第三代测序第5页

一文搞懂RNA-seq的链特异性测序和非链特异性测序

1.测序方法两种建库方法对应两种测序方法：非链特异性测序方法（non-strandedRNA-seqprotocol）：得到的reads没有方向性，无法判断reads是属于GeneA还是属于Gen

简说基因-专业生信合作伙伴·2024-02-01 09:27

单细胞转录组测序技术及各类数据分析方法总结

自从2009年**单细胞转录组测序（single-cellRNA-seq，scRNA-seq）**技术首次问世，至今已经有几十种不同的scRNA-seq技术相继被开发出来。

AIPuFu·2024-02-01 09:22

iMETHYL : 整合了DNA甲基化, SNP和RNA_seq的多组学联合数据库

从近100名志愿者中提取3种类型的细胞，并分别进行WGS,WGBS,RNA_seq测序分析，将最终

生信修炼手册·2024-02-01 07:13

是时候创造和领导你的生活了：更新你的时间管理逻辑

优缺点比较：第一代和第二代时间管理法第三代：把目标、计划、价值挂钩起来，注重产出。优先级很

镜中的阿当·2024-02-01 03:05

RPKM，FPKM和TPM明确解释| RNA-Seq博客

RPKM，FPKM和TPM明确解释|RNA-Seq博客来自StatQuest过去，当您进行RNA测序时，您以RPKM（ReadsPerKilobaseMillion每千碱基百万个读数）或FPKM（FragmentsPerKilobaseMillion

Seurat_Satija·2024-02-01 03:24

第三代互联网趋势分析

1，第三代互联网，也被称为万物互联（IoT），是指将所有物品通过信息传感设备与互联网连接起来，实现智能化识别与管理。

selenia8860·2024-01-31 23:04

2021-12-27

NatRev丨癌症基因组测序数据的计算分析原创珍奇图灵基因2021-12-2707:03收录于话题#前沿生物大数据分析撰文：珍奇IF：60.716推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本文描述了癌症基因组生物信息学分析中涉及的主要步骤

图灵基因·2024-01-31 23:49

【Time Series】LSTM代码实战

二、算法原理长短期记忆网络（LSTM）是一种特殊的循环神经网络（RNN），用于处理和预测序列数据的时间依赖性。

BoostingIsm·2024-01-31 19:14

Redhat 8.4 一键安装 Oracle 11GR2 单机版

一键安装脚本，演示Redhat8.4一键安装Oracle11GR2单机版过程（全程无需人工干预）：（脚本包括ORALCEPSU/OJVM等补丁自动安装）⭐️脚本下载地址：Shell脚本安装Oracle数据库脚本第三代支持

Lucifer三思而后行·2024-01-31 18:40

Seurat24式太极拳之9单鞭---用于sctransform的标准化值存储在哪里？

给定细胞中给定基因的正残基表明，与基因在种群和细胞测序深度中的平均表达相比，我们观察到的UMI比预期多，而负残基则相反。sctransfrom的结果存储在“SCT”分析中。您可以在我们的插图，命令备忘

Seurat_·2024-01-31 13:24

今年的hsctf里遇到了一个比较少见的nds逆向题目，侥幸拿下一血

基本介绍NDS：任天堂DS，是电玩游戏生产商任天堂公司2004年发售的第三代便携式游戏机。主要的特征包括了双屏幕显示，其中下方的屏幕为触摸屏；并配置有麦克风声音输入装置和Wi-Fi无线网络功能。

H_00c8·2024-01-31 12:56

学习小组Day7 测序知识--yu

测序基本知识基本知识链接https://blog.csdn.net/leroylee7/article/details/112414577各代测序技术及原理测序原理NGS组学内容基础介绍链接https:

Iris09·2024-01-31 11:30

赌王为何推迟到明年才下葬

他是香港广东真步堂天文历算第三代传人，香港各种版本的《通胜》中，历法部分都是由他编纂的。蔡伯励年轻时不太相信风水历法，后来因为是家里长子，要负责家族传承的重任，二十多岁就获得巨大声名。

