blast

Themis新篇章：老牌衍生品协议登陆Blast L2，探索全新经济模型

本文将深入分析Themis的最新经济模型，探讨其核心概念和机制、优势与创新之处、风险与挑战。一、引言随着区块链技术的不断发展，DeFi衍生品项目逐渐成为市场的焦点。而用户体验的革新，进一步的金融创新，去中心化治理方案的优化，新的流动性挖矿和激励机制的实施，使去中心化衍生品交易进入快速发展期。行业的快速发展离不开合适的契机，太早或者太晚都是一种错误！基础设施的完善，对于一个项目，甚至一个行业的发展至
小树苗193·2024-09-05 03:23

NCBI BLAST+：分析生物内在编码的工具

在生物信息学的广阔领域中，NCBI（NationalCenterforBiotechnologyInformation，美国国立生物技术信息中心）开发的BLAST（BasicLocalAlignmentSearchTool
belldeep·2024-09-02 23:52

简并碱基

以下简并碱基所代表的字母在NCBI-Blast，primerpremier,oligo等软件中能够被识别，故可放心使用。
我想养只猫zhl·2024-02-14 15:10

自然环境下，4种水稻叶片病虫害数据集，并使用深度卷积网络对其识别，准确率在98.6%以上（python代码，带有数据集，可以直接运行，带有GUI界面，对代码感兴趣可以私信，为本人创作）

1.数据集介绍：自然环境下，4种水稻叶片病虫害数据集Bacterialblight（白叶枯病）共1548张，Blast（稻瘟病）共1440张，BrownSpot（褐斑病）共1600张，Tungro(水稻東格魯桿狀病毒
深度学习的奋斗者·2024-02-09 22:25

XMLtoPairwise | 又多一个BLAST结果解析器

写在前面前两天，推了一篇《简洁|优雅地整理BLAST比对结果》。
生信石头·2024-02-06 07:48

Android14 SurfaceFlinger-BLASTBufferQueue的创建

如果mWindowSession.relayout之后，mSurfaceControl将会变成有效的，此时会判断blast是否开启（blast特性时12新推出的，它默认开启的），所以进入到getOrCreateBLASTSurface
jinyanmei_335·2024-02-05 21:23

python global用法_用Python设计PCR引物: Primer3py

Primer-BLAST、PrimerPremier都是比较经典的软件，除此之外还有很多新的在线设计软件，也很方便。
weixin_39717026·2024-02-05 06:13

Day 26-富士山下的“自杀森林”里，他用摇滚乐治愈人心

KyochiblastsJohnLennon's"Imagine"intothenight---hopingthatmusiccanliftpeoplefromtheirdespairbeforeit'stoolate.blast
ShirleyYi·2024-02-03 10:28

答读者问(1)：非模式物种找marker；如何根据marker定义细胞类型

一开始以为是想问我非模式物种的marker基因在哪儿找，读者朋友也提到了blast研究的主要细胞类型的marker是有的让读者朋友困惑的是一张表，cluster乘样本的表，每一个值表示表达这个marker
TOP生物信息·2024-02-03 00:42

LINUX的练习题

LINUX的练习题：最低要求是完成我的linux20题http://www.bio-info-trainee.com/2900.html其次完成生物信息学数据格式的习题(blast/blat/fa-fq
七七师姐·2024-01-31 00:14

用Modules优雅地管理你的环境变量

我管理的基因组学群里，今天有人提出了这样一个问题，如果有多个版本的BLAST，并且都是用conda安装，应该如何调用不同版本的BLAST提问截图对于这个问题，其实存在多种解决方案：用绝对路径进行调用使用
xuzhougeng·2024-01-30 14:54

【一竞技CS2】shox回归参加BLAST The Draft第一赛季

Zyphon去年曾为Heroic担任过一段时间的替补,帮助他们参加了BLAST秋季决赛和BLAST世界总决赛。在职业生涯早期,他还曾为CPHF效力,是参加斯德哥尔摩和安特卫普Major的队伍成员之一。
全景网动态·2024-01-29 12:31

