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r语言kmeans聚类
R可视化——Mantel test分析及可视化
此前我们已经讲过了如何使用
R语言
计算两列数据相关性的分析方法,今天,我们来看一种检验两个矩阵相关关系的方法——Manteltest方法,这种分析方法可用在植物微生物群落与生态环境之间相关性的检验以及人体肠道微生物群落与人体疾病相关性检验等领域
科研那点事儿
·
2023-12-18 02:29
R语言
文本分析《三国演义》
数据读取与包的加载由于最近对文本分析比较感兴趣,所以分析三国演义的文本。getwd()setwd("E:\\三国")library(jiebaR)library(ggplot2)library(jpeg)library(reshape2)library(wordcloud)读取前十行>sanguosanguo[1:10]#展现数据前十行[1]"三国演义明?罗贯中"[2]"致读者"[3]"“大江东去
乔巴爱雪雪
·
2023-12-18 01:31
R语言
R
文本分析
词频统计
[原创][
R语言
]股票分析实战[2]:周级别涨幅趋势的相关性
[简介]常用网名:猪头三出生日期:1981.XX.XXQQ联系:643439947个人网站:80x86汇编小站https://www.x86asm.org编程生涯:2001年~至今[共22年]职业生涯:20年开发语言:C/C++、80x86ASM、PHP、Perl、Objective-C、ObjectPascal、C#、Python开发工具:VisualStudio、Delphi、XCode、Ec
我不是代码教父
·
2023-12-18 01:49
#
R语言大数据分析
r语言
股票
大数据
数据挖掘
提升
R语言
分析效率:如何精准定位CRAN中你想要的高质量R包?
对于数据科学家和
R语言
爱好者来说,寻找合适的R包以满足特定需求是一项重要但往往令人困惑的任务。
R语言数据分析视界
·
2023-12-18 00:19
r语言
开发语言
KMeans
聚类
算法
KMeans
KMeans
是一种无监督学习
聚类
方法,目的是发现数据中数据对象之间的关系,将数据进行分组,组内的相似性越大,组间的差别越大,则
聚类
效果越好。
七八音
·
2023-12-17 23:47
学习小组Day5笔记--没有眼镜
R的数据结构向量&数据框
R语言
数据结构.png使用数据框中的变量作图options(stringsAsFactors=T)a<-data.frame(case=paste0("S",1:9),values
没有眼镜
·
2023-12-17 23:15
R语言
_ifelse()函数用法
ifelse()函数Usageifelse(test,yes,no)ifelsereturnsavaluewiththesameshapeastestwhichisfilledwithelementsselectedfromeitheryesornodependingonwhethertheelementoftestisTRUEorFALSE.如果test成立,执行yes,否则执行no,可以对数据
谢俊飞
·
2023-12-17 21:46
机器学习笔记
classification离散型数据常用算法:Knn,朴素贝叶斯,svm,决策树与随机森林,逻辑回归2.1.2回归regression连续型数据常用算法:线性回归,岭回归2.2非监督学习数据集无标签常用算法:
聚类
偏偏偏执先生
·
2023-12-17 17:40
灰色
聚类
模型
一、灰色关联
聚类
模型(指标
聚类
)灰色
聚类
也叫“灰色绝对关联
聚类
”,是基于指标间两两形成的灰色关联度的一种
聚类
方法。通过灰色关联矩阵将一些观测指标或观测对象聚集成若干个可以定义类别的方法。
一学就废的小张
·
2023-12-17 16:58
数学建模
数学建模
Python点云处理(八)点云
聚类
算法(下)
目录0简述1Mean-Shift
聚类
算法2Agglomerative
聚类
算法3Spectral
聚类
算法4结语0简述本篇为点云
聚类
算法下篇,上一篇中实现了DBSCAN
聚类
算法、K-means
聚类
算法、OPTICS
Auto工程师
·
2023-12-17 16:24
Python点云处理
算法
python
聚类
3d
不同分布的QQ图绘制
研究动机在
R语言
中常用qqnorm()绘制QQ图的散点图,qqline()用于在图上添加一条参考直线。
庄闪闪
·
2023-12-17 16:08
R数据科学
r语言
2020-07-01 大型吃书现场之NEwR(001)
答:NEwR:NumericalEcologywithR(数量生态学——
R语言
的应用)然后解释一下,为什么叫大型吃书现场?
