第三代测序

国家发改委课题组赴合发全球公司总部考察调研

合发全球作为以区块链、人工智能为核心的第三代互联网平台，经过7年多的发展
精彩资讯·2024-03-04 18:26

Code Review、InLineChat、RAG全部独家提供，这波上新CodeGeeX平替Github Copilot稳了！

智谱AI2024年度的技术开放日上，CodeGeeX重磅发布第三代模型。针对CodeGeeX插件产品的系列新功能，也同时上线发布，提供给用户免费使用。
·2024-02-29 09:47

扩增子质控流程多，专属名词来揭晓

在高通量测序王国中，Rawreads（或rawdata）已不陌生，但在扩增子测序的质控数据中还有Rawtags、Cleantags、Effectivetags等一串的专属名词，这些名词代表什么，分析要关注哪些数据
ee00dc6faab7·2024-02-26 16:53

生信工具 | 测序数据质控与过滤 - fqtrim

fqtrimtrimming&filteringofnext-genreadsfqtrim是一个多功能的独立实用程序，可用于去除高通量测序仪产出的测序数据接头，poly-A尾，末端未知碱基（Ns）和低质量
·2024-02-23 02:36

转录组结果和qRT-PCR结果又不一致？！

转录组测序（RNA-seq）将细胞内某一类型（或全部）的RNA逆转录成DNA，通过高通量测序的方法测定其序列并统计其表达水平的一项技术。是检测基因表达变化的通用方法。
Seurat_·2024-02-20 20:22

希腊神话—神王宙斯

我们今天主角第三代神王宙斯是如何成为“天空之神”的呢？上一篇讲到第一代天空神乌拉诺斯被小儿子
醉酒东城01号·2024-02-20 18:17

数字创新潮流：Web3如何引领下一波技术革命

1.Web3的本质Web3，即第三代互联网，是对传统中心化互联网的一次全面升级。它通过引入去中心化技术和加密学的理念，重新定义了用户与数据、应用之间的关系。去中心化的
Roun3·2024-02-20 16:37

继小米机器狗、特斯拉机器人后，小鹏汽车发布智能机器马：真的能骑！

9月7日，小鹏汽车（09868.HK；XPEV.US）正式公布生态企业新成员——深圳鹏行智能研究有限公司（以下简称“鹏行智能”），并发布首款智能机器马第三代原型机。
程序员的店小二·2024-02-20 15:58

二代测序原理（Illumina）

虽然三代测序现在已经商用，但是目前的主流还是二代测序，尤其是Illumina公司的测序方式更是大行其道。那么，下面我们从四个方面来说说illumina家的二代测序是怎么得到的生物数据。
白墨石·2024-02-20 13:10

【动植物研究动态】20220501文献解读

揭示现代油菜遗传改良的基因组学基础Genomicselectionandgeneticarchitectureofagronomictraitsduringmodernrapeseedbreeding基于418份现代油菜种质高深度重测序数据
生物信息与育种·2024-02-20 09:53

10本不容错过的心理学书籍推荐

本书作者马斯洛是现当代全世界最有影响力的美国心理学家、人本主义心理学的主要发起者和理论家，第三代心理学的开创者。本书是其研究人性与社会关系的顶级著作。
发酵菌书单·2024-02-20 08:15

一文带你了解单细胞数据基因集打分的所有算法

上一周Immugent写了一篇一文解决单细胞亚群注释的所有问题，引出了单细胞测序技术的面临的几大未解决的技术难题，其中最主要的一个问题就是由于测序深度不足产生的"dropout"现象。
生信宝库·2024-02-20 00:23

机器学习---HMM前向、后向和维特比算法的计算

HMMimportnumpyasnp#In[15]:classHiddenMarkov:defforward(self,Q,V,A,B,O,PI):#使用前向算法N=len(Q)#状态序列的大小M=len(O)#观测序列的大小
三月七꧁ ꧂·2024-02-19 23:23

两则脐带血相关文献

[精读]一篇单细胞转录组测序分析的文章：Single-cellTranscriptomicLandscapeofNucleatedCellsinUmbilicalCordBlood[泛读]一篇生统分析脐带血的血常规数据的文章
MC学公卫·2024-02-19 18:22

生信学习小组Day7笔记--苏剑请

今日收获大致了解了第一到三代的测序历史、原理和特点深入了解了二代测序的过程，虽然还没能完全看懂以上知识点总结归纳于下面两图（以下知识点均为生信星球公众号提供）：生信Day7笔记1.png生信Day7笔记
苏剑清·2024-02-19 17:29

科研汪的日常 21 科研中的套路与反套路

中等水平的杂志期刊中收录的文章相较水刊的质量会高很多，如XinZong等人在2021年的研究中首先通过对肠上皮细胞样品进行核糖体印迹测序和m6A-seq分析，找到靶分子YTHDF1和Traf6，由后续
007木子·2024-02-19 16:40

今日武器装备分享-瑞典JAS39鹰狮战斗机

JAS39鹰狮战斗机是一种轻型多用途战斗机单发战斗机，与阵风战斗机和台风战斗机并称欧洲三雄，属于第三代战斗机。JAS39鹰狮战斗机由瑞典萨博公司在1980年开始研发，1988年首飞，1996年服役。
上甘岭的旗帜·2024-02-19 15:26

