Blas 第5页

通过 blast 结果查看测序数据fastq是否被污染，以及污染reads所属物种、所占比例

下面我们通过blast的结果，来检查测序数据fastq是否被污染，以及污染来源、所占比例。

风风是超人·2023-10-21 02:57

3D MAX插件大全介绍

好的插件可以达到事半功倍的效果,但装多了会吃不消的呀,呵呵,以下是一些插件的介绍,大家有空可以看看:MAXMATTER印刷特效Atomizer喷雾器特效Pandora潘朵拉特效BonesProMAX骨骼变形特效SandBlaster

pizi0475·2023-10-20 21:45

PyTorch 模型性能分析和优化 - 第 6 部分

使用torch.use_definistic_algorithms函数和cuBLAS环境变量CUBLAS_WORKSPACE_CON

冷冻工厂·2023-10-20 00:45

解决pycharm提示ImportError: libcublas.so.9.0: cannot open shared object file: No such file or directory

报错信息：ImportError:libcublas.so.9.0:c

WarrenGonaWhere·2023-10-18 06:23

【网络安全 --- MySQL数据库】网络安全MySQL数据库应该掌握的知识，还不收藏开始学习。

#修改yum源的配置文件vim/etc/yum.repos.d/mariadb.repoi[mariadb]name=mariadblast

网络安全_Aini·2023-10-18 05:13

[linux] libcublas.so.11: undefined symbol: cublasLtGetStatusString, version libcublasLt.so.11 报错

libcublas.so.11:undefinedsymbol:cublasLtGetStatusString,versionlibcublasLt.so.11-CSDN博客安装torch之后，pipinstalltorch

心心喵·2023-10-18 02:02

ubuntu深度学习配置

1.删除旧cuca，旧显卡驱动sudoapt-get--purgeremove"*cublas*""*cufft*""*curand*""*cusolver*""*cusparse*""*npp*""*

rush_mj·2023-10-17 21:08

What‘s means undefined symbol: cublasLtHSHMatmulAlgoInit, version libcublasLt.so.11

exportLD_LIBRARY_PATH=/opt/conda/lib/python3.9/site-packages/nvidia/cublas/lib/:$LD_LIBRARY_PATHvim~/

明星海棠果·2023-10-17 17:28

【错误】 undefined symbol: cublasLtHSHMatmulAlgoInit, version libcublasLt.so.11

问题分析pip安装完pytorch=1.13.1后，build代码时出错：undefinedsymbol:cublasLtHSHMatmulAlgoInit,versionlibcublasLt.so.11

there2belief·2023-10-17 17:22

ensemble使用教程

ensemble数据库的功能非常多，在此主要介绍用ensemble下载目标物种的全基因组文件和基因注释文件，以及如何用ensemble进行blast

花舞lala·2023-10-16 16:55

深度学习模型里super函数的作用和def init的作用

super()函数可以隐式地将子类(sublass)里的method，与父类(superclass)里的method进行关联。这样的好处在于我们不用在子类里显式地重新创建父类method里的属性。

zghnwsc·2023-10-16 12:20

10X单细胞（10X空间转录组）层次聚类分析intra-tumor variability programs

，大家好，今天我们继续分享一些寻找肿瘤programs的方法，参考文章在AnIntegrativeModelofCellularStates,Plasticity,andGeneticsforGlioblastoma

单细胞空间交响乐·2023-10-16 05:56

blast本地比对输出结果

之前写过一篇如何使用blast+套件进行本地blast库的创建及比对，今天跟大家聊聊比对结果的输出格式。

xiaoji_hb·2023-10-15 02:10

各种工具一览

目录LabelmeLabelImgLabelboxPowerPointWPSNIrCMDDoxygenU-BootfrpMicrosoftVisualC++(MSVC)IntelMKLLLVMBLAScuDNNAMIOpenMPIEigenxtermturboboostwheelNEONRedisOpenAIGym

天边一坨浮云·2023-10-14 22:47

基础知识复习之比对

reads分布在什么位置，然后根据这个去找变异或者看表达量多少；拼接的话可以拼接转录本或者构建基因组序列比对就是将测序reads重新定位到基因组/转录组上，又叫mapping先说下特点和平常我们常用的blast

刘小泽·2023-10-14 17:59

CUDA编程模型系列十( CUDA Stream / CUDA 流 / 多流执行)

多流执行)本系列视频目的是帮助开发者们一步步地学会利用CUDA编程模型加速GPU应用,我们的口号是:让GPU飞起来本期我介绍了CUDA中Stream的概念和使用方法,CUDA流也是很多CUDA加速库(cuBLAS

