异质图神经网络第10页

图神经网络笔记总结

本文的所有图表均来自于https://distill.pub/2021/gnn-intro/图神经网络：GNN首先我们需了解图结构是什么？

wcc8848·2023-10-13 09:12

图神经网络笔记

1.图神经网络介绍近年来，对于图结构的数据，如社交网络中的人际关系、化学中的分子相互作用、三维点云数据以及数据中各个单元之间的结构，研究人员借鉴了卷积神经网络、循环神经网络和深度自编码器的思路，设计了专门用于处理图结构数据的神经网络

抱抱宝·2023-10-13 09:36

KDD 2022 | 图“预训练、提示、微调”范式下的图神经网络泛化框架

©作者|社媒派SMP来源|社媒派SMP本文是SIGKDD2022入选论文“GPPT:GraphPre-trainingandPromptTuningtoGeneralizeGraphNeuralNetworks”的解读。该论文由吉林大学计算机科学与技术学院王英教授课题组完成。本文首次提出“Pre-training、Prompt、Fine-tuning”的概念将下游任务进行重构，使其具有与Prete

PaperWeekly·2023-10-13 07:36

知识图谱04——openGL与ubuntu22.04

跑图神经网络的时候遇到了如下问题libGLerror:failedtoloaddriver:irislibGLerror:MESA-LOADER:failedtoopeniris:/usr/lib/dri

铭....·2023-10-13 07:02

2022-09-01

NatRev丨如何巧妙使用条形码单细胞技术探索癌症异质性原创珍奇图灵基因2022-09-0110:40发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术撰文：珍奇IF：69.800推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本篇综述讨论了细胞条形码技术在癌症研究中的使用

图灵基因·2023-10-12 20:05

Paper_4: 转录编程决定了尤因肉瘤肿瘤内异质性（单细胞水平）

Highlights对EWSR1-FLI1基因融合导致的尤因肉瘤的细胞系进行了时间分辨的单细胞转录组测序EWSR1-FLI1融合癌基因高度特异的转录特征尤因肉瘤中转录组水平异质性的来源EWSR1-FLI1

TOP生物信息·2023-10-12 19:32

R语言地理加权回归、主成份分析、判别分析等空间异质性数据分析

目录专题一：地理加权回归下的描述性统计学专题二：地理加权主成分分析专题三：地理加权回归专题四：高级回归与回归之外在自然和社会科学领域有大量与地理或空间有关的数据，这一类数据一般具有严重的空间异质性，而通常的统计学方法并不能处理空间异质性

天青色等烟雨..·2023-10-12 13:13

A Comprehensive Survey on Graph Neural Networks 2019 ——图神经网络综述

论文地址：https://arxiv.org/pdf/1901.00596.pdf摘要深度学习近年来彻底改变了许多机器学习任务，从图像分类和视频处理到语音识别和自然语言理解。这些任务中的数据通常表示在欧几里德空间中。然而，越来越多的应用程序从非欧几里德域生成数据，并表示为具有复杂关系和对象之间相互依赖性的图。图数据的复杂性给现有的机器学习算法带来了重大挑战。最近，出现了许多关于扩展图形数据的深度学

冉芽·2023-10-12 07:08

Transformer模型 | 基于Spatial-Temporal Transformer的城市交通流预测

文章还提出了一种新的图神经网络，称为spatialtransformer，利用自注

算法如诗·2023-10-12 07:33

4+经典思路，肿瘤+WGCNA+预后模型鉴定预后标志物

乳腺癌（BRCA）是一种发病率较高的异质性疾病，是女性癌症死亡的第二大原因[1

生信风暴·2023-10-11 12:57

图神经网络2:CNN的卷积和池化

CNN常见结构：1.1卷积层1.1.1卷积的定义注意点1:卷积层包括若干个卷积核，每个卷积核都是3维矩阵，其中通道数与输入通道数需保持一致。注意点2:每个滤波器对应一个偏置权重，有N个卷积核则对应N个偏置权重。1.1.2卷积的运算过程：1)feature_size运算公式：2)feature_number运算公式：3)参数数量运算公式：1.1.31✖️1卷积：1.2全连接层1.3池化层：1.3.1

_xuyuanjian_·2023-10-11 10:16

Heterogeneous Edge-Enhanced Graph Attention Network For Multi-Agent Trajectory Prediction(HEATConv)

