第三代测序

单细胞DNA测序方法比较及应用

Lorenz曲线：越接近对角线，测序覆盖越均一Bulk大量细胞测序MDA直接使用DNA聚合酶Phi29扩增均一度：Bulk>MALBAC>MDA3种方法测肿瘤细胞CNV：横轴-染色体序列；纵轴-测序的覆盖深度
6102·2024-09-07 06:26

党旗飘扬 铁人精神不倒

第三代铁人李新民牢记初心，不忘使命，作为一名优秀的共产党员，更好的诠释了新时代的铁人精神。我作为一名新时代党员，要向李新民学习，坚定信念，永不动摇。一、勤学好问以人为师。
AIFree_1ce7·2024-09-07 03:08

Trimmomatic 数据过滤

支持SE和PE测序数据。主要用来去除Illumina平台的fastq序列中的接头，并根据碱基质量值对fastq进行修剪。
生信编程日常·2024-09-06 06:52

Signac::EnhanceCoveragePlot 参考实现流程

它显示了特定基因组区域内测序读取的覆盖度，即每个位置上读取的频率。覆盖度图形对于理解基因组的开放区域、调控元件活性以及染色质状态等方面具有重要作用。通过将多个样本的Coverag
倪桦·2024-09-04 12:23

2022-01-14

Tree_microbiome的博客_CSDN博客-微生物组测序数据可视化,微生物组测序分析领域博主（一）不同分类水平注释结果相对丰富度转化在微生物组测序中我们会从taxa_bar.qvz文件中下载到不同水平
Tree_microbiome·2024-09-03 21:24

解惑深度学习中的困惑度Perplexity

语言模型(languagemodel)可以预测序列(比如一个句子)中每个时间步词元(比如一个句子中的逐个单词)的概率分布，继而计算一个序列的概率。
Axlsss·2024-09-01 20:11

使用clusterProfiler进行GO、KEGG富集分析（有参情况）

寻找差异表达的基因并识别它们的功能，是我们进行RNA测序的最主要目的。
纪伟讲测序·2024-08-31 14:42

论文阅读瞎记(四) Cascade R-CNN: Delving into High Quality Object Detection 2017

网络由一个检测序列组成，这些序列训练时会伴随IOU增长从而对FP样本更加有选择性地判别。检测器一个
码大哥·2024-08-30 15:58

肿瘤免疫微环境/免疫浸润分析

2.计算免疫微环境的常用方法：“实测法”，高精度的单细胞测序，SinglecellRNA-seq等手段。即一
期待未来·2024-08-30 15:02

路由器以及路由原理

第三代路由器：随着互联网的普及，路由器成为了家庭和企业必备
taotao796·2024-08-29 23:43

python调用statsmodels模块实现整合移动平均自回归模型(ARIMA)——以预测股票收盘价为例.md

数据集下载代码分析程序简介调用statsmodels模块对上证指数的收盘价进行ARIMA模型动态建模，ARIMA适合短期预测，因此输入为15个数据，输出为1个数据程序输入：原序列，需要往后预测的个数程序输出：预测序列
爆米LiuChen·2024-08-28 14:28

【好书分享第十期】大模型应用解决方案_基于ChatGPT和GPT-4等Transformer架构的自然语言处理（文末送书）

BERT、T5和GPT等模型现在已成为计算机视觉、语音识别、翻译、蛋白质测序、编码等各个领域中新应用的基础构件。
屿小夏·2024-08-28 14:56

科研盘点丨空间转录组技术在肝脏研究中的应用

哺乳动物的肝脏是维持代谢稳态及解毒的重要器官，单细胞RNA测序技术可以鉴定到大多数肝细胞类型，但如何获取细胞类型在组织上的定位及其基因表达情况，并研究细胞间相互作用及通讯对于增强我们对肝脏发育及疾病发生
晶典教你玩转科研·2024-08-26 23:34

