E-COM-NET
首页
在线工具
Layui镜像站
SUI文档
联系我们
推荐频道
Java
PHP
C++
C
C#
Python
Ruby
go语言
Scala
Servlet
Vue
MySQL
NoSQL
Redis
CSS
Oracle
SQL Server
DB2
HBase
Http
HTML5
Spring
Ajax
Jquery
JavaScript
Json
XML
NodeJs
mybatis
Hibernate
算法
设计模式
shell
数据结构
大数据
JS
消息中间件
正则表达式
Tomcat
SQL
Nginx
Shiro
Maven
Linux
基因组学
健康长寿的秘密
目前,有关长寿的
基因组学
和社会学研究较多,如Kim等研究发现MLH1酶的多态性能够维持基因组的稳定性,进而影响寿命,Sebastiani等基于1055名百岁老人和1267名对照例的
基因组学
研究,检测到影响长寿的多个基因标志
一号秃头女孩
·
2023-04-17 10:18
RegulomeDB和HaploReg数据库:后GWAS时代的数据整合
RegulomeDB和HaploReg数据库提供了将大量
基因组学
数据与非编码突变整合的思路。
BryceBryce
·
2023-04-15 16:26
Genomic Data Science- JHU Course 2 Genomic Data Science with Galaxy 笔记
IntroductionGalaxy是一个公开的
基因组学
分析平台,包含了一系列流程化分析工具,针对质控、组装、注释以及包括Chip-seq、RNA-seq、变异鉴定等常见的组学流程pipeline。
精神秃头生信小伙儿
·
2023-04-15 06:56
分子生物学 第三章 基因、基因组及
基因组学
文章目录第三章基因、基因组及
基因组学
第一节基因1基因认识的三个阶段2基因的特征(1)跳跃基因(2)断裂基因3基因的分类4基因的结构5基因的大小6基因的数目第二节基因组1基因组的概念2噬菌体基因组3细菌基因组以大肠杆菌
丸丸丸子w
·
2023-04-14 02:22
分子生物学
分子生物学
基因
基因组学
大熊猫全基因组研究
大熊猫由于其濒危的地位和特殊的竹子食性受到广泛的关注,科学家们一直致力于研究并试图解决大熊猫危机,寻找影响大熊猫特殊生活习性的特殊基因组成分,本篇综述旨在阐述近十年,从第一个大熊猫基因组发表,到对大熊猫的基因组特征分析、比较
基因组学
AJJDog
·
2023-04-13 14:37
【珍藏版】热点综述 | 单细胞多组学研究怎么做?
大量的多组学分析,如多维
基因组学
和蛋白质
基因组学
分析,已被证明有利于获得对细胞事件的全面了解。这一优势促进了单细胞多组学分析的发展,使细胞类型特异性基因调控得以检测。单细胞多组学研究怎么做?
