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基因组学
心血管疾病药物不良反应不容忽视,华大基因基因检测辅助降低风险!
在此趋势下,华大基因基因检测基于药物
基因组学
的药物选择和个性化用药方案,为心血管疾病患者的临床治疗提供了新机会,同时可以更好地帮助患者控制心血管疾病,提高药物使用的安全性和有效性,实现优化剂量、增强疗效
ZAKER科技动态
·
2023-10-30 04:15
ajax
2022-07-30
NatComm|更大时空背景下的病原体研究:古代和现代鞭虫种群
基因组学
原创图灵基因图灵基因2022-07-3009:30发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学机制来自WellcomeSanger研究所、哥本哈根大学和其他机构的研究人员报告说
图灵基因
·
2023-10-29 17:40
如何做GWAS关联分析
GWAS的出现为全面系统地研究
基因组学
掀开了新的一页,目前主要应用于人类疾病复杂性状的分析,已鉴定出大量与人类复杂疾病或数量性状相关的遗传变异,成为研究人类
基因组学
的关键手段。在植物基因组中的研究
组学大讲堂
·
2023-10-27 15:39
宏
基因组学
研究—宏基因组Reads的组装与分类/分箱
1.高通量测序是探索宏
基因组学
研究的一个工具1.1与参考基因组进行Mapping来重构宏基因组Reads许多微生物未被分离,数据库中无相关信息;利用宏基因组Reads与当前已知数据库进行比较分析,可以对数据产生新的理解
JarySun
·
2023-10-26 09:10
基因组学
5-利用faSomeRecords根据基因ID提取基因序列
安装从该网址下载其安装脚本:http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/我一般都是保存在bin目录下,cd到该目录运行命令行:$chmod+xfaSomeRecords#赋予文件可执行权限,为Linux系统下执行写到环境变量echoexport"PATH=~/bin/faSomeRecords/:$PATH">>~/.bashrc.~
blue_unique
·
2023-10-24 07:31
学习小组Day7——林瑶
一代测序(Sanger测序):利用双脱氧核苷酸ddNTP去摸索DNA分子二代测序构建DNA文库上样桥式PCR测序名词结构化
基因组学
(核酸序列分析)转录组学(基因表达分析)蛋白质组学代谢组学Day7.png
瑶_4ff9
·
2023-10-23 05:18
8+ 基因与疾病百年研究进展
随着技术的不断进步,
基因组学
领域发
概普生信
·
2023-10-22 18:12
生信教程 | 基于PSMC估计有效群体大小
它最初于2011年发布,现已成为
基因组学
领域非常流行的工具。在本教程中,我们将逐步完成为PSMC生成必要的输入数据的步骤,并在发布的猛犸象数据上运行它。
冷冻工厂
·
2023-10-20 07:20
程序人生
跟着Nature Communications学作图:R语言ggplot2做堆积柱形图展示群体
基因组学
的结果
Genomicinsightsintolocaladaptationandfutureclimate-inducedvulnerabilityofakeystoneforesttreeinEastAsiahttps://www.nature.com/articles/s41467-022-34206-8#Sec23完整的数据分析代码涉及到群体
基因组学
作图数据
小明的数据分析笔记本
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2023-10-17 21:23
美国计算机生物学要求,美国研究生生物信息学与计算生物学学校列表
QuantitativeandComputationalBiologyPhD自然科学部生物信息学与计算生物学Bioinformatics&ComputationalBiologyMS、PhD计算机科学系2生物信息学与
基因组学
琉璃与大大
·
2023-10-16 10:42
美国计算机生物学要求
生物信息学研究方向
目录一、生信的两个大类研究方向:前者偏理论,后者偏向证明第一类研究方向:第二类研究方向:二、具体的研究方向1、序列分析2、计算进化生物学3、生物多样性的度量4、蛋白质结构预测5、蛋白质表达分析6、比较
基因组学
conch0329
·
2023-10-16 10:02
生物信息学
生物
生物信息
二代测序文库构建-概述与挑战(1)
高通量测序又称NGS,重新定义了
基因组学
研究。近年来,NGS技术稳步发展,伴随着成本下降以及测序应用呈指数增加。
Juan_NF
·
2023-10-13 03:49
GeneWalk 基因通路分析
高通量功能
基因组学
的分析每次能得到成百上千的基因和大量的通路,要在这大量的基因和通路里分析出生物学意义上更重要的部分很依赖于个人的经验和知识,尤其是许多的基因都是多功能的。
