3DSlicer

快准狠！在3D Slicer中，使用TotalSegmentator扩展可在1分钟内自动分割全身117个器官

本系列涵盖从3DSlicer医学图像查看器的基础使用到高级自动分割扩展程序的内容（从入门到高阶！）

Tina姐·2024-02-07 18:30

3D Slicer-最强大的开源医学图像分割工具简要概述

3DSlicer-最强大的开源医学图像分割工具简要概述本系列涵盖从3DSlicer医学图像查看器的基础使用到高级自动分割扩展程序的内容（从入门到高阶！）

Tina姐·2024-02-07 18:00

3DSlicer如何设置中文以及汉化之后重启无法启动的问题

插件自动方式加载文件手动加载翻译文件3DSlicer中languagepacks使用汉化之后重启无法启动的问题安装SlicerLanguagePacks扩展。

$老无所依￥·2024-02-05 03:02

3DSlicer在Windows下源码编译运行（20231127待补充）

目录一、3DSlicer是什么？二、为什么要源码编译？三、一些注意事项1.花费时间和文档2.

$老无所依￥·2024-02-05 03:31

3Dslicer在windows下源码编译源码并打包程序亲测可用

对于医疗图像数据可视化有一些比较成熟的开源软件库，其中包括volview(2011年已经停止维护和更新)，MITK（德国非中科大版），3Dslicer和ITK-SNAP。

火炎焱燚1989·2024-01-15 13:28

Vicky__3021·2024-01-11 12:16

Li‘s 影像组学radiomics视频学习笔记(34)-使用3D Slicer软件提取影像组学特征

来源：简书，已获授权转载RadiomicsWorld.com“影像组学世界”论坛：影像组学世界/RadiomicsWorld本笔记来源于B站Up主:有Li的影像组学系列教学视频本节(34)主要介绍:使用3DSlicer

有Li·2023-12-03 00:23

CT图像的窗宽窗位（VTK及3Dslicer中的使用）

1.窗宽/窗位概念窗技术(WindowTechnique)是医生用以观察不同密度正常组织或病变的一种显示技术，其包括窗宽(windowwidth)和窗位(windowlevel)。由于各种不同组织结构或病变具有不同的像素值，因些欲显示某一组织结构细节时，应选择适合观察组织结构的窗宽窗位，以获得显示最佳效果。CT能识别人体内2000个不同灰阶的密度差别。而人的眼睛却只能分辨16个灰阶度。因此，人眼在

北方骑马的萝卜·2023-11-25 12:54

【3DSlicer】基于心脏ct影像重建3d模型及导出

3DSlicer4.11这里使用软件自带数据可以调整看得更清晰点击ADD添加两层，双击改名heart,background点击paint，选中heart，在ct图像中画出心脏区域选中background，在ct图像中画出心脏外围可以按住shift和鼠标滚轮调整画笔大小可调动多画几个GrowfromseedsInitialize过程可以使用painterase进行调整applyshow3D隐藏bac

声声ss·2023-11-08 05:46

重新安装ubuntu系统

好久没有进去linux系统，因为要测试3DSlicer软件，登陆ubuntu居然很慢，发现是后台在更新，是版本更新。不能耐受很慢很卡，手动重启后发现不能进入系统。以后系统更新切记不能重启。

杨晓凯·2023-10-31 19:15

影像组学学习笔记(34)-使用3D Slicer软件提取影像组学特征

本笔记来源于B站Up主:有Li的影像组学系列教学视频本节(34)主要介绍:使用3DSlicer软件提取影像组学特征Pyradiomics官网里有介绍，pyradiomics也可以通过软件3DSlicer

北欧森林·2023-09-03 21:02

放射组学常用到的一些工具（软件）

Treatmentplanningsystems/查看工具（勾画ROI）：3DSlicer(www.slicer.