尐尐呅
·
2023-04-13 07:56
2021-10-26
多模态数据整合推动精准肿瘤学的发展原创风不止步图灵基因今天收录于话题#前沿生物大数据分析撰文:风不止步IF=60.710推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:先进分子诊断、放射学和组织学成像以及编码临床数据的多模式整合为推进精准肿瘤学超越
基因组学
和标准分子技术提供机会
图灵基因
·
2023-04-12 07:50
如何进行高维变量筛选和特征选择(一)?Lasso回归
01模型简介随着海量电子病历的挖掘,影像学、
基因组学
等数据进入医学统计分析,经常会面临对高维变量特征选择的问题,Lasso回归是在线性回归模型的代价函数后面加上L1范数的约束项的模型,它通过控制参数lambda
小易学统计
·
2023-04-12 03:24
国宝吃竹子并非发自内心-比较
基因组学
分析揭示大熊猫“心路历程”
今天就从比较
基因组学
的角度解析一下原因。图片基因组获取和同源基因筛选为了实
生信师姐
·
2023-04-11 23:00
GATK-HaplotypeCaller 变异检测详解
1.GATK-HaplotypeCaller简介基因组变异检测是
基因组学
领域一个非常重要的问题,是遗传性疾病溯源,物种进化等分析的前提。
心如止水-WTF
·
2023-04-11 21:07
shell
python
经验分享
Blood (IF 22.1) | 血液病顶刊!组学领军大牛Ruedi利用DIA蛋白组绘制慢性淋巴细胞白血病图谱
最近,包括
基因组学
、表观
基因组学
、转录组学和大量患者的离体药物反应表型在内的综合组学分析提供了对CLL生物学的见解。尽管如此,由于缺少蛋白质表达的数据,生物学分子层面与肿瘤表型的关系仍然部分未知。
中科新生命
·
2023-04-11 14:32
宏
基因组学
研究—宏基因组数据的假设检验
1.宏基因组数据假设检验介绍1.1假设检验在科研中的应用假设检验随着人类微生物研究从技术发展和基础科学发现向转化医学和环境研究的转变,统计假设检验的应用将变得越来越重要。假设检验:一种统计过程,用以确定所收集的数据是否提供了足够的证据来接受一个无效的假设。1.2多少样本才能达到特定效能水平支持组别的差异明确四个问题:1)生成数据的分布是什么?2)效应值(Effectsize)有多大?3)什么样的检
JarySun
·
2023-04-11 13:32
A Paper A Week 2021-10-11
大家好,本周给大家分享的是一篇2020年6月2日发表在CellHostandMicrobe上使用比较
基因组学
解析毛螺菌科分离株之间的功能和基因组变异并揭示其种间和种内的物种多样性的文章。
ZMQ要加油呀
·
2023-04-10 14:36
【分享NVIDIA GTC 23大会干货】加速生成式AI在生物学和医疗领域的应用
在生物学和医疗领域的应用1.NVIDIA医疗领域AI计算平台——NVIDIACLARA2.NVIDIACLARA医学影像子平台——MONAI3.NVIDIACLARA医疗设备子平台——Holoscan4.NVIDIA
基因组学
解决方案
L1_Zhang
·
2023-04-09 19:22
其他
人工智能
自然语言处理
深度学习
nvidia
GTC
癌症
基因组学
和精准医学的全基因组测序分析
摘要新一代测序仪(NGS)和计算分析的爆炸性进展,使探索大多数癌症类型的体细胞蛋白改变突变成为可能,编码突变数据密集积累。然而,关于非编码区(包括内含子、调控元件和非编码RNA)体细胞突变的信息有限。癌症基因组中的结构变异和病原体仍未得到广泛的探索。全基因组测序(WGS)方法可用于全面探索所有类型的癌症基因改变和帮助我们更好的理解整个景观的司机在癌症基因组变异和突变特征,阐明这些未知基因的功能或临
亦是旅人呐
·
2023-04-09 19:16
从“脱圈”实例看谱系孩子为什么需要做基因检测
美国儿科学会、美国医学遗传学和
基因组学
院以及美国神经病学学会,都建议将基因检测作为谱系儿童的评估工具,目的很明确:寻找病因、预测相关合并症、提供针对性治疗措施、估计生育风险。
椰菜君
·
2023-04-09 05:16
三维和空间
基因组学
时代(上篇)
摘要十多年前,高通量染色质构象捕获(Hi-C)技术的出现开启了三维
基因组学
的新纪元。
Davey1220
·
2023-04-09 03:26
【
基因组学
】水稻常用基因组数据库介绍
