Blas

2021.11.21【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第五章 高级数据库搜索 中 ）

5.3寻找远缘相关蛋白质：位置特异性迭代BLAST（PSI-BLAST）和DELTA-BLASTPAM250矩阵给探测远缘相关蛋白质提供了一个更好的打分系统，可以改变打分矩阵来检测远缘蛋白质，但仍然有局限性
穆易青·2023-11-14 01:11

2021.01.05【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第四章 局部比对搜索基本工具-BLAST 上）

学习目标学会在NCBI网站上进行BLAST搜索理解BLAST各个参数的用途理解BLAST搜索的三个步骤（整理，扫描/延伸，回溯）;理解BLASTE值和分数的数学关系；阐明BLAST搜索的策略引言基本局部比对搜索工具
穆易青·2023-11-14 01:41

2021.01.05【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第四章 局部比对搜索基本工具-BLAST 下）

BLAST算法使用局部比对搜索的策略BLAST算法组成部分：列表、扫描、延伸BLASTP算法可以描述为以下3个阶段蛋白质搜索中，BLAST编译一个初步的两两比对序列，称为字段对BLASTP算法编译了一个由查询序列生成的固定长度为
穆易青·2023-11-14 01:41

2021.03.25【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第五章 高级数据库搜索 上）

学习目标定义位置特异性打分矩阵（PSSM）；解释位置特异性迭代BLAST(PSI-BLAST)和DELTA-BLAST怎样大幅提升蛋白质BLAST蛋白搜索的灵敏度；描述谱隐马尔可夫模型（HMMs）并解释其与
穆易青·2023-11-14 01:41

视频：PNAS报道纤维化扩展中“旁张力信号”介导的细胞间机械通讯

美国国家科学院院刊）在线发表了华大学医学院生物医学工程系和清华-北大生命联合中心杜亚楠教授研究组题为“Matrix-transmittedparatensilesignalingenablesmyofibroblast-fibroblastcrosstalkinfibrosisexpansion
生信宝典·2023-11-13 16:34

cellchat最新完整版本

getwd()dir.create("~/silicosis/fibroblast_20230930_universal_special/cellchat_fibroblast_macrohpages"
生信小博士·2023-11-13 06:18

【AI实战】llama.cpp量化cuBLAS编译；nvcc fatal:Value ‘native‘ is not defined for option ‘gpu-architecture‘

【AI实战】llama.cpp量化cuBLAS编译；nvccfatal:Value'native'isnotdefinedforoption'gpu-architecture'llama.cpp量化介绍
szZack·2023-11-12 08:29

B-ICE-EDA/SOPC FPGA创新电子教学实验平台

IntelCycloneIV/V系列，标准配置如下：主机B-ICE-EDA/SOPC，核心板可选GX-SOPC-EP4CE115-M484或GX-SOPC-5CEFA7/A5-5CEBA7/A5-M484，配置USB-Blaster
北京革新创展科技有限公司·2023-11-12 00:39

osg点云加载与渲染

点云文件constchar*lasfile=path.c_str();std::ifstreamifs;ifs.open(lasfile,std::ios::in|std::ios::binary);liblas
谢大旭·2023-11-11 18:04

【游戏开发引擎】 实验3：Captain Blaster 2D 滚动射击游戏

在本实验中，将制作一款名称为CaptainBlaster的2D滚动射击游戏。你首先将设计游戏的多个元素。接着，将开始构建滚动背景。一旦建立了运动的理念，就可以开始构建多个游戏实体。在完成了实体之
悠哟哟·2023-11-08 05:56

Ubuntu1604安装torch，以及NOTFOUND CUDA_cublas_device_LIBRARY解决办法

安装步骤1从git上获取相关文件cuda10以下选择gitclonehttps://github.com/torch/distro.git~/torch--recursivecuda10以上选择gitclonehttps://github.com/nagadomi/distro~/torch--recursive||如果出错error:RPCfailed;curl56GnuTLSrecverror
-Mingo·2023-11-07 09:37

