AMBER

用Gromacs对蛋白与小分子进行模拟

本文主要参考Gromacs官方的教程，另外关于amber的部分主要参考了antechamber和acpype用Gromacs对蛋白与小分子进行模拟最重要的是要生成小分子的力场文件。
华山论剑·2023-09-04 20:37

高中英语《In Search of the Amber Room》阅读课，逐字逐句，试讲稿

《InSearchoftheAmberRoom》试讲稿高中题目:阅读课材料:FrederickWilliamI，theKingofPrussia,couldneverhaveimaginedthathisgreatestgifttotheRussianpeoplewouldhavesuchanamazinghistory.ThisgiftwastheAmberRoom,whichwasgivent
风水宝地·2023-09-04 03:03

第十章 amber 醒悟

amber向Luna摆摆手示意她不用出来，然后再熟门熟路的从柜子里将领带
予羽千·2023-08-27 18:07

有关梦想的一些随笔

28/07/2019寒腊(Amber)
安老伯儿·2023-08-22 13:26

【转】都是 “编码格式” 惹得祸

原文地址：https://wyiyi.github.io/amber/2021/01/13/unicode/coverdescription:"很多事来不及思考，就这样自然发生了"date:2021.02.2810
AlphaHinex·2023-08-20 14:23

Flutter 开发笔记

UIWidgetsInkWellonContainerwithbackground下面这种情况下，为InkWell设置的splashColor不会生效：InkWell(splashColor:Colors.amber
aJIEw·2023-08-15 16:12

写给Amber的23岁

Amber是我口语考试时用的英文名。它让我想起Perfume：TheStoryofaMurderer里Laura酒红色柔软的长发和某个夜晚与Grenouille四目相对时酝酿暧昧和杀机的惊鸿一瞥。
郎骑南瓜来·2023-08-14 03:04

MJ关键词检索

好看的颜色Cerulean(天蓝色)Magenta(洋红色)Goldenrod(金菊黄色)Emerald(翠绿色)Crimson(深红色)Turquoise(绿松石色)Lavender(薰衣草紫色)Amber
是jin奥·2023-08-13 18:20

vol.29：金门有个北山，北山有个蔡依林 | 黑熊FM

这是「跨海声音纪录片」的第二部分，紧接上集在风狮爷看完《小丑》之后，打车前往北山洋玩艺民宿，主理人叫Jack，安柏（Amber）是他的姐姐。和他一起打理民宿。她六年前从台北回到金门，她父母的老家。
通米·2023-08-13 05:41

流式套接字学习笔记

本文首发于Amber'sBlog-流式套接字学习笔记流式套接字依托TCP协议提供面向连接的、可靠的数据传输服务，基于流的特点，使用流式套接字传输的数据形态是没有记录边界的有序数据流。
Ackerzy·2023-08-09 10:01

「像美国人一样说英语」找朋友出去玩儿前，来自妈妈的突然关心

TEDGOESOUTFORTHEEVENINGTedleavestogovisithisgirlfriendAmber.Ted'smotherSusansaysshedoesn'treallylikeAmber.Shewisheshimagoodtimeanyway.Ted去看望他的女朋友Amber
京酱Jing·2023-08-07 15:52

Max工作总结

今日工作总结1.打扫卫生开会30mins2.开教研会，学习几个新的游戏方式30mins3.第一大道搬回来橱子一个饮水机一个1.5h4.amber一对一，课后反馈1.5h相对来说内容比较简单，比较适合孩子
Max_pang·2023-08-06 12:53

amber复盘-20180216

年度目标：阅读10本以上书籍／每日运动，降低感冒频次；哈他瑜伽阴瑜伽结合练习，提高1个层次／幼儿成长，陪同养成自主自理习惯／理财，获取多种投资途径／工作尽责／家庭，好好有效沟通，包容，控制情绪化；本周目标：阅读完一本书籍／瑜伽2次／每日运动／冥想昨日复盘：瑜伽30分钟／亲子教育／游乐场大年三十陪着公婆看春晚到结束，顺便也忙着朋友圈抢红包／给朋友发新年祝福，支付宝五福卡分到1.88元，虽然今年没花太
amber2040·2023-08-06 03:10

Elasticsearch官方测试数据导入

pwd=7n5n提取码：7n5n文档格式{"index":{"_id":"1"}}{"account_number":1,"balance":39225,"firstname":"Amber","lastname
IEVEl·2023-08-05 13:35