BeeBee生信
·
2023-10-12 11:51
植物基因组测序二十年:成就与挑战
第一批拟南芥和水稻基因组论文的引文树显示了植物
基因组学
的重大发展和植物基因组使植物生物学所有学科在过去20年的复兴。构建接近完整的基因组、组装复杂基因组和构建参考泛基因组
Bioture
·
2023-10-08 11:01
三维基因组 【一】
转自:https://blog.csdn.net/u011262253/article/details/111691514随着
基因组学
研究的发展,由结构
基因组学
过渡到功能
基因组学
,科学家对于基因组各种元件的功能及其调控关系有了进一步的了解
生信师姐
·
2023-10-08 08:07
北邮人工智能学院刘勇教授实验室,招聘博士后研究人员
图片来自官网因实验室建设需要,实验室现面向国内外公开招聘博士后2名,岗位研究方向为脑影像大数据、模式识别与智能系统、认知神经科学、认知神经影像
基因组学
等相关领域。
我爱计算机视觉
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2023-10-08 01:57
人工智能
微软
qml
css
大数据
hi-c 文献导读-3 Hi-C analysis
文献:Hi-Canalysis:fromdatagenerationtointegration文章首先回顾与论述了3D
基因组学
发展的必然性,以及3C、4C、5C,Hi-C的发展以及Hi-C的基本步骤,这里就不在叙述
小贝学生信
·
2023-10-07 22:05
这些生长在阴道里的细菌,你和她有必要了解
马里兰大学医学院基因组科学研究所的教授兼
基因组学
副主任JacquesRavel说,细菌群落(被科学地称为微生物群或微生物群落)存在于全身,包括阴道内。
文译世界
·
2023-10-04 09:15
基因组学
基因组概论基因组(Genome)指的是细胞内全套染色体及其所携带的全部基因,包括基因序列和基因间序列。C值(CValue):在每一种生物中其单倍体基因组的DNA总量。C值悖论(CValueParadox):生物的C值并不与生物复杂程度(或进化上所处地位)相关。G值悖论(GValueParadox):基因组中全部基因的数目与物种的复杂程度同样没有明显的相关性。病毒基因组:大小从几kb到几百kb不等;
没有眼镜
·
2023-10-03 06:29
19.4.19上海交大单细胞论坛学习
利用单细胞功能
基因组学
分析技术(单细胞RNA-Seq转录组分析、单细胞DNA甲
刘小泽
·
2023-10-02 19:08
BLAST本地比对太慢,不怕用diamond
在宏
基因组学
研究中,又或者你准备做大规模的系统进化的相关研究等等,需要分析了数百万个序列的reads,以确定来自环境的微生物样品的功能或分类学含量,找出对应reads同源的物种。
lakeseafly
·
2023-10-01 18:30
代谢组学常用分析方法
代谢组学是效仿
基因组学
和蛋白质组学的研究思想,对生物体内所有代谢物进行定量分析,并寻找代谢物与生理病理变化的相对关系的研究。
Seurat_Satija
·
2023-09-29 09:40
17-思路清奇:纯生信分析表观
基因组学
和形态学ITH的比较空间分析
一.研究背景肺腺癌(ADC)是肺癌中最普遍的亚型,占所有病例的46%以上。在分子层面上,ADC的特征是具有复杂的基因组格局。最近的研究集中在深入了解基因组和表观基因组改变的后果以及肿瘤异质性在治疗反应和治疗抵抗中的作用。ADC组织病理学生长模式的分析显示广泛的肿瘤内异质性(ITH)。值得注意的是,尽管在许多情况下发现了多种组织学,但主要的组织形态学生长模式(鳞状,腺泡,乳头状,微乳头状,实体状)具
AAA肿瘤信息学王协
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2023-09-25 08:27
计算技术与生物学:应用、挑战与未来
计算生物学在
基因组学
、蛋白质组学、代谢组学等领域有着广泛的应用,对于揭示生物体的复杂性、研究生物系统的运行机
a谷雨c
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2023-09-23 01:02
计算机视觉
计算生物学:理解生命过程的强大工具
计算生物学在
基因组学
、蛋白质组学、代谢组学等多个生命科学领域有着广泛的应用,对于我
a谷雨c
·
2023-09-23 01:02
计算机视觉
宏基因组介绍
广义的宏基因组或宏
基因组学
泛指研究微生物群体组成、功能基因、代谢产物的学科、以揭示微生物组
斗战胜佛oh
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2023-09-22 10:26
AI与医疗保健:革命性技术如何拯救生命
文章目录引言AI的应用领域1.影像识别2.疾病诊断3.药物研发4.个性化治疗AI技术1.机器学习2.深度学习3.自然语言处理4.