SmallJam
·
2023-12-17 16:22
R语言
|分面中嵌入趋势线
简介关于分面的推文,小编根据实际科研需求,已经分享了很多技巧。例如:分面中添加不同表格分面中添加不同的直线基于分面的面积图绘制分面中的细节调整汇总基于分面的折线图绘制最近科研中又遇到了与分面相关的需求:在分面中添加拟合线。本期就针对该问题,绘制出以下图形:图形含义:随着时间的推移,展示多个测试产品退化累积量的箱线图。这些产品涵盖了两种不同的退化性能(PC)。图中的红线表示通过提出的模型拟合得到的平
庄闪闪
·
2023-12-17 16:07
r语言
开发语言
代做COMP0037、代做Planning Algorithms、Python编程语言代写、代写Python代写
R语言
程序|代做数据库S
COMP0037Coursework1Term2,2019“PathPlanninginaKnownWorld”InvestigatingPathPlanningAlgorithmsCOMP0037Assignment1SimonJulier(
[email protected]
),DanButters(
[email protected]
),JuliusSustarevas(j
longwanggua
·
2023-12-17 15:02
【
R语言
】R package -- ggpubr
ggpubrggpubr专门为学术期刊绘图而生,据说是能画出editor最喜欢看的图。1.安装和加载由于这个包放在cran上,所以安装也方便,直接install.packages().install.packages("ggpubr")library("ggpubr")2.绘图示例GeneexpressiondataBoxplotsViolinplotsStripchartsanddotplots
巩翔宇Ibrahimovic
·
2023-12-17 15:15
OSCA单细胞数据分析笔记-9、Clustering
从一步开始,就可以开始叙述我们的生物学故事了~源网,侵删~笔记要点1、clustering是一个显微镜2、基于图
聚类
的分群3、其它分群算法(k均
小贝学生信
·
2023-12-17 13:12
机器学习---数字
聚类
案例
1、K-means找中心点和数据点分类例子importnumpyasnpdefloadDataSet(fileName):dataMat=[]fr=open(fileName)forlineinfr.readlines():curLine=line.strip().split('\t')fltLine=map(float,curLine)dataMat.append(fltLine)returnd
30岁老阿姨
·
2023-12-17 12:32
机器学习
机器学习
聚类
人工智能
python--seaborn散点图
seaborn是专门用于统计数据可视化的包,可媲美
R语言
中的ggplot2包。本文介绍用seaborn绘制散点图。
FTDdata
·
2023-12-17 12:27
scitb包1.6版本发布,一个为制作专业统计表格而生的R包
目前,本人写的scitb包1.6版本已经正式在
R语言
官方CRAN上线,scitb包是一个为生成专业化统计表格而生的R包。
天桥下的卖艺者
·
2023-12-17 11:27
R语言
我写的R包
r语言
基线表
表一
R语言
对医学中的自然语言(NLP)进行机器学习处理(1)
什么是自然语言(NLP),就是网络中的一些书面文本。对于医疗方面,例如医疗记录、病人反馈、医生业绩评估和社交媒体评论,可以成为帮助临床决策和提高质量的丰富数据来源。如互联网上有基于文本的数据(例如,对医疗保健提供者的社交媒体评论),这些数据我们可以直接下载,有些可以通过爬虫抓取。例如:在病人论坛上发表对疾病或药物的评论,可以将它们存储在数据库中,然后进行分析。在这个之前需要了解什么是情绪分析,情绪
天桥下的卖艺者
·
2023-12-17 11:53
R语言
r语言
自然语言处理
机器学习
跟着Nature Communications学作图:
R语言
ggplot2画图展示捐赠者的临床概况
论文Commonanti-cancertherapiesinducesomaticmutationsinstemcellsofhealthytissuehttps://www.nature.com/articles/s41467-022-33663-5#Sec18今天的推文我们重复一下论文中的Figure1a,看起来非常像一个表格,很有意思image.png我们使用ggplot2来实现,主要分为三
