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r语言逻辑回归
R语言
进行相关性分析
相关性分析相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析,从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性分析旨在研究两个或两个以上随机变量之间相互依存关系的方向和密切程度。一般来讲研究对象(样品或处理组)之间使用距离分析,而元素(物种或环境因子)之间进行相关性分析。两个变量之间的相关性可以用简单相关系数(例如皮尔森相关系数等)进行表示,相关系数越接近1,两个元素相关性越大,相关系数越接近0,两
Seurat_Satija
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2023-12-31 09:46
2020-03-30 线性时间序列案例学习—汽油价格
www.math.pku.edu.cn/teachers/lidf/course/fts/ftsnotes/html/_ftsnotes/fts-ltscases-gas.html这一章用三个实例来详细讲解如何用
R语言
和线性时间序列模型分析实际数据
程凉皮儿
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2023-12-31 09:45
pytorch01:概念、张量操作、线性回归与
逻辑回归
目录一、pytorch介绍1.1pytorch简介1.2发展历史1.3pytorch优点二、张量简介与创建2.1什么是张量?2.2Tensor与Variable2.3张量的创建2.3.1直接创建torch.tensor()2.3.2从numpy创建tensor2.4根据数值创建2.4.1torch.zeros()2.4.2torch.zeros_like()2.4.3torch.ones()和to
慕溪同学
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2023-12-31 09:22
Pytorch
线性回归
逻辑回归
算法
pytorch
深度学习
人工智能
R语言
【CoordinateCleaner】——cc_cen(): 移除或标记政治国家和省份的地理质心周围半径内的记录。生物数据库中地理参考较差的发生记录经常被错误地地理参考为质心。
PackageCoordinateCleanerversion2.0-20Parameterscc_cen(x,lon="decimallongitude",lat="decimallatitude",species="species",buffer=1000,geod=TRUE,test="both",ref=NULL,verify=FALSE,value="clean",verbose=TRU
ALittleHigh
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2023-12-31 00:17
#
r语言
数据库
开发语言
R语言
【base】——cat() 输出对象,连接表示法,其运行的转换比 print 少得多
Packagebaseversion4.3.2Parameterscat(...,file="",sep="",fill=FALSE,labels=NULL,append=FALSE)参数【...】:R对象。参数【file】:一个connection,或一个命名要打印到的文件的字符串。如果是""(默认值),cat会打印到标准输出连接,即控制台,除非被sink重定向。参数【sep】:字符串向量,用于
ALittleHigh
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2023-12-31 00:47
#
R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【CoordinateCleaner】——cc_zero(): 删除或标记经度或纬度为零的记录,以及经度和纬度为零的点周围的半径。这些问题通常是由于错误的数据输入或地理参考造成的
PackageCoordinateCleanerversion2.0-20Parameterscc_zero(x,lon="decimallongitude",lat="decimallatitude",buffer=0.5,value="clean",verbose=TRUE)参数【x】:data.frame。包含地理坐标和物种名称。参数【lon】:字符串。具有经度坐标的列。默认值=“decim
ALittleHigh
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2023-12-31 00:47
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r语言
开发语言
数据库
R语言
【CoordinateCleaner】——cc_cap(): 删除或标记国家/地区首都周围特定半径范围内的记录。生物数据库中地理参考性差的发生记录经常被错误地地理参考为首都。
PackageCoordinateCleanerversion2.0-20Parameterscc_cap(x,lon="decimallongitude",lat="decimallatitude",species="species",buffer=10000,geod=TRUE,ref=NULL,verify=FALSE,value="clean",verbose=TRUE)参数【x】:dat
ALittleHigh