理财启蒙（一）

一前期准备在听的过程中，重燃了对儿子财商启蒙的想法，印象中Amber写过结合《小狗钱钱》对七岁女儿理财意识的引导，我是不是可以借鉴一下呢！
七年一遇·2023-07-26 23:15

《大表姐excel》学习笔记

十点课堂上学了大表姐的,对了大表姐Amber也叫琥珀老师。将学习笔记记录如下。零、双击公式格子右下角代替拉拽。
王晓城·2023-07-25 21:22

AMBER生物分子动力模拟工作站配置推荐

Amber是专门针对生物分子系统模拟而开发的分子动力学应用程序，AMBER支持GPU加速，可运行显式溶剂PME和隐式溶剂GB模拟。
wdf8088·2023-07-24 22:22

Day6 朋友圈

日常&精致【传奇】不对称设计，宴会之王【胡桃夹子】实物比图片更美，小星星可以在轨道上移动，又名“旋转星星”【巴洛克】大圈修饰脸型，树脂质地轻巧，配色百搭【Amber】手工滴胶，金色底色大气，中长款各种脸型均可产品介绍思路
唧唧啊唧唧·2023-07-21 17:07

【2班组】Day9 新媒体写作的特殊之处

图片发自App【学员信息】：2班1组-Amber-07【作业要求】：文章标题修改/分析，价值分析【作业如下】：请对以下文章进行标题修改，价值分析《金融圈的香艳丑闻里，没有一个无辜者》https://mp.weixin.qq.com
静然说·2023-07-21 11:05

只有想不到，没有做不到

最初本来就是给Amber过生日，可是无意中，创造了一个大家没见过的“蛋糕”套路，用这个套路一路进军中区。
爱读书君·2023-07-21 08:51

2020-02-12

却一直在向错误的方向寻找友情，我很沉迷于虚拟世界，但我也明白不可能，自己生活中的感情才是自己的，镜头下的生活，那是别人的，我永远也无法和他们发生交互，也可能一旦认识，聊了之后会发现他们并没有意思，我说的是那些明星（amber
黑夜里独行·2023-07-20 19:54

2022-02-10amber,mmpbsa

ante-MMPBSA.py-pbox.prmtop-ccom.prmtop-s":WAT,Cl-"--radii=mbondi2ante-MMPBSA.py-pbox.prmtop-crec.prmtop-s":WAT,Cl-,475"--radii=mbondi2ante-MMPBSA.py-pbox.prmtop-clig.prmtop-s":WAT,cl-,1-474"--radii=mb
DoubleT_2aac·2023-07-16 19:00

同源建模MOE：请叫我永远的神！

MMFF94x是一个用于小分子和复合物模拟的力场,不能很好地适用于大分子模拟,由于这里我们要进行同源模建,模拟对象是蛋白质结构,因此首先要将缺省分子力场MMFF94x更改为适用于蛋白质模拟的相关分子力场，如Amber
lixuegaoyunfeng·2023-07-15 13:49

AMBER分子动力学模拟之结果分析(突变型的能量计算,丙氨酸扫描)-- HIV蛋白酶-抑制剂复合物(5)

AMBER分子动力学模拟之结果分析(突变型的能量计算,丙氨酸扫描)--HIV蛋白酶-抑制剂复合物(5)丙氨酸扫描在带电残基上引入一个或几个丙氨酸，观察这些改变对蛋白功能的影响。
发呆的比目鱼·2023-06-17 16:12

AMBER分子动力学模拟之结果分析(构象分析)-- HIV蛋白酶-抑制剂复合物(6)

AMBER分子动力学模拟之结果分析(构象分析)--HIV蛋白酶-抑制剂复合物(6)RMSDRMSFb-facto计算RMSDRMSDmeasuresthedeviationofatargetsetofcoordinates
发呆的比目鱼·2023-06-17 16:12

关于Amber庄迪

2020第一天，伽涛老师带我参加了一个酒会，中国都市女性俱乐部，认识了Amber庄迪这个人，91年，年收入8-9位数，之前在网络上大致了解，原以为那些都是包装出来的，因为现在那样的人太多了，随便一个人出来都说自己是导师
爱音_zhang·2023-06-14 16:25

AMBER分子动力学模拟技术

AMBER分子动力学程序包是加州圣弗兰西斯科大学（UniversityofCaliforniaSanFrancisco,UCSF)的PeterAKollman和其同事编的，程序很全，现在已经发展到版本9.0
桃子0·2023-06-13 09:54

