基因组信息学第19页

转录组学习第5弹-比对参考基因组

比对参考基因组在构建文库的过程中需要将DNA片段化，因此测序得到的序列只是基因组的部分序列。

长腿猴子请来的救兵·2023-11-29 18:12

人工智能与我们的生活

医疗影像分析、基因组学研究等都受益于人工智能技术，为医学领域带来了突破性的进展。b.金融领域在金融领域，人工智能被广泛应用于风险管理、投资策略、反欺诈等方面。

qing_ti_xx·2023-11-29 18:04

2021-01-04根据SNP验证自然选择—XPEHH分析

转载自https://mp.weixin.qq.com/s/1IM6KSCGIq0cUJhKKXVcIw背景选择清除分析是常用于鉴定群体基因组水平受选择区域的一种方法，其背后的理论是：在受选择群体中，会出现有利等位基因的频率快速上升

麦冬花儿·2023-11-29 17:22

61.《Bioinformatics Data Skills》之SAM文件格式(1)

我们已经知道BED与GTF文件用于存储基因组区域与基因组特征注释信息。

DataScience·2023-11-29 06:36

皮尔逊相关系数php,生信分析网站（相关性分析）

ONCOMINE从全景、亚型两个维度做表达差异分析；临床标本从蛋白水平确认(或HPA数据库)，很重要；Kaplan-MeierPlotter从临床意义的角度阐明其重要性；cBio-portal数据库做基因组学的分析

weixin_39599097·2023-11-29 03:02

r语言相关性作图_R绘图：相关性分析与作图

公众号“生信小课堂”TCGA数据分析课程：生物信息学教学相关性分析是我们生信分析中必不可少的技能，单基因的批量相关性分析，可以用于做单基因的GO，KEGG富集分析和GSEA分析，也有多基因之间的相关性分析

知乎剧综·2023-11-29 03:32

探针寻找之旅（5）——拆分长探针到短探针的 python脚本

故事起源，我们想知道35bp序列中有几个15bp的片段，用这些15bp的片段比对到基因组，并统计情况。因此想要写一个python脚本实现由35bp的序列文件生成所有可能包含的的15bp片段序列。

嗒嘀嗒嗒嘀嗒嘀嘀·2023-11-29 03:10

2022计算机系

北京市(10002)中国人民大学院系所专业研究方向考试范围(159)信息学院（专业学位）(085400)(专业学位)电子信息(02)非全日在校学习详情(10005)北京工业大学院系所专业研究方向考试范围

姚天宇~·2023-11-29 03:16

2021-09-09

Nature|从体细胞突变推断胚胎克隆动力学原创存在一棵树图灵基因今天收录于话题#前沿生物大数据分析撰文：存在一棵树IF=49.963推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：探索了334个单细胞集落的全基因组，并针对379

图灵基因·2023-11-29 03:29

多组学结合基因组来增加基因组预测（GP）的准确性

最近参加了EAAP会议，听了OleF.Christensen报告了将多组学数据加入到GP中的报告。image.png其测试的结果是：微生物组(https://doi.org/10.3168/jds.2022-22948)没有帮助提高GS和GP的准确性；但是代谢组也没有提高GS的准确性，但是提高了GP的准确性。代谢组整合到GP的文章最近发表在了GSE上，现在整理出，让我们使用其他组学进行测试和借鉴。

Hello育种·2023-11-29 01:21

【报告笔记】基因组组装的最后挑战-T2T

长读长组装发展2012：三代组装、二代校正；耗资源，适合小基因组，如细菌，4-15%错误率2013：三代组装、三代校正；仍然只适用小的2014：华夏一号（中国人三代参考基因组）2016：Falcon/Falcon-Unzip

生物信息与育种·2023-11-29 01:57

linux系统配置sftp服务器,linux配置sftp服务器配置

linux配置sftp服务器配置内容精选换一换简要介绍miRanda是一种用于寻找microRNA基因组靶标的算法。该算法已用C语言编写，可以作为GPL下的开源方法使用。

foolcage·2023-11-28 20:08

加权基因共表达网络分析 (WGCNA）| 共表达网络模块构建 |生物信息学数据分析必备技能

一、前言1.1概念加权基因共表达网络分析(WGCNA,Weightedcorrelationnetworkanalysis)是用来描述不同样品之间基因关联模式的系统生物学方法，可以用来鉴定高度协同变化的基因集,并根据基因集的内连性和基因集与表型之间的关联鉴定候补生物标记基因或治疗靶点。该分析方法旨在寻找协同表达的基因模块(module)，并探索基因网络与关注的表型之间的关联关系，以及网络中的核心基