基因组学
实际案例1.GoogleHealth的深度学习模型2.IBMWatsonforOncology3
IT·陈寒
·
2023-09-18 14:17
AIGC人工智能
机器学习入门
人工智能
ATAC-seq数据可视化——超简单教程
大家好这里是有时候季更,有时候月更的
基因组学
研究生。上一期记录了ATAC数据从Fastq数据到bam文件的处理脚本。
基因组学研究生
·
2023-09-14 10:55
精选| 2020年2月R新包推荐(第39期)
此次整理了十一个类别,分别为数据、计算方法、
基因组学
、机器学习、数学、医学、科学、统计学、时间序列、效率工具
黄小伟Yeah
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2023-09-14 07:16
3行代码基于python的matplotlib绘制桑基图
比如:在
基因组学
领域,有研究利用桑基图来表示生物分子之间的调控关系。目前多数桑基图软件包(如plotly等)大多数调用了d3.js,它允许提供一些可交互操作,但安装和使用的参数设定有一定不便利。
ProbSimplex
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2023-09-14 03:12
深度学习在医疗保健领域的应用:从图像识别到疾病预测
文章目录深度学习在医学影像识别中的应用1.癌症检测2.病理学图像分析3.医学图像分割深度学习在疾病预测中的应用1.疾病风险预测2.疾病诊断辅助3.药物研发深度学习在个性化治疗中的应用1.
基因组学
分析2.
IT·陈寒
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2023-09-12 13:50
AIGC人工智能
机器学习入门
深度学习
人工智能
2022《Cell》 作物驯化与育种中的整合
基因组学
导读野生植物被成功地驯化为农作物是人类文明的大事件。该过程的成功很大程度上要归功于持续的人工选择。本文总结了过去十年在作物驯化和育种研究中的新发现。作物基因组图谱的构建和众多性状控制基因的功能解析为科研提供了基础信息。在许多植物的研究中都正在应用读取、解读和改造复杂遗传信息的方法来高效地从头设计物种或对野生种进行重新驯化。了解作物微观进化的潜在机制,将其应用于农业生产,或将为未来应对粮食安全方面的
生信师姐
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2023-09-10 21:03
病原宏基因组测序技术(有点乱)
病原宏基因组二代测序(mNGS),是不基于培养,直接从环境/临床样品中提取全部微生物的DNA,利用
基因组学
的研究策略研究环境样品中所包含的全部微生物的遗传组成及其群落功能,可广泛分析
晓佥
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2023-09-09 01:50
Seurat4.0系列教程18:Weighted Nearest Neighbor Analysis(WNN))
同时测量多种模式的数据,也称为多模式分析,代表了单细胞
基因组学
的一个令人兴奋的前沿,迫切需要新的算法来定义基于多种数据类型的细胞状态。
Seurat_Satija
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2023-09-08 07:53
【
基因组学
】使用IGV可视化查看基因组重测序比对结果
写在前面IGV能够将基因组的变异情况可视化,因此广泛应用于
基因组学
的研究中。下面我以windows下的IGV为例,介绍一下IGV在查看基因组变异方面的应用。
巩翔宇Ibrahimovic
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2023-09-08 06:32
2022-07-25
NatRev|单细胞表观
基因组学
揭秘顺式调控元件原创huacishu图灵基因2022-07-2511:03发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文:huacishuIF=59.581推荐度:⭐⭐⭐⭐
图灵基因
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2023-09-06 12:57
好书推荐——病毒宏
基因组学
:方法和指南
今天给大家介绍一部病毒宏
基因组学
方法与指南,该书详细介绍了不同类型样
SYSU星空
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2023-09-04 01:55
轰动学界的Nature重磅进展:生信研究迎来史诗级大爆发
年度人物均授予了CRISPR相关技术的突破,2020年CRISPR技术获得诺贝奖,短短不到十年时间CRISPR技术荣获最高学术荣誉随着高通量生物技术的发展,已经开发了多种组学技术来表征不同但互补的生物信息,包括
基因组学
生信宝典
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2023-09-02 19:30
基于Echarts的大数据可视化模板:大数据医疗服务平台
目录引言大数据在医疗领域的应用ECharts在医疗服务中的作用医疗大数据的应用方向临床决策支持药物研发与安全性监测健康管理与预防流行病监测与公共卫生
