sra数据转换fasta

ArcGIS pro与SuperMap根据属性自动填充颜色步骤

GIS项目经常会接触到控规CAD数据，想要把数据转换成GIS图层并发布，需要进行专题配图。研究了一下ArcGISpro和SuperMapiDesktop的配图，整理一下用到的一些技术思路。
THEDEAMON·2023-12-15 19:30

windows下SRA Toolkit下载原始数据

打脸时刻来了~~~~之前在Linux下用SRAToolkit下载数据效果不好，所以，果断的将它拉入了黑名单。但是最近下载数据，用windows版本的SRAToolkit，啊~真香~~1、下载image.png然后解压缩。2、安装D:\1系统软件安装包\sratoolkit.2.11.0-win64\bin\vdb-config--interactive会出现以下界面，有点懵逼。image.png但
谢京合·2023-12-15 17:00

迅速理解什么是通信前置机

前置机的作用：隔离——隔离客户端与服务端，保障后端安全减负——处理非核心业务，分担后端服务器压力，缓存数据转换——不同数据格式之间的转换，传递数据
小菜的成长之路·2023-12-15 17:54

使用Flink完成流数据统计 | 京东云技术团队

一、统计流程所有流计算统计的流程都是：1、接入数据源2、进行多次数据转换操作(过滤、拆分、聚合计算等)3、计算结果的存储其中数据源可以是多个、数据转换的节点处理完数据可以发送到一个和多个下一个节点继续处理数据
京东云开发者·2023-12-15 16:02

机器学习中的 Transformation Pipelines（Machine Learning 研习之十）

TransformationPipelines有许多数据转换步骤需要以正确的顺序执行。幸运的是，Scikit-Learn提供了Pipeline类来帮助处理这样的转换序列。
甄齐才·2023-12-15 13:21

(启程)西门子PLC模拟量线性变换子程序的编写

在西门子300PLC编程中，系统自带的两个线性变换功能块FC105和FC106是最常用的两个数据转换模块。
启程自动化熊老师·2023-12-15 09:27

提升数据分析效率：Amazon S3 Express One Zone数据湖实战教程

实现概述技术架构组件实现步骤概览第一步：构建数据湖的基础第二步：选择并查看数据集第三步：在Athena中搭建架构第四步：数据转换与优化第五步：查询和验证数据第六步：将更多数据添加到表第七步：性能和成本效益分析体会结语附录提升数据分析效率
AI_Maynor·2023-12-15 08:43

BWT算法

BWT（Burrows-WheelerTransform）算法是一种数据转换算法，它将一个字符串中的相似字符放在相邻的位置，以便于后续的压缩2、BWT编码目的：BWT编码后，原始字符串中的相似字符会处在比较相邻的位置步骤
基因组分析·2023-12-15 04:38

[⑦ADRV902x]: JESD204学习笔记

前言JESD204B/C基于SERDES（SERialization/DESerialization）技术，也就是串化和解串，在发送端将多位并行的数据转换为1bit的串行数据，在接收端将串行数据恢复成原始的并行数据
李71~李先森·2023-12-15 04:59

组装细菌基因组

一、在GenomeAnnouncements网站（https://mra.asm.org/）找到一篇细菌基因组文章1.标题如下image.png2.有多个SRA号，只选择其中一个SRR9209170image.pngimage.png
努力再努力_cf77·2023-12-15 04:00

Matlab之带时区的日期时间数据和不带时区的日期时间数据相互转换方法

使用datetime和datetimezone函数通过使用datetime和datetimezone函数，可以将带时区的日期时间数据转换为不带时区的数据，或者将不带时区的日期时间数据转换为带时区的数据。
珞瑜··2023-12-15 01:16

工业领域VR/AR软件实现数据转换有困难？看HOOPS如何解决！

Halocline公司背景Halocline是一家德国公司，拥有近750名员工，分属三个主要业务部门。软件解决方案部门专注于开发工业应用的创新软件产品。2016年，该部门成立了一个EmbodiedEngineering部门，具体目标是开发将虚拟现实（VR）融入制造过程的应用。"VR为制造业开辟了全新的可能性，"Halocline的产品经理FabianSchlarmann说。"我们的‘Embodie
慧都科技3D·2023-12-15 01:47