《当人工智能牵手新兴技术：安全挑战与应对之策》

一、人工智能与生物技术结合的安全挑战1.生物数据安全风险人工智能在生物技术领域的应用，如基因测序和分析，产生了大量的生物数据。这些数据包含着个人的遗传信息，一旦泄露，可能被用于非法目的，如遗传歧视
程序猿阿伟·2024-08-25 22:03

Web3入门指南：了解去中心化互联网的基础知识

作为Web的第三代版本，Web3代表了去中心化互联网的未来发展方向。本指南将深入探讨Web3的基本概念、关键技术以及其对未来互联网的影响，帮助读者全面了解这一前沿技术。
清 晨·2024-08-23 15:19

Datawhale AI夏令营第四期魔搭- AIGC文生图方向 task03笔记

如何学习八图ai模型kolors1,Kolors是由快手公司开源的第三代文本到图像生成模型，基于StableDiffusion框架开发。它支持中英文输入，特别在中文内容的理解和生成上表现出色。
汪贤阳·2024-08-22 11:30

3月18日，每日信息差

素材来源官方媒体/网络新闻高通推出第三代骁龙8s移动平台亚马逊将在日本新建一个物流设施北京将发布第一代通用开放人形机器人本体川渝1000千伏特高压交流工程重庆段全线贯通✨下一代锂硫电池或在5分钟内完成充电中国海油在渤海获得亿吨级油田发现第一
信息差Pro·2024-03-25 09:26

如何处理NGS数据中的污染？

本次文章和大家讨论一个大家可能胡遇到很常见的一个问题，在测序中我们很难避免引入一些微生物污染或者人类的污染，例如，我想测序拟南芥，其中由于实验员的操作不够干净，很容易引入一些人类的DNA，又或者该拟南芥的叶子上也混杂着细菌真菌等其他的
lakeseafly·2024-03-18 15:46

隐马尔可夫模型(HMM) ｜前向算法 ｜一个简单的例子说清计算过程 ｜一般步骤总结

如是我闻:本文通过一个简单的例子来详细说明隐马尔可夫模型(HMM)的前向算法我们求解的问题类型是：给定模型及观测序列计算其出现的概率。
漂亮_大男孩·2024-03-16 03:03

高通量测序的数据处理与分析(二)-宏基因组2

博客原文宏基因组数据处理方法数据下载wget下载宏基因组的数据主要分布在两个数据库：1.NCBI的SRA数据库，2.ENA。近年来也有许多研究者将数据上传到中国的数据库：NGDC你可以直接通过网页下载数据，或者是通过各个网站提供的下载工具进行批量下载。也可以到sra-exporter这个网站上输入项目号获得样本的下载链接。用wget或者其他下载工具进行下载，示例的命令如下:wget-cftp://
lantary·2024-03-08 09:58

国家发改委课题组赴合发全球公司总部考察调研

合发全球作为以区块链、人工智能为核心的第三代互联网平台，经过7年多的发展
精彩资讯·2024-03-04 18:26

Code Review、InLineChat、RAG全部独家提供，这波上新CodeGeeX平替Github Copilot稳了！

智谱AI2024年度的技术开放日上，CodeGeeX重磅发布第三代模型。针对CodeGeeX插件产品的系列新功能，也同时上线发布，提供给用户免费使用。
·2024-02-29 09:47

扩增子质控流程多，专属名词来揭晓

在高通量测序王国中，Rawreads（或rawdata）已不陌生，但在扩增子测序的质控数据中还有Rawtags、Cleantags、Effectivetags等一串的专属名词，这些名词代表什么，分析要关注哪些数据
ee00dc6faab7·2024-02-26 16:53

生信工具 | 测序数据质控与过滤 - fqtrim

fqtrimtrimming&filteringofnext-genreadsfqtrim是一个多功能的独立实用程序，可用于去除高通量测序仪产出的测序数据接头，poly-A尾，末端未知碱基（Ns）和低质量
·2024-02-23 02:36

