基因组信息学

[文献分享]稻瘟病中的几丁质酶参与水稻免疫

paperAMagnaportheChitinaseInteractswithaRiceJacalin-RelatedLectintoPromoteHostColonizationAbstract水稻稻瘟病的基因组编码
巩翔宇Ibrahimovic·2023-12-30 02:30

小学生C++趣味编程 上机作业 每日一练 第1单元 顺序结构

请将账号及密码记在常用的书籍的上面或者手机上，以免以后忘掉我的主页：http://openjudge.cn/user/741463/二、注册账号并将你的主页记下来洛谷：首页-洛谷|计算机科学教育新生态一本通信息学奥赛一本通
dllglvzhenfeng·2023-12-30 02:57

最少6小时，你达标了吗？

来自：网络该项研究由西班牙马德里国家心血管研究中心的首席研究员、波士顿塔夫茨大学吉恩梅耶乌斯达人类衰老营养研究中心的营养和基因组学主任JoseOrdovas领导的团队完成。
zhaiyz·2023-12-30 02:07

学学这篇免疫浸润文章和作者一样发5+分

Anovelimmune-relatedgenesprognosisbiomarkerformelanoma-associatedwithtumormicroenvironment.在文章中作者构建了基于8个IRGs的黑色素瘤预后分类器模型，而且进行了全面的生物信息学分析
科研菌·2023-12-29 23:21

信息学奥赛一本通基础篇例4.1、例4.2、练4.1、练4.2、练4.3、练4.4答案及自编课后习题

【例4.1】交换两个数的位置【题目描述】现有两个整型变量a和b，分别存放了整数20和22，编程实现交换两个变量里的数，并输出结果。【样例输入】无【样例输出】a=22b=20【代码实现】#include#includeusingnamespacestd;intmain(){inta=20;intb=22;swap(a,b);cout。可以运用为：#includeusingnamespacestd;i
A3024857·2023-12-29 23:36

软件测试计划文档

1.2项目背景项目名称：英雄达拉崩吧项目提出者：Scientific_ZEAL软工小分队开发单位：华中农业大学信息学院。用户：所有喜爱RPG-战旗类的朋友们项目实施单位：S
软件测试果冻·2023-12-29 21:29

2020.9.15丨Chip-seq结果可视化之peak检测（上）

macs2callpeak-tK1_ChIPed_S1_L007_R1.bam-cK1_Input_S5_L007_R1.bam-fBAM-gmm-nK1-B-q0.01-t-c实验组和对照组结果-f输入文件格式-g参考基因组有效大小
穆易青·2023-12-29 19:43

ChIP-seq 数据分析

1ChIP-Seq技术1.1概念1.2ChIP-seq技术原理2ChIP-Seq数据分析2.1数据下载2.2质量控制（data_assess）2.3比对到参考基因组（mapping_analysis）2.4
fengzhibifang·2023-12-29 19:13

ChIP-seq笔记

文章目录ChIP-seq学习1数据下载1.1数据主要分为三个部分1.2从NCBI上下载数据2质量控制2.1软件安装2.2转化数据格式sra-----fastq2.3下载小鼠参考基因组的index2.4质量检测
sunyu_03·2023-12-29 19:43

ChIP-seq 数据分析1 ChIP-Seq技术2 ChIP-Seq数据分析

1ChIP-Seq技术1.1概念1.2ChIP-seq技术原理2ChIP-Seq数据分析2.1数据下载2.2质量控制（data_assess）2.3比对到参考基因组（mapping_analysis）2.4
wx1871428·2023-12-29 19:43

数据原理——1、ChIP-seq

文章目录1、背景介绍2、测序对象：三种类型组蛋白（组蛋白、转录因子、转录调控子）3、测序原理4、检测蛋白质与DNA序列的结合峰（1）测序片段匹配到参考基因组（2）检测峰（2）提高峰质量5、影响ChIPseq
很酷的女超人·2023-12-29 19:12

