第三代测序第5页

文明、现代化、价值投资与中国（一）

《文明、现代化、价值投资与中国》是喜马拉雅资本创始人、查理·芒格家族资产管理人、价值投资思想第三代代表人物李录的文集。

大寶天天践·2024-01-25 14:19

5G赋能智慧文旅：科技与文化的完美结合，打造无缝旅游体验，重塑旅游业的未来

2016年，3GPP（第三代合作伙伴计划）发布了5G的初步技术规范，标志着5G进入了标准化阶段。在此后的几年中，全球各地的运营商和产业链相关企业积极参与5G技术的研发和试

方案365·2024-01-25 11:08

单细胞测序笔记1：数据读取

（一）准备工作我们先向R中安装如下包以确保准备工作的完成install.packages("BiocManager")BiocManager::install("mulltest")#似乎只有Bioc里面才能安装mulltestif(!require(Seurat))install.packages("Seurat")if(!require(dplyr))install.packages("dpl

陈天白·2024-01-25 11:37

高分文章热门测序结果验证方法，解决你的选择困扰

随着测序技术的发展和应用的普及，研究者们在拿到大量的测序结果后，面临的困扰是怎样选择合适的结果验证策略。在这里，我们一起来了解一下高分文章中有哪些热门的验证方法吧，总有一种适合你。

ee00dc6faab7·2024-01-25 09:26

240124学习记录：查看/提取bam文件的reads

BAM文件（BinaryAlignment/Mapfile）是一种常用于存储测序数据的二进制格式。它主要用于存储DNA测序数据的比对（alignment）信息。

丁优雅ya·2024-01-25 05:22

基因组与转录组，深入挖掘基因表达信息--02

本研究对在中国广泛种植的杂合猕猴桃“Hongyang”（A.chinensis）的基因组进行测序分析。该基因组序列的可用性不仅为了解猕猴桃及其野生近缘种的特定农学重要性状的潜在分子基础提供了见解

百迈客生物·2024-01-24 23:12

深度学习-循环神经网络-RNN实现股价预测-LSTM自动生成文本

序列模型（SequenceModel）基于文本内容及其前后信息进行预测基于目标不同时刻状态进行预测基于数据历史信息进行预测序列模型：输入或者输出中包含有序列数据的模型突出数据的前后序列关系两大特点：输入

小旺不正经·2024-01-24 16:55

基因组评估软件gaep

基因组组装评估指标基因组评估软件geap，overviewoftheGAEPpipelinemainworkflowoftheGAEPmisassemblydetectionmoduleGAEP是一款能够基于二代、三代测序以及转录组测序数据

花生学生信·2024-01-24 08:17

Day17

今天有一件高兴的事:拿去测序的样本全部质检合格，明天交完上机检测表就可以测序了，两周左右就能拿到结果。加油！不负韶

Lucky_笑·2024-01-24 06:11

学习小组Day7笔记--WX

测序知识特别鸣谢：@公众号：生信星球豆豆&花花老习惯，先来张思维导图~Day7-测序知识再补充些Illumina二代测序技术中涉及到的名词~flowcell：测序反应的载体/容器，1个flowcell有

xiaoxiaomiya·2024-01-24 04:29

舔狗舔狗，舔到最后，一无所有

我今天上午轻仓抄底了600460士兰微，没想到的是，半导体板块今天居然大爆发——尤其是昨天收盘笔记里提到的第三代半导体——600460居然涨停了，真的只恨自己抄底抄少了啊！

龙叔的自由之路·2024-01-24 03:57

2021-11-26

丨非小细胞肺癌单细胞分析细化了肿瘤分类和患者分层原创珍奇图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制撰文：珍奇IF：31.743推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本研究通过多尺度单细胞分析对更大的患者队列进行分析，从而定义在肿瘤微环境中诱导的分子免疫状态；通过测序将免疫细胞的单细胞

图灵基因·2024-01-23 22:41

数模---灰色预测模型python代码模板

data,num_prediction):"""GM(1,1)灰色预测模型:paramdata:原始数据序列(一维NumPy数组):paramnum_prediction:需要预测的步数:return:预测序列

Faelan.·2024-01-23 21:31

难过的2021年尾

这几天感觉心情就像过山车一样，突然一下西安的疫情紧张起来了，通过官方报道是巴基斯坦境外输入，东莞的确诊和西安确诊者基因链测序一样。

转角遇到你·2024-01-23 19:40

南京疫情之感

南京市疾控中心副主任丁洁27日通报，本轮南京发生的疫情中，一直在对病例进行基因测序，从完成的病例看，结果显示为德尔塔毒株。

ddc9033275cf·2024-01-23 16:40

Linux系统下TASSEL5.0的安装及使用

之前做SSR标记和简化测序都是用的桌面化的TASSEL进行运算，对于做关联分析的初学者非常简单，十分好入门。

种地的pele·2024-01-23 16:57

TensorFlow框架(6)之RNN循环神经网络详解

RNN的主要用途是处理和预测序列数据。全连接的前馈神经网络和卷积神经网络模型中，网络结构都是从输入层到隐藏层再到输出层，层与层之间是全连接或部分连接的，但每层之间的节点是无连接的。