LSTM参数详解

LSTM（长短期记忆网络）是一种特殊类型的循环神经网络（RNN），主要用于处理和预测序列数据的重要模型。
实名吃香菜·2024-02-19 14:38

肠道微生物研究的“法宝”

随着分子测序工具和技术的迅速发展，肠道微生物组在人类微生物组的研究过程中取得了长足的进步。这些发现揭示了在重组和改革疾病病理与药物方面有着非凡未来的可能性。
茗创科技·2024-02-19 13:33

齐派第三代弟子一一一张凭

(齐白石一一→李可染一一→张凭)图片发自App张凭(1934一一2010.03.20)，原名张守道，河南省新乡市人，中央美术学院教授，中国美术家协会会员，享受国务院特殊贡献津贴，李可染大师入室弟子。图片发自App图片发自App图片发自App1951年于新乡市文化馆从事群众美术工作，1962年毕业于中央美术学院中国画系，并拜导师李可染为师，1961年毕业创作《山河咏》。图片发自App图片发自App图
萃雅轩主范成元·2024-02-19 13:29

2019-01-15

一、密码学1、七个世代第一代：隐藏法第二代：移位法和替代法第三代：维吉尼亚加密法第四代：恩尼格玛机第五代：魔王加密系统第六代：RSA加密法第七代：量子加密2、分水岭以计算机为分界，之前为古典密码学，之后为现代密码学
曹鑫鑫_9dc8·2024-02-15 09:56

转录调控研究数据库推荐 | 你要找的ChIP-seq数据都在这里啦！

染色质免疫沉淀、DNase-I超敏反应和转座酶可及性分析结合高通量测序，使染色质动力学、转录因子结合和基因调控的全基因组研究成为可能。
尐尐呅·2024-02-15 04:49

浅谈数字钱包交易系统开发_区块链技术市场应用系统开发

阶段四、第三代数字钱包，是一种看不见，但又确切意义上存在的钱包，可以通过它来
贫穷限制不了我的想象·2024-02-15 03:41

你敢想吗？90%的亿万富翁，毕生积蓄都毁于一件事

据统计，90%成功企业家创造的家族财富会被其家族第三代毁于一旦。虽然这一数据是基于美国和欧洲区域的调查得出的，但同样，该数据在其他区域也会得到相似印证。
KC商盟·2024-02-15 02:49

机器学习---概率图模型（概率计算问题）

1.直接计算法给定模型和观测序列，计算观测序列O出现的概率。
三月七꧁ ꧂·2024-02-14 17:06

2022-12-01

Nature|空间基因组学描绘癌症克隆的结构、性质和进化（2）原创图灵基因图灵基因2022-12-0109:19发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术一种新的空间技术，碱基特异性原位测序（BaSISS
图灵基因·2024-02-14 08:35

单细胞测序最好的教程（一）：质量控制

目前，国内对于单细胞测序分析的教程五花八门，百花齐放，一个合适且准确的pipeline对于分析是很有价值的。
Starlitnightly·2024-02-14 06:18

单细胞测序最好的教程（二）：归一化

由于单细胞测序技术的限制，我们在样本中获得RNA的时候，经过了分子捕获，逆转录还有测序。
Starlitnightly·2024-02-14 06:18

单细胞测序最好的教程（三）：特征基因选择

前言提到，在过去两天的教程中，我们讲解了使用omicverse进行单细胞测序数据的质控以及归一化的一些思想。
Starlitnightly·2024-02-14 06:18

python基因差异分析包_一个生信素人的上道经验分享-转录组测序（差异分析篇）...

原标题：一个生信素人的上道经验分享-转录组测序(差异分析篇)转录组测序技术(RNA-seq)作为目前二代测序领域最普遍的技术手段，自从转录组测序问世以来，已经开发了数百种分析工具。
weixin_39607873·2024-02-14 06:17

Python 资源大全（七）

官网bcbio-nextgen：这个工具箱为全自动高通量测序分析提供符
忘了呼吸的那只猫·2024-02-14 05:46

人生是一条轴线

人生态度第三代催眠导师斯蒂芬.吉利根博士做过一个实验。让人们进入不同的情绪状态，然后再回答一些如你小时候的经历之类的问题。实验发现当人在正向情绪中的时候，想
酒剑仙_2762·2024-02-14 05:45

介绍一款单细胞细胞类型注释软件-scibet

作者：童蒙编辑：amethyst引言随着技术的进步，测序成本的降低，单细胞转录组的数据呈指数级的爆发。
生信阿拉丁·2024-02-14 01:55

第三代互联网web3.0

Web3.0，通常被称为第三代互联网，代表了互联网技术的下一个演进阶段。它主要基于区块链、去中心化和用户赋权的理念构建，旨在创造一个更加智能、开放且安全的网络环境。
安语未·2024-02-14 00:58

06高通量测序-RPKM,FPKM,and TPM

,andTPMRNA-seq标准我们过去使用RPKM(ReadsPerKilobaseMillion)或FPKM(FragmentsPerKilobaseMillion)这些均一化的read计数如下:测序仪深度
不到7不改名·2024-02-13 20:56

