单细胞聚类第13页

海贼王，我当定了

单细胞的船长面对着大海许下了诺言，孩子气的笑脸在阳光的照射下显得那样灿烂。或许最初的原因已经忘记了，不过不要紧，因为现在有了新的理由，戴在头上的草帽并不只是虚无的存在，那是我与你诺言的见证，杰克。

流氓也丶可爱_cdec·2024-01-07 20:27

论文阅读“Deep Adversarial Multi-view Clustering Network”

,WangQ,TaoZ,etal.DeepAdversarialMulti-viewClusteringNetwork[C]//IJCAI.2019:2952-2958.摘要导读近年来，利用跨视图公共聚类结构的多视图聚类受到越来越多的关注

掉了西红柿皮_Kee·2024-01-07 19:36

第一章：文字和语言VS数字和信息

概念与主题：通信的原理和信息传播的模型（信源）编码和最短编码解码的规则，语法聚类校验位双语对照文本，语料库，机器翻译多义性和利用上下午消除歧义性image.png信息的冗余是信息安全的保障。

dreampai·2024-01-07 18:14

[Python] 如何使用scikit-learn库进行线性回归训练和预测

它提供了各种监督和无监督学习算法，包括分类、回归、聚类、降维等。Scikit-learn易于使用且功能强大，可以处理大型数据集，并且具有很好的可扩展性。

老狼IT工作室·2024-01-07 17:15

2021-11-14

NatMed|空间转录组学分析单细胞分辨率图谱原创存在一棵树图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学技术撰文：存在一棵树IF=28.547推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：开发了SpaGCN，一种图卷积网络方法，其可通过图卷积从相邻点聚合每个点的基因表达

图灵基因·2024-01-07 16:58

生信人R语言

05.热图#测试数据#pheatmap绘制聚类热图的R包a1=rnorm(100)#rnorm()生成随机数dim(a1)=c(5,20)a2=rnorm(100)+2dim(a2)=c(5,20)library

Yinwen(o^^o)·2024-01-07 16:21

16s—β多样性分析（R画三维PCoA图）

通过计算样本间距离可以获得β多样性计算矩阵，后续一般会利用PCoA、进化树聚类等分析对此数值关系进行图形展示。

walnutoil·2024-01-07 16:23

10X单细胞 && 10X空间转录组分析之cellphoneDB可视化进阶

10X单细胞（10X空间转录组）细胞通讯的一个小小的细节考虑空间位置的通讯分析手段---

单细胞空间交响乐·2024-01-07 15:22

2022年多元统计分析期末试题

2023年多元统计分析期末试题1.试论述系统聚类、动态聚类和有序聚类的异同之处。

倒杯Whisky·2024-01-07 11:35

人工智能_机器学习087_DBSCAN聚类案例_聚类数据创建---人工智能工作笔记0127

之前我们把DBSCAN的原理以及参数都理解了,现在我们看如何使用首先我们导包importnumpyasnp导入数学计算包importmatplotlib.pyplotasplt导入画图包fromsklearn.clusterimportKMeans,DBSCAN导入算法fromsklearnimportdatasets导入数据集包X,y=datasets.make_circles(n_sample

脑瓜凉·2024-01-07 11:50

2022-07-17

NatBiotech|单细胞全长转录组分析新方法：实现廉价和高通量原创huacishu图灵基因2022-07-1608:36发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文：huacishuIF=68.164