小明的数据分析笔记本
·
2023-12-17 09:19
机器学习之无监督学习
聚类
:发掘纵向结构的某种模式信息,某些x属于相同的分布或者类别特征学习:发掘横向结构的某种模式信息,每一行都可以看成是一种属性或特征密度估计:发掘底层数据分布,x都是从某个未知分布p(x)采出来的,p(
__如果
·
2023-12-17 09:26
机器学习
学习
人工智能
文本
聚类
——文本相似度(
聚类
算法基本概念)
一、文本相似度1.度量指标:两个文本对象之间的相似度两个文本集合之间的相似度文本对象与集合之间的相似度2.样本间的相似度基于距离的度量:欧氏距离曼哈顿距离切比雪夫距离闵可夫斯基距离马氏距离杰卡德距离基于夹角余弦的度量公式:当文本进行了2-范数归一化,余弦相似度与内积相似度是等价的。距离度量衡量的是空间各个点的绝对距离,与各点的位置(即个体特征维度的数值)直接相关,而余弦相似度衡量的事空间向量的夹角
星宇星静
·
2023-12-17 08:18
笔记
聚类
机器学习
算法
相似度
笔记
论文笔记
R语言
根据列名提取/筛选列的两种方法
R语言
根据列名提取/筛选列的两种方法在
R语言
中,我们经常需要根据列名来提取或筛选数据框中的列。本文将介绍两种常用的方法来实现这个目标。
翠绿山川间探索冒险
·
2023-12-17 08:05
r语言
数据库
开发语言
R语言
数据筛选:使用
R语言
进行数据筛选
数据筛选:使用
R语言
进行数据筛选在数据分析和处理中,数据筛选是一项重要的任务。
R语言
是一种功能强大的编程语言和环境,它提供了各种方法和函数来处理和筛选数据。
翠绿山川间探索冒险
·
2023-12-17 08:05
r语言
python
开发语言
R语言
R语言
教程
Day1(2020.9.12)1.向量赋值X13运行结果[1]TRUE5==3运行结果[1]FALSEsqrt(2)^2==2L运行结果[1]FALSEsqrt(2)^2-2L运行结果[1]4.440892e-16注:数据类型不同,导致不能划等号4.随机取数,比较大小,求平均数x10y运行结果[1]TRUEFALSEFALSEFALSETRUETRUETRUETRUEFALSEFALSEFALSE
kaobiguo
·
2023-12-17 07:47
使用
R语言
导入数据
使用
R语言
导入数据在
R语言
中,导入数据是进行数据分析和处理的第一步。R提供了多种方法来导入不同格式的数据,包括文本文件、Excel文件、数据库等。下面将介绍几种常见的导入数据的方法。
程序梦想征途
·
2023-12-17 07:19
r语言
开发语言
R语言
R语言
学习之GO富集分析结果可视化(柱状图、网络图)
读取genesymbollibrary(clusterProfiler)library(org.Hs.eg.db)input<-read.table("gene.csv",sep=",",header=T)把symbol转换为ENTREZIDgenetransform<-bitr(input$target,fromType="SYMBOL",toType=c("ENSEMBL","ENTREZID
佐博伊森
·
2023-12-17 07:19
学习小组Day1笔记--林枫
R语言
的集成开发环境(R的衣服)特点:友好的图形界面优秀的学习环境免费的科研工具开源1.Rstudio的正确打开方式创建Project(文件.Rproj存在目录为工作目录)打开"Rstudio"->File
致年
·
2023-12-17 06:36
K-Means
聚类
图像
使用K-Means
聚类
图像像素颜色importcv2importnumpyasnpfromsklearn.clusterimport
KMeans
importmatplotlib.pyplotaspltdef
kmeans
_image_clustering
赢勾喜欢海
·
2023-12-17 06:53
kmeans
聚类
算法
聚类
分析实例
目录层次
聚类
概述自底向上的合并算法相似度计算实例分别计算欧式距离值(矩阵)两个组合数据点间的距离层次
聚类
实例K-MEANS算法基本概念工作流程K-Means算法实例K值对结果的影响DBSCAN算法算法步骤基本步骤工作流程参数选择层次
聚类
概述层次
聚类
llovew.
