python机器学习生物信息学

2023最后一个工作日

2023年教程汇总|《小杜的生信笔记》「小杜的生信筆記」，主要发表或收录生物信息学的教程，以及基于R的分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!!
小杜的生信筆記·2023-12-30 15:08

——生物信息学了解一下

别担心，来到重庆邮电大学生物信息学专业上述愿望统统帮您实现！
Yolanda_44ad·2023-12-30 09:59

学学这篇免疫浸润文章和作者一样发5+分

Anovelimmune-relatedgenesprognosisbiomarkerformelanoma-associatedwithtumormicroenvironment.在文章中作者构建了基于8个IRGs的黑色素瘤预后分类器模型，而且进行了全面的生物信息学分析
科研菌·2023-12-29 23:21

BED 文件格式 chip-seq m6a数据可视化会用到

//bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/general-usage.htmlBED格式（BrowserExtensibleDataformat）是一种在生物信息学中广泛使用的文本文件格式
生信小博士·2023-12-29 19:10

机器学习笔记

机器学习黑马程序员3天快速入门python机器学习_哔哩哔哩_bilibili1.概述1.1机器学习、人工智能、深度学习关系机器学习是人工智能的一个实现途径深度学习是机器学习一个方法发展而来1.2定义机器学习是从数据中自动获得模型
王小白学习·2023-12-29 08:18

机器学习库Scikit-learn

监督学习算法3.3.4无监督学习算法3.3.5评价指标3.3.6交叉验证及超参数调优3.4Scikit-learn总结参考文献Scikit-learn是基于NumPy、SciPy和Matplotlib的开源Python
风度78·2023-12-29 04:48

人工智能python 模块_python机器学习和人工智能，基础模块和环境搭建

本文搭建包括numpy、pandas、gensim、matplotlib、tensorflow、sklearn、jieba、NLTK常用机器学习库，打造一个基础和全面的机器学习环境。人类一直试图让机器能够智能化，能有自主学习的能力，也就是人们常说的人工智能。从上世纪50年代，人工智能就开始了“推理期”；到70年代，人工智能的发展进入“知识期”；直到现在，人工智能在越来越多的领域深入实践。一，简介那
weixin_39560064·2023-12-28 21:54

Python机器学习入门：从零开始，10天学会

本博客系列将从零开始介绍Python机器学习。我们将从基础知识开始，逐步深入到机器学习的各个方面。
乔明飞·2023-12-27 16:35

云鹏农学实习报告

寒假结束，2月25号，我来到了我实习老师赵彦宏老师的办公室，从此开始了我三个月的实习生活；我自己给自己定的目标有三个：1、在校实习三个月，必须完成毕业论文；2、学习到生物信息学专业知识，自己可以处理数据
8云8·2023-12-27 05:14

Python机器学习——KNN

目录原理步骤案例原理1、KNN（K-nearestneighbors）：意为K近邻。取名由来or算法思想：如果想要了解一个人的经济水平，只需要知道他最好的5个朋友的经济能力，对他的这五个朋友的经济水平求平均就是这个人的经济水平2、在一个没有标签的样本进入算法后，首先计算他与训练集中每个样本的距离，找到与他最近的K个样本，然后用他这K个最近邻居的标签来确定它的标签3、属于机器学习中有监督的分类预测模
棒棒糖one·2023-12-27 03:48

python实现knn算法案例_python机器学习——KNN算法简单入门（真的很简单！）

所有代码请移步GitHub——kNNbyPython很多人在第一次听到机器学习的时候都不知所措，无从下手。起初我也是这样的，各种看别人的博客，吴恩达的课程也死磕，但效果不佳。后来发现一个神奇的网站k-近邻算法实现手写数字识别系统--《机器学习实战》,跟着过了一遍之后感觉还不错，也顺便买了《机器学习实战》这本书，接着就正式入坑机器学习。KNN算法应该是机器学习中最简单的算法之一，作为机器学习的入门是
weixin_39892481·2023-12-27 03:18

python机器学习算法书籍代码-赵志勇

Python-Machine-Learning-Algorithm:Python-Machine-Learning-Algorithm(github.com)基于python3.8mechine-learning-aigorithn:python
finbarr45·2023-12-26 13:07

机器学习中的强学习器：AdaBoost算法详解

错误率与权重更新3.AdaBoost的工作流程3.1初始化权重3.2训练弱学习器3.3更新样本权重3.4构建强学习器4.AdaBoost的优缺点4.1优点4.2缺点5.应用场景5.1图像识别5.2语音处理5.3生物信息学
轩Scott·2023-12-26 11:21