ELK的日志解决方案

Logstash是一个开源的数据收集引擎，用于将不同来源的数据转换成统一的格式并发送到Elasticsearch中。Kibana是一个开源的数据可视化工具，用于展示Elas
forty-nine·2023-12-15 00:02

数据转换

1.Z-Score标准化image.pngZ-Score标准化后的数据平均值为0，方差为1.对应的api：（1）scipy.stats.zscore(2)sklearn.preprocessing.StandardScaler()2.min-max标准化将数值缩放到0-1之间image.png对应的api：sklearn.preprocessing.MinMaxScaler()3.独热编码，one
何hw·2023-12-14 20:58

el-upload 附加json数据

自定义事件点击上传exportdefault{methods:{addJsonToUpload(file){//将需要添加到上传文件中的JSON数据转换为FormData格式constformData=
xixiyuguang·2023-12-14 16:14

OSI七层网络参考模型

而且搭建网络的时候也并不一定需要划分为7层但是当今互联网广泛使用的是TCP/IP网络模型,他原本是四层，实际上划分为五层更符合实应用层：把应用数据转换成二进制传输层：利用端口号将数据包传输到正确的目的应用
是三好·2023-12-14 15:57

第七周作业

表示层：使用应用层的下一层，应用层的数据会首先经过表示层，将为应用层产生的数据提供数据转换类的服
毅_·2023-12-06 21:05

Elasticsearch：什么是向量嵌入？

向量嵌入定义向量嵌入(vectorembeddings)是一种将单词、句子和其他数据转换为捕获其含义和关系的数字的方法。它们将不同的数据类型表示为多维空间中的点，其中相似的数据点更紧密地聚集在一起。
Elastic 中国社区官方博客·2023-12-06 20:56

【python 爬取接口数据】

解析接口返回的数据，可以使用Python中的json库将返回的JSON数据转换为Python对象，或者使用BeautifulSoup库解析HTML数据。
cv全粘工程师·2023-12-06 18:25

Retrofit的转换器

我们经常需要对字符串进行解析将其转变为一个JavaBean对象，比如服务器响应数据为JSON格式字符串，那么我们可以自己利用GSON库完成反序列化的操作，而Retrofit提供了多个转换器使得响应能够完成自动的数据转换
豆沙***·2023-12-06 16:51

典型的ETL使用场景

典型的ETL使用场景ETL(Extract，Transform，Load)是一种用于数据集成和数据转换的常用技术。它主要用于从多个数据源中提取数据，对数据进行清洗、转换和整合，最后加载到目标系统中。
ETLCloud数据集成社区·2023-12-06 12:28

QT——数据转换（int/QString/QByteArray/char/string）等

目录1.QString怎么转成int2.int转QString3.int转string4.string转int5.QString转string6.string转QString7.QByteArray转QString8.QString转QByteArray9.QByteArray转化为char*10.char*转化为QByteArray11.QString转char*12.char*转QString
口袋里のInit·2023-12-06 09:42

pythonlist函数的用法_Python的list()函数

它可以将任何可迭代数据转换为列表类型，并返回转换后的列表。当参数为空时，list函数可以创建一个空列表。
weixin_39897505·2023-12-06 09:40

数据标准化 VS 数据归一化

数据标准化VS数据归一化数据标准化目的方法应用场景优点缺点数据归一化目的方法应用场景优点缺点总结数据标准化目的将数据转换为均值为0，标准差为1的分布。
trust Tomorrow·2023-12-06 08:52

pytorch如何生成小批量数据并传入神经网络？

第一部分：Excel表格数据的预处理1.1加载Excel数据1.2数据清洗1.2.1删除无用数据1.2.2填充缺失值1.2.3数据类型转换1.3将数据转换为张量1.4创建数据集和数据加载器1.4.1创建数据集
高山莫衣·2023-12-06 07:16

