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高通量
RNA 3. SCI 文章中基于TCGA 差异表达基因之 DESeq2
在比较
高通量
测序分析中,一项基本任务是分析计数数据,如RNA-seq中每个基因的Readcount,以获得跨实验条件的系统性变化的证据。离
桓峰基因
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2023-01-19 08:17
r语言
数据分析
开发语言
什么是肿瘤伴随诊断行业?
什么是肿瘤伴随诊断行业1.什么是IVD2.体外诊断试剂分类2.1按产品风险程度划分2.2按检测原理和方法划分3.IVD市场规模4.分子诊断应用场景5.肿瘤分子诊断5.1按平台划分5.1.1PCR5.1.2NGS(
高通量
测序
S_AGZX
·
2023-01-18 18:28
癌症
人工智能
anaconda
【生物信息学】ATAC-seq流程及代码分析、复现文章
:ATAC-seq的定义及用途whatisATAC-seq全称是AssayforTransposase-AccessibleChromatinsequencing即借助Tn5转座酶对开放染色质区域进行
高通量
测序主要原理
爱做饭的电饭煲
·
2023-01-09 17:16
中科大研究生考试
ATAC-seq
生物信息学ATAC
多组学-ATAC-seq-概念
AssayforTransposase-AccessibleChromatinwithhighthroughputsequencing)是美国Stanford大学WilliamGreenleaf教授2013年研发的全新方法,利用DNA转座酶结合
高通量
测序技术
bannerDr
·
2023-01-09 17:45
生物信息
组学
ATAC-seq
用Python进行GEO数据挖掘(学习笔记四):富集分析
1.了解富集分析(1)介绍随着
高通量
测序技术的发展,生物医学相关的研究领域进入了一个以海量数据为特征的组学时代。通过测序后往往会得到差异表达的基因或者蛋白列表。
Python_YBYB
·
2023-01-07 13:13
笔记
GEO数据挖掘
学习
python
数据挖掘
算法
双聚类的研究与进展
近年来随着基因芯片和DNA微阵列等
高通量
检测技术的发展,产生了众多的基因表达数据。对这些数据进行有效的分析已经成为后基因组时代的研究重点。
resourse_sharing
·
2023-01-05 00:32
机器学习
数理统计
数据处理
双聚类
机器学习
聚类
综述阅读笔记-生物网络分析与深度学习
生物网络分析与深度学习BriefingsinBioinformatic2021Mar22BiologicalnetworkanalysiswithdeeplearningAbstract实验
高通量
技术的最新进展扩大了生物学中分子数据的可用性和数量
努力AC的潇潇
·
2023-01-04 09:18
AI与药物联合疗法
论文阅读
节后开课 | 转录组分析的正确姿势你了解了吗?
转录组分析是目前应用最广的
高通量
测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较,寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本,并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。
生信宝典
·
2022-12-31 16:17
可视化
大数据
编程语言
机器学习
人工智能
2021年最后一期 | 转录组分析的正确姿势你了解了吗?
转录组分析是目前应用最广的
高通量
测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较,寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本,并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。
生信宝典
·
2022-12-31 16:17
可视化
大数据
编程语言
机器学习
人工智能
生信入门转录组和可视化学习捷径
转录组分析是目前应用最广的
高通量
测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较,寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本,并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。
生信宝典
·
2022-12-31 16:47
可视化
大数据
编程语言
人工智能
数据分析
最后一周!导师推荐的转录组和可视化学习捷径
转录组分析是目前应用最广的
高通量
测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较,寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本,并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。
生信宝典
·
2022-12-31 16:46
可视化
大数据
编程语言
人工智能
数据分析
最后3天!生信入门转录组和可视化学习捷径
转录组分析是目前应用最广的
高通量
测序分析技术之一。常见设计是不同样品之间比较,寻找差异基因、标志基因、协同变化基因、差异剪接和新转录本,并进行结果可视化、功能注释和网络分析等。
生信宝典
·
2022-12-31 16:46
可视化
大数据
编程语言
人工智能
数据分析
肠道菌群失调是II型糖尿病和炎症性肠病的标志物
随着
高通量
多组学技术的快速创新推动,微生物群,尤其是肠道菌群失调已被明确与许多人类疾病有关,包括2型糖尿病和炎症性肠病。
谷禾牛博
·
2022-12-30 04:14
肠道菌群
python
生活
健康医疗
关于胶质母细胞瘤的影像组学和影像基因组学
这是通过形态学、纹理和功能特征的三位一体实现的,这些定量体素级的
高通量
特征来自对MR图像提取。然而,采集参数缺乏标准化,研究之间的方法不一致,使得验
思影科技
·
2022-12-29 15:49
脑科学
自学生物信息学(思维+超全常用网站)
一个基因或一种蛋白质1、在DNA水平上2、在转录层面3、在蛋白质水平上一组基因/蛋白质芯片
高通量
测序数一系列测序数据生物学问题一个基因或一种蛋白质1、在DNA水平上这个基因的基因组位置是什么?
