基因组信息学第16页

本周最新文献速递20210704

Geneticdriversofm6Amethylationinhumanbrain,lung,heartandmuscle不想看英文题目：人脑、肺、心脏和肌肉中m6A甲基化的遗传驱动因素研究杂志和影响因子：NatGenet(IF:27.603;Q1)研究意义：全基因组关联分析

橙子牛奶糖·2023-12-19 23:28

中国在竹子群体遗传研究方面取得重要突破！

2021年9月15日，国际权威期刊《NatureCommunications》在线发表了中国研究人员在竹子群体遗传研究方面取得的最新研究成果，通过对427个毛竹个体基因组的分析，揭示了毛竹种群结构的特点以及材性性状的遗传基础

尐尐呅·2023-12-19 22:49

2021-05-11 转录组分析学习笔记：关于ENSEMBL 转换 ENTREZID的一点心得

凭着从生信技能树各位老师那里学来的技能，很快就顺利完成从数据质控和过滤、比对到参考基因组、到基因表达定量的全套上游分析

范旭_d6fc·2023-12-19 21:07

《生物信息学生R入门教程》读书笔记 Chapter 1

前言最近在阅读欧剑虹老师《生物信息学生R入门教程》非常适合于刚入手NGS的初学者使用，这里我仅做我个人的读书笔记使用本书分为八个章节：1.R/Bioconductor简介2.基因芯片的数据分析3.RNA-seq

小潤澤·2023-12-19 19:08

Nature Plants | 全球首个高粱泛基因组研究成果发表！

该研究构建了世界上首个高粱泛基因组，揭示了高粱一级基因库资源广泛的遗传多样性，为高粱驯化研究和育种应用打下了坚实的基础。此项研

尐尐呅·2023-12-19 18:11

慢病毒载体的包装系统

包装成分由HIV-1基因组去除了包装、逆转录和整合所需的顺式作用序列而构建，能够反式提供产生病毒颗粒所必需的蛋白；载体成分则与包装成分互补，即含有包装、逆转录和整合所需的顺式作用序列，同时具有异源启动子控制下的多克隆位点及在此位点插入的目的基因

实验小助手·2023-12-19 18:50

基因组坐标 “0-base” 和 “1-base”

讲的特别详细就搬运过来了，搬运链接：TheUCSCGenomeBrowserCoordinateCountingSystems“1-start,fully-closed”=coordinatespositionedwithintheweb-basedUCSCGenomeBrowser.“0-start,half-open”=coordinatesstoredindatabasetables.Tab

热衷组培的二货潜·2023-12-19 16:54

Java毕业设计 SSM SpringBoot 在线学习系统

阿亮说技术·2023-12-19 16:59

宏基因组经典论文复现(1) ggplot2绘制散点图

之前写了不少微生物多样性的数据可视化案例，但是始终没有与宏基因组接触，如今大势所趋不得不走上这条道路，论文复现也得早日提上日程，今天就让我们开始来复现下述论文中的图Expandedcatalogofmicrobialgenesandmetagenome-assembledgenomesfromthepiggutmicrobiome

R语言数据分析指南·2023-12-19 12:46

FASTA和FASTQ 介绍

参考:从零开始完整学习全基因组测序数据分析：第2节FASTA和FASTQ作者：碱基矿工前言在生物信息分析过程中，各种组学（基因、转录、蛋白等）各种数据库，不同类型的数据可能都有其特有的数据文件与特殊的存储格式

Peng_001·2023-12-19 12:29

Centos8 安装并使用Ansible（一）

基本信息学习之前，我们先了解一下常用Ansible术语：节点信息Controlnode:任何安装了Ansible的主机。Ansible控制节点主要用于在托管主机上运行任务。

老率的IT私房菜·2023-12-19 10:36

宏基因组学Metagenome-磷循环Pcycle功能基因分析-从分析过程到代码及结果演示-超详细保姆级流程

大背景介绍生信分析，凡事先看论文，有了论文就有了参考，后续分析就有底了，直接上硬菜开干：PCycDB:acomprehensiveandaccuratedatabaseforfastanalysisofphosphoruscyclinggenes-PubMed数据库及部分分析代码github库：GitHub-ZengJiaxiong/Phosphorus-cycling-database:This

小果运维·2023-12-19 09:19

2086：【22CSPJ普及组】乘方(pow)