水稻常用数据库介绍 近几年随着测序数据量呈井喷式增长,涌现出一大批优秀的数据库。而水稻和拟南芥分别作为植物研究中单双子叶的模式植物,其基因组信息得到了很大程度的挖掘。下面我结合自己对水稻基因组数据库两年多的使用经验,向大家介绍一下常用的水稻基因组数据库。如有不全之处还望大家多多指正。1.RAP-db[RAP-db]:https://rapdb.dna.affrc.go.jp/ 我们知道
巩翔宇Ibrahimovic
·
2023-04-08 19:53
maftools : WES外显子测序数据分析总结、分析、可视化-汇总分析
maftools_2clp02June,2020maftools:总结、分析、可视化MAF文件maftools:总结、分析、可视化MAF文件1简介随着肿瘤
基因组学
的发展,突变注释格式(MAF)正被广泛接受并用于存储检测到的体细胞变异
Seurat_Satija
·
2023-04-07 15:55
Seurat4.0系列教程2:多模式数据联合分析
加载数据能够同时测量来自同一细胞的多种数据类型,称为多模式联合分析,代表了单细胞
基因组学
的一个新的和令人兴奋的前沿。例如CITE-seq能够同时测量来自同一细胞的转录组和细胞表面蛋白质。
Seurat_Satija
·
2023-04-06 09:09
[
基因组学
]使用biomaRt做水稻ID转换及相关信息的填充
水稻的基因号大致分为两类,一类是RAP号,格式为“Os-Chr-g-number”,另一类是MSU号,格式为“LOC_Os-Chr-g-number”。平时做各种分析时,需要你输入的基因号都有指定的要求,因此学习基因的ID转换至关重要。在水稻中有一些网页工具能完成ID的转换,如EnsemblePlants(http://plants.ensembl.org/index.html),RAP-Db(h
巩翔宇Ibrahimovic
·
2023-04-06 03:43
DNA 2. SCI 文章中基因组变异分析神器之 maftools
点击关注,桓峰基因桓峰基因生物信息分析,SCI文章撰写及生物信息基础知识学习:R语言学习,perl基础编程,linux系统命令,Python遇见更好的你80篇原创内容-->公众号前言随着癌症
基因组学
的进步
桓峰基因
·
2023-04-06 01:56
宏
基因组学
研究—纵向微生物组数据分析
1.宏基因组纵向数据的意义1.1纵向数据提供了更多的信息纵向数据从根本上比单点(End-point)数据提供了更多的信息,因为时间系列有两个特殊特征:(a)时间对样本施加了固有的、不可逆的排序;(b)样本具有时间函数的统计相关性。时间系列数据的特征使得人们能够发现关于研究系统的丰富信息,包括短期和长期趋势,甚至系统变量之间的因果关系。然而,时间系列数据的这些特征也使分析复杂化,需要使用适当的计算分
JarySun
·
2023-04-05 17:23
微生物生态学研究中的宏基因组工具
2021年2月,来自美国、荷兰、中国、挪威的多国研究团队在《CurrentOpinioninBiotechnology》发表综述,回顾了从宏
基因组学
的应用中收集到的关于微生物生命的新见解,以及促进探索复杂微生物群落多样性和功能的广泛分析工具
尐尐呅
·
2023-04-05 11:08
本周最新文献速递20210528
故提前发本周的文献速递推文;一文献题目:Interpretingtype1diabetesriskwithgeneticsandsingle-cellepigenomics不想看英文题目:利用遗传学和单细胞表观
基因组学
解析
橙子牛奶糖
·
2023-04-05 11:06
宏病毒组学 | 纽约市废水系统宏病毒组初探
2020年6月16日,纽约大学
基因组学
与系统生物学中心E.Ghedin研究团队在mSystems发表了题为Ini
易基因科技
·
2023-04-05 06:30
宏病毒组学 | 病毒宏基因组相关基金资助项目研究分析
病毒宏
基因组学
(Meta-virome)是在宏
基因组学
理论的基础上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支,是某类样本中所有病毒(virus)或病毒类似物(virus-like-particle
易基因科技
·
2023-04-05 06:50
如何自学生物信息学
什么是生物信息学生物信息学与以往的传统生物学不同,它本身是一个混合体,而且在今天看来它应当还要包含现在的NGS和
基因组学
。
hello~bye~
·
2023-04-04 15:32
生物信息学
生物信息学
一大波生信友好期刊来袭,请注意查收!