Servlet技术之Filter

系列文章目录提示：这里可以添加系列文章的所有文章的目录，目录需要自己手动添加例如：第一章Python机器学习入门之pandas的使用提示：写完文章后，目录可以自动生成，如何生成可参考右边的帮助文档文章目录系列文章目录前言一
键盘敲烂~~~·2023-12-26 07:21

R语言处理缺失值之naniar包

获取更多R语言和生信知识，请欢迎关注公众号：医学和生信笔记医学和生信笔记公众号主要分享：1.医学小知识、肛肠科小知识；2.R语言和Python相关的数据分析、可视化、机器学习等；3.生物信息学学习资料和自己的学习笔记
医学和生信笔记·2023-12-26 06:14

这个只需一步就可做富集分析的网站还未发表就被CNS等引用超过350次

Metascape专门为生物学者设计的基因富集分析网站image一、Metascape简介Metascape（http://metascape.org/）是一个功能强大的基因功能注释分析工具，能帮助用户将当前流行的生物信息学分析方法应用到批量基因和蛋白质的分析中
生信宝典·2023-12-25 22:07

大师兄的Python机器学习笔记:特征提取

大师兄的Python机器学习笔记:Pandas库一、关于分类(Classification)1.什么是分类分类是机器学习的重要模块，主要用来预测数据的类别标签。
superkmi·2023-12-25 13:38

Python机器学习实践与Kaggle实战（转）

https://mlnote.wordpress.com/2015/12/16/python%E6%9C%BA%E5%99%A8%E5%AD%A6%E4%B9%A0%E5%AE%9E%E8%B7%B5%E4%B8%8Ekaggle%E5%AE%9E%E6%88%98-machine-learning-for-kaggle-competition-in-python/Author:MiaoFan(范
weixin_30512785·2023-12-25 08:47

Python数据科学视频讲解：特征归一化、特征标准化、样本归一化

针对数据分析或机器学习推荐两本入门级的图书：《Python机器学习原
数据科学作家·2023-12-25 06:42

Python数据科学视频讲解：特征等宽分箱和等频分箱

针对数据分析或机器学习推荐两本入门级的图书：《Python机器学习原理与算法实现
数据科学作家·2023-12-25 06:42

Python数据科学视频讲解：特征决策树分箱

针对数据分析或机器学习推荐两本入门级的图书：《Python机器学习原理与算法实现》（杨维
数据科学作家·2023-12-25 06:09

python机器学习（三）——机器学习学习方法

本文内容根据黑马程序员3天快速入门python机器学习所写，详情点击链接，可观看相关视频往期链接python机器学习（一）——机器学习的含义以及数据集的构成python机器学习（二）——机器学习算法分类正文
十八子是李·2023-12-25 02:06

python机器学习（一）——机器学习的含义以及数据集的构成

本文内容根据黑马程序员3天快速入门python机器学习所写，详情点击链接，可观看相关视频1.什么是机器学习机器学习是从数据中自动分析获得模型，并利用模型对未知数据进行预测。
十八子是李·2023-12-25 02:35

SpringMVC之拦截器

系列文章目录提示：这里可以添加系列文章的所有文章的目录，目录需要自己手动添加例如：第一章Python机器学习入门之pandas的使用提示：写完文章后，目录可以自动生成，如何生成可参考右边的帮助文档文章目录系列文章目录前言一
键盘敲烂~~~·2023-12-24 23:37

Python机器学习实战：用Python构建10个有趣的应用

机器学习是一门强大的工具，可以用于解决各种各样的问题。通过学习机器学习，您可以开发出能够自动化任务、做出预测甚至创造艺术的应用程序。如果您是一名Python开发人员，那么您将很高兴知道，有许多可以用Python构建的有趣机器学习应用程序。在本博客文章中，我们将介绍10个这样的应用程序。应用一：垃圾邮件过滤器垃圾邮件过滤器是一种使用机器学习来识别垃圾邮件的应用程序。垃圾邮件过滤器可以使用各种机器学习
乔明飞·2023-12-24 23:49

【Python机器学习系列】建立决策树模型预测心脏疾病（完整实现过程）

一文彻底搞懂机器学习中的归一化与反归一化问题【Python机器学习系列】一文彻底搞懂机器学习中表格数据的输入形式（理论+源码）【Python特征工程系列】利用随机森林模型分析特征重要性（源码）【Pytho
数据杂坛·2023-12-24 20:41

