函数的update_all()来开发消息传递功能。
♡Coisíní♡
·
2023-11-21 11:19
DGL
DGL
图卷积神经网络
异构图
GCN
GNN
GAT
GraphSAGE
DGL
使用笔记
DGL
一个基于pytorch的图神经网络库使用方法importdglimporttorchasthg=
dgl
.graph(([0,0,1,5],[1,2,2,0]))#6个节点,4条边上面为创建图的过程
脉望虫
·
2023-11-21 11:48
Python
DGL
pytorch
图神经网络
DGL
创建异构图
利用
DGL
创建具有3种节点类型和3种边类型的异构图graph_data={#(src_type,edge_type,dst_type)('drug','interacts','drug'):(th.tensor
♡Coisíní♡
·
2023-11-21 11:35
DGL
DGL
图神经网络
GCN
GNN
GraphSAGE
GAT
虚拟环境 ‘import‘ 不是内部或外部命令,也不是可运行的程序 或批处理文件。
__version__)导入
dgl
包检查importdgl.datadataset=
dgl
.data.CoraGraphDatase
仙女笔记
·
2023-11-20 04:46
pycharm
ide
python
使用
dgl
库实现GCN【官方案例】
学习目的学习使用gnn进行节点分类的基本工作流程,即预测图中节点的类别。关于GCN节点分类的综述在图数据上最流行和广泛采用的任务之一是节点分类,其中模型需要预测每个节点的真实类别。在图神经网络之前,许多被提出的方法要么单独使用连通性(如DeepWalk或node2vec),要么简单地结合连通性和节点自身的特征。相比之下,gnn通过结合局部邻域的连通性和特征提供了获得节点表示的机会。Kipf等人将节
♡Coisíní♡
·
2023-11-14 05:33
DGL
图卷积神经网络
异构图
GCN
GNN
再服务器上配置其他版本的
DGL
1、先创建pytorch环境:condacreate-nljj_torch190python=3.8condaactivateljj_torch1902、下载pytorch(带上了cuda111)StartLocally|PyTorch这里面没有安装CUDAToolkit,所以需要再安装匹配cuda的toolkits,报错如下:安装:condainstallcudatoolkit=10.2【最新】
爱吃甜的火龙果巧克力
·
2023-11-09 14:52
python
DGL
教程【一】使用Cora数据集进行分类
首先安装dglpipinstalldgl-ihttps://pypi.douban.com/simple/加载Cora数据集importdgl.datadataset=
dgl
.data.
vincent_hahaha
·
2023-11-09 00:37
DGL
sklearn
python
机器学习
安装
dgl
-cuda
1.对应各种cuda版本的
dgl
-cuda下载地址为:Packagerepositoryfordglteam::Anaconda.org以cuda11.1为例2.将对应的文件下载到本地,并解压到anaconda
DarryRingLW
·
2023-11-09 00:37
python
深度学习
dgl-cuda
windows下
DGL
库cuda版本安装
windows下
DGL
库cuda版本安装方法1在
dgl
官网下https://www.
dgl
.ai/pages/start.html找到对应版本根据命令安装但是可能会出现安装成功,但是importdgl报错的情况方法
wa07
·
2023-11-09 00:36
windows
python
人工智能
CUDA+pytorch+
DGL
安装
CUDA版本查看显卡状态更新/下载显卡驱动(如果有需要)更新/下载CUDACUDA版本选择CUDA安装安装成功检验cuDNN安装GPU版本的pytorch安装GPU版本的tensorflow安装概述要想使用
DGL
Brilliant_11
·
2023-11-09 00:03
pytorch
深度学习
tensorflow
python
神经网络
DGL
-KE使用
DGL
-KE是亚马逊开发的基于
DGL
的知识图片嵌入库,提供了TransE,TransR等一系列嵌入方法,可以使用命令行的方式快速得到知识图谱中实体和关系的嵌入。
canaryW
·
2023-11-08 23:25
机器学习
graph
ML&&DL
知识图谱
dgl
安装教程
我在矩池云服务器上安装了一个
dgl
的环境,以后都可以用这个了首先我的基础环境是最终的版本如下安装步骤如下pipinstalldgl==0.9.1-fhttps://s3.us-west-2.amazonaws.com
我的心永远是冰冰哒
·
2023-11-08 23:46
macos
【已解决】ModuleNotFoundError: No module named ‘
dgl
‘
禁止使用下面方法安装
DGL
,这种方法会更新你的pytorch版本,环境越变越乱pipinstalldgl二是进入
DGL
官网:DeepGraphLibrary(
dgl
.ai),了解自己的配置情况,比如我cuda11.8
鳗小鱼
·
2023-11-07 21:28
Bugs(程序报错)
人工智能
神经网络
机器学习
opencv
计算机视觉
知识图谱
gnu
中新金盾信息安全管理系统存在默认密码
qbase64=
dGl
0bGU9IuS4reaWsOmHkeebvuS%2FoeaBr%2BWuieWF
香芋320
·
2023-11-05 19:45
计算机
12月蓝心组优秀文章
第一周优秀文章:作者:露露:冬日沉思链接:https://mp.weixin.qq.com/s/kYn8
Dgl
0LKsWaG-CKJmFxw推荐理由:给人带来温暖的文章第二周优秀文章:作者:新生七年-007
蓝心百合
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2023-11-03 11:25
在服务器上运行代码
1安装包
dgl
用于开发图神经网络打开网页https://www.