薛白袍·2024-01-31 11:59

【细胞通讯】CellTalk

单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的发展可有效帮助研究人员认识细胞表型的异质性和复杂组织的细胞类型组成，促进了单细胞分辨率下对细胞间通讯的系统研究。

jjjscuedu·2024-01-31 10:13

运行picard遇到一个错误: "java.io.IOException: No space left on device"

这几天在跑重测序的流程，自己去年的这个时候整理过，之后在几个服务器上都跑过，没出现什么问题，然而又换了一个服务器之后在picard排序和标记(PCR)重复这两步频繁报错。

TOP生物信息·2024-01-31 10:55

精选推文 | 基于三代转录组的基因注释踩坑经历以及GSAman使用

--CJ-陈程杰前言随着测序技术的进步和普及，现如今已经步入到“功能基因组学”（functionalgenomics)的时代。

生信石头·2024-01-31 04:39

【文献简报】-空间转录组学和原位测序研究联合研究阿尔兹海默症

空间转录组文章逐步进入爆发期，单细胞方向的未来是单细胞空间组学，这篇文章利用空间转录组（ST）和原位杂交测序（ISS）研究阿尔茨海默症。

六博说·2024-01-30 22:07

事前诸葛亮

老爷子辛辛苦苦拉扯七八个孩子，都成家立业，并且第三代也都大了。“孩子的孩子都结孩子了，能不老吗？”啦起呱来，有个老伙计如是说。在孩子们的资助下，老人随棚户区改造，搬到了新建小区。

南良大维·2024-01-30 16:58

2021-08-12

矿工都是人上人·2024-01-30 08:57

Fastp使用方法

fastp是一个速度非常快的测序数据质控软件，以下为软件参数的说明，根据github内容整理。

WuYankang·2024-01-30 07:11

生信技能树《GEO数据框挖掘》笔记

1.通读文献阅读及规律这一块儿主要就是在你感兴趣的文章里，找到其测序信息的GSE号，在GEO数据库中直接检索该文件号。2.了解GEO数据库比如我们对GSE42872这个测序结果比较感兴趣，我们现在GE

鹿枫堂·2024-01-30 04:14

一个未播先火的网剧《明星志愿》，评分低的原因……

大宇在1995年1月1日正式发布了明志系列的游戏，因为这部游戏人气一直很好，所以在2016年开始拍摄了这部以第三代游戏的故事为背景改编的电视剧，这也便是这部电视网剧未播先

新诚影视艺画·2024-01-29 22:40

StatQuest学习笔记16——t-SNE

46节，它的主要内容是t-SNE，t-SNE是一种对复杂数据的降维分类方法，我最初知道这种方法是在接触质谱流式细胞仪CytoTOF的时候，当时的很多文献对细胞的分类方法都是采用t-SNE，现在很多单细胞测序类文章也会使用

backup备份·2024-01-29 19:33

[基因组学]使用GAMP根据已知CDS序列来进行未知基因组序列的功能注释

后来高通量测序时代，又开发了GSNAP支持高通量数据比对。软件安装我采用的是利用源代码且在无root权限下进行安装。

巩翔宇Ibrahimovic·2024-01-29 14:11

RNA 3. SCI 文章中基于T CGA 差异表达基因之 DESeq2

区别主要在于一个是计算芯片探针给出来的结果，而DESeq2是基于NGS测序结果中Readcounts来计算差异表达，根据输入数据的不同，我们对比一下做法。

90066456ace6·2024-01-29 12:48

南京观海微电子----DDR的工作原理——DDR接口专栏（一）

DDR的发展历程SDRAM从发展到现在已经经历了四代，分别是：第一代SDRSDRAM，第二代DDRSDRAM，第三代DDR2SDRAM，第四代DDR3SDRAM，现在已经发展到DDR5SDRAM。

