质控

scRNA基础分析-3：鉴定细胞类型

scRNA基础分析-1:安装包、导入数据、过滤质控-scRNA基础分析-2：降维与聚类-scRNA基础分析-3：鉴定细胞类型-scRNA基础分析-4：细胞亚类再聚类、注释-scRNA基础分析-5：伪时间分析
小贝学生信·2023-06-07 09:30

C#医院LIS系统源码 LIS实验室管理信息系统源码 LIS检验系统源码

架构客户端：WPF+WindowsForms服务端：C#+.Net数据库：Oracle接口技术：RESTfulAPI+Http+WCF2、LIS主要功能模块：报告管理模块、字典管理模块、医院设备站点模块、质控管理模块
源码技术栈·2023-06-07 02:02

shot-gun宏基因组：KneadData质控，Kraken2Bracken物种分类，HUMAnN3功能注释

一、质控-KneadDatakneaddataGITHUB:https://github.com/biobakery/kneaddatakneaddata软件获取condainsta
胡童远·2023-05-09 22:04

全基因组关联分析（GWAS）-基本分析内容

1、GWAS流程image.png数据质控•1）按分型百分比条件过滤，多数文章剔除缺失率在20%以上的位点，样本量较大的群体中，可以将缺失率小于50%的位点都保留；•2）按等位基因频率过滤，通常去除第二等位基因频率小于
Zhigang_Han·2023-04-21 04:00

金钱的能量其实是爱的能量（转载）

02缘开始了舍外求内，逐步脱离部分物质控制，有意识地选择放下一些，开始回归到身体本质层面，明白身体是修行的根基，开始爱自己，花精力去修复还原自我的身体和心灵，并且已经懂得了回归生命，进入到本源！
悦动生命·2023-04-20 18:15

2020-01-21 测序数据的质控和过滤

二代测序数据下机后一般为rawdata，这时候含有一些低质量测序数据和街头污染数据，我们要将低质量数据过滤掉获得cleandata用于后续分析；本过程涉及到的软件Fastqc(用于测序数据质控)，MultiQC
xiaoguolaile·2023-04-19 04:01

加班

作为临检组组长，首要任务就是要把每个月的质量质控做好。今天休息，下午回去加班打算花两个钟把质控做好。四点半到的科室，可我竟然做到晚上十点半，用了六个小时。在做的过程中，我明显看到我对这项工作的厌恶。
Vivi_huang·2023-04-18 11:59

蛋白质组学实验设计、质控与分析

1.实验设计与技术路线(1)常用流程流程说明1.材料收集细胞、细胞上清、组织、血浆、血清、脑脊液、外泌体、尿液......2.定量技术蛋白组：iTRAQ/TMT、LabelFree、SILAC、修饰；代谢组：靶向、非靶3.数据验证蛋白组：PRM、WB、ELISA；代谢组：MRM4.深入研究临床标志物、生理病理机制、药效机制、中医理论、药物靶点......(2)样品样品类型Pool（混样）Indiv
Bioinfarmer·2023-04-16 15:57

2020-01-23 【转录组】二、fastp 批量 质控及过滤

选区_009.pngforiin{52..61};dofastp-i~/1data/01fastq/SRR31837${i}.sra_1.fastq-o~/1data/03fastp/SRR31837${i}_1.fastq.gz-I~/1data/01fastq/SRR31837${i}.sra_2.fastq-O~/1data/03fastp/SRR31837${i}_2.fastq.gz-w
my_derek·2023-04-15 18:09

Genomic Data Science- JHU Course 2 Genomic Data Science with Galaxy 笔记

IntroductionGalaxy是一个公开的基因组学分析平台，包含了一系列流程化分析工具，针对质控、组装、注释以及包括Chip-seq、RNA-seq、变异鉴定等常见的组学流程pipeline。
精神秃头生信小伙儿·2023-04-15 06:56

医学检验信息系统源码 .Net Core版云LIS系统源码

云LIS系统是医院信息管理的重要组成部分之一，集申请、采样、核收、计费、检验、审核、发布、质控、查询、耗材控制等检验科工作为一体的网络管理系统。
淘源码A·2023-04-14 23:06