Joker 007·2023-07-16 23:07

2018-03-20

好久没有搞站点，是协助建立3Dslicer中国站点的过程中，对wordpress和discourse产生了兴趣，进而着迷于docker的学习和使用。

yakeworld·2023-03-09 02:34

3d slicer matlab,使用3D Slicer进行颅骨去除

关于3DSlicer的下载、安装及模块安装在上一篇博客中以及介绍过，以下将专注于使用3DSlicer进行颅骨去除准备此次，我们需要安装SwissSkullStripper模块，安装后需要重启软件才能使用该模块使用

诗无忌·2023-02-01 13:19

使用freesurfer和3Dslicer进行脑区分割和电极定点（日常记录）

一、前期准备Linux系统安装Freesurfer、MATLAB插件spm12、fieldtrip，Windows下载mricron、Slicer3D（需要插件SlicerFreeSurfer）软件文件准备ct和mrit1文件，格式为dicom，需要转换为nii格式（可在spm中转换）edf文件，包含脑电的所有数据电极位置图，手术计划二、Ubantu下进行脑区分割准备工作1、安装好matlab和f

zQIANYUN·2023-01-08 16:04

3Dslicer医学图像三维坐标系(xyz,RAS,IJK)差异，转换，旋转，平面角

目录Worldcoordinatesystem世界坐标系xyzAnatomicalcoordinatesystem解剖学坐标系(LPS/RAS/RAI)Imagecoordinatesystem图像坐标系ijkImagetransformation图像转换三维坐标变换A.旋转矩阵和旋转向量B.欧拉角C.四元数编辑计算平面角AnglePlanes插件参考链接处理医学图像和应用程序时的问题之一是坐标系

luemeon·2023-01-07 07:36

slicer安装_3D Slicer教程【软件安装及设置】

3DSlicer教程【软件安装及设置】【教程001】软件安装及设置前言我最先接触到3DSlicer的时候是2016年11月份，医院购买STORZ神经内镜，因有两个学习的名额，医院派我到301医院陈晓雷教授主办的内镜学习班学习了一天

weixin_39748858·2022-12-23 21:45

3D Slicer简单三维重建

前言本文章使用3DSlicer对输入数据进行三维重建，结合别人的经验以及自己的摸索，写成这一篇文章，只是简单的记录一下自己做过的事情，并没有多少深入的去研究，对一些东西可能理解的不够好，希望读这篇文章的人能够谅解

沉默的前行者·2022-12-16 13:51

影像组学

首推Ants,其次FSL，此外3DSlicer组间也可进行配准。另外，SimpleITK包可支持多种编程

Li_yi_chao·2022-12-11 22:55

批量转换json文件并提取label图像

医学图像大部分是用3DSlicer来标注肺结节。但是由于有一批dcm转换出来的jpg格式图像，为了操作方便采用了labelme对图像进行标注。记录一下labelme批量转换json文件的方法。

风潇子·2022-12-09 11:37

3DSlicer入门操作教程

目录简介用户界面数据探针应用程序菜单工具栏状态栏查看加载的数据选择显示的数据与视图交互查看交叉引用鼠标模式3D视图切片视图数据格式DICOM格式NIFTI格式DICOM和NIFTI的区别Nrrd格式.mhd+rawmhd格式数据3DSlicer

luemeon·2022-12-06 23:20

使用FSL快速检查3D数据质量，一秒审查上百张！

通常的做法是使用3D图像查看工具（ITKsnap,3Dslicer等），一个一个打开查看。当数据量变大（成千上万）的时候,这个做法非常消耗时间和精力，这时又怎么办？

Tina姐·2022-12-04 21:08

Qt编写的知名的开源软件汇总

3DSlicer用于可视化和医学图像计算的免费开源软件。AcetoneISO镜像文件挂载软件。AdobePhotoshopAlbum图像组织应用

码肥人壮·2022-09-03 18:11

3DSlicer扩展模块如何加入外部扩展包？

通常，在pycharm软件中的终端中输入pipinstall+扩展包名可以很方便的下载外部扩展程序，但是在slicer中这种方式是行不通的。因为在slicer中有一套自己的开发环境，其中的内部库相对来说是稳定的，用惯用的方法去扩充其内部环境是不行的。下面以加入opencv-python库为例介绍加入外部扩展包的方法。首先我们可以在opencv库官方网站上找到我们想使用的opencv对应的版本库，将

