生物医学深度学习实战第11页

NCBI、UniProt、RCSB PDB的部分功能使用（蛋白质晶体结构、蛋白质氨基酸序列、基因序列、序列比对等）

NCBI、UniProt、RCSBPDB三个数据库是在生物医学领域非常重要的数据库。本帖主要为自己学习记录，可供大家学习参考。

笙箫一曲唱元璞·2023-04-15 05:06

PyTorch深度学习实战 | 神经网络的优化难题

即使我们可以利用反向传播来进行优化，但是训练过程中仍然会出现一系列的问题，比如鞍点、病态条件、梯度消失和梯度爆炸，对此我们首先提出了小批量随机梯度下降，并且基于批量随机梯度下降的不稳定的特点，继续对其做出方向和学习率上的优化。01、局部极小值，鞍点和非凸优化基于梯度的一阶和二阶优化都在梯度为零的点停止迭代，梯度为零的点并非表示我们真的找到了最佳的参数，更可能是局部极小值或者鞍点，在统计学习的大部分

TiAmo zhang·2023-04-14 13:19

奥林巴斯显微镜UIS2无限远光学系统的结构图

在过去的10年中，主要的显微镜制造商基本上都迁移到研究级生物医学和工业显微镜都无限远校正光学系统的利用率。

a888188·2023-04-14 04:26

MolTrans: Molecular Interaction Transformer for drug–target interaction prediction

1.Introduction随着大量生物医学数据和知识的收集与利用以及在许多应用领域取得巨大成功的深度学习技术的进步，药物发现过程，特别是DTI预测得到了显著增强。

NLP菜鸟·2023-04-14 02:07

7月AI第一会：遍阅医疗人工智能，谁执牛耳？

由浙江生物医学工程学会放射学专业委员会主办、浙江大学医学院附属第二医院承办，医学人工智能联盟协办的第五届钱江国际影像论坛在杭州开元名都大酒店隆重召开。

weixin_34088583·2023-04-13 21:55

心理治疗为何难以在精神科医院壮大发展？

1977年美国医生恩格尔在“科学”杂志上发表文章“需要新的医学模式—对生物医学模式的挑战”，批评了生物医学模式“还原论”和“心身二元论”的局限，并提出了“生物-心理-社会医学模式”的概念。

心身合医·2023-04-13 15:05

2021-10-26

数据工程、异构数据分析的计算方法和生物医学研究中协同数据模型的实例化的共同努力是成功的必要条件。将互补的数据模态与新

图灵基因·2023-04-12 07:50

文档级关系抽取介绍

GDA是生物医学领域的一个大规模数据集，它包含29192篇文档以供训练，其任务是预测基因和疾病概念之间的二元相互作用。

舒语---依依·2023-04-12 01:11

Python深度学习实战PyQt5窗口切换的堆叠布局示例详解

本文以堆叠窗口控件为例，详细介绍堆叠布局的界面设计和程序实现过程，通过案例带小白创建一个典型的堆叠布局多窗口切换程序软件项目中经常需要多种不同的图形界面，以适应不同的任务场景。选项卡控件（QTackedWidget）通过标签选择打开对应的对话框页面，不需要另外编程。堆叠窗口控件（QStackedWidget）在主程序中通过编程来控制显示的图形界面，相对比较复杂，但也更加通用和灵活。1.堆叠布局简介

Prince_Treasure·2023-04-11 03:27

PyTorch深度学习实战 | 基于线性回归、决策树和SVM进行鸢尾花分类

鸢尾花数据集是机器学习领域非常经典的一个分类任务数据集。它的英文名称为IrisDataSet，使用sklearn库可以直接下载并导入该数据集。数据集总共包含150行数据，每一行数据由4个特征值及一个标签组成。标签为三种不同类别的鸢尾花，分别为：IrisSetosa，IrisVersicolour，IrisVirginica。对于多分类任务，有较多机器学习的算法可以支持。本文将使用决策树、线性回归、

TiAmo zhang·2023-04-10 15:03

不同性格的人

合适这种个性的职业包括电工、牙医、外科医生和生物医学工程师。二、探究型：他们擅长剖析，头脑灵敏，具备科学肉体。在做决议前普通喜欢搜集大量信息，对没有合理数据支持的观念提出质疑。