9亿少女的噩梦·2024-01-29 08:58

无标题文章

二代测序数据质量评估软件FastQC的安装及使用说明标签：_生信工具,_测序数据质控及评估二代测序数据质量评估软件FastQC的安装及使用说明当我们拿到二代测序数据后，第一件事肯定就是要查看一下测序质量的好坏了

星空_2739·2024-01-29 08:36

反思录2021-08-01

今天事情安排得有点太多，临时又收到测序数据，有点焦头烂额，根本忙不过来。专注最重要的事情，少就是多。今日反思：给自己安排的事情偏多了，慢下来，专注。

考拉王的桉树·2024-01-28 20:49

地缚少年花子君，阿普的弟弟阿司登场，还当着阿普的面夸赞七峰樱

作为一部很好的动漫作品，日本动画《地缚少年花子君》在小安的心中占有重要地位，小安相信很多人都被花子君平日里调皮捣蛋的性格圈粉了，同时对于花子君而言很明显可以看出在他的世界里藏有很多不为人知的秘密，为何他会变成第三代厕所里的花子呢

ACGN安乐·2024-01-27 23:47

NGS 数据mapping 算法简介

简介取得测序序列信息后，在有参考基因的情况下我们通过Mapping到参考基因组进行后续分析；没有则重头拼接序列。一般而言，基因组的组装将比readalignment消耗更多的计算资源。

茄子_0937·2024-01-27 20:06

帕里斯的裁判：谁是古希腊神话中最美的女人?

图片发自App第一位，赫拉（Hera）,古希腊神话中的婚姻与生育女神，奥林匹斯十二主神之一，天父宙斯的老婆，第三代天后。她的名字在古希腊语中为“贵妇人”，“女主人”，“高贵的女性”的意思。

云沁2018·2024-01-27 05:58

学习小组DAY7笔记--路超杰

思维导图高通量测序二代测序的专业名词flowcell：测序反应的载体/容器，1个flowcell有8个lanelane：测序反应的平行泳道，试剂添加、洗脱等过程的发生位置tile：每次荧光扫描的位置，肉眼是看不到的双端测序

Imimp·2024-01-27 01:24

一文掌握R包DESeq2的差异基因分析过程

转录组测序的最直接目的，就是设法寻找组间显著表达变化的基因，解释基因表达水平的变化对生物功能的影响。

纪伟讲测序·2024-01-26 12:20

计算机基础知识简答题汇总,计算机基础（简答）

第三代(1964年-1972年)为中小规模集成电路计算机，其主要逻辑元件是中小规模集成电路。第四代(1972年至今)为大规模

weixin_39720865·2024-01-26 11:47

长夜将尽【连载12】

若是谈起Billy，真的很少能给他贴出与众不同的标签，第三代移民，穿着完全意大利风格的日本人。对待人生目标很明确，大抵上便是这些了。他喜欢物理，是那种真正的与爱好不同的喜欢。这从他的目光里便能发现。

奶味盐·2024-01-26 10:08

2020-05-04 eigenMT

这种校正方法虽然准确，但对于大规模队列测序/大样本测序，需要数天到数周的高计算成本。与其相比，我们的方法减少了数量级的计算负担，同时保持了较高的精度。为了做到这一点，我们

程凉皮儿·2024-01-26 04:16

2022-06-23

单细胞RNA测序的研究表明，总mRNA含量与肿瘤表型息息相关。然而，目前为止，还未出现能够对总mRNA进行大规模泛癌检查的技术。近期，美国安德森癌症中心

图灵基因·2024-01-25 21:45

WGVD：小麦基因组变异与选择信号数据库 | CNGBdb收录数据库推荐

随着完整的小麦参考基因组的发布以及下一代测序技术的发展，来自面包小麦及其祖先的大量基因组数据已经产生，并为小麦遗传学研究提供了基因组资源。

尐尐呅·2024-01-25 21:50

文明、现代化、价值投资与中国（一）

《文明、现代化、价值投资与中国》是喜马拉雅资本创始人、查理·芒格家族资产管理人、价值投资思想第三代代表人物李录的文集。

大寶天天践·2024-01-25 14:19

5G赋能智慧文旅：科技与文化的完美结合，打造无缝旅游体验，重塑旅游业的未来

2016年，3GPP（第三代合作伙伴计划）发布了5G的初步技术规范，标志着5G进入了标准化阶段。在此后的几年中，全球各地的运营商和产业链相关企业积极参与5G技术的研发和试