AI小白龙*·2024-01-23 15:06

如何使用R的sweep函数对表达矩阵进行标准化

我们知道一般做表达谱数据分析之前，第一步就是对我们的表达矩阵进行标准化（归一化），去除由于测序深度，或者荧光强度不均一等原因造成的表达差异。

生信交流平台·2024-01-23 15:26

一文解决单细胞亚群注释的所有问题

单细胞测序技术是近十年最火爆的生物学技术之一，它赋予

生信宝库·2024-01-23 09:42

3‘aTWAS—3‘adapter-based transcriptome-wide association study

该技术利用高通量测序技术，对大量样本进行转录组测序，并通过对测序数据进行分析，识别与特定表型或疾病状态相关的基因和转录本。3'aT

m1chiru·2024-01-23 09:23

标准化方法

转录组测序采取的打断基因序列获得基因测序的片段，再将reads比对到参考基因组上，并对读序定量，因而最初的表达矩阵是读序数。那么，当需要对样本进行差异分析时，就必须考虑影响读序数的几个因素。

新欣enjoy·2024-01-23 02:43

生物信息学导论-北大-新一代测序NGS：转录组分析RNA-Seq 1

ref:https://www.coursera.org/learn/sheng-wu-xin-xi-xue/home本文主要来自本课的讲义+搜索内容。Real-TimeqRT-PCR基于互补杂交反应（complementaryhybridizationreaction），PCR技术的发展促进了本技术的发展，缺点是：1.低通量2.需要有转录本序列的先验知识。步骤：Real-TimeQuantita

陆沙·2024-01-23 00:50

【科研集市】一文带你读懂Hi-C（附高分文献汇总）

High-throughchromosomeconformationcapture)技术源于染色体构象捕获（Chromosomeconformationcapture,3C）技术，以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术

d5c9c866171f·2024-01-22 22:29

7-1 堆栈操作合法性 (10分)

输入格式:输入第一行给出两个正整数N和M，其中N是待测序列的个数，M（≤50）是堆栈的最大容量。随后N行，每行中给出一个仅由S和X构成的序列

超好的小白·2024-01-22 21:01

津恩一家亲，携手抗疫情

当晚，天津疾控对其中两名确诊病例新冠病毒全基因组测序确认为奥密克戎变异株。这也是中国本土新冠疫情（香港、台湾地区除外）中，首次与新冠奥密克戎变异株正面交锋。这20个阳

精进的医生·2024-01-22 21:41

有价值的陪伴

作为教育工作者，无数的案例让我们认识到家庭与学校的紧密配合的1+1远远大于2，但是城市化进程带来的生源骤增的背后，是很多孩子成长陪伴的缺失，第三代陪伴、单亲教育、全托管半托管方式等，让今天学校儿

eggplant·2024-01-22 17:39

Reads, Metagenomic assembly, and custom MAGs的区别与联系解读

当进行元基因组学研究时，研究者通常会涉及到以下三个数据类型，每个都有其独特的角色和应用：Reads（读数）:定义：Reads是从原始测序数据（例如Illumina测序的FASTQ文件）中获得的短序列片段

WDPLA·2024-01-22 15:18

linux系统下，将.fastq文件统一改为.fq文件

#高通量测序获得宏基因组/宏转录组进行后续分析的过程中，常碰到.fastq与.fq文件后缀不一致的问题#在Linux系统中，你可以使用rename命令或者mv命令来将文件名中的特定后缀进行修改。

WDPLA·2024-01-22 15:47

CUTANA™ CUT&RUN Assays ——实现超敏基因组定位

但是由于ChIP存在高细胞需求量、技术难度大、成本高、深度测序、数据质量差以及变量

Neobioscience·2024-01-22 11:14

单细胞测序3 丨丨构建文库

上期分享了单细胞测序2丨丨细胞捕获&cDNA扩增，主要介绍了单细胞测序第二环节--基因表达实验流程：GEMs形成、mRNA逆转录、二链cDNA合成与扩增。接下来进入单细胞测序的第三环节--文库构建。

知之为知之不知否·2024-01-22 10:02

转录组测序1-测序原始数据说明

转录组测序是最常用的组学实验，对全谱基因定量，找到差异表达基因。

纪伟讲测序·2024-01-22 08:45

零代码进行转录组数据分析实战（一）：质量控制

一个完整的转录组测序项目大概分为以下三个阶段：体内：mRNA生成阶段。转录生成mRNA前体，再经过转录后加工形成成熟的mRNA。体外：建库测序阶段。RNA提取、片段化、逆转录以及上机测序。

简说基因-专业生信合作伙伴·2024-01-22 08:49

生物信息基础：pysam读写基因组文件

Pysam[1]是一个Python模块，它打包了高通量测序库htslib[2]的C-API，可用于读写基因组相关文件，如Fasta/Fastq，SAM/BAM/CRAM，VCF等。