【题目描述】小文同学刚刚接触了信息学竞赛，有一天她遇到了这样一个题：给定正整数a和b，求ab的值是多少。ab即b个a相乘的值，例如23即为3个2相乘，结果为2×2×2=8。“简单！”

longxuan01·2023-12-19 07:50

支持向量机（SVM）：高效分类的强大工具

1.SVM的基本原理1.1核心思想1.2支持向量1.3最大化建模1.4松弛变量1.5核函数2.SVM与逻辑回归的区别和联系2.1区别2.2联系3.SVM的应用领域3.1图像分类3.2文本分类3.3生物信息学

_用户昵称_·2023-12-19 06:34

体内内源基因调控之CRISPRi与CRISPRa

众所周知，CRISPR/Cas9系统可以用来操纵基因组：规律成簇的间隔短回文重复CRISPR与内切酶Cas9的组合，可以在引导RNA（gRNA）的指引下，靶向基因组中的特定区域并切割DNA，产生DNA双链断裂

辛晓红·2023-12-19 04:19

实验-载体

一、前言：分子生物学着重于分子机制的研究，即基因与基因组的结构和功能，生物大分子执行功能的过程。这个领域的发展源于工具和方法的发展，每一场技术革命都让分

乔伊nikkie·2023-12-19 02:10

生信 | 三维基因组技术（二）：Hi-C辅助组装与Lachesis的使用

染色体疆域Hi-C实验原理图Hi-C实验原理图基因组互作衰减染色体内互作强度较强，但也随着空间距离的增大互作强度在衰减互作衰减Hi-C互作三大规律1.染色体内互作富集（Intrachromosom

生信卷王·2023-12-19 00:43

GWAS--基本概念(未完待续...)

全基因组关联分析GWAS(Genome-wideassociationstudy)应用基因组中数以百万计的单核苷酸多态；SNP为分子遗传标记，进行全基因组水平上的对照分析或相关性分析，通过比较发现影响复杂性状的基因变异的一种新策略

晓佥·2023-12-18 21:05

当初自己为什么选择计算机？

接着第一次参加信息学奥林匹

小邓在森林·2023-12-18 12:36

医疗智能化革命：AI技术引领医疗领域的创新进程

它不仅在医学影像诊断、病理学分析和基因组学研究等领域展现出了巨大潜力，也在远程医疗、智能健康监测和精准医疗等方面彰显着其独特的价值。

4.0啊·2023-12-18 10:23

【动植物研究动态】20220815文献解读

HorticRes|武汉大学李家儒：盾叶薯蓣高质量基因组解析与薯蓣皂苷生物合成进化ThegenomeofDioscoreazingiberensisshedslightonthebiosynthesis

生物信息与育种·2023-12-18 10:16

每周文献 2021-08-02

大家好，最近因为有需要了解甲基化作用，看到这篇文献，拿出来给大家分享一下，这是一篇关于揭示蛋白BANP与基因组的CGCG基序结合，从而激活必需基因表达的文章。

杨博士聊生信·2023-12-18 10:54

生信步骤|转录组mRNA数据的有参组装

转录组的组装能够提供丰富的组学信息，是生物信息学中重要的基础步骤。测序的下机数据经过过滤，比对，排序，组装，最终得到转录本的全部序列信息。

学术程稻属·2023-12-18 03:56

第十三章健康信息学课件

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吉吉的家·2023-12-18 02:40

在线作图|2分钟绘制一张精美的火山图（Volcano Plot）

在生物信息分析中，火山图常用于转录组、基因组，蛋白质组，代谢组等统计数据。im

维凡生物·2023-12-17 22:49

区块链：拥抱实体经济最可期

在浙江大学区块链研究中心主任、信息学部主任、中国工程院院士陈纯看来，未来区块

少年已不年少201901·2023-12-17 20:34

基因-疾病数据库/工具大集合

科学技术的发展极大地改变了基因组领域，尤其是在基因图谱、数据库、疾病图谱、CRISPR/Cas9、大数据和下一代测序等方面。

尐尐呅·2023-12-17 15:26

北大中文核心期刊目录2021年无线电电子学、电信技术

北大中文核心期刊目录2021年无线电电子学、电信技术1电子与信息学报2雷达学报3电子学报4红外与激光工程5系统工程与电子技术6激光与光电子学进展7信号处理8通信学报9电波科学学报10西安电子科技大学学报