HeterogeneousEdge-EnhancedGraphAttentionNetworkForMulti-AgentTrajectoryPrediction(HEATConv)摘要多个异质交通参与者的同时轨迹预测对于互联的自动车辆在现实世界中复杂驾驶环境下的安全高效运行至关重要

杰克船长有烦恼·2023-10-11 00:04

Physica A 2020 | 链接预测综述（三）

目录前言[email protected]数据集4.链接预测问题的变化4.1时态网络链接预测4.2二分网络链接预测4.3异质网络链接预测

Cyril_KI·2023-10-11 00:02

【论文翻译 IJCAI-20】Heterogeneous Network Representation Learning 异构网络表示学习

文章目录摘要1引言2异构网络挖掘3异构网络表示3.1异构网络嵌入3.2异构图神经网络3.3知识图谱与属性网络3.4应用4挑战、方向和开源数据4.1未来方向避免设计元路径多感官（Multi-sense）表示异构

林若漫空·2023-10-10 22:21

专栏十二：单细胞空间转录组四种常见的不同整合pipline

harmony的整合力度较弱，强异质性细胞如肿瘤

18kkk·2023-10-10 18:38

CS224W-图神经网络笔记2.1：Properties of Networks and Random Graph Models - 图的四大属性

本文总结之日CS224WWinter2021只更新到了第四节，所以下文会参考2021年课程的PPT并结合2019年秋季课程进行总结以求内容完整课程主页：CS224W:MachineLearningwithGraphs视频链接：【斯坦福】CS224W：图机器学习(中英字幕|2019秋)1引言初步了解一个人，我们通常会问其身高、年龄、体重等信息。那么，要了解一个图Graph我们需要关注哪些信息呢？这就

Epiphron·2023-10-10 11:51

穿越百件价值连城的国宝，梦回千年前古老的华夏大地

诗魔白乐天在散文《除孔戣等官制》中曾有云：“浑金、璞玉，方圭、圆珠，虽性异质殊，皆国宝也。”

薛宝钗的冷香丸·2023-10-09 18:15

07-IF6+:基于核磁、CT、PET数据进行特征选择来筛选头颈癌的分子亚型和预后标志物

一.研究背景头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)是一种常见的异质性恶性肿瘤，每年全球约有50万新发病例，包括口腔、口咽、鼻咽癌、下咽癌和喉癌。

AAA肿瘤信息学王协·2023-10-09 04:15

【文献阅读】【NMI 2022】LocalTransform ：基于广义模板的有机反应性准确预测图神经网络

预测有机反应产物是有机化学的一个基本问题。基于成熟有机化学知识，化学家现在能够设计实验来制造用于不同目的的新分子。但是，它需要经验丰富的专业化学家来准确预测化学反应的结果。为了进一步帮助有机化学家并在数字化学时代实现全自动发现，机器智能可以准确预测有机反应的产物，大大加快新分子的设计过程。最近，已经提出了几种基于机器学习的方法来预测有机反应产物，但仍然需要改进反应预测模型才能达到足够的准确性，与普

HealthScience·2023-10-08 16:46

通证经济系统共性初探

二、贯通性通证经济系统各部分、各部门、各要素的同质、异质、同异交质的自然、人际、心灵、文明之间的相互胶粘、贯洽、交通，即互相渗透，以及由互相渗透的发展，而引起互相转化、

陶庐·2023-10-08 05:52

最新成果展示：p+-GaN/SiO2/ITO隧穿结模型的开发与应用

此外，蓝宝石衬底上的异质外延生长所产生的高缺陷密度还会引起漏电流的产生，而较高的空间电荷复合电流也会增大器件的理想因子。为解决上述问题，天津赛米卡尔科技有限公司技术团体设计并制备了一种具有p+-G

Simucal·2023-10-07 14:47

新成果展示：基于Metal/Ga2O3/GaN混合结构的日盲紫外探测器的设计与制备

该探测器分为Ga2O3吸收层和GaN传输层，如图1（a）和1（b）所示，在无光照情况下，Ga2O3吸收层中的电子浓度被Ni/Ga2O3异质结的内建电场耗尽；如图1（b）和1（d）所示，在有紫外光照情况下

Simucal·2023-10-07 14:47

Graph Wavenet：入门图神经网络训练的demo

1.数据的准备DCRNN的github项目有完整的数据GraphWavenet提供的数据缺少'/data/sensor_graph/adj_mx.pkl'2.engine.train与engine.eval的区别区别仅在于model.train()与model.eval()具体区别见https://blog.csdn.net/qq_43118572/article/details/11861509

