单细胞聚类第15页

2022-08-30

TrendsBiotechnol|单细胞分析循环肿瘤细胞原创huacishu图灵基因2022-08-3011:43发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文：huacishuIF=21.942推荐度：

图灵基因·2024-01-02 02:55

机器学习的分类与经典算法

按照学习任务分类，可以分为分类、回归、聚类。按照应用领

RainTicking·2024-01-02 02:31

【小沐学NLP】Python实现K-Means聚类算法（nltk、sklearn）

文章目录1、简介1.1机器学习1.2K均值聚类1.2.1聚类定义1.2.2K-Means定义1.2.3K-Means优缺点1.2.4K-Means算法步骤2、测试2.1K-Means（Python）2.2K-Means

爱看书的小沐·2024-01-01 22:01

地球物理中的深度学习理论（DNN的架构、反向传播、梯度消失、梯度爆炸）

在未来地球物理学中涉及到DL的研究提供了几个有希望的方向，例如无监督学习（聚类）、迁移学习（利用之前标记好的数据）、多模态DL（通过DL实现和处理多元模态）、联邦学习、不确定性估计和主动学习。

hhhhhhhhhhyyyyyy·2024-01-01 12:56

【2023年中国高校大数据挑战赛】赛题 B DNA 存储中的序列聚类与比对 Python实现

【2023年中国高校大数据挑战赛】赛题BDNA存储中的序列聚类与比对Python实现更新时间：2023-12-291题目赛题BDNA存储中的序列聚类与比对近年来，随着新互联网设备的大量涌入和对其服务需求的指数级增长

Better Bench·2024-01-01 10:06

自然语言处理(第17课文本分类和聚类)

一、学习目标1.学习文本分类的两种传统机器学习方法：朴素贝叶斯和支持向量机2.学习文本分类的深度学习方法3.学习文本分类的性能评估标准4.学习文本聚类的相似性度量、具体算法、性能评估二、文本分类1.概述将文本分类

komjay·2024-01-01 08:13

数据挖掘模糊聚类

importmatplotlib.pyplotasplt#绘图importpandasaspd#读取数据集fromsklearn.preprocessingimportscalefromsklearn.clusterimportDBSCAN#聚类

亖嘁·2024-01-01 07:51

数据挖掘与知识发现：解析关键概念

2.2数据挖掘过程2.2.1问题定义2.2.2数据采集与清洗2.2.3特征选择2.2.4模型构建2.2.5模型评估与验证2.2.6模型部署2.3数据挖掘任务2.3.1关联规则挖掘2.3.2分类2.3.3聚类

轩Scott·2024-01-01 07:49

多维时空数据介绍（3）局部异常值分析

01、局部异常值分析局部异常值工具可识别具有高值或低值的要素是否存在空间聚类和异常值。聚类是指高值周围围绕高值，低值周围围绕低值，异常值是指高值周围围绕低值，低值周围围绕高值的情况。

YXGiser·2024-01-01 04:07

10X单细胞（10X空间转录组）数据分析之基于代谢物介导的细胞间通讯

六一到了，遥想自己上小学，还是课间操的队长，我在的地方是长治市壶关县北大安村，六一就回去店上镇参加体操比赛，人生如梦，转眼马上就要进入而立之年，小时候的梦想实现了么？这么多年，有没有让自己觉得难忘的事情？今天我们来分享一个通讯分析的内容，当然，方法都在不断的更新升级，考虑的也更加全面，参考文章在MEBOCOST:MetabolicCell-CellCommunicationModelingbySi

单细胞空间交响乐·2024-01-01 03:21

数学建模算法总结

目录一.数据预处理模型1.对于缺失值的补全处理：插值拟合1.插值2.拟合总结：拟合得到的是一条曲线，拟合得到的函数不一定过所有点2.数据降维主成分分析3.数据异常值处查找与删除聚类分析4.数据整体描述性分析二

今日说"法"·2024-01-01 02:31

【Acta Neuropathol ，IF=14.25】揭开重症肌无力疾病面纱—如何通过单细胞蛋白组发现潜在免疫治疗靶点

✎文章导读文章导读：Single-cellprofilingofmyastheniagravisidentifiesapathogenicTcellsignature发表期刊/影响因子：ActaNeuropathol/2021-03/14.251研究样本：外周血、胸腺组织研究内容：1）CyTOF挖掘确定MG致病关键细胞亚群，且与疾病严重程度相关；2）大规模研究验证，该信号可作为监测疾病严重程度和指