【算法详解】STitch3D：空间转录组数据和单细胞RNA测序数据共同建模的空转数据对齐和整合算法，实现更高分辨率的3D结构重建

目录0参考文献1模型特色2算法解析2.1模型概述2.2获得隐空间表示2.3获得细胞类型比例2.4处理批次效应0参考文献STitch3D原论文：Constructionofa3Dwholeorganismspatialatlasbyjointmodellingofmultiplesliceswithdeepneuralnetworks1模型特色生物体器官具有复杂的三维结构，生理过程的进行也很少在二维
yaoyao255·2024-02-13 18:32

R、python读取空间转录组的8种方式

“空间转录组测序主要包括5个步骤，我们着重下游分析部分：空转数据分析和可视化。
生信小博士·2024-02-13 18:01

菌群宏基因组分析能解答哪些科学问题？

比较基因组学在微生物领域的应用基因组测序在细菌基因组中的应用基因组测序在真菌基因组中的应用宏基因组研究内容：1.研究环境样本中微生物的构成与丰度；2.研究环境样本中的功能基因信息及丰度；3.研究不同环境样本间细菌群落
f70420f979c3·2024-02-13 18:02

pacbio三代扩增子测序序列比对

新手小白求问一个fasta文件里面包含很多序列有什么办法能够把TTA开头的提取出来，ATGG开头的提取出来，如图一。关于序列比对的问题求助序列比对完之后可视化方法，比如300多条序列有同样的突变或者缺失规律，该怎样用一条序列或其他可视化方法表示出来。图一
小鹿不吃香菜·2024-02-13 18:58

单细胞测序生信分析1-Seurat

单细胞分析的经典包——Seurat包有自己的官方教程，跟着教程过一遍可以get大致过程（https://satijalab.org/seurat/archive/v3.1/pbmc3k_tutorial.html）在我看来最难的部分其实是第一步的数据准备阶段，如果GEO数据库可以下载到标准的10X数据（包含三个文件（barcodes.tsv/genes.tsv/matrix.mtx）），那直接用S
18b79e7933ad·2024-02-13 08:46

HTTP/3 来了 ！HTTP/2 还没怎么用起来呢，先一起扫个盲吧！

此后，凭借着多路复用、头部压缩、服务器推送等优势，HTTP/2得到了越来越多开发者的青睐，不知不觉的HTTP已经发展到了第三代。
码农小光·2024-02-13 02:20

2021-10-10

CellRepMet|基因筛查的通用工具箱STAMPScreen原创图灵基因图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学技术基因工程领域积累了一个巨大的工具箱：海量在线数据集、基因编辑工具和快速廉价的基因组测序
图灵基因·2024-02-12 20:33

名副其实的教师之家-------写在2021年教师节

然后就是在自家群里发送教师节祝福，因为，我们家三代人有五位教师，第一代是我的父亲，教思想政治，第二代是我的大嫂，高中老师，也是教思想政治，还有我，一位心理咨询师（也可以称之为心灵导师），第三代是我的外甥媳妇
萌妈智慧一心理咨询师·2024-02-12 20:54

浅谈路由器

一次查表，多次路由3.第三代路由器：分布式软件转发。处理能力强，接口种类多，配置灵活；转发速率小，共享总线容量限制路由器的吞吐量4.第四代路由器：基于ASIC与交换矩阵。
LYDlsj·2024-02-12 18:12

2021-03-22

03、测序数据批量比对到参考基因组建立索引：cd/home/ngs/Pipeline/WES/database/gatk/hg38gzip-dHomo_sapiens_assembly38.fasta.gzmkdirindex
Jason_5b5a·2024-02-12 15:46

2022-07-28

CancerDiscov|8万个单细胞测序揭示肿瘤浸润淋巴细胞分化动态原创huacishu图灵基因2022-07-2811:47发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文：huacishuIF=38.272
图灵基因·2024-02-12 13:17

我们能成为孩子的上帝吗—— 谁来管理非法行医的贺建奎

贺建奎，原南方科技大学副教授，毕业于美国斯坦福大学，拥有多学科交叉的背景，并在基因测序仪研究，CRISPR基因编辑，生物信息学等多个领域取得研究突破。
闲月农·2024-02-12 06:31

2022-01-27

参考：生物信息学100个基础问题——第1~5题答案公布-知乎(zhihu.com)掌握FASTQ格式特点第2行就是测序得到的序列信息，一般用ATCGN来表示，其中N用于荧光信号干扰无法判断到底是哪个碱基时的代表符号
学习生信的小兔子·2024-02-12 01:29

抗诱惑训练

第二天，拿着第三代零食问他今天他的零食还在不在，如果不在，就当他面把零食拿走并且一下午都没有吃的。第二周接着训练，然后隔半个月继续训练。同时告诉他：人这一
橙子姜·2024-02-11 22:35

2023-04-06

将二代测序短reads比对到参考基因组上，并进行排序和去重复的等处理，用于后续的变异检测。
小谷头·2024-02-11 21:58
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