小飞棍来喽~
·
2022-12-29 03:34
数据库
geo差异表达分析_如何使用GEOquery和limma完成芯片数据的差异表达分析
如何分析芯片数据我最早接触的
高通量
数据就是RNA-seq,后来接触的也基本是
高通量
测序结果而不是芯片数据,因此我从来没有分析过一次芯片数据,而最近有一个学员在看生信技能树在腾讯课堂发布的课程GEO数据库表达芯片处理之
weixin_39727976
·
2022-12-24 08:06
geo差异表达分析
GEO数据挖掘(3)-芯片基础知识
高通量
、全基因组的DNA芯片已经成为生物领域十分有用的工具。然而,芯片实验产生的数据量日益增长,由于不同的分析方法,会得出不同结论,因而分析起着关键作用。
我是菜鸟www
·
2022-12-24 08:04
数据库
六问 Kafka 为啥那么牛
该项目的目标是为处理实时数据提供一个统一、
高通量
、低等待的平台。Kafka是一个分布式消息队列,Kafk
小小怪下士 XIA
·
2022-12-19 08:03
Java
kafka
分布式
java
易基因科技|单细胞甲基化测序低至2500元/样
易基因
高通量
单细胞DNA甲基化测序:单细胞DNA甲基化组学研究很大程度上受制于建库技术,传统的文库构建方法或类似于基因组DNA的单细胞扩增技术很难应用到甲基化实验过程中。
易基因科技
·
2022-12-17 07:11
技术推介
生物学
生物信息学
经验分享
数据挖掘
人工智能
2021世界人工智能大会最高奖项——卓越人工智能引领者奖(Super AI Leader,简称SAIL奖)在大会开幕式揭晓...
获得2021SAIL奖的是——利物浦大学机器人科学家、中科院上海微系统所免开颅微创植入式
高通量
柔性脑机接口、鲲云科技高性能数据流AI芯片CAISA、浙江大学数字创意智能设计引擎,以及由朱明杰、吴飞、卢策吾撰写的论文
人工智能学家
·
2022-12-14 15:49
人工智能
芯片
大数据
区块链
物联网
基于计算的蛋白质复合物预测方法综述
目前,随着
高通量
实验技术的不断发展,全基因组蛋白质相互作用(PPI)数据日益增多,领域内已经出现了很多基于计算的蛋白质复合物预测方法。虽然现有方法各具特色与优势,但也存在一些不足。
宋罗世家技术屋
·
2022-12-14 07:44
物联网及AI前沿技术专栏
算法
人工智能
RNA分析流程
要理解整个流程,个人觉得可以按数据的四个流程来拆分:
高通量
测序,准备工作,上游分析,下游分析【什么是
高通量
转录组测序】所谓
高通量
测序技术是什么?