小杜的生信筆記·2023-11-28 17:42

莫队（普通莫队，带修莫队，回滚莫队）

（优雅的暴力）（莫队：2010年信息学国家集训队队员莫涛） “离线”和“在线”的概念。在线是交互式的，一问一答；如果前面的答案用于后面的提问，称为“强制在线”。

@小阿宝·2023-11-28 16:09

2021-12-14

NatRev|基因组学中应用机器学习可能遇到的陷阱原创huacishu图灵基因2021-12-1407:03收录于话题#前沿生物大数据分析撰文：huacishuIF=53.243推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：

图灵基因·2023-11-28 16:30

全基因组关联分析GWAS专题1——群体结构

一.GWAS与群体结构（1）群体遗传结构：群体水平大尺度遗传差异，亚群水平等位基因频率差异，不同祖先来源，个体间亲缘关系，家系等不同的群体结构。图1群体结构类型（2）群体结构对GWAS的影响：GWAS的研究对象包括自然群体、种质资源，半同胞家系，混合家系，MAGIC/NAM家系等。自然群体内性状变异和遗传变异丰富，群体内积累许多重组和突变信息，使用GWAS定位的分辨率大大提高；使用人工设计群体进行

felix108·2023-11-28 14:20

DNA 11. 识别肿瘤蛋白质三维结构上突变热点(HotSpot3D)

点击关注，桓峰基因桓峰基因生物信息分析，SCI文章撰写及生物信息基础知识学习：R语言学习，perl基础编程，linux系统命令，Python遇见更好的你125篇原创内容-->公众号桓峰基因公众号推出基于基因组变异数据生信分析教程并配有视频在线教程

90066456ace6·2023-11-28 14:46

小航助学信息学奥赛C++ GoC期末考试试卷（含题库答题软件账号）

需要在线模拟训练的题库账号请点击小航助学编程在线模拟试卷系统（含题库答题软件账号）_程序猿下山的博客-CSDN博客单选题4.0分删除编辑答案:B第1题GoC的编译+运行的快捷键是（）A、F5B、F11C、F8D、F12答案解析：单选题4.0分删除编辑答案:A第2题GoC程序源文件扩展名是（），经过编译后生成的可执行文件扩展名是（）A、CPPEXEB、EXECPPC、CPPBATD、EXECCP答案

程序猿下山·2023-11-28 09:47

基因组组装练习

上GenomeAnnouncements网站（https://mra.asm.org/）找一篇细菌基因组文章；找到文章记载的SRA号；QQ图片20211108211549.pngimage.png从SRA

月时有青天·2023-11-28 05:54

文章被分享的感觉真的很不错

最近在写一些干货类的文章，关注基因组学和生信分析相关的。前几天刚申请的公众号，目前写了2篇了。

基因组学研究生·2023-11-28 02:20

基因家族分析（6）：基因家族顺势作用元件可视化

本文主要工作：对SBT基因家族的顺式作用元件进行可视化4.3顺式作用元件可视化顺式作用元件是位于基因组上的非编码序列，它一般位于基因序列的附近，主要作用是调控基因的表达。

逐鸿·2023-11-28 02:06

《谷物大脑》要点梳理

2、基因组的显著改变需要4万至7万年的时间，所以虽然我们不再被称呼为狩猎者和采集者，但我们的基因还是几万年前的模式。3、确实，现代人比我们的祖先活得长，但是这大部分归功于意外事故和儿童时期存活率

振涛_老鹰中尉·2023-11-27 23:47

metawrap宏基因组数据处理流程（亲测有用）

1.metaWRAP简介MetaWRAP旨在成为一个易于使用的宏基因组数据分析软件包，从头到尾完成宏基因组分析的核心任务：序列质量控制、组装、可视化、分类分析、提取基因组草图（又称分箱binning）和功能注释