10-【BPGA】的安装和使用

2.安装2.1下载Usearch官网下载后，解压缩后将文件重命名为usearchusearch是一款序列分析工具，其提供的搜索和聚类算法比blast快几个数量级。
lkj666·2024-01-27 05:07

序列比对之blast在线和本地使用

序列比对（SequenceAlignment）比较两个或两个以上序列的相似性blast（BasicLocalAlignmentSearchTool）是一种序列相似性比对工具，是生物信息分析最常用的一款软件
Nemo_53e9·2024-01-26 19:10

BLAST深入源码剖析

背景：以前分屏pip课程时候讲解过pip由小变大时候有使用到一个方式方式叫做同步事务，这个之前课程也讲解了他的使用方式和作用及表面原理，并没有深入到BLASTBufferQueue部分讲解。刚好这次需要讲解BLASTBufferQueue的新特性，刚好以这个为案例进行分析。服务端部分sync逻辑回忆一下当时代码同步事务调用代码：可以看到这里先调用了的是SyncTransactionQueued.q
千里马学框架·2024-01-22 15:54

生物信息学导论-北大-变异的功能预测3（Comparative Modeling）

回放：同源建模HomologyModeling：SWISS-MODEL执行：先在数据库中搜索（i.e.BLAST）找到至少一个
陆沙·2024-01-21 17:34

序列比对原理

主要几种算法包括全局比对算法（Needleman-Wunsch算法），局部比对算法（Smith-Waterman算法），Blast等。
生信自修室·2024-01-18 05:40

蛋白质基础分析

NCBI数据库常用四个子库:PubMed、BLAST、Nucleotide、Protein.对于一个蛋白质的基础分析:1.获得蛋白质序列：NCBI2.预测信号肽:SignalP4.1Server3.等电点和分子量
BioLearner·2024-01-18 04:53

Ubuntu下载并安装blas、cblas、lapack

gfortransudoapt-getinstallgfortran2.下载安装包blas：http://www.netlib.org/blas/blas.tgzcblas：http://www.netlib.org/blas/blast-forum
美人胖八分·2024-01-17 19:37

使用Diamond比对NR数据库获取物种注释

再用NR库试试参考：将NR数据库diamond比对结果做物种注释_diamond物种注释-CSDN博客NR下载nohupwget-t0-c-bhttps://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast
CAAS_IFR_zp·2024-01-15 22:56

剧本杀百变大侦探《消失的制作人》凶手是谁剧透+真相答案复盘解析攻略

剧本杀部分真相复盘剧透获取完整真相复盘只需两步①【微信关注公众号：奶茶剧本杀】②回复【消失的制作人】即可查看获取哦剧本杀百变大侦探消失的制作人剧本杀真相答案凶手剧透：以下是部分关键证据，凶手，时间线，复盘解析，推理逻辑茂先生（男）今年41岁，是BLAST
VX搜_奶茶剧本杀·2024-01-15 02:08

噬菌体

噬菌体的宿主预测：利用细菌的spacers和自己宏基因组测序得到的序列，细菌的spacers建立blast索引，然后使用blastn参数：blastn-short-e1e-5进行比对。
宏病毒组·2024-01-11 18:00

生物信息百Jia软件（八）：blat

blat与blast其实是不同的，虽然都是局部比对工具，但是blat实现了“多对一”的比对，也就是能将不同的外显子定位到同一个基因上。
基因学苑·2024-01-10 10:46

点点点 | 真香！Simple GO GSEA 富集分析 ~

那会，我写了几款小的软件，包括“blast3go”，为的是应对即将收费的“blast2go”。当然，后来相关功能都整合到TBtools中。而其中有一个重点功能，即GO富集分析。
生信石头·2024-01-09 21:17

本地blast

建数据库：makeblastdb-in.\miR171.fa-input_typefasta-dbtypenucl比对：blastn-dbmiR171.fa-queryrco.fa-outrco.csv-evalue1e-5-outfmt7-num_threads2
德先森的书·2024-01-06 12:04

NCBI线下blastn-short比对

ncbi的BLAST比我想象中的要强大，用普通blastn貌似不能将basepire数小于50的序列比对到基因组。像我，想将一些15bp的序列比对到基因组上做统计。
嗒嘀嗒嗒嘀嗒嘀嘀·2023-12-28 03:33