wangchuang2017
·
2022-12-12 14:23
RNA-seq
其他
【影像组学】影像组学--基本步骤(概述)
放射组学(Radiomics):从医学影像图像中挖掘
高通量
的定量影像特征,使用统计学方法筛选出能够提供有用的诊断、预测或预后信息等最有价值的影像特征,可用于疾病的定性、疗效评估和预后预测等研究。
莫默子momo
·
2022-12-11 22:31
影像组学
机器学习
深度学习
入门篇:医学影像组学与机器学习(进入飞桨Aistudio平台,不用配置环境,开箱即用)
背景影像组学的概念最早由荷兰学者在2012年提出,其强调的深层次含义是指从影像(CT、MRI、PET等)中
高通量
地提取大量影像信息,实现肿瘤分割、特征提取与模型建立,凭借对海量影像数据信息进行更深层次的挖掘
吖查
·
2022-12-11 22:30
影像组学
机器学习
Radiology:影像组学:图像不仅仅是图片,它们还是数据
这些研究促进了对图像定量特征
高通量
提取过程的发展,从而将图像转换为可挖掘数据特征,并随后对这些数据进行分析,以提供临床决策支持;这种做法被称为影像组学。
思影科技
·
2022-12-11 22:25
脑科学
S电子产品和半导体的X射线检测
因此,条件稳定的
高通量
工艺流程至关重要。本文将给出如何在高端电子生产(PCB组装)、电池生产和半后端生产环境中提高生产率和品质可靠性的解决方案。Part1、在线X射线检测工艺流程中的缺陷越早发现越好。
szhtw168
·
2022-12-07 18:32
测序故事:微生物基因组常见测序类型简介及案例分享(二)
今天,就给大家分享下微生物基因组研究常见的项目类型,一般思路和一些凌恩的经典微生物基因组研究案例——首先,用一张表来汇总下目前常见的基于
高通量
测序的微生物基因
SHANGHAILINGEN
·
2022-12-06 11:31
科技
其他
经验分享
GEO数据库的使用(一)
创建于2000年,收录世界各国研究机构提交的
高通量
基因表达数据。
xiaobai1_1
·
2022-12-04 16:50
GEO和TCGA
它创建于2000年,收录了世界各国研究机构提交的
高通量
基因表达数据,也就是说只要是目前已经发表的论文,论文中涉及到的基因表达检测的数据都可以通过这个数据库中找到。关键是这个数据是免费的!免费的!
我是小飞熊
·
2022-12-04 16:49
GEO数据库学习一(简介 数据下载 芯片知识)
2.3ExpressionSet对象简单讲解3.芯片基础知识3.1基础介绍3.2illumina的bead系列表达芯片扫盲1.GEO数据库简介NCBIGeneExpressionOmnibus(GEO)是一个存储各种
高通量
实验数据的公共数据库
你真的不能替我学吗
·
2022-11-30 01:32
GEO数据库学习
学习
艾美捷PEG化蛋白ELISA试剂盒—高度灵敏度,
高通量
格式!
背景:聚(乙二醇)(PEG)是药物输送系统中广泛使用的聚合物,通常直接与药物治疗剂结合。药物治疗剂的聚乙二醇化是合乎需要的,因为已经发现它可以增加保留时间、降低免疫原性并增加对代谢酶的稳定性。聚乙二醇化蛋白质ELISA试剂盒适用于药物开发和药物制造应用,包括药物配方、药代动力学分析、药物比较、先导候选物鉴定、批次放行标准和过程中QC研究。目前,还没有长期研究揭示这种聚合物在体内的命运。已经确定需要
Sylvia_sc
·
2022-11-29 12:57
PEG化蛋白ELISA试剂盒
基因芯片Pro-processions -------Bioconductor 安装包
基于R的一个用于分析
高通量
基因组数据的工具,Bioconductor的应用功能是以包的集成形式呈现在用户面前,它提供的软件包中包括各种基因组数据分析和注释工具,其中大多数工具是针对DNA微阵列或基因芯片数据的处理
root_lty
·
2022-11-28 20:46
R学习中的问题
【生物信息】影像组学入门实践成长营(14天)
影像组学入门实践成长营第一节组学浅析之通俗理解影像组学的定义第2节影像组学介绍第3节影像组学文献导读第4节python入门及实践第5节基于
高通量
图像表型的标准化定量影像组学/影像组学的数据格式常见的医学影像数据格式第
鱼与钰遇雨
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2022-11-27 10:19
生物信息学
python
人工智能
医学影像
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一)
关于课程采用
高通量
测序技术获取单细胞水平的
生信宝典
·
2022-11-25 13:32
生物信息
转录组
单细胞
生物信息
单细胞
转录组
单细胞转录组分析
GEO数据挖掘(学习笔记)
1.GEO数据库简介NCBIGeneExpressionOmnibus(GEO)是一个存储各种
高通量
实验数据的公共数据库。这
生信小菜鸟啊
·
2022-11-25 01:49
转录组学
r语言
geodatabase
GEO数据挖掘(一)基础介绍
