高通量第9页

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220415更新221020更新内容主要分成两大块：1.DataScience统计学和RRShiny(更新中)ggplot2图形艺术(更新中)2.BioScience生信工具箱vcf数据分析系列(已完结)NGS高通量分析管道

Jason数据分析生信教室·2022-10-29 16:34

[Spark、hadoop]Spark Streaming整合kafka实战

方式温习Kafka是由Apache软件基金会开发的一个开源流处理平台,它使用Scala和Java语言编写，是一个基于Zookeeper系统的分布式发布订阅消息系统，该项目的设计初衷是为实时数据提供一个统一、高通量

发量不足·2022-10-18 07:00

链偏倚（strand bias）对Illumina短序列测序数据的影响

1摘要背景：当使用Illumina高通量仪器进行短序列测序时，有些时候正链和负链显示的变异类型却显著不同，一个可能显示是纯合突变，一个可能显示是杂合突变，这种现象被称为

生信小书童·2022-10-05 22:52

2021-06-24 GEO数据库

它创建于2000年，收录了世界各国研究机构提交的高通量基因表达数据，也就是说只要是目前已经发表的论文，论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以通过这个数据库中找到。关键是这个数据是免费的！

学习生信的小兔子·2022-09-28 17:52

染色质调控区域的研究：对CHIP-seq和ATAC-seq发展的深入思考

表观基因组测序技术，如染色质免疫共沉淀测序(CHIP-seq)和转座酶开放染色质高通量测序(ATAC-seq)，使我们能够通过检测特定的染色质状态及其相应的转录因子，在时间和空间维度上剖析细胞和组织的基因组调控格局

易基因科技·2022-09-24 07:39

全基因组测序数据分析--导

目前，高通量全基因组测序(WGS)和全外显子组测序(WES)被广泛用于研究DNA序列变异对人类多样性的影响，识别与人类复杂性或孟德尔病相关的遗传变异，并揭示不同人群的变异。

亦是旅人呐·2022-09-20 14:18

ChIP-seq应用领域、研究思路、数据挖掘、下游实验、实验关键 | 易讲堂

在ChIP的基础上，用二代测序检测ChIP实验的DNA产物，将ChIP与高通量测序技术相结合的ChIP-seq技术，可在全基因组范围对特定蛋白的DNA结合位点进行高效而准确的筛

易基因科技·2022-08-19 07:34

圣庭医疗联合创始人谷红仓：高通量基因测序在药物研发和靶向治疗中的应用

摘要：2022年8月5日，2022阿里云生命科学与智能计算峰会在北京望京昆泰酒店举行，圣庭医疗联合创始人&首席科学家谷红仓博士，带来了题为《高通量基因测序在药物研发和靶向治疗中的应用》，以下是他的演讲内容整理

·2022-08-18 10:47

roce和iwarp_Kubernetes与HPC：（1）RDMA网络

这允许高通量、低延迟的网络通信，尤其适合在大规模并行计算机集群中使用。RDMA实现常见网络环境介绍RDMA网络实现之前，先介绍一下常见的几种网络环境：以太网(ethernet)、IB网

CharlesDDDD·2022-08-15 09:45

四十而不惑——DNA测序技术的前世今生和未来

从1977年Sanger牛刀小试的双脱氧终止法到近十年如日中天的高通量测序技术，再到目前蓄势待发的三代单分子测序技术，这跨越近40年的风雨历程，DNA测序是指测定和分析特定DNA片段中，碱基序列的排列情况

生信小白白·2022-08-14 00:35

一日千里，追风逐月 | 深势科技发布极致加速版分子对接引擎Uni-Docking

研发团队使用Uni-Docking以KRASG12D为测试靶点，对EnamineDiverseReal类药数据库3820万分子开展了分层高通量

PaperWeekly·2022-08-12 07:31

真菌和细菌高通量测序引物选择

最常用的真菌ITS1区引物细菌内生菌测序引物进行巢式PCR引物选择及反应条件一些引物选择相关文献：ThefungalprimersITS5-1737-F(5′-GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3′)andITS2-2043-R(5′-GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3′)withspecificbarcodewereusedtoamplifytheITS1regionsof

周欣5518·2022-07-25 14:02

油溶性量子点（齐岳）

油溶性量子点通过封装后可以作为LED背光光源，增强显示色域；另外，对油溶性量子点进行表面修饰引入活性基团后，可以与生物分子进行偶联，应用于生物标记/检测、高通量编码、活体成像及动态示踪等领域。

齐岳生物mio·2022-07-19 19:55

转录组分析_转录组

基于Illumina高通量測序平台的转彔组测序技术，能够在单核苷酸水平对任意物种的整体转录活动进行检测，在分析转录本的结构和表达水平的同时，还能发现未知转录本和稀有转录本，精确地识别可变

weixin_39709674·2022-07-15 07:35

SpatialDB |单细胞空间转录组数据分析可视化平台

单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。(单细胞转录组教程汇总)单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。