CHIP-Seq数据分析流程

文章目录CHIP-Seq数据分析流程相关软件安装数据下载将SRA转化为fastq文件数据质控，过滤数据质控然后进行质控，过滤低质量reads，去接头比对下载小鼠参考基因组的索引和注释文件比对sam文件转
美丽的lemon·2023-12-29 19:41

易基因｜ChIP-seq分析方法：实用的工作流程和高级应用

以下为原文总结分享：一、介绍（Introduction）染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）是表观基因组学研究中的一种主要方法。全基因组的组蛋白修饰分析（如增强子分析和全
易基因科技·2023-12-29 19:40

BED 文件格式 chip-seq m6a数据可视化会用到

bedtools.readthedocs.io/en/latest/content/general-usage.htmlBED格式（BrowserExtensibleDataformat）是一种在生物信息学中广泛使用的文本文件格式
生信小博士·2023-12-29 19:10

360沃通亮相2023年深圳市卫生健康信息学术会议，展示医疗行业商密应用方案

2023年12月15日-16日，深圳市卫生健康信息协会举办主题为“智慧健康引领网络安全护航”的2023年深圳市卫生健康信息学术会议暨“京沪宁深连线”深圳专场，360沃通作为深圳密码领域代表性企业受邀参会
沃通WoTrus·2023-12-29 17:48

【基因组组装】HiC挂载软件以及如何用Juice_box手工纠错？

1.常用HiC挂载软件ALLHiC张兴坦老师专为多倍体和高杂合度物种基因组挂载开发。如果是复杂基因组，肯定是首选。对于简单基因组，我跑了下，结果不佳。
生物信息与育种·2023-12-29 08:42

第二章 癌症的本质

在多细胞生物中，绝大多数的细胞内都含有完整的生物体基因组，其所包含的信息量大大超过了任何一个细胞本身的存活所需。
白鸽坐飞机·2023-12-29 05:05

内容聚合产品在东南亚市场的创业内幕 | Google Play 开发者中文播客节目

本期嘉宾image王思达，BuzzBreak创始人兼CEO，资深Android开发者，信息学竞赛
谷歌开发者·2023-12-28 21:49

Scratch少儿编程：培养孩子的编程思维，为信息学奥赛做准备

6547网将探讨如何通过Scratch少儿编程培养孩子的编程思维，为信息学奥赛做好准备。一、Scratch少儿编程简介Scratch是一款由麻省理工学院（MIT）开发的图形化编程工具，其核心理念是
@小码农·2023-12-28 19:08

【文献速度】综述-空间组学分析:平台、应用及分析工具

基因组测序、蛋白质组学等分子图谱技术已经改变了生物医学研究，但这些技术大多需要组织分离，导致组织形态和空间信息的丢失。
六博说·2023-12-28 14:50

物质与意识的连接 二

但人类基因组研究发现，颠覆了这一概念。科学上普遍认
时光波·2023-12-28 14:45

炮炮面试——经典面试问题汇总

我叫XXX，今年25岁，目前是XXX大学电子信息学院研三的一名学生，面试岗位是前端研发工程师。
大炮不想学习·2023-12-28 13:18

贪心算法综述

贪心算法综述引言贪心算法的基本概念贪心算法的定义贪心算法的选择性质贪心算法的流程贪心算法的实现过程贪心算法与动态规划贪心算法模型背包问题单源最短路径问题贪心算法的问题贪心算法的优缺点经典贪心算法普里姆算法普里姆算法概览算法简单描述Kruskal算法Kruskal算法概览算法简单描述Dijkstra算法Dijkstra算法思想Dijkstra算法步骤引言近年来的信息学竞赛中
bigplipli·2023-12-28 13:04

人工智能的积极意义

通过分析大量的医学图像、病例数据和基因组数据，人工智能
人工智能卡贝·2023-12-28 11:47

文献阅读1

我们认为，TEs的固有遗传特性及其与宿主的相互冲突的关系促进了其在不同基因组中调节功能的补充。我
黑森林深处的小星星·2023-12-28 11:43

经典sql练习题（oracle版）

用到的表信息学生信息表Student(Sid,Sname,Sage,Ssex)Sid学生学号,Sname学生姓名,Sage出生年月,Ssex学生性别课程表Course(Cid,Cname,Tid)Cid
ysmlgr·2023-12-28 09:55