ClustalW----多序列比对分析(一)

例如:BLAST、FASTA。序列同源性分析:将待研究序列与一组与之同源，但来自不同物种的序列进行多序列比较，以确定该序列与其他序列间的同源性大小。完成这一步需要多序列比对算法。例如:Clustal。
bcl_hx·2023-12-25 03:44

blast安装及简单使用

一、安装blast1.Ubuntu环境#下载blastwgethttps://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/2.9.0/ncbi-blast
陈年小趴菜·2023-12-23 14:15

Linux本地化运行NCBI blast+

前言：作为生物科研人员的标配，BLAST知多少？BLAST简介：BLAST是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。
谢俊飞·2023-12-23 00:39

非root用户安装nodejs和npm

2020-02-19注意，安装这个主要是为了安装blastutils，安装blastutils或者是说blast-pipe，主要是为了解决VFDB毒力因子的本地化的问题一、下载和安装nodejs和npm
暮色下的烟波澜·2023-12-21 15:20

11 月公链盘点：Solana 强势复苏，Blast 飞速崛起，Web3 游戏市值猛涨

在以太坊继续主导TVL和像Arbitrum这样的Layer2成为焦点的同时，我们也见证了Solana引人注目的复苏和Blast流星般的崛起。
Footprint_Analytics·2023-12-17 04:55

11 月 NFT 动态：交易量增长，Layer 2 格局剧变

NFT领域中，Blur的交易量飙升，进一步巩固地位；Blast的亮相，改写了Layer2格局。与此同时，币安CEO宣布辞职，标志着一个拥抱合规并勇往直前的成熟市场的到来。
Footprint_Analytics·2023-12-17 04:49

Blast 5【某活动设定稿】

最近在忙的间隙，接了一个小私活，给某线上活动做设定，包括人设、背景设定、故事梗概，等等。第一版的时候对方提的需求和最后所给的需求，基本完全不同，这个倒也没啥，很正常。然后这是第一版的时候写的设定，晚上干完正事的时候所想的，后来不出意料地被KO了，对方想要更逗逼更中二的。虽说是随便写的，而且也被KO了，但放自己电脑上还是感觉太浪费了，所以放出来让大家乐乐，说不定还能激发别人灵感/吐槽欲望，这也挺好。
LostAbaddon·2023-12-06 02:56

blat下载与安装

blat是一款很经典的比对工具，与blast相比，具有速度快、共线性输出比对结果等优点。但是，blat源码包里面的README文件写得很不清楚，这里，我来提供一份详细的安装文档。
记号晴系·2023-12-05 16:04

本地blast与nr/nt库

步骤一：NT/NR库全库下载用wget对数据库进行下载NT/NR库：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/NT库有76个子文件构建成NT全库NR库有63个子文件构建成
筱贺学生信·2023-12-03 18:59

Blast中文手册(6)

AppendicesCreated:June23,2008;Updated:March14,2021.ConversionfromCtoolkitapplications(从C工具包到应用程序的转换)ThefunctionalityofferedbytheBLAST+applicationshasbeenorganizedbyprogramtype.Thefollowinggraphdepicts
病树前头·2023-12-02 03:38

dbCAN碳水化合物酶基因数据库及run_dbCAN4工具安装配置及使用

它基于隐马尔可夫模型（HMM）和BLAST搜索，能够在蛋白质序列中识别和注释不同类型的碳水化合物酶基因，包括纤维素酶、木质素酶、半纤维素酶、淀粉酶、果糖酶等等。
小果运维·2023-12-01 14:46

【现学现卖】宏基因组数据与深度学习

当拿到了这些数据，如果用传统的assemble，blast，mapping的方法可能不利于找到样品中的新物种。比如我提取了真菌的dsRNA，送测序，得到几十万个reads，有
乔伊nikkie·2023-11-30 13:34