图灵基因·2024-01-07 07:25

机器学习系列 - 9. 主成分分析法 PCA

也可以用来削减回归分析和聚类分析中变量的数目。1.2为什么要做主成分分析在很多场景中需要对多变量数据进行观测，在一定程度上

小蘑菇1962·2024-01-07 07:20

Open3D聚类算法

按照官网的例子使用聚类，发现结果是全黑的。

easyboot·2024-01-07 04:38

Open3D将聚类结果显示或者保存

将聚类结果按大小排序，并取出最大的4个结果importtimeimportopen3daso3d;importnumpyasnp;importmatplotlib.pyplotasplt#坐标mesh_coord_frame

easyboot·2024-01-07 04:38

标签设计

一、标签体系构建原则原则一、放弃大而全的框架，以业务场景倒推标签需求放弃顶层的用户抽象视角，针对各业务线或部门的诉求和实际的应用场景，分别将标签聚类起来提供给相应部门。

yimengtianya1·2024-01-07 04:56

基于Kdtree加速的DBSCAN点云聚类

聚类是点云分割中的一类方法（其他方法有模型拟合、区域增长、基于图的方法、深度学习方法等）

点云处理·2024-01-07 02:10

八大在线项目实习 2024年第一期即将开班

八大项目：某实习网站招聘信息采集与分析（Python数据采集与分析）股票价格形态聚类与收益分析（Python金融分析）某平台网络入侵用户自动识别（Python机器学习）某平台广东省区采购数据分析（Excel

泰迪智能科技·2024-01-07 01:14

数据挖掘聚类算法--划分(partitioning)

数据挖掘--聚类算法简介聚类是对物理的或者抽象的对象集合分组的过程，聚类生成的组称为簇，而簇是数据对象的集合。

Mr_Peter_Hu·2024-01-06 21:55

Hierarchical Clusting模型

介绍：HierarchicalClustering是一种常用的聚类方法，它通过构建一个层次化的聚类树（或者称为聚类图），将数据点逐步合并组成不同的聚类簇。

取名真难.·2024-01-06 19:59

聚类分析 | Matlab实现基于RIME-DBSCAN的数据聚类可视化

聚类分析|Matlab实现基于RIME-DBSCAN的数据聚类可视化目录聚类分析|Matlab实现基于RIME-DBSCAN的数据聚类可视化效果一览基本介绍程序设计参考资料效果一览基本介绍1.聚类分析|

机器学习之心·2024-01-06 19:52

各种组织的marker gene

最近做单细胞分群，总结一下我自己查文献查到的各种组织有哪些细胞，这些细胞的markergene是什么。注意这些都是mice中的哦！

微光**·2024-01-06 14:11

cellranger处理单细胞数据的一些错误记录

cellranger处理单细胞数据的一些错误记录1、由于fastq不完整报错报错信息原因解决方案2、化学版本选择错误报错信息原因解决方案1、由于fastq不完整报错报错信息[error]Pipestancefailed.Errorlogat

微光**·2024-01-06 14:11

空间转录组分析流程（使用Seurat对空间数据集进行分析）

尽管分析流程类似于单细胞RNA序列分析的Seurat工作流程，但我们引入了更新的交互作用和可视化工具，特别着重于空间和分子信息的整合。

微光**·2024-01-06 14:41

学习：StatQuest-K-means

前言K-means属于动态聚类，聚类速度较快，难点是不太好找到初始凝聚点K-meansimage.png第一步，我们的K代表的是你要聚成几类，譬如K=3即分成3类image.png第二步就是选择初始凝聚点

小潤澤·2024-01-06 10:59

李宏毅机器学习-PCA

无监督学习做什么无监督学习主要做两件事情：聚类&降维：比如说下图的树木，只有输入图片，没有标签，我们希望通过一个函数抽象的表达他们，于是抽出一个更抽象的表述生成器：也就是无中生有，我们有很多图片，但不知道是怎么生成的

Zhuanshan_·2024-01-06 09:43

机器学习——特征工程之K均值降维

机器学习——特征工程之K均值降维前言一、K-均值聚类（K-means）1、算法推导2、举例二、降维前言1、先直观解释什么是平面（线性子空间）和流形（非线性子空间）：答：如果线性子空间是一张平展的纸，那么非线性流形的一个简单例子就是卷起来的纸

macan_dct·2024-01-06 09:11

人工智能_机器学习091_使用三维瑞士卷数据_KMeans聚类算法进行瑞士卷数据聚类---人工智能工作笔记0131

然后我们首先来构建一下数据准备瑞士卷数据:importnumpyasnp导入数学计算包importmatplotlib.pyplotasplt导入画图包#自底向上聚类fromsklearn.clusterimportAgglceerativeClustering