ATAC-seq 质控

1.写在前面1年前看技能树在的文字教程第一次跑ATAC-seq分析流程，当时还很懵懂，以为每一步只有一个工具，现在通过技能树刚发在b站的视频再次学习ATAC-seq分析流程，感觉眼界更开阔了，同时看视频总是能偷学到很多Jimmy老师的小技巧，简直血赚。视频链接：https://www.bilibili.com/video/BV1C7411C7ez总的一些标准在：https://www.encode
大吉岭猹·2023-04-14 12:35

RNA-seq转录组数据分析丨一套完整的案例流程

今天分享的学习笔记是一套转录组分析简单流程，适用于初学者入门阅读，从原始测序数据开始，经过质控、序列比对、定量表达、差异表达、功能富集等一系列分析步骤，最终获得基因表达信息。
生信分析笔记·2023-04-13 16:10

易基因｜RNA m5C甲基化测序(RNA-BS)全流程

m5C存在于tRNA上时，可以对翻译进行调节；存在于rRNA上时，可以对核糖体的生物合成进行质控；存在于mRNA上时，则可以影响mRNA的结构、稳定性及翻译过程。
易基因科技·2023-04-13 14:29

RNA-seq入门实战（一）：上游数据下载、格式转化和质控清洗

命令根据SRR号下载SRA文件3.使用fasterq-dump/fastq-dump命令将SRA文件转为FASTQ格式，pigz软件多线程压缩（可选）4.使用fastqc和multiqc进行测序数据的质控查看
嘿嘿嘿嘿哈·2023-04-12 12:16

细菌基因组的组装

4.Fastqc质控，去接头用fas
空泠棱·2023-04-12 09:03

RNAseq生信分析流程简介

文章目录RNAseq简介RNAseq分析流程1.实验设计1.1目标RNA提取策略和文库类型选择1.2测序深度或文库大小1.3实验重复2.RNAseq信息分析2.1质控和过滤2.2比对2.3新转录本的发现
心如止水-WTF·2023-04-11 21:38

0506内经

比如dgf质控，不懂的名词可以百度丁香园，查到的文章要自己理解后记录，思考新的问题写成文章。有能力还可以翻译外文文献。这
宇智博·2023-04-11 21:27

TCGA甲基化芯片数据质控和过滤

在step1中，我们获得了TCGA中OSCC的32个病人的T-N配对样本和对应的临床信息,并将其组成了一个名为my_Load的ChAMP对象。rm(list=ls())library(ChAMP)library(stringr)load('./Rdata/step1_myLoad.Rdata')myLoad$beta[1:4,1:4]#>TCGA-CV-6959-01TCGA-CV-6436-11
小洁忘了怎么分身·2023-04-11 19:59

一种采用第四代稀土纳米荧光材料的荧光免疫层析技术

该技术以固定有检测线(包被抗体或包被抗原)和质控线(抗抗体)的条状纤维层析材料为固定相，测试液为流动相，荧光标记抗体或抗原固定于连接垫，通过毛细管作用使待分析物在层析条上移动。
Mr_Matrix·2023-04-11 09:01

【我家的故事全原创】~《我怎么如此幸运423》#99天能量将帅挑战赛第77天

意想不到谁给你补足缺欠谁就是质控你！06:17意想不到老庄爷爷说：啾啾的演讲是为了什么，鼓掌的人收获了了吗？爷爷说：云光说好像不在乎对方有没有收获，就是在说。意想不到说了，对方没有收获，为什么要说呢？
李静媛嘛嘛·2023-04-11 00:08

WCF手麻系统源码，手术室麻醉临床系统源代码，商业源码 有演示

仓储模式开发语言：C#开发工具：VisualStudio2019前端框架：Winform后端框架：WCF数据库：sqlserver手术麻醉临床信息管理系统完整实现了围手术期内以患者为中心，以临床路径为导向，以质控管理为依据的信息
淘源码d·2023-04-10 03:07

CellRanger初探

SRA原始数据转fastq公共数据库的SRA数据需要借助fastq-dump转为fastq文件，然后进行质控、CellRanger定量等操作。
新欣enjoy·2023-04-09 05:27

对SNP的VCF文件质控筛选

对SNP的VCF文件质控筛选1.vcfR简介vcfRisapackageintendedtohelpvisualize,manipulateandqualityfilterdatainVCFfile.参考资料链接
小鹏_哒哒哒·2023-04-09 00:38