【Python机器学习系列】一文搞懂机器学习中的转换器和估计器（附案例）

一、引言表格数据一套完整的机器学习建模流程如下：在机器学习中，转换器（Transformer）和估计器（Estimator）是两个重要的概念，转换器和估计器在机器学习中扮演不同的角色，但它们通常可以结合在一起构建一个完整的机器学习流程。二、转换器转换器（Transformer）是一种用于数据转换和预处理的对象或类。它接受输入数据，并对其进行某种形式的变换。转换器通常用于数据的特征工程，包括特征缩放
数据杂坛·2023-12-24 20:38

决策曲线分析DCA用于lasso回归/随机森林

主要分享R语言做医学统计学、meta分析、网络药理学、临床预测模型、机器学习、生物信息学等。前面介绍了超多DCA的实现方法，基本上常见的方法都包括了，代码和数据获取方法也给了大家。
医学和生信笔记·2023-12-23 21:29

Python机器学习之数据探索可视化库yellowbrick-tutorial

背景介绍从学sklearn时，除了算法的坎要过，还得学习matplotlib可视化，对我的实践应用而言，可视化更重要一些，然而matplotlib的易用性和美观性确实不敢恭维。陆续使用过plotly、seaborn，最终定格在了Bokeh，因为它可以与Flask完美的结合，数据看板的开发难度降低了很多。前阵子看到这个库可以较为便捷的实现数据探索，今天得空打算学习一下。原本访问的是英文文档，结果发现
civilpy·2023-12-23 06:32

Python机器学习之数据探索可视化库yellowbrick

背景介绍从学sklearn时，除了算法的坎要过，还得学习matplotlib可视化，对我的实践应用而言，可视化更重要一些，然而matplotlib的易用性和美观性确实不敢恭维。陆续使用过plotly、seaborn，最终定格在了Bokeh，因为它可以与Flask完美的结合，数据看板的开发难度降低了很多。前阵子看到这个库可以较为便捷的实现数据探索，今天得空打算学习一下。原本访问的是英文文档，结果发现
civilpy·2023-12-23 06:02

遗传图谱应用分析案例：菊花高密度遗传图谱的构建和花型相关位点的鉴定【百迈客生物】

遗传图谱遗传图谱（Geneticmap），是基于全基因组重测序技术或简化基因组测序技术，对某物种家系样本进行测序，利用生物信息学方法，开发SNP分子标记，计算标记间的遗传连锁距离，绘制高密度遗传图谱。
百迈客生物·2023-12-23 03:06

利用简单的python机器学习库玩转『低代码』

转载于：2022了你还不会『低代码』？数据科学也能玩转Low-Code啦！-掘金(juejin.cn)低代码开发，顾名思义，指的是软件开发过程中只需要编写少量代码就够了。与传统开发方式相比，低代码大幅减少了编写代码的工作量，这使其具备了更快的速度、更短的开发时间与更低的成本。无代码/低代码机器学习平台（和库）的兴起，加速了代码开发速度。借助于这些平台和框架，数据科学家们在繁重的探索研究和大量的编程
m0_61899108·2023-12-22 05:19

工具系列：PyCaret介绍_多分类代码示例

工具系列：PyCaret介绍_多分类代码示例PyCaret介绍PyCaret是一个开源的、低代码的Python机器学习库，可以自动化机器学习工作流程。
愤斗的橘子·2023-12-22 05:49

TCR-seq数据分析(一)

该方法诞生的目的就是用生物信息学手段来全面高速地分析高通量测序技术检测靶向扩增后的T细胞抗原识别决定性表面分子，即T细胞受体多样性的检测技术，用以揭示机体在生理和病理状态下T细胞介导的细胞免疫应答状态
生信云笔记·2023-12-21 13:08

龙芯loongarch64服务器编译安装pytorch

前言PyTorch是一个开源的Python机器学习库，基于Torch，用于自然语言处理等应用程序，它是一个基于Python的可续计算包。
番茄小能手·2023-12-21 07:09

生物信息学R分析工具包ggkegg的详细使用方法

ggkegg介绍ggkegg是一个用于生物信息学研究的工具，可以用于分析和解释基因组学数据，并将其与已知的KEGG数据库进行比较。
小果运维·2023-12-20 14:22

Python机器学习基础（一）---数据集加载的方法

几个数据集加载的方式鸢尾花练习资源(这个资源有瑕疵，index列和Species都是带”“的字符串导致一些加载现实问题，从而验证还是pandas最好用)"index","Sepal.Length","Sepal.Width","Petal.Length","Petal.Width","Species""1",5.1,3.5,1.4,0.2,"setosa""2",4.9,3,1.4,0.2,"se
落世繁华·2023-12-20 04:27