LOVECTGU·2023-12-17 12:02

临检中心公布报告：华大基因顺利通过这项室间质量评价预研活动

11月中旬，国家卫生健康委临床检验中心(以下简称“临检中心")公布了2023年“全国血液微生物cfDNA宏基因组高通量测序室间质量评价预研活动结果报告”，华大基因下属子公司天津华大医学检验所顺利通过此次室间质评

ZAKER科技动态·2023-12-17 11:26

信息学奥赛一本通第二章顺序结构程序设计五节C语言非C++

第二章顺序结构程序设计第五节顺序结构实例2070：【例2.13】数字对调#includeintmain(){intn,a,b,c;//从输入读取一个整数nscanf("%d",&n);//通过取余数运算得到n的个位数aa=n%10;//个位//通过除以10然后取余数运算得到n的十位数bb=n/10%10;//十位//通过除以100运算得到n的百位数cc=n/100;//百位//输出n的个位、十位和

bye world·2023-12-17 10:33

wtdbg2 三代基因组组装

wtdbg2软件下载与安装gitclonehttps://github.com/ruanjue/wtdbg2cdwtdbg2make进行基因组装第一步是组装第二步是得到一致性序列#!

candel·2023-12-17 07:00

Hi-C辅助组装问题盘点

根据染色体内部互作频率显著高于染色体间互作频率，同时，在同一条染色体上互作频率随着互作距离的增加而减少的原理，将Contig或者Scaffold聚类到组群，并进一步对组群内的Contig/Scaffold进行排序及定向，实现趋近于染色体水平的基因组挂载

生信阿拉丁·2023-12-17 00:17

需求分析与脑图

②登录学生通过学号、密码进行登录③查看个人信息学生可以查看个人姓名、学号、课程、题目通过率、排名，修改个人密码④消息系统学生可以获取有关课程的信息，如题目发

企业应用开发小组·2023-12-16 23:05

文章系列2：Unraveling the functional dark matter through global metagenomics

通讯作者是来自于DOEJointGenomeInstitute,LawrenceBerkeleyNationalLaboratory,Berkeley,CA,USA.背景介绍&目标作者首先背景介绍了两种主流宏基因组分析方法

土豆西红柿青椒·2023-12-16 21:33

蹭热点的代价是失去科研深度！

多年前，蛋白组学、基因组学火了。很多人便立即着手将研究内容往组学上靠。无论研究什么，你没点组学内容，都不好意思说自己是做科研的。于是，大家在检索文献时，会发现组学相关

聊点学术·2023-12-16 20:59

6年级学生C++零基础，学过Scratch少儿编程，学习CSP-J的年度计划表

我是一个6年级学生C++零基础，只学过一些Scratch少儿编程知识，准备明年参加信息学奥赛的CSP-J比赛，请为我写个学习计划，以下是一个针对学生的情况制定的学习计划：**学习目标：**1.掌握C++

@小码农·2023-12-16 19:54

《生物信息学生R入门教程》读书笔记 Chapter 6

这次介绍的是10XGenomics的数据分析数据读取#构建Seurat对象library(Seurat)library(dplyr)#读取PeripheralBloodMononuclearCells(PBMC)数据pbmc.data0){buf0]2.cell筛选#Seurat会计算基因数以及UMI数(nGeneandnUMI).#Seurat会将原始数据保存在raw.dataslot中，#每一

小潤澤·2023-12-16 19:44

基于BWA，Bowtie2，samtools、checkm等工具计算宏基因组学序列分析中Contigs与Genes在样品中的丰度，多种计算方式和脚本对比

以下是计算这两个指标的意义：1.Contigs的相对丰度：contigs是利用基因组测序技术获得的碎片序列，通过计算contigs的相对丰度可以了解微生物群落中不同菌种的相对丰度。

小果运维·2023-12-16 18:28

ACM 网址和一些建议

USACOhttp://ace.delos.com/usacogate美国著名在线题库，专门为信息学竞赛选手准备TJUhttp://acm.tongji.edu.cn/同济大学在线题库，唯一的中文题库，

剑西楼·2023-12-16 17:10

ACM大量习题题库及建议培养计划

USACOhttp://ace.delos.com/usacogate美国著名在线题库，专门为信息学竞赛选手准备TJUhttp://acm.tongji.edu.cn/同济大学在线题库，唯一的中文题库，

Ellating123·2023-12-16 17:10

【生物信息学】scRNA-seq数据分析（一）：质控~细胞筛选~高表达基因筛选

文章目录一、实验介绍二、实验环境1.配置虚拟环境2.库版本介绍三、实验内容0.导入必要的库1.质控2.细胞筛选3.高表达基因筛选一、实验介绍质控~细胞筛选~高表达基因筛选二、实验环境1.配置虚拟环境可使用如下指令：condacreate-nbiopython==3.9condaactivatebiopipinstall-rrequirements.txt 其中，requirements.