蛋白-配体相互作用、柔性对接及基于结构的虚拟筛选、基于药效团虚拟筛选、构效关系模型预测分子活性

其它相关课程：《Amber分子动力学技术与应用专题培训》、《Gromacs分子动力学技术与应用专题培训》、《人工智能药物设计技术与应用专题培训》、《新药先导化合物的虚拟筛选技术与实践专题培训》具体介绍请咨询联系人
桃子0·2023-04-20 14:16

amber复盘--20180211

／幼儿成长，陪同养成自主自理习惯／理财，获取多种投资途径／工作尽责／家庭，好好有效沟通，包容，控制情绪化；本周目标：阅读完一本书籍／瑜伽2次／每日运动／冥想昨日复盘：瑜伽15分钟／牛津树教学／亲子陪伴牛津树教材实在不知该怎样指导才好，才第3小册，孩子情绪依然不高，一遍遍带读憋了一肚子火，简单单词还能跟读，一到句子就像对牛弹琴。是不是已经错过了敏感期，点读笔也是一顿乱点乱按，完全没有学习的兴趣。看着
amber2040·2023-04-13 15:42

Week5│记录，是为了留下生活中的高光时刻

文│Amber本周小成就【每日打卡】听力练习7天、英语阅读7天，极光单词7天，潘多拉口语7天，英文日记1天、中文阅读4天。【书籍阅读】《芒果街的小屋》（英），输出读后感。
Amber的教学日记·2023-04-11 21:24

2018-05-19

我肯定回复你“像Amber和下铺这样，下铺给Amber在37摄氏度的土壤里种一颗爱的草莓，Amber趁着下铺碎觉的时候给她在眉心揪出来一个通红通红的天眼，像二郎神一样”逢人人怕的天眼～小谷说她觉得自己整个人都变了
南希大人·2023-04-09 14:15

第三章 成员聚齐（二）

amber看见宋茜只是微笑不说话，就体贴的中文解释：“你好，我是amber，我是中国人，她是在夸…你漂亮，她叫…崔雪莉，那个最高的…叫朴善怜，至于那个害羞…躲在后面的…小鬼叫郑秀晶。”
予羽千·2023-04-05 01:12

05-24禅生见解：新级别中枢开端，主流币酝酿新机会！

7.Amber首席执行官：比特币不是一场技术革命，而是一场
禅生论币·2023-04-03 16:04

amber复盘-20170120

年度目标：阅读10本以上书籍／每日运动，降低感冒频次；哈他瑜伽阴瑜伽结合练习，提高1个层次／幼儿成长，陪同养成自主自理习惯／理财，获取多种投资途径／工作尽责／家庭，好好有效沟通，包容，控制情绪化；本周目标：阅读完一本书籍／瑜伽2次／每日运动／冥想上周复盘：上周制定的计划因为出差都没完成今日目标：阅读1小时／养身：温灸泡澡／瑜伽一次昨日又在嘉兴一整天，终于定下来购买万科中环公园的项目。购买者以上海投
amber2040·2023-04-02 15:51

【芷水文心教育故事】隔离的某三个晚上

上学期Amber怀孕期间，经常加班很晚，有时吃饭也很晚，他常常绕到办公室问Amber：“Amber，你在干嘛呢？你怎么还不吃饭？”没有更多的话，渐渐地，Amber就懂得了，那是关心。
芷水文心·2023-04-01 03:32

敏捷自组织团队的10个特质 2020-07-15

敏捷自组织团队的10个特质Selforgnizingteam翻译：Amber原文地址：https://devqa.io/10-traits-agile-self-organizing-team/成功的敏捷思维的关键重要方面之一就是拥有一个自组织的团队
AmberLi00000·2023-03-31 13:23

Amber的ScalersTalk第四轮《新概念》朗读持续力训练 Day19 20181029

Lesson22GlassenvelopeMydaughter,Jane,neverdreamedofreceivingaletterfromagirlofherownageinHolland.Lastyear,weweretravelingacrosstheChannelandJaneputapieceofpaperwithhernameandaddressonitintoabottle.She
Amber_2ae5·2023-03-29 12:33

《魔鬼经济学》笔记第六天-孩子的名字

Amber和Heather刚开始是高收入家庭使用的名字，Stephanie；和Brittany也是如此，可很快，富人家庭里每出生一个Stephanie或Brittany，就会有5个低收入家庭给自己的孩子取同样的名字
爱读书君·2023-03-26 17:26