·
2023-12-17 06:45
机器学习
算法
机器学习
人工智能
聚类
python
数据挖掘
R语言
绘制三元图、RGB颜色空间图
本文介绍基于
R语言
中的Ternary包,绘制三元图(TernaryPlot)的详细方法;其中,我们就以RGB三色分布图为例来具体介绍。
疯狂学习GIS
·
2023-12-17 05:02
Python实现
Kmeans
文本
聚类
接着我们要通过对每句话进行分词转向量,最后使用
kmeans
进行
聚类
并输出结果。二、代码2.1、加载停用词在stop_words目录下有多个停用词表,需要循环加总所有停用词。defdefined_sto
zkkkkkkkkkkkkk
·
2023-12-17 04:08
python
机器学习
聚类
数据挖掘
基于K-Means的图片
聚类
算法实战
因此,需要一个算法对图片进行自动化分类并保存,也就是本文的《基于K-Means的图片
聚类
算法实战》。
CV-deeplearning
·
2023-12-17 03:32
机器学习
算法
kmeans
聚类
模糊C均值
聚类
简述
模糊C均值
聚类
简述By:YangLiu1.什么是模糊C均值
聚类
模糊c-均值
聚类
算法fuzzyc-meansalgorithm(FCMA)或称(FCM)。
vendetta_gg
·
2023-12-17 02:19
聚类算法
算法
机器学习
聚类
模糊C均值
聚类
算法
学习了一下模糊
聚类
中的模糊C均值
聚类
算法(FuzzyC-MeansClustering)。 Fuzzy意为模糊,其中包括几种模糊的方式,这里使用的是最简单的方式,它是基于概率的概念。
蓝子娃娃
·
2023-12-17 02:47
机器学习
算法
机器学习
fuzzy clustering(模糊(C_均值)
聚类
)
目录概述隶属度矩阵模糊
聚类
算法步骤概述k-means属于一种硬
聚类
的方法,也就是说一个样本属于哪个类了后,他就是哪个类别的了,非此即彼;模糊
聚类
意味着样本不再是刚性的属于某一类别了,而是给出其属于各个类别的概率
身影王座
·
2023-12-17 02:47
算法
聚类
机器学习
算法
用通俗易懂的方式讲解:关键词提取方法总结及实现
文章目录一、关键词提取概述二、TF-IDF关键词提取算法及实现三、TextRank关键词提取算法实现四、LDA主题模型关键词提取算法及实现五、Word2Vec词
聚类
的关键词提取算法及实现六、信息增益关键词提取算法及实现七
深度学习算法与自然语言处理
·
2023-12-17 02:07
机器学习
人工智能
python
模糊C均值
聚类
(Fuzzy C-means)算法(FCM)
https://github.com/helloWorldchn/MachineLearning一、FCM算法简介1、模糊集理论L.A.Zadeh在1965年最早提出模糊集理论,在该理论中,针对传统的硬
聚类
算法其隶属度值非
helloWorldZMY
·
2023-12-17 02:06
机器学习
聚类
python
数据分析
Hi-C辅助组装问题盘点
angelicaHi-C辅助组装技术是通过捕获染色体DNA的交互关系,根据染色体内部互作频率显著高于染色体间互作频率,同时,在同一条染色体上互作频率随着互作距离的增加而减少的原理,将Contig或者Scaffold
聚类
到组群
生信阿拉丁
·
2023-12-17 00:17
安装SingleR之前,先看看它的数据库里有没有你要的细胞
singleR这个R包,还有它配套的celldex数据库,安装真的好麻烦啊为了安装它,把我的的R升到了最新版,结果更新又很麻烦……好不容易安上了这个包,发现自动注释出来的结果跟我
聚类
出来的图一对比,不能说是一模一样吧
小鱼同学的踩坑记录
·
2023-12-16 22:28
【
R语言
入门与数据分析-3】 数据转换
使用过程中发现自己的
R语言
基础太差了,回头补课。P34-P40所学视频:https://www.bilibili.com/video/BV19x411X7C6?
