质控第5页

单细胞测序基础知识

构建文库上机测序根据不同的荧光检测不同的碱基质量控制（质控QC）去除低质量的序列表达定量统计reads数，进而得到表达矩阵标准化让所有样本处在同一起跑线上主成分分析PCA图中每个点都代表一个样本，不同颜色表示不同类别

来份芒果布丁·2023-08-07 05:42

一文看懂病原微生物检测（下篇）

基本步骤如下：1.数据质控2.去除人基因组3.与数据库比对，鉴定病原微生物4.生成报告01数据质控数据质控主要包括去除低质量的re

生信阿拉丁·2023-08-05 18:55

生产管理之班组长的作用

有些企业呢，把生产计划、人员培训、设备维护、品质控制等等管理责任全部压给班组长，一出问题就找班组长的责任，活生生的把班组长不当班组长看。

深蓝管理咨询·2023-08-02 17:24

GWAs——全基因组关联分析流程

一、质控质检1、控制检出率在最初的二进制文件中，存在着缺失SNPs数据的

Odd_guy·2023-08-02 14:50

微生物菌群多样性研究—原始数据质控

今天我们继续更新在微生物多样性研究过程中涉及到的知识点和常见的分析方法辨析。希望能给初入研究的小白在连载中滤清思路、获得启发。菌群多样性分析是通过测序技术对微生物基因组中的marker基因（细菌为16S序列，真菌为18S或ITS序列）全长区段或部分区段进行测序从而得到环境样本中微生物种类和丰度信息的，基于现在的基因测序技术和菌群多样性的研究目的，对于marker基因的扩增、测序绝大多是通过二代测序

上海唯那生物·2023-08-02 11:16

[GWAS]杂合度质控

在一群自然群体种，基因型个体的杂合度过高或者过低都是不正常的，我们需要根据杂合度来进行过滤。这里的偏差可能表明样品收到污染，或者近亲繁殖。我们采取的做法是删除样品杂合率平均值中偏离±3SD（sd就是标准差）的个体非自然群体中，比如自交系，杂交种F1，这些群体不需要过滤杂合度参数过滤合手动过滤：plink有个特点，所有的过滤标准，都可以生成过滤之前的文件，然后可以手动过滤，也可以用参数进行过滤。比如

Gremmie2003·2023-08-02 02:55

[GWAS]基于plink的亲缘关系质控

本篇我们要对一下具有亲子关系的个体进行过滤，然后计算类似于IBS的结果血缘同源（IdentityByDescent，IBD），子代中共有的等位基因来源于同一祖先。状态同源（identicalbystate，IBS），两个个体拥有相同的等位基因（不一定来源以同一祖先）。不太了解的同学IBD/IBS这里讲亲子关系的移除其实不是必须要的，比如我们分析的群体里面有亲子关系的个体，想要进行分析，不需要做这一

Gremmie2003·2023-08-02 02:55

10月19日！东南DX5杭州站重磅上市，等你来撩！

全新东南DX5重磅上市，致力为有梦敢拼青年打造的“颜质控，精致SUV”！助力事业更向上，演绎生活精彩，官方指导价6.

倾夕思念·2023-08-01 04:54

WGS完整流程介绍(原始数据质控、数据预处理、变异检测、数据注释)

一、原始数据质控1.原始测序数据(也是reads)从测序仪中直接取下来的数据，它包括了所有的碱基，无论是测序质量低的，还有可能包含测错的，可能还会包含实验误差。

如意的小家·2023-08-01 01:21

FG12组装注释全过程

测序：RNA-seq：100Xnanopore：80Xresequence：30X质控：使用fastp对RNAseq和Resequence测序数据进行质控ResequenceQ20，Q30皆为100%RNAseqQ20

马连洼小法师·2023-07-31 16:10

实验室十二大要素

1八大计划①仪器检定计划②人员讲训计划③内审计划④管理评审计划⑤质控计划⑥期间核查计划⑦质量监督计划⑧能力认证计划2四个唯一性标识①仪器设备唯一性标识②文件唯一性标识③样品唯一性标识④报告唯一性标识3十大岗位设置