生命的三个层次

标签：恐惧焦虑贪婪自私愤怒冷漠羞愧内疚自责悲伤轻狂傲慢自以为是第二层开始了舍外求内，逐步脱离部分物质控制，有意识的选择放下一些，开始回归到身体本质层面，明白身体是修行
雨瑶喜悦王·2023-04-08 16:05

书海拾贝----< 故事思维>

故事思维图片发自App书必须是凿破我们心中冰封海洋的一把斧子当人们从你的身上嗅出了欺诈的味道，他们会远远地避开你一个充满激情的质控经理，如果被员工们认为是“没有人性的机器”，他渴望提升客服水平的雄心壮志也只能付之东流
风一火·2023-04-08 12:01

rna-seq定量分析流程

从read比对结果中获取定量数据现在我手头已经有公司质控过后的rawdata，并且也已经通过hisat2和samtools拿到了bam文件，想进一步进行定量分析，首先需要对基因（转录本）的表达进行定量，
无人写诗的日落·2023-04-08 09:26

如何理解PCR跑胶图

最左边为一个参考条带；2.右边右边是实际PCR出的片段分布，跑胶(以肉眼可见的方式显示PCR片段长短的分布)的作用主要有两个：作用一：质控，如果出现明显的拖尾，代表PCR片段长度比较杂，有可能出现降解；
生信汪·2023-04-07 22:12

26岁，人生的岔路口，我该如何前行

其实，六年的工作，并非没有辉煌的时刻，也许是因为运气，2019年的元月，我由起初的机械操机，调到了三坐标测量室，成为了一名质控测量员，负责编程测量工件
隔壁锤总·2023-04-07 19:24

设计模式-代理模式

个对象存在不同的地址空间的事实），虚代理（延迟加载lazyload），保护代理（在代理前后做额外操作，权限管理，引⽤计数等）；b.在分布式系统中，actor模型（skynet）等常⽤的设计模式；4.本质控制对象访问
18189298828·2023-04-07 02:51

提升管理能力

今天召开集团质控会议，对李经理的总结分享印象深刻，其中讲到的提升管理能力的四个方面，分别是沟通能力、协调能力、规划能力、决策能力。1.沟通能力一个人的管理能力怎么样，首先得看他的沟通能力如何。
燕霞·2023-04-06 17:45

NGS 数据质控软件—fastp

image.png陈实富博士编写的fastp软件能实现FASTQ数据自动化过滤、剪裁、错误校正等功能，因其多样的功能和高效的速度受到了许多用户的欢迎，已成为NGS质控领域不可或缺的软件。
生信小书童·2023-04-06 10:28

今天安装了Miniconda

/home/bio12/biosoft里面查看当前服务器上安装的所有软件列表condalist微信图片_20210523161353.png搜索conda软件condasearchfastqc(以数据质控软件
Silva·2023-04-05 09:05

生物信息数据质控详解（全基因组）第一辑

目标全基因组关联研究(GWAS)在鉴定单核苷酸多态性(SNP)和表型特征之间的关联方面变得越来越流行。GWAS方法通常应用于社会科学。但是，需要仔细进行统计分析，并且需要使用专用的遗传学软件。本教程旨在为进行遗传分析提供指导。方法我们讨论和解释关键概念，并说明如何使用通过https://gitee.com/apexone/GWA_tutorial提供的示例脚本进行GWAS。除了标准GWAS的说明外
超级宇航员·2023-04-05 04:09

新年期待一

我们虽然一直有做，但这次重新整合构建同样是因为看好市场，不愿局限于之前的模式，而是想通过严格的品质控制做成有影响力的品牌。并期待在保质有量增长的基础上，将我们在核桃仁及坚
安于不安·2023-04-04 16:11

chatGPT在业务开发中的实战-写一个业务文档（文末附完整文档）

最近需要调研影像图像质控系统，但对于这块内容完全不明白，于是今天上午跟chatGPT探讨了半个小时，最终完成了一份影像图像质控系统的文档，感觉有了这份文档都能下手写代码了，chatGPT确实是非常之强大
十步杀一人_千里不留行·2023-04-04 03:50

WGS分析笔记（1）数据+质控 2021-12-15

最近在做数据分析，同时把笔记整理一下，查漏补缺。Step1.miniconda3创建虚拟环境condaenvlist#可以查看虚拟环境，默认安装的为base环境，*号表示当前环境condacreate-nyour_env_name#创建虚拟环境condaactivateyour_env_name#激活虚拟环境sourceactivateyour_env_name#激活虚拟环境condadeacti
阿含是白白·2023-04-04 03:10

