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第三代测序
iMeta | 青岛华大范广益组基于共标签
测序
数据的高质量宏基因组组装工具MetaTrass...
点击蓝字关注我们MetaTrass:基于共标签
测序
数据的人类肠道微生物高质量宏基因组组装工具https://doi.org/10.1002/imt2.46RESEARCHARTICLE●2022年8月15
生信宝典
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2024-01-07 12:45
大数据
编程语言
python
机器学习
人工智能
链读
测序
技术在宏基因组组装研究中的应用
链读
测序
(Linked-readsequencing)通过将相同的barcode与长DNA片段(10-100kb)的序列连接在一起,能够消除其中的一些错读,从而改进宏基因组组装。
谷禾牛博
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2024-01-07 12:44
原创||宏基因组干货分享专题———组装
就是一个微生物群落里面的全部DNA被提取出来,然后被随机进行剪断、
测序
,得到一系列短序列;把这些短的序列拼接成连续的长序列过程就叫组装。简单点说就是从短序列拼接
bioDeep
·
2024-01-07 12:44
宏基因组
大数据
宏基因组序列无参考基因组装工具idba-ud的介绍及详细使用方法
介绍idba-ud工具是一种用于组装无参考基因组的工具,它可以将高通量
测序
数据转化为基因组序列。它是idba工具的升级版本,专门用于组装多样性的无参考基因组。
小果运维
·
2024-01-07 12:14
生信分析-bioinfo
idba_ud
基因组装
gene
assembly
Guideseq分析流程
Guideseq是一种检测体内基因编辑脱靶的
测序
方法,基本原理是CRISPR系统剪切基因组后,在进行基因组修复时可能会将一段设计好的双链DNA,即tag,插入到基因组中,通过tag设计引物可将基因组断裂位点两侧的序列扩增出来建库
WuYankang
·
2024-01-07 10:44
催眠研习社喊你加入
第三代
催眠是斯蒂芬.吉利根结合艾瑞克森式催眠心理式治疗、合气道、佛学、冥想,以及表演艺术,发展了一套全新的基础觉醒方法。让催眠治疗更宽广、深远、无所不在,堪称中西智能的结合。
骆驼_8fdf
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2024-01-07 07:51
2022-07-17
2022-07-1608:36发表于江苏收录于合集#前沿生物大数据分析撰文:huacishuIF=68.164推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐亮点:1、作者开发了VASA-seq程序,这是一种能够对单细胞的全长转录组进行
测序
的新技术
图灵基因
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2024-01-07 07:25
外泌体多组学07-骨髓肥大细胞来源外泌体lncRNA与miRNA的有效数据量
目前市面上有很多公司外泌体RNA
测序
推荐的数据量很少,为了合理评价一个合适的有说服力的有效数据量,我们对公开发表的相关外泌体文章和数据进行检索和信息收集,此次文章如下:文章信息文献标题:Characterizationofprotein
_十三
·
2024-01-07 05:24
2022-10-18 历史上的今天
2009年,俄“进步M-03M”货运飞船与国际空间站成功对接;2008年,中国
第三代
导演谢晋去世;2002年,我国第一个国家信息化规划出台;1998年,亚太议员环发大会年会闭幕发表《桂林宣言》;1998
玉石儿
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2024-01-07 02:00
通信--学习记录
1.移动发展史1.1代表性技术3GPPG:全称generation,代,4G就是第四代移动通信GSM作为2G网络的代表通信技术,WCDMA,是
第三代
移动通信的代表技术,被应用于联通;TD-SCDMA,则是被应用于移动
进击的小白9527
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2024-01-06 22:23
信息与通信
《祖国颂》
六十九年前伴随着一个伟人雄伟庄严的声音您诞生了从此世界的东方有了您巍峨的身影三十九年前伴随着另一个伟人的频频招手您开放了从此多彩的世界有了您呐喊的声音二十九年前伴随着
第三代
领导人的彻夜思考您飞翔了从此强手如林的世界上您日新月异十九年前伴随着主席的亲切微笑您腾飞了从此世界的东方您谱写了一首强国之歌
雁翱九州
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2024-01-06 17:38
WES学习2:外显子
测序
分析——小男孩的硬骨化病基因突变
首先感谢生信技能树!书接上回,看完了jimmyB站的WES视频及教程《给学徒的WES数据分析流程》。因为不知道他的原始数据在哪,找了一个乳腺癌WEScohort队列把整个流程跑完了。然后还想找一些WES/WGS的现成教程跟着学习的。结果找到这个教程:Exomesequencingdataanalysisfordiagnosingageneticdisease。是一个在线数据处理平台:galaxy。
颗粒神经园
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2024-01-06 16:36