简说基因-专业生信合作伙伴·2024-01-22 08:37

对一个生命的期盼

折腾了很长时间，前年3月份开始，促排卵、取卵、配对胚胎3对，结果做第三代基因检测后有不健康嫌疑而放弃移植。于是再促排、再取卵、三次促排、三次取卵，最后配对成2个胚胎，时间就这样到了年底。

遇见更丰盛的生命·2024-01-22 05:41

北大公开课-2 生物信息学历史

在分子水平研究演化L.pauling1965sangerDNAsequencing19771988人类基因组计划2001年人类基因组计划2005二代测序1991年Linux系统系统特点由目的单一的小程序组成

番番番茄小姐·2024-01-21 18:24

高通量测序数据质控神器Trimmomatic

简介高通量测序下机的原始数据中存在一些低质量数据、接头以及barcode序列等，为消除其对后续分析准确性产生的影响，在数据下机以后对原始数据进行质控处理就成了至关重要的环节。

kongxx·2024-01-21 15:56

04高通量测序-R实现主成分分析

R实现主成分分析如何使用prcomp()函数来做PCA如何使用基础图形和ggplot2绘制PCA图如何确定每个主成分占多少变动如何检查载荷得分（LoadingScores），以确定哪些变量对图表有最大的影响。构建数据集首先，让我们生成一个可以在演示中使用的假数据集。#我们将用10个样本制作一个数据矩阵，在每个样本中测量100个基因data.matrixstr(pca)Listof5$sdev:nu

不到7不改名·2024-01-21 12:35

齐派第三代弟子一一一马波生

(齐白石一一李可染一一马波生)图片发自App马波生(1942一一)出生在江苏省徐州市。1986年拜李可染为师。图片发自App1987年结业于中央美院国画系。图片发自App图片发自App图片发自App图片发自App图片发自App图片发自App萃雅轩主范成元2019.01.25

萃雅轩主范成元·2024-01-21 11:08

在线作图|如何绘制一个好看的堆叠柱状图

比如，在微生物组成谱和宏基因组测序中，堆叠柱形图常常用来展示微生物物种的组成情况。Question2：如何不

维凡生物·2024-01-21 10:05

基因组联合代谢组与转录组锁定关键通路--02

本研究测序组装了香蕉B基

百迈客生物·2024-01-21 08:08

第一单元 Linux系统介绍及安装

第一单元Linux系统介绍及安装1.计算机的历史第一代计算机(1946~1958)电子管为基本电子器件第二代计算机(1958~1964)晶体管为主要器件第三代计算机(1964~1971)普遍采用集成电路第四代计算机

Dovis_911b·2024-01-21 07:28

《山里的外婆家》

第三代的我们，求学后也离开了令人心安的外婆家，从此再也不见了甘甜的井水，古朴的木质“佬佬“（井上拴绳往上吊打有井水的木桶），听不见了热至正午的蝉鸣，雨天屋檐雨滴铜盆的铃声，也失去了环顾四周的青山绿水，失去了星罗棋布般的满天繁星

赵三饭·2024-01-21 04:41

儿孙自有儿孙福，审慎为后人安排后事

这些庞大规模的房产，是一笔巨额开销，没多久，他的富二代后人，就付不起房产税了，只好用政府的贷款付税款，到了第三代，他的后人

山峰奇美·2024-01-21 04:39

WisecondorX 拷贝数变异检测 NGS NIPT

背景低深度全基因组测序（sWGS），主要通过覆盖深度的方法（DOC）检测CNV。

茄子_0937·2024-01-20 16:45

《三生三世枕上书》与凤九关系不错的三位男主，你看好哪一个？

《三生三世枕上书》讲述了青丘第三代女帝凤九和天帝公主东华帝君之间历经三世恩怨，又甜又虐，最终修成正果

幸运的那一个·2024-01-20 09:37

全球单细胞测序平台介绍

2009年，单细胞测序技术问世。2013年被NatureMethods评为年度技术。2015年以来，10XGenomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现。

生物医学小站·2024-01-20 07:54

【生信知识】---Nanopore测序分析软件nanopolish

前言：nanopolish是开源的综合性分析软件，集成了非常多的三代测序数据分析小工具。

卡布达b1·2024-01-20 02:44

单细胞转录组|Seurat 4.0 使用指南

通过IlluminaNextSeq500测序的2700个单细胞。示例数据下载:https://cf.10xgenomics.com/s

木舟笔记·2024-01-20 01:01

scRNA-seq Course 学习

对scRNA-seq的介绍scRNA-seq是对单个细胞进行测序分析，便于研究单个细胞水平的问题，例如：鉴定细胞类型，鉴定细胞基因表达差异，细胞反应的差异，单个细胞内部的基因表达调控。

劳工小朋友·2024-01-20 01:29

细胞基因完整矩阵转10xGenomics稀疏矩阵文件

经常分析单细胞数据的同学都知道，10xGenomics的细胞基因矩阵通常存储在三个关键文件中，这些文件共同描述了单细胞测序数据。

我是胡锦州·2024-01-20 01:27

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