43118·2023-10-04 13:19

2021-11-22

NatComm|单细胞克隆跟踪解码癌症异质性原创图灵基因图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制单个癌症患者体内的单个肿瘤细胞表现出与生长、转移和化疗反应相关的不同行为。

图灵基因·2023-10-03 21:29

做一个盗取火种者

在文中，作者指出，要使精彩观念产生，教师可以从以下几点入手：1.接纳异质思维达克沃斯指出，教育就是为学习者提供机会建构知识。

垦读者·2023-10-03 15:43

单细胞转录组学生物标志物和靶点挖掘的新方法

单细胞转录组学（sc-RNAseq）研究，可以更加有效的解释组织的异质性，从单个细胞分辨率来解释更多bulk水平上难以解释的生物学问题。已经广泛用于肿瘤异质性、细胞发育、免疫微环境等课题研究。

felix108·2023-10-03 00:46

torch_geometric获取datasets（解决连不了外网的问题）

，查看数据集下载链接3.2放置到对应文件夹下3.3重新运行之前写的程序4.一点感慨1.torch_geometric.data介绍torch_geometric，简称pyg，是基于pytorch实现的图神经网络库

薛钦亮·2023-10-02 21:41

图神经网络GNN(一）GraphEmbedding

DeepWalk使用随机游走采样得到每个结点x的上下文信息，记作Context(x)。SkipGram优化的目标函数：P(Context(x)|x;θ)θ=argmaxP(Context(x)|x;θ)DeepWalk这种GraphEmbedding方法是一种无监督方法，个人理解有点类似生成模型的Encoder过程，下面的代码中，node_proj是一个简单的线性映射函数，加上elu激活函数，可以

天津泰达康师傅·2023-10-02 16:04

Meta-Learning Based Knowledge Extrapolation for Knowledge Graphs in theFederated Setting

基于采样任务，我们元训练了一个图神经网络框架，该框架可以基于结构信息为未见组件构建特征并为其输出嵌入。实验结果表明，我们

小蜗子·2023-10-02 13:31

2.3 Node2vec（图神经网络笔记）

BFS：广度优先DFS：深度优先描述，当前已从t节点到达V节点，可以选择x1、x2、x3、t任意一个节点dtx=0，从t-v-t,回到原点dtx=1，还是说从t出发，离t节点距离为1，有z、x1节点dtx=2，还是说从t出发，离t节点距离为2，有x2、x3节点d节点长度γ游走次数l随机游走长度k窗口数量q小，深度优先p小，广度优先

hlllllllhhhhh·2023-10-02 09:50

理解图神经网络

入门介绍直观了解图神经网络https://theaisummer.com/Graph_Neural_Networks/入门文献:AcomprehensivesurveyonGraphNeuralnetworkAgentleIntroductiontoDeeplearningforGraph2020GraphMachinelearning

魏清宇·2023-10-02 03:37

Graph Neural Networks for Social Recommendation

GraphNeuralNetworksforSocialRecommendation1.摘要构建基于图神经网络的推荐系统的三大挑战theuser-itemgraphencodesbothinteractionsandtheirassociatedopinionssocialrelationshaveheterogeneousstrengthsusersinvolveintwographs

ZSCDumin·2023-10-02 01:49

我眼中的群体

这本书以法国大革命为背景，主要的研究对象是异质性的群体，所谓异质性主要指匿名

wangjie_Austin·2023-10-01 04:10

基于图神经网络的电商购买预测

背景先说一下背景，基于电商的用户行为数据，某人的点击行为，做购买预测。有人点很多商品一个不买，也有人点几个商品就买了。其中图中为同一用户的点击行为。有两个数据集，如下所示：yoochoose-clicks.dat：表示用户的浏览行为，其中一个session_id就表示一次登录都浏览了啥东西。yoochoose-buys.dat:表示用户最终购买了啥，里面是标签。1.数据简单处理fromsklear

Cary丿Xin·2023-10-01 02:25

图神经网络（Graph Neural Networks）简单介绍

文章目录图神经网络（GraphNeuralNetworks）简单介绍什么是图神经网络图神经网络的基本概念1.图（Graph）2.邻接矩阵（AdjacencyMatrix）3.图信号（GraphSignal