Bioinformatics
大数据
chip-seq
测序
分析流程
步骤1:质量控制fastqc质控,假如有两个样本,实验组为sample1,对照组为control1#双端
测序
fastqcsample1_1.fq.gzsample1_2.fq.gzfastqccontrol1
微光**
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2024-01-06 14:11
chrome
前端
Bulk-RNA-seq流程——从
测序
数据到count文件(AGSdata)
2022-2-11软件安装conda的安装和配置wget-chttps://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.shchmod777Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh#给执行权限bashMiniconda3-latest-Linux-x86_64.sh#运行当命令行前面出现(base)
璐璐璐璐璐952
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2024-01-06 14:40
RNA-seq
linux
ubuntu
bulk-RNA seq
测序
数据分析流程
假如有bulk-RNA
测序
的数据:TH1,TH2,TH3三个重复(实验组),TW1,TW2,TW3三个重复(对照组)准备工作需要安装的软件(如FastQC、Trimmomatic、HISAT2、StringTie
微光**
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2024-01-06 14:38
数据分析
数据挖掘
目标跟踪算法中的卡尔曼滤波学习
背景知识在理解卡尔曼滤波前,有几个概念值得考虑下:时序序列模型,滤波,线性动态系统1.时间序列模型时间序列模型都可以用如下示意图表示:这个模型包含两个序列,一个是黄色部分的状态序列,用X表示,一个是绿色部分的观
测序
列
AAI机器之心
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2024-01-06 13:33
目标跟踪
算法
学习
人工智能
深度学习
计算机视觉
pytorch
云原生战专题 | 深入浅出分析云原生微服务的技术结构和架构设计
深入浅出分析云原生微服务的技术结构和架构设计云原生容器技术背景容器编排Kubernetes控制平面的四大组件Kubernetes在容器编排中的设计要点云原生微服务典型架构第一代微服务架构第二代微服务架构
第三代
微服务架构第四代微服务架构未来的云原生架构
洛神灬殇
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2024-01-06 06:21
实战指南之分布式/微服务
#
云原生
微服务
架构
如何向外行讲解 2G、3G 和 4G LTE 的区别?
第二代,
第三代
,第四代移动通信这样的文字定义无法透露更多信息,那么站在消费者的角度,最直观的变化有哪些?感谢各位的回答!PS:现在,站在内
weixin_38402680
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2024-01-06 03:18
如何向外行讲解
2G
3G
和
4G
LTE
的区别?
【单细胞组学】scCITE-seq(单细胞转录组+细胞表面蛋白表达)
单细胞水平的
测序
技术发展的越来越快,目前应用最多的是集中于mRNA表达的scRNA-seq和结合了空间信息的空间转录组。
SciNote
·
2024-01-05 13:43
疫情.怡情(之六百三十九)
今天,那不勒斯OspedaleCotugno医院实验室发出
测序
报告称,意大利Omicron变体零号感染者的妻子和两个孩子均被感染Omicron变体。当前全意共确诊4例Omicron变体病例。
飞扬的雪ing
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2024-01-05 07:31
Linux安装
第三代
计算机(1964~1971)普遍采用集成电路;体积缩小;运算速度每秒几
KiKi_2005A
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2024-01-05 01:37
chatgpt3.5和chatgpt4的区别
GPT-3(
第三代
生成式预训练模型)是OpenAl开发的一个大型语言模型,它在很多自然语言处理任务中表现出色。
ai使用测评
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2024-01-04 21:25
gpt-3
openai
chatgpt
gpt
基因组联合代谢组与转录组锁定关键通路--03
然而,全基因组
测序
工作还未
百迈客生物
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2024-01-04 20:37
在线作图|微生物多样性分析——稀释曲线
稀释曲线稀释曲线(RarefactionCurve,也称稀疏曲线):一般在微生物组研究中用于评估
测序
量或样本量的饱和情况。
维凡生物
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2024-01-04 19:29
关于Omisc Core WES 计算TMB的一点见解
上周FDA授予Nanthealth公司OmiscCoreWES基因检测许可,这是FDA批准的首个使用全外显子
测序
方法来检测实体瘤的体外诊断产品。