方案365·2024-01-25 11:08

单细胞测序笔记1：数据读取

（一）准备工作我们先向R中安装如下包以确保准备工作的完成install.packages("BiocManager")BiocManager::install("mulltest")#似乎只有Bioc里面才能安装mulltestif(!require(Seurat))install.packages("Seurat")if(!require(dplyr))install.packages("dpl

陈天白·2024-01-25 11:37

高分文章热门测序结果验证方法，解决你的选择困扰

随着测序技术的发展和应用的普及，研究者们在拿到大量的测序结果后，面临的困扰是怎样选择合适的结果验证策略。在这里，我们一起来了解一下高分文章中有哪些热门的验证方法吧，总有一种适合你。

ee00dc6faab7·2024-01-25 09:26

240124学习记录：查看/提取bam文件的reads

BAM文件（BinaryAlignment/Mapfile）是一种常用于存储测序数据的二进制格式。它主要用于存储DNA测序数据的比对（alignment）信息。

丁优雅ya·2024-01-25 05:22

基因组与转录组，深入挖掘基因表达信息--02

本研究对在中国广泛种植的杂合猕猴桃“Hongyang”（A.chinensis）的基因组进行测序分析。该基因组序列的可用性不仅为了解猕猴桃及其野生近缘种的特定农学重要性状的潜在分子基础提供了见解

百迈客生物·2024-01-24 23:12

深度学习-循环神经网络-RNN实现股价预测-LSTM自动生成文本

序列模型（SequenceModel）基于文本内容及其前后信息进行预测基于目标不同时刻状态进行预测基于数据历史信息进行预测序列模型：输入或者输出中包含有序列数据的模型突出数据的前后序列关系两大特点：输入

小旺不正经·2024-01-24 16:55

基因组评估软件gaep

基因组组装评估指标基因组评估软件geap，overviewoftheGAEPpipelinemainworkflowoftheGAEPmisassemblydetectionmoduleGAEP是一款能够基于二代、三代测序以及转录组测序数据

花生学生信·2024-01-24 08:17

Day17

今天有一件高兴的事:拿去测序的样本全部质检合格，明天交完上机检测表就可以测序了，两周左右就能拿到结果。加油！不负韶

Lucky_笑·2024-01-24 06:11

学习小组Day7笔记--WX

测序知识特别鸣谢：@公众号：生信星球豆豆&花花老习惯，先来张思维导图~Day7-测序知识再补充些Illumina二代测序技术中涉及到的名词~flowcell：测序反应的载体/容器，1个flowcell有

xiaoxiaomiya·2024-01-24 04:29

舔狗舔狗，舔到最后，一无所有

我今天上午轻仓抄底了600460士兰微，没想到的是，半导体板块今天居然大爆发——尤其是昨天收盘笔记里提到的第三代半导体——600460居然涨停了，真的只恨自己抄底抄少了啊！

龙叔的自由之路·2024-01-24 03:57

2021-11-26

丨非小细胞肺癌单细胞分析细化了肿瘤分类和患者分层原创珍奇图灵基因今天收录于话题#前沿分子生物学机制撰文：珍奇IF：31.743推荐度：⭐⭐⭐⭐⭐亮点：本研究通过多尺度单细胞分析对更大的患者队列进行分析，从而定义在肿瘤微环境中诱导的分子免疫状态；通过测序将免疫细胞的单细胞

图灵基因·2024-01-23 22:41

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