不锈铁·2023-11-27 21:44

GDAS004-Bioconductor与基因组级数据分析简介

title:GDAS004-Bioconductor与基因组级数据分析简介date:2019-09-0312:0:00type:"tags"tags:Bioconductorcategories:GenomicsDataAnalysisSeries

backup备份·2023-11-27 15:57

OpenJudge NOI题库 116题

信息学奥赛一本通（C++版）在线评测系统啊哈C语言第7讲3、04输出保留3位小数的浮点数啊哈C语言第7讲3、04输出保留3

dllglvzhenfeng·2023-11-27 12:20

《信息学奥赛一本通 · 编程启蒙 C++ 版》第6课加法、减法和乘法

[例6.1]比赛成绩信息学奥赛一本通-编程启蒙（C++版）在线评测系统[例6.2]捡石头信息学奥赛一本通-编程启蒙（C++版）在线评测系统[例6.3]套盒子信息学奥赛一本通-编程启蒙（C++版）在线评测系统练

dllglvzhenfeng·2023-11-27 12:20

1.6编程基础之一维数组 10大整数加法

1.6编程基础之一维数组10大整数加法OpenJudge-10:大整数加法1168：大整数加法信息学奥赛一本通（C++版）在线评测系统P1601A+BProblem（高精）A+BProblem（高精）-

dllglvzhenfeng·2023-11-27 12:49

【R语言】maftools包计算肿瘤突变负荷（TMB）

相信很多小伙伴都听过肿瘤突变负荷（tumormutationburden,TMB），它是指肿瘤基因组去除胚系突变后的体细胞突变数量。

生信交流平台·2023-11-27 06:13

Paper_5: 子宫内膜癌的蛋白基因组学特征

HighlightsProteogenomicsprovidesnewinsightsintooncogenicsignalinginendometrialcarcinomaGlobalacetylomeandphosphoproteomesurveysidentifynewregulatorymechanismsQKI,circRNAs,andmiRNAsformapotentialfeedba

TOP生物信息·2023-11-27 06:13

【新闻】基因编辑不管是啥，单词要背

1.germlinegenomeediting生殖细胞系基因组编辑germlinen.生殖细胞；genome['dʒiːnəʊm]n.基因组2.embryo['embrɪəʊ]n.胚胎3.outra

大汪小喵·2023-11-27 03:31

基因组与转录组，深入挖掘基因表达信息--03

除性染色体上的基因外，大多数的基因组在雄性和雌性之间是共享的，所以性二态往往是由基因在性别间差异性表达引起的。

百迈客生物·2023-11-27 03:40

一行命令批量修改染色体和位置为RS号

注意以下教程展示的是修改hg19基因组版本的RS号，如果你的数据是其他版本的，请修改为对应版本的数据。

橙子牛奶糖·2023-11-27 00:18

全基因组关联分析学习资料（GWAS tutorial）20210313更新版

同时感谢多年陪伴我成长、一直默默关注我的**「你们」**~by「橙子牛奶糖（陈文燕）」1.前言很多人问我有没有关于全基因组关联分析（GWAS）原理的书籍或者文章推荐。

橙子牛奶糖·2023-11-27 00:17

在没有系谱信息的情况下对热带肉牛进行多品种基因组评估

背景在多品种热带肉牛群体中实施基因组选择一直具有挑战性。如果可以在这些基因组评估的参考群体中使用商业（通常是杂交）动物，则可以允许非常大的参考群体。在热带牛肉系统中，此类动物通常没有谱系信息。

Hello育种·2023-11-26 23:57

组织细胞DNA提取中如何使基因组DNA更容易释放出来

操作步骤：请自行准备：无水乙醇、异丙醇、1.5mL离心管，生理盐水。1取出洗涤液，按70%比例加入无水乙醇，9mL加入21mL无水乙醇，18mL加入42mL无水乙醇，混匀。2.样本处理：A.组织样本：取10-20mg左右的组织，用液氮研磨为粉末，转入1.5mL离心管内，加入100μL生理盐水，振荡15秒（或直接在100μL生理盐水中将组织匀浆为细胞悬液）；B.细胞样本：取1.5mL离心管，直接加入

清风拂面vv·2023-11-26 22:00

Rfam本地安装教程

Rfam简介Rfam是Rfam是用来鉴定non-codingRNAs的数据库，常用于注释新的核酸序列或者基因组序列。

小杜的生信筆記·2023-11-26 20:08

基于Qiime2处理Silva数据库

生物信息学习提示：仅供学习交流使用。

Biostudy-1005·2023-11-26 18:27

QIIME2进阶一_用QIIME2解析序列，诠释生命

本文旨在介绍生物信息学软件QIIME2及其核心组成。2010年，美国科罗拉多大学的RobKnight教授（现单位美国加州大学圣地亚哥分校）团队发布QIIME（发音同chime）分析流程。