ciciv123
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2024-01-04 16:34
5G MEC如何产生:从标准演进看云网融合
3GPP:the3rdGenerationPartnershipProject,
第三代
合作伙伴计划。ETSI:Eur
边缘计算社区
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2024-01-04 11:02
大数据
人工智能
xhtml
编程语言
hierarchy
巴夏:心物一元:转换进入你新的平行实相!转换一个新的频道,进入新的世界。
華嚴宗
第三代
祖師賢首大師,法名叫法藏,他有
明朗咨询
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2024-01-04 07:52
植物空间||拟南芥单细胞空间转录组图谱文献解析
一、文章简介文章题目:单细胞空间转录组
测序
揭示拟南芥叶片中特定区域的细胞亚型和转录组图谱期刊:DevelopmentalC
畅背书
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2024-01-04 07:58
第五章 习惯三 要事第一——自我管理原则
第三代
是目前正流行、讲求优先顺序的观念。也就是依据轻重缓急设
kkkobe7
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2024-01-04 07:42
Kotlin 零基础学习 DSL 领域特定语言
Kotlin最让人激动人心的特性DSL,是一个类似于用自然语言话术去让程序执行,这样没有编程背景的人也可以参与到编程的体验当中,未来编程就会向第五代编程语言自然语言发展,因此Kotlin将来会取代第四代、
第三代
编程语言的
__素颜__
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2024-01-04 06:40
ExpHunterSuite
它可以用于从高通量
测序
数据中提取差异表达基因,并对其进行注释和功能富集分析。
m1chiru
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2024-01-03 23:09
学习方法
了解长短期记忆 (LSTM) 网络:穿越时间和记忆的旅程
LSTM旨在解决传统循环神经网络(RNN)的局限性,尤其是在学习长期依赖性方面的局限性,彻底改变了我们在各个领域建模和预
测序
列的能力。
无水先生
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2024-01-03 20:23
人工智能
lstm
网络
人工智能
【单细胞
测序
】数据格式转换loomR
今天读文献,遇到比较感兴趣的样本,数据下载下来是loom文件,查了下loom文件转换为seurat对象的方法。做个笔记。背景seurat分析无法应付指数级增长的单细胞数据集计算需求。Linnarson实验室开发的基于hdf5的数据结构loom,可以方便地存储单细胞基因组数据集和元数据。HDF5数据格式不将数据存储在内存中,而是提供高效的磁盘存储,甚至可以扩展到大型数据集(甚至是>1M细胞)。注意:
森尼啊
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2024-01-03 20:18
第一单元 Linux系统介绍及安装
1、计算机的历史第一代计算机(1946~1958)第二代计算机(1958~1964)
第三代
计算机(1964~1971)第四代计算机(1971~)2、Linux安装1、安装模拟器1、点击点击Vware-workstation-full2
Shan_d703
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2024-01-03 18:14
“集成多组学数据的机器学习在生物医学中的应用”
“集成多组学数据的机器学习在生物医学中的应用”一、理解⼀种疾病的某种现象仅使用⼀种数据类型是远远不够的,随着高通量
测序
和多组学的快速发展,生物医学研究开始采取多组学技术结合的方法,传统的信息数据处理算法不能满足大数据的处理要求
20220705
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2024-01-03 12:07
人工智能
python
分享经济
分享经济强调的两个核心理念是“使用而不占有”(AccessoverOwnership)和“不使用即浪费”(ValueUnusedisWaste)[1所以分享经济是电商
第三代
经济它对人脉没有伤害不是微商明天详细说
c9d342511f99
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2024-01-03 09:11
ICT笔记
中国无线局域网安全强制性标准是WAPIWLAN发展历程第一代WLAN:11b第二代WLAN:11a/g
第三代
WLAN:11nWLAN拓扑介绍基本服务集(BasicServiceSet,简称BSS)是802.11
叶梓翎
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2024-01-02 20:26
笔记
RNA-seq最强综述名词解释&思维导图|关于RNA-seq,你想知道的都在这(续)
前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、单细胞
测序
分析(重磅综述:三万字长文读懂单细胞
生信宝典