普罗亭·2024-01-01 02:05

ggplot2 | 单细胞类间比较的火山图 - 经典效果

1.定义画图函数定义函数。VolcanoPlot=function(dif,log2FC=log2(1.5),padj=0.05,label.symbols=NULL,label.max=30,cols=c("#497aa2","#ae3137"),title=""){if(all(!c("log2FoldChange","padj","symbol")%in%colnames(dif))){st

biomooc·2024-01-01 00:06

单细胞拟时序分析 | diffusionMap

1.简介DiffusionMap（扩散映射）是一款R软件，通过高斯模型和马尔科夫模型，把单细胞（scRNA）表达矩阵的非线性结构映射为连续性结构，并关联至对应细胞分组。

biomooc·2024-01-01 00:02

Matlab：K-means算法

K-means算法是一种常见的聚类算法，它将一组数据划分为K个不同的簇，以最小化每个簇内部数据点与簇中心之间的平方距离的总和为目标实现聚类。

不吃橘子的橘猫·2023-12-31 15:14

Analysis of single cell RNA-seq data 学习笔记(七)

这个包的用法QC首先我们先介绍下UMI这个概念，UMI其实就是区分每个测序分子片段的barcode，这么做可以区分每个分子是哪一个cell表达的我们还是采用deng这个数据做例子首先我们构造Seurat的单细胞对象

小潤澤·2023-12-31 13:27

机器学习之聚类算法Kmeans

K-means算法（无监督算法，聚类算法）1、基本概念聚类算法：是一种典型的无监督学习算法，主要用于将相似的样本自动归到一个类别中。

zhw864680355·2023-12-31 12:03

讨论k值以及初始聚类中心对聚类结果的影响_K均值聚类需要标准化数据吗

数据挖掘一种新兴的交叉的学科技术，涉及了模式识别、数据库、统计学、机器学习和人工智能等多个领撤分类、聚类、关联规则是数据挖掘技术几个主要的研究领域。在数据挖掘的几个主要研究领域中，聚类是其中一个重要研

是空空呀·2023-12-31 12:33

人工智能_机器学习080_KMeans聚类算法原理和流程_KMeans损失函数_随机聚类中心_对异常值_初始值敏感---人工智能工作笔记0120

然后我们来看一下KMeans聚类算法的原理可以看到,聚类的过程是,首先1.将N个样本数据,映射到K个簇中,这个K就是我们指定的划分成几类,比如3对吧,那么指定了K个类别以后,然后我们再去随机指定K个,簇中心然后再去计算

脑瓜凉·2023-12-31 12:30

软件设计师——软件工程（三）

软件工程的文章，如果有什么需要改进的地方还请大佬指出⛺️作者简介：大家好，我是听风与他☁️博客首页：CSDN主页听风与他每日一句：狠狠沉淀，顶峰相见目录前言11.在敏捷过程的方法中（）认为12.该模块的内聚类型为

听风与他·2023-12-31 09:20

九-1.聚类分析

聚类通常作为其他数据挖掘或建模的前奏一.特征认知1.有监督无监督分类:有监督学习（有标签学习）数据特征聚类:无监督学习（没有标签）数据特征2.聚类概念聚类是把各不相同的个体分割为有更多相似性子集合的工作

唐-import-某人·2023-12-31 08:46

Day5+7组53号瓶小喵Yolanda+《学习力》第七-八章读书笔记

黄金屋中的小逗姑娘·2023-12-31 08:47

spotify音乐下载_使用Python和R对音乐进行聚类以在Spotify上创建播放列表。

spotify音乐下载SpotifyisoneofthemostfamousMusicPlatformstodiscovernewmusic.Thecompanyusesalotofdifferentalgorithmstorecommendtheusernewmusicbasedontheirmusicpreferencesandmostoftheserecommendationsareloca

weixin_26752765·2023-12-31 06:38

2019-12-29

K-Means聚类算法1、原理第一步：选K个初始聚类中心，z1(1)，z2(1)，…，zK(1)，其中括号内的序号为寻找聚类中心的迭代运算的次序号。

xias147·2023-12-31 06:07

竞赛保研基于大数据的股票量化分析与股价预测系统

文章目录0前言1课题背景2实现效果3设计原理QTChartsarma模型预测K-means聚类算法算法实现关键问题说明4部分核心代码5最后0前言优质竞赛项目系列，今天要分享的是基于大数据的股票量化分析与股价预测系统该项目较为新颖

iuerfee·2023-12-31 06:07

【Lidar】Open3D点云K-Means聚类算法：基于距离的点云聚类（单木分割）附Python代码

1K-Means算法介绍K-means聚类算法是一种无监督学习算法，主要用于数据聚类。

RS迷途小书童·2023-12-30 19:03

点成案例 | 如何利用细胞计数仪在单细胞测序中评估细胞

一、概述单细胞测序技术能够用来表征异常细胞群，分析稀有细胞和细胞图谱网络，发现异质性等。由于单细胞测序巨大的应用潜力，目前此技术正在经历爆炸性增长。然而，单细胞测序需要成本和时间的大量投资。