《哈利·波特》：不合格教师的6个特征

文|Amber看完《哈利·波特与凤凰社》（本文简称《哈利·波特5》），对反派DoloresUmbridge（多洛雷斯·乌姆里奇）这个角色真是恨得咬牙切齿。
Amber的教学日记·2023-03-26 07:29

JDK20正式发布了GA版本，短期维护支持，以及JDK21预览

JDK20提供了来自OpenJDK项目Amber的语言改进（S
小简(JanYork)·2023-03-25 19:27

JDK20正式发布了GA版本，短期维护支持，以及JDK21预览

JDK20提供了来自OpenJDK项目Amber的语言改进（S
Java知识库·2023-03-25 00:07

Day6经典案例实操巩固

3组-Amber拆解案例：***AI英语【课程名称】第一部分／营销模型一、【模型框架】：49元转2880元（1）模型1教育分销平台投放49转2880选择理由：家长群体比较集中优缺点：家长之间通过分销形式裂变速度更快
琥珀妞·2023-03-23 00:51

PySpark库

导入库frompysparkimportSparkConf,SparkContextsc=SparkContext.getOrCreate()创建RDDdata=sc.parallelize([('Amber
JUNjianshuZHU·2023-03-22 03:27

amber复盘-2017年12月17日-21天

加入123复盘群已经21天了，感觉过得飞快！坚持记录大概17天，期间发了4次左右的红包。每天生活平静按部就班，没太大的变化，后期已经感觉内容贫乏没什么好记录的，好几次萌生放弃的念头。明天开始尝试用excel记录法，把每天计划要做的事分解列出来。这21天围绕亲子／健康／阅读三大块展开，亲子每天持续进行也取得一定成就，阿诺在识字阅读／电子琴上进步较大。健康锻炼断断续续进行着，但不系统没有太大的感觉。阅
amber2040·2023-03-21 00:34

语冰/Amber的2021-2022年度之最

今年的时间大部分过得比较收敛~最有成就感的时刻，我在二语习得领域的重大发现，终于可以为四年的探索基本画出一个句点了，给我一点时间，我会把这些整理发出来......最开心的时刻，被偶像语音回答问题并有个简短的交流，开兴到自己在家像个孩子蹦起来最生气的时刻，因为学生工作一些同学不配合气到凌晨1点睡不着，表示这种事情以后再不会发生最感动的时刻，看姐姐出嫁最突破的时刻，学游泳（我恐水，严格地说，我还没突破
王文静_5a03·2023-03-20 12:33

你的自律中隐藏着你的价值

下面是我学amber老师的时间管理课梳理的一些想法：一、时间有形人有觉时间一刻不停地流逝，为什么我们察觉不到呢？
曹瀚文·2023-03-19 04:55

肥胖也有“克星”，想瘦的你千万别忽视被称为“刮油神器”的膳食纤维！

现在Amber就为你介绍一种“刮油神器”，它就是被誉为“脂肪克星”的膳食纤维。那么，究竟什么是膳食纤维？膳食纤维有哪些好处？跟着Amber了解一下吧【什么是膳食纤维？】
Amber正能量博主·2023-03-16 14:56

大人越放手 孩子更能干

中午和Amber一起商讨如何具体安排。
Lucy56·2023-03-15 17:48

教育操盘手自查标准——操盘手必备条件

3组-Amber1、个人背景【昵称】Amber【公司】**英语（前）【岗位】社群运营【工作年限】4年（转少儿教育行业0.5年）【年薪范围】***2、核心能力模型【人员管理】4-10人团队管理【承载能力】
琥珀妞·2023-03-15 09:13

amber复盘

年度目标：阅读10本以上书籍／每日运动，降低感冒频次；哈他瑜伽阴瑜伽结合练习，提高1个层次／幼儿成长，陪同养成自主自理习惯／理财，获取多种投资途径／工作尽责／家庭，好好有效沟通，包容，控制情绪化；本周目标：阅读2小时／瑜伽1次／每日运动本周复盘：亲子/聚会/出差/阅读本周已经发了4次红包，连续多天没有复盘记录。缘由：上午开会及出差。聚餐+出差引起的问题：本周已经连续2晚下班跟朋友聚会加上出差2天，
amber2040·2023-03-12 08:40
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