遇见小me·2023-07-29 20:23

ChIP-seq数据比对注意事项

关于ChIP-seq的实验对照与偏差来源4：ChIP-seq的实验设计补充5：ChIP-seq数据库及实战数据介绍然后开始实战部分：6：ChIP-seq计算资源准备与实战数据下载7：ChIP-seq数据质控和过滤这一次将介绍不同的比对方法和参数设置注意事项比对的目的

刘小泽·2023-07-29 16:35

FastQC

“Aqualitycontroltoolforhighthroughputsequencedata.”FastQC是JAVA语言编写的能够对高通量测序数据进行质控的软件。

希望你会好·2023-07-27 15:54

汲汲忙忙盈晚秋

护理部院感科统计科要各种月报表，财务科要月帐单，人事科要考勤，疫情防控的督导，护理质控，上级单位要各种汇总表，文字的电子的不一而足。

自由行走的女人花·2023-07-27 14:11

2023.07.05【bug笔记】|bwa比对报错：Segmentation fault

问题描述经过正常质控，建立参考基因组索引后，样品在比对过程开始发生报错：bwamem-R'@RG\tID:foo\tSM:8_F282_22_8_328350w_GF1\tLB:CDGenomics'-

穆易青·2023-07-26 19:43

你应该懂点，人生中三个高度！

天空很蓝人生的三个层次第一层一直活在物质的世界里一辈子被物质假象迷惑所困全部精力去追求财富名利欲望身体消亡的那一刻也没弄明白为何而来回归何处这一世等于白来85%的人活在这个层标签:恐惧焦虑贪婪自私愤怒悲伤冷漠羞愧内疚自责轻狂傲慢自以为是天人合一第二层开始了舍外求内逐步脱离部分物质控制有意识的选择放下一些开始回归到身体本质层面明白身体是修行的根基开始了爱自己花精力去修复还原自我的身体和心灵这些人已经

知识摆渡人·2023-07-26 15:01

Trim Galore ——自动检测adapter的质控软件

之前分析过的测序数据，数据质量都很好，给了我一个错觉质控的前后差别不是很大，内心里对质控这一步也就不是很重视，跑完质控有时也懒得看结果，拿到一批测序数据后，也总是忽略了去看测序策略是什么，按照固定的流程用

六六_ryx·2023-07-23 17:15

7.31

实验室——质控上机组终于终于终于历经九九八十一个关卡，来到最后一步啦，质控上机主要由质控、Pooling、上机三步组成，下面让我们慢慢揭开这神秘的面纱，一起探索基因序列的奥秘吧！

寒林_4c5c·2023-07-23 15:02

day46 转录组质控

学习资料：B站jimmy大神的视频一、质控命令用到的fastqc是北鲲云上自带的，multiqc是在conda的py3.7环境里自己装的。

meraner·2023-07-22 19:13

在梦里发泄

三十多天的时间，我把每个岗位的工作都学了一遍，最后，我被安排在质控部门做实习质量工程师。与我同部门的，都是些99年前后的小伙子小姑娘，他们都是初中毕业之后就到这个地方。

Jack罗杰·2023-07-21 23:22

孤岛谋杀—《无人生还》

当晚，一个神秘的声音质控了每个人心

溜溜梦cx·2023-07-21 07:50

生命的三个层次，你在哪一层？

【第二层】开始了舍外求内逐步脱离部分物质控制，有意识的选择放下一些，开始回归到身体本

枫的鸟儿·2023-07-20 14:40

转载：王月芬：作业改革要抓住这六大关键（光明社教育家 2022-08-10 15:38 发表于北京）

对作业的提质控量增效，是学校作业设计的价值追求。当前不少学校对作业的设计和研究非常低级，仅仅停留在布置作业的层面，很少思考布置的作业到底好不好。很多老师和家长都觉得，做作业就是做试卷，刷题越多越好。

送柳音·2023-07-20 12:45

IPQC的检验流程

IPQC是指产品从物料投入生产到产品最终包装过程的品质控制。

KLOCK·2023-07-20 07:35

10X单细胞目前大多数公司基本和高级分析汇总

这次我们客套话就不讲了，直接上干货列表汇总图片.png我们来逐步看看（质控部分）图片.png图片.png细胞聚类及可视化图片.png样本/cluster差异分析图片.png图片.png图片.png批次效应去除图片