郭敏_中·2023-04-10 14:04

生物医学研究和临床应用中单细胞RNA-seq数据分析指南

单细胞RNA测序(scRNA-seq)在生物医学研究中的应用，提高了对疾病发病机制的认识，并为新的诊断和治疗策略提供了有价值的见解。

Evil_Genius·2023-04-09 23:55

深度学习实战23(进阶版)-语义分割实战，实现人物图像抠图的效果（计算机视觉）

大家好，我是微学AI，今天给大家带来深度学习实战23(进阶版)-语义分割实战，实现人物图像抠图的效果。语义分割是计算机视觉中的一项重要任务，其目标是将图像中的每个像素都分配一个语义类别标签。

微学AI·2023-04-09 23:13

PyTorch深度学习实战 | 基于多层感知机模型和随机森林模型的某地房价预测

简介：在现实生活中，除了分类问题外，也存在很多需要预测出具体值的回归问题，例如年龄预测、房价预测、股价预测等。相比分类问题而言，回归问题输出类型为一个连续值，如下表所示为两者的区别。在本文中，将完成房价预测这一回归问题。■分类问题与回归问题区别对于一个回归问题，从简单到复杂，可以采取的模型有多层感知机、SVR、回归森林算法等，下面将介绍如何使用这些算法完成这一任务。01、使用MLP实现房价预测首先

TiAmo zhang·2023-04-09 20:11

[数据库]常用生物医学数据库与分析软件介绍

参考资料：https://max.book118.com/html/2017/0727/124711768.shtm先前在哈尔滨医科大学生信培训资料里看到了一张这样的总结图，感觉还不错，它简单的整理生物信息相关的一些数据库,这里把它推荐给大家：它包含核算数据库、蛋白数据库、表达数据库、遗传变异数据库、功能通路数据库、转录调控数据库、疾病表型数据库、新一代测序数据库、整合数据库、其他数据库常用生物医

郑宝童·2023-04-09 13:31

PyTorch深度学习实战 | 预测工资——线性回归

通过员工工作年限与工资的对应关系表，找出二者之间的关系，并预测在指定的年限时，工资会有多少。01、训练流程1●场景说明通过员工工作年限与工资的对应关系表，找出二者之间的关系，并预测在指定的年限时，工资会有多少。可以看出，这是一个用工作年限预测工资的简单线性回归问题。

TiAmo zhang·2023-04-09 06:40

五下第15周（5.23-5.29）

本周，我们聆听了瑞思德生物医学集团带来的防疫讲座，进行了劳动技能大比拼，交流着儿童节的游戏，细数着毕业前的十个心愿。

青岛中学海螺教室·2023-04-08 19:05

PyTorch深度学习实战 | 搭建卷积神经网络进行图像分类与图像风格迁移

PyTorch是当前主流深度学习框架之一，其设计追求最少的封装、最直观的设计，其简洁优美的特性使得PyTorch代码更易理解，对新手非常友好。本文为实战篇，介绍搭建卷积神经网络进行图像分类与图像风格迁移。1、实验数据准备本文中准备使用MIT67数据集，这是一个标准的室内场景检测数据集，一共有67个室内场景，每类包括80张训练图片和20张测试图片，大家可以登录http://web.mit.edu/t

TiAmo zhang·2023-04-08 17:03

Nature专栏：博士生合理管理时间，走出泥潭

她在美国加州大学圣地亚哥分校攻读生物医学科学博士，目前是第4个年头，她已经共同发表了一篇Nature论文和一篇Nature子刊论文。Maya对科研很是着迷。

Datawhale·2023-04-08 06:34

活动报名丨ChatDoctor：基于LLaMA在医学领域知识上微调的医学对话模型

智源社区·2023-04-07 21:04

2022-09-22

NatMed|多模态生物医学人工智能原创huacishu图灵基因2022-09-2216:26发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文：huacishuIF=87.241推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：1、

图灵基因·2023-04-07 06:53

04 | 药物投送系统：怎么精准地找到杀伤目标？

这种工具在武器领域就是大炮轰炸机和精确制导的导弹，在生物医学领域就是药物投送系统。1.1、把药品口服下去，或者把液体药物注射到人体的肌肉或者血管里，就是一套古老的药物投送系统，这当然是非常粗糙的。