百年孤独百年·2023-10-01 02:24

思无邪

工作，本来是一种必须，慢慢地成为一种兴趣，异质状态下演化成一种激情。尤其关乎文字，“云胡不喜”的状态才是大忌。

浓茶1220·2023-09-30 20:40

【读书】《乌合之众》体会与书摘

勒庞眼中的群体是失去了异质性而趋于同质性的“精神群体”，这样的群体数量众多，理性欠缺，靠激情和对领袖的信仰本能具有短期内的强大行动力。

伪文中·2023-09-30 07:35

文献(2): 综述_癌症相关成纤维细胞(CAF)的异质性【建议收藏】

上一个单细胞课题做了一些关于CAF的工作，当时就参考了这一篇综述。细胞亚群的解读算是单细胞课题中耗时耗力的内容，非免疫细胞更是如此，因为非免疫细胞的文献比免疫细胞少多了。这一篇综述系统总结了2020年之前单细胞领域CAF的一些工作，值得仔细读读。我个人觉得CAF是TME里面比较有趣的一块内容，欢迎大家在公众号后台留言交流呀~如果需要文献原文和翻译，可在后台直接回复20210309摘要尽管近几十年来

TOP生物信息·2023-09-29 23:49

蛋白质科学中的人工智能

最近在图神经网络、扩散模型和3D几何建模方面的突破使得机器学习可以加速发现新蛋白质。

远洋之帆·2023-09-29 19:10

《论文阅读27》SuperGlue: Learning Feature Matching with Graph Neural Networks

LearningFeatureMatchingwithGraphNeuralNetworksCVPR2020veido论文code二、论文简述[参考][参考][参考]三、论文详述SuperGlue：使用图神经网络学习特征匹配本文介绍了

Darren_pty·2023-09-29 18:20

邻接矩阵对称归一化的作用

这样做的主要目的是为了解决在使用邻接矩阵进行图神经网络训练时出现的两个问题：度数偏差和梯度消失。度数偏差指的是一些节点的度数较大，而另一些节点的度数较小。

物物不物于物·2023-09-29 16:46

2022-01-14

01-1409:24收录于话题#前沿分子生物学技术撰文：旧岛望月亮IF=54.901推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：1.突破了传统谱系追踪对大量个体信息的依赖，有助于在干细胞动态变化过程中区分个体内和个体间的异质性

图灵基因·2023-09-29 07:48

Talk | KDD‘23 Best Paper 港中文孙相国：All in One - 提示学习在图神经网络中的探索

他与大家分享的主题是:“提示学习在图神经网络中的探索”，他分享了提示学习基本概念，并介绍了他的团队提出的图模型多任务提示方法。

TechBeat人工智能社区·2023-09-29 05:21

Paper_3: 正常输卵管上皮细胞的单细胞测序揭示了浆液性卵巢癌的非遗传异质性

利用输卵管上皮细胞（FTE）的亚型定义了浆液性卵巢癌（SOC）的分子分型FTE细胞在单细胞水平上的整体描述鉴定了6种分子亚型的细胞类群在1700个高级浆液性卵巢癌（HGSOC）的肿瘤bulk样本中鉴定到了大量非遗传异质性的存在一种间叶细胞含量高的

TOP生物信息·2023-09-29 00:06

单细胞ATAC和RNA测序的结合分析

前列腺癌具有异质性，那些对系统治疗有反应的患者，如果存在某些方法对这些患者进行分层，那将使患者受益。

概普生信·2023-09-28 12:36

[异构图-论文阅读]Heterogeneous Graph Transformer

许多现有的图神经网络（GNNs）主要针对同构图设计，无法有效表示异构结构。HGT通过设计节点和边类型相关的参数来模拟异构注意力，从而允许HGT为不同类型的节点和边保持专用的表示。

SimonChenHere·2023-09-27 18:11

论文阅读：Heterogeneous Graph Contrastive Learning for Recommendation（WSDM ’23）

aaHua_·2023-09-25 22:04

课堂中小组合作的那些事

目前许多专家学者提出的小组分组方法原则是“组内异质，组间同质”（解释见下面）。八字分组

贾小薰·2023-09-25 18:49

“不务正业”的青年刘金银

刘金银的亲友相邻的不理解、不认同，或许源于他们缺乏“异质思维”。没有通过教育改变的农家子弟，打工成为单一化的出路和定型化的

四海之楠·2023-09-25 15:40

17-思路清奇：纯生信分析表观基因组学和形态学ITH的比较空间分析

最近的研究集中在深入了解基因组和表观基因组改变的后果以及肿瘤异质性在治疗反应和治疗抵抗中的作用。ADC组织病理学生长模式的分析显示广泛的肿瘤内异质性（ITH）。

AAA肿瘤信息学王协·2023-09-25 08:27

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