单细胞空间交响乐·2023-07-20 02:15

【JAVA】云HIS系统功能菜单知识（一）

一、云HIS特色云HIS滚动消息栏：质控消息、住院时长、药库结转、患者入院、医嘱停止、新开医嘱、门诊用药不良、出院审核、药品调拨、排班提醒、药品库存、药品过期、药品临期等帮助医生、护士和相关管理人员实时接收院内消息并作出处理

源码技术栈·2023-07-19 12:04

2021-09-10 TCGA批次（2）

TCGA:质控样本过滤和基因过滤TCGA：批次校正批次效应是在进行实验的时候附带产生了和实验结果没有关系的数据偏差。

一去二三·2023-07-19 06:18

是不是上班族都有个辞职梦？

实习时，只是纯粹干活，不用操太多心，不用不停的业务学习，不用每周查房，每月质控，不用刷学分……而且最最最重要的一点是刚上班时压力好大，

小孩抓丫·2023-07-19 01:36

[GWAS]plink基因数据性别质控并用R作图

不太熟悉plink的朋友先去熟悉一下它的一些用法plink常用参数→本篇主要针对人类性别的信息的质控,主要是根据性染色体上SNP的比值,判断性别,然后把性别错误的个体去掉或者更改性别信息.对其他的物种参考意义不大

Gremmie2003·2023-07-17 17:23

20211229报奖任务归档

日更243/300天（2021年第243篇）星期三，@明发，天气晴因为周五可以提前回家，所以这两天赶紧找领导签字，把报奖项目的归档工作做完，提交了，目前还差我们部门的质控负责人，所以还需要等下周一才可以提交最终成果

青争无生·2023-07-16 23:17

SQLLineage.com（分析SQL的数据血缘关系）

而数据的多样性和差异性使得数据生产不得不不断的迭代处理逻辑，分层数仓的设计简化了单层数据模型的设计，但增加了额外的计算资源消耗，当出现数据质量问题时更是质控者的噩梦。

ding__lin·2023-07-16 14:36

【R>>scRNA】单细胞交响乐2-从实验到下游分析workflow

先定个小目标，系统的学习完刘小泽老师的《单细胞交响乐1-31》两张非常重要的图scRNA-Workflow原来不用Seurat也可以做到质控、挑高变化基因：下面分析下droplet-based的视网膜数据

高大石头·2023-07-16 13:00

[GWAS]plink数据格式的转化和缺失质控

本篇笔记整理于邓飞大佬的GWAS学习教程,他在B站上发布了一系列教学课程,推荐大家去看看plink数据格式的转化plink的bfile格式，二进制不方便查看，我们将其转化为文本map和ped的格式。plink--bfile[bfile格式的二进制文件]--recode--outtest最后的–out代表输出为test文件.结果:PLINKv1.90b764-bit(16Jan2023)www.co

Gremmie2003·2023-07-16 11:04

管理脑电研究：准备工作以及质控方案

摘要在进行脑电图(EEG)研究时，研究的严谨性和可重复性十分重要，无论是何种规模的研究项目，数据采集和质量控制都极其关键。本文的目的在于为脑电研究的组织与实施提供指导建议。本文涵盖以下内容：一、数据收集前的准备工作。包括建立和培训研究团队、实验设计和试点研究的注意事项、实验设备和软件设置、开发正式协议文件以及与研究团队成员规划沟通策略。二、数据收集开始后的相关工作。包括EEG数据质量监控、实验方案

茗创科技·2023-07-16 08:09

LIS医学检验信息系统智慧检验实验室系统源码

医学检验信息系统(LIS)涵盖实验室的全部管理流程，包括从检验申请、标本采集、实验检测、报告发布的完整流程，以及质控管理、科室事务、试剂管理等功能，遵循医学实验室认可标准ISO15189的要求规范，适合各种实验机构的业务流程