Python机器学习基础（二）---数据可视化

一.简单图形生成1.Pandas生成折线图importpandasaspdimportnumpyasnpfrommatplotlibimportpyplot#生成10行4列标准正态分布的数据df=pd.DataFrame(np.random.randn(10,4),index=pd.date_range('1/1/2000',periods=10),columns=list('ABCD'))df.
落世繁华·2023-12-20 04:27

Python机器学习基础（三）---数据预处理

一.数据预处理作用数据预处理会将选定的数据转换为我们可以使用的形式或可以提供给ML算法的形式，以使其符合机器学习算法的期望。二.数据处理的常用方法1.规范化数据规范化是使属性数据按比例缩放，这样就将原来的数值映射到一个新的特定区域中，包括归一化，标准化等。1.1.归一化1.1.1：概念把数据变成（0，1）或者（1，1）之间的小数。主要是为了数据处理方便提出来的，把数据映射到0～1范围之内处理，更加
落世繁华·2023-12-20 04:27

2021-01-26基因ID+TMP

基因ID总参考-医学生物信息学数据库常用：基因名称例如:TP53,RNF180。这样的名字，是这个基因功能+编号的简写。
小森的生统笔记·2023-12-20 00:15

《生物信息学生R入门教程》读书笔记 Chapter 1

前言最近在阅读欧剑虹老师《生物信息学生R入门教程》非常适合于刚入手NGS的初学者使用，这里我仅做我个人的读书笔记使用本书分为八个章节：1.R/Bioconductor简介2.基因芯片的数据分析3.RNA-seq
小潤澤·2023-12-19 19:08

支持向量机（SVM）：高效分类的强大工具

文章目录前言1.SVM的基本原理1.1核心思想1.2支持向量1.3最大化建模1.4松弛变量1.5核函数2.SVM与逻辑回归的区别和联系2.1区别2.2联系3.SVM的应用领域3.1图像分类3.2文本分类3.3生物信息学
_用户昵称_·2023-12-19 06:34

机器学习入门六（贝叶斯网络数据分类）

目前作者了解到了辛普森悖论，所以想找一个比较合适的方法做一下因果分析，于是找到了《Python机器学习算法与实战》这本书看了一眼里面的内容，偷学了一手贝叶斯网络书数据分类方法哈哈哈。
朱笨笨·2023-12-19 06:18

Python机器学习19——常用六种机器学习的异常值监测方法(孤立森林，数据支持描述，自编码器，高斯混合，DBSCAN，LOF)

案例背景异常值监测是机器学习的一个重要领域，博主以前做预测多，异常值监测涉及得少，但之后的工作可能需要做异常值方面的工作，所以大致总结了一下常用的机器学习来做异常值监测的方法以及代码。标题的这些机器学习方法基本都可以调包，使用sklearn库实现。不需要装很多包。(那些传统统计学的方法就不多介绍了，什么三西格玛(方差)准则，t检验，95%分位点啥的，那太简单了，本文主要介绍机器学习的方法。)方法思
阡之尘埃·2023-12-18 23:01

使用Yellowbrick绘制获取最佳聚类K值的示例

在本文中，我们将使用Yellowbrick这个强大的Python机器学习可视化工具来帮助我们选择最佳的聚类簇数。
后端工程架构·2023-12-18 07:16

生信步骤|转录组mRNA数据的有参组装

转录组的组装能够提供丰富的组学信息，是生物信息学中重要的基础步骤。测序的下机数据经过过滤，比对，排序，组装，最终得到转录本的全部序列信息。
学术程稻属·2023-12-18 03:56

数据分析大作业：使用Python机器学习相关算法对某地区房地产数据分析预测报告 完整代码+报告

定义挖掘目标：**1、**房价和哪些因素有关，在之后的中介推销中重点关注**2、**开发商该如何建造房屋才能让更多的客户来选择购买居住**3、**预估房屋价值，给房产中介提供合理的房价信息完整数据加代码：https://download.csdn.net/download/qq_38735017/87418814数据初步处理：%%matplotlibinlineimportpandasaspdim
计算机毕设论文·2023-12-18 02:32

Python数据科学视频讲解：Python集合

针对数据分析或机器学习推荐两本入门级的图书：《Python机器学习原理与算法实现》
数据科学作家·2023-12-17 15:34

Python数据科学视频讲解：Python字符串

针对数据分析或机器学习推荐两本入门级的图书：《Python机器学习原理与算法实现
数据科学作家·2023-12-17 15:34

Python数据科学视频讲解：Python字典

针对数据分析或机器学习推荐两本入门级的图书：《Python机器学习原理与算法实现》
数据科学作家·2023-12-17 15:04
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