环微分析·2023-11-26 18:53

QIIME 2介绍

QIIME2（QuantitativeInsightsIntoMicrobialEcology2）是一个用于分析和解释微生物组数据的开源生物信息学工具。

qq_27390023·2023-11-26 18:51

如何NCBI上传Genbank数据

此处就不再重复了，登录完成后同样点击首页的submit进入即可，进入后往下翻页，看到Genbank提交数据，选择对应的选项即可，根据提交的数据不同，进行选择即可，后续的步骤都是类似的，此处以提交叶绿体基因组为示例

生信阿拉丁·2023-11-26 18:44

Web Scraper 高级用法——利用正则表达式筛选文本信息 | 简易数据分析 17

原文首发于博客园：WebScraper高级用法——利用正则表达式筛选文本信息学习了这么多课，我想大家已经发现了，webscraper主要是用来爬取文本信息的。

sky卤代烃·2023-11-26 17:05

WDL语言入门

WDL最初是由BroadInstitute为基因组分析管道开发的。语法简单，易于表达，能很好的描述流程；且跨平台。GATK首选的pipeline解决方案：WDL+cromwell****。

基因组分析·2023-11-26 15:38

血液DNA提取试剂盒主要特点有哪些？

产品介绍BIOG剂盒采用独特的裂解液配方，可直接从新鲜、冷冻或陈旧的全血中提取高质量的基因组DNA，也可以直接提取得到血液中感染的细菌或转移的肿瘤细胞DNA，省去了一般血液DNA提取试剂盒所需

清风拂面vv·2023-11-26 13:51

纯生物信息学SCI文章好发吗？不好意思，很难了

如我题目所说，这次探讨的问题是纯生物信息学文章好不好发表。纯生物信息学最大的好处就是跳过了基础实验这个最大门槛，省去大量时间和精力，以至于同学们对生信发文的坚信程度达到了无比执着的境地。

医学程序研究·2023-11-26 10:34

信息学奥赛一本通-编程启蒙3007：练3.1 唐诗春晓

3007：练3.1唐诗春晓时间限制:1000ms内存限制:65536KB提交数:12971通过数:7083【题目描述】《春晓》是一首有名的诗，但校园里更流行的孩子们自编的《春晓》。诗如下：春晓春眠不觉晓，处处蚊子咬。夜来嗡嗡声，脓包知多少。【输入】无【输出】输出题目与诗句，其中题目、每句诗句都要换行。【输入样例】无【输出样例】春晓春眠不觉晓，处处蚊子咬。夜来嗡嗡声，脓包知多少。思路：直接输出就好了

ptyz306·2023-11-26 08:56

信息学奥赛一本通1331：【例1-2】后缀表达式的值

1331：【例1-2】后缀表达式的值时间限制:10ms内存限制:65536KB提交数:54713通过数:13547【题目描述】从键盘读入一个后缀表达式（字符串），只含有0-9组成的运算数及加（+）、减（—）、乘（*）、除（/）四种运算符。每个运算数之间用一个空格隔开，不需要判断给你的表达式是否合法。以@作为结束标志。比如，16–9*(4+3)转换成后缀表达式为：16□9□4□3□+*–，在字符数组

ptyz306·2023-11-26 08:19

基因组在动物的实际应用综述

image.png关键点•获取牲畜高维基因组信息的速度正在加快。•基因分型的投资回报取决于生成的信息。•个体动物的基因组信息的用途越来越多。•未来可能涉及（几乎）所有动物出生时的基因分型。

Hello育种·2023-11-26 05:17

CDS和ncRNA的分物种数据库

EnsemblFTP网站(ftp://ftp.ensembl.org/pub/current_fasta)收集了大多数物种的DNA,protein,CDS,ncRNA信息1.DNA不用说，就是基因组信息

bioinfo2011·2023-11-26 02:09

【24择校指南】合肥工业大学计算机考研考情分析

小鹿学姐计算机考研·2023-11-26 01:00

GeNets：发表在nature上的基因组分析网站平台工具

2018年6月NatureMethods上发表了一篇关于机器学习分析特定基因集内部关系工具的文章，简单来说就是，通常我们做了差异基因分析得到一个基因集合，然后会用GO/KEGG富集进行进一步分析，但是该工具给我们提供了另一种可能，通过对差异基因集进行机器学习训练最终得到部分关键的基因以及基因间相互作用。该工具以网站的形式方便大家使用，目前只支持人的基因集输入，笔者输入数据后的运行结果如下图所示，如

斗战胜佛oh·2023-11-26 00:46

推荐频道

基因组信息学