扫地的小何尚·2023-10-14 10:39

深度学习平台搭建： Ubuntu16.04 + 显卡驱动384 + cuda8.0 + cudnnv6.0 + anaconda3 + tensorflow-gpu-1.2 + keras

tensorflowgpu-1.2+keras#########################################先附上可能会报错的问题：问题1：导入TensorFlow报错：libcublas.so

hutingting0611·2023-10-14 01:03

miRNA测序数据生信分析——第四讲，未知物种的生信分析实例

——第四讲，未知物种的生信分析实例miRNA测序数据生信分析——第四讲，未知物种的生信分析实例1.下载测序数据2.原始数据质控——软件fastqc3.注释tRNA和rRNA，使用Rfam数据库——软件blast

彼岸花128·2023-10-13 23:09

miRNA测序数据生信分析——第三讲，已知物种的生信分析实例

——第三讲，已知物种的生信分析实例miRNA测序数据生信分析——第三讲，已知物种的生信分析实例1.下载测序数据2.原始数据质控——软件fastqc3.注释tRNA和rRNA，使用Rfam数据库——软件blast

彼岸花128·2023-10-13 20:26

文献:单细胞+空间转录组分析揭示大肠癌中成纤维细胞和巨噬细胞的相互作用

文献名称:Single-cellandspatialanalysisrevealinteractionofFAPfibroblastsandSPP1macrophagesincolorectalcancer.NatCommun20220401

大王福不福·2023-10-13 05:38

Quartus&Modelsim安装及有关配置

文章目录一.Quartus和Modelsim的安装二.Quartus破解三.Quartus配置Modelsim四.usb_blaster驱动更新五.VScode联合Modelsim检错一.Quartus

Álegg xy.·2023-10-13 03:09

jetson tx2 部署yolov5环境运行detect.py遇到非法指令（核心已转储）问题

核心已转储问题所在在jetsontx2部署yolo环境中，安装各种包的情况下，会遇到各种包不兼容问题，比如numpy如何解决在创建的虚拟环境中，输入exportOPENBLAS_CORETYPE=ARMV8

呆神plus·2023-10-10 19:39

Ubuntu环境下LAS数据格式与PCD数据格式的转换

Ubuntu环境下LAS数据格式与PCD数据格式的转换１LAS简介２源文件代码３在Ubuntu环境下使用遇到的问题４解决办法1）安装boost库2）安装liblas库５运行功能包１LAS简介 LAS是一种用于激光雷达数据交换的已发布标准文件格式

Roar冷颜·2023-10-10 06:30

分子生物学词汇（A~B）

脱碱基位点，无碱基位点abaxial远轴的abequose阿比可糖，beta脱氧岩藻糖aberrantsplicing异常剪接aberration象差；畸变；失常abiogenesis自然发生论，无生源论ablastin

casularm·2023-10-09 19:53

openpose环境基于opencv4.4 +cuda11.3+cudnn8.X

RELEASE\-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/usr/local\-DWITH_TBB=OFF\-DENABLE_FAST_MATH=1\-DCUDA_FAST_MATH=1\-DWITH_CUBLAS

多财多亿,凭亿近人·2023-10-09 16:10

NCBI下载nt/nr/swissprot库

NCBI下载nt/nr/swissprot库1.确定你要下载文件的位置https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/FASTA/2.进行下载方法一：使用wget，nohupwgethttps

彼岸花128·2023-10-08 08:59

EGFR突变通过表观组学和转录因子网络重构促进恶性胶质瘤发生--2021-04-09

EGFRMutationPromotesGlioblastomathroughEpigenomeandTranscriptionFactorNetworkRemodelingmolecularcell15.584

FFwizard·2023-10-07 18:47

jetson设备上如何加速opencv？

CUDAFastMath(cuBLAS)OpenGLGStreamer1.0Video4Linux(V4L)Python2.7andPython3.5supportTBB(ThreadingBuildBlocks

phoenixmy·2023-10-07 11:01

游戏日志_Blasphemous

游戏类型:银河恶魔城题材：天主教宗教题材美术风格：像素游戏时间：13.9小时游戏画面:像素画面，画面简单但不简约。整体画面的色调采用的比较冷色系符合游戏主要叙事氛围。背景：游戏的背景绘制精度较高，场景内层次与层次的区分度较大。近境，中景，远景的构成物描写的细致程度明显。位于不同层次的场景，从清晰度以及饱和度上即可看出明显差距，场景的整体打光统一十分优秀。同时为了打破素材重复利用等问题，近境中的场景

zuika·2023-10-05 18:54

2018-03-01

WhatisBLAST:BLASTisamethodologytosearchfewandshortsequencesagainstacollectionofsequences(potentiallymillions

大宝贝喜欢徐先生·2023-10-04 06:39

搭建PrimerServer2之Web UI界面

目前，已经有许多成熟的引物设计软件供大家使用，如本地版的Primer5以及NCBI上的Primer-BLAST等等。

老饕_Ljw·2023-10-03 07:53

解决报错：CUBLAS_STATUS_INVALID_VALUE when calling `cublasSgemmStridedBatched( handle, opa, opb, m......