TCGA甲基化数据质量控制和差异分析（使用ChAMP包）

参考文章：1.甲基化芯片入门学习-ChAMP包（二）2.TCGA数据库的癌症甲基化芯片数据重分析3.TCGA甲基化芯片数据质控和过滤4.甲基化芯片数据的差异分析5.甲基化芯片注释中的CpGshores,
生信start_site·2023-04-03 18:47

2022-06-06D84天周一

不要再熬夜，总是一再做同样的誓言，成年人了，有意思吧，好笑，不过本周不用再质控了，但是以后的时间也不一定好多少，因为越来越少人在固定门诊了，所以呵呵。
笑笑狗尾草·2023-04-03 18:11

测序质控软件-trim_galore安装（2018-05-25）

1.源代码下载：https://github.com/FelixKrueger/TrimGalore2.查看安装日志：InstallationTrimGalore!isaaPerlwrapperaroundtwotools:CutadaptandFastQC.Touse,ensurethatthesetwopiecesofsoftwareareavailableandcopythetrim_gal
简单点lili·2023-04-03 10:46

关于年目标（五）：如何提升目标制定后的风险防范意识？

医院里，一般会设置质控部，来负责监督
林畅是个小太阳·2023-04-01 06:52

从0开始的RNA-seq教程

样本：植物的叶和茎的转录组；测序方法：双端测序；有参考基因组文件1.数据质控拿到测序数据，第一步进行md5检测，确定文件没有损坏。
五香可达鸭·2023-04-01 06:40

R-Seurat单细胞数据分析流程

Seuratstandardpipeline创建Seurat对象质控Normalization特征选择数据缩放线性降维维数选择细胞聚类非线性降维（UMAP/tSNE）鉴定差异表达特征（clustermarkers
尘世中一个迷途小书僮·2023-03-31 14:15

生信入门学习顺序

cdlsmkdirrmpwdln-svishlesscatsortgrepawk2、学习linux运行程序的基本方法（1h）sh运行文件screen的使用如何向程序传递参数3、学习xshell和filezilla的使用（0.5h）4、在服务器上运行fastqc对二代测序结果进行质控
野生拟南芥·2023-03-31 01:25

动态纹理-颜色

材质控制：materialvarredTube=viewer.entities.add({name:'Redtubewithroundedcorners',polylineVolume:{positions
Cherry9507·2023-03-30 19:42

要解决问题2022.04.05

多个样本单细胞分析流程*单细胞转录组高级分析一：多样本合并与批次校正单细胞转录组高级分析一：多样本合并与批次校正单细胞分析实录(6):去除批次效应/整合数据哈佛大学单细胞课程|笔记汇总（六）单细胞数据的导入与质控
oceanandshore·2023-03-30 03:12

RNA-seq实战分析流程

一、下载测序数据①SRA数据库[存储二代测序的原始数据]②在进行上游分析时，数据格式转换过程概述如下：sra↓FASTQ↓bam↓counts③质控处理的相关软件：•fastqc•cutadapt•TrimGalore
ShanSly·2023-03-29 04:58

学习总结

池塘养殖水质控制的目标是为养殖动物提供并维持一个相对稳定的、各种水质参数适合于该动物生存、生长的水生生态环境。稳定是相对的，不稳定是绝对的。
谷欢欢·2023-03-29 04:59

最美的相逢

质控板块在一个阳光明媚的早晨，组织大家到海滩联谊，有一个跳绳活动，她不小心跳的时候把
小古_2214·2023-03-28 15:32

2020-01-08

让我不舒服时有地方躺会儿感恩张燕主任给我瞧病感恩护士为我做治疗感恩病中坚持为病人服务感恩孩子的说妈妈你多喝水感恩灵淼发来的照片，重温美好时光感恩小屈给我测病毒感恩自己的甲流，我感受到老公孩子的关爱感恩老公做的挂面汤感恩孩子关心我是否需要输液感恩我的车载我回到温暖的家感恩孩子做独一无二的自己感恩自己聪明智慧将质控纠正感恩温馨可爱的家感恩老
卉倾·2023-03-27 07:21
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