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2023-12-31 00:47
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r语言
数据库
开发语言
R语言
【base】——使用library判断是否已经安装第三方软件包:library(package, logical.return=TRUE)
Packagebaseversion4.3.2Parameterslibrary(package,help,pos=2,lib.loc=NULL,character.only=FALSE,logical.return=FALSE,warn.conflicts,quietly=FALSE,verbose=getOption("verbose"),mask.ok,exclude,include.onl
ALittleHigh
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2023-12-31 00:46
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R语言【base】
r语言
开发语言
51-
R语言
机器学习:时间序列与因果关系
《精通机器学习:基于R第二版》学习笔记1、数据理解与数据准备使用的数据记录的是年度异常数据,它由某一年的年度地表温度中位数与参考年度(1961~1990)平均温度的差构成。>climatestr(climate)##'data.frame':95obs.of3variables:##$Year:int1919192019211922192319241925192619271928...##$CO2
wonphen
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2023-12-30 23:34
java大数据和javaee哪个好,java与大数据之间的关系
Sourcecodedownload:本文相关源码大数据是目前互联网流行的技术语言,处理大数据的编程语言比较有优势的也很多,比如java、python、go、
R语言
、Hadoop等等,按道理来说每种编程语言都可以处理大数据
chatgpt001
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2023-12-30 17:14
java
最优化方法Python计算:无约束优化应用——逻辑分类模型
逻辑回归
模型更多地用于如下例所示判断或分类场景。
戌崂石
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2023-12-30 16:08
最优化方法
python
分类
机器学习
最优化方法
代做MATH202-19S2作业、代写Java/c++课程设计作业、Python编程语言作业调试代写
R语言
编程|代做
R语言
编程
MATH202-19S2AssignmentA1Due—4pm,23AugustYourcompletedassignmentshouldbehandedinviatheMATH202boxinthereceptionareaonLevel4oftheErskinebuilding.Youmaydotheassignmentonyourown,orasapairwithoneotherstuden
fujianjia
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2023-12-30 15:07
R语言
【base】——merge(): 通过共同列名或行名合并两个数据帧
Packagebaseversion4.2.0Parametersmerge(x,y,...)##DefaultS3method:merge(x,y,...)##S3methodforclass'data.frame'merge(x,y,by=intersect(names(x),names(y)),by.x=by,by.y=by,all=FALSE,all.x=all,all.y=all,sor
ALittleHigh
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2023-12-30 15:38
#
R语言【base】
r语言
数据库
vue.js
回顾2023,自己做了啥呢 |
R语言
绘图
2023年总结2023年即将结束,我们即将迎来2024年。2023年,我们做了什么呢??这个是个值得深思的问题…?12月份是个快乐且痛苦时间节点。前一段时间,单位需要提交2023年工作总结,真的是憋了好久才可以下笔,但下笔后一直在沉思,再回想自己2023年到底做了什么呢?杂事做了很多,但没有成果。害!这就难办了,我们平时在开会时,你口述可以说,我做了这样,做了那样…等等。但是,在写工作总结时,可不
小杜的生信筆記
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2023-12-30 15:38
R语言精美图形绘制教程
r语言
R语言
开发语言
KEGG富集分析
生物信息学
组学
组学分析
2023教程发布最后一个教程 |
R语言
绘图汇总
2023年总结2023年即将结束,我们即将迎来2024年。2023年,我们做了什么呢??这个是个值得深思的问题…?12月份是个快乐且痛苦时间节点。前一段时间,单位需要提交2023年工作总结,真的是憋了好久才可以下笔,但下笔后一直在沉思,再回想自己2023年到底做了什么呢?杂事做了很多,但没有成果。害!这就难办了,我们平时在开会时,你口述可以说,我做了这样,做了那样…等等。但是,在写工作总结时,可不
小杜的生信筆記