文章目录CUBLAS_STATUS_INVALID_VALUE1.Batchsize2.版本不匹配3.维度不匹配3.恢复LD_LIBRARY_PATH默认设置CUBLAS_STATUS_INVALID_VALUE

莫余·2023-10-02 08:43

新沂机器人比赛获全国机器人竞赛一等奖可喜可贺

新沂机器人小学代表队，荣获2018中国区Theblastgames青少年机器人竞技活动一等奖。

新沂少儿编程·2023-10-02 07:40

FPGA下载器驱动的安装

二、更新USBblaster1、右键此电脑(我的电脑)选择管理双击设备管理查找USBBlaster 第一次使用USB-Blaster的时候，在其他设备可能会出现驱动不正常的情况。

佣兵之王@大青山·2023-10-02 01:24

BLAST本地比对太慢，不怕用diamond

长期以来，BLASTX因其高灵敏度而被认为是此标准的黄金标准工具。但是，BLAST

lakeseafly·2023-10-01 18:30

EnglishPod｜1950's

It’llbeablast!B:Firstofallit’stheSadieHawkinsdance.Thegirlsgottaasktheguys.Also.

京酱Jing·2023-10-01 06:00

iOS与c++ 混编 ,联调opencv & dlib遇到的坑~~

Dlib安装1.dlib安装需要的依赖有openblas,opencv，都可以通过brew安装$brewinstallopenblas$brewinstallopencv2.然后安装X11https:/

黄易女民工jiang·2023-09-30 04:25

OpenBlas0.3.14编译

OpenBLAS各个版本下载：https://github.com/xianyi/OpenBLAS/releasesgit下载：gitclone-bv0.3.14https://github.com/xianyi

落花逐流水·2023-09-29 08:41

今日英文学习

blastpauseshatteredmarkcatastrophicplungemarchdevastateportdestructiveobserveammoniumnitratetoll

清听漫语·2023-09-28 21:28

安装treemix报错configure: error: could not find GSL BLAS怎么办？

报错：在安装treemix的时候，报错了configure:error:couldnotfindGSLBLAS解决方案installGSLwgethttp://mirrors.ustc.edu.cn/gnu

石博士·2023-09-25 09:15

看完iPhone12的文案中文版，你还觉得“十三香”吗？

1.Blastpastfast.图源网络中国官网：升维大提速。图源网络中国香港官网：速度，突破另一层次。图源网络中国台湾

文案鉴赏集·2023-09-24 14:49

如何计算kaks值和4dtv值

前期准备不同物种的蛋白和cds序列：os.pep,os.cds,sb.pep,sb.cds依赖程序：blast+,clustalw2,ParaAT,KaKs_Calculator注：所依赖程序需提前安装好

Davey1220·2023-09-23 10:49

http代理和socks代理

Socks是个电路级的底层网关，是DavidKoblas在1990

terryhuang·2023-09-21 19:52

OpenBlas在J1900下的编译问题

最近在使用别人提供的离线人脸识别sdk的时候，涉及到了OpenBlas这个开源的矩阵计算库，但是这个库对cpu有特殊要求，本人使用的J1900是赛扬系列的，编译的时候出现了问题：yingbin@yingbin-desktop

搬砖程序员·2023-09-20 04:54

blastall报错之一

[blastall]WARNING:Contig41035:CouldnotcalculateungappedKarlin-Altschulparametersduetoaninvalidquerysequenceoritstranslation.Pleaseverifythequerysequence

溪溪溪溪溪川·2023-09-19 16:16

使用R语言包RIdeogram展示blast双序列比对结果

RIdeogram是用来展示染色体组型（idiogram）的一个R语言包，比如展示snp的密度分布；展示某类基因在染色体上的分布等等。具体介绍可以参考https://www.plob.org/article/16335.html发表的论文是RIdeogram:drawingSVGgraphicstovisualizeandmapgenome-widedataontheidiogramsPeerJ2

小明的数据分析笔记本·2023-09-19 11:32

解决 ChatGLM.CPP+clBlast 编译错误（也适用于SD.CPP）

首先安装OpenCL和clblast：vcpkginstallopenclclblast下载GitHub上的源码：gitclone--recurse-submoduleshttps://github.com

绝不原创的飞龙·2023-09-18 19:29

ubuntu环境下部署PaddleOCR运行慢问题解决

上一篇博客中下载的预测库为：manylinux_cpu_avx_openblas_gcc5.4经过在网上一番查找有人说建议下载mkl版本的预测库即manylinux_cpu_avx_mkl_gcc5.4

xp_fangfei·2023-09-18 12:59

肿瘤免疫治疗怎么开展？来看看大佬们怎么做吧！

导言今天小编分享一篇2021年4月9日发表于Cell的有关免疫治疗的文章——Glioblastomasacquiremyeloid-affiliatedtranscriptionalprogramsviaepigeneticimmunoeditingtoelicitimmuneevasion

博士苑·2023-09-18 10:50

blast错误问题

所以想起来使用blast。win下blast，上学那阵子不知道跑了多少遍了。以为信手拈来，木想到安装之后居然翻车了。

谢京合·2023-09-18 09:14

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