2002年创刊的MolecularCancer杂志,在影响因子层面一路高歌猛进,目前IF=27.401,其主要接收靶向治疗、分子与细胞生物学、
基因组学
、遗传学、病理与肿瘤免
概普生信
·
2023-04-04 13:23
2022-01-13
收录于话题#前沿生物大数据分析撰文:huacishuIF=39.391推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:1、作者对来自30名患有原发性或复发性胶质瘤或转移性脑肿瘤的患者队列的93个样本进行了系统和全面的多部门免疫
基因组学
分析
图灵基因
·
2023-04-04 08:13
2022-12-13
TMM|影像
基因组学
:数据融合揭示疾病遗传力原创huacishu图灵基因2022-12-1310:11发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文:huacishuIF=15.272推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点
图灵基因
·
2023-04-04 04:27
基因组学
基本感念
基因组学
基本感念转录本:是由一条基因通过转录形成的一种或多种可供编码蛋白质的成熟的mRNA。
wangchuang2017
·
2023-04-03 18:03
Nature子刊|“二代+三代”宏
基因组学
揭示肠道微生物群的个性化结构变异
2022年,《Naturecommunications》期刊发表的“Short-andlong-readmetagenomicsexpandindividualizedstructuralvariationsingutmicrobiomes”研究论文中,通过建立了ONT三代测序和Illumina二代测序数据混合组装的新方法,表征了来自健康人类的数百个肠道微生物组中结构变异(SV)的精细遗传变异。研
凌恩生物
·
2023-04-01 12:30
比较
基因组学
分析2:基因家族收缩与扩张分析
比较
基因组学
分析目录1:单拷贝基因构建物种树以及计算分化时间2:基因家族收缩与扩张分析3:特异节点富集分析前言上篇推文中介绍到比较
基因组学
分析常用套路的第一步,利用单拷贝基因构建具有分化时间的物种树,补充一点
周小钊
·
2023-03-31 10:16
稳健生物信息学研究的“黄金法则”
当我们利用新的工具和技能来分析
基因组学
数据时,有必要确保我们的方法可重复和稳健,就像实验方法一样。然而,庞大的数据和复杂的分析流程,使得在
基因组学
中实现这一目标变得尤其困难。
沈博士
·
2023-03-28 03:11
开启生信分析之旅的准备工作
生物信息学的主要研究方向包括:
基因组学
-蛋白质组学-系统生物学-比较
基因组学
。本人目前的研究方向主
可乐凉拌皮卡丘
·
2023-03-27 21:04
星迈研究院丨天上一日,人间千年—分子机制揭晓,斯坦福大学斯奈德教授访问杭州,为君解答!
美国国家航空航天局NASA发布“从太空到地球推进个性化医疗”的研究计划,
基因组学
负责人、斯坦福大学遗传学系主任和
基因组学
中心主任—麦克斯奈德教授(MichaelSnyder)介绍科学最前沿。
sensomics
·
2023-03-27 14:58
BioSciTools: bioinformatics desktop software
BioSciToolshttps://bioscitools.github.io基于Java(JDK-11),JFX,R-4.2.0开发的桌面程序,旨在为生物信息学的发展做出新的探索和贡献,实现序列分析、转录组学、
基因组学
benben_miao
·
2023-03-26 21:52
NCBI官方基因组坐标转换工具(一)
NCBI官方基因组坐标转换工具本文转载自网上教程首先强调这是一篇实用贴,做
基因组学
研究的朋友们也许经常会碰到准确获取基因或者某一功能位点在基因组上的位置的问题。
京古
·
2023-03-26 15:19
生信学习Day4笔记--测序--周晓飞
Illumina、ABISOLiD平台)优点:成本低、速度快、准确缺点:读长短、拼接困难、pcr扩增错误高三代SMRT和纳米孔单分子测序优点:pcr无需扩增、超长读长缺点:pcr错误率高二、NGS组学分类1.