码农不码·2022-06-29 07:23

3Dslicer默认扩展模块程序介绍

非常简单的程序架构在默认扩展模块中程序架构非常简单，总共由4个部分组成4个类。分别是基类、组件类，逻辑类和测试类。无论是您自己创建的默认扩展模块还是slicer中自带的测试案例，所有的应用程序都是编写在这四个类中。下面是基类FW初始化函数的部分程序classEX(ScriptedLoadableModule):"""UsesScriptedLoadableModulebaseclass,avail

码农不码·2022-06-29 07:22

3Dslicer默认扩展模块界面介绍

打开“Help&Acknowledgement”折叠控件，如下图所示这里的Help与Acknowledgement相当于扩展模块中自带的公告栏，3DSlicer是公开的医学影像研究平台，支持广大开

码农不码·2022-06-29 07:22

3DSlicer中使用简单脚本处理数据

打开slicer中的自带Python交互器。可以通过，菜单栏“View”中的“PythonInteractor”打开，也可以直接点击工具栏中的Python图标。如何利用Python脚本做些有趣的事编辑代码，按回车运行。>>>importqt>>>button=qt.QPushButton("TestButton")Slicer中会创建一个窗口并添加一个Button控件在上面，试试点击这个Butto

码农不码·2022-06-29 07:21

3DSlicer导入医学图像数据

三种方法可以导入DICOM数据：通过“菜单栏”中File选项中的“AddData”导入。其中有两种导入数据的方式，第一种是导入数据所在的文件夹，第二种是导入数据文件。如果只导入一个DICOM文件，两种方式都可使用；如果导入DICOM序列文件，则建议使用第一种方式直接读取文件夹数据。通常，我们选择“ChooseDirectorytoAdd”即可。在“FindDirectory”界面中选择我们的数据文

码农不码·2022-06-29 07:21

3DSlicer简介与安装教程

什么是3DSlicer？一个开源医学影像分析和可视化平台。桌面软件，用于解决高级图像计算挑战，专注于临床和生物医学应用。开发平台，使用免费的开源软件快速构建和部署用于研究和商业产品的自定义解决方案。

码农不码·2022-06-29 07:20

在3Dslicer中使用opencv连接相机

前面已经介绍了创建扩展后的默认扩展程序，下面将修改这一扩展程序调用opencv库连接相机并在3Dslicer中显示出来。

码农不码·2022-06-29 07:40

3DSlicer教程（1）简介

支持的操作系统：Linux，MacOSX和Windows2.相关网址英文文档英文社区论坛中文社区论坛3.3DSlicer能够应用那些数据格式3DSlicer能够应用的最基本格式是DICOM，DICOM格式包含患者姓名

求则得之，舍则失之·2022-03-05 07:29

slicer 3d操作

v=YjkUxVD3U6Ecropvalumeeditorthreadholdmakemodleeffect点十字+shift为RYG三平面同步操作耳屏前切线基本为基底节中点超级简单的3Dslicer教程

yao枫叶_acf3·2021-06-09 01:05

体渲染-------颜色、不透明度调整

看到3DSlicer和paraview中的颜色不透明度调整，你是否也有心动。经过多天摸索，发现这虽然是个小模块，可是如果真是自己做，还挺复杂(可能是自己VTK和QT学的还不够好)。

peanut_wu·2020-09-17 08:51

linux 安装 3D slicer

官网下载linux版本3Dslicer:https://download.slicer.org/官网安装教程：https://www.slicer.org/wiki/Documentation/4.10

迷路在代码中·2020-09-17 03:51

使用pyradiomics库对dcm图像进行特征提取

一制作掩膜图像医学掩膜图像的制作可以使用labelme和3DSlicer获得，下文中仅介绍使用labelme对dcm图像标注后获得json文件的一些处理，至于labelme的使用请参考其他博客。

她曾让你心动·2020-09-12 22:47

3DSlicer将.seg.nrrd文件导出为.obj文件

博主之前所做的一些工作是使用3DSlicer软件，对软件自带的一些人体扫描图像进行处理，进而得到一些点面数据。

weixin_44587573·2020-09-12 14:06

基于3d slicer开发医学图像标注插件

基于3dslicer开发医学图像标注插件3dslicer是一款开源的医学图像处理软件，它基本上集成了医学图像处理的所有功能，包括重建、分割、配置、分析、实时导航等功能。