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2023-12-30 15:37
R语言精美图形绘制教程
r语言
开发语言
KEGG
富集分析
KEGG富集
生物信息学
R语言
学习笔记:
R语言
基础
文章目录一、
R语言
简介二、选择R的原因三、R基本数据对象(一)向量(二)矩阵(三)数组(四)因子(五)列表(六)数据框(七)函数四、基本函数应用示例五、自定义函数(一)自定义函数定义(二)自定义函数示例
howard2005
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2023-12-30 13:43
R语言基础
学习
笔记
r语言
机器学习 ---
逻辑回归
第1关:
逻辑回归
核心思想#encoding=utf8importnumpyasnpdefsigmoid(t):'''完成sigmoid函数计算:paramt:负无穷到正无穷的实数:return:转换后的概率值
*Crystal
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2023-12-30 10:46
机器学习
逻辑回归
人工智能
r语言
独立性检验
卡方检验>library(vcd)>mytablechisq.test(mytable)Pearson'sChi-squaredtestdata:mytableX-squared=13.055,df=2,p-value=0.001463#由上述的内容可以看出:本次检验治疗和改善之后的效果是否与原有的效果显著,由于p=0.001,小于显著性水平,拒绝原假设,接受对立假设,效果是显著的。>mytabl
肖玉贤
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2023-12-30 03:31
R语言
ggplot2画右三角方块热图的简单小例子
还是这幅图image.png本来以为今天的推文可以重复出来的,但还是高估自己了,实现过程遇到了问题,暂时还不知道如何解决,后面想到办法再来介绍吧!今天的推文先介绍右上角的方块热图实现办法吧!首先是方块四周的灰色边框这里使用到的是geom_tile()函数。把填充设置为白色,然后把边框线设置为灰色就可以达成这种效果下面是一个简单小例子示例数据image.png代码library(readxl)df5
小明的数据分析笔记本
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2023-12-30 02:26
R语言
| 缺失值判断
缺失值判断一、缺失值判断通常用“NA"表示,判断数据是否存在缺失值的常用方法使用函数is.na()使用函数is.na(),该函数是判断缺失值的最基本的函数。可以用于判断不同的数据对象,如向量、列表和数据框.其函数的基本书写格式为:is.na(x)判断数据集中是否存在缺失值,如果存在,返回TRUE;如果不存在,则返回FALSE例:>library(DMwR)>data("algae")>sum(is
mint1104
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2023-12-29 19:01
R语言
数据分析
数据挖掘
r语言
R语言
:缺失值处理
前言 一个完整的处理方法通常包含以下几个步骤: (1)识别缺失数据; (2)检查导致数据缺失的原因; (3)删除包含缺失值的实例或用合理的数值代替(插补)缺失值。 但遗憾的是,仅有识别缺失数据是最清晰明确的步骤。知道数据为何缺失依赖于你对数据生成过程的理解,而决定如何处理缺失值则需要判断哪种方法的结果最为可靠和精确。 统计学家通常将缺失数据分为三类。它们都用概率术语进行描述,但思想都非
猪逻辑公园
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2023-12-29 19:31
R语言
R语言
arabic2kansuji包,将阿拉伯数字转换为汉字数字。
WeChatScreenshot_20210109104046.png#SatJan0910:36:192021-#字符编码:UTF-8#R版本:Rx644.0.3forwindow10#
[email protected]
#个人笔记不负责任#——拎了个梨.rs.restartR()require(arabic2kansuji)rm(list=ls());gc()arabic2kansuji(2
youmigo
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2023-12-29 17:17
R语言
【base】——sprintf():接受格式化文本和变量值来搭建字符型向量。
Packagebaseversion4.2.0Parameterssprintf(fmt,...)gettextf(fmt,...,domain=NULL,trim=TRUE)参数【fmt】:格式字符串的字符向量,每个字符串最多8192个字节。参数【...】:要传递给参数【fmt】的值。仅支持逻辑向量、整数向量、实数向量和字符向量,但会进行一些强制。最多100。参数【trim,domain】:参见
ALittleHigh
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2023-12-29 16:21
#
R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【base】——names():用于获取或设置对象名称的函数