基因组学
与个性化医疗医疗保险与费用管理Echarts与大数据可视化
摔跤猫子
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2023-09-02 03:59
Echarts
信息可视化
echarts
前端
vue
大数据
医疗服务
Nature| 论2023年最新“ 颠覆性 ”技术,人工智能在
基因组学
与单细胞直线开挂
一、科研背景生物医学是综合医学、生命科学和生物学的理论和方法而发展起来的前沿交叉学科,基本任务是运用生物学及工程技术手段研究和解决生命科学,特别是医学中的有关问题。机器学习技术能利用复杂的算法在大规模、异质性数据集中进行运行,在生物医学方面、人类基因组项目、癌症全基因组项目、等项目上都表现出了巨大的潜力,收集并分析与医学疗法和患者预后相关的大量数据集或能将医学转化称为一种数据驱动、以结果为导向的学
秀材
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2023-09-01 16:32
机器学习
人工智能
深度学习
GATK4重测序数据怎么分析?上游分析标准流程
重测序是指在
基因组学
研究中,通
生信分析笔记
·
2023-09-01 10:35
后端
Ensembl 简介及其参考基因组
网址https://asia.ensembl.org/index.htmlEnsembl是一个脊椎动物基因组的基因组浏览器,支持比较
基因组学
、进化、序列变异和转录调控的研究。
花色匆匆
·
2023-08-31 14:06
腹部主动脉瘤的重大进展!基因组数据可预测患病风险的新模式!
由斯坦福
基因组学
和个性化医学中心的MichaelSnyde
南博屹生物医学
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2023-08-30 07:20
代谢组学和宏
基因组学
研究不同添加剂对青贮品质的影响
文章标题:Additivesaffectthedistributionofmetabolicprofile,microbialcommunitiesandantibioticresistancegenesinhigh-moisturesweetcornkernelsilage发表期刊:BioresourceTechnology影响因子:9.642百趣生物提供服务:代谢组学+宏基因组研究背景人口增长
09eb862dd2cf
·
2023-08-30 00:17
【珍藏版】热点综述 | 单细胞多组学研究怎么做?
大量的多组学分析,如多维
基因组学
和蛋白质
基因组学
分析,已被证明有利于获得对细胞事件的全面了解。这一优势促进了单细胞多组学分析的发展,使细胞类型特异性基因调控得以检测。单细胞多组学研究怎么做?
尐尐呅
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2023-08-29 17:00
研究生方向高性能并行计算推荐入行吗?
从气候模拟到
基因组学
研究,从金融分析到人工智能应用,高性能并行计算在各个领域都发挥着重要作用。因此,有相关技能和知识的专业人士将受到市场的青睐。技术发展:高性能并行计算领域正处于快速发
猿代码科技
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2023-08-26 05:27
高性能计算
高性能计算
GPU
边缘计算
人工智能
Best practices for analysing microbiomes
比如对近期快速发展的精确序列变异(exactsequencevariants/ESV,详者注:目前更多使用ASV的名称)的方法替代传统基于聚类的OTU分析,整合宏
基因组学
和代谢组学的方法,组成型数据分析问题等方面的近期突破性的进展开展探讨
超人快飞
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2023-08-24 21:18
Slide-tags
Slide-tags:scalable,single-nucleusbarcodingformulti-modalspatialgenomics(Slide-tags:可扩展的、用于多模态空间
基因组学
的单核条形码技术
阿May ♬
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2023-08-23 16:01
人工智能
2020-09-15
改进和发展分析这些基因组并揭示其效用的方法在许多领域都具有重大意义,如比较和功能
基因组学
、进化和生物信息学。
Boowean
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2023-08-21 11:57
学习小组Day4笔记--素还真
二代测序流程图image.png组学分类:
基因组学
:image.png转录组:image.png蛋白组学:image.png代谢组学:image.png
素还真_cf26
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2023-08-20 19:12
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