扬凡起航·2020-08-26 16:03

医学图像处理常用的看图软件介绍及使用(RadiAnt DICOM Viewer、ITK-Snap和3D Slicer)

作者常用的医学图像看图软件有RadiAntDICOMViewer、ITK-Snap和3DSlicer，这三个都可从网上下载到。在不同的场景下，不同软件的功能和便利程度都不同。

小鹿学长·2020-07-30 09:35

3Dslicer学（在slicer中编程）

1.Slicer的模块：CLI(命令行交互)Python脚本模块：这个是特色，我们可以用python控制台去访问数据，对象，GUI，处理库(numpy,VTK,ITK,CTK等)可加载的模块：用于优化计算，是C++插件。本学习部分的目标是实现拉普拉斯滤波。2.python在slicer的版本是2.7：打开python交互器：**3.**加载一个MRI数据，名字是name，格式是nrrd。4.在控制

Monologue_thl·2020-07-30 08:27

3DSlicer21:Windows7+VisualStudio2013构建3DSlicer史上最详细版（Debug）

考虑到国内对于3DSlicer的需求很高，然后相关参考文献及资料极其匮乏，本系列博客尝试改变这种现状，所有项目及教程均具有可重复性。

沈子恒·2020-07-30 07:35

用python处理dicom数据

一般情况下，3DSlicer是一个不错的选择，尤其是如果需要对dicom数据进行进一步处理的话。

摆一茶几·2020-07-28 13:21

3D Slicer - 医学图像检测标注教程(矩形框)

3DSlicer(4.10.2)中的SegmentEditor与Legacy/Editor都可以对三维体数据中的ROI进行矩形标签框注。

LiveAn·2020-07-27 19:09

常见开源脑影像分析产品

常见开源脑影像分析产品软件名称类型描述官网或下载链接3DSlicer通用3DSlicer是一款开源免费的软件，用于图像处理和分析，支持三维处理切片等功能，可在多个平台使用，支持Windows,Linux

陈知鱼·2020-07-12 12:23

3Dslicer +VS2013编译介绍

前言：3Dslicer在windows64位上整整编译了一周，才成功。和linux相比，在windows上编译，过程不是一般的难。

三世·2020-07-11 14:11

QT开发和MFC开发的经典案例

大家来欣赏下Qt写的程序（摘自百度百科）3DSlicer,afreeopensourcesoftwareforvisualizationandmedicalimagecomputingAcetoneISO

疯狂的挖掘机·2020-07-02 09:04

使用Qt 开发图形界面的软件

3DSlicer,afreeopensourcesoftwareforvisualizationandmedicalimagecomputingAcetoneISO：镜像文件挂载软件AdobePhotoshopAlbum

weixin_33950035·2020-06-28 08:41

医学图像分割-在3DSlicer中使用英伟达的AI辅助工具NvidiaAIAssistedAnnotation自动切割医学图像教程

前期准备下载3DSlicer并安装：3DSlicer官网（http://www.slicer.org）或者直接下载（https://download.slicer.org），需要注意目前该插件只支持最新的

DuanYongchun·2020-04-05 15:00

老卫带你学---pyradiomics医学图像特征提取

目录获取代码在系统上安装用法指导视频例命令行使用互动使用3DSlicer中的PyRadiomics直接使用要素

老卫带你学·2020-01-08 17:09

Build Slicer application--Compiling and installing Slicer from source

谈一谈我在win10上编译3Dslicer的经验。同样，对Slicer官网的原版英文教程不做更改，不做翻译。仅谈理解和实践经验。

似水~年华·2019-04-04 17:44

3DSlicer开发之路——Extensions（二）

RequirementsforSlicerExtensionsSlicerCatalog根据以下条件将所有的extensions分为了以下的三类Category1Category1extensionsmustmeetthefollowingconditions:complywiththeSlicerLicense（遵守Slicer许可证）compileandinstallonallplatform

似水~年华·2019-03-28 23:14

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