dgl
.ai/pages/start.html,复制命令,在服务器中运行image.png查看
dgl
包下载情况condalistdgl运行代码后台运行
辘轳鹿鹿
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2023-11-01 09:02
Anaconda+
DGL
+Pytorch环境搭建
目录Anaconda的下载1.进入官网选择需要的版本搭建虚拟环境
DGL
的安装1.进入官网点击Install2.根据自己的情况选择选项PyTorch的安装进入PyTorch官网并按照提示安装Anaconda
这人很白
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2023-10-31 09:21
GNN
pytorch
深度学习
python
人工智能
AttributeError: module ‘
dgl
‘ has no attribute ‘batch_hetero‘
DGLWarning:Fromv0.5,DGLHeteroGraphismergedintoDGLGraph.Youcansafelyreplacedgl.batch_heterowithdgl.batch
Go 鹏ya
·
2023-10-22 23:47
NLP
python
2021-07-22
DGL
图神经网络开源工作 更新翻译
这是一个新的主要版本,包含各种系统优化、新特性和增强功能、新模型和错误修复。Thisisanewmajorreleasewithvarioussystemoptimizations,newfeaturesandenhancements,newmodelsandbugfixes.重要改变,在pypi安装上进行了与以往安装的区分。目录Important:ChangeonPyPIInstallation
路人与大师
·
2023-10-16 13:00
深度学习框架
pip 安装
dgl
的问题
在该官网链接找到需要的对应包:官网链接安装之后可能的问题:这个时候应该是网络问题导致的,这个时候可以自行前往网站下载下载之后安装:发现缺少依赖psutilpsutilpsutil,于是前往官网下载:官网链接完成啦!
九思Atopos
·
2023-10-16 13:51
pip
AttributeError: module ‘
dgl
‘ has no attribute ‘batch_hetero‘
DGLWarning:Fromv0.5,DGLHeteroGraphismergedintoDGLGraph.Youcansafelyreplacedgl.batch_heterowithdgl.batch
Go 鹏ya
·
2023-10-03 23:06
NLP
python
不同图框架的差异性
DGL
:[1909.01315]DeepGraphLibrary:AGraph-Centric,Highly-PerformantPackageforGraphNeuralNetworks(arxiv.org
Jerry_ICCAS
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2023-10-03 04:14
深度学习
人工智能
笔记(一)斯坦福CS224W图机器学习、图神经网络、知识图谱
,需要满足以下几个方面:1、图是任意尺寸输入2、图是动态变化的,有时也是多模态数据图,可以实现端到端的表示学习图嵌入,把节点映射为D维向量,并且能够反应原数据的语义信息工具:PyG、NetworkX、
dgl
hlllllllhhhhh
·
2023-09-15 00:00
笔记
神经网络
人工智能
DLG一些例子的解释
DGL
创建异质图:importdglimporttorchdata_dict={('user','follows','user'):(torch.tensor([0,1]),torch.tensor([
thelong的学习日记
·
2023-09-05 04:54
【图神经网络-RGCN】关系图神经网络
dgl
版本实现
参考文献【1】是数学上的解读参考文献【2】是升级版本,有空来填坑参考文献[1]【深度学习】R-GCN的
dgl
官方代码解读(entityclassification)[2]
dgl
官方解读[3]异构图神经网络入门笔记
一穷二白到年薪百万
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2023-08-09 01:29
图机器学习
神经网络
人工智能
深度学习
【图神经网络】邻居采样算法
在大规模图上遇到节点爆炸问题,可以参考下面的文献参考文献[1]
dgl
.sampling.sample_neighbors[2]graphSAGE-pytorch/src/dataCenter.py[3]
一穷二白到年薪百万
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2023-08-09 01:56
图机器学习
神经网络
人工智能
深度学习
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