生信宝典·2022-07-15 07:55

阿里云架构师马颂：云上高性能计算助力基因测序

致力于通过自主研发的高通量单细胞产品实验及生信分析全链条服务，将单细胞技术普适化，助力临床诊断和药物研发，推动精准医

·2022-07-14 23:11

JASMINER：创新突破存算一体核心技术，抢占高通量芯片制高点

具备高算力、低功耗的高通量芯片，成为当下市场中亟待填补的版图。

JASMINER茉莉·2022-07-14 07:53

一文带你了解Kafka【一看就懂】

该项目的目标是为处理实时数据提供一个统一、高通量、低等待的平台。Kafka官网：ApacheKaf

hah杨大仙·2022-07-13 08:42

基于R语言的微生物群落组成多样性分析——α多样性及其可视化

对于许多做微生物的同学来说，基于高通量测序的16S扩增子测序是对细菌群落组成及多样性进行分析的重要手段。

科研那点事儿·2022-07-08 08:36

中药网络药理学分析

网络药理学研究建立在高通量组学数据分析、计算机虚拟计算及网络数据库检索基础上，围绕生物学、生物网络构建和分析、连接性、冗余性和多效性等进行药物有效性、毒性、代谢特性的揭示[2]。

维凡生物·2022-07-04 14:41

Read count、CPM、 RPKM、FPKM和TPM的区别

基因长度：由于高通量测序是将cDNA碎片化后再进行测序的，因此越长的基因产生的碎片也会

Hayley笔记·2022-07-01 10:46

职等你来 | 软件工程师；C++（15-25k）；UE4研发工程师

040601软件工程师杭州恩和生物科技薪资开放任职要求：设计、开发、调试和维护基于Python编写的Web的应用程序；参与并支持我们R&D工艺开发部门的软件应用程序开发周期（包括高通量筛选、分析、发酵、

小猿君·2022-06-28 22:54

fcbf特征选择python_一文读懂聚类特征选择

《FeatureSelectionforClustering:AReview》0.1introduction介绍高通量技术导致数据维度以及样本数量呈指数增长，使得对数据集进行手动处理显得不太实际。

浪迹天涯的小透明·2022-06-23 02:31

T 细胞组库分析及多样性和克隆性度量

T-cellrepertoireanalysisandmetricsofdiversityandclonality-ScienceDirect摘要高通量bul

可能性之兽·2022-06-17 20:15

Kafka_01介绍与安装

该项目的目标是为处理实时数据提供一个统一、高通量、低等待的平台。Kafka是一个分布式消息队列。Kafka对消息保存时根据Topic进行归

hellowordx007·2022-06-13 10:22

基于Cellar的交互式单细胞数据分析

AnalysisofscRNA-seqdataAnalysisofscATAC-seqdataAnalysisofspatialtranscriptomicsdata(CODEX)Jointanalysisofmultiplemodalities摘要对于所有类型的高通量单细胞数据

tzc_fly·2022-06-12 19:30

一篇文章详解：RNA-seq 数据分析加速

RNAseq，即通过高通量测序技术进行转录组测序分析技术，作为研究RNA的表达水平以及表达差异基因的应用，在过去的十几年内迅速发展。

Eric@Lee·2022-06-02 07:36

如何进行基因组注释

定义基因组注释：是利用生物信息学方法和工具，对基因组所有基因的生物学功能进行高通量注释，是当前功能基因组学研究的一个热点。

生信技术·2022-05-28 01:23

宏基因组分析-基于组装

一般从环境样品中提取基因组DNA,进行高通量测序，从而分析微生物多样性、种群结构、功能信息、与环境之间的关系等。宏基因组的分析目前主要包括三种方法：基于组装分析、基于reads分析、基于bin分析。

微基生物·2022-05-27 07:14

一种高通量单克隆抗体肽图Mapping的 LC-MS 方法

一种高通量单克隆抗体肽图Mapping的LC-MS方法High-ThroughputPeptideMappingofMonoclonalAntibodiesUsingTandemLiquidChromatography–MassSpectrometryAnalyticalstrategiesforhighqualitymanagement

LH_TMO·2022-05-11 13:49

科研汪的日常 13 实验室里的"鸡毛蒜皮"

试用了高通量组织研磨仪（理论上，这台仪器3分钟内可以完成48个样品的研磨）之后，师姐动了买一台的心思，但3万+的报价和销售犹犹豫豫不肯说

007木子·2022-05-05 00:11

突破数据分析瓶颈，寻因生物单细胞测序数据分析迈入云时代

而其中，高通量测序（NGS）技术因其高度准确性和

·2022-04-01 10:47

茉莉Jasminer X4-1U ETH高新能静音矿机简介测评

（csdn简介+v）2021年6月6日，中科声龙历史上首场新品发布会在北京召开，隆重推出新一代存算一体高通量算力芯片JasminerX4。

rybtc123·2022-03-26 06:30

使用mixcr构建免疫组库及下游分析

免疫组库分析是指运用高通量测序技术对个体免疫组库多样性分析，以及对T细胞和B细胞独特性分析。mixcr允许多种数据输入，特异性免疫组库测序或RNA-seq测序都可以作为输入。