瞰川·2023-04-06 10:58

深度学习实战——卷积神经网络/CNN实践(LeNet、Resnet)

第一章深度学习实战——不同方式的模型部署（CNN、Yolo）_如何部署cnn_@李忆如的博客第二章深度学习实战——卷积神经网络实践目录系列文章目录一、实

@李忆如·2023-04-05 14:25

Python深度学习实战PyQt5布局管理项目示例详解

本文具体介绍基本的水平布局、垂直布局、栅格布局、表格布局和进阶的嵌套布局和容器布局，最后通过案例带小白创建一个有型的图形布局窗口布局管理就是管理图形窗口中各个部件的位置和排列。图形窗口中的大量部件也需要通过布局管理，对部件进行整理分组、排列定位，才能使界面整齐有序、美观大方。1.从绝对定位到布局管理1.1什么是布局管理布局管理就是管理图形窗口中各个部件的位置和排列。网站、报纸要对发布的文章设置栏目

Prince_Treasure·2023-04-05 00:26

《PBL黄金法则》2.03 第二章什么是PBL的黄金法则？—— 医学教育与问题式教学

他们还受到传统医学院课程的困扰，这种方法强调记忆分散的生物医学知识，而不是整合成医生需要掌握的知识、技能和品格。他们想尝试一种新的教学方法。

PBL课栈·2023-04-04 17:24

深度学习 - 基本网络篇

2RNN(RecurrentNeuralNetwork)1、普通RNN深度学习实战教程(五)：循环神经网络特点：输入不仅有当前的，还有上一时刻的输出；考虑的是时间轴上的关系。

aaa小菜鸡·2023-04-04 13:51

外泌体顶刊综述 | Science：外泌体的生物学、功能和生物医学应用

2020年初，外泌体领域的顶级专家RaghuKalluri和ValerieS.LeBleu在Science发表综述，详细总结了外泌体的生物发生、异质性、功能以及在生物医学中的应用。

尐尐呅·2023-04-04 11:02

Pytorch深度学习实战3-7：详解数据加载DataLoader与模型处理

目录1数据集Dataset2数据加载DataLoader3常用预处理方法4模型处理5实例：MNIST数据集处理1数据集DatasetDataset类是Pytorch中图像数据集操作的核心类，Pytorch中所有数据集加载类都继承自Dataset父类。当我们自定义数据集处理时，必须实现Dataset类中的三个接口：初始化def__init__(self)构造函数，定义一些数据集的公有属性，如数据集下

Mr.Winter`·2023-04-04 11:31

2020-02-19考研常识：五类数学的区别（三）

选用数学一、数学二、数学三或招生单位自命题理学数学的专业学硕：理学门类下4个一级学科(力学、电子科学与技术、环境科学与工程、生物医学工程)专硕：无选用数学一、数学二、数学三、“工业设计工程”自命题科目或生物化学的专业学硕

邹老师么么哒·2023-04-03 20:41

PyTorch 深度学习实战 |用 TensorFlow 训练神经网络

为了更好地理解神经网络如何解决现实世界中的问题，同时也为了熟悉TensorFlow的API，本篇我们将会做一个有关如何训练神经网络的练习，并以此为例，训练一个类似的神经网络。我们即将看到的神经网络，是一个预训练好的用于对手写体数字（整数）图像进行识别的神经网络，它使用了MNIST数据集(http://yann.lecun.com/exdb/mnist/)，这是一个经常被用于研究模式识别任务的经典的

TiAmo zhang·2023-04-03 20:19

PyTorch深度学习实战

本专栏分为两大部分，专栏内容如下：第1部分探讨PyTorch与其他深度学习框架的区别。如何在PyTorchHub中下载和运行模型。PyTorch的基本构建组件——张量展示不同类型的数据如何被表示为张量，以及深度学习模型期望构造什么样的张量。梯度下降机制，以及PyTorch如何实现自动微分。利用PyTorch的神经网络（nn）和优化（optim）模块来建立和训练一个用于回归的神经网络的过程。构建一个