森尼啊
·
2023-12-16 21:03
R语言
中的table函数:统计数据频数并生成表格
R语言
中的table函数:统计数据频数并生成表格在
R语言
中,table函数是一个非常有用的函数,它可以用来统计数据的频数并生成相应的表格。它接受一个或多个向量作为输入,并返回一个包含数据频数的表格。
安静漫游
·
2023-12-16 21:37
r语言
开发语言
R语言
R语言
如何对每一行求和
最近遇到的小问题,需要对每一行的特定列求和文件实例df%column_to_rownames(.,var="sample")对value1到value3求和,求和的方法非常多,这里使用mutate(增加新列)rowSum(求和)来自dyplrdf%>%column_to_rownames(.,var="sample")%>%mutate(rowsum=rowSums(.[1:4]))有时候给个变量
土豆西红柿青椒
·
2023-12-16 21:03
生物信息
R语言
去掉NA求均值
数据里面有很多NA,去掉NA再对每列求均值怎么求呢?这里用到的是dyplr包a% summarise(mean_mpg=mean(a,na.rm=T),mean_b=mean(b,na.rm=T),mean_d=mean(d,na.rm=T))>aabd111NA22313NA424353这里得到每个变量去掉NA之后的均值。
土豆西红柿青椒
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2023-12-16 21:03
生物信息
R语言
piecewiseSEM结构方程模型在生态环境领域实践技术应用
在
R语言
结构方程程序包中,piecewiseSEM语法简洁,将结构方程模型拆分为多个组分(component)模型进行拟合和评估
梦想的初衷~
·
2023-12-16 19:37
生态
环境
r语言
开发语言
R语言
生物群落(生态)数据统计分析与绘图实践技术应用
R语言
作的开源、自由、免费等特点使其广泛应用于生物群落数据统计分析。生物群落数据多样而复杂,涉及众多统计分析方法。
梦想的初衷~
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2023-12-16 19:35
生态
r语言
开发语言
聚类
算法模型的概念、评估及应用
聚类
是一种无监督学习方法,其目标是将数据集中的样本分成不同的组别,使得同一组内的样本相似度较高,而不同组之间的样本相似度较低。
聚类
算法模型通常通过计算样本之间的相似度或距离来实现这一目标。
rubyw
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2023-12-16 19:09
#
概念和理论
算法
聚类
kmeans
我的数据仓库与数据挖掘期末大作业重置版
JupyterNotebook的预设定调整MatPlotLib和Pandas的输出设置任务1:预测问题数据的保存和读取数据的分析和预处理模型的选择和构建线性回归一元多项式回归拟合预测拟合优度的评估任务2:
聚类
分析问题数据的保存和读取数据的分析和预处理
聚类
的实现
聚类
结果有效性评估任务
BOXonline1396529
·
2023-12-16 17:05
数据仓库
数据挖掘
课程设计
R语言
学习笔记_02
字符串操作主要介绍R基础函数以及stringr包中对应函数paste,paste0连接两个字符串,其中paste0的默认分隔符是"";在stringr中使用str_c(collapse=)指定分隔符合并字符串。#需要注意一般配合管道函数%>%使用,只需要指定collapse参数(str_c)或sep(paste)即可paste('abc','def',sep='')#等同于paste0('abc'
nnlrl
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2023-12-16 16:21
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