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2024-01-02 16:05
扩增子
测序
中OTU表进行抽平的两种方式
Arandomrarefactionofsamplereadsaccordingtoaspecificreadslength(usuallythesmallestvalue)shouldbeperformedfirstlyfordownstreamanalysis.扩增子
测序
拿到
凯凯何_Boy
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2024-01-02 16:08
单细胞RNA速率(RNA velocity)
单细胞RNA
测序
可以以高定量精度、灵敏度和通量揭示RNA丰度。然而,这种方法仅捕获某个时间点的静态快照,这对分析胚胎发生或组织再生等时间分辨现象提出了挑战。
生信小鹏
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2024-01-02 14:33
算法
人工智能
OSCA单细胞数据分析笔记-14、Empty/Doublet droplet
对应原版教程第15、16章http://bioconductor.org/books/release/OSCA/overview.html现行主流的Droplet-based单细胞
测序
技术主要思路是一个磁珠捕获一个细胞置于油包水的腔室里完成添加标签
小贝学生信
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2024-01-02 14:31
全基因组
测序
揭示家族性乳腺癌病因的临床相关见解
PMID:31090900PMCID:PMC6637375DOI:10.1093/annonc/mdz132ANNALSOFONCOLOGYIF:32.976(2021年6月30日公布)摘要背景:全基因组
测序
亦是旅人呐
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2024-01-02 00:47
(日常记录)smRNA本地注释分类
准备:1、rfam数据库2、rfamclain文件3、软件infernal4、待
测序
列(fasta文件)一、数据库下载进入rfam官网,点击FTP,选择最新版本,下载这两个文件并解压。
重新开始_xy
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2024-01-01 23:19
基因
测序
的昨天、今天、明天
会议题目:NGS的未来蓝海与现实突破主办方:CHC医疗咨询与IVD联盟会议嘉宾:朱师达-华大基因副总裁、肿瘤事业部总经理张江立-鹍远生物联合创始人、兼首席执行官王海蛟-高特佳投资执行合伙人于洋-诺禾致源副总裁段云-山蓝资本执行董事会议议题:1、中国NGS市场现状如何,在哪些领域有较好的临床应用?2、在这些领域,产业链国产化程度如何?3、如何改变肿瘤NGS基因检测的内卷现状?有哪些新的产业蓝海?4、
基因江湖
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2024-01-01 22:08
第三代
半导体SiC 专业术语及指标解释
SiC:化合物半导体材料,
第三代
半导体材料代表,主要用于功率半导体领域GaN:化合物半导体材料,
第三代
半导体材料代表,主要用于高频射频领域GaAs:化合物半导体材料,第二代半导体材料代表,主要用于射频和光领域
阿拉伯梳子
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2024-01-01 22:29
半导体工艺
制造
经验分享
跟着NC学cfDNA全基因组片段化丰度谱分析
继续我们的跟着NC学系列,前面分享的是关于16S扩增子
测序
和宏基因组数据分析的。
zd200572
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2024-01-01 19:54
机器学习
人工智能
深度学习
纳米孔(Oxford Nanopore)
测序
仪的学习笔记
最近学习了
测序
中国探基学院的相关课程,关于纳米孔(OxfordNanopore)
测序
仪,由诺禾致源的工作人员主讲,收获了一些知识,在此记录一下。他们讲的内容多了一些实践相关的经验,值得学习。
zd200572
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2024-01-01 19:54
测序
Oxford
Nanopore
牛津纳米孔
基因组survey——K-mer频谱
Kmer是从
测序
数据中滑窗提取出的长度为k的寡聚核苷酸序列,可以评估基因组大小、杂合度、重复序列比例等。
徐诗芬
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2024-01-01 16:52
StatQuest学习笔记25——差异表达分析
主要内容讲的是高通
测序
数据的差异基因分析,其中,第59节的内容是edgeR进行的文库均一化;第60节是DESeq2的文库均一化;第61节则是讲的是edgeR和DESeq2均一化的一些阈值选择。
backup备份
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2024-01-01 13:02
DC宇宙中的超级反派「3」
第三代
“费迪”,是意念超能力者。爱丽丝疯帽匠:杰维斯·泰奇,一名神经学专家,擅长催眠术,身材矮小,相貌丑陋,爱上一名爱丽丝的女孩,被拒绝后心理产生扭曲。
夏洛克不养猫
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