【MATLAB源码-第83期】基于matlab的MIMO中V-BALST结构ZF和MMSE检测算法性能误码率对比。

操作环境：MATLAB2022a1、算法描述在多输入多输出（MIMO）通信系统中，V-BLAST（垂直波束形成层间空间时间编码技术）是一种流行的技术，用于提高无线通信的数据传输速率和容量。
Matlab程序猿·2023-11-21 09:16

clermontyping安装使用

1安装依赖根据github主页提供的指示，我们需要安装以下依赖：1.1BLAST+下载并解压包：wgethttps://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/LATEST
Odd_guy·2023-11-15 22:15

【学习笔记】山东大学生物信息学-02 序列比较

山东大学生物信息学文章目录二、序列比较2.1认识序列2.2序列相似性2.3替换记分矩阵2.4序列两两比较：打点法2.5序列两两比较：序列比对法（定量）2.6一致性和相似度2.7在线双序列比对工具2.8BLAST
taotaotao7777777·2023-11-14 01:43

2021.12.19【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第五章 高级数据库搜索 下）

5.5用类似于BLAST的比对工具快速搜索基因组DNA需求：随着基因组DNA数据库数量增长，对比对工具要求越来越高能在基因组DNA中找到外显子比对时考虑基因组DNA包含的测序错误有相应的算法解决相关物种的基因组在比对中出现删除
穆易青·2023-11-14 01:42

2021.11.22【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第五章第五节 用类似于BLAST的比对工具快速搜索基因组DNA）

5.5用类似于BLAST的比对工具快速搜索基因组DNA需求：随着基因组DNA数据库数量增长，对比对工具要求越来越高能在基因组DNA中找到外显子比对时考虑基因组DNA包含的测序错误有相应的算法解决相关物种的基因组在比对中出现删除
穆易青·2023-11-14 01:12

2022.09.17【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第十三章 蛋白质结构预测 下）

目录蛋白质结构预测三种方法同源建模(比较建模)穿线法从头预测（abinitio）基于假设推荐策略精度与方法选择Alphafold2相关信息蛋白质结构预测三种方法同源建模(比较建模)建模4步骤1.模板选择和确定折叠构象通过blast
穆易青·2023-11-14 01:12

2021.11.21【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第五章 高级数据库搜索 中 ）

5.3寻找远缘相关蛋白质：位置特异性迭代BLAST（PSI-BLAST）和DELTA-BLASTPAM250矩阵给探测远缘相关蛋白质提供了一个更好的打分系统，可以改变打分矩阵来检测远缘蛋白质，但仍然有局限性
穆易青·2023-11-14 01:11

2021.01.05【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第四章 局部比对搜索基本工具-BLAST 上）

学习目标学会在NCBI网站上进行BLAST搜索理解BLAST各个参数的用途理解BLAST搜索的三个步骤（整理，扫描/延伸，回溯）;理解BLASTE值和分数的数学关系；阐明BLAST搜索的策略引言基本局部比对搜索工具
穆易青·2023-11-14 01:41

2021.01.05【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第四章 局部比对搜索基本工具-BLAST 下）

BLAST算法使用局部比对搜索的策略BLAST算法组成部分：列表、扫描、延伸BLASTP算法可以描述为以下3个阶段蛋白质搜索中，BLAST编译一个初步的两两比对序列，称为字段对BLASTP算法编译了一个由查询序列生成的固定长度为
穆易青·2023-11-14 01:41

2021.03.25【读书笔记】丨生物信息学与功能基因组学（第五章 高级数据库搜索 上）

学习目标定义位置特异性打分矩阵（PSSM）；解释位置特异性迭代BLAST(PSI-BLAST)和DELTA-BLAST怎样大幅提升蛋白质BLAST蛋白搜索的灵敏度；描述谱隐马尔可夫模型（HMMs）并解释其与
穆易青·2023-11-14 01:41

使用MAKER进行注释: 学习MAKER的配置参数

/The_MAKER_control_files_explainedMAKER会生成三个配置文件，如下maker_opts.ctl:控制MAKER分析行为的主要配置文件maker_bopts.ctl:BLAST
xuzhougeng·2023-11-05 08:00

30-DAY CHALLENGES - NO.11

(done)英语Missiles导弹Amid在其中Eliciting诱发Applause鼓掌Allies盟友Pact协定accord、treaty近义词Expire呼出，到期Blast猛攻；爆炸Satellites
Mr_Waiting·2023-11-05 07:08
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