源码集结号·2023-07-16 01:19

云 LIS 实验室信息管理系统源码 C#检验系统源码

云LIS系统技术架构：ASP.NETCORE3.1MVC+SQLserver+Redis等一、云LIS的基本功能：集齐前处理、检验、报告、质控、统计分析、两癌等模块。检验标本采集：护

源码集结号·2023-07-16 01:18

生命的三个层次，你在哪个层级

全部精力去追求财富名利欲望，身体消亡那一刻也没弄明白为何而来，回归何处，这一世等于白来85%的人活在这个层标签：恐惧焦虑贪婪自私愤怒悲伤冷漠羞愧内疚自责轻狂傲慢自以为是第二层开始了舍外求内，逐步脱离部分物质控制

七色花园·2023-07-14 16:11

读书 | 掌控自己，掌控世界

书上说，人脑中的前额皮质控制着我们去关注什么、想些什么，甚至能影响我们的感觉。斯坦福大学的神经生

GiGi咩·2023-07-14 02:14

RSeQC使用

官网：http://rseqc.sourceforge.net/ref1：RSeQC使用笔记–生信笔记ref2：RSeQC对RNA-seq数据质控|生信菜鸟团1.geneBody_coverage.pygeneBody_coverage.py-rhg19

苏牧传媒·2023-07-13 21:43

如何借助数理统计中的区间估计进行质控

目录如何借助数理统计中的区间估计进行质控场景描述如何估计确定分布及估计量区间估计新的改变功能快捷键合理的创建标题，有助于目录的生成如何改变文本的样式插入链接与图片如何插入一段漂亮的代码片生成一个适合你的列表创建一个表格设定内容居中

lingzi_zhou·2023-06-22 21:54

嫁不起的妈宝男！

婶子是质控官，个子不高的、身材不好的、相貌不佳的统统被她刷了下去。长相好的、会做

甜栗子·2023-06-22 13:00

如何将Seurat聚类结果导入到Loupe Browser

而Seurat作为使用最广泛的单细胞转录组分析软件，可以对数据进行各种质控以及下游分析。然而其官方可视化软件LoupeBrowser对于没有R语言基础的老师来说，是十分方便的分析工具。

生信阿拉丁·2023-06-17 05:56

MultiQC软件安装运行的过程

但是几乎所有的质控工具都是针对单个样本生成一个报告，用户自己要逐一查找各个QC结果，十分耗时、重复又复杂，而且还不能快速看出所有样本的异同。

千万英里·2023-06-16 21:06

跟着Cell学单细胞转录组分析(六):细胞比例计算及可视化

跟着Cell学单细胞转录组分析(二):单细胞转录组测序文件的读入及Seurat对象构建跟着Cell学单细胞转录组分析(三):单细胞转录组数据质控（QC）及合并去除批次效应跟着Cell学单细胞转录组分析(

TS的美梦·2023-06-15 20:13

C#基于云计算SaaS模式的医学检验云LIS系统全套源码

一、云LIS系统概述：云LIS系统是一种基于云计算技术的实验室信息管理系统，它的主要功能是管理实验室中的各种信息数据，包括样品数据、检测结果、仪器设备管理、质控管理等。

源码技术栈·2023-06-15 04:19

2018-12-15 《全国医院信息化建设标准与规范（试行）》

建设标准中，对于大数据的具体内容和要求如下标准中多处强调电子病历的标准化和质控，国家对电子病历的重视增加，有利于企业推进专病结构化电子病历。目前来看，科研仍然是医院的重点需求。

Liz_Shi·2023-06-15 03:42

生信技能树单细胞数据挖掘笔记(2)

生信技能树单细胞数据挖掘笔记(1)：数据读入生信技能树单细胞数据挖掘笔记(2)：创建Seurat对象并进行质控、筛选高变基因并可视化生信技能树单细胞数据挖掘笔记(3)：降维与聚类生信技能树单细胞数据挖掘笔记

周小钊·2023-06-13 00:23

基于云计算的检验所云LIS系统源码（两癌筛查）

SaaS服务，无需部署，开通账号接口快速入门使用，集齐前处理、检验、报告、质控、统计分析、两癌等模块。

源码技术栈·2023-06-12 16:22

第三方实验室云LIS系统