ggplot 第7页

R语言数据可视化ggplot2-检验变量相关性图形汇总

RookieTrevor·2023-10-21 02:56

把基因画在染色体上

经过一番奇奇怪怪的操作之后，最终用ggplot2画了。。。

果蝇饲养员的生信笔记·2023-10-20 02:14

友好的可视化工具——trelliscope

众所周知，R的一个为人称道之处是它的可视化工具体系，以ggplot为代表的可视化语法自诞生之日起在数据科学领域流行至今。不过，ggplot主要专长于建立静态的可视化效果，可交互性略显不足。

人邮异步社区·2023-10-20 00:06

R语言ggplot2作图一些好看的颜色搭配

elegant-scientific-graphs-learning-from-examples/，我使用snipaste软件把颜色弄下来了，记录一下，自己备用，也分享给大家三个颜色image.pnglibrary(ggplot2

小明的数据分析笔记本·2023-10-19 07:05

R语言可视化——用ggplot构造期待已久的雷达图

之前一直苦恼于ggplot函数无法制作雷达图，心想着既然饼图可以通过柱形图+极坐标模拟出来，为啥雷达图不行。我尝试着用折线图+极坐标来模拟雷达图（之前在制作饼图和圆环图以及玫瑰图的时候

村狗儿·2023-10-18 18:32

infercnv运行测试9--ref_group_names=NULL

4000cell47min>rm(list=ls())>options(stringsAsFactors=F)>library(Seurat)>library(ggplot2)>library(infercnv

Seurat_Satija·2023-10-18 11:41

跟着Nature学作图：R语言ggplot2频率分布直方图和散点图添加误差线

论文Asaturatedmapofcommongeneticvariantsassociatedwithhumanheighthttps://www.nature.com/articles/s41586-022-05275-ys41586-022-05275-y.pdf代码没有公开，但是作图数据基本都公开了，争取把每个图都重复一遍今天的推文重复论文中的extendedFigure4频率分布直方图和

小明的数据分析笔记本·2023-10-18 04:46

Seurat4.0系列教程17：Mixscape

加载所需的包#Loadpackages.library(Seurat)library(SeuratData)library(ggplot2)library(p

Seurat_Satija·2023-10-17 23:09

跟着Nature Communications学作图：R语言ggplot2做堆积柱形图展示群体基因组学的结果

论文Genomicinsightsintolocaladaptationandfutureclimate-inducedvulnerabilityofakeystoneforesttreeinEastAsiahttps://www.nature.com/articles/s41467-022-34206-8#Sec23完整的数据分析代码涉及到群体基因组学作图数据``https://github.c

小明的数据分析笔记本·2023-10-17 21:23

R语言零基础基因/数据差异分析（二）

文章目录结果展示安装ggplot2包制作方法注意，本系列有连贯性，每一步都很详细，每一步都很重要，请耐心读完！！结果展示安装ggplot2包如图操作找到并勾上即可。

Frms·2023-10-17 14:54

如何对多变量数据批量进行t test和anova test并标注P值

就分两步走用ggplot或者基础函数画出boxplot进行可视化用t.testoneway.test等函数进行统计分析重复1和2这种方法应付少量的变量还可以，当变量是几十个甚至几百个的时候就有点力不从心了

Jason数据分析生信教室·2023-10-17 10:00

R语言ggplot2画漂亮的环形柱形图的一个实例

代码和数据也是公开的，今天的推文来学习一下他的代码代码来源的链接是https://github.com/NearAndDistant/data_science_with_r这个链接还有很多其他的R语言ggplot2

小明的数据分析笔记本·2023-10-17 01:13

20180416-H · Global Mortality · ggplot2 地图 gganimate 动图动态地图 · R 语言数据可视化案例源码

所有作品合集传送门：TidyTuesday2018年合集传送门：2018GlobalMortalityWhatdopeoplediefrom?在过去的几个世纪里，世界发生了很大的变化–这就是《我们的世界》的数据所显示的。然而，有一件事在这种转变中一直保持不变：我们都必须在某个时候死亡。然而，随着生活水平的提高、医疗保健的进步和生活方式的改变，死亡的原因正在发生变化。在这篇博客中，我们试图回答“人们