NCBI线下blastn-short比对

ncbi的BLAST比我想象中的要强大，用普通blastn貌似不能将basepire数小于50的序列比对到基因组。像我，想将一些15bp的序列比对到基因组上做统计。
嗒嘀嗒嗒嘀嗒嘀嘀·2023-12-28 03:33

NGS010 测序数据质控

Depth：测序深度Mappingratio：比对率，有两种计算方式，及reads/baseGCbias：GC含量分布，正常人基因组GC含量约为40%-60%Insertsize：插入片段大小
caoqiansheng·2023-12-28 02:24

SCAU课堂 | 「比较基因组分析」专用 Docker 镜像

具体覆盖了比较基因组分析的大部分内容。基因家族聚类和物种树获取物种分歧时间基因家族扩展与收缩分析WGD分析（基于Ks
生信石头·2023-12-28 01:32

Huggingface 超详细介绍

10年+软件研发及数据处理经验，关注机器学习，机器人技术，自动驾驶，医疗信息学等方面Huggingface起初是一家总部位于纽约的聊天机器人初创服务商，他们本来打算创业做聊天机器人，然后在github上开源了一个
baidu_huihui·2023-12-28 01:45

高通量测序的数据处理与分析指北(二)--宏基因组3

博客原文宏基因组宿主去污染在上一篇文章中，详细的介绍了宏基因组如何下载以及如何使用fastp进行质控，本篇文章主要聚焦于如何对宿主污染进行去除。
lantary·2023-12-27 23:49

转基因泛滥会使人体内出现有害基因吗？（崔永元真的是对的吗？）

@：凉天佳月文章表示，一家英国科学期刊“雪莱遗传学通讯”发表的论文称“在对中国平民阶层进行基因组学研究时发现了在转基因作物中用来促进生长的
凉天佳月·2023-12-27 20:00

HaploMerger2: 从高杂合二倍体基因组组装中重建单倍型

本文只是按照自己的需求翻译了HaploMerger2提供的手册部分内容。HaploMerger2的帮助文档写的非常好，一定要花点时间去读啊！HaploMerger2的分析流程如下重建单倍体组装中的等位基因关系检测并纠正二倍体组装中的错连(mis-join)重建2个单倍型组装进一步对单倍型组装进行桥接检测并移除串联错配补洞图片流程:HaploMerger2的流程图对于如何使用HaploMerger2
xuzhougeng·2023-12-27 17:46

听达尔文有感

进化论是一个一直在发展的科学理论，从达尔文、华莱士、赫胥黎、赖尔、约瑟夫•胡克那个时代开始，后来又经历了动物学、植物学的研究，细胞的研究，遗传现象的发现，DNA分子生物学的发现，基因组、微生物组的研究，
沧海止水·2023-12-27 10:50

云鹏农学实习报告

寒假结束，2月25号，我来到了我实习老师赵彦宏老师的办公室，从此开始了我三个月的实习生活；我自己给自己定的目标有三个：1、在校实习三个月，必须完成毕业论文；2、学习到生物信息学专业知识，自己可以处理数据
8云8·2023-12-27 05:14

2021-12-28

Science|泛基因组分析优化结构变异识别原创图灵基因图灵基因2021-12-2807:03收录于话题#前沿生物大数据分析Giraffe，由加州大学（UC）SantaCruz分校基因组学研究所的科学家开发的一种新的制图算法
图灵基因·2023-12-27 04:32