脑瓜凉·2024-01-06 09:03

人工智能_机器学习092_使用三维瑞士卷数据_利用分层聚类算法进行瑞士卷数据三维聚类---人工智能工作笔记0132

然后我们使用分层聚类算法来对我们导入的瑞士卷数据进行聚类agg=AgglomerativeClustering(n_clusters=6,linkage='ward')可以看到这里我们使用的,聚类距离计算用的是

脑瓜凉·2024-01-06 09:03

利用自编码器(AutoEncoder, AE)，对图像或信号进行降维和聚类，并将隐空间在2D空间中可视化，通过Matlab编程实现

自编码器（AutoEncoder）是一种无监督学习方法，用于对数据进行降维和聚类。它通过学习输入数据的低维表示来重构输入数据，同时保持数据的分布不变。

学兔兔VIP·2024-01-06 04:04

论文图鉴14：多组学2

多组学1在这里论文日鉴7--单细胞数据整合-(jianshu.com)MOGONEMOGONETintegratesmulti-omicsdatausinggraphconvolutionalnetworksallowingpatientclassificationandbiomarkeridentification

可能性之兽·2024-01-06 01:37

机器学习算法分类

监督学习目标值：类别--分类问题目标值：连续型的数据--回归问题分类模型k近邻算法，贝叶斯分类，决策树与随机森林，逻辑回归,SVM,回归模型线性回归，岭回归无监督学习目标值：无聚类模型k-means机器学习开发流程获取数据数据清洗特征工程

学了忘了学·2024-01-06 01:40

单细胞基因可视化之热图改造修饰1

单细胞基因可视化中热图也是比较受欢迎的，在分析完每群的marker基因之后，可以挑选显著的gene用seurat自带函数DoHeatmap可视化。当然也可以选任意自己想展示的基因进行可视化。

KS科研分享与服务·2024-01-05 23:58

词向量系列之One-Hot编码详解

独热编码的缺点1.4独热编码适用的情况2.独热编码的实现2.1python简单实现one-hot编码2.2sklearn2.3Keras2.4tensorflow3NLP中的独热表示0.前言在回归，分类，聚类等机器学习算法中

Elenstone·2024-01-05 22:22

仓鼠日记

在最近，我发现了一个重磅消息：我们人类的基因竟然有95%和仓鼠一样，我觉得有可能人类和仓鼠是同一种单细胞生物进化出来的，现在也只不过是一种外形上的区别而已，但内部在发生着一种我们无法想象的变化，而且，仓鼠不管是灵活性还是生育能力和独自生存能力都强于人类

王卓骁·2024-01-05 20:27

聚类分析--基本原理、方法(Kmeans,层次聚类)

文章目录聚类分析的定义基本原理商业应用场景聚类分析步骤聚类分析方法层次分析法/系统聚类法（小样本）提问：如何选择合适的分类结果K-means疑问：聚类分析的定义聚类分析就是将研究对象根据一些特征指标，把比较相似的研究对象

universe_1207·2024-01-05 18:38

机器学习--聚类系列--层次聚类

层次聚类层次聚类(HierarchicalClustering)是聚类算法的一种，通过计算不同类别数据点间的相似度来创建一棵有层次的嵌套聚类树。

weixin_34319817·2024-01-05 18:38

第九章聚类

9.1聚类任务聚类是试图将数据集中的样本划分为若干个通常是不相交的子集，每个子集称为一个“簇”。通过这样的划分，每个簇可能对应于一些潜在的概念（类别）。

T Lai·2024-01-05 18:38

《数据挖掘基础》实验：Weka平台实现聚类算法

实验目的进一步理解聚类算法（K-平均、PAM、层次聚类、密度聚类），利用weka实现数据集的聚类处理，学会调整模型参数，以图或树的形式给出挖掘结果，并解释规则的含义。

