高通量

illumina、ion Torrent、MGI测序平台芯片通量汇总

原文链接：https://mp.weixin.qq.com/s/q3pTJtJp2-C7GLau-XiKnQ大家好，今天的OnePIC系列制作了三大高通量基因测序平台目前在售的基因测序芯片的通量对比图，
基因Share·2023-03-29 00:19

TCGA数据下载与整理-TCGAbiolinks包

写在前面，如果不是R语言高手，建议利用网站下载个人爱好——1、官网：https://portal.gdc.cancer.gov方法见从TCGA数据库下载并整合清洗高通量肿瘤表达谱-临床性状数据。
young5100·2023-03-28 19:01

R绘图|ggplot2火山图的绘制

上一期R绘图|ggplot2散点图的绘制简单介绍了散点图在高通量数据展示上的作用，以及如何绘制？散点图在数据展示上存在局限，只能体现基因的差异幅度，并不能体现统计学意义。
Clariom·2023-03-27 15:24

扩增子和宏基因组分析实用指南 | 微生物组研究

高通量测序技术和分析方法的发展为微生物组研究提供了新见解。然而，这些新的发展让研究人员（特别是没有生物信息背景的研究人员）在选择合适的分析软件/脚本上面临挑战。
尐尐呅·2023-03-26 13:38

跨组学大数据系列论坛之基因组学统计分析方法与应用

高通量组学技术的成熟与发展，实验室检测成本的大幅降低，使在人群中获得各层面跨组学数据（基因组学、转录组学、蛋白组学、微生物组学、单细胞组学）成为可能，这为从群体水平上探讨复杂疾病（心血管疾病、肿瘤等）的内在遗传机制提供了重大机遇
秦小琮SK·2023-03-26 10:13

过滤专题：1.关于滤芯材质类型及孔径选择

1.聚醚砜滤膜（PES）·特性亲水性、高流速、高通量、低蛋白吸附、低溶出物、耐高压灭菌·应用1）一般试剂，样品的实验室过滤2）超纯水、食品、饮料等的过滤3）血清样品的过滤2.醋酸纤维素滤膜（CA）·特性亲水性
抚平回忆留下的疤·2023-03-26 05:09

单细胞转录组数据分析流程

而单细胞转录组技术则提供了一种在单个细胞水平进行高通量转录组测序的一项新技术，能够有效解决细胞间转录组异质性以细胞群间
iBioinformatics·2023-03-25 17:55

基因检测到底有啥用

基因检测，取被检测者的血液、口腔粘膜细胞，经提取和扩增其基因信息后，通过基因芯片技术或超高通量SNP分型技术，对被检测者细胞中的DNA分子的基因信息进行检测，分析他所含有的各种疾病易感基因的情况，从而使人们能及时了解自己的基因信息
恩本健康9167·2023-03-25 15:54

揭秘弥勒珠芽魔芋多叶生长的相关因素—反式玉米素核苷浓度

Ahightrans-zeatinnucleosideconcentrationincormsmaypromotethemultileafgrowthofAmorphophallusmuelleri发表期刊：FrontiersinPlantScience影响因子：6.627作者单位：昆明学院百趣提供服务：植物激素高通量靶标定量
代谢组学相关资讯分享·2023-03-24 18:55

文献分享：Optimization of therapeutic antibodies by predicting antigen specificity from antibody seq...

标题及作者介绍18年文章介绍了利用cas9基于哺乳动物进行抗体高通量改造的方法Cas9建库方法参考18年文章这篇文章结合cas9和深度学习开发了一种抗体药物高通量优
PureZhang·2023-03-24 17:14

NMPA肿瘤相关基因注册性能评价指导原则

2019年12月05日国家药品监督管理局医疗器械技术审评中心发布了《肿瘤相关突变基因检测试剂（高通量测序法）性能评价通用注册技术审查指导原则》，该原则为NGSpanel的注册和评审提供了指导意见，其中一些内容是需要重点学习
生信小书童·2023-03-23 15:08

2020-02-21

在未来3-5年中，美国公司和实验室将演示量子网络的基础科学和关键技术，包括量子互联、量子中续器、量子储存器、高通量量子信道和洲际天基纠缠分发，在未来15-20年里，量子互联网连络将利用网络化量子设备实现经典技术无法实现的新功能
金融界侦探·2023-03-23 15:46

根据barcode拆分测序数据

扩增子测序不同于其他高通量测序项目，扩增子测序往往样品量较大，但单个样品的数据量要求不高（因为仅仅研究扩增区域的序列）。
赵会成·2023-03-22 18:28

转录组分析(1) - 基础介绍

转录组分析是目前应用最广的高通量测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较，寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本，并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。
半夜一更·2023-03-21 15:17

一步到位-生信分析流程构建框架介绍

而随着高通量测序技术的不断发展，各种组学大数据正形成井喷的局面，我们越来越多地将目光聚焦在怎么才能准确、高效、低耗利用好这些数据。
亮亮就是亮·2023-03-21 11:43