转录组结果和qRT-PCR结果又不一致？！

转录组测序（RNA-seq）将细胞内某一类型（或全部）的RNA逆转录成DNA，通过高通量测序的方法测定其序列并统计其表达水平的一项技术。是检测基因表达变化的通用方法。
Seurat_·2024-02-20 20:22

希腊神话—神王宙斯

我们今天主角第三代神王宙斯是如何成为“天空之神”的呢？上一篇讲到第一代天空神乌拉诺斯被小儿子
醉酒东城01号·2024-02-20 18:17

数字创新潮流：Web3如何引领下一波技术革命

1.Web3的本质Web3，即第三代互联网，是对传统中心化互联网的一次全面升级。它通过引入去中心化技术和加密学的理念，重新定义了用户与数据、应用之间的关系。去中心化的
Roun3·2024-02-20 16:37

继小米机器狗、特斯拉机器人后，小鹏汽车发布智能机器马：真的能骑！

9月7日，小鹏汽车（09868.HK；XPEV.US）正式公布生态企业新成员——深圳鹏行智能研究有限公司（以下简称“鹏行智能”），并发布首款智能机器马第三代原型机。
程序员的店小二·2024-02-20 15:58

二代测序原理（Illumina）

虽然三代测序现在已经商用，但是目前的主流还是二代测序，尤其是Illumina公司的测序方式更是大行其道。那么，下面我们从四个方面来说说illumina家的二代测序是怎么得到的生物数据。
白墨石·2024-02-20 13:10

【动植物研究动态】20220501文献解读

揭示现代油菜遗传改良的基因组学基础Genomicselectionandgeneticarchitectureofagronomictraitsduringmodernrapeseedbreeding基于418份现代油菜种质高深度重测序数据
生物信息与育种·2024-02-20 09:53

10本不容错过的心理学书籍推荐

本书作者马斯洛是现当代全世界最有影响力的美国心理学家、人本主义心理学的主要发起者和理论家，第三代心理学的开创者。本书是其研究人性与社会关系的顶级著作。
发酵菌书单·2024-02-20 08:15

一文带你了解单细胞数据基因集打分的所有算法

上一周Immugent写了一篇一文解决单细胞亚群注释的所有问题，引出了单细胞测序技术的面临的几大未解决的技术难题，其中最主要的一个问题就是由于测序深度不足产生的"dropout"现象。
生信宝库·2024-02-20 00:23

机器学习---HMM前向、后向和维特比算法的计算

HMMimportnumpyasnp#In[15]:classHiddenMarkov:defforward(self,Q,V,A,B,O,PI):#使用前向算法N=len(Q)#状态序列的大小M=len(O)#观测序列的大小
三月七꧁ ꧂·2024-02-19 23:23

两则脐带血相关文献

[精读]一篇单细胞转录组测序分析的文章：Single-cellTranscriptomicLandscapeofNucleatedCellsinUmbilicalCordBlood[泛读]一篇生统分析脐带血的血常规数据的文章
MC学公卫·2024-02-19 18:22

生信学习小组Day7笔记--苏剑请

今日收获大致了解了第一到三代的测序历史、原理和特点深入了解了二代测序的过程，虽然还没能完全看懂以上知识点总结归纳于下面两图（以下知识点均为生信星球公众号提供）：生信Day7笔记1.png生信Day7笔记
苏剑清·2024-02-19 17:29

科研汪的日常 21 科研中的套路与反套路

中等水平的杂志期刊中收录的文章相较水刊的质量会高很多，如XinZong等人在2021年的研究中首先通过对肠上皮细胞样品进行核糖体印迹测序和m6A-seq分析，找到靶分子YTHDF1和Traf6，由后续
007木子·2024-02-19 16:40

今日武器装备分享-瑞典JAS39鹰狮战斗机

JAS39鹰狮战斗机是一种轻型多用途战斗机单发战斗机，与阵风战斗机和台风战斗机并称欧洲三雄，属于第三代战斗机。JAS39鹰狮战斗机由瑞典萨博公司在1980年开始研发，1988年首飞，1996年服役。
上甘岭的旗帜·2024-02-19 15:26