数绘小站·2023-10-16 13:54

ggplot2 -- geom_linerange 函数的简单使用

brief需要三个参数确定一个直线，x轴位置，y轴起始位置，y轴结束位置。有别于一些垂直辅助线，可以实现柱状图，瓷砖图等等。example实现柱状图library(tidyverse)tibble(theta=seq(from=0,to=1,by=.1),prior=c(seq(from=0,to=.2,length.out=6),seq(from=.16,to=0,length.out=5)))

All_Will_Be_Fine噻·2023-10-16 12:40

ggplot2|ggpubr进行“paper”组图合并

多个图形进行组图展示，既可以展示一个“事情”的多个角度，也可以进行异同的比较，同时也是发表paper所必须的。可以利用PS或者AI进行处理，但是图形的大小，位置，布局，字体等的调整也不是一个小工程。本文利用R包-ggpubr函数从0开始介绍组图的合并方式，也许。。。比AI或者PS更简单易学呢。基础函数进行组图合并可参考R|绘图边距及布局载入数据，R包加载函数包及数据集#install.packag

生信补给站·2023-10-16 12:08

R语言中ggplot2绘制——随心所欲修改横纵坐标！！！

1、首先绘制一个自带的数据散点图：install.packages("ggplot2")#安装ggplot2包library("ggplot2")#加载该包ggplot(iris,aes(Sepal.Length

Guanghui Yu·2023-10-15 17:37

芯片分析中DEG如何解决"org.Mm.eg.db"加载失败的问题？

首先安装：>BiocManager::install("org.Mm.eg.db")>library(ggplot2)>library(clusterProfiler)>library

李建华0302·2023-10-15 15:05

GEO数据挖掘之使用clusterProfiler进行GO/KEGG富集分析

library(clusterProfiler)>library(dplyr)>library(ggplot2)>library(stringr)Warningmessage:程辑包‘stringr’是用

Seurat_·2023-10-15 06:12

南丁格尔玫瑰图 With ggplot2【R语言】

前言之前在饼图中提到过，要整理一下南丁格尔玫瑰图的画法南丁格尔玫瑰图又名鸡冠花图、极坐标区域图，是南丁格尔在克里米亚战争期间提交的一份关于士兵死伤的报告时发明的一种图表。南丁格尔玫瑰图是在极坐标下绘制的柱状图，使用圆弧的半径长短表示数据的大小（数量的多少）。由于半径和面积的关系是平方的关系，南丁格尔玫瑰图会将数据的比例大小夸大，尤其适合对比大小相近的数值。由于圆形有周期的特性，所以玫瑰图也适用于表

万木春❀·2023-10-14 16:58

R语言~图例中的合并同类项

在网上找到了答案https://stackoverflow.com/questions/37140266/how-to-merge-color-line-style-and-shape-legends-in-ggplot

Oodelay·2023-10-14 12:35

R语言ggplot2作图的时候给坐标轴添加文本π

image.png今天用ggplot2作图y轴的标题想实现上图红框里的形式，查了一下如何实现记录一下代码首先是构造一份数据集df<-data.frame(x=1,y=1)R语言ggplot2散点图并添加文本

小明的数据分析笔记本·2023-10-14 10:39

跟着Nature Genetics 学画图：R语言ggplot2散点图展示PCA结果

论文是Whole-genomeresequencingof445Lactucaaccessionsrevealsthedomesticationhistoryofcultivatedlettuceimage.png这篇论文的数据是公开的，代码也公开了一部分，那我们就可以按照他的代码来学二代测序的数据分析啦今天我们来学习一些论文中Fig1c的画图代码，如下image.png数据对应的是论文中的sou

小明的数据分析笔记本·2023-10-14 01:23

用ggplot2画Pathway气泡图

成品图KEGGPathway富集分析气泡图横坐标为pathwayimpact纵坐标为pathway名称。这里是我瞎编的气泡的颜色代表p值气泡的大小代表富集到的代谢物数量。这里我是用代谢组结果做的KEGG分析，所以是代谢物数量，如果用转录组做，则是基因数量。数据准备Pathway_results_sample代谢组的KEGGPathway分析我使用的是MetaboAnalyst提供的在线分析工具结果