QomolangmaH·2023-12-16 14:11

化学信息的表示

化学信息学可分为两大组成部分，即可化学物质和化学信息和媒体形式的化学信息前者是通过测量得到的化学成分相关信息，如理化性质、成分结构后者是化学信息的记录和传播手段，通过书籍、期刊、专利、数据库等可共享化学信息化合物结构编码线性编码

AtomXe·2023-12-16 12:47

三月份读书心得 | 人类与信息

三月份读书心得|人类与信息我比较喜欢关注与信息学科相关的文章，平常也会读一些相关的书籍。

Biiuuu·2023-12-16 12:54

仰望

最近一条爆炸新闻一直列居本地热榜榜首，山东威海实验高级中学的高一学生戚朗瑞以541分获得信息学奥赛第一名，遥遥领先第二名25分!现已保送清华姚班。

zzyy2222·2023-12-16 11:14

感恩单11.26

1.感谢闹钟叫我起床2.感谢早上的米稀，好好喝3.感谢老师给我们上课，信息学老师好有意思，下午的自然辩证法也很有意思4.感谢中午吃的好吃的午饭.太喜欢焖锅了5.感谢我的电脑也辛苦工作啦6.感谢室友帮我占座位

krysdracula·2023-12-16 07:58

信息学奥赛一本通（1108：向量点积计算）

1108：向量点积计算时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:22720通过数:17933【题目描述】在线性代数、计算几何中，向量点积是一种十分重要的运算。给定两个nn维向量a=(a1,a2,...,an)a=(a1,a2,...,an)和b=(b1,b2,...,bn)b=(b1,b2,...,bn)，求点积a⋅b=a1b1+a2b2+...+anbna·b=a1b1+a2b2+.

橙子教师·2023-12-16 03:07

信息学奥赛一本通：1108：向量点积计算

1108：向量点积计算时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:36182通过数:28574【题目描述】在线性代数、计算几何中，向量点积是一种十分重要的运算。给定两个n维向量a=(a1,a2,...,an))和b=(b1,b2,...,bn)，求点积a⋅b=a1b1+a2b2+...+anbn。【输入】第一行是一个整数n(1≤n≤1000；第二行包含n个整数a1,a2,...,an；第

阿耨多羅·2023-12-16 03:37

听勃拉姆斯的上午

首先是学业，清晰地意识到自己对植物基因组研究兴趣寡然，在夏令营地时候就发现，我和一些同学相比，缺乏对植物本能的热爱，最后一天从植物所的食堂吃饭出来，

Li亦维·2023-12-16 02:12

2021-11-06从人见人爱的向日葵说起——Ks与全基因组多倍化事件

向日葵是吃瓜群众喜闻乐见的一种植物，除了能够长出朵朵葵花向太阳的萌萌大脑袋，还能结出令人爱不释手的瓜子，无论干炒、奶油、五香，都很好吃！不仅如此，向日葵还是重要的油料作物，葵花子油颜色金黄，气味清香，含有大量的亚油酸等人体必需的不饱和脂肪酸，可以促进人体细胞的再生和成长，保护皮肤健康，并能减少胆固醇在血液中的淤积，是一种高级营养油。新疆盛产葵花，维吾尔族姑娘的辫子又多又长，乌黑油亮，据说与姑娘们爱

麦冬花儿·2023-12-15 23:36

文献解读：抗旱玉米品种基因组组装及抗旱机制解析

文献2023NatureGeneticsGenomeassemblyandgeneticdissectionofaprominentdrought-resistantmaizegermplasm研究背景干旱是作物生产的巨大环境限制，造成的作物年产量损失比所有病原体的总和还要高。由于全球气候变化等气候问题，培育高产和抗旱强的品种需求迫在眉睫。玉米是一种世界范围的作物，每年因干旱导致玉米减产越39.3

我与生信·2023-12-15 21:59

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