随笔--解决ubuntu虚拟环境的依赖问题

ImportError:libcupti.so.11.7:cannotopensharedobjectfile:Nosuchfileordirectory解决步骤问题二：RuntimeError:CUDAerror:CUBLAS_STATUS_INVALID_VALUEwhencallingcublasSgemmStridedBatched
永久_小玖·2023-11-07 06:48

python的mkl库_[转]Numpy使用MKL库提升计算性能

但是默认链接的blas/lapack库性能非常差，在矩阵计算方面比MATLAB慢了不少。原因在于MATL
weixin_39769183·2023-11-06 20:27

使用MAKER进行注释: 学习MAKER的配置参数

/The_MAKER_control_files_explainedMAKER会生成三个配置文件，如下maker_opts.ctl:控制MAKER分析行为的主要配置文件maker_bopts.ctl:BLAST
xuzhougeng·2023-11-05 08:00

30-DAY CHALLENGES - NO.11

(done)英语Missiles导弹Amid在其中Eliciting诱发Applause鼓掌Allies盟友Pact协定accord、treaty近义词Expire呼出，到期Blast猛攻；爆炸Satellites
Mr_Waiting·2023-11-05 07:08

could not load cublas64_11.dll

在文件目录下有该文件，环境变量也配好了，但还是报错couldnotload，这时候就得重启大法！！！
couldn·2023-11-05 06:57

ZLIB静态库的编译

www.zlib.net截至目前最新版本1.2.1.1本如下图我选择从官网下载下载源代码下载完以后解压得到源代码目录结构大致如下amiga├─contrib│├─ada│├─amd64│├─asm686│├─blast
夜已深茶已凉·2023-11-04 15:19

Faiss(16)：编译时添加对AVX512指令的支持

2.编译OpenBLASopenblas是一个开源的矩阵计算库，包含了诸多的精度和形式的矩阵计算算法。就精度而言，包括float和double，两种数据类型的数
翔底·2023-11-04 06:49

DL4J无法下载MNIST数据集解决 Server returned HTTP response code: 403 for URL解决方法

报错情况报错如下：16:45:41.463[main]INFOorg.nd4j.nativeblas.Nd4jBlas-NumberofthreadsusedforOpenMPBLAS:616:45:41.497
zrc007007·2023-11-04 01:25

get colors from seurat dimplot 获取ggplot对象的颜色

·Issue#2366·satijalab/seurat·GitHubp<-DimPlot(fibroblast,label=TRUE)#GeneratethetSNEplot,butsaveitasanobj
生信小博士·2023-11-03 00:05

FPGA_Signal TapII 逻辑分析仪 在线信号波形抓取

连接开发板与Blaster仿真器，对开发板上电，完成之后打开tool
自小吃多·2023-11-01 15:36

ubuntu(18.04) 安装 blast 并在php中调用

1、下载https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/2、解压，配置环境变量tarzvxfncbi-blast-2.14.1+
暗夜潜行·2023-11-01 06:16

单细胞108篇文献解读之2---Spatially and functionally distinct subclasses of breast cancer-associated fibrob...

2、天罡星玉麒麟卢俊义2018年12月的NC文章：Spatiallyandfunctionallydistinctsubclassesofbreastcancer-associatedfibroblastsrevealedbysinglecellRNAsequencingimage.png
Seurat_Satija·2023-11-01 02:14

Blast常用命令

构建蛋白质数据库：makeblastdb-inspinach.fa-parse_seqids-hash_index-outspinach_DB-dbtypeprot构建核酸数据库：makeblastdb-inspinach.fa-parse_seqids-hash_index-outspinach_DB-dbtypenucl
BINBINCC·2023-10-31 21:27

Linux-RepeatMasker&RepeatModeler安装

一、RepeatMasker安装DownloadPage(repeatmasker.org)Prerequisties依赖软件：rmblast、trf、repeatdatabaseconda可解决的安装
Akuooo·2023-10-31 19:36