Cdudu·2023-10-13 15:06

ggplot2分面作图然后在其中一个添加注释

ggplot2分面作图如果添加注释通常在每一个小图都会添加上比如df<-reshape2::melt(iris)head(df)library(ggplot2)ggplot(df,aes(x=variable

小明的数据分析笔记本·2023-10-13 11:47

用ggplot2做一个箱图--写给刚刚开始用ggplot2作图的同仁

选择包library(ggplot2)library(ggsc

xuwenpku·2023-10-13 02:50

记一次用ggplot2做双因素条形（Bar）图+显著性p值+errorbar

2导入数据集从spss导入数据集，同时加载相关R包，代码如下：library(ggplot2)library(ggsignif)#添加显著性library(Hmisc)#利用该包的SPSS.get函数从

捣乱_Psy·2023-10-12 22:56

WGCNA代码

WGCNArm(list=ls())#加载R包library(WGCNA)library(tidyr)library(ggplot2)library(gridExtra)setwd("D:\\项目探索\

陈洪瑜·2023-10-12 16:57

跟着Nature Communications学作图：R语言ggplot2做柱形图并添加误差线和显著性P值

论文是AgiantNLRgeneconfersbroad-spectrumresistancetoPhytophthorasojaeinsoybeanimage.png论文里公布了大部分柱形图和箱线图的原始数据，今天的推文试着用论文中的数据模仿一下论文中的Figure2bcimage.pngFigure2b的数据image.png类似的图之前录制过视频进行介绍，如果习惯看视频的话可以关注下我的B站

小明的数据分析笔记本·2023-10-11 16:14

r读取shape文件可视化_干货分享 | R_ggplot2地理信息可视化_史上最全(二)

原标题：干货分享|R_ggplot2地理信息可视化_史上最全(二)前言：上文R_ggplot2地理信息可视化_史上最全(一)讲了sp和sf数据类型，这篇讲解地图数据集以及与其他几何对象的结合，还有栅格地图

沉默的真实·2023-10-11 06:39

R语言学堂推文索引-2022年11月

2022.11.220前言1数据处理通识专辑1.1R语言基础与base-R1.2数据处理与tidy-R1.3各类型数据处理方案1.4高级数据管理1.5数据获取方法2制表与可视化专辑2.1基础绘图系统2.2ggplot2

R语言学堂·2023-10-11 04:02

R语言学堂推文索引-2022年12月

2022.12.120前言1数据处理通识专辑1.1R语言基础与base-R1.2数据处理与tidy-R1.3各类型数据处理方案1.4高级数据管理1.5数据获取方法2制表与可视化专辑2.1基础绘图系统2.2ggplot2

R语言学堂·2023-10-11 04:02

R语言学堂推文索引-2022年10月

:2022.10.210前言1数据处理通识专辑1.1R语言基础知识1.2base-r/tidy-r1.3各类型数据处理方案1.4高级数据管理1.5数据获取方法2制表与可视化专辑2.1基础绘图系统2.2ggplot2

R语言学堂·2023-10-11 04:31

R语言ggplot2画热图的时候在色块上添加文本

355787260image.png首先是示例数据的格式画热图的数据image.png用来添加文本的数据image.png如果还有其他文本需要添加，可以再准备一份数据image.png加载需要用到的R包library(ggplot2

小明的数据分析笔记本·2023-10-10 14:29

ggplot多图叠加_R作图 ggplot2图片的布局排版

ggplot2是R语言中用来可视化的利器，其图层逻辑非常人性化，简单的说就是一句话一张图，后一张图叠加在前一张图上，所想表达的几乎都可以用一句代码在图形上展示出来。

weixin_39568083·2023-10-10 13:52

R语言快速实现图片布局（1）

/表示分行，|表示分列library(patchwork)pp1<-ggplot(mtcars)+geom_point(aes(mpg,disp))pp2<-ggplot(mtcars)+geom_boxplot

weixin_49320263·2023-10-10 13:44

R语言矩阵相关性计算及其可视化？

library(ggplot2)cor(mtcars)cor.test(mtcars)#errorcor.test(mtcars,mtcars)#err

生物信息与育种·2023-10-10 11:45

monocle的细胞轨迹图用ggplot重新做

my_plot_cell_trajectory%as.data.frame()%>%select_(prin_graph_dim_1=x,prin_graph_dim_2=y)%>%mutate(sample_name=rownames(.),sample_state=rownames(.))dp_mst%igraph::as_data_frame()%>%select_(source="from