Packagebaseversion4.2.0Parametersnames(x)names(x)<-value参数【x】:一个R对象。参数【value】:与参数【x】长度相同的字符向量,或者NULL。Detailsnames是一个通用访问函数,而names<-是一个通用替换函数。默认方法用于获取和设置向量(包括列表)或配对表的"names"属性。对于环境env,names(env)会给出相应列表
ALittleHigh
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2023-12-29 16:21
#
R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【base】——读取或设置类矩阵对象的行或列名:rownames() 和 colnames()
Packagebaseversion4.3.2Parametersrownames(x,do.NULL=TRUE,prefix="row")rownames(x)<-valuecolnames(x,do.NULL=TRUE,prefix="col")colnames(x)<-value参数【x】:一个类似矩阵的R对象,colnames至少有两个维度。参数【do.NULL】:逻辑。如果为FALSE且
ALittleHigh
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2023-12-29 16:51
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R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【stats】——处理R对象中的缺省值:na.fail(), na.omit(), na.exclude(), na.pass()
Packagestatsversion4.3.2Parametersna.fail(object,...)na.omit(object,...)na.exclude(object,...)na.pass(object,...)参数【object】:R对象,通常是一个数据帧。参数【...】:特殊方法可能需要的其他参数。目前,它们只能处理向量、矩阵以及由向量和矩阵组成的数据帧。如果na.omit删除了
ALittleHigh
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2023-12-29 16:51
R语言
r语言
开发语言
R语言
【base】——which():给出逻辑对象的 TRUE 索引,允许使用数组索引。
Packagebaseversion4.2.0Parameterswhich(x,arr.ind=FALSE,useNames=TRUE)arrayInd(ind,.dim,.dimnames=NULL,useNames=FALSE)参数【x】:逻辑向量或数组。允许省略NA(视作FALSE)。参数【arr.ind】:逻辑;当参数【x】是一个数组时,是否应返回数组索引?除了单个真值外,其他任何值都会
ALittleHigh
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2023-12-29 16:51
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R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【base】——dir.exists()和dir.create()目录和文件权限的操作
Packagebaseversion4.3.2Parametersdir.exists(paths)dir.create(path,showWarnings=TRUE,recursive=FALSE,mode="0777")Sys.chmod(paths,mode="0777",use_umask=TRUE)Sys.umask(mode=NA)参数【path】:是一个字符向量,包含一个路径名。参数
ALittleHigh
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2023-12-29 16:20
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R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【rgbif】——name_backbone()和name_backbone_verbose()在 GBIF 分类树中查找名称。
Packagergbifversion3.7.8Parametersname_backbone(name,rank=NULL,kingdom=NULL,phylum=NULL,class=NULL,order=NULL,family=NULL,genus=NULL,strict=FALSE,verbose=FALSE,start=NULL,limit=100,curlopts=list())nam
ALittleHigh
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2023-12-29 16:20
#
rgbif
r语言
人工智能
R语言
【base】——file.path() 构建文件路径
Packagebaseversion4.3.2Parametersfile.path(...,fsep=.Platform$file.sep)参数【...】:字符矢量。不支持长向量。参数【fsep】:要使用的路径分隔符(假定为ASCII)。由于该函数在R中被广泛使用,因此其实现设计得非常快(比paste更快)。它也可用于PATH和R_LIBS等环境路径,使用fsep=.Platform$path.