点成生物科技·2023-12-30 19:42

人工智能_机器学习076_Kmeans聚类算法_体验_亚洲国家队自动划分类别---人工智能工作笔记0116

我们开始来看聚类算法可以看到,聚类算法,其实就是发现事物之间的,潜在的关联,把有关联的数据分为一类我们先启动jupyternotebook,然后我们看到这里我们需要两个测试文件AsiaFootball.txt

脑瓜凉·2023-12-30 18:04

熵值法确定权重，主成分分析，聚类分析

选自《战略性新兴产业集群梯度差异与协同发展——基于江苏的数据分析》采用主成分分析法对江苏省战略新兴产业集群发展竞争力进行综合评价。（1）数据的标准化Zij=（x－u）/σZij为标准化后的变量值;x为实际变量值;μ为所有样本数据的均值，σ为所有样本数据的标准差。（2）计算第j项指标下第i产业指标值比重pij:（3）计算第j项指标的熵值：（4）计算第j项指标的差异系数：（5）计算评价指标权重。利用熵

Joy19·2023-12-30 17:24

2020-11-24: 文献阅读: 压力超负荷驱动的心衰小鼠免疫浸润的单细胞转录组测序揭示了免疫激活程度

论文信息Title:Single-CellSequencingofMouseHeartImmuneInfiltrateinPressureOverload-DrivenHeartFailureRevealsExtentofImmuneActivationJournal:CirculationIF:23.603Publishdate:2019Author:Martini,Elisa;Kunderfr

辛晓红·2023-12-30 16:47

单细胞转录组及空间转录组学习资源

(1).单细胞上游软件cellranger：单细胞上游软件cellranger从头说(2).singleR操作说明：singleR(3).seurat操作说明：seurat官网；seurat官方教程：seurat

小潤澤·2023-12-30 15:23

AUCell:单细胞转录组中识别每一个细胞对某个通路的富集程度

AUCell：能够看出某个通路在细胞中的激活情况，在文章中可以用于差异比较，即这个通路多数在巨噬细胞中激活，而在其他细胞群中不激活8f37c46e064b71c7fc55ec17806e6e2.png1.R包的下载if(!requireNamespace("BiocManager",quietly=TRUE))install.packages("BiocManager")#Tosupportpar

汪汪队队长_莱德·2023-12-30 13:57

人工智能_机器学习083_聚类评价指标_调整兰德系数_算法公式原理解析_手写代码使用兰德系数对聚类结果评分---人工智能工作笔记0123

然后我们再来看一下另一个评价聚类指标的系数,可以看到兰德系数上面RI=a+b/C2...首先要知道这里的C,就是实际的类别,就是我们在业务上知道的类别数,然后K表示聚类以后的结果当然当C==K一样的时候

脑瓜凉·2023-12-30 13:54

【华为OD】人工智能面试题目

描述一下你使用过的聚类算法，以及它的应用场景。解释一下支持向量机的基本原理。

道亦无名·2023-12-30 10:13

2023 年中国高校大数据挑战赛赛题B DNA 存储中的序列聚类与比对-解析与参考代码

题目背景：目前往往需要对测序后的序列进行聚类与比对。其中聚类指的是将测序序列聚类以判断原始序列有多少条，聚类后相同类的序列定义为一个簇。

lichensun·2023-12-30 09:06

人工智能_机器学习084_使用聚类算法_提取图片主要颜色_对图片进行聚类提取特征_对图片进行压缩---人工智能工作笔记0124

然后我们再来看之前我们说聚类是可以进行数据压缩的对吧,现在我们用聚类KMeans进行对图片主要特征颜色提取,来压缩图片首先看一下我们准备的一张图片首先导包,显示一下图片importnumpyasnp导入数学计算包

脑瓜凉·2023-12-30 06:55

机器学习之K-means聚类

概念K-means是一种常用的机器学习算法，用于聚类分析。聚类是一种无监督学习方法，它试图将数据集中的样本划分为具有相似特征的组（簇）。

贾斯汀玛尔斯·2023-12-30 05:34

K-means 聚类算法分析

对于K-means算法，首先需要初始化k个聚类中心,然后通过计算每一个对象到每一个聚类中心的欧式距离，如下式所示：这里的表示第i个对象，表示第j个聚类中心，表

夏天是冰红茶·2023-12-30 04:42

2022-07-18

CommBio|TAS-Seq提高单细胞测序准确性原创图灵基因图灵基因2022-07-1809:04发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术日本科学家开发了一种新的DNA扩增和测序方法，可提高单细胞RNA