【笔记】关于JS的数据转换

数据转换字符与数字转换Number()能用于任何数据类型转换成数字如果是null、false返回0，如果是包含了非数字字符、undefined返回NaNparseInt()和parseFloat()，分别能够返回第一个解析到的整数
Fortaro·2023-12-06 06:34

【开源视频联动物联网平台】如何解决物联网协议多样性问题

通过将不同协议的数据转换为标准协议，可以实现物联网设备之间的互联互通。这种方法需要在设备之间建立协议转换的通道，确保数据能够在不同协议之间传递。
帐篷Li·2023-12-06 06:10

uni-APP，微信小程序，保存日志文件为txt文件，然后转发给微信好友

wx.getFileSystemManager();2、保存日志文件内容为txt文件getTxtFileToShare(){letjson={"a":'1234567890','b':'测试中文内容'}//将数据转换为字符串
八分钟de温暖·2023-12-06 06:33

使用pandas将字符串格式数据转换为单独的行

有时在处理数据时，可能会遇到这样的情况，即数据框中的整个字符串条目需要拆分到不同的行中。这可能是一项具有挑战性的任务，特别是当数据庞大而复杂时。尽管如此，一个名为pandas的Python库提供了各种函数，使用这些函数可以轻松有效地完成这项任务。因此，在本文中，我们将研究如何使用pandas中可用的方法（即split和explode）将字符串格式的字符串条目转换为单独的行。什么是PandasDat
python收藏家·2023-12-06 04:35

C++学习之路（十三）C++ 用Qt5实现一个工具箱（增加一个Base64加解密功能）- 示例代码拆分讲解

Base64是一种将二进制数据转换为文本
天河书阁 VicRestart·2023-12-06 03:12

Web API

JavaScript中有些API可能使用率比较低BlobAPIBlobAPI用于处理二进制数据，可以方便地将数据转换为Blob对象或从Blob对象读取数据。
Yxj-5211314·2023-12-06 00:35

一个转录组上游分析流程 | Hisat2-Stringtie

/bin/bash##使用fastq-dump解压sra数据#本数据集为双端数据#解压格式为fq.gzforiinSRR6929571SRR6929572SRR6929573SRR6929574SRR6929577SRR6929578
小杜的生信筆記·2023-12-05 21:44

一个完整的转录组分析流程

/bin/bash##使用fastq-dump解压sra数据#本数据集为双端数据#解压格式为fq.gzforiinSRR6929571SRR6929572SRR6929573SRR6929574SRR6929577SRR6929578
小杜的生信筆記·2023-12-05 21:09

flink入门基础知识整理（持续更新）

大规模复杂计算1.1.5多平台部署2.API介绍2.1API层次2.2DataStream体系2.3数据读取（Source）2.3.1内存读取2.3.2文件读取2.3.3SOCKET接入2.3.4自定义读取2.4数据转换处理
大胡在进步·2023-12-05 21:02

转置行列数据并可实时更新

实务中，经常碰到需要将横向数据转换为竖式排列的问题，如图所示：常见的方法有选择性粘贴-转置、TRANSPOSE数组公式，但都有相应的缺点。
不正经会计师·2023-12-05 18:43

如何在vue3中封装并使用echarts组件

asechartsfrom'echarts/core'//引入柱状图，折线图import{BarChart,LineChart}from'echarts/charts'//引入提示框，标题，直角坐标系，数据集，内置数据转换器组件
正方形的圆灬·2023-12-05 17:21

Python处理Point, MultiPolygon, Polygon, LineString等Geo地理形状数据

依赖库fromshapelyimportPolygon,Point,LineStringimportre自编写函数1.将字符串Polygon/MultiPolygon数据转换为坐标数据输入输出调用方式：
Alkali！·2023-12-05 10:34

3D Web可视化平台助力Aras开发PLM系统：提供数据访问、可视化和发布功能

因为用户很多使用的不同的CAD系统，所以数据转换和3D可视化成了一大难题。Aras希
慧都科技3D·2023-12-05 09:32

python 的数据转换函数(13个)