生信入门：序列比对之blast在线和本地使用

主要内容1背景2在线blast3本地blast3.1老版本blast3.2新版本blast背景序列比对（SequenceAlignment）的基本问题是比较两个或两个以上序列的相似性。
基因的生物信息学分析·2023-10-31 09:50

生物信息课程学习 --- 比对，BLAST，马尔可夫

90‘，97’发表了BLAST，GappedBLAST和PSIBLAST（多序列比对）。
bannerDr·2023-10-31 09:49

生物信息学（1）——双序列比对之Needleman-Wunsch(NW)算法详解及C++实现

生物信息学系列博客索引生物信息学（1）——双序列比对之Needleman-Wunsch(NW)算法详解及C++实现生物信息学（2）——双序列比对之Smith-Waterman(SW)算法详解生物信息学（3）——双序列比对之BLAST
大青儿·2023-10-31 09:19

生物信息学分析-blast序列比对及结果详细说明

1.软件说明Blast是一种基于序列比对的分析工具，可以用于寻找生物序列之间的同源性，它的全称是BasicLocalAlignmentSearchTool。
小果运维·2023-10-31 09:47

vue 使用turn.js 翻书效果

官方demo：：：：https://github.com/blasten/turn.js/blob/master/demos/magazine_single/index.html1.去以上地址把对应的jq
Meditate_MasterYi·2023-10-30 19:28

Linux下实现 psi-blast 的多进程并批量生成 pssm 文件

0.说明：在Linux通过Python的多进程模块实现psi-blast的并行，批量生成pssm文件。
@ZyuanZhang·2023-10-30 19:51

libcublas.so: undefined reference to `cublasLtGetStatusString@libcublasLt.so.11‘

解决方案比较简单暴力:直接重新安装原来的cuda,比如我ubuntu里面安装的是cuda11.7,后面我就是直接shcudaXXX_11.7.run只安装GUI里面提示的cudatoolkit就解决了,不要安装里面提示的driver驱动,PS:GUI里面的X是表示选择也就是选择这个安装的意思!!:安装cuda的链接在这里
阿维的博客日记·2023-10-30 09:49

多组学高分文献7-蛋白质组学揭示NNMT是癌症相关成纤维细胞的主要代谢调节因子

ProteomicsrevealsNNMTasamastermetabolicregulatorofcancerassociatedfibroblasts蛋白质组学揭示NNMT是癌症相关成纤维细胞的主要代谢调节剂期刊
纪伟讲测序·2023-10-30 02:17

波士顿房价预测

初始化库并导入数据2.查看是否有缺失值，查看各个变量的相关性3.探究各变量之间的相关关系4.初始化并训练线性模型5.可视化预测情况6.模型优化idea1：减少决策变量idea2：数据归一化idea3：尝试其他模型XGBLasso
灬德布罗意的猫灬·2023-10-29 22:48

numpy官方文档整理—线性代数（Linear algebra (numpy.linalg)）

MatrixandvectorproductsDecompositionsMatrixeigenvaluesNormsandothernumbersSolvingequationsandinvertingmatricesExceptionsTheNumPylinearalgebrafunctionsrelyonBLASandLAPACKtoprovideefficientlowleveli
千行百行·2023-10-29 18:04

M1 安装pandas报错解决方法

问题：pipinstallpandas报错commanderroredoutwithexitstatus1解决方法：brewinstallopenblaspip3installcythonOPENBLAS
Archie_uk·2023-10-28 18:17

linux makemap命令,Linux命令大全——LMNOPQ

lastblastb:lastbadlogin，显示登录失败的账号lastb，显示登录失败的账号。lastb-i，显示IP地址，而不显示主机名称。
weixin_39602280·2023-10-28 10:13

记 ：2023CTF羊城杯-Reverse方向 CSGO ‘ ‘ 题目复现

当初打都没写出来，现在复现一下；羊城杯题目复现：第一题知识点：DES算法：Ez加密器第三题虚假控制流py字典MD5算法；；Blast知识点，只是博主个人学习的点。
Sciurdae·2023-10-27 00:28