图灵基因·2023-12-30 00:53

单细胞转录组数据分析课件||7. Clustering of scRNA-seq data

单细胞分析的一个亮点就是可以找出细胞的异质性，也就是可以对细胞进行分群，找出有意思的亚群。所以这节课很重要：数据聚类。

周运来就是我·2023-12-29 23:49

【完整思路】2023 年中国高校大数据挑战赛赛题 B DNA 存储中的序列聚类与比对

2023年中国高校大数据挑战赛赛题BDNA存储中的序列聚类与比对任务1.错误率和拷贝数分析：分析“train_reads.txt”和“train_reference.txt”数据集中的错误率（插入、删除

千千小屋grow·2023-12-29 09:38

2023 年中国高校大数据挑战赛赛题 B DNA 存储中的序列聚类与比对

近年来，随着新互联网设备的大量涌入和对其服务需求的指数级增长，越来越多的数据信息被产生与收集。预计到2021年，数据中心内部的IP流量将达到ZB，数据中心之间的流量将达到2.8ZB。如何储存与运输如此庞大的数据已经成为了难题。DNA存储技术是一项着眼于未来的具有划时代意义存储技术，正成为应对数据爆炸的关键技术之一。DNA存储技术指的是使用人工合成的脱氧核糖核苷酸（DNA）作为介质进行信息存储的技术

BZD数模社·2023-12-29 09:03

数据挖掘聚类度量

fromsklearnimportmetrics#聚类算法的评估指标。fromsklearn.clusterimportKMeans#K均值聚类算法fromhopkins_

亖嘁·2023-12-29 09:01

数据挖掘 K-Means聚类

frommatplotlibimportpyplotasplt#绘图fromsklearn.preprocessingimportMinMaxScaler#归一化fromsklearn.clusterimportKMeans#聚类

亖嘁·2023-12-29 09:55

使用immunarch包进行单细胞免疫组库数据分析（四）：Basic analysis and clonality

基本分析在本节中，我们将使用immunarch包中的基本函数对免疫组库数据进行常规分析。常用函数如下：repExplore-计算基本统计数据，例如克隆数或长度和计数的分布。要探索它们，您需要将统计信息如“count”传递给.method参数.repClonality-计算TCR/BCR库的克隆性。repOverlap-计算不同TCR/BCR库的重叠性。repOverlapAnalysis-分析TC

Davey1220·2023-12-29 08:34

第九节-聚类算法实验分析（第一章: 机器学习算法精进及其案例应用(课程笔记) ）

9.聚类算法实验分析聚类算法实践Kmeans与Dbscan算法半监督问题解决方案聚类评估方法环境：importnumpyasnpimportos%matplotlibinlineimportmatplotlibimportmatplotlib.pyplotaspltplt.rcParams

ZAE_·2023-12-29 08:19

讲解机器学习中的 K-均值聚类算法及其有缺点

K-均值聚类（K-meansclustering）是一种无监督学习算法，用于将数据集划分为K个不同的群类。其基本思想是将数据点分为K个簇，使得每个簇内部的点越相似，不同簇之间的差异越大。

weixin_45906460·2023-12-29 08:48

多元正态分析(3):聚类分析

3.1简介3.1.1聚类分析概念将分类对象（样本、指标）分成若干类，相似的归为一类定量的指标之间相似性的度量：统计距离统计距离包括：注意：欧氏距离、绝对值距离、明考斯基距离、切比雪夫距离受量纲的影响！！

Oasis of the World·2023-12-29 08:17

讲解机器学习中的 K-均值聚类算法及其优缺点。

K-均值聚类的步骤如下：随机选择K个点作为初始化质心。分别计算每个样本与所有质心之间的距离，将每个样本分配到与其距离最近的质心所在的簇中。更新质心，即将每个簇的质心移动到该簇中所有样本的平均位置。

程序猿～厾罗·2023-12-29 08:12

人工智能_机器学习081_聚类评价指标_轮廓系数_公式理解---人工智能工作笔记0121

用均方误差.而我们在Kmeans衡量分成几类比较好用的函数是,轮廓系数对吧,可以看到上面是轮廓系数的公式可以看到,他有两个点可以看到公式中的a和ba,表示某个样本和它所在的簇内的,其他样本的平均距离,其实聚类分的好不好

脑瓜凉·2023-12-29 08:10

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