函数描述int(x[,base])将字符串x转换成一个整数float(x)将字符串x转换为一个浮点数complex(real[imag])根据real和imag创建一个浮点数str(x)将对象x转换为一个字符串repr(obj)将对象obj当做python语句执行,返回结果的字符串形式eval(str)计算字符串中有效的python表达式,返回结果tuple(s)将序列s转换为一个元组list(s
HIICIO·2023-12-05 08:19

C语言- 数据转换汇总

概述项目上经常有用到的数据状态。一、多种转换方式/**Calculateintegerbitcountofb'1*/#defineINT_BIT_COUNT(integer,count){\count=0;\while(integer)\{\count++;\integer&=integer-1;\}\}/**Streamskiplen*/#defineSTREAM_SKIP_LEN(s,len)
Ch_champion·2023-12-05 07:39

省事地获取已公开测序数据的下载链接（.sra|.fastq.gz）

写在前面课题需要，前述，在TBtools中开放了一个SraExperimentXML2InfoTable的功能。在这个功能的辅助下，我们较快的完成了阶段任务。筛选数据完成了，但是下载数据却出现了问题。主要遇到的问题是NCBI的数据，似乎有时候能下载到，有时候却下载不到。或许网速是一个原因，但我更多地开始认为或许NCBI并没有存储所有的短读段测序数据。DDBJ也是一样。相反ENA似乎存储全面，只是传
生信石头·2023-12-05 02:00

PLC通过485Modbus转Profinet网关与温控表通讯在发酵罐的应用

然而，对于一些不支持Profinet协议的设备，需要通过网关来进行数据转换，使其能够与PLC进行通讯。这就需要将PLC通过485Modbus
兴达易控·2023-12-05 01:38

C++ Primer 类 12.4 explicit 构造函数

按照默认规定，只有一个参数的构造函数也定义了一个隐式转换，将该构造函数对应数据类型的数据转换为该类对象，如下面所示：classString{String(constchar*p);//用C风格的字符串p
big_bit·2023-12-04 22:06

转录组重建系统发育（三）使用minimap2过滤掉序列中的叶绿体和线粒体基因

/database/chloroplast_genome/gesneriaceae_chloroplast.fasta../04.trinity_longest/SRS7102777_trinity
惊鸿影·2023-12-04 21:57

hive sql&spark 优化

中间源数据库的效率和代码质量、抽取数据的服务器资源、数据转换的效率、hive数据的插入sql效率等都是限制数据抽取效率的瓶颈，如何在保证系统稳定的情况下，效的优化各阶段的运行速度，从而整体提高数据抽取的效率
刘文钊1·2023-12-04 20:08

Day10-提取fasta文件中指定顺序的序列

    好久不见啦，办公室的工作有点繁忙鸭~今天遇到了一个挺简单的问题，但是用awk/sed/grep来解决好像有点难，就是提取fasta文件中第一条序列。
腐草为嘤·2023-12-04 18:35

pytorch使用GPU炼丹笔记

如何使用GPU训练/测试模型使用单GPU设置设备将数据转换成CUDA张量将模型参数转换成CUDA张量使用指定GPU1.使用CUDA_VISIBLE_DEVICES。
赤坂·龙之介·2023-12-04 16:45

exceljs读取el-upload上传的excle数据并转为json输出

当使用ElementUI的el-upload组件上传Excel文件时，您可以使用exceljs库将上传的Excel数据转换为JSON格式。
啃火龙果的兔子·2023-12-04 12:39

原神切服器 2.0

原神切服器（安卓端）(支持鸿蒙）重磅更新，现已支持原神国服、B服、小米服、国际服，四服的通用数据转换，以此来实现四个软件共同使用一份游戏数据，避免手机内存不够的问题。
Anyexyz·2023-12-04 12:54

3.3 描述性统计分析 之 描述性分析

描述性分析（Descriptives）主要用于描述连续变量统计量计算，也可将原始数据转换成标准Z分值（标准化数据）并存入数据集。
碎片时间学统计·2023-12-04 11:15
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