雍珑庚·2023-04-03 15:35

PyTorch深度学习实战 | 计算机视觉

深度学习领域技术的飞速发展，给人们的生活带来了很大改变。例如，智能语音助手能够与人类无障碍地沟通，甚至在视频通话时可以提供实时翻译；将手机摄像头聚焦在某个物体上，该物体的相关信息就会被迅速地反馈给使用者；在购物网站上浏览商品时，机器也在同时分析着用户的偏好，并及时个性化地推荐用户可能感兴趣的商品。原先以为只有人类才能做到的事，现在机器也能毫无差错地完成，甚至超越人类，这显然与深度学习的发展密不可分

TiAmo zhang·2023-04-03 14:27

PyTorch 深度学习实战 | DIEN 模拟兴趣演化的序列网络

01、实例：DIEN模拟兴趣演化的序列网络深度兴趣演化网络(DeepInterestEvolutionNetwork,DIEN)是阿里巴巴团队在2018年推出的另一力作,比DIN多了一个Evolution,即演化的概念。在DIEN模型结构上比DIN复杂许多,但大家丝毫不用担心,我们将DIEN拆解开来详细地说明。首先来看从DIEN论文中截下的模型结构图,如图1所示。■图1DIEN模型结构全图这张图初

TiAmo zhang·2023-04-02 23:01

PyTorch深度学习实战 | 猫狗分类

本文内容使用TensorFlow和Keras建立一个猫狗图片分类器。图1猫狗图片01、安装TensorFlow和Keras库TensorFlow是一个采用数据流图（dataflowgraphs），用于数值计算的开源软件库。节点（Nodes）在图中表示数学操作，图中的线（edges）则表示在节点间相互联系的多维数据数组，即张量（tensor）。它灵活的架构让你可以在多种平台上展开计算，例如台式计算机

TiAmo zhang·2023-04-02 15:13

PyTorch深度学习实战 | 基于ResNet的人脸关键点检测

人脸关键点检测指的是用于标定人脸五官和轮廓位置的一系列特征点的检测，是对于人脸形状的稀疏表示。关键点的精确定位可以为后续应用提供十分丰富的信息。因此，人脸关键点检测是人脸分析领域的基础技术之一。许多应用场景(如人脸识别、人脸三维重塑、表情分析等)均将人脸关键点检测作为其前序步骤来实现。本文将通过深度学习的方法来搭建一个人脸关键点检测模型。1995年，Cootes提出ASM(activeshapem

TiAmo zhang·2023-04-02 14:42

深度学习实战22(进阶版)-AI漫画视频生成模型，做自己的漫画视频

大家好，我是微学AI，今天给大家带来深度学习实战22(进阶版)-AI漫画视频生成模型。

微学AI·2023-04-02 12:17

请管理好自己的情绪

所以他们不能再仅仅依靠单纯生物医学模式来治疗这些患者，而应当从生物-心理-社会三个层面去治疗。

陶沐卉·2023-04-02 03:22

《知识演进时，经验靠不住》有感

诺贝尔生物医学奖得主坎德尔（EricKandel）讲过一个故事，有位同行的研究路线最终被发现是条死胡同，毕生努力尽成泡影，极为沮丧。波普尔告诉他，不，你

cenweiwei·2023-04-02 00:38

Tensorflow深度学习实战之(一)--Tensorflow 基本运算机制

Tensorflow基本运算机制本人学习编写有关深度学习的第一篇博客，包括CSDN博客的写法不是很熟悉，所以不要太在意排版的错误，哈哈哈一起学习到内容才是我的初衷，继续加油吧思文！！！该系列专栏所涉及到的Tensorflow配置的环境说明1.CPU版本的Tensorflow==1.13.12.GPU版本的Tensorflow==2.6.2,英伟达显卡驱动CUDA版本==11.6，Python版本=

TORE007·2023-04-01 21:37

Pytorch深度学习实战3-6：详解网络骨架模块nn.Module(附实例)

目录1什么是nn.Module？2从一个例子说起3nn.Module主要方法4自定义网络一般步骤1什么是nn.Module？在实际应用过程中，经典网络结构(如卷积神经网络)往往不能满足我们的需求，因而大多数时候都需要自定义模型，比如：多输入多输出(MIMO)、多分支模型、跨层连接模型等。nn.Module就是Pytorch中用于自定义模型的核心方法。在Pytorch中，自定义层、自定义块、自定义模