基因组学
测序分类
小灰_6edc
·
2023-03-26 14:28
跨组学大数据系列论坛之
基因组学
统计分析方法与应用
高通量组学技术的成熟与发展,实验室检测成本的大幅降低,使在人群中获得各层面跨组学数据(
基因组学
、转录组学、蛋白组学、微生物组学、单细胞组学)成为可能,这为从群体水平上探讨复杂疾病(心血管疾病、肿瘤等)的内在遗传机制提供了重大机遇
秦小琮SK
·
2023-03-26 10:13
公众需要知道的:关于病毒
基因组学
变异和适应进化的知识
一种新型的冠状病毒正在中国武汉蔓延,全球都有报告出患病和死亡的病例。尽管现在已经确定该病毒可以在人与人之间进行传播,但其传播速度和与疾病相关的死亡率仍存在很大的不确定性。面对不断变化的新闻以及未经证实和令人恐惧的报道(特别是关于病毒变异和进化的内容),公众很容易会感到焦虑和困惑。以下内容是为了帮助公众了解科学家在检查病毒序列时正在寻找什么,以及你可以在这些数据中了解什么。病毒“稳定”了吗?这意味着
lakeseafly
·
2023-03-25 11:49
Current Biology | 渐渗是啥子?
在过去的几十年里,
基因组学
的进步改变了我们对物种间基因流动的理解,以及我们对自然界生殖隔离的看法。
生信师姐
·
2023-03-21 12:41
R语言宏
基因组学
统计分析(第四章)笔记之ggplot2
4.3ggplot2简介4.3.1ggplot2和图形语法ggplot2可以用来创建优雅的图形,由于它的灵活,简洁和一致的接口,可以提供美丽、可直接用来发表的图形,吸引了许多用户,特别是科研领域的用户。ggplot2使用grid包来提供一系列的高水平的函数,并将其延伸为图形语法,即独立指定绘图组件,并将它们组合起来,以构建我们想要的任何图形显示。图形语法包含6个主要成分:data,transfor
zd200572
·
2023-03-20 18:22
循环肿瘤细胞 : Circulating Tumor Cell
单细胞蛋白质
基因组学
已经成为CTC研究的新一代技术方法。CTC或许可以作为一种marker来标记特定的肿瘤:有各种各样的仪器和方法来捕获、富集和计数
周运来就是我
·
2023-03-20 12:38
Systematic Biology — 南京农业大学揭示土壤动物代表类群弹尾虫从地上生境向地下生境的过渡演化过程
该研究通过系统发育
基因组学
分析、分歧时
贝瑞科服
·
2023-03-17 14:37
基因组学
系列专栏
基因组学
与人类健康大家好!我是Honglei,欢迎大家来到
基因组学
系列专栏!
宇宙独一无二的我
·
2023-03-16 17:53
【
基因组学
工具】变异注释SnpEff
写在前面在进行
基因组学
研究中,总避免不了对一些SNP和Indel进行分析,如何去注释它们的,就需要用到SnpEff,SnpEff是一个变异注释和预测变异影响(氨基酸和核酸改变)的工具。
巩翔宇Ibrahimovic
·
2023-03-16 16:03
癌症相关
基因组学
大数据库
2021/03/15这里有一些数据库的介绍,极其简单一、High-throughputsequencingdata二、Processedgenomicdata三、CancerTermsAPrimerforAccesstoRepositoriesofCancer-RelatedGenomicBigDatahttps://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1
所以suoyi
·
2023-03-15 12:54
IGV-基因组浏览器
电脑系统:Ubuntu18.04ItegrativeGenomicsViewer(IGV)是由Broad研究院的研究人员开发的一款功能强大的综合性
基因组学
可视化工具,此工具可以让从事生物信息的科研工作者轻松的分析查看多种基因组数据
东风008
·
2023-03-12 15:34
上一页
1
2
3
4
5
6
7
8
下一页
按字母分类:
A
B
C
D
E
F
G
H
I
J
K
L
M
N
O
P
Q
R
S
T
U
V
W
X
Y
Z
其他