USACO历年青铜组真题解析 | 2023年12月Candy Cane Feast

记录下USACO（美国信息学奥赛）备考青铜组别比赛学习过程中的题目，记录每一个瞬间。
热爱编程的通信人·2023-12-26 22:15

USACO备考冲刺必刷题 | P2639 Bessie‘s Weight Problem

记录下USACO（美国信息学奥赛）备考学习过程中的题目，记录每一个瞬间。
热爱编程的通信人·2023-12-26 22:40

USACO备考冲刺必刷题 | P2693 Combination Lock

记录下USACO（美国信息学奥赛）备考学习过程中的题目，记录每一个瞬间。附上汇总贴：USACO备考冲刺必刷题|汇总-CSDN博客【题目描述】农夫约翰的奶牛不停地从他的农场中逃出来，导致了很多损害。
热爱编程的通信人·2023-12-26 22:40

USACO历年青铜组真题解析 | 2023年12月Farmer John Actually Farms

记录下USACO（美国信息学奥赛）备考青铜组别比赛学习过程中的题目，记录每一个瞬间。
热爱编程的通信人·2023-12-26 22:40

USACO历年青铜组真题解析 | 2023年12月Cowntact Tracing 2

记录下USACO（美国信息学奥赛）备考青铜组别比赛学习过程中的题目，记录每一个瞬间。
热爱编程的通信人·2023-12-26 22:08

ChIP实验原理精讲

真核生物的基因组DNA以染色质的形式存在。CHIP不仅可以检测体内反式因子与DNA的动态作用，还可以用来研究组蛋白的各种共价修饰与基因表达的
斗战胜佛oh·2023-12-26 13:03

局域网（信息学奥赛一本通-T1391）

【题目描述】某个局域网内有n(n≤100)台计算机，由于搭建局域网时工作人员的疏忽，现在局域网内的连接形成了回路，我们知道如果局域网形成回路那么数据将不停的在回路内传输，造成网络卡的现象。因为连接计算机的网线本身不同，所以有一些连线不是很畅通，我们用f(i,j)表示i,j之间连接的畅通程度(f(i,j)≤1000)，f(i,j)值越小表示i,j之间连接越通畅，f(i,j)为0表示i,j之间无网线连
Alex_McAvoy·2023-12-26 13:56

机器学习中的强学习器：AdaBoost算法详解

错误率与权重更新3.AdaBoost的工作流程3.1初始化权重3.2训练弱学习器3.3更新样本权重3.4构建强学习器4.AdaBoost的优缺点4.1优点4.2缺点5.应用场景5.1图像识别5.2语音处理5.3生物信息学
轩Scott·2023-12-26 11:21

Pilon | 基因组纠错

本次介绍使用Pilon通过引入二代测序数据来对三代基因组进行纠错。
生信百宝箱·2023-12-26 09:11

最详细的HiC-Pro使用记录及结果解读

HiC-Pro是2015年发表的一款处理Hi-C数据用来辅助组装基因组的
吕强强学生信·2023-12-26 08:16

1.1信息与信息的特征

信息与信息的特征一、什么是信息三种典型观点信息学奠基人香浓：信息是“用来消除不确定的东西”。控制论奠基人维纳：信息是区别于物质与能量的第三类资源。
梦紫霄·2023-12-26 07:26

R语言处理缺失值之naniar包

获取更多R语言和生信知识，请欢迎关注公众号：医学和生信笔记医学和生信笔记公众号主要分享：1.医学小知识、肛肠科小知识；2.R语言和Python相关的数据分析、可视化、机器学习等；3.生物信息学学习资料和自己的学习笔记
医学和生信笔记·2023-12-26 06:14

自律相关概念之认知飞轮

物理学找到了原子，生物学找到了细胞和基因，信息学找到了比特，那么“认知”的基本颗粒就是“认知飞轮”。“认知飞轮”由感知、认知、决策以及行动这四
奔跑的红豹子·2023-12-25 23:27

这个只需一步就可做富集分析的网站还未发表就被CNS等引用超过350次

专门为生物学者设计的基因富集分析网站image一、Metascape简介Metascape（http://metascape.org/）是一个功能强大的基因功能注释分析工具，能帮助用户将当前流行的生物信息学分析方法应用到批量基因和蛋白质的分析中
生信宝典·2023-12-25 22:07
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