Mr.Winter`·2023-04-01 21:18

Pytorch深度学习实战3-2：什么是张量？Tensor的创建与索引

目录1什么是张量？2Pytorch数据类型与转化3张量Tensor的创建3.1类型创建3.2序列转换3.30/1张量3.4对角张量3.5正态张量3.6随机向量3.7线性张量4张量Tensor的索引4.1下标索引4.2条件索引4.3附加控制索引1什么是张量？张量(Tensor)是多维数组结构，在人工智能领域应用广泛，例如输入彩色图片即是3维张量——RGB三维且每维都是二维平面像素矩阵。下面这张表直观

Mr.Winter`·2023-03-31 10:16

等温扩增

通过等温扩增方法生产的扩增子也已被用于构建通用的核酸纳米材料，有望用于生物医学，生物成像和生物传感领域。将

caoqiansheng·2023-03-31 06:53

浙江大学计算机学院最权威的老师,浙江大学计算机科学与技术专业导师介绍：郑能干...

计算机科学与技术学院招生资格类别:硕士生导师研究方向:人工智能嵌入式系统神经信息工程普适计算Email:[email protected]个人简介郑能干，男，1980年生，博士，2002年毕业于浙江大学生物医学工程系

Emmamkq·2023-03-31 04:32

【神经网络深度学习】--语义分割 Unet

Unet的初衷是为了解决生物医学图像的问题，由于效果确实很好后来也被广泛的应用在语义分割的各个方向，如卫星图像分割，工业瑕疵检测等。

图 (TU商兴)·2023-03-30 12:53

CSIG AI前沿技术培训首期开讲，携手百度飞桨走进北科大开启深度学习实战

活动以北京科技大学为第一站，携手百度飞桨围绕「深度学习实战」开展主题培训。CSIG理事长、湖南大学王耀南院士，北京科技大学副校长张卫冬，北京科技大学计算机与通信工程学院党委书记蒋韬，CS

飞桨PaddlePaddle·2023-03-30 08:31

PyTorch深度学习实战 | 典型卷积神经网络

在深度学习的发展过程中，出现了很多经典的卷积神经网络，它们对深度学习的学术研究和工业生产都起到了巨大的促进作用，如VGG、ResNet、Inception和DenseNet等，很多投入实用的卷积神经都是在它们的基础上进行改进的。初学者应从试验开始，通过阅读论文和实现代码（tensorflow.keras.applications包中实现了很多有影响力的神经网络模型的源代码）来全面了解它们。下文简要

TiAmo zhang·2023-03-30 08:51

深度学习实战视频教程+资料全套

─1-9│1、课程：多层感知机DNN.1、浅层网络的问题.mp4│1、课程：多层感知机DNN.2、涌现现象与深度网络为何高效.mp4│1、课程：多层感知机DNN.3、计算图.mp4│1、课程：多层感知机DNN.4、导数的反向传播.mp4│2、课程：梯度下降法.1、梯度下降的直观例子（一）.mp4│2、课程：梯度下降法.2、梯度下降的直观例子（二）.mp4│2、课程：梯度下降法.3、梯度下降的代码实

globals_11de·2023-03-30 06:32

护肤最佳时间表

巴塞罗那生物医学研究所研究表明，皮肤在一天一次的昼夜更替中，如果干细胞匮乏，那么细胞就很有可能提前衰老，即肌肤的周期性更替模式可以修复细胞受到的损伤。

DRDING2019·2023-03-29 22:34

CBLUE: A Chinese Biomedical LanguageUnderstanding Evaluation Benchmark

AChineseBiomedicalLanguageUnderstandingEvaluationBenchmarkpaper:https://arxiv.org/pdf/2106.08087摘要人工智能(AI)，随着生物医学语言理解的最新进展

发呆的比目鱼·2023-03-29 03:32

动态状态估计 - 卡尔曼滤波 (Kalman Filter)

案例导入：具有动态变化的连续变量的例子物体轨迹跟踪（雷达、声纳、图像、声学）导航控制应用生物医学应用股票预测金融产品的风险评估状态空间（statespace）状态矢量（statevector）状态被定义为预测该系统未来状态所必需的变量的集合

火羽白panda·2023-03-28 09:16

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