ALittleHigh
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2023-12-29 16:20
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R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
【base】——将单个 R 对象写入文件并将其还原的函数:saveRDS(),readRDS() 和 infoRDS()
Packagebaseversion4.3.2ParameterssaveRDS(object,file="",ascii=FALSE,version=NULL,compress=TRUE,refhook=NULL)readRDS(file,refhook=NULL)infoRDS(file)参数【object】:要序列化的R对象。参数【file】:连接或R对象保存或读取的文件名。参数【ascii
ALittleHigh
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2023-12-29 16:20
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R语言【base】
r语言
开发语言
R语言
整洁编码的12大原则
对于
R语言
新手,也建议大家规范编码。刚开始可能不习惯,但如果坚持练习,很快就能适应并成为你的第二天性,看着不规范的代码就难受,代码完美主义技能get。本文我们就来学习一下
R语言
整洁编码的12大原则。
简说基因-专业生信合作伙伴
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2023-12-29 16:50
r语言
开发语言
R语言
【base】——字符转换和大小写:chartr(),tolower(),toupper(), casefold()
Packagebaseversion4.3.2Parameterschartr(old,new,x)tolower(x)toupper(x)casefold(x,upper=FALSE)参数【x】:字符向量,或可通过as.character强制转换为字符的对象。参数【old】:字符串,指定要转换的字符。如果提供的字符向量长度为2或更长,则使用第一个元素并发出警告。参数【new】:指定转换的字符串。
ALittleHigh
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2023-12-29 15:13
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R语言【base】
r语言
开发语言
最优化方法Python计算:无约束优化应用——
逻辑回归
模型
S型函数sigmoid(x)=11+e−x\text{sigmoid}(x)=\frac{1}{1+e^{-x}}sigmoid(x)=1+e−x1将全体实数R\text{R}R映射到(0,1)(0,1)(0,1),称为逻辑函数。其图像为该函数连续、有界、单调、可微,性质量好。拟合函数为F(w;x)=sigmoid((x⊤,1)w)=11+e−(x⊤,1)wF(\boldsymbol{w};\bo
戌崂石
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2023-12-29 12:43
最优化方法
python
逻辑回归
机器学习
最优化方法
R语言
学习笔记-R包的安装
推荐在线安装,可以解决包与包之间的依赖关系。1.首先在RGui:2.在RStudio的console下:如安装ggplot2包,则:install.packages("ggplot2")生信方面:首先安装:install.packages("BiocManager")则就可以这样安装ggplot2包:BiocManager::install("ggplot2")
生信研究猿
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2023-12-29 10:12
R语言课程笔记
学习
100天搞定机器学习|Day16 通过内核技巧实现SVM
前情回顾机器学习100天|Day1数据预处理100天搞定机器学习|Day2简单线性回归分析100天搞定机器学习|Day3多元线性回归100天搞定机器学习|Day4-6
逻辑回归
100天搞定机器学习|Day7K-NN100
统计学家
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2023-12-29 02:09
进击的机器学习 Fifth Day——
逻辑回归
(Logistic Regression)
提到
逻辑回归
呢?我一下子就想起了我批判性思维的老师晋逻辑。
焜俞
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2023-12-29 01:34
模型调参
模型调参模型调参的具体操作1.学习目标2.模型对比与性能2.1
逻辑回归
2.2决策树模型2.3集成模型集成方法(ensemblemethod)2.4模型评估方法3.模型调参的三种方法3.1贪心算法3.2网格调参
alstonlou
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2023-12-28 23:43
数据挖掘
2019-04-19 R读取csv文件 绘制散点和密度图代码
原csv文件部分截图:字段名
R语言
绘图首先需要加载包install.package(ggplot2)#如果已经下载就不用install.packageinstall.package(reshape2)#
今年二圆可以到一百吗
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2023-12-28 18:27
机器学习系列--
R语言
随机森林进行生存分析(1)
随机森林(Breiman2001a)(RF)是一种非参数统计方法,需要没有关于响应的协变关系的分布假设。RF是一种强大的、非线性的技术,通过拟合一组树来稳定预测精度模型估计。随机生存森林(RSF)(Ishwaran和Kogalur,2007;Ishwaraan,Kogalur、Blackstone和Lauer(2008)是Breimans射频技术的延伸从而降低了对时间到事件数据的有效非参数分析。R
天桥下的卖艺者
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2023-12-28 16:59
R语言
机器学习
机器学习
r语言
随机森林
R语言
机器学习与临床预测模型36--随机森林Random Forest
本内容为【科研私家菜】
R语言
机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍
R语言
机器学习与预测模型的学习笔记你想要的
R语言
学习资料都在这里,快来收藏关注【科研私家菜】01什么是随机森林?