lazyn·2024-01-05 18:08

【数据挖掘】聚类趋势估计、簇数确定、质量测定等评估方法详解（图文解释超详细）

需要PPT和源码请点赞关注收藏后评论区留言私信~~~聚类评估用于对在数据集上进行聚类的可行性和被聚类方法产生的结果的质量进行评估。

showswoller·2024-01-05 18:37

DBSCAN及簇评估

8.4DBSCAN基于密度的聚类寻找低密度区域分离的高密度区域。

DMU_lzq1996·2024-01-05 18:07

聚类分析-K-means、层次聚类、DBSCAN、簇评估

聚类分析基本概念聚类分析定义聚类分析是一种数据分析技术，对大量未知标注的数据集，通过将具有相似数据特性的数据对象分组到一起，使得类别内的数据相似度较大而类别间的数据相似度较小，以便对这些数据对象进行更好的理解和分析

norah2·2024-01-05 18:06

GEE土地分类：土地分类精度评定和分类后影像进行（Kmeans，Gmeans，SNIC (Simple Non-Iterative Clustering）聚类分析和滤波（focal_mode）分析

本教程将通过指定区域的土地分类结果，进行聚类处理和滤波处理，聚类主要使用三种方法。而滤波则使用focal通过调参来进行分析。从而实现土地分类后的后处理。

此星光明·2024-01-05 18:07

CCAT：SCENT的形象代言者，干性分析新秀

前言在前不久的一篇推文中：SCENT：单细胞层面干性评估的扛把子,Immugent就给大家介绍了SCENT软件的第一版，今天我们来进一步介绍它的升级版--CCAT。

生信宝库·2024-01-05 17:48

人工智能_机器学习090_分层聚类算法的概念原理和参数说明---人工智能工作笔记0130

然后我们再来看一种聚类的算法可以看到就是这种分层聚类算法可以看到它的原理就是,首先聚成小类,比如白杏和红杏靠的比较近就分为一类了,然后这种聚合的小类,再按照他们类别之间的距离,再合并,不断下去最后把子类都聚合成一个大类这样的聚类原理可以看到当考虑聚类效率的时候

脑瓜凉·2024-01-05 14:52

04 supervised learning

Summary:unspervisedlearningclustering（聚类算法）Anomalydetection（异常检测）RecommenderSystems（推荐系统）ReinforcementLearning

叮咚Zz·2024-01-05 14:39

【单细胞组学】scCITE-seq（单细胞转录组+细胞表面蛋白表达）

单细胞水平的测序技术发展的越来越快，目前应用最多的是集中于mRNA表达的scRNA-seq和结合了空间信息的空间转录组。

SciNote·2024-01-05 13:43

讲解机器学习中的 K-均值聚类算法及其优缺点。

K-均值聚类算法是一种常见的无监督学习算法，用于将数据集中的观测点分成K个不同的组或簇。它是一种迭代算法，通过计算每个观测点与K个中心点的距离，并将每个观测点分配到距离最近的中心点所属的簇中。

荆赫同艺·2024-01-05 13:38

k-means算法的中文名字是什么，是用来干什么的呢。

这是一种常用于聚类分析的算法，通过将数据分成k个簇，使得每个数据点都属于离其最近的簇的中心。算法的目标是最小化数据点与其所属簇中心之间的平方距离之和。

神笔馬良·2024-01-05 12:26

python（经典）数据标准化方法、聚类方法、分类方法总结：

博主这里分析另一篇关于什么时候需要数据标准化的链接https://blog.csdn.net/data_bug/article/details/87695229（二）聚类的方法：（1

cjz0422·2024-01-05 12:16

K-均值聚类（K-means clustering）

K-均值聚类（K-meansclustering）是一种常用的无监督学习算法，用于将样本数据划分成K个不同的类别。K-均值聚类试图找到K个簇，使得簇内的样本点相似度最高，而簇间的样本点相似度最低。

python无人驾驶医学芯片·2024-01-05 07:30

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