一只烟酒僧·2023-10-10 04:30

【R语言可视化】-- 柱状图要点一网打尽

其中主要用到的R包为ggplot2，不会再讲解R语言自带的基础函数，如plot、barp

可视化艺术·2023-10-09 14:59

R包ggpubr绘制发表级别图片

HadleyWickham创建的可视化包ggplot2可以流畅地进行优美的可视化，但是如果要通过ggplot2定制一套图形，尤其是适用于杂志期刊等出版物的图形，对于那些没有深入了解ggplot2的人来说就有点困难了

Seurat_Satija·2023-10-09 05:34

跟着Nature学作图：R语言ggplot2画带有置信区间的折线图展示核心基因和非必需基因的数量

论文Achickpeageneticvariationmapbasedonthesequencingof3,366genomesimage.png本地存储s41586-021-04066-1.pdf鹰嘴豆基因组重测序论文，涉及到了泛基因组。最近朋友圈好多人转发这个论文。就找到原文来看了看。论文里的Figure1a基本上泛基因组的论文都会涉及到，正好论文提供了作图的原始数据，所以我们用原始数据尝试来

小明的数据分析笔记本·2023-10-08 19:33

PCA 画图

ggplot2画PCA，加library(ggplot2)library(ggalt)setwd("G:/code/R/pca")pca0.3,]pcacycle20,]pcacycle3<-pca[pca

生信小白2018·2023-10-08 05:14

ggsignif箱线图添加显著性差异标识(多组分析)

exprSet_L,method="wilcox.test",paired=FALSE)my_comparisons<-list(c("T1","T2"),c("T1","T3"),c("T1","T4"))ggplot

陈宇乔·2023-10-07 08:49

数据点处理问题

df<-data.frame(set12$RatioMC.x,set12$RatioMC.y)ggplot(df,aes(x=df[,1],y=df[,2]))+geom_point(alpha=1,colour

MJades·2023-10-06 22:53

ggplot误差棒添加

参考自《RGraphicsCookbook》本文针对ggplot2添加误差棒的一种方法：使用geom_errorbar()语法library(ggplot2)library(gcookbook)library

ChrisJO·2023-10-05 13:52

R/qtl，遗传图校正距离

library(ggplot2)library(ggpubr)library(qtl)f210thelim10even10for(iinodd){axis(side=2,at=chrpos[i],labels

93830eddc2a4·2023-10-03 14:25

【R】常用的包

ggplot2，tidydplyr是一个强大的R软件包，用于处理，清理和汇总非结构化数据。简而言之，它使得R中的数据探索和数据操作变得简单快捷。

南谛走心·2023-10-03 14:53

数据可视化笔记 Task5 - Matplotlib样式色彩

importmatplotlib.pyplotaspltimportnumpyasnpplt.style.use('ggplot')plt.p

xyc_undermoon·2023-10-03 11:57

R plot图片背景设置为透明_万能转换：R图和统计表转成发表级的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量图等...

你和PPT高手之间，就只差一个iSlideExcel改变了你的基因名，30%相关Nature文章受影响，NCBI也受波及特点可以用命令将交互式R图或ggplot2、Lattice或baseR图保存到MicrosoftWor

weixin_39780962·2023-10-02 23:30

ggplot学习笔记（三）

在前面的一个例图中，在ggplot()函数中将color和fill映射到了continent变量，使得不仅散点颜色代表了不同大洲，还使得每个大洲单独拟合了曲线。如果希望所有大洲拟合同一条曲线怎么办？

财富经略·2023-10-02 03:36

跟着Nature学作图:R语言ggplot2簇状柱形图完整示例

论文Aglobalreptileassessmenthighlightssharedconservationneedsoftetrapodshttps://www.nature.com/articles/s41586-022-04664-7#Sec33数据代码链接https://github.com/j-marin/Global-reptile-assessment-今天的推文学习一下推文中的Fi

小明的数据分析笔记本·2023-10-02 03:41

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