收录了世界各国研究机构提交的
高通量
基因表达数据。2000年开始建立的时候,主要是表达芯片数据,但是之后随着数据库的流行,逐渐扩展业务到许多其它的
yuxiang&chenxi
·
2022-11-25 00:14
数据挖掘
数据分析
人工智能
使用北鲲云在AWS上运行基因分析HPC任务
生物信息学产生和迅猛发展的主要推动力来自于新一代测序等
高通量
技术在生命科学领域越来越广泛的应用。
北鲲云_beikun
·
2022-11-24 19:09
云计算
aws
云计算
基因分析
二代测序技术之illumina测序技术原理简介
现今的生信领域几乎就是和无数的序列打交道,而这些序列的来源就是如今风靡的
高通量
测序技术,现今的测序不论是测RNA、DNA、miRNA还是ChIP-Seq等等,都是基于NGS(二代测序,next-generationsequencing
你大佬来啦
·
2022-11-24 09:37
生信基础知识
大数据
经典脂质组学检测&定量脂质组学检测-百趣生物
百趣生物提供脂质组学检测(经典脂质组学、定量脂质组学)服务,百趣生物采用
高通量
高分辨率质谱平台精准助力临床脂质组学检测,本文整理了脂质组学相关应用方向、案例分析、高分文献等,欢迎一起交流脂质组学相关技术
代谢组学相关资讯分享
·
2022-11-24 01:24
AI 与合成生物学「联姻」的五大挑战:技术、数据、算法、评估与社会学
高通量
表型数据与DNA的精确编辑结合到一起,将底层
人工智能学家
·
2022-11-23 17:36
人工智能
大数据
算法
编程语言
python
“非因线上讲堂”RPPA新型蛋白组学系列第二讲——RPPA技术总览、优势和应用
非因RPPA新型靶向蛋白组学作为一种
高通量
的多重蛋白靶点分析技术
BroH
·
2022-11-23 07:04
生物学
“非因线上讲堂”RPPA新型蛋白组学系列第四讲——RPPA在药物研发中的应用
RPPA是一种基于平面微阵列和免疫反应的
高通量
高内涵靶向蛋白组学技术,可实现上千例
BroH
·
2022-11-23 07:04
其他
生物信息学
距离RPPA新型蛋白组学系列第四讲还剩2天时间
RPPA是一种基于平面微阵列和免疫反应的
高通量
高内涵靶向蛋白组学技术,可实现上千例
BroH
·
2022-11-23 07:04
生物信息学
其他
“非因线上讲堂”多组学前沿技术系列讲座开始啦!!!
秋高气爽非因分享随着组学新技术的不断涌现,加快了组学研究向定量化、
高通量
的方向发展,尤其在后基因组时代,新型蛋白组学和空间组学已成为组学研究的新焦点,为科学家探索生命机制提供了新的方向。
BroH
·
2022-11-23 07:34
fcbf特征选择步骤_一文读懂 聚类特征选择
《FeatureSelectionforClustering:AReview》0.1introduction介绍
高通量
技术导致数据维度以及样本数量呈指数增长,使得对数据集进行手动处理显得不太实际。
烟雨千年
·
2022-11-23 06:26
fcbf特征选择步骤
Emeditor -- windows最强txt编辑器,没有之一
图1.EmEditor界面图2.15G文件我就问你一句:
高通量
测序fastq文件15G,请问什
余丁,微生信
·
2022-11-21 14:12
数据可视化
数据分析
易基因技术推介|m1A RNA甲基化测序(MeRIP-seq/m1A-seq)
基于
高通量
测序技术最新研究揭示m1ARNA修饰在基因调控和生物过程中的关键作用:对RNA稳定性和翻译起始等过程有着重要调节作用,广泛参与多种疾病的发生和发展。
易基因科技
·
2022-11-19 11:57
技术推介
生物学
生物信息学
经验分享
北鲲云超算平台对于基因组学研究能够提供哪些帮助?
从
高通量
/多组学,到单分子/单细胞;从多倍体/单倍型到宏基因组/环境基因组;从精准医疗到系统医学等等,后基因组时代的基因组技术正在颠覆传统生物学和医学的方式。
北鲲云_beikun
·
2022-11-11 11:11
big
data
云计算
运维
比色免疫测定:Enzo CHO宿主细胞蛋白ELISA试剂盒方案
艾美捷EnzoCHO宿主细胞蛋白ELISA试剂盒特点:1、CHO宿主细胞蛋白的灵敏测量,检测低至10ng/ml2、低测定内变异性允许简化测试3、
高通量
格式,3小时内出结果4、超越半定量蛋白质印迹分析的全定量结果艾美捷
Sylvia_sc
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2022-11-03 19:07
宿主细胞蛋白ELISA试剂盒
php 生存分析,KM-plotter在线做生存分析
目前网站可以针对54,675个基因、18,674个癌症样本展开研究,涉及了乳腺癌、肺癌等等;数据类型有芯片数据、
高通量
测序数据,涉及mRNA和miRNA,并且在不断丰富之中。
繁心花少
·
2022-11-02 11:24
php
生存分析
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