LSTM参数详解

LSTM（长短期记忆网络）是一种特殊类型的循环神经网络（RNN），主要用于处理和预测序列数据的重要模型。
实名吃香菜·2024-02-19 14:38

肠道微生物研究的“法宝”

随着分子测序工具和技术的迅速发展，肠道微生物组在人类微生物组的研究过程中取得了长足的进步。这些发现揭示了在重组和改革疾病病理与药物方面有着非凡未来的可能性。
茗创科技·2024-02-19 13:33

齐派第三代弟子一一一张凭

(齐白石一一→李可染一一→张凭)图片发自App张凭(1934一一2010.03.20)，原名张守道，河南省新乡市人，中央美术学院教授，中国美术家协会会员，享受国务院特殊贡献津贴，李可染大师入室弟子。图片发自App图片发自App图片发自App1951年于新乡市文化馆从事群众美术工作，1962年毕业于中央美术学院中国画系，并拜导师李可染为师，1961年毕业创作《山河咏》。图片发自App图片发自App图
萃雅轩主范成元·2024-02-19 13:29

2019-01-15

一、密码学1、七个世代第一代：隐藏法第二代：移位法和替代法第三代：维吉尼亚加密法第四代：恩尼格玛机第五代：魔王加密系统第六代：RSA加密法第七代：量子加密2、分水岭以计算机为分界，之前为古典密码学，之后为现代密码学
曹鑫鑫_9dc8·2024-02-15 09:56

转录调控研究数据库推荐 | 你要找的ChIP-seq数据都在这里啦！

染色质免疫沉淀、DNase-I超敏反应和转座酶可及性分析结合高通量测序，使染色质动力学、转录因子结合和基因调控的全基因组研究成为可能。
尐尐呅·2024-02-15 04:49

浅谈数字钱包交易系统开发_区块链技术市场应用系统开发

阶段四、第三代数字钱包，是一种看不见，但又确切意义上存在的钱包，可以通过它来
贫穷限制不了我的想象·2024-02-15 03:41

你敢想吗？90%的亿万富翁，毕生积蓄都毁于一件事

据统计，90%成功企业家创造的家族财富会被其家族第三代毁于一旦。虽然这一数据是基于美国和欧洲区域的调查得出的，但同样，该数据在其他区域也会得到相似印证。
KC商盟·2024-02-15 02:49

机器学习---概率图模型（概率计算问题）

1.直接计算法给定模型和观测序列，计算观测序列O出现的概率。
三月七꧁ ꧂·2024-02-14 17:06

2022-12-01

Nature|空间基因组学描绘癌症克隆的结构、性质和进化（2）原创图灵基因图灵基因2022-12-0109:19发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术一种新的空间技术，碱基特异性原位测序（BaSISS
图灵基因·2024-02-14 08:35

单细胞测序最好的教程（一）：质量控制

目前，国内对于单细胞测序分析的教程五花八门，百花齐放，一个合适且准确的pipeline对于分析是很有价值的。
Starlitnightly·2024-02-14 06:18

单细胞测序最好的教程（二）：归一化

由于单细胞测序技术的限制，我们在样本中获得RNA的时候，经过了分子捕获，逆转录还有测序。
Starlitnightly·2024-02-14 06:18

单细胞测序最好的教程（三）：特征基因选择

前言提到，在过去两天的教程中，我们讲解了使用omicverse进行单细胞测序数据的质控以及归一化的一些思想。
Starlitnightly·2024-02-14 06:18

python基因差异分析包_一个生信素人的上道经验分享-转录组测序（差异分析篇）...

原标题：一个生信素人的上道经验分享-转录组测序(差异分析篇)转录组测序技术(RNA-seq)作为目前二代测序领域最普遍的技术手段，自从转录组测序问世以来，已经开发了数百种分析工具。
weixin_39607873·2024-02-14 06:17
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