记 ： CTF2023羊城杯 - Reverse 方向 Blast 题目复现and学习记录

文章目录前言题目分析and复习过程exp前言羊城杯题目复现：第一题知识点：DES算法：链接：Ez加密器第二题知识点：动态调试：链接：CSGO这一题的查缺补漏：虚假控制流的去除（还没学习）；MD5加密算法的原理：链接：MD5加密算法原理python字典的使用刚学点题目分析and复习过程ida打开，到main函数里面发现都是虚假控制流的混淆，还不知道怎么去除，先Shift+F12搜索字符串看到succ
Sciurdae·2023-10-27 00:28

记：2023羊城杯-Ez加密器-题目复现和学习记录““

羊城杯题目复现：第二题知识点：动态调试：CSGO第三题虚假控制流py字典MD5加密“”“”Blast题目分析and调试过程查壳nie进入IDA，shift+F12查找下字符串看看，定位过去先用N重命名一下函数
Sciurdae·2023-10-27 00:56

【代码分析】cublasSgemm 矩阵乘法详解

目录前言预备知识cublasSgemm函数求解C=AxB不使用cublasSgemmtransa与transb参数示例程序使用cublasSgemmtransa与transb参数示例程序前言cublasSgemm
HaoBBNuanMM·2023-10-26 11:54

VASP 5.4.4 保姆级安装全过程 （附带vaspkit）

InstallGNUCompilersudoapt-getinstallmakebuild-essentialg++gfortranInstallrequiredVASPlibraries(lapack,scalapack,openmpi,andfftw)sudoapt-getinstalllibblas-devliblapack-devl
萌新待开发·2023-10-26 01:02

2022-06-28

Wiley在线发表在美国癌症协会同行评议期刊《Cancer》上的新发现“Efficacyofpost-inductiontherapyforhigh-riskneuroblastomapatien
图灵基因·2023-10-25 22:12

RL debug

GPUrelatedBlasGEMMlaunchfailedSolution:RestartCode/Jupyter/TerminalReason:GPUisfullyconsumed.ENVrelatedTensorflowrelatedWinerelatedUbuntu
松山剑客·2023-10-25 08:21

基于MIMO+16QAM系统的VBLAST译码算法matlab仿真

目录1.算法运行效果图预览2.算法运行软件版本3.部分核心程序4.算法理论概述5.算法完整程序工程1.算法运行效果图预览2.算法运行软件版本matlab2022a3.部分核心程序........................................................................forSNR_dB=SNRSNR_dBind=ind+1;bertmp=0;N
简简单单做算法·2023-10-24 22:15

【request爬虫3】批量爬取Cell Blast

frompyqueryimportPyQueryaspqimporttimeimportjsonimportsysimportosimportre#设置数据保存路径&请求网址wd=r'/share/disk1/Data/Users/luohb/spider/Cell_BLAST
Geekero·2023-10-23 09:24

python矩阵相乘 速度_如何在Python中加速矩阵乘法？

我当前版本的numpy使用blas，或者它看起来是这样的，因为numpy.core._dotblas.dot显示为占处理总时间80%的函数。因为它是我的神经网络的核心，而且我必须经
weixin_39787606·2023-10-22 20:18

python安装pandas出错_python pandas 安装失败原因揭晓_python pandas 教程

，对于32位的python2.7，可以在sourceforge上面下载再安装，或者从lfd那里下载再安装，这个地方提供了32位与64位的whl安装文件，用wheel安装即可，而且这里提供的numpy的blas
weixin_39890431·2023-10-22 18:57

C++ 命名空间 namespace的 嵌套

的定义方式#include#includenamespacedetail//定义一个namespace{constinti=99;}namespaceant//namespace嵌套{namespaceblas
Dr. Qing·2023-10-22 16:58

sql-内连接和左外链接处理一对多情况的实验

使用等值连接，，在选择列表中列出LandTbl和TownTbl表中重复列(TownCode)：例：Select*fromLandTblasAinnerjoinTownTblasBonA.TownCode
科学的发展-只不过是读大自然写的代码·2023-10-21 07:28
上一页 1 2 3 4 5 6 7 8 下一页
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他