R package：xcms代谢组学初探

预处理数据以实现高通量，非靶的分析物分析。
佳名·2023-03-19 18:03

转录调控专题 | 概念篇：转录组学介绍及应用

对于刚刚接触高通量的人来说，可能对这些内容并不是很清楚。接下来我们通过今天的内容来了解一下转录组学吧！概念遗传学中心法则表明，遗传信息在
诺禾致源科技服务·2023-03-19 11:55

Ribo-seq实验总结

Ribosomeprofiling是一种新出现的实验技术，它结合了高通量测序技术的应用，可以在全基因组水平上监测蛋白质的翻译水平，给研究细胞内蛋白质的翻译调控机制带来了新的可能。
本木大·2023-03-18 13:55

使用blast+samtools view+featurecounts对qpcr的靶序列在高通量结果中定量

背景我们在进行高通量测序后，会对筛选得到的差异基因进行qpcr验证。而在很多器官中，因为基因的特异性表达，有些外显子存在组织特异性。这就会导致qpcr的结果可能与高通量得到的结论不同。
一只烟酒僧·2023-03-17 20:28

外显子测序简介及分析流程

A：外显子组测序是指利用序列捕获或者靶向技术将全基因组外显子区域DNA富集后再进行高通量测序的基因组分析方法。
Seurat_Satija·2023-03-17 00:25

三维基因组（Hi-C）的原理以及应用

Hi-C技术源于染色体构象捕获（ChromosomeConformationCapture,3C）技术，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质三维结构信息
生信编程日常·2023-03-15 12:45

植物内生细菌——降解石油污染的新方向！

本研究利用高通量测序技术和传统微生物培养技术，研究了石油污染地区芦苇和虎尾草的内生细菌群落的特征及其在烃
SHANGHAILINGEN·2023-03-14 22:53

环境微生物测序采样指南

随着高通量测序技术飞速发展，人们对微生物的认知也在逐渐深入。
SHANGHAILINGEN·2023-03-14 22:52

如何学习R语言

强大的数据分析工具及各种扩展包高通量的数据处理能力Rstudio（强大的R编辑器，极大降低了R语言学习难度）安装R&RstudioR镜像：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn
茶思饭·2023-03-14 12:37

Qualimap安装及简单使用

对于高通量测序后的文件要进行质控QC有多个软件可以完成，包括最开始的fastqc以及对sam/bam文件的质控如：samtools、mosdepth、bamqst等。
xianmao123·2023-03-14 12:41

超详细教程！如何下载、安装和运行AlphaFold2

目前，AlphaFold2的源代码已经在GitHub上公开，而且现在科学家正在利用AlphaFold2对已有的蛋白数据库进行高通量的预测，建立了一些模式生物物种所有蛋白的AlphaFold2预测结
巴斯德的细菌·2023-03-13 15:55

二代测序数据质控 QC

NGS-QCillumina测序原理高通量测序（High-ThroughputSequencing）又名二代测序|下一代测序（NextGenerationSequencing，NGS），是相对于传统的桑格测序
点滴生信·2023-03-12 06:09

基因组学总结

基因组学还包括基因组测序和分析，通过使用高通量DNA测序和生物信息学来组装和分析整个基因组的功能和结构。
花生学生信·2023-03-09 00:33

在开始前定一个主基调

概述一下二代测序技术（nextgenerationsequencing，NGS），又称为高通量测序技术（high-throughputsequencing，HTS）或深度测序（deepsequencing
十三而舍·2023-02-18 17:54

生物信息学习网站参考

Perl1.3R学习相关：菜鸟教程-R1.4Linux学习相关：菜鸟教程-Linux1.5生信综合类：生信技能树、语雀_生信技能树、生信菜鸟团、_生信菜鸟团、生信宝典文章集锦、sam’notes、知乎_高通量测序技术
莫讠·2023-02-17 19:33

下载NCBI SRA数据的最佳方法

高通量的原始数据通常情况下会上传到NCBI的SRA（SequenceReadArchive）数据库。当我们需要用到这些数据的时候，就需要合适的方法来下载。
亮亮就是亮·2023-02-17 05:01

靶基因高通量测序建库流程介绍

高通量测序简单介绍：高通量测序技术（High-throughputsequencing）又称“下一代”测序技术（"Next-generation"sequencingtechnology），以能一次并行对几十万到几百万条
微基生物·2023-02-07 11:23

PICRUSt2功能预测分析

16S高通量测序的群落数据分析中,更深层次的数据挖掘是很重要的一环,但是微生物群落标记基因测序的一个局限性就在于它无法提供有关采样群落功能组成的信息。所以我们引入了功能预测分析.
微基生物·2023-02-07 11:23

微生物分析培养介绍

微基生物微生物分离培养项目主要采用下面的流程：实验流程和目的步骤一、原始样本微生态检测：在进行分离培养前，需要首先确认待分离的样本中是否有目标菌株，这时需要通过高通量测序的方法来检测样本中微生物的种类和相对丰度
微基生物·2023-02-07 11:53

高通量二代测序如何建库？

第二代高通量测序也称为下一代测序技术，相比于第一代测序通量更高、速度更快、成本更低，主要有样本制备、文库构建、测序反应等过程。
微基生物·2023-02-07 11:22