科研私家菜
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2023-12-28 15:21
最大似然估计和最大后验概率估计的区别
今天在看
逻辑回归
算法的时候,对其原理有点困惑,便去晚上找了找前辈的博客。
逻辑回归
算法是基于最大似然估计的。最大似然估计是概率论里的知识。然后就找到了这一篇帖子,前前后后看了两遍,终于明白了。
糖醋排骨盐酥鸡
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2023-12-28 10:27
R语言
|ggtreeExtra包绘制进化树
R包-ggtreeExtra绘制进化树ggplot2提供的geom_tile图层可以画热图了,ggplot2的geom_point或者ggstar的geom_star可以绘制点图层。为了扩展ggtree在点和布局中的系统发育树的外环上呈现相关数据,开发的ggtreeExtra包提供了一个函数,geom_fruit用于将图形与树对齐,相关图表将在树的外部面板的不同位置对齐。还开发geom_fruit
维凡生物
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2023-12-28 10:47
【
R语言
科研绘图】--- 柱状图
R语言
科研绘图——柱状图柱状图
R语言
科研绘图——柱状图前言一、柱状图二、使用工具1.所使用的包2.数据特征3.绘图3.1两组均值之间的比较3.2多组均值之间的比较后记前言使用
R语言
绘制能够发表的图片,ggplot2
生信小鹏
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2023-12-28 09:12
科研绘图
R
for
Data
Science
r语言
【
R语言
科研绘图】——韦恩图
构建数据set.seed(20190708)genes<-paste("gene",1:1000,sep="")x<-list(A=sample(genes,300),B=sample(genes,525),C=sample(genes,440),D=sample(genes,350))使用ggVennDiagram绘制韦恩图比较经典的韦恩图是使用venndiagram作图,但是缺点是不能使用pd
生信小鹏
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2023-12-28 09:12
科研绘图
数据挖掘
r语言
数据分析
R语言
机器学习与临床预测模型25--净重新分类指数
本内容为【科研私家菜】
R语言
机器学习与临床预测模型系列课程R小盐准备介绍
R语言
机器学习与预测模型的学习笔记你想要的
R语言
学习资料都在这里,快来收藏关注【科研私家菜】01什么是净重新分类指数NRI?
科研私家菜
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2023-12-28 09:42
R语言
4.3.0安装及使用教程(非常详细),从零基础入门到精通,看完这一篇就够了(附安装包))
一、软件下载软件:
R语言
版本:4.3.0语言:简体中文大小:77.74M安装环境:Win7及以上版本,64位操作系统硬件要求:
[email protected]
内存@4G(或更高)下载通道①百度网盘丨64位下载链接:
教IT的无语强
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2023-12-28 06:29
r语言
开发语言
看书标记【
R语言
数据分析项目精解:理论、方法、实战 2】
看书标记——关于
R语言
chapter2
R语言
基础2.1安装
R语言
2.2
R语言
基本对象2.2.2向量【
R语言
数据分析项目精解:理论、方法、实战】chapter2
R语言
基础
R语言
用高深的理论作为支撑、用简捷的语法作为工具
小胡涂记
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2023-12-28 06:28
r语言
数据分析
开发语言
1.
R语言
基础知识
目录一、
R语言
的介绍
R语言
的下载与按照RstudioR包的安装工作空间管理基本运算二、R的数据结构1.数据类型2.数据类型的转换和判断3.数据结构三、导入/导出数据获取内置数据集获取其他格式的数据四、数据框的常用操作
Dr_long1996
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2023-12-28 06:58
R语言
临床统计分析
r语言
R语言
入门与数据分析(1)
①Ctrl+Shift+c注释当前行,选中后再使用会注释选中区域,两次则会取消单行注释②Alt±赋值号③Ctrl+L刷新控制台(清空屏幕)④仅支持单行注释#1.显示当前工作路径>getwd()[1]"C:/Users/sxl/Documents"2.改变当前工作路径>setwd(dir="c:/Users/sxl/Desktop/R")3.查看目录下包含的文件(两者功能一样)>list.files
瓴翎玲
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2023-12-28 06:58
R语言
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