不会生信·2022-03-14 09:59

创新研发高通量芯片技术，JASMINER实现区块链芯片大突破

近年来，随着JASMINER在高通量芯片领域的不断深耕与投入，其在区块链专用半导体领域也始终保持着强劲的发展势头，这也使得JASMINERX4系列算力产品的能效表现持续领

·2022-03-11 11:07

GenVisR 基因组数据可视化实战(一)

从高通量基因组技术直观地可视化和解读数据仍然具有挑战性。

11的雾·2022-03-08 22:13

逆境之中见真章，JASMINER在众多出海企业中脱颖而出

凭借“新渠道战略“，高通量算力芯片出海领军企业JASMINER，承压之下高歌猛进，并从众多出海玩家中脱颖而出，为全球累计约5亿用户提供了稳定良好的算力体验，成为全球化区

·2022-03-08 13:13

2022-2028年中国高通量药物筛选与创新药物行业市场调查研究及发展前景展望报告

报告类型：产业研究报告格式：电子版、纸介版出品单位：智研咨询-产业信息网智研咨询发布的《2022-2028年中国高通量药物筛选与创新药物行业市场调查研究及发展前景展望报告》共十一章。

kt346·2022-03-05 15:30

TOOLs:高通量测序数据下载之aspera和SRA Toolkit

高通量数据库的数据，下载方法有三种：常规下载(wget,迅雷、IDM)asperaSRAToolkit的prefetchwget下载数据速度很慢，比较容易断。

wo_monic·2022-02-24 16:09

2018-03-27

的编辑模式太难用了，以后会转到word，有时间会发到微信上今天解决的问题:高通量测序原理，FASTQ和FASTA格式问题。linux中的shell,vim/vi提RNA反转录，播种拟南芥，摇农杆菌

纤蹄马·2022-02-22 05:22

盘点宏转录组分析方法

导读1.宏转录组概念：宏转录组测序是对某一特定时期、特定环境样品中的全部微生物的RNA进行高通量测序，直接获得该环境中所有微生物转录组信息的一种测序技术的新应用。

小白菜学生信·2022-02-22 03:52

aspera: 如何快速下载测序原始数据(raw data)

如何快速学会芯片或高通量分析的流程呢？实践！拿一套原始数据，从头开始认真的学习一遍。从原始数据出发，一步步探索，由浅入深，由表及里是非常有必要的。

生信学社·2022-02-20 13:34

植物基因组学-fastp进行高通量测序数据的质控

对于各位小伙伴来说，无论是自己独立进行高通量测序数据分析，还是解读公司的测序结果，一个必须要面对的情况就是高通量测序数据的质量控制，又称QualityControl。

blue_unique·2022-02-19 19:31

GEO的SRA|fastq下载

GEO的各种英文缩写GPLGEOPlatform平台GSEGEOSeriesSRA-----SequenceReadArchive存档来自高通量测序平台的原始测序数据和比对信息，包括Roche454GSSystem

Juan_NF·2022-02-18 12:18

从单细胞转录组数据识别细胞类型：Identification of Cell Types from Single-CellTranscriptomic Data

单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的空前的技术进步现在使以低成本和高通量分析单细胞中全基因组表达成为可能。

Sc_RNA_seq·2022-02-18 11:12

featurecounts的使用说明

原理文献参考：featureCounts:anefficientgeneralpurposeprogramforassigningsequencereadstogenomicfeatures摘要1、在高通量测序分析中用于下游分析的关键信息是比对到每个

一只烟酒僧·2022-02-15 21:23

2018-11-18

因此随着基因芯片和深度测序等高通量数据的出现，计算方法在TFBS的分析中得到了广泛的

是杰宝呀·2022-02-10 05:48

全基因组测序——贰.质控

质控高通量测序数据下机后的原始fastq文件，包含4行，其中一行为质量值，另外一行则为对应序列，得到下机数据后我们首先进行质量检测，详细见质量检测：FastQC然后进行质量控制，这个过程包括去接头、过滤低质量

oddxix·2022-02-09 11:30

TBtools使用讲演课程-录屏-

目前，高通量测序已然是生物实验室的常用研究手段。数据不断积累，而解读数据的难度也越来越大。从海量的生信数据中，抽取出有价值的生物信息，将有助于生物方向的确定与实验的开展。

生信药丸·2022-02-06 20:49

候选基因功能验证

目的：利用高通量测序数据进行致病基因的挖掘，可根据样本情况采用不同的分析方法，但无论哪种方法最终都将面临从众多confounder中筛选出候选基因（narrowdown）并验证基因与表型关系的问题。

bioyangyang·2021-12-09 11:48

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