宏基因组分析-基于binning

一般从环境样品中提取基因组DNA,进行高通量测序，从而分析微生物多样性、种群结构、功能信息、与环境之间的关系等。宏基因组的分析目前主要包括三种方法：基于组装分析、基于reads分析、基于bin分析。
微基生物·2023-02-07 11:22

组织样本微生物检测介绍

而近年来发展出来的高通量测序技术从根本上改变了
微基生物·2023-02-07 11:22

宏基因组生信分析方法介绍

随着高通量技术的发展，宏基因组学（metagenomics）已经成为研究微生物群落物种及功能的前沿科学，在肠道微生物、环境微生物等研究领域具有广泛应用。
微基生物·2023-02-07 11:21

二代测序平台的介绍

一、测序技术的发展史高通量测序（High-ThroughputSequencing）又名下一代测序（NextGenerationSequencing，NGS），是相对于传统的Sanger测序（SangerSequencing
微基生物·2023-02-07 11:21

宏基因组分析-基于Reads比对

一般从环境样品中提取基因组DNA,进行高通量测序，从而分析微生物多样性、种群结构、功能信息、与环境之间的关系等。宏基因组的分析目前主要包括三种方法：基于组装分析、基于reads分析、基于bin分析。
微基生物·2023-02-07 11:50

如何做好测序产品开发和后续服务

高通量测序技术可以说是目前生物行业最炙手可热的技术之一，对科研领域来说，极大的推动了研究进程和向应用的转化，包括农业分子育种中关键性状位点的挖掘以及临床医学研究中遗传致病位点的发现和针对性的药物开发或产前诊断的应用
我爱工作_工作使我快乐·2023-02-07 02:31

CADD之分子对接一：背景介绍

SBVS可以看成是对传统实验高通量筛选(HTS)的一种计算机模拟。SBVS方法需要得到靶蛋白的三维(3D)结构及
随便叫点什么……·2023-02-06 09:19

影像组学特征的生物学意义

影像组学可以通过提取高通量特征来预测患者的预后，使用大型训练样本来探究图像特征和疾病状态之间的微妙关系。但是，基于数据驱动的影像组学本质上无法解释潜在的生物学机制。
思影科技·2023-02-05 21:26

OFM描述符介绍

OFM描述符介绍1.引言2.提出OFM描述符3.验证描述符有效性4.OFM描述符复现4.1导入包4.2定义OFM函数4.3Ag2Br2的OFM描述符示例参考1.引言  近年来，第一性原理高通量计算(ab-initiohigh-throughputcomputationalmethods
喝过期的拉菲·2023-02-05 04:15

DAP-seq完整技术实验流程和原理-蓝景科信河北生物科技有限公司

所以，ChIP-seq通常在规模上受到限制，难以进行高通量扩展。因此，只有少数转录因子可以获得结合位点信息，大量TFBS的覆盖范围仅适
蓝景科信·2023-02-03 17:24

蓝景科信DAP-SEQ（DNA亲和纯化测序）技术服务常见问题（Input对照是什么？）

DAP-SEQ技术简介DAP-SEQ是基于DNA亲和纯化，通过体外表达转录因子鉴定TFBS的技术，具有不受抗体和物种限制，且高通量的优势，自该技术问世以来，已被广泛应用于转录调控和表观组学的研究。
蓝景科信·2023-02-03 17:24

2019-01-20 day7 -endless

测序的历史代数名称机器优点\缺点一代双脱氧链终止法ddNTP+标记准确率高/低通量成本高二代循环阵列合成测序法NOVASEQHISEQ速度快成本低高通量/拼接困难读长短三代单分子测序-超长读长/错误率高测序分类测序酚类
Endless_5513·2023-02-03 05:37

影像组学：医学影像学与个性化精准医疗的桥梁

影像组学是一种从标准医学影像图像中高通量挖掘定量图像特征的技术，能够在临床决策支持系统中提取和应用数据，以提高诊断、预后和预测的准确性，在癌症研究中变得越来越重要。
思影科技·2023-02-02 08:34

mNGS病原检测是什么？

mNGS：宏基因组学二代测序技术应用：病原微生物高通量基因检测定义：mNGS是一种不需培养就可以深入快速鉴定感染病原体的新技术，相比传统培养方法拥有更高敏感性的同时又与“精准诊疗”的理念相契合。
老白杂谈·2023-01-31 03:00

虹科案例|基于SOLA光源的高通量Spike展示平台加速新冠病毒疫苗研制

背景提要自21世纪初以来，三种冠状病毒已越过物种壁垒，导致人类致命的肺炎：严重急性呼吸综合征（SARS）冠状病毒（SARS-CoV）、中东呼吸综合征（MERS）冠状病毒（MERS-CoV）和SARS-CoV-2（之前称为2019年新型冠状病毒,2019-nCoV）。SARS-CoV于2002年在中国广东省出现，并通过航空旅行路线传播到五大洲，感染8098人，造成774人死亡。2012年，MERS-
虹科光电团队·2023-01-30 16:29
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